Trizol法大鼠心肌总RNA提取方法探讨
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trizol法提取rna的原理
Trizol法是一种常用的RNA提取方法,它是一种单步法,可以同时提取RNA、DNA和蛋白质。
该方法基于酚和胍的化学性质,通过酚的溶解性和胍的离子性来分离RNA、DNA和蛋白质。
Trizol法的原理是利用酚的溶解性质将细胞膜和细胞核膜破坏,使RNA、DNA和蛋白质释放出来。
然后,加入氯仿,使RNA、DNA和蛋白质分为两个相,RNA在上层,DNA和蛋白质在下层。
接着,加入异丙醇,使RNA从上层转移到异丙醇层中,形成RNA沉淀。
最后,将RNA沉淀用乙醇洗涤,去除杂质,得到纯净的RNA。
Trizol法的优点是简单、快速、高效,可以同时提取RNA、DNA 和蛋白质,适用于多种样品类型,如细胞、组织、血液、尿液等。
此外,该方法提取的RNA质量好,适用于后续的实验操作,如RT-PCR、Northern blot、RNA测序等。
但是,Trizol法也存在一些缺点。
首先,该方法对RNA的长度和结构有一定的限制,不适用于长链RNA和某些结构特殊的RNA。
其次,该方法对样品的处理和操作技巧要求较高,容易受到外界因素的影响,如温度、湿度、pH值等。
最后,该方法的成本较高,需要使用较多的试剂和设备。
Trizol法是一种常用的RNA提取方法,其原理是利用酚和胍的化学性质分离RNA、DNA和蛋白质。
该方法具有简单、快速、高效等
优点,但也存在一些缺点。
在实际应用中,需要根据具体情况选择合适的RNA提取方法。
trizol提rna方法TRIzol提RNA方法简介TRIzol提RNA方法是一种常用的RNA提取方法,采用TRIzol试剂将RNA稳定在总RNA样品中提取出来,通过分离纯化使RNA的质量和完整性得到一定保证。
TRIzol提RNA方法具有以下特点:1. 适用范围广TRIzol提RNA方法不仅适用于多种类型的样品,如细胞、组织和微生物等,还可用于分离多种类型的RNA分子,如mRNA、rRNA和miRNA等。
2. 提高RNA的纯度和质量TRIzol试剂具有独特的成分,可以最大限度地去除DNA、蛋白质等干扰物质,提高RNA的纯度和质量。
同时,TRIzol提RNA方法还可以避免RNA的降解和失活,保证RNA完整性。
3. 操作简单、快速TRIzol提RNA方法操作简单,一般可以在1-2小时内完成RNA提取。
相对于其他RNA提取方法,TRIzol提RNA方法快速、高效。
TRIzol提RNA方法步骤TRIzol提RNA方法共分为以下步骤:1. 样品裂解将样品加入TRIzol试剂中,裂解细胞并溶解RNA。
2. 相分离将样品和TRIzol混合液沉淀,然后加入一个有机溶剂,使RNA与水相分离。
3. 提取RNA将RNA上清液收集起来,加入氯仿,进一步去除有机溶剂和DNA。
4. 沉淀RNA将RNA上清液沉淀,将RNA稳定在沉淀中,去除残留的有机溶剂和盐分。
5. 溶解RNA将RNA沉淀中的RNase-free水添加至RNA沉淀中,彻底溶解RNA。
如何提高TRIzol提RNA质量和完整性1. 样品处理不同类型的样品有不同的处理方式。
对于细胞和组织等样品,应尽量在收集后尽快进行TRIzol提RNA操作,避免RNA在细胞或组织中降解和失活。
2. TRIzol试剂的使用使用新鲜的TRIzol试剂,并根据使用说明操作。
避免直接接触试剂和皮肤等。
3. RNA逆转录和扩增在进行RNA逆转录和扩增前,应对RNA质量和完整性进行检测,以确保数据准确性。
总RNA的提取(Trizol法提取)在收集到生物材料之后,最好能即刻进行RNA制备工作。
若需暂时储存,则应以液氮将生物材料急速冷冻后,储存于-80℃冷冻柜。
在制备RNA时,将储存于冷冻柜的材料取出,立即以加入液氮研磨的方式打破细胞,不可以先行解冻,以避免RNase的作用。
1.提取组织RNA时,每50~100mg组织用1ml Trizol试剂对组织进行裂解;提取细胞RNA时,先离心沉淀细胞,每5-10╳106个细胞加1ml Trizol后,反复用枪吹打或剧烈振荡以裂解细胞;2.将上述组织或细胞的Trizol裂解液转入EP管中,在室温15~30C下放置5分钟;3.在上述EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.2ml氯仿的量加入氯仿,盖上EP管盖子,在手中用力震荡15秒,在室温下(15℃~30℃)放置2~3分钟后,12000g(2℃~8℃)离心15分钟;4.取上层水相置于新EP管中,按照每1ml TRIZOL加0.5ml异丙醇的量加入异丙醇,在室温下(15℃~30℃)放置10分钟,12000g(2℃~8℃)离心10分钟;5.弃上清,按照每1ml TRIZOL加1ml75%乙醇进行洗涤,涡旋混合,7500g(2℃~8℃)离心5分钟,弃上清;6.让沉淀的RNA在室温下自然干燥;7.用Rnase-free water溶解RNA沉淀。
PCR实验室常用DNA聚合酶有三种:TaKaRa Taq TM,TaKaRa E X Taq TM和Pyrobest TM DNA Polymerase。
TaKaRa Taq TM是一般的DNA聚合酶,保真性较差,但价钱便宜,一般用于基因表达的检测等。
TaKaRa E X Taq TM是具有Proof reading 活性的耐热性DNA聚合酶,具有一定的保真性,而且其扩增得到的PCR产物3’端附有一个“A”碱基,如果希望直接将产物克隆到T-vector可以用此酶。
Pyrobest TM DNA Polymerase也是具有Proof reading活性的耐热性DNA聚合酶,其特点是保真性极高,扩增得到的PCR产物为平滑末端。
Trizol提取组织总RNA的方法实验原理:Trizol试剂中的主要成分为异硫氰酸胍和苯酚,其中异硫氰酸胍可裂解细胞,促使核蛋白体的解离,使RNA与蛋白质分离,并将RNA释放到溶液中。
当加入氯仿时,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA进入水相,离心后可形成水相层和有机层,这样RNA与仍留在有机相中的蛋白质和DNA 分离开。
水相层(无色)主要为RNA,有机层(黄色)主要为DNA和蛋白质。
液氮研磨组织:实验准备:研钵、研棒、药匙清洗后高压消毒;线手套、烧杯高压消毒。
材料:1.5mlEP管,200μL EP管(RNA-Free)试剂:Trizol;氯仿;异丙醇;75%乙醇(DEPC处理水:无水乙醇=1:3);桌面清理干净,酒精擦拭消毒。
1.取出冻存于-80℃的组织,放于液氮中。
2.在研钵中导入部分液氮,对研钵、研锤进行预冷。
取出组织,放入含有液氮的研钵中,左手戴上线手套,外面套两层PE手套,扶住研钵,右手持研锤压碎组织。
Tip:为了防止组织研碎过程中蹦出,左手在刚开始研磨过程中可以护住研钵口;可以用研棒将组织聚集到一起进行研磨,这样更容易捣碎;研磨期间不断加入液氮,防止组织中RNA因温度升高降解;3.研磨完成后,将研磨好的组织粉末收集到已经编号的含有Trizol的EP管中。
如果组织较少,可以将Trizol 的量减半(500μL)。
4.接下来进行Trizol提取RNA操作Trizol 提取RNA实验准备:离心机预冷;70%乙醇预冷值-20℃。
1.将EP管上下颠倒,充分混匀,室温放置5分钟。
2.在通风橱中操作。
加入200ul(0.2倍体积)的氯仿,盖紧盖,剧烈震荡混匀15秒,室温静置5 min。
12000g,4℃离心15min。
Tip:使用1mL的枪吸取。
3.离心后溶液分为三层,RNA存在于上清中,离心管从离心机上拿下来时要轻巧,以免管内物质震荡导致下层沉淀激起。
吸取上清的时候一定要轻,切忌吸取太多,少量即可(400-500ul),避免碰到下层沉淀。
Trizol法提取总RNATrizol法是一种常用的RNA提取方法,其原理是基于氯仿-异硫氰酸胍的试剂,能够迅速破碎细胞并抑制细胞释放出的核酸酶。
通过将样品与Trizol试剂混合,可以裂解细胞并释放出RNA。
然后加入氯仿进一步抽提RNA,并通过离心分离出上清液中的RNA。
最后通过乙醇沉淀和洗涤得到纯化的RNA。
所需试剂和耗材1.Trizol试剂:用于细胞裂解和RNA的释放。
2.氯仿:用于抽提RNA。
3.无水乙醇:用于洗涤沉淀的RNA。
4.DEPC水:用于制备无RNA酶的水。
5.1.5ml Eppendorf管:用于RNA的存储。
6.Tips:用于吸取无RNA酶的水和Trizol试剂。
实验仪器1.台式高速离心机:用于离心分离RNA。
2.涡旋振荡器:用于混合样品和试剂。
3.移液器:用于吸取试剂和样品。
4.无菌微量离心管:用于样品和试剂的存储。
5.无菌手套:用于防止RNA酶的污染。
准备工作1.在实验前需要将实验区域和所有实验用具进行清洁和消毒,以避免RNA酶的污染。
2.使用Trizol试剂前需仔细阅读说明书,并确保按照说明书的要求进行操作。
3.为避免RNA酶的污染,需要穿戴无菌手套进行实验操作。
实验方法1.准备无菌的DEPC水,加入DEPC水至10ml,然后加入10μl的氯仿,充分混匀后放置备用。
2.在无菌的1.5ml Eppendorf管中加入100μl的Trizol试剂,加入10μl的氯仿,充分混匀后加入步骤1中制备好的DEPC水-氯仿混合液100μl,再次充分混匀后放置备用。
3.将样品加入到步骤2中制备好的溶液中,充分混匀后加入氯仿,再次充分混匀后进行高速离心,分离出上清液。
4.将上清液转移至新的离心管中,加入等体积的无水乙醇,充分混匀后进行高速离心,收集沉淀的RNA。
5.用70%乙醇洗涤沉淀的RNA,去除残留的乙醇和盐类,最后将RNA沉淀干燥后重新溶解在水中或指定的缓冲液中。
注意事项1.在加入氯仿之前,不要洗涤细胞,以免降解mRNA。
Trizol法大鼠心肌总RNA提取方法探讨戴先成;柴智锋;徐永城;王山青【摘要】目的探讨大鼠心肌总RNA的提取方法,为今后法医学研究和实践工作提供参考.方法用Trizol法,严格注意无RNA酶操作,通过裂解组织,分离、沉淀RNA 而提取大鼠心肌总RNA,并用分光光度计、凝胶电泳及RT-PCR检测结果.结果Trizol法能获得较高纯度和产量的完整总RNA.结论 Trizol法是提取总RNA可靠有效的方法,可望在法医学领域有较广的应用.【期刊名称】《刑事技术》【年(卷),期】2014(000)003【总页数】2页(P15-16)【关键词】法医病理学;总RNA提取;Trizol法【作者】戴先成;柴智锋;徐永城;王山青【作者单位】浙江省诸暨市公安局,311800;浙江省诸暨市公安局,311800;浙江省宁波市公安局鄞州分局,315100;北京市公安局法医中心二部,102488【正文语种】中文【中图分类】DF795.1分子生物学技术已经在各个领域广泛运用,其中在RNA 方面的研究也正在被各领域研究人员所青睐,法医工作者也不例外。
但是由于RNA 降解快而使其应用大受限制,本文介绍以Trizol为主要试剂的总RNA 提取方法,并就其提取过程中的注意事项进行讨论,以期在法医学领域能有较好的应用。
1 材料与方法1.1 材料健康雌性Sprague-Dawley大鼠3只(8周龄,200±20g);焦碳酸二乙酯(DEPC)、Trizol(美国)、氯仿、异丙醇等试剂;ND-100分光光度计(美国)、Microfuge 22R4℃离心机(美国)、9700PCR 仪(美国)等设备。
1.2 方法实验准备:200℃干烤金属器械及玻璃器材4h、1/1000DEPC液浸泡塑料器材过夜后烘干待用;实验员戴无RNA 酶手套、医用口罩及手术帽,用3%H2O2 擦洗操作台及设备。
实验操作:(1)断颈处死大鼠,立即剪取新鲜心肌组织50mg~100mg,液氮浸泡数分钟(直至组织块不冒气泡、完全沉到液氮底部为止),再放入已加1mL预冷Trizol的玻璃匀浆器,冰上碾磨15min,转移混合液至2mL EP管并室温裂解5min;(2)4℃、12000r/min离心10min,后转移上清至新管,向新管加氯仿200μL,盖紧并振荡混匀,手动剧烈摇晃15sec,室温放置3min;(3)4℃、12000r/min离心15min,再用200μL 小枪头分多次转移上清至新管,向新管加异丙醇500μL,盖紧混匀,手动摇晃15sec,室温放置10min;(4)4℃、12000r/min离心10min,弃上清并加入75%乙醇1mL,温和震荡、悬浮沉淀;(5)4℃、7500r/min离心5min,弃上清并在超净工作台风干;(6)用20μL 无RNA 酶水溶解沉淀,ND-100 分光光度计及1%琼脂糖凝胶电泳检测;(7)将RNA 逆转录成cDNA,并对管家基因GAPDH 进行PCR 扩增及电泳检测。
心肌细胞总RNA 的提取1. 匀浆化作用:50mg 心肌(置于1ml 玻璃匀浆器内)加1mlTrizol 溶液①进行研磨匀浆液(倒入1.5mlEP 管中)颠倒混匀10下,室温静置5分钟,12,000rmp4℃离心5分钟。
下层液(弃去) 上清液(置新的EP 管中)2.分离阶段上清液加入氯仿(0.2ml ),剧烈震荡15秒,乳化后,室温静置5分钟,12,000rmp4℃离心15分钟。
分为三层的匀浆液3.RNA 的沉淀 三层匀浆液白色中间层 无色的上清液 下层有机相(取0.2ml 置新的EP 管中)加入0.2ml 异丙醇,上下颠倒混匀,室温静置10分钟,12,000rmp4℃离心10分钟。
具沉淀上清液4.RNA的洗脱具沉淀上清液上清液(弃去)沉淀缓慢沿EP管壁加入75%乙醇1ml(DEPC水配制并预冷)②,轻轻振摇,12,000rmp4℃离心5分钟。
乙醇(弃去)沉淀(新)5.RNA的再溶解沉淀(新)室温干燥3-5分钟,加入适当的Rnase-free水(20ul)③溶解。
溶液(于-80℃保存)①Trizol溶液:在2000ml的烧杯中加入以下物质,混合均匀:500ml重蒸苯酚;250g异硫氢酸胍;293mL蒸馏水;17.6mL 0.75M 柠檬酸钠溶液(pH≥7)26.4mL 10%sarcosy(十二烷基肌氨酸钠)溶液50mL 2M NaAc溶液(pH≥4)TRIzol需4℃低温保存,保质期约一年。
100mL TRIzol试剂市场售价约478元人民币。
注释:(1)水和苯酚部分互溶,Trizol中苯酚被水饱和,形成均匀溶液;(2)NaAc等盐类的作用是提供缓冲环境。
②75%乙醇(DEPC水配制):先配置DEPC水,1000 ml双蒸水加1 ml DEPC,不用灭菌。
100%的乙醇与DEPC水按3:1的体积比配置;一段时间(一般12小时左右)后再高压灭菌。
③Rnase-free水:1000 ml双蒸水加1 ml DEPC,不用灭菌。
Trizol总RNA抽提步骤1样品的处理1.1样品的匀浆A.贴壁细胞尽量弃去培养液,直接往直径3.5cm的培养板中加入1ml Total RNA Extraction Reagent 覆盖并反复吹打裂解细胞。
【注】:1)依据培养板的面积而不是细胞的数量来决定所需的Total RNA Extraction Reagent 量(每10cm2 加1ml)。
2)当加入Total RNA Extraction Reagent量不足时可导致抽提的RNA有DNA污染。
3)贴壁培养细胞往往不能完全从培养瓶(皿)脱落,这并不意味着裂解不完全,此时细胞膜实际已经完全裂开,并已释放RNA,继续后续实验即可。
B. 悬浮细胞离心收集细胞,每5 ×106-107个细胞加入1 ml Total RNA Extraction Reagent,用移液器反复吹打直至无明显颗粒样存在。
【注】:在加入Total RNA Extraction Reagent前避免洗涤细胞,否则会增加mRNA降解的可能性。
裂解某些酵母和细菌可能需要使用匀浆器。
C. 动/植物组织取新鲜动植物组织或-70℃冻存动物组织在液氮中充分研磨,按照表1加入适当量Total RNA Extraction Reagent 混匀。
或取新鲜动植物组织尽量剪碎,加入适当Total RNA Extraction Reagent量,匀浆仪进行匀浆处理。
【注】:样品体积一般不要超过Total RNA Extraction Reagent体积的10%。
1.2 将匀浆样品剧烈震荡后在室温条件下放置5分钟以使核蛋白体完全解离。
1.3(可选)在4℃条件下,12000rpm 离心10min,取上清。
【注】:如样品中含有较多蛋白质、脂肪、多糖或肌肉,植物的块茎结节等可离心去除。
离心后的沉淀中包含有细胞外膜、多糖以及高分子量DNA,上清中含有RNA。
处理脂肪组织样品时,上层是大量油脂应尽量去除,取澄清的匀浆液进行后续实验。
Trizol法提取RNA实验步骤及原理RNA(核糖核酸)在许多生物学过程中起着至关重要的作用,如基因表达调控、蛋白质合成等。
Trizol 法是一种广泛应用于提取细胞或组织中总 RNA 的方法。
下面将详细介绍 Trizol 法提取 RNA 的实验步骤及原理。
一、实验原理Trizol 试剂主要成分包括苯酚、异硫氰酸胍等。
异硫氰酸胍是一种强变性剂,能够迅速破坏细胞结构,使核蛋白与核酸分离,并抑制RNA 酶的活性,从而保护RNA 不被降解。
苯酚则能够促使蛋白变性,并使核酸从蛋白核酸复合物中释放出来。
在 Trizol 处理样品后,RNA 会溶解在水相中。
通过加入氯仿,离心后可将溶液分为水相、有机相和中间层。
RNA 存在于水相中,而 DNA 和蛋白质分别存在于有机相和中间层。
收集水相,通过异丙醇沉淀可得到 RNA。
最后,用乙醇洗涤 RNA 沉淀以去除残留的盐和杂质,从而获得较为纯净的 RNA。
二、实验步骤1、材料准备细胞或组织样本Trizol 试剂氯仿异丙醇75%乙醇(用 DEPC 水配制)无 RNA 酶的离心管、移液器吸头离心机涡旋振荡器2、样本处理细胞样本:将培养的细胞收集到离心管中,离心弃去培养液。
加入适量的 Trizol 试剂,反复吹打使细胞充分裂解。
组织样本:将新鲜组织切成小块,放入液氮中速冻,然后研磨成粉末。
加入适量的 Trizol 试剂,充分匀浆。
3、室温静置裂解后的样本在室温下静置 5 分钟,使核蛋白体完全解离。
4、加入氯仿按每 1ml Trizol 试剂加入 02ml 氯仿的比例,剧烈振荡 15 秒,然后室温静置 2 3 分钟。
5、离心在 4℃下,以 12000g 离心 15 分钟。
离心后,溶液分为三层:上层为无色的水相,含有 RNA;中间层为白色;下层为红色的有机相,含有 DNA 和蛋白质。
6、转移水相用移液器小心地将上层水相转移到一个新的无RNA 酶的离心管中,避免吸取中间层和有机相。