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各种DNA提取方法提取方法提取方法提取方法一，基因组DNA提取方法制备基因组DNA是进行基因结构和功能研究的重要步骤，通常要求得到的片段的长度不小于100-200kb。
在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素，以保证DNA的完整性，为后续的实验打下基础。
主要是CTAB方法，其他的方法还有1物理方式:玻璃珠法超声波法研磨法冻融法。
2化学方式：异硫氰酸胍法碱裂解法3生物方式:酶法。
根据核酸分离纯化方式的不同有:硅质材料、阴离子交换树脂等试验步骤：1、贴壁细胞用胰酶消化，离心收集。
2、细胞重悬于冰冷的PBS漂洗一次，离心收集。
试验步骤2再重新作一边。
3、加入5mlDNA提取缓冲液，(10mmol/%SDS)混匀。
4、加入25ul 蛋白酶K使终浓度达到100ug/ml 混匀，50℃水浴3h 5、用等体积的酚抽提一次，2500rpm离心收集水相，用等体积的（酚，氯仿，异戊醇）混合物抽提一次，2500r/min离心收集水相6、用等体积的氯仿，异戊醇抽提一次。
加入等体积的5mol/L的LiCL混匀，冰浴，10min.。
7、2500rpm离心10min.转上清于一离心管中。
加入等体积的异丙醇。
室温10min。
2500rpm离心10min。
弃上清。
8、加入倍体积3mol/L乙酸钠与2倍体积-20℃预冷无水乙醇。
-20℃20min。
9、12000r/min室温离心5min。
弃上清。
将DNA 溶于适量TE中。
二，外周血DNA提取技术分离外周血白细胞提取方法：试验步骤：1、取人肘静脉血5ml，EDTA抗凝，2500rpm 离心10min。
2、小心吸取上层血浆，分装到3个离心管中。
3、在血细胞中加入3倍体积的溶血液，摇匀，冰浴15min。
4、2500rpm离心10min，弃上清。
5、加入10ml 溶血液，摇匀，冰浴15min。
6、3000rpm离心10min，弃上清。
7、倒置离心管，去掉残液。
8、得白细胞，－80℃冻存。
基因组DNA的提取一、从哺乳动物组织提取基因组DNA实验材料：液氮、消化缓冲液、PBS（冰冷）、25:24:1酚/氯仿/异戊醇、7.5M乙酸铵、无水乙醇及70%乙醇、0.1%SDS、RNA酶、TE缓冲液（pH8.0）、离心管、研钵、冷冻离心机。
实验步骤：1.取新鲜或冰冻动物组织块，剪成小块。
置于液氮中冻结。
2.将500mg的组织用预冷的研钵和研杵研碎，或用小锤子将其捣为细粉末，每100mg组织用1.2 mL消化缓冲液悬浮。
3.将6ml样品在盖紧的离心管中于50℃摇荡下温育12～18 h。
4.用6ml酚/氯仿/异戊醇抽提样品，1700g离心10 min。
如果样品溶解得不好，再加6ml不含蛋白酶K的消化缓冲液，并重复离心。
如果在界面上有一层厚的白色物质，重复有机抽提，将上层(水溶液)转移至一个新管中。
5.加入6ml 7.5M乙酸铵和24ml 100%乙醇，1700g离心2 min。
6.用70%乙醇洗涤，晾干，沉淀用TE缓冲液重新溶解，使终浓度在约1mg/mL左右。
7.加入0.1%的SDS和1pg/mL无DNA酶的RNA酶，37℃温育1h,以除去残留的RNA.重复步骤 4～5。
二、从植物组织提取基因组DNA实验材料：液氮/干冰、2-巯基乙醇(2-ME)、 CTAB抽提液、CTAB/NaCl溶液、24:1(v/v)氯仿/异戊醇、CTAB沉淀液、高盐TE缓冲液、80%乙醇、TE缓冲液、抗有机溶剂的试管和烧杯、研钵和研杵、粉碎器/匀浆器、捣碎机、恒温金属浴、冷冻离心机。
实验步骤：1.取1g的鲜叶组织，在3.2ml CTAB抽提液中加入0.8ml 2-巯基乙醇，使终浓度达2%(v/v)。
将此溶液及1ml CTAB/NaCl溶液加热至65℃。
2.用液氮(-196℃)或干冰(一78℃)冷却粉碎器/匀浆器，将植物组织粉碎成为细粉，然后将冷冻的组织转移到一个抗有机溶剂的试管或烧杯中。
3.往粉碎的组织中加入预热的2-ME/CTAB,混合使之充分湿润，65℃温育10～60min,不时混匀：4.用4ml的24:1氯仿/异戊醇抽提匀浆液，颠倒使充分混合，于4℃, 7500g离心5 min(对于小样品，在离心机上以10000 r/min离心),回收上(水)相。
基因组DNA提取步骤1.从无水乙醇中取出少许组织（约50mg）加入干净灭菌的EP管中，剪碎；2.加入400ul 1％的SDS，8ul（20mg/ml）的蛋白酶K，充分浸润，入55℃摇床（100转/分），期间振荡助溶至澄清（5-6h）；3.取出消化液，加入6mol/L的NaCl300ul，氯仿200ul，轻柔正反颠倒，使其充分乳化，4℃13000转/分离心30min；4.取出上清（约400ul），加入等体积氯仿抽提一次，轻柔颠倒后，4℃13000转/分离心10min；5.上清加入5μl RNaseA(10μg/μl), 37℃10分钟, 除去RNA(RNA对DNA的操作、分析一般无影响，可省略该步骤）。
6.取上清加入等体积异丙醇，轻柔混匀后-20℃沉淀10min；7.4℃13000转/分离心15min，弃上清；8.用75％乙醇洗涤1-2次（1000ul，11000转/分离心2min），弃上清；9.冰冻无水乙醇洗涤1-2次（1000ul，11000转/分离心4min）弃上清，自然晾干或烘干，DDW溶解，30-50ul。
基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southern杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。
利用基因组DNA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子DNA分离。
加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出，而小分子DNA则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部, 从而达到提取的目的。
在提取过程中,染色体会发生机械断裂,产生大小不同的片段,因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作,如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓, 以保证得到较长的DNA。
一般来说,构建基因组文库, 初始DNA长度必须在100kb以上,否则酶切后两边都带合适末端的有效片段很少。
而进行RFLP和PCR分析, DNA长度可短至50kb, 在该长度以上,可保证酶切后产生RFLP片段(20kb以下),并可保证包含PCR所扩增的片段(一般2kb以下)。
基因组DNA提取的流程
1. 样本选择：选择适合提取基因组DNA的样本类型，如细胞、组织或血液。
确保样本保存在合适的条件下，以保持DNA的完整性。
2. 细胞破碎：对于细胞样本，首先需要将细胞破碎以释放DNA。
可以使用物理方法，如机械剪切或超声波处理，或者使用化学方法，如洗涤溶解和细胞裂解酶处理。
3. DNA溶解：将细胞裂解提取物加入DNA溶解缓冲液中，以彻底溶解DNA。
4. 去除杂质：通过离心、过滤或沉淀等方法去除蛋白质、RNA 等杂质。
5. 纯化DNA：使用吸附剂、洗涤剂或沉淀剂等方法去除剩余的杂质，得到纯化的基因组DNA。
6. 检测与定量：通过电泳、荧光光谱等技术检测提取的DNA质量和浓度，确保提取的DNA满足后续实验的要求。
以上是基因组DNA提取的一般流程，具体操作可能会因实验条件、样本类型和目标DNA的不同而有所差异。
基因组dna的提取原理基因组DNA的提取原理。
基因组DNA的提取是生物学实验中的一项重要步骤，它是从生物样本中分离出DNA分子的过程。
DNA提取的目的是为了进一步的分子生物学研究，如PCR扩增、测序、重组等实验。
下面将介绍基因组DNA提取的原理及步骤。
1. 样本的准备。
在进行基因组DNA提取之前，首先需要准备样本。
样本可以是细胞、组织或血液等。
对于细胞和组织样本，通常需要将其打碎以释放细胞内的DNA。
而对于血液样本，则需要进行红细胞溶解，以获得含有DNA的白细胞。
2. 细胞裂解。
细胞裂解是DNA提取的第一步，其目的是破坏细胞膜和核膜，释放细胞内的DNA。
通常可以使用裂解酶或裂解缓冲液来实现细胞裂解。
在裂解过程中，可以加入蛋白酶来降解蛋白质，以减少对DNA的污染。
3. 蛋白质沉淀。
裂解后的细胞溶液中可能含有大量的蛋白质和其他杂质，需要进行蛋白质沉淀。
通常可以加入盐和酒精来沉淀蛋白质，然后通过离心将沉淀的蛋白质去除，留下含有DNA的上清液。
4. DNA沉淀。
为了获得纯净的DNA，需要将其从上清液中沉淀出来。
可以通过加入乙醇或异丙醇来沉淀DNA，然后通过离心将沉淀的DNA收集起来。
5. DNA纯化。
最后一步是对沉淀得到的DNA进行纯化。
可以使用乙醚或异丙醇来去除残留的盐和其他杂质，然后用适当的缓冲液溶解DNA，得到纯净的基因组DNA。
通过以上步骤，就可以从生物样本中提取出纯净的基因组DNA。
这些DNA可以用于后续的分子生物学实验，如PCR扩增、基因测序、重组等。
基因组DNA的提取原理并不复杂，但需要严格控制实验条件，以确保提取得到的DNA质量和纯度。
质粒dna 的提取和基因组dna的提取以质粒DNA的提取和基因组DNA的提取为标题，本文将分别介绍质粒DNA和基因组DNA的提取方法。
一、质粒DNA的提取质粒DNA是存在于细菌细胞内的一个环状DNA分子，它具有独立复制和转录的能力。
质粒DNA的提取是进行基因工程研究和分子生物学实验的重要步骤之一。
质粒DNA的提取方法一般包括以下步骤：1.细菌培养与收获：首先选取含有目标质粒的细菌菌株进行培养，培养至适宜的生长阶段，然后通过离心将细菌菌体收获。
2.细菌菌体破碎：将收获的细菌菌体进行破碎，破碎方法常用的有物理破碎和化学破碎。
物理破碎可以通过超声波处理或高压破碎等方法进行；化学破碎则常使用蛋白酶K等酶进行。
3.质粒DNA的分离：通过离心将破碎后的细菌细胞碎片与其他细胞组分进行分离。
常用的方法包括差速离心和密度梯度离心等。
4.质粒DNA的纯化：将分离得到的质粒DNA进行纯化，去除杂质和其他核酸。
纯化方法常用的有酚-氯仿法、硅胶柱层析法和离子交换层析法等。
5.质粒DNA的测定：对提取得到的质粒DNA进行浓度和纯度的测定，常用的方法有比色法和紫外分光光度法等。
二、基因组DNA的提取基因组DNA是一个生物体内所有基因的总和，它包含了生物体的全部遗传信息。
基因组DNA的提取是进行基因组学研究和遗传分析的重要步骤之一。
基因组DNA的提取方法一般包括以下步骤：1.样品处理：首先选择合适的样品，如动物组织、植物组织或微生物等，然后对样品进行预处理，如细胞破碎、蛋白酶处理等。
2.细胞破碎：将样品中的细胞破碎，使细胞内的DNA释放出来。
破碎方法常用的有物理破碎和化学破碎。
物理破碎可以通过高温、高压或超声波处理等方法进行；化学破碎则常使用蛋白酶K等酶进行。
3.基因组DNA的分离：通过离心将破碎后的细胞碎片与其他细胞组分进行分离。
常用的方法包括差速离心和密度梯度离心等。
4.基因组DNA的纯化：将分离得到的基因组DNA进行纯化，去除杂质和其他核酸。
基因组dna的提取原理
基因组DNA的提取原理是通过一系列化学、生物学和生物化
学技术的组合来分离和纯化目标DNA分子。
1. 细胞破碎：首先，需要将目标细胞破碎，并释放出细胞质和细胞核中的DNA。
通常使用机械方法（如搅拌、研磨等）或
化学方法（如细胞溶解剂）来破坏细胞膜和核膜。
2. DNA溶解：接下来，使用缓冲液来将DNA从细胞质和细胞核溶解出来。
缓冲液中通常含有高盐浓度、EDTA和蛋白酶等
成分，可以破坏细胞膜和核膜的结构，同时也能够使细胞蛋白质发生变性并失去功能。
3. 蛋白酶处理：蛋白酶的加入能够降解蛋白质，包括细胞膜上的表面蛋白、核膜蛋白和组蛋白等，从而使DNA不再受到蛋
白质的阻碍。
4. DNA纯化：通过一系列步骤，如加入盐和异丙醇，可以使DNA在溶液中聚集形成沉淀。
随后，通过离心将沉淀分离出来，可以将DNA从其他污染物中纯化出来。
此外，还可以利
用特定的纯化柱或介质来选择性地吸附DNA，并通过洗脱步
骤将其从其他杂质中分离出来。
5. DNA沉淀：最后，将纯化的DNA溶解在缓冲液中，如TE
缓冲液，并通过测定其浓度和纯度来评估提取的DNA质量。
综上所述，基因组DNA的提取原理包括细胞破碎、DNA溶解、
蛋白酶处理、DNA纯化以及DNA沉淀等步骤，通过这些步骤可以将目标DNA从细胞中提取出来并进行纯化，为后续的实验分析和应用提供高质量的DNA样本。
基因组DNA提取步骤1.从无水乙醇中取出少许组织（约50mg）加入干净灭菌的E P管中，剪碎；2.加入400ul 1％的SDS，8ul（20mg/ml）的蛋白酶K，充分浸润，入55℃摇床（100转/分），期间振荡助溶至澄清（5-6h）；3.取出消化液，加入6mol/L的NaCl300ul，氯仿200u l，轻柔正反颠倒，使其充分乳化，4℃13000转/分离心30m in；4.取出上清（约400ul），加入等体积氯仿抽提一次，轻柔颠倒后，4℃13000转/分离心10m i n；5.上清加入5μl RNaseA(10μg/μl), 37℃10分钟, 除去RNA(RNA对DN A的操作、分析一般无影响，可省略该步骤）。
6.取上清加入等体积异丙醇，轻柔混匀后-20℃沉淀10mi n；7.4℃13000转/分离心15m i n，弃上清；8.用75％乙醇洗涤1-2次（1000ul，11000转/分离心2mi n），弃上清；9.冰冻无水乙醇洗涤1-2次（1000ul，11000转/分离心4mi n）弃上清，自然晾干或烘干，DDW溶解，30-50ul。
基因组DNA的提取通常用于构建基因组文库、Southe rn杂交(包括RFLP)及PCR分离基因等。
利用基因组D NA较长的特性,可以将其与细胞器或质粒等小分子D NA分离。
加入一定量的异丙醇或乙醇，基因组的大分子DNA即沉淀形成纤维状絮团飘浮其中, 可用玻棒将其取出，而小分子DN A则只形成颗粒状沉淀附于壁上及底部, 从而达到提取的目的。
在提取过程中,染色体会发生机械断裂,产生大小不同的片段,因此分离基因组DNA时应尽量在温和的条件下操作,如尽量减少酚/氯仿抽提、混匀过程要轻缓, 以保证得到较长的DNA。
基因组DNA的分离纯化提取方法综述
1.高盐法：
高盐法是最常用的基因组DNA提取方法之一、该方法利用高浓度盐水（如NaCl）沉淀DNA，同时去除蛋白质和其他污染物。
步骤包括细胞破碎、蛋白质沉淀和DNA沉淀。
此方法简便、廉价，适用于大多数细胞类型。
2.酚酚氯仿提取法：
酚酚氯仿提取法是另一个常用的基因组DNA提取方法。
该方法利用酚
酚提取细胞组织中的DNA，并通过氯仿的添加分离DNA和蛋白质。
此方法
适用于多样的生物标本，如细菌、真菌、植物等。
3.环硅酸盐法：
环硅酸盐法基于DNA与硅颗粒间的结合原理。
在此方法中，细胞裂解后，DNA与硅颗粒结合形成复合物，复合物通过离心和洗涤步骤获得纯化
的DNA。
该方法适用于基因组DNA的高通量纯化。
4.硅基附着法：
硅基附着法也是一种利用硅颗粒的DNA分离纯化方法。
此方法常利用
硅基膜滤板或硅颗粒填充的柱子，使DNA与硅基结合，然后通过洗涤和离
心步骤分离纯化DNA。
该方法适用于小样本量或少量目标DNA的纯化。
5.磁珠吸附法：
磁珠吸附法是一种快速高效的DNA提取方法。
通过特定的磁珠与DNA
的结合，可将DNA快速提取纯化。
该方法通常结合磁力分离和洗涤步骤，
使DNA与磁珠结合，然后通过磁力将DNA分离。
此方法适用于高通量或高
效率DNA提取。
细胞基因组dna提取一、细胞基因组DNA提取的概念细胞基因组DNA提取是指从生物体内的细胞中提取出其基因组DNA，以便进行分子生物学实验。
DNA提取是许多分子生物学技术和实验的前提，如PCR、限制性酶切、电泳等。
二、细胞基因组DNA提取的原理1. 细胞破碎：将细胞破碎以释放DNA。
可以使用机械方法（如超声波）、化学方法（如溶液中加入洗涤剂）或酶解方法（如加入蛋白酶）等方式进行破碎。
2. DNA分离：将破碎后的混合物离心，使得DNA沉淀到底部。
然后通过去除上层液体和洗涤沉淀来纯化DNA。
3. DNA溶解：将沉淀的DNA溶解在适当的缓冲液中，以便进行后续实验操作。
三、细胞基因组DNA提取的步骤1. 收集样品：收集需要提取DNA的样品，如血液、组织或菌落等。
2. 细胞破碎：使用适当的方法对样品中的细胞进行破碎，释放出DNA。
3. 清洁DNA：通过离心等方法将DNA沉淀到底部，去除上层液体和洗涤沉淀来清洁DNA。
4. 溶解DNA：将沉淀的DNA溶解在适当的缓冲液中，以便进行后续实验操作。
四、细胞基因组DNA提取的影响因素1. 样品来源：不同的样品来源对细胞基因组DNA提取有不同的影响。
如血液、组织或菌落等。
2. 细胞数量：细胞数量越多，提取到的DNA量越多。
3. 细胞类型：不同类型的细胞具有不同的细胞壁和膜结构，需要采用不同的破碎方法。
4. 存储条件：样品在收集后需要妥善存储，避免样品受到污染或降解。
五、细胞基因组DNA提取常用方法1. CTAB法：CTAB法是一种化学法，使用CTAB（十六烷基三甲基溴化铵）来裂解细胞壁和膜，并与核酸结合形成复合物。
该方法适用于高含量多酚类物质的样品。
2. 盐溶法：盐溶法是一种简单易行的方法，使用盐和洗涤剂来裂解细胞壁和膜，并与核酸结合形成复合物。
该方法适用于低含量多酚类物质的样品。
3. 商业化试剂盒：商业化试剂盒是一种快速方便的DNA提取方法，通过购买商业化试剂盒来进行DNA提取。
1 快速微量提取法A.取1.5ml菌体培养物于一灭菌Ep管中，12000rpm离心1min, 丢去上清夜，收集菌体。
B.加入400ul裂解液（40mMTris-醋酸，20mM醋酸钠,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8）混匀,置于37oC水浴1hr。
C.然后加入200ul5mol/L的氯化钠溶液，混匀后于13000rpm离心15min。
D.取上清液，用苯酚抽提2次，氯仿抽提1次。
E.加两倍体积无水乙醇，1/10体积醋酸钾(3M ,pH8.0)，-20度保存1小时后，13000rpm离心15min，弃上清液，沉淀用70%乙醇洗2次；置于室温干燥后，溶于50ulTE 溶液中，置4oC保存备用。
2 蛋白酶/SDS法制备先用10ml含适当抗生素的GBM过夜培养Delftia sp.，第二天4000rpm离心10min收集菌体，用Washing TE （50mmol/LTris-HCl pH8.0,10mmol/LEDTA pH8.0）洗菌体2次，之后将菌体充分悬浮在5ml 1×TE缓冲液中，先后加入0.5ml 5mg/L的蛋白酶、0.5ml 10% SDS，轻轻混匀后50℃放置3h~5h，接着用等体积的Tris饱和苯酚抽提2次，苯酚/氯仿/异戊醇抽提一次，氯仿抽提一次后，乙醇沉淀DNA，用自动移液器吸管头将絮状DNA沉淀块吸附到Ep管中，70%乙醇洗2次，干燥后溶于适当1×TE或ddH2O中。
3 1) 细菌培养：细菌接种于5ml 液体培养基中，37℃摇床（300rpm）培养过液。
2) 细菌收集：取1ml培养物于1.5ml EP 管中，室温8000rpm离心5min，弃上清，沉淀重新悬浮于1ml TE（pH8.0）中（用ddH2O 也行)。
3) 菌体裂解：加入6μl 50mg/ml的溶菌酶，37℃作用2h。
再加2mol/LNaCl50μl，10%SDS 110μl，20mg/ml的蛋白酶K 3μl，50℃作用3h或37℃过夜。
（此时菌液应为透明粘稠液体）4) 抽提：菌液均分到两个1.5ml EP管，加等体积的酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1)，混匀，室温放置5-10min。
12000rpm离心10min。
抽提两次。
（上清很粘稠，吸取时应小心，最好枪头尖应剪去）5) 沉淀：加0.6倍体积的异丙醇，混匀，室温放置10min。
1 2000rpm离心10min。
6)洗涤：沉淀用75%的乙醇洗涤。
7) 抽（凉）干后，溶于50μl ddH2O中，取2-5μl电泳。
作PCR模板用。
细菌基因组DNA的微量提取法本方法通过SDS裂解细胞，蛋白酶降解蛋白，CTAB去除多糖成分一：仪器：同方法一二：试剂：TE、TAE缓冲液；10%SDS；５ＭNaCL；20mg/ml蛋白酶Ｋ；CTAB/NaCL溶液(10% CTAB，0.7M NaCL 4.1gNaCL 溶于80ml 水中，缓慢加入10gCTAB，加热溶解)；25/24/1,酚/氯仿/异戊醇; 24/1,氯仿/异戊醇；异丙醇；７０％及100%乙醇三：操作1.5ml 对数生长期细菌细胞离心，5000rpm,1min沉淀溶于500μl TE缓冲液中混匀30μl 10%SDS,3μL蛋白酶Ｋ，混匀，37℃,1小时100μl NaCL(5M) 混匀80μl的CTAB/NaCL,*混匀；65℃10min（可不做）加入等体积酚/氯仿/异戊醇混合液，混匀，离心12000rpm,4-5min取上清，以下操作与方法一中有机溶剂抽提、沉淀、干燥、除RNA 、复溶等步骤一致。
注意１，*此步操作后，离心管中NaCL的浓度不应低于0.5M，否则DNA将与CTAB共沉淀。
2,本法适用于从多糖含量高的样品中提取DNA。
对于菌体样品,通过此流程,•可以获得较为完整的DNA分子。
细菌总DNA的提取和鉴定【目的和要求】1. 学会CTAB法提取细菌总DNA。
2. 掌握DNA的琼脂糖凝胶电泳法。
【实验原理】DNA在生物体内是与蛋白质形成复合物的形式存在的，因此提取出脱氧核糖核蛋白复合物后，必须将其中蛋白质去除。
CTAB（溴代十六烷基三甲胺）是一种去污剂，它能与核酸形成复合物，在高盐溶液中可溶并且稳定存在，若降低盐浓度，CTAB与核酸的复合物会沉淀出来，而大部分蛋白和多糖仍溶于溶液中。
DNA的电泳原理与蛋白质的电泳原理基本相同。
DNA分子在高于其等电点的pH溶液中带负电荷，在电场中向正极移动。
由于DNA分子或DNA片断的分子量差别，电泳后呈现迁移位置的差异。
【实验试剂和器材】（一）试剂：菌株（E.coli）；蛋白酶K（20mg/ml）；琼脂糖；标准DNA水解液1. 10%SDS2．酚/氯仿/异戊醇（1/1/1）3. 异丙醇；70%乙醇4．LB培养基：蛋白胨10g, 酵母粉5g, NaCl 10g加蒸馏水至1升，然后灭菌备用。
5．TE缓冲液：10mM Tris•HCl, 0.1mM EDTA (pH8.0)。
6．CTAB/NaCl溶液(5% w/v)：5g CTAB 溶于100ml 0.5M NaCl溶液中，需要加热到65℃使之溶解，然后室温保存。
7．TAE缓冲液（50×）(pH8.0)：每升溶液中含有242g Tris, 57.1ml 冰乙酸，100ml 0.5mol/L EDTA。
电泳时稀释成1×浓度使用。
8．溴酚兰-甘油指示剂：先配制0.1%溴酚兰水溶液，然后取1份0.1%溴酚兰溶液与等体积的甘油混合即成9．0.5ug/ml 溴乙啶染液：称取5mg溴乙啶，用重蒸水溶解定容到10ml, 取1ml此溶液用1xTAE缓冲液稀释到1升，最终浓度为0.5ug/ml。
（二）器材：锥形瓶（250ml），1.5ml 离心管，水浴锅，离心机，电泳槽，电泳仪，摇床，移液枪，洁净工作台，电磁炉，紫外成像仪【实验方法】（一）细菌总DNA的提取1. 将菌株接种于液体LB培养基，37℃震荡培养过夜。
2. 取1.5ml培养物12000rpm离心2min。
3. 沉淀物加入567 ul的TE缓冲液，反复吹打使之重新悬浮，加入30ul 10%SDS和15ul 的蛋白酶K，混匀，于37℃温育1h.4. 加入100ul 5mol/L NaCl, 充分混匀，再加入80ul CTAB/NaCl溶液，混匀后再65℃温育10min。
5. 加入等体积的酚/氯仿/异戊醇混匀，离心4-5min, 将上清转入一只新管中，加入0.6-0.8倍体积的异丙醇，轻轻混合直到DNA沉淀下来，沉淀可稍加离心。
6. 沉淀用1ml的70%乙醇洗涤后，离心弃乙醇，在洁净工作台中稍加干燥，重溶于20ul TE 缓冲液(含RNaseA﹤25ng/ml)中，准备电泳检测。
（二）琼脂糖凝胶电泳1. 制胶：称取琼脂糖粉末，置于三角瓶中，加入TAE缓冲液配成0.8%的浓度，加热使琼脂糖全部融化于缓冲液中，待溶液温度降至65℃时，立即倒入制胶槽中，插入样品梳。
在室温放置0.5-1h，待凝胶全部凝结后，轻轻拔出样品梳。
然后在电泳槽中加入电泳缓冲液直到没过凝胶为止。
2. 加样：取0.5-1 ug 左右的样品，体积为10-20ul，加入1/4体积的溴酚兰-甘油指示剂，混匀后小心地加到样品槽中。
同时另取一个已知分子量的标准DNA水解液，在同一凝胶板上进行电泳。
3. 电泳：维持恒压100V，电泳0.5-1h，直到溴酚兰指示剂移动到凝胶底部，停止电泳。
4. 染色：将凝胶取出后浸入0.5mg/ml 溴乙啶溶液中，染色0.5-1h。
染液可反复多次使用。
5. 观察：将凝胶板置于254nm波长紫外灯下进行观察。
DNA存在的位置呈现橙黄色荧光。
【注意事项】1. 溴乙啶有毒，配制和使用溶液时要戴手套，勿将溶液滴洒在台面或地面上。
溴乙啶溶液于室温保存在棕色瓶中。
2. 倒凝胶板时不要太厚，否则影响电泳效果。
细菌基因组DNA提取方法综述细菌基因组DNA的提取方法综述，提供了5种方法。
1 快速微量提取法A.取1.5ml菌体培养物于一灭菌Ep管中，12000rpm离心1min, 丢去上清夜，收集菌体。
B.加入400ul裂解液（40mMTris-醋酸，20mM醋酸钠,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8）混匀,置于37oC水浴1hr。
C.然后加入200ul5mol/L的氯化钠溶液，混匀后于13000rpm离心15min。
D.取上清液，用苯酚抽提2次，氯仿抽提1次。
E.加两倍体积无水乙醇，1/10体积醋酸钾(3M ,pH8.0)，-20度保存1小时后，13000rpm离心15min，弃上清液，沉淀用70%乙醇洗2次；置于室温干燥后，溶于50ulTE溶液中，置4℃保存备用。
2 蛋白酶/SDS法制备先用10ml含适当抗生素的GBM过夜培养Delftia sp.，第二天4000rpm离心10min收集菌体，用Washing TE（50mmol/LTris-HCl pH8.0,10mmol/LEDTA pH8.0）洗菌体2次，之后将菌体充分悬浮在5ml 1×TE缓冲液中，先后加入0.5ml 5mg/L的蛋白酶、0.5ml 10% SDS，轻轻混匀后50℃放置3h~5h，接着用等体积的Tris饱和苯酚抽提2次，苯酚/氯仿/异戊醇抽提一次，氯仿抽提一次后，乙醇沉淀DNA，用自动移液器吸管头将絮状DNA沉淀块吸附到Ep管中，70%乙醇洗2次，干燥后溶于适当1×TE或ddH2O中。
31) 细菌培养：细菌接种于5ml液体培养基中，37℃摇床（300rpm）培养过液。
2) 细菌收集：取1ml培养物于1.5ml EP管中，室温8000rpm离心5min，弃上清，沉淀重新悬浮于1ml TE（pH8.0）中（用ddH2O也行)。
3) 菌体裂解：加入6μl 50mg/ml的溶菌酶，37℃作用2h。
再加2mol/LNaCl50μl，10%SDS 110μl，20mg/ml的蛋白酶K 3μl，50℃作用3h或37℃过夜。
（此时菌液应为透明粘稠液体）4) 抽提：菌液均分到两个1.5ml EP管，加等体积的酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1)，混匀，室温放置5-10min。
12000rpm离心10min。
抽提两次。
（上清很粘稠，吸取时应小心，最好枪头尖应剪去）5) 沉淀：加0.6倍体积的异丙醇，混匀，室温放置10min。
1 2000rpm离心10min。
6)洗涤：沉淀用75%的乙醇洗涤。
7) 抽（凉）干后，溶于50μl ddH2O中，取2-5μl电泳。
作PCR模板用。
4. DNA EXTRACTION PROCEDURE - GENERAL1) Grow cells overnight in 500 ml broth medium.2) Pellet cells by centrifugation, and resuspend in 5 ml 50 mM Tris (pH 8.0), 50 mM EDTA.3) Freeze cell suspension at -20C4) Add 0.5 ml 250 mM Tris (pH 8.0), 10 mg/ml lysozyme to frozen suspension, and let thaw at room temperature. When thawed, place on ice for 45 min.5) Add 1 ml 0.5% SDS, 50 mM Tris (pH 7.5), 0.4 M EDTA, 1 mg/ml proteinase K. Place in 50C water bath for 60 min.6) Extract with 6 ml Tris-equilibrated phenol and centrifuge at 10,000X g for 15 min. Transfer top layer to new tube (avoid interface). Re-do this step if necessary.7) Add 0.1 vol 3M Na acetate (mix gently), then add 2 vol 95% ethanol (mix by inverting). Spool out DNA and transfer to 5 ml 50 mM Tris (pH 7.5), 1 mM EDTA, 200 g/ml RNase. Dissolve overnight by rocking at 4C.8) Extract with equal volume chloroform (mix by inverting) and centrifuge at 10,000X g for 5 min. Transfer top layer to a new tube.9) Add 0.1 vol 3M Na acetate (mix gently), then add 2 vol 95% ethanol (mix by inverting).10) Spool out DNA and dissolve in 2 ml 50 mM Tris (pH 7.5), 1 mM EDTA.11) Check purity of DNA by electrophoresis and spectrophotometric analysis.51) 100ml 细菌过夜培养液, 5000rpm离心10分钟, 去上清液。
