细胞基因组DNA的提取.ppt
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真核细胞基因组DNA的提取与鉴定一、目的要求掌握真核细胞基因组DNA的提取方法,掌握紫外分光光度法测定DNA含量的方法和DNA电泳方法。
重点实践植物 DNA 的抽提,掌握 CTAB 法快速抽提白三叶草 DNA 。
二、基本原理植物DNA的抽提常采用两种方法:(1)SDS 法:离子去污剂,过程长,纯度高;(2)CTAB 法:该方法简便、快速,DNA产量高(纯度稍次,适用于一般分子生物学操作) 。
CTAB是一种非离子去污剂,植物材料在CTAB的处理下,结合65℃水浴使细胞裂解、蛋白质变性、DNA被释放出来。
CTAB与核酸形成复合物,此复合物在高盐(>0.7mM )浓度下可溶,并稳定存在,但在低盐浓度(0.1-0.5mM NaCl )下CTAB-核酸复合物就因溶解度降低而沉淀,而大部分的蛋白质及多糖等仍溶解于溶液中。
经离心弃上清后,CTAB-核酸复合物再用70-75%酒精浸泡可洗脱掉CTAB。
再经过氯仿/ 异戊醇(24:1) 抽提去除蛋白质、多糖、色素等来纯化DNA,最后经异丙醇或乙醇等DNA沉淀剂将DNA 沉淀分离出来。
现生物试剂公司多依据此原理,经过改造,以吸附膜吸附DNA,除去杂质,从而减少了使用有害药品氯仿抽提的步骤。
琼脂糖凝胶电泳是分离、鉴定和纯化DNA片段的标准方法之一。
琼脂糖是从海藻中提取出来的一种线状高聚物,将其熔化在所需缓冲液中使成清澈、透明的溶液,然后倒入胶模令其固化。
不同浓度的琼脂糖形成的固体基质具有不同的密度(或孔隙度),因此适宜分离不同大小的DNA片段。
在电场中,DNA分子主要因其分子大小不同而被分离。
三、实验步骤(具体见试剂盒操作说明)植物基因组DNA的提取(参考步骤)1.采集适量幼嫩叶片,用液N2 研成粉末,0.4 g 装入1.5ml 离心管中(-20 ℃预冷)。
2.预热 1.5 ×CTAB 到95 ℃,加1ml 到装有叶片粉末的离心管中,混匀(防止冻融)。
细胞基因组dna提取一、细胞基因组DNA提取的概念细胞基因组DNA提取是指从生物体内的细胞中提取出其基因组DNA,以便进行分子生物学实验。
DNA提取是许多分子生物学技术和实验的前提,如PCR、限制性酶切、电泳等。
二、细胞基因组DNA提取的原理1. 细胞破碎:将细胞破碎以释放DNA。
可以使用机械方法(如超声波)、化学方法(如溶液中加入洗涤剂)或酶解方法(如加入蛋白酶)等方式进行破碎。
2. DNA分离:将破碎后的混合物离心,使得DNA沉淀到底部。
然后通过去除上层液体和洗涤沉淀来纯化DNA。
3. DNA溶解:将沉淀的DNA溶解在适当的缓冲液中,以便进行后续实验操作。
三、细胞基因组DNA提取的步骤1. 收集样品:收集需要提取DNA的样品,如血液、组织或菌落等。
2. 细胞破碎:使用适当的方法对样品中的细胞进行破碎,释放出DNA。
3. 清洁DNA:通过离心等方法将DNA沉淀到底部,去除上层液体和洗涤沉淀来清洁DNA。
4. 溶解DNA:将沉淀的DNA溶解在适当的缓冲液中,以便进行后续实验操作。
四、细胞基因组DNA提取的影响因素1. 样品来源:不同的样品来源对细胞基因组DNA提取有不同的影响。
如血液、组织或菌落等。
2. 细胞数量:细胞数量越多,提取到的DNA量越多。
3. 细胞类型:不同类型的细胞具有不同的细胞壁和膜结构,需要采用不同的破碎方法。
4. 存储条件:样品在收集后需要妥善存储,避免样品受到污染或降解。
五、细胞基因组DNA提取常用方法1. CTAB法:CTAB法是一种化学法,使用CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)来裂解细胞壁和膜,并与核酸结合形成复合物。
该方法适用于高含量多酚类物质的样品。
2. 盐溶法:盐溶法是一种简单易行的方法,使用盐和洗涤剂来裂解细胞壁和膜,并与核酸结合形成复合物。
该方法适用于低含量多酚类物质的样品。
3. 商业化试剂盒:商业化试剂盒是一种快速方便的DNA提取方法,通过购买商业化试剂盒来进行DNA提取。
动物组织细胞基因组DNA提取一、实验原理真核生物的一切有核细胞(包括培养细胞)都能用来制备基因组DNA。
真核生物的DNA 是以染色体的形式存在于细胞核内,因此,制备DNA的原则是既要将DNA与蛋白质、月旨类和糖类等分离,又要保持DNA分子的完整。
提取DNA的一般过程是将分散好的组织细胞在含SDS(十二烷基硫酸钠)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白质,再用酚和氯仿/异戊醇抽提分离蛋白质,得到的DNA溶液经乙醇沉淀使DNA从溶液中析出。
蛋白酶K的重要特性是能在SDS和EDTA(乙二胺四乙酸二钠)存在下保持很高的活性。
在匀浆后提取DNA的反应体系中,SDS可破坏细胞膜、核膜,并使组织蛋白与DNA分离,EDTA则抑制细胞中Dnase的活性;而蛋白酶K可将蛋白质降解成小肽或氨基酸,使DNA 分子完整地分离出来。
二、仪器及试剂1. 仪器:恒温水浴锅、台式离心机、紫外分光光度计(GeneQuant)、移液器、玻璃匀浆器、离心管(灭菌)、吸头(灭菌)2. 试剂:(1)细胞裂解缓冲液:Tris(pH8.0)100mmol/LEDTA(pH8.0)500mmol/LNaCL20mmol/LSDS10%胰RNA酶20ug/ml(2)蛋白酶K:称取20mg蛋白酶k溶于1ml灭菌的双蒸水中,C20°C备用。
(3)TE缓冲液(pH8.0):高压灭菌,室温贮存。
(4)酚?氯仿?异戊醇(25:24:1)、(5)异丙醇、冷无水乙醇、70%乙醇、灭菌水。
三、操作步骤1.取新鲜或冰冻动物组织块0.1g(0.5cm3),尽量剪碎。
置于玻璃匀浆器中,加入1ml的细胞裂解缓冲液匀浆至不见组织块,转入1.5ml离心管中,加入蛋白酶K(500ug/ml)20pl,混匀。
在65C恒温水浴锅中水浴30min,也可转入37C水浴12〜24h,间歇振荡离心管数次。
于台式离心机以12000rpm离心5min,取上清液入另一离心管中。
2•加2倍体积异丙醇,倒转混匀后,可以看见丝状物,用100ul吸头挑出,凉干,用200ulTE 重新溶解。