实验8_植物基因组DNA的提取20101104
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基因组dna提取实验报告基因组 DNA 提取实验报告一、实验目的本次实验的主要目的是从不同的生物样本中提取高质量的基因组DNA,以便进行后续的分子生物学实验,如 PCR 扩增、基因测序等。
通过本次实验,掌握基因组 DNA 提取的基本原理和操作方法,了解影响 DNA 提取质量的因素,并对提取的 DNA 进行质量检测和分析。
二、实验原理基因组DNA 提取的基本原理是利用细胞裂解液破坏细胞膜和核膜,使细胞内的物质释放出来,然后通过蛋白酶 K 消化蛋白质,去除 RNA 等杂质,再利用酚/氯仿等有机溶剂抽提,将蛋白质、多糖等杂质去除,最后通过乙醇沉淀或异丙醇沉淀得到纯净的基因组 DNA。
三、实验材料与试剂(一)实验材料1、新鲜的动物组织(如肝脏、肌肉等)2、植物叶片3、细菌培养物(二)实验试剂1、细胞裂解液(含 TrisHCl、EDTA、NaCl、SDS 等)2、蛋白酶 K3、酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)4、无水乙醇5、 70%乙醇6、 RNA 酶 A7、 3M 醋酸钠(pH 52)8、 TE 缓冲液(10 mM TrisHCl,1 mM EDTA,pH 80)(三)实验仪器1、离心机2、移液器3、恒温水浴锅4、紫外分光光度计5、电泳仪及电泳槽四、实验步骤(一)动物组织基因组 DNA 提取1、取约 01g 新鲜的动物组织,放入 15ml 离心管中,加入 1ml 细胞裂解液,用剪刀将组织剪碎,然后在冰上放置 10min。
2、向离心管中加入20μl 蛋白酶 K(20mg/ml),充分混匀,在 55℃水浴锅中孵育过夜,直至组织完全消化。
3、加入等体积的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),轻轻颠倒离心管10min,使溶液充分混匀。
4、 12000rpm 离心 10min,将上清液转移到新的离心管中。
5、重复步骤 3 和 4 一次。
6、向上清液中加入 1/10 体积的 3M 醋酸钠(pH 52)和 2 倍体积的无水乙醇,轻轻颠倒离心管,可见白色的 DNA 沉淀出现。
题目:植物基因组DNA的提取与检测一、实验目的1.了解真核生物基因组DNA提取的一般原理;2.掌握基因组DNA提取的方法和步骤。
二、实验原理1.在液氮中对植物组织进行研磨,破碎细胞;2.SDS等离子型表面活性剂能溶解膜蛋白而破坏细胞膜,使核蛋白解聚,从而使DNA游离出来;3.苯酚和氯仿等有机溶剂能使蛋白质变性,并使抽提液分相,因核酸水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质;4.上清液中加入异丙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于TE缓冲液中,即得植物基因组DNA 溶;5.DNA的琼脂糖凝胶电泳鉴定:带电荷的物质,在电场中的趋向运动称为电泳。
DNA的琼脂糖凝胶电泳可以分离长度为200bp至近50kb的DNA分子。
DNA的迁移率(U)的对数与凝胶浓度(T)之间存在反平行线性关系。
因此,要有效地分离不同大小的DNA片段,选用适当的琼脂糖凝胶浓度是非常重要的。
三、实验材料1.设备移液器,台式高速离心机,水浴锅,陶瓷研钵,1.5ml离心管2.材料植物幼嫩叶片3.试剂(1)细胞提取液:100mmol/L Tris-HCl, pH8.0, 5mmol/L EDTA, 500mmol/L NaCl, 1.25% SDS,1%β-巯基乙醇(去除酚类)(2)氯仿:异戊醇(24:1)(3)其它试剂:液氮、无水乙醇、 TE缓冲液、异丙醇、洗涤缓冲液四、方法和步骤1、取500μL细胞提取液于650C水浴(金属浴)中加热备用;2、研钵用液氮预冷,新鲜植物叶片(自来水清洗,蒸馏水冲洗干),去除叶脉,剪成细条状,置于研钵中研磨成粉末状(越细越好);3、取0.1g粉末(大约两勺半)转移至500μL预热的细胞提取液中,迅速摇匀,650C 水浴(金属浴)中保温30min,10min左右温和颠倒混匀一次;第 1 页题目:植物基因组DNA的提取与检测4、从水浴(金属浴)中取出离心管,加等体积(约500μL)氯仿/异戊醇(24:1),室温下10000rpm×10min;5.将上清液转移到另一1.5mL离心管中(使用的枪头用剪刀剪成大口),加等2/3体积的异丙醇,轻轻混匀,静置1min,使核酸沉淀下来,12000r/min× 5min,倒掉上清液;6、加入1ml洗涤缓冲液,轻轻转动离心管使核酸沉淀悬浮起来,静置5min,12000r/min × 2min,去除上清液,再加入1ml洗涤缓冲液,轻轻转动离心管使核酸沉淀悬浮起来,放置5min;7、12000r/min× 10min后,倒去上清液,用小滤纸条将管壁上多余的水分吸掉,室温静置干燥;8、干燥后,加入20μLTE缓冲液,溶解DNA,做好标记;9、取5μL溶液,0.7%琼脂糖凝胶电泳检测DNA大小和质量。
植物基因组dna的提取实验报告植物基因组DNA的提取实验报告引言:DNA提取是生物学研究中的基础实验之一,它可以帮助我们了解植物的遗传信息和基因组结构。
本实验旨在通过提取植物基因组DNA,探索DNA的提取方法以及其在植物基因研究中的应用。
材料与方法:1. 实验材料:新鲜植物叶片、细碎器、提取液(含有细胞裂解酶、蛋白酶K和盐酸)、离心管、离心机、冰浴装置、乙醇、磷酸盐缓冲液等。
2. 实验步骤:- 步骤一:取一片新鲜植物叶片,用细碎器将其细碎成细小颗粒。
- 步骤二:将细碎的植物组织转移到离心管中,并加入适量的提取液。
- 步骤三:将离心管放入冰浴装置中,在4℃下反应30分钟。
- 步骤四:离心管中的混合液离心10分钟,将上清液转移到新的离心管中。
- 步骤五:加入等体积的冷乙醇,轻轻摇晃离心管,使DNA沉淀。
- 步骤六:用微量移液器将DNA沉淀转移到新的离心管中。
- 步骤七:加入适量的磷酸盐缓冲液溶解DNA。
结果与讨论:通过上述实验步骤,我们成功地从新鲜植物叶片中提取到了DNA。
下面将对实验结果进行讨论。
首先,实验中使用的提取液含有细胞裂解酶和蛋白酶K。
细胞裂解酶可以破坏细胞膜,使细胞内容物释放出来,而蛋白酶K则能降解蛋白质,避免其对DNA的影响。
这两种酶的作用协同进行,为DNA的提取提供了基础。
其次,实验中的冰浴装置和离心机的使用是为了维持低温和分离混合液中的固体和液体。
低温可以减缓酶的活性,防止DNA的降解。
离心则可以将细胞碎片和其他杂质沉淀下来,使上清液中富含DNA。
最后,实验中的乙醇是用来沉淀DNA的。
加入乙醇后,DNA会与乙醇结合形成白色沉淀物。
通过轻轻摇晃离心管,可以帮助DNA更好地沉淀。
而且,乙醇的加入还能帮助去除杂质,使得提取到的DNA更纯净。
DNA的提取是植物基因研究的重要步骤之一。
通过提取到的DNA,我们可以进行一系列的遗传学研究,如PCR扩增、DNA测序等。
此外,DNA的提取还可以用于植物种质资源的鉴定和保护,以及基因工程的应用等领域。
实验二、植物基因组DNA的小量提取【实验目的】掌握植物总DNA的抽提方法和基本原理。
学习根据不同的植物和实验要求设计和改良植物总DNA抽提方法。
【实验原理】通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,由于植物细胞匀浆含有多种酶类(尤其是氧化酶类)对DNA的抽提产生不利的影响,在抽提缓冲液中需加入抗氧化剂或强还原剂(如巯基乙醇)以降低这些酶类的活性。
在液氮中研磨,材料易于破碎,并减少研磨过程中各种酶类的作用。
十二烷基肌酸钠(sarkosyl)、十六烷基三甲基溴化铵(hexadyltrimethyl ammomum bromide,简称为CTAB)、十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,简称SDS)等离子型表面活性剂,能溶解细胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,从而使DNA得以游离出来。
再加入苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性,并使抽提液分相,因DNA水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。
上清液中加入无水乙醇使DNA沉淀,沉淀DNA溶于TE溶液中,即得植物总DNA 溶液。
【实验材料】拟南芥叶片【试剂和器材】DNA提取液(1L):称取24.228 g Tris-HCl(0.2 M, pH=9.0),LiCl 16.956 g(0.4 M),EDTA 9.306 g(2.5 mmol/L),全部溶解完全后加入10 g SDS先加入少量双蒸水搅拌至透明定容。
器材:研钵,恒温水浴,离心机,离心管等。
【实验步骤】1、剪取新鲜幼嫩的植物叶片1~2片于1.5 mL离心管中.2、先加入少量的DNA提取液100 μL,用研磨棒充分研磨尽量避免提取液溅出。
3、再加入600 μL的DNA提取液,使DNA提取液的总体积为700 μL,上下颠倒混合均匀。
4、放入高速离心机4 ℃条件下12 000 rpm离心15 min。
5、取上层水相,移入标有相应序号的新的离心管中,加入600 μL的异丙醇(与加入DNA提取液的总体积相同),上下颠倒混匀。
植物基因组D NA 提取2ml 离心管提取取新鲜叶片采用C TAB 法,按M urry 等{Murray, 1980 #9}的方法,略加改进,具体操作过程如下:1. 2.0 ml 离心管加入离心管盖大小新鲜叶片2片;2. 液氮充分研磨成粉末,加入900 µL CTAB 缓冲液;3. 65 ℃水浴1小时,期间摇匀3次;4. 置于4℃冰箱冷却至15 ℃以下;5. 加入900 µL25: 24:1 酚/氯仿/异戊醇,上下混匀2-5 分钟,保证样品与氯仿充分混合;6. 12,000 rpm 离心20-30 分钟;7. 取上清液约800 µL,加入预先加好的700 µL 异丙醇的1.5 ml 离心管中,轻轻上下颠倒混匀;8. -20℃冰箱静止30 分钟以上;9. 12,000 rpm 离心15-20 分钟,弃上清夜;10. 75%酒精洗涤沉淀,弃上清液,12,000 rpm 离心15-20 分钟;11. 风干D NA,让酒精挥发干净(4 小时以上或过夜);12. 加入100 µL 的纯水(含终浓度为1%RNase)溶解D NA;13. 放入37 ℃环境中,约60 分钟消化R NA;14. 取2 µL DNA 进行检测。
50ml 离心管提取取新鲜叶片采用C TAB 法,按M urry 等{Murray, 1980 #9}的方法,略加改进,具体操作过程如下:1. 取新鲜叶片在研钵用液氮研磨成粉末;2. 向50ml 离心管里加入叶片粉末,至刚好覆盖住管圆底部,加入20mlCTAB 缓冲液充分混匀;3. 65 ℃水浴1小时,期间摇匀3次;4. 取出,冷却至15 ℃以下;5. 加入20ml 的25: 24:1 酚/氯仿/异戊醇,上下混匀2-5min,保证样品与氯仿充分混合;6. 4500rpm 离心40 分钟;(如不需要抽提第2次,可直接到9步骤)7. 小心吸取上清液至新的50ml 离心管中,加入20ml 的氯仿溶液,混匀2-5min左右8. 4500rpm 离心40 分钟;9. 取上清液于50ml 离心管中,加入等体积的异丙醇,轻轻上下颠倒混匀,此时会看到絮状沉淀;10. -20℃冰箱静止30min 以上;11. 4500rpm 离心40min,弃上清夜;12. 加入5ml 的75%酒精洗涤沉淀,4500 rpm 离心30min,弃上清液;13. 风干D NA,让酒精挥发干净(4 小时以上或过夜);14. 加入约300 µL 的纯水(含终浓度为1%RNase)溶解D NA;15. 放入37 ℃环境中,约60min 消化R NA;16. 取2 µL DNA 进行检测。
实验一植物基因组DNA提取一、目的与原理DNA是绝大多数生物(除少数RNA病毒外)储存、传递信息的生物大分子。
为了进行DNA 分子的体外重组,必须提取具有天然结构并具有一定长度的DNA大分子。
提取分离DNA大分子,有酚法,氯仿一异丙醇法、酶法、SDS法、CTAB法等方法。
主要操作都是围绕如何尽可能除尽结合蛋白质和多糖等杂质,本实验的目的是介绍CTAB法。
CTAB 法提取基因组DNA 原理:CTAB 是一种非离子去污剂。
CTAB 与核酸形成复合物,此复合物在高盐(>0.7mM)浓度下可溶,并稳定存在,但在低盐浓度(0.1-0.5 mM NaCl)下CTAB-核酸复合物就因浓度降低而沉淀,而大部分的蛋白质及多糖等仍溶解于溶液中。
经离心弃上清后,CTAB-核酸复合物再用75%酒精浸泡可洗脱掉CTAB。
二、实验材料、仪器和试剂(一) 实验材料:新鲜的植物叶片(水稻叶子),适量液氮(二) 试剂:(1)EDTA溶液(0.5M、pH=8.0、500 mL)(2)Tris·HCl溶液(1.0 M、pH=8.0、500 mL)(3)2%CTAB抽提液(pH=8.0、500 mL)①称取CTAB粉末10.000 g,NaCl粉末40.908 g,PVP 405.000 g;②0.5M EDTA溶液20 mL;1.0M Tris·Cl溶液50 mL;③定溶至500 mL,121℃高压灭菌后,常温放置,待用。
(4)1×TE缓冲液(pH=8.0、200 mL)(5)RNase(10 mg/mL)1.5 mL离心管(121℃高压灭菌),加入0.015 g RNase,15μL 1M Tris·Cl溶0.001305 gNaCl(几小粒),无菌ddH2O(重蒸水)定容至1.5 mL,100℃煮15min;低温放置,待用。
(RNaseA,Sigma,M=487.5)。
(三)仪器通风橱、天平、离心机、摇床、微量移液器、水浴锅、研钵三、植物组DNA提取步骤1.准备工作。
植物基因组dna的提取实验报告
实验报告:
实验目的:
本实验旨在从植物样品中提取基因组DNA,为后续的分子生物学研究打下基础。
实验原理:
基因组DNA提取是利用化学或物理方法将细胞壁和细胞膜溶解,使基因组DNA裸露并获得。
提取过程包括浸泡、分离、洗涤、溶解等步骤。
具体步骤如下:
取所需植物材料,洗净、切碎样品;
加入提取缓冲液(Tris-HCl pH 8.0,EDTA,SDS,NaCl),使样品充分混合,破坏细胞膜和核膜;
加入蛋白酶K,分解蛋白质,避免DNA被酶水解;
加入异丙醇或氯仿使蛋白质、核酸等组分分层,去除上层杂质;
加入70%乙醇将DNA沉淀,并进行清洗和干燥;
加入TE缓冲液(Tris-HCl pH 8.0, EDTA)溶解DNA。
实验步骤:
取植物样品(番茄、酸枣等)粉碎,加入4ml提取缓冲液,放入离心管中;
加入1μl蛋白酶K,轻轻颠倒离心管使样品混合均匀;
培养30分钟于65°C恒温器内;
加入1ml氯仿并振荡10次后,离心5分钟,将上层液体转移至新的离心管中;
加入1ml异丙醇,并离心5分钟,将上层液体转移至新的离心管中;
加入1ml70%乙醇,并离心5分钟,将上层液体倒掉,留下沉淀;
加入1ml去离子水,将沉淀溶解,得到DNA提取液。
实验结果:
经过以上步骤,成功从植物样品中提取到基因组DNA。
通过分光光度法检测DNA浓度为200 ng/μl,纯度可达到A260/A280=1.8。
结论:
本实验成功从植物样品中提取到基因组DNA,提取效果良好,为后续的分子生物学实验打下基础。