C在干细胞表观遗传药理学中的调控作用
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表观遗传学的作用及其在医学中的应用表观遗传学是关于基因表达和细胞特异性的研究领域,它研究的是从DNA到RNA和蛋白质表达之间的调控和过程。
表观遗传学在医学中有广泛的应用,这篇文章将深入探讨表观遗传学的作用和在医学中的应用。
一、表观遗传学的作用表观遗传学的作用十分重要,因为它可以由遗传形式产生的多样性。
1.1 分化表观遗传学被用来解释为什么一个单一的DNA序列能够驱动产生不同细胞类型取决于DNA的表达方式或“选择性地表达子集”。
这是在起初阶段即从胚胎干细胞发育到成熟的多种细胞类型时非常重要的。
1.2 在分裂中修改表观遗传学是在细胞分裂中实现的,因为细胞分裂会影响细胞内一些基因的表达。
因此,表观遗传学可以使细胞命运保持不变。
例如,在人体的代谢细胞中,由于表观遗传学作用于某些基因使其表达受到抑制,因此它们不能转变为其他类型的细胞。
1.3 学习和记忆表观遗传学在人类行为方面也起着重要作用。
神经细胞可以建立记忆和新的学习体验,这主要是由表观遗传学提供的蛋白质反应和化学反应导致的。
二、表观遗传学在医学中的应用在医学领域,表观遗传学有许多应用。
我们现在将介绍一些与表观遗传学相关的医学应用。
2.1 研究疾病的新机制表观遗传学提供了研究疾病的新机制的途径。
对于许多疾病,基因测序和外显子测序已被广泛使用。
但是,在很多情况下,表观遗传的变化也会导致疾病的发生。
例如,在多种癌症中,DNA 甲基化的增加会导致癌细胞的不规律增长。
因此,研究表观遗传学机制可提供治疗癌症的新靶点。
2.2 治疗某些心脏疾病心脏疾病是全球范围内的重大健康问题之一。
表观遗传学也在这方面发挥着重要作用。
研究表明,在某些心脏病中,基因表达的表观遗传修饰发生了改变,这可以给疾病的治疗带来新思路。
通过限制或改善表观遗传的变化,例如使用已知的表观遗传抑制剂等,可以对疾病的发生和发展进行干预。
因此,表观遗传学的发现对心血管疾病的治疗和预防提供了新的机会。
2.3 研究先天性免疫系统疾病表观遗传学也被用于研究先天性免疫系统疾病。
原发性肝癌(HCC)的表观遗传学调节与靶向治疗策略肝细胞肝癌(Hepatocellular carcinoma, HCC )是原发性肝癌的主要病理类型,是我国常见的恶性肿瘤之一。
最新研究表明,肝癌全球发病率位居所有肿瘤的第 5位、病死率位居第 3位。
然而,目前肝癌的发病机制并不完全清楚,以往研究认为,遗传学改变是肝癌发生的关键环节之一,随着研究的深入,越来越多的研究表明肿瘤异质性这一重要特征在肝癌的发生、发展中起重要作用。
多项研究表明,表观遗传修饰通过对致癌基因与抑癌基因的表观调节参与HCC的增殖与转移,表观遗传修饰同时亦是HCC药物研究的一个重要的靶点。
miRNA是一类短序列、非编码、具有调控功能的单链小分子RNA,miRNA在肿瘤干细胞自我更新和肿瘤进展中发挥着重要作用。
miRNA调节转录后的基因表达,初始miRNA由RNA聚合酶II产生,并由RN酶III介导前体mRNA(pre-miRNA)的产生。
随后pre-miRNA由膜转运蛋白(exportin)被转运至胞浆。
miRNA的异常表达与多种肿瘤的进展和转移有关。
上皮间质转化(EMT)相关的miRNATGF-β信号通路相关的miRNATGF-β信号在EMT过程中起到非常重要的作用。
TGF-β通过激活Smad信号诱导细胞失去上皮特性,获得迁移能力。
TGF-β信号的下游基因为Smad2/3和Smad4,作为转录因子改变EMT相关基因的表达包括Snail和ZEB(锌指蛋白)。
最近的研究显示,miRNA介导的TGF-β/Smad信号通路的异常调节诱导恶性肿瘤的发展。
在HCC中常发现miRNA-542-3p和miR-142呈低表达。
Wnt信号通路相关的miRNA有多项证据表明,Wnt/β-catenin信号通路在EMT转化过程中起到重要的作用,尤其是β-catenin的核定位增加目的基因的表达,如粘纤蛋白(fibronectin)和基质金属蛋白(MMP-7),从而使得细胞拥有了间质样的表型。
遗传药理学---中南大学遗传药理研究所作者:周宏灏刘…文章来源:本站原创点击数:29046 更新时间:2008-12-26 14:36:37遗传药理学中南大学遗传药理研究所周宏灏刘洁(原载于刘耕陶主编:当代药理学,中国协和医科大学出版社,2008年5月)遗传药理学(pharmacogenetics)是研究人体先天性遗传变异引起的药物代谢酶、药物转运体和药物作用靶点功能异常,导致药物代谢和效应群体和个体差异的一门科学。
近些年来,遗传药理学已成为生命科学中发展迅速和备受关注的研究领域。
这是因为它从基因到基因的表达来解释药物治疗效应和不良反应的根本机理,因为它运用分子生物学的最新技术和方法来研究药物的作用,也因为它把从分子水平的学科到临床水平的学科,包括药理学、生理学、遗传学、基因组学、临床医学、流行病学、统计学、生物信息学、生物计算机学等多学科联合到一起来阐明药物的作用和作用机理。
药物反应个体差异是临床药物治疗中常见的普遍现象,因此,目前运用的传统药物治疗模式,即根据疾病的诊断实行“一病一药一剂量”治疗方案常常在部分病人中或是无效、或是发生严重不良反应甚至毒性反应。
引起药物反应个体差异的原因很多,有性别、年龄、伴随的疾病、体重等,而其中尤为重要的是遗传因素,而这恰恰被忽视。
随着新世纪的到来和生命科学的迅猛发展,人类对药物治疗的要求发生了重大变化。
人类基因组计划的实施和进展,促进了遗传药理学和药物基因组学(pharmacogenomics)的发展。
近20年来遗传药理学的研究证实了药物代谢酶、转运体和药物作用靶点的基因多态性是药物反应个体差异的原因,阐明了药物处置和效应差异的遗传本质。
药物基因组学是应用已获得的遗传信息预测药物治疗结果(治疗性和毒性作用),以促进药物的开发,并为以每个病人的基因结构为基础的合理药物治疗提供科学依据。
从而使药物治疗模式开始由过去的诊断导向治疗(diagnosis-directed drug therapy)向根据个体的遗传结构实行基因导向性治疗(gene-directed drug therapy)的新模式转换,美国华尔街日报敏锐地于1999年4月16日以“针对个人独特的遗传特征的个体化用药的新时代”(New era of personalized medicine: targeting drugs for each unique genetic profile)为题以头条报道了这一新的动态。
细胞分化的表观遗传调控机制细胞分化是多细胞生物发育过程中的一项关键过程,它使得幼体的细胞从未分化状态进一步发育为不同类型的细胞。
细胞分化是一个高度调控的过程,其中一个关键机制就是表观遗传调控。
表观遗传调控是指通过调控基因组DNA外部修饰和染色质的结构来影响基因的表达状态,从而决定细胞的功能和特性。
本文将介绍细胞分化的表观遗传调控机制及其在个体发育和疾病中的重要性。
一、DNA甲基化调控细胞分化DNA甲基化是最早也是最为广泛研究的一种表观遗传修饰。
DNA甲基化是指在DNA分子中加入甲基基团,主要发生在CpG二核苷酸位点上。
在细胞分化过程中,DNA甲基化状态的改变可以激活或抑制特定基因的表达。
研究发现,在干细胞中,未分化状态的基因往往处于去甲基化状态,使得这些基因保持沉默。
当细胞进入分化状态时,特定的基因会经历DNA去甲基化和DNA重新甲基化过程,这使得相关基因的表达被激活。
因此,DNA甲基化在细胞分化过程中起到了重要的调控作用。
二、组蛋白修饰对细胞分化的影响除了DNA甲基化外,组蛋白修饰也是表观遗传调控的重要方式之一。
组蛋白是核小体的主要组成部分,通过对组蛋白分子进行修饰,可以改变染色质的结构和可及性,从而影响基因的表达状态。
组蛋白修饰主要包括甲基化、乙酰化、泛素化等多种类型。
在细胞分化过程中,不同的组蛋白修饰方式可以导致不同的基因表达模式。
例如,乙酰化修饰通常与基因的活化相关,而甲基化修饰则与基因的沉默相关。
通过对组蛋白修饰的研究,科学家们可以更好地理解不同类型细胞的分化过程,并寻找特定基因调控的靶点,以实现对细胞分化的精确调控。
三、非编码RNA在细胞分化中的作用近年来,越来越多的研究表明,非编码RNA在细胞分化过程中发挥了重要的调控作用。
非编码RNA是指不被翻译为蛋白质的RNA分子。
通过调控转录后水平的基因表达,非编码RNA可以影响多种细胞过程,包括细胞分化。
其中,长链非编码RNA(lncRNA)是研究最为广泛的一类非编码RNA。
植物根尖干细胞的表观遗传调控唐艺璇; 皮利民; 朱玉贤【期刊名称】《《植物科学学报》》【年(卷),期】2019(037)005【总页数】8页(P682-689)【关键词】根尖干细胞; 表观调控; 染色质修饰; 多能性【作者】唐艺璇; 皮利民; 朱玉贤【作者单位】武汉大学生命科学学院武汉430070; 武汉大学高等研究院武汉430070【正文语种】中文【中图分类】Q943.2植物干细胞是一类能自我更新并且具有分化为不同细胞类型潜能的细胞,其命运受周围相邻细胞的调控。
由这些相邻细胞形成的特殊微环境被称之为干细胞巢(stem cell niche,SCN)。
一个干细胞通过有丝分裂产生两个子细胞。
与巢细胞相邻的细胞仍旧保持未分化属性,形成新的干细胞;而另外一个子细胞脱离干细胞巢,开始分化为具有执行特定生理功能的成熟细胞。
根作为植物最重要的器官之一,负责植株的固定以及营养和水分的吸收。
根的生长发育依赖于根尖分生组织(root apical meristem,RAM)细胞的持续分裂和分化。
根尖中央的2 ~ 4个细胞很少进行有丝分裂,被称之为静止中心(quiescent center,QC)。
围绕静止中心的一层细胞为分裂较为旺盛的干细胞[1]。
干细胞经不对称分裂产生子代细胞,子代细胞又经数代有丝分裂后分化成成熟的不同细胞类型。
由外周向内依次为侧根冠(lateral root cap)、表皮(epidermis)、皮层(cortex)、内皮层(endodermis)和中柱(stele)。
静止中心往下一层细胞为小柱干细胞(columella stem cell,CSC),其分裂后形成小柱细胞[1, 2]。
静止中心以一种非细胞自主性(non-cell autonomous)的方式维持了周围干细胞的未分化状态[3, 4]。
这种植物干细胞巢的组织和调控方式与动物中干细胞巢有较大的相似性。
由DNA和组蛋白组成的核小体是染色质的基本单位。
多种表观遗传修饰的功能阐述表观遗传修饰是指非DNA序列本身的改变,例如DNA甲基化、组蛋白修饰等,这些改变对基因表达和细胞发育起着非常重要的调控作用。
本文将从多个方面解析表观遗传修饰的功能。
DNA甲基化:基因沉默和组织特异性表达的关键DNA甲基化是表观遗传修饰中最早被研究的一种。
在DNA甲基化过程中,甲基转移酶将甲基基团转移给DNA中的胸腺嘧啶(C),形成5-甲基胸腺嘧啶(5mC)。
这种修饰往往出现在CpG二联体上,影响了某些基因的表达,导致它们在细胞中沉默。
同时,DNA甲基化还对组织特异性表达发挥了重要作用。
例如,胚胎发育过程中,DNA甲基化能够调节基因表达从而促进器官的发育。
组蛋白修饰:基因活性的调节剂组蛋白修饰是表观遗传修饰中的另一种非常重要的类型。
组蛋白修饰常常包括乙酰、甲基和磷酸化等。
在组织和细胞中,组蛋白的修饰状态和染色质结构密切相关。
例如,在组蛋白乙酰化中,基因启动子处的乙酰化水平与基因活性有很强的关联。
高水平的乙酰化往往会增强基因的表达,而低水平的乙酰化则会导致基因的沉默。
同样,在组蛋白磷酸化修饰中,磷酸化乙酸组蛋白能够促进基因转录和基因表达,同时不同的组蛋白磷酸化修饰也带来不同的基因表达调控作用。
miRNA调控:基因沉默和细胞增殖的扰动因子miRNA(microRNA)是一种大约21-25个核苷酸的非编码RNA,能够与特定靶基因的3' UTR区域结合并影响其转录后修饰和表达。
miRNA在人类疾病的发展和细胞增殖中起着重要的作用。
例如,miRNA能够沉默趋肾性肝细胞癌基因(TGF-β)等癌基因,从而抑制癌细胞的生长和扩散。
此外,miRNA miR-122还能够影响肝细胞中脂质代谢的调控。
miRNA的高通量测序技术已经使人们更深入地研究miRNA在基因表达中的作用。
表观遗传修饰在细胞分化和器官发育中的分工细胞分化和器官发育是表观遗传修饰的另一个重要领域。
在胚胎发育过程中,表观遗传修饰能够对特定的基因进行调控,引导细胞分化为不同种类的细胞,这种分化还产生一种表观记忆效应。
基因调控和表观遗传学对生物发育和进化的作用近年来,随着基因调控和表观遗传学的研究深入,科学家们对生物发育和进化的了解也逐渐深入。
基因调控和表观遗传学是控制个体发育与进化过程中基因表达的两个重要角色,这两个领域的交叉和融合,为我们对生命现象的理解提供了更深层次的解释和理论。
本文将从基因调控以及表观遗传学这两个方面,探讨它们如何对生物发育和进化发挥作用。
一、基因调控基因调控是指细胞内的信号传递机制和转录机制,在特定的时间和空间内调节基因的表达。
这种过程中,特定的基因启动子会受到外界信号的影响,进而在调节因子的介入下,将基因转录为mRNA,然后转化为蛋白质。
基因调控对于生物的信号传递、发育、生长、分化等过程都有着决定性的作用。
(1)基因调控在胚胎发育中的作用在胚胎发育过程中,基因调控是非常重要的。
在受精卵中,一系列生化反应通过特定的转录因子调控特定的基因实现了最初的细胞分化。
例如,持续表达TFAP2C和SOX2促进pluripotent干细胞(ES)细胞状态,而瞬时表达真皮和神经堆细胞的相应基因,则促进胚胎分化进入相应的发育阶段。
此外,在发育过程中,许多基因的启动子的可用性也随着胚胎的进化而发生变化。
这些基因调控所带来的可塑性,支持了胚胎发育过程中复杂而令人侧目的分化模式。
(2)基因调控对器官的发育与重建的影响基因调控也对器官的发育与重建有着决定性的作用。
以爪子的发育为例,爪子发育的过程受到一系列基因的调控,包括Wnt、Bmp、Shh、Hox和Fgf等信号通路的作用。
这一酶调控网络的受损会导致各种发育异常,如爪子弯曲、增生、缺失等不良现象。
二、表观遗传学相对于基因调控而言,表观遗传学方面的研究起步较晚,但从目前的研究中可以看出,表观遗传学在生物发育和进化的过程中,扮演着非常重要的角色。
表观遗传学是指在不改变DNA序列的情况下,通过DNA甲基化、组蛋白修饰以及microRNA等方式,调节基因的表达。
表观遗传学的作用与基因调控不同,前者的调节过程不仅仅是单纯的启动或抑制某一个基因的表达,还涉及到基因组整体的开放性与紧张度,从而决定个体在环境刺激下发育进程及进化方向的选择。
干细胞分化的分子调控机制干细胞是一种特殊的细胞类型,具有自我更新和分化成各种类型细胞的潜能。
干细胞分化的分子调控机制是非常重要的研究方向,它不仅可以帮助我们了解细胞命运决定的途径,还可以为干细胞治疗和再生医学提供指导。
在干细胞分化的过程中,有许多分子参与了不同的调控途径,这些途径相互作用,综合作用才决定了一个细胞的终极命运。
其中,调控干细胞分化最重要的是转录因子、信号通路和表观遗传学。
转录因子是一组可以控制基因表达的DNA结合蛋白。
它们通过与DNA结合,可以促进或抑制基因的转录,从而控制基因的表达。
在干细胞分化的过程中,许多转录因子都发挥了很重要的作用。
比如,Oct4、Sox2和Nanog,它们都是干细胞自我更新的关键因子。
当干细胞开始分化时,这些因子的表达量就会下降,而一些早期分化相关的转录因子的表达就会上升。
这使得干细胞很快地走向了某种细胞类型的分化。
信号通路也是干细胞分化过程中非常重要的调控途径。
它们可以通过细胞外的信号物质,传递信号到细胞内部,从而影响不同的转录因子的表达和功能。
比如,Wnt、BMP和FGF等信号通路可以通过不同的途径调控干细胞的分化命运。
Wnt信号通路可以阻止干细胞向神经分化,促进干细胞向肝脏或胆囊分化。
而BMP信号通路可以使干细胞向骨骼或肌肉分化。
FGF信号通路则可以促进干细胞向神经或血管分化。
表观遗传学也在干细胞分化过程中扮演着重要角色。
表观遗传学包括DNA甲基化、组蛋白修饰等一系列可以影响基因表达的化学修饰。
在干细胞中,表观遗传学可以通过调整染色体的状态来影响转录因子的表达和功能。
比如,在干细胞分化过程中,许多基因将被转录因子Silencer所沉默,这些基因的启动子上就会被甲基化,从而使得这些基因失去了表达的能力。
综合上述调控途径,我们可以发现,干细胞分化的分子调控机制是非常复杂的,需要不同的途径之间相互协调才能实现一个细胞的完整分化过程。
因此,把握干细胞分化的分子调控机制,不仅可以帮助我们恢复或替代缺陷的细胞类型,还可以为再生医学提供更深入的认识和指导。
生物化学表观遗传学生物化学表观遗传学是研究生物体的基因表达调控和遗传信息传递的一门学科。
它关注的是基因组上的化学修饰如何影响基因表达,并探索这些修饰如何被维持和遗传给后代。
本文将介绍生物化学表观遗传学的基本概念、作用机制以及在生命科学领域的应用。
一、基本概念生物化学表观遗传学是研究基因表达调控的一门学科。
在生物体的细胞中,基因组DNA上的化学修饰可以影响基因的活性,从而调控基因的表达。
这些化学修饰可以通过添加或去除特定的化学基团来改变染色质的结构和功能,从而影响基因的可及性和转录活性。
生物化学表观遗传学的研究内容主要包括DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质重塑等。
二、作用机制1. DNA甲基化DNA甲基化是最常见的表观遗传修饰方式之一。
它通过在DNA分子上添加甲基基团来改变基因的表达。
甲基化主要发生在CpG二核苷酸位点上,即DNA链中的Cytosine(C)与Guanine(G)之间的碱基对。
DNA甲基化可以静默基因,使得其在转录过程中难以被RNA聚合酶识别和结合,从而抑制基因的表达。
2. 组蛋白修饰组蛋白是染色质的主要组成部分,它不仅可以调控DNA的结构和可及性,还可以通过化学修饰来影响基因的表达。
组蛋白修饰包括甲基化、乙酰化、磷酸化等多种修饰方式。
例如,组蛋白乙酰化可以增强染色质的松弛度,提高基因的可及性,从而促进基因的表达。
3. 染色质重塑染色质重塑是指通过改变染色质的三维结构来调控基因的表达。
染色质在细胞核中呈现出一种高度有序的结构,不同区域的染色质紧密程度不同,从而影响基因的可及性和表达水平。
染色质重塑可以通过转录因子、非编码RNA等多种机制实现,从而调控基因的表达。
三、应用领域生物化学表观遗传学在生命科学领域有着广泛的应用。
它不仅有助于解释生物个体的发育和分化过程,还可以解析疾病的发生机制,并为疾病的预防和治疗提供新的思路。
以下是生物化学表观遗传学在几个重要领域的应用示例:1. 癌症研究生物化学表观遗传学的异常调控与肿瘤的发生和发展密切相关。
遗传学中的基因调控和表观遗传修饰遗传学是关于基因和遗传物质的研究,因此基因调控和表观遗传修饰是遗传学中的两大重要研究方向。
本文将分别从基因调控和表观遗传修饰两个方向入手,探究它们的意义和研究现状。
一、基因调控基因调控是指通过各种方式控制基因的表达来控制细胞命运和形态。
在复杂多细胞生物中,不同细胞具有不同的形态和功能,这是基因调控的结果。
通俗的说,基因调控就是管好细胞的开关,让它们按照自己的程序运转。
基因调控的方式有很多,如DNA甲基化、组蛋白修饰、转录因子结合等,这些方式不仅影响单个基因的表达,还可以影响大量基因的协同表达,因此它们对于细胞命运和形态的调控作用是至关重要的。
基因调控在医学和生命科学中具有重要的意义。
例如,在肿瘤形成过程中,基因调控机制的失衡导致了癌细胞的增殖和扩散,因此研究基因调控机制对于治疗癌症具有重要的意义。
此外,基因调控还与许多疾病的发生发展密切相关,如心血管疾病、神经系统疾病等。
在未来,研究基因调控机制将会为疾病的预防和治疗提供新的思路和方法。
目前,基因调控的研究面临许多挑战。
其中一个主要问题就是如何解析基因调控网络的复杂性。
基因调控涉及到大量的转录因子、能量代谢途径等,因此其调控过程是非常复杂的。
如何从大量的数据中提取出有意义的信息,仍然是当前研究的难点之一。
另外,由于基因调控是一个相对短期的过程,因此如何建立动态的观测和分析体系仍然需要进一步的努力。
二、表观遗传修饰表观遗传修饰是指通过改变某些化学基团的附加方式来控制DNA和组蛋白等遗传物质的结构和功能。
它是一种遗传物质的可逆性调控方式,能够直接或间接地影响基因表达和细胞命运。
表观遗传修饰包括DNA甲基化、组蛋白乙酰化、甲基化等,它们影响了基因的开放性和染色质的组织状态,从而影响基因的转录和表达。
表观遗传修饰在很多生物学过程中具有重要作用。
例如,胚胎发育过程中的细胞分化和组织形成,就受到了表观遗传修饰的严密调控。
在某些人类疾病的发生和发展过程中,表观遗传修饰也发挥了重要作用。