分子标记辅助育种技术
分子标记辅助育种技术
第一节
分子标记的类型和作用原理
遗传标记是指可以明确反映遗传多态性的生物特征。
在经典遗传学中，遗传多态性是指等位基因的变异。
在现代遗传学中，遗传多态性是指基因组中任何座位上的相对差异。
在遗传学研究中，遗传标记主要应用于连锁分析、基因定位、遗传作图及基因转移等。
在作物育种中，通常将与育种目标性状紧密连锁的遗传标记用来对目标性状进行追踪选择。
在现代分子育种研究中，遗传标记主要用来进行基因定位和辅助选择。
1、形态标记
形态标记是指那些能够明确显示遗传多态性的外观性状。如、株高、穗型、粒色等的相对差异。
形态标记数量少，可鉴别标记基因有限，难以建立饱和的遗传图谱。
有些形态标记受环境的影响，使之在育种的应用中受到限制。
2、细胞学标记
细胞学标记是指能够明确显示遗传多态性的细胞学特征。如染色体的结构特征和数量特征。
核型：染色体的长度、着丝粒位置、随体有无。
可以反映染色体的缺失、重复、倒位、易位。
染色体结构特征
带型：染色体经特殊染色显带后，带的颜色深浅、宽窄
和位置顺序,可以反映染色体上常染色质和异染
色质的分布差异。 染色体数量特征—是指细胞中染色体数目的多少。染色体数量上的
遗传多态性包括整倍体和非整倍体变异。
细胞学标记
优点：克服了形态标记易受环境影响的缺点。
缺点：
（1）培养这种标记材料需花费大量的人力物力；
（2）有些物种对对染色体结构和数目变异的耐受性差，难以获得相应的标记材料； （3）这种标记常常伴有对生物有害的表型效应；
（4）观察鉴定比较困难。
3、蛋白质标记
用作遗传标记的蛋白质分为酶蛋白质和非酶蛋白质两种。
非酶蛋白质：用种子储藏蛋白质经一维或二维聚丙烯酰胺凝胶电泳，根据显示的蛋白质谱带或点，确定其分子结构和组成的差异。
酶蛋白质：利用非变性淀粉凝胶或聚丙烯酰胺凝胶电泳及特异性染色检测，根据电泳谱带的不同来显示酶蛋白在遗传上的多态性。
1 / 5 DNA标记：以两种或多种易于区别的形式存在的DNA序列，可在遗传图、物理图或整合图谱中用作位置标记。
DNA标记辅助育种：是借助（分子）遗传标记信息选择种用个体。
DNA指纹：可用来进行个人识别及亲权鉴定，同人体核DNA的酶切片段杂交，获得了由多个位点上的等位基因组成的长度不等的杂交带图纹，这种图纹极少有两个人完全相同，故称为"DNA指纹"。
闭锁群育种方法：利用长期不从群外引进种畜的群体继带选育方法。
标记辅助BLUP选择：是基于主基因-多基因混合模型下的线性模型的具体应用，是常规BLUP方法的扩展，亦称MAS和BLUP综合选择法
标记辅助保种：就是利用与目标基因有紧密连锁的DNA 标记,对目标基因在保种过程中的分离和重组进行跟踪,通过有意识地选留而加以保护,使之不因遗传漂变而丢失。
标记辅助导出：将供体群中少数优良目的基因(QTL) 导出到受体群,MAS既可用于跟踪鉴别目的基因,又可加速受体基因组( 背景基因) 的恢复
标记辅助导入：将供体群中少数优良目的基因(QTL) 导入到受体群,MAS既可用于跟踪鉴别目的基因,又可加速受体基因组( 背景基因) 的恢复
标记辅助选择：是指与特定的数量性状相关的遗传标记为工具，以标记信息作为辅助信息，对该数量性状进行选择，以在育种中获得较大的遗传进展
标记辅助预测：在动物育种过程中，借助标记信息对个体育种值作预测，一般结合最佳线性无偏预测(BLUP)方法进行。
不完全双列杂交：缺少部分杂交组合的双列杂交。
测定站测定：将所有待测个体集中在一个专门的性能测定站或某一特定的牧场，一定时间内测定。
测交：定义为测定杂合个体的基因型而进行的未知基因型杂合个体与有关隐性纯合个体之间的交配。
场内测定：直接在各个种猪场内进行性能测定,且不要求在统一的时间内进行。
超显性学说：假设等位基因间不存在显隐性关系，杂种生活力的提高来自杂合性本身，杂合越多，杂种优势越明显。
华南农业大学农学院《生物技术》复习题（附答案）
一、有关名词
遗传标记 指可稳定遗传的、易于识别的特殊的遗传多态性形式。
遗传多态性 现代遗传学中是指基因组中任何座位上的相对差异或DNA序列的差异。
形态标记 简单性状的遗传（普通遗传学）
细胞学标记 染色体变异与细胞学特征（细胞遗传学）
生化标记 同工酶与电泳技术（生化遗传学）
同工酶 是指具有功能相同而结构及组成有差异的一类酶
分子标记 DNA标记，以染色体DNA上特定的核苷酸序列作为标记。
PCR 聚合酶链式反应。是一种在体外快速扩增特定基因或DNA序列的方法，故又称为基因的体外扩增法。
RFLP 限制性片段长度多态性。不同样品DNA经限制性酶酶解所产生片段大小的差异。
RAPD 随机扩增多态DNA。是以一个寡聚脱氧核苷酸单链作随机引物(primer) ，通过PCR扩增基因组DNA，获得长度不同的多态性DNA片段，然后用凝胶电泳分离扩增片段，经染色来显示扩增片段的多态性。
SSR 简单序列重复。是一类由几个核苷酸组成的基序（motif）为重复单元串联组成的DNA序列，广泛分布于基因组的不同位置。
AFLP 扩增片段长度多态性。 是一种通过限制性内切酶酶切DNA产生不同长度DNA片段，再结合PCR技术来检测DNA多态性的分子标记技术。
FM
遗传图谱 又称遗传连锁图谱。指反映基因组内基因(遗传标记)在染色体上线性排列顺序及其相对位置的图谱。
分子遗传图谱 不同分子标记在染色体上的相对位置或排列情况。
作图群体 是指用于遗传作图的符合孟德尔定律的分离群体。
RIL群体 即重组近交系群体，是由重组近交系组成的分离群体，由F2经多代自交一粒传使后代基因组相对纯合的群体。
DH群体 是由通过对F1进行花药离体培养或通过特殊技术获得单倍体植株再经染色体加倍而获得的加倍单倍体群体。
育种复习题及答案
《动物育种学》复习题
⼀、名词解释
选择强度: 不同性状间由于度量单位和标准差不同，为统⼀标准，都除以各⾃的标准差，使之标准化，这种标准化的选择差
选择差: 被选留个体的平均表型值与侯选群平均表型值之差。
选择反应: 通过⼈⼯选择，在⼀定时间内，使得性状向着育种⽬标⽅向改进的程度。它是选择差稳定遗传给后代的部分。
间接选择反应: 利⽤性状间的遗传相关，通过对另⼀个性状的选择来间接选择所要改良的某个性状的选择⽅法。
育种值: 各种基因型的加性效应值, 个体加性效应的⾼低反映了它在育种上贡献的⼤⼩，因⽽称之为育种值
个体育种值: 个体育种值的简称育种值，指的是种⽤个体某⼀性状上能稳定遗传给下⼀代的基因的加性效应值。
配合⼒: 通过杂交能够获得的杂种优势程度，也即种群通过杂交能够获得的杂种优势程度，也即杂交效果的好坏和⼤⼩。
⼀般配合⼒: ⼀个种群和其它各种群杂交能获得的平均效果，遗传基础是基因的加性效应，主要依靠纯繁选育提⾼。
特殊配合⼒: 两个特定种群间杂交所能获得超过⼀般配合⼒的杂种优势，遗传基础是基因的⾮加性效应，其提⾼主要依靠杂交组合的选择。
家系选择: ⽐较全群若⼲家系的均值，根据家系平均值的⾼低选留名次在前的家系的全体。该法只考虑家系均值，⽽不考虑家系内偏差，个体的表型值除对家系均值起作⽤外，对选择并不起独⽴的作⽤。
物种: 是具有⼀定形态、⽣理特征和⾃然分布区域的⽣物类群，是⽣物分类系统的基本单位品种: 畜牧学的单位，指具有特定⽣物学特性、经济特性和种⽤价值、能适应⼀定⾃然和经济条件、能满⾜⼈类⼀定需求、具有⼀定数量的某种家畜类群。
品系: 指来源于同⼀头卓越的系祖，且有与系祖类似的体质和⽣产⼒的种⽤⾼产畜群；这些畜群都符合该品种的基本⽅向。⼴义：指⼀群具有突出优点，并能将这些突出优点相对稳定地遗传下去的具有较⾼种⽤价值的种畜群。
表型选择:
基因型选择:
个体选择: 对两部分同等重视，即把超出群体均值最多的个体留种。
