向日葵抗坏血酸过氧化物酶的电子克隆和生物信息学分析

生物信息学期末复习资料（小字）名词解释或辨析。

1.生物信息学：生物信息学是包含生物信息的获取、处理、贮存、分发、分析和解释的所有方面的一门学科，它综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具进行研究，目的在于了解大量的生物学意义。

2.基因芯片：固定有寡核苷酸、基因组DNA或互补DNA 等的生物芯片。

利用这类芯片与标记的生物样品进行杂交，可对样品的基因表达谱生物信息进行快速定性和定量分析。

3.人类基因组计划：HGP，是一项规模宏大，跨国跨学科的科学探索工程。

其宗旨在于测定组成人类染色体（指单倍体)中所包含的30亿个碱基对组成的核苷酸序列，从而描绘人类基因组图谱，并且辨识其载有的基因及其序列，达到破译人类遗传信息的最终目的。

4.中心法则：分子生物学的基本法则，是1958年由克里克（Crick）提出的遗传信息传递的规律，包括由DNA到DNA的复制，由DNA到RNA的转录和由RNA 到蛋白质的翻译等过程。

20世纪70年代逆转录酶的发现，表明还有由RNA逆转录形成DNA的机制，是对中心法则的补充和丰富。

5.相似性和同源性：相似性（similarity）和同源性（homology）是两个完全不同的概念。

同源序列是指从某一共同祖先经过趋异进化而形成的不同序列。

相似性是指序列比对过程中检测序列和目标序列之间相同碱基或氨基酸残基序列所占比例的大小。

当两条序列同源时，他们的氨基酸或核苷酸序列通常有显著的一致性（identity）。

如果两条系列有一个共同进化的祖先，那么他们是同源的。

这里不存在同源性的程度问题，两条序列要么是同源的要么是不同源的。

1.生物信息学：综合计算机科学、信息技术和数学的理论和方法来研究生物信息的交叉学科。

包括生物学数据的研究、存档、显示、处理和模拟，基因组遗传和物理图谱的处理，核苷酸和氨基酸序列分析，新基因的发现和蛋白质结构的预测等。

2.蛋白质组：指由一个基因组，或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。

异戊烯基焦磷酸(IPP)异构酶的生物信息学分析
刘巅;李娅;李连强;朱飞
【期刊名称】《安徽农业科学》
【年(卷),期】2007(035)020
【摘要】对来源于多种植物和其他生物的IPI蛋白特性、亚细胞定位及其亲缘关系等方面进行生物信息学分析和电子预测,为研究IPI家族蛋白的酶学特性和萜类生物合成的分子机理提供一定的理论依据.
【总页数】3页(P6018-6019,6023)
【作者】刘巅;李娅;李连强;朱飞
【作者单位】西南大学生命科学学院,重庆,400715;西南大学生命科学学院,重庆,400715;西南大学生命科学学院,重庆,400715;西南大学生命科学学院,重
庆,400715;开县实验中学,重庆,405400
【正文语种】中文
【中图分类】Q55
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4.卷叶贝母异戊烯基焦磷酸异构酶基因(IDI)的克隆与分析 [J], 杨千叶; 黄可佳; 张阳; 李锐
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抗坏血酸过氧化物酶（ascorbateperoxidase ，APX）活性测定试剂盒使用说明微量法100T/96S产品简介：APX 是植物清除活性氧的重要抗氧化酶之一，也是抗坏血酸代谢的关键酶之一。

APX 具有多种同功酶，分别定位于叶绿体、胞质、线粒体、过氧化物和乙醛酸体，以及过氧化体和类囊体膜上。

APX 催化H 2O 2氧化AsA，是植物AsA 的主要消耗者。

APX 的活性直接影响到AsA的含量，在胁迫和解胁迫条件下，APX 与AsA 具有一定的负相关性。

APX 催化H 2O 2氧化AsA，通过测定AsA 的氧化速率，可计算得APX 活性。

试验中所需的仪器和试剂：低温离心机、紫外分光光度计/酶标仪、微量石英比色皿/96孔板、移液枪、研钵、冰和蒸馏水。

产品内容：试剂一：液体×2瓶，4℃保存。

试剂二：粉剂×1瓶，4℃保存。

临用前加3mL 蒸馏水充分溶解。

试剂三：液体×1支，4℃保存。

操作步骤：一、粗酶液提取：称取约0.1g 样品，加1mL 试剂一，冰上充分研磨，13000g 4℃离心20min，取上清液。

二、测定操作表：1.分光光度计预热30min 以上，调节波长到265nm，用蒸馏水调零。

2.试剂一在25℃中预热30min 以上。

3.空白管：依次在微量石英比色皿/96孔板中加入20µL 蒸馏水、140µL 预热的试剂一、20µL试剂二和20µL试剂三，迅速混匀后在265nm测定10s和130s光吸收。

4.测定管：依次在微量石英比色皿/96孔板中加入20µL上清液、140µL预热的试剂一、20µL试剂二和20µL试剂三，迅速混匀后在265nm测定10s和130s光吸收。

APX活力计算：a.使用微量石英比色皿测定的计算公式如下（1）按蛋白浓度计算活性单位定义：每毫克蛋白每分钟氧化1µmol AsA为1U。

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控制器自动检测系统的设计开发集成电路我国集成电路行业的环境、健康和安全管理体系研究低压低功耗集成电路中电压自举电路的分析与设计集成电路衬底制造过程中应力问题的研究射频通信集成电路及其相关模块的研究异步集成电路设计方法研究ISO7816协议研究及其集成电路实现极大规模集成电路铜化学机械抛光液及平坦化工艺的研究大功率模拟集成电路直流参数测试集成电路测试仪控制模块及驱动设计集成电路布图设计专有权撤销程序的探讨基于自组织理论的我国集成电路设计产业竞争力研究功率集成电路中高压器件的设计存储测试专用集成电路成测技术研究低损耗混合信号集成电路衬底研究深圳市驰创电子有限公司营销创新的案例研究FPGA 中的BRAM设计研究基于事务的自动化验证平台的研究与实现IC 制造成本模型与决策支持系统应用研究射频CMOS 集成电路中可变电容的研究与应用模拟集成电路测试系统及网络设计集成电路电光测试仪相关技术研究数模混合集成电路的防静电保护创新型产业集群形成条件及演化机制区域集成电路产业竞争力评价研究集成电路自动测试方法及可测性设计研究公共技术平台的可持续发展模式研究基于集群理论的集成电路企业成长性评价新型超大规模集成电路（VLSI）直流参数自动测试系统基于PWM的两相混合式步进电机细分驱动芯片的设计集成电路测试系统后逻辑支持电路改进与模拟延迟线性能分析8 位CMOS微控制器HR6P73PGDA的设计验证大规模集成电路界面热阻试验研究硅片预对准系统的研制面向IC 制造的净化机器人的研究与设计功率集成电路中的闩锁效应研究基于FPGA的全数字激光测距信号处理系统的设计超大规模集成电路详细布局算法研究简指令微处理器（RISC）的全流程设计硅片自旋转磨削面型仿真与实验研究薄膜压力传感器性能研究及软件补偿基于标准CMOS工艺的电压型多值逻辑电路设计基于BCD 工艺的单片BUCK DC/DC 变换器芯片设计硅片传输机器人设计及轨迹规划一种低功耗磁敏感应集成电路的设计汽车智能功率集成电路低成本测试技术研究亚微米数字集成电路测试与验证方法研究及实现集成电路成品率测试结构自动实现与研究深亚微米集成电路互连电阻异常分析及其解决方法图形化编程在集成电路测试软件平台中的研究与应用用于纳米集成电路可制造性设计的测试结构版图生成器设计电信SCDMA 小灵通信令监测软件设计与实现基于ZigBee网络的电信机房动力环境远程监控系统的设计研究宽带业务代理监控系统的设计与实现俄罗斯铁通公司员工激励模式研究垃圾短信侵权行为研究嵌入式无线家庭网关的设计与应用钻探工程项目数据存储及其安全的应用研究CC 通信公司客户经理管理体系优化研究云计算环境下数据库系统的分层排队网络模型统一支付平台网上商城的设计与实现计费账务模块系统的设计与实现产业融合背景下手机电视的发展策略研究多业务融合IP承载网发展及关键技术研究基于PON 技术电信光纤接入网设计基于ATSC DTV 信号的频谱感知算法研究H.264 帧内预测算法研究基于中国联通业务支撑系统的计费账务引擎设计与实现基于流水线设计模式的AES 加密算法优化合肥联通3G业务营销策略研究抚顺联通移动通信全业务品牌发展战略研究中国电信服务业国际化战略研究TD-SCDMA 系统中基于Schur 算法的信道估计方法研究手机阅读产业价值链研究新版移动业务管理子系统（NSMS）的设计与实现基于三网融合的智能型家庭网关的研究与实现PTN 技术研究及其在3G传送网中的应用PSK 调制方式的无线信标机关键技术研究基于软件无线电技术的信标系统设计NFT 电信分公司绩效管理体系优化策略研究大学生手机小说阅读行为研究含三个圈的本原不可幂定号有向图的基直真科技软件开发与管理模式基于P2P技术的ONS解析机制的研究中国移动无线数据通信业务发展策略研究移动梦网若干法律问题研究国有经济存续下的自然垄断行业的规制改革彩铃IP 化的研究与应用H 公司工程设计部门知识共享研究平凉电信全业务时代的差异化竞争战略基于双阶梯理论的晋升机制和职业生涯规划研究经营者安全保障义务法律问题研究高星酒店IPTV体系结构研究及应用基于CTI 的语音缴费系统研究面向机顶盒的数字版权管理系统设计与实现中国联通甘肃省分公司固定资产实物管理改进研究基于ITIL 的甘肃号百公司IT运维管理研究中日韩三国贸易本币结算的可行性分析北京电信公司传输网项目成本控制研究电信业顾客满意、顾客忠诚与企业绩效关系研究青海移动GPRS业务精确营销模型研究。

未知驱动探索，专注成就专业
抗坏血酸过氧化物酶
抗坏血酸过氧化物酶（ascorbate peroxidase，APX）是
一种重要的氧化酶，负责在植物体内催化抗坏血酸（维生
素C）与过氧化氢之间的氧化还原反应。

该酶可以将有害的过氧化氢转化为水和氧气，起到清除细胞内部过氧化氢的
作用。

抗坏血酸过氧化物酶广泛存在于植物体内，尤其在叶片和
根部等活跃代谢组织中含量较高。

它是维持植物细胞内氧
化还原平衡的关键酶之一。

在植物遭受各种逆境胁迫时，
如高温、干旱、盐碱等，会导致植物体内产生过量的过氧
化氢，进而引发氧化应激反应。

抗坏血酸过氧化物酶的活
性会得到显著增强，从而帮助植物对抗逆境胁迫。

此外，抗坏血酸过氧化物酶还参与植物生长和发育的调控。

研究发现，抗坏血酸过氧化物酶的缺失或突变会导致植物
叶片发生病斑、失绿、畸形生长等异常现象，甚至影响到
植物的种子萌发和幼苗生长。

因此，抗坏血酸过氧化物酶
在植物生理生化过程中具有重要的功能和调控作用。

1。

《水杨酸相关基因HaNPR1、HaDMR6、HaSAMT在向日葵列当寄生中的作用研究》篇一一、引言向日葵列当是一种常见的植物寄生菌，对向日葵等作物的生长和产量产生严重影响。

近年来，随着分子生物学技术的发展，越来越多的研究开始关注植物与病原菌之间的相互作用机制。

其中，水杨酸（Salicylic acid，简称SA）信号通路在植物防御反应中起着重要作用。

本文旨在研究水杨酸相关基因HaNPR1、HaDMR6、HaSAMT在向日葵列当寄生中的作用，以期为向日葵抗病育种提供理论依据。

二、材料与方法1. 材料实验材料为向日葵及其列当病原菌，以及与水杨酸信号通路相关的三个基因HaNPR1、HaDMR6、HaSAMT。

2. 方法（1）基因克隆与表达分析：通过PCR技术克隆出HaNPR1、HaDMR6、HaSAMT基因，并利用生物信息学方法对其序列进行分析。

（2）转基因植物制备：将克隆得到的基因转入向日葵中，制备转基因植物。

（3）表型观察与生理指标测定：观察转基因植物与野生型植物在列当寄生过程中的表型变化，测定相关生理指标。

（4）基因表达量分析：利用实时荧光定量PCR技术，分析转基因植物与野生型植物中相关基因的表达量。

三、结果与分析1. 基因序列分析通过生物信息学方法对HaNPR1、HaDMR6、HaSAMT基因的序列进行分析，发现这些基因具有典型的植物水杨酸信号通路相关基因的特征。

其中，HaNPR1属于NPR（Non-expressor of PR gene）家族成员，参与SA信号的传导；HaDMR6可能是一个与SA合成或代谢相关的基因；HaSAMT则可能是一个与SA转运或修饰相关的基因。

2. 表型观察与生理指标测定在列当寄生过程中，转基因植物与野生型植物表现出明显的差异。

转基因植物的抗病性明显提高，列当的寄生率显著降低。

同时，转基因植物的生理指标也发生了变化，如SA含量、H2O2含量等均有所改变。

3. 基因表达量分析实时荧光定量PCR结果显示，在列当寄生过程中，转基因植物中HaNPR1、HaDMR6、HaSAMT基因的表达量均有所变化。