我国首个前列腺癌数据库将启用
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TCGA数据库介绍TCGA(The Cancer Genome Atlas)是一个国际合作的项目,旨在通过全面研究多种人类癌症的基因组变异,进一步加深对癌症的认识。
TCGA项目由美国国立卫生研究院(NIH)和美国癌症研究所(NCI)联合发起,自2024年启动以来,已经成为全球最大的癌症基因组学项目之一TCGA项目收集并分析人体内约20种癌症的基因组数据,并将其公开发布在TCGA数据库中。
这些癌症类型包括但不限于结直肠癌、肺癌、乳腺癌、子宫内膜癌、肝癌和前列腺癌等。
通过对这些癌症样本的深度测序和分析,TCGA数据库提供了广泛的基因信息、表达谱、临床特征等数据,为研究人员和医疗专业人员提供了宝贵的资源。
TCGA数据库中的数据主要包括两个方面:基因组数据和临床数据。
基因组数据包括基因突变信息、DNA甲基化信息、基因拷贝数变异信息等。
这些信息可以帮助研究人员深入了解癌症发生和发展的分子机制,发现潜在的治疗靶点。
临床数据包括患者的生存数据、治疗信息、病理学特征等。
这些数据可以帮助医疗专业人员制定个性化治疗方案,改善癌症患者的生存率和生活质量。
TCGA数据库的数据共享政策使得全球的研究人员和医疗专业人员都可以自由访问和使用这些宝贵的数据资源。
研究人员可以利用这些数据开展各种癌症基因组学研究,寻找新的治疗方案和预测指标。
医疗专业人员可以利用这些数据指导临床决策,提供更好的个体化治疗。
除了数据本身,TCGA项目还提供了许多工具和平台,帮助用户更好地分析和解释数据。
例如,TCGA数据包含了丰富的调查表和数据字典,以帮助用户理解和使用数据。
此外,TCGA还提供了一系列的分析工具和软件,如GARFIELD、Firehose、DAVID等,以帮助用户进行数据挖掘和进一步分析。
TCGA数据库的影响已经超出了癌症研究领域。
许多其他研究和临床领域的学者也开始利用TCGA数据库进行多种疾病的基因组学研究,如心血管疾病、神经系统疾病等。
前列腺癌药物去势治疗随访管理专家共识2024(完整版)摘要随着诊疗技术的进步,前列腺癌患者的5年生存率显著提升,前列腺癌进入慢性疾病管理时代。
雄激素剥夺治疗是晚期前列腺癌患者的基石治疗方案,并贯穿患者治疗的各阶段。
前列腺癌药物去势治疗后的疾病进展、治疗相关不良反应以及相关并发症已成为前列腺癌长期管理的一大难题,影响患者的生存及生活质量。
除了在诊断和治疗过程中需要注重前列腺癌的疾病管理,更应该密切随访药物去势治疗后患者的整体情况,尤其对于处于疾病治疗关键阶段的患者,应在疾病重要节点(疾病阶段起始点和治疗切换点)监测睾酮或其他指标,避免错过最佳治疗窗口期。
前列腺癌随访管理应该兼顾疾病本身治疗阶段特点(疾病分期、既往症状、预后因素及治疗方案)和患者自身诉求,定制个性化的随访策略,更好地提高患者治疗依从性,改善预后。
目前中国尚缺乏前列腺癌患者药物去势治疗后随访及生活质量管理的指南或共识,为此,中国前列腺癌研究协作组组织国内相关专家制定了前列腺癌药物去势治疗随访管理中国专家共识(2024版),以期为接受药物去势治疗前列腺癌患者的随访及生活管理提供参考,进一步改善中国前列腺癌患者的预后及生活质量。
【关键词】前列腺肿瘤;药物去势;随访;生活质量;共识在全球范围内,前列腺癌作为男性的第2大常见肿瘤,已成为一项重大的公共健康问题。
随着医学诊疗技术的进步以及前列腺癌早筛意识的不断普及,前列腺癌患者的5年生存率显著改善。
美国癌症协会发布的2023年恶性肿瘤统计数据显示,美国前列腺癌患者的5年相对生存率已达97.0%,仅次于甲状腺癌。
中国前列腺癌患者的5年生存率虽然与美国存在差距,但2012—2015年中国前列腺癌患者的年龄标化5年相对生存率也已从2003—2005年的53.8%提高至66.4%。
生存时间的延长预示前列腺癌进入慢性疾病管理阶段。
在长期的治疗和康复过程中,患者的生活质量、疾病认知、心理状态等问题应在随访期间给予相应的支持和指导。
中国前列腺癌流行病学研究进展一、本文概述前列腺癌是一种在男性中较为常见的恶性肿瘤,其发病率和死亡率在全球范围内均呈上升趋势。
近年来,随着中国社会经济的发展和生活方式的改变,前列腺癌的发病率也呈现出逐年上升的趋势,已成为威胁男性健康的主要疾病之一。
因此,对中国前列腺癌流行病学的研究具有重要的现实意义。
本文旨在综述近年来中国前列腺癌流行病学研究的进展,包括前列腺癌的发病率、流行趋势、影响因素、筛查与早期诊断等方面的研究,以期为进一步深入探讨前列腺癌的病因、预防和治疗提供科学依据。
通过回顾和分析近年来的相关文献,本文发现,中国前列腺癌流行病学研究在多个方面取得了显著进展。
在发病率和流行趋势方面,通过大规模的流行病学调查,揭示了前列腺癌在中国的发病特点和流行趋势,为制定相应的防治策略提供了重要依据。
在影响因素方面,深入探讨了年龄、遗传、生活方式、环境因素等对前列腺癌发病风险的影响,为预防和控制前列腺癌的发生提供了理论依据。
在筛查与早期诊断方面,通过不断探索和实践,提高了前列腺癌的早期诊断率,为前列腺癌的早期治疗创造了有利条件。
然而,尽管中国前列腺癌流行病学研究取得了一定的成果,但仍存在许多挑战和问题。
前列腺癌的发病机制仍不完全清楚,需要进一步深入研究。
前列腺癌的筛查和早期诊断方法仍有待改进和完善,以提高早期发现率和治疗成功率。
前列腺癌的预防和控制策略也需要不断更新和优化,以适应社会发展和人群需求的变化。
中国前列腺癌流行病学研究在多个方面取得了显著进展,但仍面临许多挑战和问题。
未来,需要进一步加强前列腺癌的基础研究和临床研究,提高前列腺癌的诊疗水平和预防控制能力,为保障男性健康做出更大的贡献。
二、前列腺癌流行病学研究方法前列腺癌的流行病学研究主要依赖于多种方法的综合应用,包括描述性流行病学、分析性流行病学以及实验流行病学等。
这些方法在前列腺癌的研究中各有侧重,共同推动了对前列腺癌病因、发病机制和预防策略的理解。
02015年中国癌症统计数据中国医学科学院肿瘤医院、国家癌症中心赫捷院士、全国肿瘤登记中心主任陈万青教授等,在影响因子144.8的《CA:A Cancer Journal for Clinjicians》杂志上发表了2015年中国癌症统计数据。
能在影响因子最高的期刊上发表文章,足以让大家顶礼膜拜!我们都来学习一下这项国人癌症统计数据研究吧。
该研究分析结果提示,2015年中国预计有429.2万例新发肿瘤病例和281.4万例死亡病例。
肺癌是发病率最高的肿瘤,也是癌症死因之首。
胃癌、食管癌和肝癌是紧随其后的我国发病率和死亡率较高的常见肿瘤。
文章指出,在中国,癌症已成为疾病死因之首,发病率和死亡率还在攀升,癌症已成为非常重要的公共健康问题。
该研究报告了我国最新的癌症发病率、死亡率和生存分析数据,不同地区几种常见肿瘤的最新发病和死亡情况,常见肿瘤的发病趋势以及防控重点等。
中国人口有13.7亿之巨,过去关于国人癌症发病率和死亡率的统计报告,多基于上世纪九十年代起的小样本数据,或局限于某特定年份的统计。
全国肿瘤登记中心(NCCR)成立于2002年,2008年全国癌症登记项目启动后,全国以人群为基础的登记点从2008年的54处增加到2014年的308处(覆盖3亿人口)。
本文报告的高质量的数据来自中国肿瘤登记中心数据库72个登记点最新(2009~2011年)数据,覆盖代表我国6.5%的总人口数。
图A显示有2000~2011年数据的22个数据点,图B显示2009~2011年数据的72个数据点分析显示,预计2015年有新发浸润性癌病例数429.2万,相当于平均每天新发12000例癌症,有281.4万癌症死亡病例,相当于平均每天7500人死于癌症。
上图为预计2015年国人癌症新发和死亡病例数男性所有肿瘤发病率2000年至2011年略显稳定(年增长0.2%)女性增长显著(年增长2.2%),男性和女性癌症死亡率从2006年以来出现显著下降(分别年降低1.4%和1.1%)。
中国肿瘤登记数据集标准肿瘤登记是指对患者的肿瘤发生情况进行系统性的记录和统计,以便在全国范围内准确掌握肿瘤发病的时空分布和流行趋势,为肿瘤防控工作提供科学依据。
为了实现数据的互通、互联,中国制定了肿瘤登记数据集标准。
在本文中,我将介绍中国肿瘤登记数据集标准的主要内容。
首先,中国肿瘤登记数据集标准规定了数据的基本要素。
基本要素包括患者的个人信息,如姓名、性别、出生日期、身份证号码等;就诊信息,如就诊日期、就诊机构、就诊科室等;肿瘤信息,如肿瘤类型、肿瘤部位、肿瘤大小等。
这些基本要素是进行肿瘤统计和研究的基础,也是与其他数据库进行数据共享的前提。
其次,中国肿瘤登记数据集标准明确了数据的详细内容。
数据内容包括了患者就诊和疾病诊断过程中的各个环节的信息。
例如,对于肿瘤诊断过程,应包括病理学检查结果、影像学检查结果、实验室检查结果等。
对于治疗过程,应包括手术治疗信息、放疗信息、化疗信息等。
对于随访过程,应包括随访日期、随访结果等。
这些详细的数据内容可以为肿瘤防控提供更全面、更准确的信息。
此外,中国肿瘤登记数据集标准还规定了数据的标准化和分类编码。
标准化是指对数据的格式、单位、命名等进行统一规范,以便实现数据的互通、互联。
分类编码是指对肿瘤、疾病、手术等进行编码,以便进行统计和分析。
中国肿瘤登记数据集标准参考了国际上通用的标准和编码系统,并结合了中国国情进行了相应的调整和补充,确保了数据的质量和可比性。
最后,中国肿瘤登记数据集标准强调了数据的保护和隐私问题。
根据法律法规的规定,肿瘤登记数据应当保护患者的个人隐私和信息安全。
标准中对于数据的存储、传输和使用都做了相应的规定,保证了数据的安全性和隐私性。
综上所述,中国肿瘤登记数据集标准在肿瘤防控工作中起着重要的作用。
它规范了数据的要素、内容、标准化和分类编码,保护了数据的隐私和安全。
通过对肿瘤登记数据的准确记录和统计,可以帮助我们更好地了解肿瘤的发病情况和分布趋势,为肿瘤防控提供科学依据和决策支持。
第27卷2期2021年3月127夭津医科大学学报Journal of Tianjin Medical UniversityVol. 27, No. 2Mar, 2021文章编号 1006-8147(2021)02-0127-06亠 _基于TCGA 数据库分析、筛选并验证前列腺癌诊断 或预后标志物贺倩王亮2,门剑龙6(天津医科大学总医院1•医学检验科2泌尿外科;3.精准医学中心,天津300052)摘要 目的:综合分析表达谱数据与DNA 甲基化数据,探索新的前列腺癌诊断或预后的标志物?方法:在TCGA 公共数据库下载前列腺癌的甲基化水平数据以及mRNA 表达数据;利用R 软件中的DESeq2包对表达谱数据进行差异表达分析,利用R 软件中的limma 包对DNA 甲基化芯片进行差异甲基化位点分析;采用美国国立卫生研究院的DAVID =6,7在线软件平台进行功能和通路的富集分析;对筛选出的基因进行Kaplan-Meier 生存分析以及分子生物学实验验证。
结果:差异表达分析得到1 130个差异表达基因,其中759个表达下调,371个表达上调;差异甲基化位点分析获得375个差异甲基化位点,其中?个低甲基化位 点,367个高甲基化位点;综合分析发现CBX5、NBPF13P 、RARB 、RCN1、SRSF5基因的异常甲基化与肿瘤复发风险密切相关;定 量PCR 显示前列腺癌患者SRSF5 mRNA 水平升高(+<0.05),甲基化特异性PCR 显示前列腺癌患者SRSF5甲基化水平降低(均+D0.05)°结论:SRSF5在前列腺癌患者中甲基化水平降低且mRNA 表达水平升高,且其低甲基化水平与复发风险密切相关。
关键词 前列腺癌;表达谱;DNA 甲基化;SRSF5中图分类号R737.25文献标志码AAnalysis, screening and validation of diagnostic or prognostic markers for prostate cancer based on TCGAdatabaseHE Qian 1, WANG Liang 2, MEN Jian —long 3(1.Department of Medicine Laboratory ; 2.Department of Urology ; 3.Precision Medicine Center , General Hospital ,Tianjin MedicalUniversity , Tianjin 300052, China)Abstract O bjective : To comprehensively analyze the expression profile data and DNA methylation data in order to explore newmolecular targets or potential therapeutic targets for prostate cancer. Methods : The methylation data and mRNA expression data of prostatecancer from TCGA public database were downloaded. Differential expression analysis was performed using DESeq2 package in R software and differential methylation site analysis was performed using limma package in R software. Then , enrichment analysis of functions andpathways were performed using the DAVID v6.7 online software platform. Finally ,Kaplan-Meier survival analysis and molecular biological experiments were performed on the selected genes. Results : Differential expression analysis revealed 1 130 differentially expressed genes ,of which 759 were down-regulated and 371 were up —regulated. Differential methylation sites analysis obtained 375 differential methylationsites ,including 8 hypomethylation sites and 367 hypermethylation sites. Comprehensive analysis found that abnormal methylation of CBX5,NBPF13P ,RARB ,RCN1 ,and SRSF5 genes were closely related to the risk of recurrence. Quantitative PCR showed that SRSF5 mRNA were increased ( all P <0.05 ) , and methylation-specific PCR successfully showed that the methylation was decreaed in patientswith prostate cancer. Conclusion : The methylation level of SRSF5 is decreased and mRNA expression level is increased in patients withprostate cancer , and its low methylation level is closely related to the risk of recurrence.Key words prostate cancer ; expression profile ; DNA methylation ;SRSF5近年来,全世界每年约有100万男性被确诊为前列腺癌,并有30万人因患前列腺癌丧生;前列腺 癌已经成为成年男性常见的恶性肿瘤之一b1-3c 。
《中国癌症杂志》2018年第28卷第8期 CHINA ONCOLOGY 2018 Vol.28 No.8584·论 著·欢迎关注本刊公众号基金项目:上海市青年科技启明星计划(16QA1401100)。
通信作者:朱 耀 E-mail: mailzhuyao@中国前列腺癌患者BRCA 1/2及ATM 基因的胚系突变研究韦 煜,吴俊龙,顾伟杰,秦晓健,林国文,戴 波,朱 耀,叶定伟复旦大学附属肿瘤医院泌尿外科,复旦大学上海医学院肿瘤学系,上海 200032[摘要] 背景与目的:BRCA 1/2、ATM 基因的致病性胚系突变与前列腺癌的发病风险和疾病进展密切相关,同时可对转移性去势抵抗性前列腺癌(metastatic castration-resistant prostate cancer ,mCRPC )患者的PARP 抑制剂治疗、铂类化疗进行指导,然而,基于中国人群的研究鲜有报道。
本研究旨在揭示中国人群前列腺癌患者BRCA 1/2、ATM 基因的胚系突变率,从而指导基因检测和临床治疗。
方法:前瞻性分析53例遗传咨询门诊确诊为前列腺癌患者的临床资料,并对这些患者的胚系DNA 进行测序,将目标基因BRCA 1/2、ATM 的突变依据美国医学遗传学与基因组学学会(American College of Medical Genetics and Genomics ,ACMG )遗传突变分类标准与指南评估致病性。
同时对致病性突变与前列腺癌患者发病年龄、家族史、Gleason 评分、前列腺特异抗原(prostate-specific antigen ,PSA )值、肿瘤转移之间的关系进行统计学分析。
结果:中国人群前列腺癌患者BRCA 1/2、ATM 基因的致病性胚系突变率为7.55%,转移性前列腺癌患者的突变率为9.68%。
在中国人群中,BRCA 1/2、ATM 基因的致病性突变与前列腺癌的早期发生有关(P =0.011);但在家族史、Gleason 评分、PSA 水平及肿瘤转移上差异无统计学意义(P >0.05)。
[收稿日期]2021-06-05 [修回日期]2022-01-06[基金项目]蚌埠医学院自然科学研究重点项目(BYKY2019035ZD);安徽省高校自然科学研究重点项目(KJ2021A0819)[作者简介]陶 润(1995-),男,回族,硕士研究生.[通信作者]张家俊,硕士研究生导师,主任医师,副教授.E⁃mail:zsyf777@[文章编号]1000⁃2200(2024)03⁃0335⁃05㊃临床医学㊃基于TCGA 数据库探究SERPINA5在前列腺癌中的表达及临床意义陶 润,李文永,关 翰,李 俊,邓 硕,张家俊(蚌埠医科大学第一附属医院泌尿外科,安徽蚌埠233004)[摘要]目的:研究前列腺癌中关键基因的差异化表达,为前列腺癌的诊疗提供新的生物治疗靶点和理论依据㊂方法:从美国癌症基因组图谱(TCGA)中下载前列腺癌的相关基因数据,利用R 软件筛选出在前列腺癌组织和癌旁组织中差异化表达的基因,并进行富集分析㊂利用STRING 11.0构建差异基因所表达蛋白的互作网络图,并通过Cytoscape_v3.7.1进一步筛选Hub 基因,通过Oncomine 数据库对Hub 基因在前列腺癌中的表达进行验证得到关键基因,随后利用R 软件对关键基因与临床数据进行统计分析,最终利用在线工具GEPIA 对关键基因进行生存分析㊂结果:总共得到551个样本(其中癌旁组织样本52个,癌组织样本499个),筛选后得到463个差异基因,其中呈现上调趋势的基因共265个,下调198个㊂富集分析后发现这些基因主要富集在顶体反应的调节㊁三酰甘油代谢过程,PPAR 信号通路等,进一步筛选后得到10个Hub 基因,与Oncomine 数据库联合验证后得到关键基因SERPINA5,进行临床分析发现前列腺癌病人的SERPINA5的表达水平与肿瘤分化程度㊁TNM 分期以及无病生存率有关(P <0.05),而与年龄㊁人种以及总生存率的差异无关(P >0.05)㊂结论:前列腺癌中存在大量差异基因可能对疾病的发生发展起到影响作用,其中SERPINA5也许可以作为前列腺癌早期筛查标志物或治疗的生物靶点,为前列腺癌的预防与治疗带来新的方案以及研究方向㊂[关键词]前列腺肿瘤;癌症基因组图谱;Oncomine 数据库[中图法分类号]R 737.25 [文献标志码]A DOI :10.13898/ki.issn.1000⁃2200.2024.03.012Expression and clinical significance of SERPINA5in prostate cancer based on TCGA databaseTAO Run,LI Wenyong,GUAN Han,LI Jun,DENG Shuo,ZHANG Jiajun(Department of Urology ,The First Affiliated Hospital of Bengbu Medical University ,Anhui Bengbu 233004,China )[Abstract ]Objective :To study the differential expression of pivotal genes in prostate cancer,and to provide a new biologicaltherapeutic target and theoretical basis for the treatment of prostate cancer.Methods :The gene data related to prostate cancer were downloaded from The Cancer Genome Atlas (TCGA).The genes differentially expressed in prostate cancer tissues and para⁃cancer tissues were selected using R software and enrichment analysis was performed.The interaction network diagram of the proteins expressed by the differential genes was constructed using STRING 11.0,and the Hub gene was further selected through Cytoscape_v 3.7.1.The expression of the Hub gene in prostate cancer was verified by Oncomine database to obtain the pivotal genes.The statistical analysis of the pivotal genes and clinical data was then performed using R software.Finally,the survival analysis of the pivotal genes was performed using online tool GEPIA.Results :A total of 551samples(including 52adjacent tissue samples and 499cancer tissue samples)were obtained,and 463differential genes were obtained after selection,among which 265genes showing an upward trend and 198genes showing a downward trend were obtained.After enrichment analysis,it was found that these genes were most enriched in the regulationof acrosome reaction,triglyceride metabolism process and PPAR signaling pathway.After further screening,10Hub genes were obtained,which were verified together with the Oncomine database to obtain the key gene SERPINA5.Clinical analysis showed that the expression level of SERPINA5in patients with prostate cancer was related to tumor differentiation,TNM stage and disease⁃free survival rate(P <0.05).and was not related to age,race,and overall survival rate(P >0.05).Conclusions :There are many differential genes in prostate cancer that may affect the occurrence and development of the disease.Among them,SERPINA5may be used as a marker for early screening of prostate cancer or a biological target for treatment,which brings new options and research directions for the preventionand treatment of prostate cancer.[Key words ]prostate neoplasms;The Cancer Genome Atlas;Oncomine database533蚌埠医学院学报2024年3月第49卷第3期 前列腺癌是一种常见的男性恶性肿瘤,2020年全球约有140万新发病例,37.5万死亡病例,是2020年全球男性第二大最常见癌症和第五大癌症死亡原因[1]㊂尽管相对于澳大利亚㊁北美,西欧等地区,亚洲地区的发病率偏低,但是我国前列腺癌发病率仍然呈现出增高的倾向[2]㊂虽然目前可以通过前列腺癌特异性抗原(PSA)检测㊁前列腺磁共振检查以及前列腺组织的病理活检进行早期诊断[3],但也会因此造成一些不必要的过度诊疗,导致对病人经济上以及医院资源的无谓消耗[4]㊂由于其早期发病时缺少显著的临床症状而易被忽视,很多病人发现时往往分期较晚,导致治疗疗效及预后不佳㊂目前国内最常见的治疗措施为手术治疗以及抗雄激素治疗,然而,大多数雄激素依赖性病人在治疗后易于复发,成为去势抵抗性前列腺癌,进一步增加了治疗难度[5]㊂晚期癌症的致命性往往是由于缺乏在基因和细胞生物学水平上产生持久反应的方案[6]㊂就目前而言,前列腺癌的诊断㊁治疗和预后还有很多不足之处㊂癌症基因组图谱(TCGA)和Oncomine 数据库是两个大型的肿瘤信息数据公共平台,含有大量的基因数据和临床信息㊂本研究通过数据库筛选出在前列腺癌与癌旁组织中差异化表达的基因,以期为前列腺癌的预防与治疗带来新的方案以及研究方向㊂1 资料与方法1.1 资料收集 通过TCGA数据库下载前列腺癌的mRNA表达数据㊂1.2 数据处理 通过R软件的 edgeR”包对数据进行筛选获取差异基因,筛选条件为|LogFC|>3,FDR<0.05,利用 gplots”包将筛选后的差异基因进行处理㊂1.3 通路与功能富集分析 通过DAVID6.8数据库对差异基因进行GO和KEGG富集分析,并利用R软件的 ggplot2”包将其可视化处理㊂1.4 构建蛋白互作网络与筛选Hub基因 通过STRING11.0数据库对差异基因进行蛋白互作网络分析(protein⁃protein interaction,PPI),并使用Cytoscape_v3.7.1软件对PPI网络进行可视化处理,利用其 cytoHubba”插件挑选出关联强度前10的Hub基因㊂1.5 筛选目标基因 将Hub基因与Oncomine数据库中的前列腺癌研究数据进一步筛选,筛选条件为:(1)分析类型,癌组织与癌旁组织;(2)癌症类型,前列腺癌;(3)数据类型,mRNA;(4)阈值,P<0.05㊂采用Mate分析得到目标基因㊂1.6 临床数据统计分析 通过R软件的 ggpubr”包以及 limma”包对TCGA下载的临床数据进行分析,并绘制可视化图表㊂1.7 关键基因的生存分析 使用在线工具GEPIA对所获得的目标基因进行预后生存分析㊂2 结果2.1 差异基因的筛选结果 通过TCGA数据库总共获得了551个样本数据(其中癌旁组织样本52个,癌组织样本499个)㊂通过R软件对样本数据处理后,共筛选出463个差异基因,其中呈现上调的265个,下调的198个㊂2.2 GO与KEGG富集分析 通过DAVID6.8数据库与R软件对差异基因进行GO富集分析后发现,这些基因在分子功能(molecular function,MF)层面中主要与丝氨酸型内肽酶抑制剂和半胱氨酸型内肽酶抑制剂活性相关㊂在细胞组分(cellular component,CC)层面中与乳糜微粒㊁血液微粒㊁细胞外间隙相关㊂在生物过程(biological process,BP)层面中主要参与顶体反应的调节㊁三酰甘油代谢过程(见图1A)㊂进行KEGG 富集分析后发现,这些差异基因主要与PPAR信号通路㊁物质代谢通路㊁唾液分泌功能㊁胃酸分泌功能以及胰腺分泌功能等相关(见图1B)㊂2.3 构建PPI网络图与筛选Hub基因 通过STRING11.0对差异基因进行分析,将基因间的相互关联系数设置为0.4,并且将孤立基因排除,得到PPI网络图㊂通过Cytoscape将PPI网络图进一步分析,并且使用其插件挑选出关联度前10的Hub基因,分别为APOH㊁FGB㊁CTAG2㊁MAGEA12㊁MAGEC1㊁MAGEA6㊁MAGEA3㊁MAGEA1㊁SERPINA5㊁APOC3(见图2)㊂2.4 联合Oncomine数据库筛选目标基因 使用Oncomine数据库搜寻目标基因相关的研究,发现自从2002年以来共有6项研究涉及SERPINA5在癌组织与癌旁组织中的差异化表达,通过Meta分析发现SERPINA5在前列腺癌中呈现低表达,且差异表达有统计学意义(P<0.05)(见图3)㊂633J Bengbu Med Coll,March2024,Vol.49,No.32.5 分析SERPINA5与临床数据的相关性 通过TCGA数据库下载前列腺癌样本的临床数据,随后利用R软件对SERPINA5进行单因素分析㊂分析后发现前列腺癌病人的SERPINA5的表达水平在不同肿瘤分化程度以及TNM分期间差异有统计学意义,其中前列腺癌中分化组SERPINA5的表达水平高于低分化组(P<0.05)(见图4D),T1+T2组SERPINA5的表达水平高于T3+T4组(P< 0.05)(见图4A),N0组SERPINA5的表达水平高于N1组(P<0.05)(见图4B),M0组SERPINA5的表达水平高于M1组(P<0.05)(见图4C),而在不同年龄㊁人种间差异均无统计学意义(P>0.05)(见图4E㊁4F)㊂2.6 生存分析 使用在线工具GEPIA对SERPINA5进行预后生存分析,发现前列腺癌病人SERPINA5的表达水平与总生存率(OS)无关(P>0.05),而与无病生存率(DFS)有关(P<0.05)(见图5)㊂其中SERPINA5的表达量越高,病人的预后情况越好㊂3 讨论 TCGA是致力于对选定的肿瘤类型进行全面基因组和表观基因组分析的几个国际组织之一,利用庞大的基因数据库以促进研究人员对疾病总进程的理解,并为所有的癌症相关研究提供一个免费开放的资源获取平台[7]㊂本研究利用TCGA数据库筛选出在前列腺癌组织与癌旁组织中差异化表达的基因㊂对差异基因筛选后选择SERPINA5为目标基因进行临床相关性的研究以及预后分析㊂丝氨酸蛋白酶抑制剂(SERPIN)是一种普遍存在于生物体内的蛋白酶抑制剂家族[8],目前人体内的SERPIN被细分A~I为9个亚族,SERPINA5为其中的A亚族成员5㊂该基因是位于14号染色体q 臂上的丝氨酸蛋白酶抑制剂基因簇中的一个,基因跨度约为13个碱基对,由5个外显子和4个内含子组成[9]㊂人血浆中的SERPINA5通过5′⁃侧翼区中的Sp1和AP2结合位点分别作为启动子和增强子在肝脏中起主要表达作用,除此之外还有部分表达于肾脏和生殖器官,包括睾丸㊁精囊和卵巢[10]㊂SERPINA5的主要特点是广泛的蛋白酶反应性和人体中广泛的组织分布㊂SERPINA5最初被描述为活化蛋白C的抑制剂,并独立作为纤溶酶原激活物尿激酶的抑制剂[8]㊂一项关于肝癌的研究[11]表明,肝细胞癌中SERPINA5基因的表达水平显著降低,并且SERPINA5的表达水平与HCC的恶性进展呈负相关关系㊂用q⁃PCR和免疫印迹法检测7种肝癌细胞系中SERPINA5的相对表达水平后发现, SERPINA5在Hep3B㊁HepG2和HUH⁃7细胞中表达水平相对较高,这些细胞没有转移潜能或转移潜能733蚌埠医学院学报2024年3月第49卷第3期较低,而SERPINA5在具有高转移潜能的SNU⁃449㊁HCCLM3和MHCC⁃97H细胞中表达水平相对较低,靶向敲除SERPINA5后可以促进肝癌细胞迁移㊂因此推测SERPINA5基因可以降低肝癌细胞的体内外转移潜能,并且SERPINA5的表达量增高可以起到抑制肝癌细胞的作用,该项研究还发现SERPINA5抑制肝癌转移的机制之一就是通过与纤连蛋白的直接相互作用和纤连蛋白-整合素信号通路的破坏,这表明SERPINA5在肝癌中可能是一个抑癌基因㊂有趣的是,在另一项关于低级别神经胶质瘤的研究[12]中发现SERPINA5启动子的两个不同的CpG 位点被高甲基化后,会引起SERPINA5的表达水平降低,从而使病人获得更好的预后,这表明SERPINA5在低级别神经胶质瘤中反而是一个促癌基因㊂SERPINA5除了在癌组织与癌旁组织中差异表达外,在某些癌症的不同分期中也有着显著的差异㊂据报道[13],在卵巢恶性肿瘤中,与早期肿瘤相比,晚期浆液性交界性肿瘤和浆液性癌的SERPINA5表达明显降低,且表达的缺失与浆液性交界性肿瘤中的微乳头状生长和微浸润以及浆液性癌的浸润表型有关㊂除此之外,还有部分研究[14-16]表明SERPINA5可能在雄性生殖㊁宿主防御中发挥作用㊂而在前列腺癌中,也有相关的研究[17]分析了SERPINA5在正常细胞(PrEC)㊁良性前列腺增生细胞(BPH⁃1)和恶性前列腺上皮细胞系(LNCaP㊁DU⁃145和PC⁃3)中8个CpG位点的甲基化程度,其中5个CpG位点的甲基化程度与SERPINA5表达水平的降低显著相关㊂并且在正常的前列腺上皮细胞㊁良性增生细胞和低侵袭性的LNCaP细胞中,有两个CpG位点(位于转录起始位点⁃19bp和⁃14bp)被高甲基化,而在侵袭性的DU⁃145和PC⁃3细胞系中,这些位点相较于正常组织基本未被甲基化㊂这表明SERPINA5启动子的两个不同CpG位点的新的甲基化模式可能有助于鉴别前列腺癌的良性和恶性㊂本研究中,对目标基因SERPINA5进行临床数据分析以及生存分析后发现,前列腺癌病人的SERPINA5的表达水平与肿瘤分化程度㊁TNM分期以及DFS的差异有统计学意义,而与年龄㊁人种以及OS的差异无统计学意义,并且SERPINA5的表达量越高,病人的预后情况越好,这表明SERPINA5在前列腺癌中是一种抑癌基因㊂然而关于SERPINA5对于前列腺癌进展中发挥作用的主要机制尚未明确,仍需要进一步的研究和探讨㊂ 此外,我们在进行富集分析时发现这些差异基因主要富集在PPAR信号通路㊁物质代谢等通路上㊂PPAR是一种核转录因子,在人体多项代谢调节中发挥重要作用㊂到目前为止,根据目前的研究[18]表明PPAR家族总共分为三种亚型:PPAR⁃α㊁PPAR⁃β和PPAR⁃γ㊂其中PPAR⁃γ在前列腺癌的进展中起到了重要作用,部分研究[19]指出,PPAR⁃γ对于前列腺癌的进展起到了抑制作用,而雄激素受体(androgen receptor,AR)可以抑制前列腺癌细胞中PPAR⁃γ的表达水平从而促进前列腺癌的发病进833J Bengbu Med Coll,March2024,Vol.49,No.3程,因此,降低AR功能的方法可用于增加前列腺癌细胞中PPAR⁃γ的表达量和PPAR⁃γ激动剂的抗肿瘤作用㊂AR不仅可以通过与PPAR⁃γ的直接作用来影响前列腺癌的进程,还可以通过与SERPIN家族中的乳腺丝氨酸蛋白酶抑制剂(mammary serineprotease inhibitor,MASPIN)的相互作用对此进行调节㊂据报道[20],AR可以通过与MASPIN启动子中的激素反应元件(hormonal responsive element,HRE)相结合,负向调节MASPIN的表达,从而促进前列腺癌的发展㊂由此我们可以猜想,同为SERPIN家族中的SERPINA5是否也会直接通过与AR的相结合,或者间接通过PPAR信号通路影响前列腺癌的进展,这还有待于进一步的研究㊂除了PPAR信号通路以外,物质代谢通路也对前列腺癌的进展起到了关键作用㊂相关研究[21]表明代谢途径紊乱会导致半胱氨酸升高,从而参与代谢中间体导致内皮细胞损伤或炎症并增加氧化应激㊂前列腺癌中继发氧化应激增加而产生的活性氧对肿瘤发展起到了促进作用[22]㊂ 综上所述,本研究利用生物信息学的方法对前列腺癌相关基因数据进行整理,最终得到目标基因SERPINA5,并且分析了目标基因与前列腺癌的临床相关性及预后情况,为前列腺癌未来的生物靶向治疗提供了理论基础和研究方向㊂[参考文献][1] SUNG H,FERLAY J,SIEGEL RL,et al.Global cancer statistics2020:GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwidefor36cancers in185countries[J].CA Cancer J Clin,2021,71(3):209.[2] CULP MB,SOERJOMATARAM I,EFSTATHIOU JA,et al.Recentglobal patterns in prostate cancer incidence and mortality rates[J].Eur Urol,2020,77(1):38.[3] 闫厚煜,邢金春,张开颜,等.前列腺癌的早期诊断研究进展[J].临床泌尿外科杂志,2020,315(3):77.[4] FENTON JJ,WEYRICH MS,DURBIN S,et al.Prostate⁃specificantigen⁃based screening for prostate cancer:evidence report andsystematic review for the us preventive services task force[J].Jama,2018,319(18):1914.[5] KIM Y,PARK SE,MOON JW,et al.Downregulation of androgenreceptors by NaAsO2via inhibition of AKT⁃NF⁃κB and HSP90incastration resistant prostate cancer[J].Prostate,2017,77(10):1128.[6] TEO MY,RATHKOPF DE,KANTOFF P,et al.Treatment ofadvanced prostate cancer[J].Annu Rev Med,2019,70:479.[7] COOPER LA,DEMICCO EG,SALTZ JH,et al.Pancancerinsights from The Cancer Genome Atlas:the pathologist′sperspective[J].J Pathol,2018,244(5):512.[8] YANG H,GEIGER M.Cell penetrating SERPINA5(proteinCinhibitor,PCI):more questions than answers[J].Semin Cell DevBiol,2017,62:187.[9] HAYASHI T,SUZUKI K.Gene organization of human protein Cinhibitor,a member of SERPIN family proteins encoded in fiveexons[J].Int J Hematol,1993,58(3):213.[10] SUZUKI K.The multi⁃functional serpin,protein C inhibitor:beyond thrombosis and hemostasis[J].J Thromb Haemost,2008,6(12):2017.[11] JING Y,JIA D,WONG CM,et al.SERPINA5inhibits tumor cellmigration by modulating the fibronectin⁃integrinβ1signalingpathway in hepatocellular carcinoma[J].Mol Oncol,2014,8(2):366.[12] ZENG WJ,YANG YL,WEN ZP,et al.Identification of geneexpression and DNA methylation of SERPINA5and TIMP1asnovel prognostic markers in lower⁃grade gliomas[J].Peer J,2020,8:e9262.[13] BIJSMANS IT,SMITS KM,DE GRAEFF P,et al.Loss ofSerpinA5protein expression is associated with advanced⁃stageserous ovarian tumors[J].Mod Pathol,2011,24(3):463.[14] PANNER SELVAM MK,AGARWAL A,PUSHPARAJ PN,et al.Sperm proteome analysis and identification of fertility⁃associatedbiomarkers in unexplained male infertility[J].Genes(Basel),2019,10(7):522.(下转第343页)研究APN基因多态性与RA病人切除术预后的关系十分必要㊂本研究发现,与对照组相比,观察组APN基因rs2241766位点TG㊁GG基因型及G等位基因频率均升高;杂合子TG型腺瘤数㊁腺瘤最大直径及平均直径均大于野生TT型,突变纯合子上述指标亦均大于杂合子TG型㊂提示APN基因rs2241766位点T→G突变可能在RA切除后复发的病理机制中发挥作用㊂进一步分析发现,APN基因rs2241766位点杂合子TG型㊁突变纯合子GG型是RA切除术后复发的危险因素,进一步提示APN基因rs2241766位点基因多态性与RA复发具有相关关系,可对TG型㊁GG型病人加强随访并及早介入治疗,可能有利于改善RA病人预后㊂综上,APN基因rs2241766位点TG㊁GG基因型及G等位基因频率的升高,与RA切除后复发有一定相关性㊂本研究存在一定不足,样本选择受制于地区㊁例数㊁人群,需进一步扩大地区㊁扩大样本量,以进一步证实APN基因突变与RA切除后复发的关系㊂[参考文献][1] 程丽,程莉,贾丹丹,等.结直肠腺瘤发生相关因素的研究进展[J].医学综述,2014,20(10):1790.[2] 宋猛.结直肠高危腺瘤患者危险因素的调查[J].中国现代医生,2012,8(50):208.[3] 陆绍龙,陈锋,叶德杰,等.结直肠癌伴发结直肠息肉的临床特点分析[J].结直肠肛门外科,2016,22(2):211. [4] 宋薇,陈爱荣.脂联素与恶性肿瘤相关性研究进展[J].甘肃医药,2016,35(3):178.[5] 陆飞宇,王文宏,王宏,等.脂联素基因多态性与南京汉族高血压脑出血易感性关系研究[J].南京医科大学学报(自然科学版),2017,37(2):212.[6] AN W,BAI Y,DENG SX,et al.Adiponectin levels in patientswith colorectal cancer and adenoma:a meta⁃analysis[J].Eur JCancer Prev,2012,21(2):126.[7] ALSALEH A,O′DELL SD,FROST GS,et al.Single nucleotidepolymorphisms at the ADIPOQ gene locus interact with age anddietary intake of fat to determine serum adiponectin in subjects atrisk of the metabolic syndrome[J].Am J Clin Nutr,2011,94(1):262.[8] 罗金英,颜建英,陈水仙,等.脂联素基因多态性与妊娠期糖尿病的相关性[J].中国妇幼保健,2019,34(1):124. [9] 孙盼盼,裴晓婷,蔚文锴,等.基于广义OR的脂联素基因外显子rs2241766多态性与中国人群糖尿病易感性的关联分析[J].郑州大学学报(医学版),2017,52(6):711. [10] 刘琦琦,袁甜,张梦洁,等.包头市蒙古族儿童脂联素基因多态性与单纯性肥胖的关联研究[J].现代预防医学,2018,45(3):427.[11] 方美花,李静波,周勇,等.健脾清肠方对结直肠腺瘤切除术后复发的影响[J].南京中医药大学学报,2018,34(1):50. [12] 梁丽,于妍斐,张继新,等.113例早期结直肠癌及癌前病变内镜黏膜下剥离术标本处理及病理学评估[J].中华消化内镜杂志,2018,35(7):470.[13] 徐伟,许海尘,薛绮萍,等.老年人结直肠腺瘤性息肉178例临床特点分析[J].胃肠病学,2015,20(2):106. [15] FLYNN C,BAKRIS GL.Interaction between adiponectin andaldosterone[J].Cardiorenal Med,2011,1(2):96. [16] 张颖,冯全林,刘长明,等.脂联素及其受体基因多态性与结直肠癌发生的相关性研[J].江苏大学学报(医学版),2012,22(4):336.[17] 李政,周天义,贺小会,等.脂联素基因rs2241766位点多态性与结直肠癌风险相关性的meta分析[J].中国普外基础与临床杂志,2018,25(5):592.[18] 刘文辉,李晓玲,袁萍,等.脂联素基因和钙蛋白酶10基因多态性与结直肠癌发生风险的关系[J].山东大学学报(医学版),2014,52(11):106.(本文编辑 卢玉清)(上接第339页)[15] VAN RAEMDONCK G,ZEGELS G,COEN E,et al.IncreasedSerpin A5levels in the cervicovaginal fluid of HIV⁃1exposedseronegatives suggest that a subtle balance between serineproteases and their inhibitors may determine susceptibility toHIV⁃1infection[J].Virology,2014,458:11.[16] PANNER SELVAM MK,FINELLI R,BASKARAN S,et al.Dysregulation of key proteins associated with sperm motility andfertility potential in cancer patients[J].Int J Mol Sci,2020,21(18):6754.[17] HAGELGANS A,JANDECK C,FRIEDEMANN M,et al.Identification of CpG sites of SERPINA5promoter with oppositemethylation patterns in benign and malignant prostate cells[J].Anticancer Res,2017,37(12):6609.[18] DHAINI HR,DAHER Z.Genetic polymorphisms of PPAR genesand human cancers:evidence for gene⁃environment interactions[J].J Environ Sci Health C Environ Carcinog Ecotoxicol Rev,2019,37(3):146.[19] OLOKPA E,MOSS PE,STEWART LV.Crosstalk between theandrogen receptor and ppar gamma signaling pathways in theprostate[J].PPAR Res,2017,2017:9456020. [20] ZHANG M,MAGIT D,SAGER R.Expression of maspin inprostate cells is regulated by a positive ets element and a negativehormonal responsive element site recognized by androgen receptor[J].Proc Natl Acad Sci U S A,1997,94(11):5673. [21] VIJAYA LAKSHMI SV,NAUSHAD SM,RUPASREE Y,et al.Interactions of5′⁃UTR thymidylate synthase polymorphism with677C→T methylene tetrahydrofolate reductase and66A→Gmethyltetrahydrofolate homocysteine methyl⁃transferase reductasepolymorphisms determine susceptibility to coronary artery disease[J].J Atheroscler Thromb,2011,18(1):56.[22] KHANDRIKA L,KUMAR B,KOUL S,et al.Oxidative stress inprostate cancer[J].Cancer Lett,2009,282(2):125.(本文编辑 刘畅)。
PC的药物治疗:内分泌治疗,抗雄激素治疗,雌激素治疗内分泌治疗,又称药物去势。
黄体生成素释放激素(LHRH)可刺激脑垂体释放黄体生成素(LH)。
人工合成的超活性LHRH类似物(LHRH A)可在用药早期刺激脑垂体释放黄体生成素(LH),使脑垂体的LHRH受体下降调节,受体减少,反而抑制了LH的释放,睾酮的产生减少,最终使睾酮下降至去势水平,从而起到与手术去势相似的疗效,称之为药物去势。
药物去势目前也是一种标准的前列腺癌内分泌治疗方法。
目前常用于治疗前列腺癌的LHRH A有亮丙瑞林(Leuprorelin,抑那通Enantone)3 .75mg、曲普瑞林(Triptorelin,达菲林Depherelin)3 75mg、戈舍瑞林(Goserelin,诺雷德Zoladex)3 6mg,均为皮下注射,每28~30d1次。
此外还有布舍瑞林(Buserelin,Receptal,Suprefact),0 5mg皮下注射,3次d,连用7天,此后改为喷鼻,每次0 1mg,每天3~6次。
药物去势的副作用与手术去势相似。
由于使用LHRH A初期刺激脑垂体释放黄体生成素(LH),睾丸产生更多的睾酮,前列腺癌症状进一步加重,对于已有脊柱转移的患者有脊髓压迫,甚至死亡的可能。
因此对于已有转移病灶,特别是膀胱颈梗阻、脊柱转移的前列腺癌患者,使用LHRH A治疗初期,应提前1周或同时使用抗雄激素药物治疗,以减轻或预防前列腺癌症状加重。
药物去势有这个缺点,而且药物价格昂贵,需长期用药,所以使用受到限制。
国内仅在患者拒绝接受手术去势且经济上又能承受时方才采用。
2.3 抗雄激素治疗抗雄激素使用的雄激素拮抗剂与雄激素受体结合,竞争性抑制DHT 而发挥作用,有类固醇类和非类固醇类两种。
前者有醋酸氯羟甲烯孕酮(CPA)、甲地孕酮(Megestrol),后者有氟他胺(Flutamide,福至尔(以前称缓退瘤)、康士得(Caso dex)、尼鲁米特(Nilutamide)等。
我国首个前列腺癌数据库将启用
发表时间:2015-05-14T09:31:16.547Z 来源:《医药前沿》2015年第1期供稿作者:[导读] 吴阶平医学基金会泌尿外科学部宣布,中国前列腺癌数据库(C-CAP)将于2015年1月1日启用。
通过手机终端,医生可查阅患者数据,患者可获得就诊用药等提醒服务吴阶平医学基金会泌尿外科学部宣布,中国前列腺癌数据库(C-CAP)将于2015年1月1日启用。
中国抗癌协会泌尿男性生殖系肿瘤专业委员会主任委员那彦群介绍,作为中国首个前列腺癌领域数据库,C-CAP将通过收集和管理中国前列腺癌患者的诊断、治疗和随访数据,了解中国前列腺癌发生、发展的规律,使临床诊疗更加规范;患者也将通过手机终端获得就诊及随访提醒等服务。
前列腺癌是全球第二大男性恶性肿瘤,既往在我国发生率较低,但人口老龄化和生活方式改变使我国前列腺癌发病率急剧上升,已跃居男性恶性肿瘤的第六位,成为泌尿外科发病率最高的肿瘤。
抽样调查显示,上海、北京和广州的前列腺癌发病率分别为32.2/10万、19.3/10万和17.57/10万。
20年间,我国前列腺癌发病率增长了10余倍,但因对此癌种的关注和认知度不够,我国前列腺癌的5年生存率仅有53%,与美国的100%相距甚远。
复旦大学附属肿瘤医院副院长、泌尿外科主任叶定伟教授表示,就上海市来说,前列腺癌发病率在过去6年增长了37%,跃居地区男性恶性肿瘤第五位。
专家预测,前列腺癌未来将超越肺癌等,跃居我国男性恶性肿瘤发病榜首。
北京医院泌尿外科主任医师朱刚介绍,中国前列腺癌数据库已完成系统搭建,正在试运行,最终将建成全面掌握我国前列腺癌发病情况的大数据库。
目前,全国范围内有32家三甲医院正通过网络向数据库传输数据,其中首批参与测试的13家医院已完成部分患者数据录入。
前列腺癌数据库正式启用后,加入该数据库医院的相关医生可直接登录数据库网站或手机客户端,简便、快速地创建、随访、查看、分析和导出其所在医院的患者数据,追踪并更新所负责患者的治疗方案。
患者只需下载手机App软件,即可随时随地获得专业的就诊、服药、科普等服务信息的推送。