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半索动物门（Phylum Hemichordata）半索动物，又称隐索动物（Adelochorda），是一个种类很少的小门（约90种）均为海产，生活于海水中或泥质沉积物中。
典型的种类如柱头虫（Balanoglossus）。
一.本门主要特征：⒈具有背神经索，其最前端变为内部有空腔的管状神经索，一般认为这是背神经管的雏形；⒉消化管的前端有鳃裂，为呼吸器官；⒊口腔背面向前伸出一条短盲管，称为“口索”，这是半索动物特有的（半索或隐索动物名称由此而来）。
二.结构和功能的适应1．生物体类型体呈蠕虫状，或固着生活，后口式发育。
半索动物曾经被分在脊索动物门中，也曾被视为无脊椎的脊索动物称为原索动物（protochordata）。
和脊索动物相似，它有由背部上皮发生而来且中空的背神经索。
但现在认为其口索与脊索不是同源器官，因此将其从脊索动物中分出，独立为半索动物。
2．身体结构三胚层，两侧对称，真体腔动物。
身体不分节，只分为吻、领和躯干三个部分（图）。
通常咽上有鳃裂。
身体分为前体、中体和后体，每部分都有分隔的体腔（参考触手冠动物）。
躯干部细长，前部两侧向外延伸形成翼状板，内有生殖腺（生殖翼）。
肛门在躯干部末端。
3．取食羽鳃类用触手冠样器官滤食，肠鳃类取食沉积物，通过鳃裂排除剩余的废物。
4．运动羽鳃类固着生活，而肠鳃类则穴居生活。
5．骨骼羽鳃类在咽的前部盲囊腹面有一棒状物，能够变硬，过去称为口索，曾经被认为是脊索的同源器官。
6．呼吸和循环系统气体交换可以通过鳃裂完成（由于纤毛作用，水由口进入咽，经咽裂、鳃囊及鳃孔流出，在这一过程中完成气体交换），其下有血管分布集中的区域，还可以通过体表完成。
循环系统有可收缩的背血管和腹血管，之间以开放的血窦相连，因此，在循环方式上属于开放式循环。
前体有可搏动的“心脏”驱动血液循环。
7．深透压调节和排泄含氮废物通过体表扩散排泄。
8．动作协调神经系统原始而特殊，身体表皮细胞基部的一层神经纤维网分别在背中线和腹中线加厚形成神经索，两神经索在躯干的前端相连形成一神经环再和位于表皮下的神经网相连。
