家蚕基因组甲基化谱发表
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家蚕基因组DNA甲基化分析
翁宏飚;曹锦如;叶爱红;牛宝龙;何丽华;沈卫锋;孟智启
【期刊名称】《蚕业科学》
【年(卷),期】2008(34)1
【摘要】DNA甲基化在生物的基因表达调控与发育调节过程中具有重要作用。
应用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术对7个家蚕保存品种的胞嘧啶甲基化模式和程度进行评估。
在所能检测的CCGG序列中,至少有8.6%~10.9%的胞嘧啶发生了甲基化;12对引物共获得1156条扩增带,其中376条在品种间呈多态性,多态性比例为32.5%。
结果显示:家蚕基因组可检测到DNA甲基化,各品种间的甲基化模式存在差异,CCGG序列中胞嘧啶外部甲基化(10.9%)高于内部甲基化(8.6%)。
【总页数】5页(P28-32)
【关键词】家蚕;DNA甲基化;甲基化敏感扩增多态性
【作者】翁宏飚;曹锦如;叶爱红;牛宝龙;何丽华;沈卫锋;孟智启
【作者单位】浙江省农业科学院蚕桑研究所
【正文语种】中文
【中图分类】S881.2
【相关文献】
1.应用DNA甲基化芯片对胃癌及其癌旁组织基因组甲基化的分析 [J],
2.应用DNA甲基化芯片对胃癌组织基因组甲基化的分析 [J], 彭涛;杨永江;赵轶峰;
高建朝;Muhammad Abbas;王国强;孙虹;李曙光
3.子宫内膜癌DNA甲基化谱的全基因组分析预测新甲基化标记物 [J], 王瑶;金鑫
4.糖尿病肾病大鼠肝DNA甲基化酶活性及基因组DNA对DNase敏感性的分析[J], 汪琛颖;马晴;何忠效
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家蚕变态发育的基因表达谱及microRNA的调控研
究的开题报告
摘要:
家蚕是重要的经济昆虫,其变态发育是其生命周期中最为重要的生理过程之一。
本文计划通过基因表达谱和microRNA的调控等方面探究家蚕变态发育过程中的分子机制,以期深入了解家蚕的生命周期和其生理调控机制。
研究内容:
1. 基因表达谱分析
利用RNA-Seq技术测序家蚕的不同发育阶段,包括卵、幼虫、蛹和成虫阶段,获取家蚕变态发育过程中的基因表达谱。
通过基因表达量的统计和差异表达基因的筛选,筛选出具有生物学意义的基因,进一步分析它们在家蚕变态发育过程中的调控作用。
2. microRNA调控分析
基于RNA-Seq测序结果,探究家蚕变态发育过程中microRNA的表达谱,并使用生物信息学分析工具对这些microRNA的靶基因进行预测。
通过分析microRNA与其靶基因之间的调控关系,以及这些关系在家蚕变态发育过程中的动态变化,揭示microRNA对家蚕变态发育过程的精细调控作用。
3. 数据整合与分析
将基因表达谱和microRNA的调控结果进行整合,通过生物信息学方法对其进行生物学意义上的分析及可视化,展示家蚕变态发育过程中的分子机制,并探究家蚕整个生命周期的调控机制。
预期结果:
本研究可望深入了解家蚕变态发育过程中的分子机制及其调控,为
家蚕的农业生产、疾病预防和治疗等方面提供重要的参考价值。
同时,
本研究也可为其他昆虫的变态发育及其分子机制的研究提供参考和启示。