(整理)质粒的分子生物学与质粒载体
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质粒的概念及主要特性质粒的概念及主要特性质粒(Plasmid)是一类存在于细菌、酵母和其他真核生物的细胞中的独立自主的环状DNA分子。
相较于基因组DNA,质粒通常具有较小的大小(通常在1-300 kb之间)和较低的复制数(通常在1-100个)。
质粒起初被认为是存在于细菌细胞中的附属小分子,但随着对质粒的研究深入,科学家们发现,质粒在细菌及其他生物体中具有广泛的功能和重要的生物学作用。
质粒可以被视为细胞的一种可重复、可传递的遗传因子,它们能够在细菌细胞内自由复制和传递,同时还能携带一些额外的性状和功能基因。
质粒的主要特性包括:1. 自主复制:质粒具备自主复制的能力,不同于细菌基因组需要借助细胞分裂来复制,质粒能够独立地复制自己的DNA。
这意味着质粒不仅可以在细菌细胞中复制,还可以通过水平基因转移的方式传递到其他细菌细胞中,从而使同种质粒存在于多个细菌细胞中。
2. 多拷贝数:质粒通常具有多拷贝数(Copy Number,CN),即一个细菌细胞中可以存在多个拷贝的质粒。
拷贝数的高低对质粒的活性和功能有重要影响,例如高拷贝数的质粒可以更快速地复制自己的DNA,并且更容易在细菌群体中传递。
3. 载体功能:质粒可作为载体(Vector)用于构建基因工程实验中。
质粒具有多个克隆位点(Cloning Site),也称为限制性内切酶位点或多克隆位点,可以用来插入外源基因。
质粒还可以携带一些额外的功能基因,如抗生素抗性基因,使转化细胞可以在含有特定抗生素的培养基中生长,并且能够通过对抗生素的筛选来区分转化与未转化的细胞。
4. 携带额外的性状:质粒不仅可以携带外源基因,还可以携带一些原生基因和调控元件。
这些额外的性状可以包括产生某种特定酶的能力、胁迫适应的功能、生物合成途径等。
这使得质粒在细菌中起到适应环境的作用,增强了细菌对不同环境中的适应性。
5. 水平基因转移:质粒通过水平基因转移的方式,在细菌种群中进行自由传递。
质粒载体名词解释
质粒载体是分子生物学中非常重要的一种实验工具。
它们制造了一种由DNA链组成的小环状结构,这种结构可以被用来储存和传输遗传物质。
这类单个元件称为“质粒”,它们是一种可以携带遗传物质的载体,以便转移到其他生物体中。
质粒载体可以在生物体内或外部制备,最常见的质粒载体类型包括重组DNA质粒、脱氧核糖核酸质粒和反转录质粒。
重组DNA质粒可以携带大量的DNA,是植物转基因的常用载体。
脱氧核糖核酸质粒和反转录质粒则可以把复杂的基因表达转换成活性的蛋白质,在细胞分裂、凋亡等过程中扮演重要角色。
质粒载体一般由三个部分组成:表达载体、质粒引物和抗性基因。
表达载体是携带转录组分子的大分子,质粒引物用来引导特定的DNA 片段,而抗性基因是防止质粒中的DNA被非特异性酶切的基因。
质粒载体的应用非常广泛,它们可以用来传输特定的DNA片段,影响基因表达,从而改变植物的外观、抵抗传染病等。
此外,质粒载体也可以用来制备特异性的抗原,用于诊断和治疗许多疾病,其中包括癌症、HIV等。
由于质粒载体的巨大潜力,现在全球科学家正在努力开发出更好的质粒载体,以帮助实现从植物转基因到药物新研发的宏伟目标。
通过不断改进分子技术,期望借助质粒载体能够研发出更多有效的药物和抗疾病的新型疫苗,从而提高人类的健康水平。
总之,质粒载体是一种重要的分子生物学实验工具,它可以携带
遗传物质并转移到其他生物体中,这样就能够产生新的基因表达,从而改变植物的外观和抵抗力。
由于质粒载体的多种功能,它已经成为实现植物转基因和新药研发的核心技术,未来仍将继续发挥重要作用。
质粒载体简介质粒在所有的细菌类群中都可发现,它们是独立于细菌染色体外自我复制的DNA分子。
自然界中,质粒是在营养充足时出现的,它在结构、大小、复制方式,每个细菌的拷贝数,在不同的细菌体内的繁殖力,在菌种之间的转移力等方面都会变化,可能最重要的是质粒所携带的特征的改变。
大多数原核生物的质粒是双链环状的DNA分子;但是无论是在革兰式阳性还是阴性菌体内都可以发现线状质粒。
质粒大小变化很大,可从几个到数百个kb。
质粒依靠宿主细胞提供的蛋白质进行复制,但也可以使宿主细胞获得质粒编码的功能。
质粒复制可以与细菌的细胞周期同步,导致菌体内质粒的拷贝数较低,质粒复制也可独立于细胞周期,使每个菌体内扩增了成百上千个质粒拷贝。
一些质粒在菌种间可自由地转移它们的DNA分子,另一些只转移质粒给同种细菌,而有些却根本不转移它们的DNA。
质粒带有具有许多功能的基因,这些功能包括对抗生素和重金属道德抗性、对诱变原的敏感性、对噬菌体的易感或抗性、产生限制酶、产生稀有的氨基酸和毒素、决定毒力、降解复杂有机分子,以及形成共生关系的能力和在生物界内转移DNA的能力。
人工构建的质粒载体分类高拷贝数的质粒载体ColE1、pMB1派生质粒具有高拷贝数的特点。
适合大量增殖克隆基因,或需要大量表达的基因产物。
低拷贝数的质粒载体由pSC101派生来的载体特点是分子量小的拷贝数。
它有特殊的用途:当有些被克隆的基因的表达产物过多时会严重影响寄主菌的正常代谢活动,导致寄主菌的死亡时,就需要低拷贝的载体。
失控的质粒载体这是一类温度敏感型复制控制质粒。
如pBEU1、pBEU2。
插入失活型克隆载体。
载体的克隆位点位于其某一个选择性标记基因内部。
如pDF41、pDF42。
正选择的质粒载体直接选择转化后的细胞。
只有带有选择标记基因的转化菌细胞才能在选择培养基上生长。
质粒载体的筛选特征选择质粒载体的要素是要了解可用到的载体的特征和预测重组克隆所用于的实验。
所有的质粒载体都有三个共同的特征:一个复制子、一个选择性标志和一个克隆位点。
质粒载体的知识点1. 什么是质粒载体?质粒载体是一种常见的DNA分子,在分子生物学研究中广泛应用。
它是一种环状的DNA分子,具有自主复制和传递的能力,能够携带外源DNA序列并在细胞内进行复制和表达。
2. 质粒载体的特点质粒载体具有以下几个特点:•自主复制能力:质粒载体可以独立于宿主细胞的染色体进行复制,从而实现外源DNA的复制。
•传递能力:质粒载体可以在细菌、酵母等微生物细胞中传递,从而实现外源DNA的表达。
•多样性:质粒载体种类繁多,可以根据实验需要选择不同的质粒载体来进行研究。
•多拷贝数:质粒载体通常具有多个拷贝数,使得外源DNA在细胞中得到高效复制和表达。
3. 质粒载体的结构质粒载体通常由以下几个部分组成:•起始子:负责启动质粒载体的复制过程。
•多个限制酶切位点:用于将外源DNA序列插入到质粒载体中。
•选择标记:帮助筛选携带质粒载体的细胞,例如抗生素抗性基因。
•表达元件:包括启动子、终止子和转录调控序列,用于控制外源DNA的表达水平。
4. 质粒载体的应用质粒载体在分子生物学研究中有广泛的应用,包括:•基因克隆:质粒载体可以用于将外源DNA序列引入到细胞中,从而克隆目标基因。
•基因表达:质粒载体可以用于外源基因的表达,从而研究其功能和调控机制。
•基因敲除:质粒载体可以用于引入RNA干扰或基因敲除工具,从而研究基因的功能。
•疫苗研究:质粒载体可以用于构建疫苗候选物,进行疫苗研究和疫苗开发。
5. 质粒载体构建的步骤质粒载体的构建通常包括以下步骤:1.选择质粒载体:根据实验需求选择合适的质粒载体,包括质粒大小、拷贝数和选择标记等因素。
2.线性化质粒载体:使用适当的限制酶切酶将质粒载体线性化,以便后续插入外源DNA序列。
3.插入外源DNA:将目标DNA序列与线性化质粒载体连接,并使用DNA连接酶进行连接反应。
4.转化宿主细胞:将质粒载体导入宿主细胞中,可以使用化学方法或电穿孔等技术实现质粒转化。
5.筛选正品系:根据质粒载体携带的选择标记进行筛选,例如使用抗生素选择培养基筛选带有抗生素抗性的细胞。
基因工程常用的三种载体
基因工程常用的三种载体
基因工程是一种用于改变和改造生物体遗传基因的技术,它是利用分子生物学技术提高生物性状的一种新技术。
在基因工程中,需要使用一种材料将外源基因投入细胞中,这种材料就是载体。
基因工程中常用的载体有以下三种:
1. 质粒载体. 质粒载体是一种比较常见的基因工程载体,具有较强的稳定性,它是一种质粒DNA,也称为质粒DNA,不是单链DNA,它是由细菌质粒的DNA结合其它分子,形成质粒DNA的结构,具有可复制性能,可以在细菌或动物细胞中复制,具有较强的稳定性。
2. 杆状病毒载体. 杆状病毒载体是一种比较常见的基因工程载体,它由病毒的全基因组和其它分子形成,用来转移外源基因到细胞中,可以把外源基因转移到细胞核或任何其它的地方,可以实现基因工程的目的。
3. 化合物载体. 化合物载体是一种新型的载体,它是由多种不同的分子组成的,可以将外源基因转移到细胞核或其它位置,并且可以把这些基因在细胞中表达出来,从而实现基因工程的目的。
质粒的分⼦⽣物学与质粒载体第三章质粒的分⼦⽣物学与质粒载体⼀、填空题1.基因⼯程中有3种主要类型的载体:——-------、------------⼀、-----------.2.由于不同构型的DNA插⼊EB的量不同,它们在琼脂糖凝胶电泳中的迁移率也不同,SC DNA的泳动速度—----------—,OC DNA泳动速度—---------—,L DNA居中,通过凝胶电泳和EB染⾊的⽅法可将不同构型的DNA分别开来。
3.质粒的复制像染⾊体的复制⼀样,是从特定的起始点区开始的。
然⽽,质粒的复制可以是—---—向的、或是—----—向的。
在杂种质粒中,每个复制⼦的起点都可以有效地加以使⽤。
但是在正常条件下只有⼀个起点可能居⽀配地位。
并认为:当某些具有低拷贝数的严紧型质粒与松弛性质粒融合后,在正常情况下—------—的复制起点可能被苯闭。
4.就克隆⼀个基因(DNA⽚段)来说,最简单的质粒载体也必需包括三个部分:—-----—、—---------—、—----------------—。
另外,⼀个理想的质粒载体必须具有低分⼦量。
5.如果两个质粒不能稳定地共存于同⼀个寄主细胞中,则属于—---------—群,这是因为它们的——————————所致。
6.质粒拷贝数是指细胞中—------------------------—。
7.复制⼦由三部分组成:(1)—-----------------—---(2)——-----------————(3)—--------------—。
8.酵母的2µm质粒有------------,可以配对形成哑铃结构。
9.⼀个带有质粒的细菌在有EB的培养液中培养⼀段时间后,⼀部分细胞中已测不出质粒,这种现象叫----------------。
10.pBR322是⼀种改造型的质粒,它的复制⼦来源于----——,它的四环素抗性基因来⾃于—-----------—,它的氨苄青霉素抗性基因来⾃于—---------—。
质 质粒 粒与 与载 载体体 中央研究院 植物研究所 杜 镇 研究员一、质粒绝大多数的生物都是以 DNA 的形式来储藏其遗传信息。
遗传物质要能生生不息地传给后代 的首要条件就是它至少要具有一个复制原(ori, origin of replication ,或译为复制起点),使整 个基因体得以复制。
含有复制原的遗传物质称为 replicon ,我们姑且把它译为为复制体吧!。
原核性复制体分为原核染色体、质粒(plasmids)和噬菌体基因体(phage genome)等三类。
其中 质粒的基因体和原核染色体类似,是由双绞炼 DNA 构成,并以超卷曲的形式存在。
它们的 基因体约由 2,000 至 150,000 个碱基对组成,绝大多数呈环状,但也有极少数是线状构造(如 Borrelia burgdorfferi)。
事实上你可以把它们视为比较小的原核染色体。
在自然环境中它们相 当普遍地生存在原核生物细胞内,并和其宿主的许多特殊功能有关,诸如:赤贺氏杆菌 (Shigella)的抗药、根瘤菌(Rhizobium)的固氮、农杆菌(Agrobacterium)的引瘤及假单胞杆菌 (Pseudomonas)对环状有机物的分解等等。
以下我们谈的以细菌性质粒为主,尤其是革兰氏阴 性菌的质粒。
二、质粒的类型当我们谈到质粒的类型时,就要看你从哪个角度来看它们,譬如说抗药性、结合生殖能力、 宿主范围及 DNA 复制方式等等。
这些分型标准之间并无横向关联。
你无法说能结合生殖的 质粒一定抗药或不抗药,也无法确定宿主范围和质粒套数的调控有何关联。
我们用到这些名 词时,只是对特定质粒的性状做一些描述而已。
质粒的真正系统分类标准并非靠些性状,而 是依据它们的不共容性(incompatibility)。
有的质粒带有显著特征可供我们侦测它们的存在,无已知特征的质粒称为隐性质粒(cryptic plasmids);有特征者称为显性质粒(acryptic plasmids);带有抗药基因的天然质粒称为 R质 粒(Rplasmids)。
第三章质粒的分子生物学与质粒载体一、填空题1.基因工程中有3种主要类型的载体:——-------、------------一、-----------.2.由于不同构型的DNA插入EB的量不同,它们在琼脂糖凝胶电泳中的迁移率也不同,SC DNA的泳动速度—----------—,OC DNA泳动速度—---------—,L DNA居中,通过凝胶电泳和EB染色的方法可将不同构型的DNA分别开来。
3.质粒的复制像染色体的复制一样,是从特定的起始点区开始的。
然而,质粒的复制可以是—---—向的、或是—----—向的。
在杂种质粒中,每个复制子的起点都可以有效地加以使用。
但是在正常条件下只有一个起点可能居支配地位。
并认为:当某些具有低拷贝数的严紧型质粒与松弛性质粒融合后,在正常情况下—------—的复制起点可能被苯闭。
4.就克隆一个基因(DNA片段)来说,最简单的质粒载体也必需包括三个部分:—-----—、—---------—、—----------------—。
另外,一个理想的质粒载体必须具有低分子量。
5.如果两个质粒不能稳定地共存于同一个寄主细胞中,则属于—---------—群,这是因为它们的——————————所致。
6.质粒拷贝数是指细胞中—------------------------—。
7.复制子由三部分组成:(1)—-----------------—---(2)——-----------————(3)—--------------—。
8.酵母的2μm质粒有------------,可以配对形成哑铃结构。
9.一个带有质粒的细菌在有EB的培养液中培养一段时间后,一部分细胞中已测不出质粒,这种现象叫----------------。
10.pBR322是一种改造型的质粒,它的复制子来源于----——,它的四环素抗性基因来自于—-----------—,它的氨苄青霉素抗性基因来自于—---------—。
11.质粒的消失同染色体基因的突变是不同的,前者不能恢复,后者可以通过—------—恢复该基因的性状。
12.ColEl质粒复制的起始需要三种酶,即—-----------—、一------------和一------。
13.YAC的最大容载能力是—-----------—,BAC载体的最大容载能力是—---------—。
14.pSCl01是一种---------——复制的质粒。
15.把那些没有可检测表型的质粒称为—--------------—。
16.转座子主要由下列部分组成:(1)—-----————————(2)---------------——(3)—----------------—。
17.pUCl8质粒是目前使用较为广泛的载体。
pUC系列的载体是通过——---------和——两种质粒改造而来。
它的复制子来自—----------—,Amp抗性基因则是来自—--------—。
18.在基因型的表示中,符号Ω表示—-----------—;符号△表示—--------------—。
二、判断题1.迄今发现的质粒DNA都是环状的。
2.线性质粒同环状质粒一样都不带有宿主必需的基因。
3.有a、b、c三个质粒,因为a和b能够共存于一个细胞,a和c也可共存于同一个细胞,所以b和c一定能够共存于同一个细胞。
4.插入元件(1S)也是一种转座元件,它除了有转座酶基因外,还有附加基因。
5.如果两个不同的质粒可以稳定地共存于同一个细胞中,这两种质粒则属于同一个不亲和群。
6.一个带有反向重复序列的双链DNA经变性后,复性时其单链可形成发夹环。
7.能够在不同的宿主细胞中复制的质粒叫穿梭质粒。
8.任何一种质粒都可以用氯霉素扩增的方法,增加它的拷贝数。
9.只有完整的复制子才能进行独立复制,一个失去了复制起点的复制子不能进行独立复制。
10.CsCl-EB密度梯度离心法纯化SC DNA原理是根据EB可以较多地插入到SC DNA中,因而沉降速度较快。
11.质粒ColEl同pSCl01共整合后,得到重组质粒pSCl34,具有两个复制起点,这两个起点在任何细胞中都是可以使用的。
12.pBR322可以用于黏性末端连接、平末端连接和同聚物接尾法连接,无论用哪种方法连接,都可以用同一种酶回收外源片段。
13.所谓穿梭质粒载体是能够在两种以上的不同宿主细胞中复制的质粒,所用的复制起点不同。
14.一般情况下,质粒既可以整合到染色体上,也可以独立存在。
15.ColEl是惟一用作基因工程的自然质粒载体,它具有四环素抗性标记,因而很容易选择。
16.某一染色体DNA经内切酶Sal I切割后,产生了若干个具有黏性末端的DNA片段,将这些片段分别在T4 DNA连接酶的作用下自身连接成环,然后导人受体细胞,都可以进行独立地复制。
17.如果细菌的某种表型特征在UV处理下丧失后不再恢复,这种表型有可能是质粒赋予的。
18.基因克隆中,低拷贝数的质粒载体是没有用的。
三、选择题(单选或多选)1.线性质粒复制的引物来自于( )(a)细胞中合成的小分子RNA(b)自身末端的端粒序列(c)外加的寡聚DNA(d)自身断裂的小分子DNA2.下面关于松弛型质粒(relaxedplasmid)性质的描述中,( )是不正确的(a)质粒的复制只受本身的遗传结构的控制,而不受染色体复制机制的制约,因而有较多的拷贝数(b)可以在氯霉素作用下进行扩增(c)通常带有抗药性标记(d)同严紧型质粒融合后,杂合质粒优先使用松弛型质粒的复制子3.基因工程中所用的质粒载体大多是改造过的,真正的天然质粒载体很少,在下列载体中只有( )被视为用作基因工程载体的天然质粒载体(a)pBR322 (b)pSCl01(c)pUBll0 (d)pUCl84.下列哪种克隆载体对外源DNA的容载量最大?( )(a)质粒(b)黏粒(c)酵母人工染色体(YAC)(d)λ噬菌体(e)cDNA表达载体5.反向重复序列:( )(a)可以回折形成发夹结构 (b)可以是某些蛋白的结合位点(c)参与转座子的转座 (d)12 1-说法都不对6.松弛型质粒: ( )(a)在寄主细胞中拷贝数较多 (b)可用氯霉素扩增(c)一般没有选择标记 (d)上述(a)、(b)两项正确7. ColEl是惟一用作基因工程载体的自然质粒,这种质粒: ( )(a)是松弛复制型 (b)具有四环素抗性(c)能被氯霉素扩增 (d)能产生肠杆菌素8.同一种质粒DNA,以三种不同的形式存在,电泳时,它们的迁移速率是:( )(a)OC DNA>SC DNP>LDNA (b)SC DNA>L DNA>OC DNA(c)L DNA>OC DNA>SC DNA (d)SC DNA>OC DNA>L DNA9. pBR322是一种改造型的质粒,含有两个抗性基因,其中四环素抗性基因来自:( )(a) ColEl (b)Ri质粒 (c)pSCl01 (d)pUCl810.关于质粒的相容性,下面哪一种说法不正确? ( )(a)不同相容群的质粒能够共存于同一个细胞(b)质粒可以分成若干个不相容群,但不能分成若干个相容群(c)如果a、b两种质粒不相容,说明它们的复制机制相同(d)属于同一个不相容群中的质粒,不仅复制机制相同,而且拷贝数和分子量也相同11.关于穿梭质粒载体,下面哪一种说法最正确?( )(a)在不同的宿主中具有不同的复制机制(b)在不同的宿主细胞中使用不同的复制起点(c)在不同的宿主细胞中使用不同的复制酶(d)在不同的宿主细胞中具有不同的复制速率12.能够用来克隆32kb以下大小的外源片段的质粒载体是( )(a)charomid (b)plasmid (c)cosmid (d)phagemid13.第一个作为重组DNA载体的质粒是( )(a)pBR322 (b)ColEl (c)pSCl01 (d)pUCl814.Ti质粒:( )(a)可从农杆菌转到植物细胞中(b)作为双链DNA被转移(c)在植物中导致肿瘤(d)介导冠瘿碱的合成,作为细菌的营养物和植物的生长激素(e)需要细菌的vir基因帮助转移(f)在植物细胞中作为染色体外质粒四、简答题1. YAC载体具有什么样的功能性DNA序列?为什么在克隆大片段时,YAC具有优越性?2.列举质粒载体必须具备的4个基本特性。
3.什么叫穿梭载体?4.说明减少质粒和噬菌体载体上某种酶的识别位点的方法和原理。
5.虽然质粒的带动转移给质粒载体的安全性带来一定的困难,但是通过带动转移将质粒转移到特定的受体菌中也是基因工程中常用的实验技术。
请举一例说明之。
6.为什么来自HfrⅹF-的重组体几乎总是F-?7.解释为什么不同的Hfr菌株具有不同的转移起点和方向?8.怎样从一个E.coli的Hfr菌株中分离到一个F′gal+的菌株?9.你已经分离了一个新的F因子,怎样用最简便的方法知道最初的F因子的部分DNA已经被切除,并被一个外源DNA(也就是细菌DNA)所替代?10.你能用哪一种基因转移的方法确定(1)Kcoli染色体上一个新发现的基因座在其染色体上的位置;(2)一个新分离的突变在基因内的位置。
11.用加有注释的图表说明F质粒是怎样从一个P细胞转移到F细胞。
并简要说明转移复制如何不同于营养体的复制。
五、问答题1.什么是复制子(replicon)?2.什么是质粒的相容性?什么是不相容群?机制是什么?3.什么是质粒的带动转移?4.说明变性定位法和限制性内切核酸酶定位法研究质粒复制起点的原理。
5. ColEl衍生质粒拷贝数调节机理的机理是什么?6. R1质粒拷贝数受到怎样的调节控制?7.质粒如何维持在细胞中的稳定?8. 引起质粒不相容性的主要原因是什么?9.由于基因工程是人为改变遗传信息的操作,因此必须注意被操作基因的安全,进行严格的监控,质粒载体的安全性是十分重要的。
请问质粒载体的安全条件包括哪几个方面?10.请指出质粒pSCl01的一些生物学特性(包括结构和遗传)及在基因工程中的作用。
11.自然界中具备理想条件的质粒载体为数不多,即使是ColEl和pSCl01这两个自然质粒也不尽人意,通常需要进行改造,请问质粒改造包括哪些基本内容?12.质粒改造的发展过程如何?13.在质粒中如何增减酶切点?14.有人用限制性内切核酸酶EcoRl分别切割松弛型质粒ColEl和严紧型质粒pSCl01(各有一个切点),然后重组连接形成一个杂种质粒pSCl34,请推测这种质粒有什么特性和用途。
15.现分离了4种新的大肠杆菌Hfr菌株,通过中断接合实验,针对每一菌株确定了高频转移的标记基因和它们进入F受体的时间分别为:Hfrl Hfr2 Hfr3 Hfr4man 13min mal 29 lys 16 pur 6标记基因和第一 trp 6 met 14 arg 9 trp 3次进入的时间 his 23 thr 4 mal 2 thr 31pur 3 uvr 20 his 32 lac 23gal 14(gal、lac、mal、man不能发酵半乳糖、乳糖、麦芽糖和甘露糖;arg、his、met、trp:生长需要精氨酸、组氨酸、赖氨酸、甲硫氨酸、嘌呤和色氨酸;uvr:紫外线敏感)。