分子模拟实验作业——分子光谱模拟一、 实验部分1.红外光谱：分别用PM3，HF/6-31G(d),B3LYP/6-31G(d),MP2/6-31G(d)四种理论方法计算H 2O 分子的红外光谱，并比较结果的优劣。实验上测得的水分子的振动频-1-1由图像可得四种理论方法得到的振动频率分别为B3LYP/6-31G(d) 1634 cm-1、3566 cm-1、3

一、反应物和产物的电子结构乙烯GAMESS Job: Minimize (Energy/Geometry) RHF/6-31G(d)Finish @ energy = -48965.597501 Kcal/Mol (-78.031711 Hartrees)Wire-frame ball-stick cylindrical bonds space fillin

1.红外光谱：分别用 PM3 ,HF/6-31G(d),B3LYP/6-31G(d),MP2/6-31G(d) 四种理论方法计算 H 2O 分子的红外光谱，并比较结果的优劣。实验 上测得的水分子的振动频率为：1594cm 1, 3657cm -1, 3756cm 1。k(Lore ntz)B3LYP/6-31G(d)由图像可得四种理论方法得到的振动频率分别为

武汉大学化学与分子科学学院《分子模拟实验》实验报告化学反应模拟指导老师：侯华姓名：陆文心专业：化学弘毅班学号：2012301040179日期：2014年11月13日、11月20日（周四下午）一、实验内容问题10-1-1仿照CH4的例子，计算甲基自由基（·CH3）的生成焓（与实验值35kcal/mol 比较）和生成自由能，可采用B3LYP/6-31G(d)理论

分子模拟

分析模拟实验实验报告（二）武汉大学化学与分子科学学院一、实验结果2.问题7-1-2 画“三键链”的结果是什么？答: “三键链”画不出来3.问题7-1-3 画出多个联苯环的共轭结构答：画不出“多联苯环的共轭结构”5.问题7-3-1 计算H2O的二聚体的结构6.问题7-4-17.问题7-4-2简介：IUPAC名称为benzylidene[1,3-bis(2,4,

分子模拟实验设计实验杨平化基一班2012301040010星期三下午指导老师：侯华利用量子化学知识模拟Ritter reaction的机理背景Ritter反应，即腈类和容易形成碳正离子的化合物，诸如烯、醇、羧酸、酯、酮等在强酸存在的条件下发生的一类反应,该反应能生成N-取代的酰胺或胺类化合物(将N-取代的酰胺水解即得),是构筑C-N键最为重要的方法之一。Ri

分子模拟实验报告一、优化分子几何构形（B3LYP/6‐31++G*）分子 结构 能量（Hartrees） 关键键参数H2O‐76.38552R O(1)‐H(2)=0.969Å∠H(3)‐O(1)‐H(2)=105.5°CH2O‐114.44963R C(1)=O(2)=1.209ÅR C(1)‐H(4)=1.109Å∠H(3)‐C(1)‐O(2)=121.

综合实验报告2011301040057 化基三班杨丽引言：为了复习本学期所学过的一些分子模拟实验的基本操作，我运用在分子模拟实验课堂上学习到的理论原理和计算方法试着对Diels-Alder反应进行了理论上的研究。选取的是最常规的乙烯与丁二烯的D-A反应。通过对D-A反应的从头算模拟，我更加系统的理解和掌握了分子模拟的基本原理及方法；初步学会了如何应用化学计算

8-1-1NO键长：1.1 A键能：-81100.1 Kcal/Mol (-129.24135 Hartrees) LUMO+1 (N=8) 163.155 eVLUMO+1 (N=7) -2.832 eVHOMO (N=6) -2.832 eVHOMO-1 (N=5) -12.846 eVHOMO-2 (N=4) -21.326 eVHOMO-3 (N=3

一、反应物和产物的电子结构乙烯GAMESS Job: Minimize (Energy/Geometry) RHF/6-31G(d)Finish @ energy = -48965.597501 Kcal/Mol (-78.031711 Hartrees)Wire-frame ball-stick cylindrical bonds space fillin

在做振动频率计算时, 必须用同一理论水平下优化好 的分子结构, 否则没有意义.一般需要后处理才能得到标准状态下的生成焓, 熵, 自由能数据.实验四 — 化学反应模拟步骤1. 热力学

分子模拟实验作业——生物大分子一、实验部分12-3-1获得PDB 号为“1HCK”的蛋白（human -cyclin -dependent kinase 2,i,e.,CKD2和ATP 的结合晶体结构），并采用不同的模型观察其特点①分别用卡通模型和丝带模型显示生物大分子结构，并用球棍模型、棒状模型显示其中小分子、金属离子等。丝带模型&球棍模型卡通模型&棒状模

武汉大学化学与分子科学学院《分子模拟实验》实验报告势能面计算指导老师：侯华姓名：陆文心专业：化学弘毅班学号：2012301040179日期：2014年10月23日、10月30日（周四下午）一、实验内容问题9-1-1Cl2分子解离的势能曲线。1. 单重态Cl2解离势能曲线（MP2、B3LYP）2. 单重态Cl2、三重态Cl2解离势能曲线（MP2）3. Mors

学校：北京化工大学 学院：化学工程学院 专业：化学工程与工艺 学号：2010013017 姓名：闵 翔 班级：化工1001 老师：黄世萍 日期：2013年4月26日Lennard-Jones 体系的分子动力学模拟Lennard-Jones体系的分子动力学模拟摘要：分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要是依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动，以在由分子体系的不同

分子模拟实验--Expt-2

武汉大学化学与分子科学学院《分子模拟实验》实验报告生物大分子模拟指导老师：侯华姓名：陆文心专业：化学弘毅班学号：2012301040179日期：2014年12月18日（周四下午）一、实验内容问题12-3-1获得PDB号为“1HCK”的蛋白（human cyclin-dependent kinase 2,i.e.，CDK2和ATP的结合晶体结构），并采用不同的

分子模拟实验实验报告化学反应模拟

分子模拟实验报告一、H-H-F共线结构势能面图的绘制绘制H-H F线型分子，改变H-H和H-F间距离，在MP2/DZV理论水平计算单点能，将R H-H、R H-F 和能量输入Origin软件，绘制3D势能面图（图1）和势能面投影图（图2）。图1 H-H-F共线结构的3D势能面图图2 H-H-F共线结构的势能面投影图二、乙烷分子内转动势垒计算在Chem3d中画

分子模拟PPT—第一章 概论