碳青霉烯酶在碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯杆菌的分布及分子流行病学
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碳青霉烯类耐药肠杆菌科细菌的分子生物学及其临床感染特征研究细菌耐药性目前已成为全球性关注的问题,耐药细菌所致感染已构成新世纪抗感染治疗的新挑战,是当前人类健康和生命面临的主要威胁。
肠杆菌科细菌分布广,与人类关系密切。
在医院感染中,肠杆菌科细菌包括大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌等是引起医院感染最常见的病原菌,并以多重耐药菌株引起的感染为显著特点。
碳青霉烯类抗生素是目前临床治疗产超广谱β-内酰胺酶(Extended Spectrumβ-Lactamases, ESBLs)及AmpC酶等多重耐药菌株所引起感染的最有效的抗菌药。
但随着该类抗生素在临床上的广泛应用及不合理使用,临床上已出现对碳青霉烯类抗生素耐药的菌株。
目前国内外关于肠杆菌科细菌对碳青霉烯类抗生素的耐药机制报道主要集中在四个方面:①产生碳青霉烯酶,如IMP型和VIM型金属酶以及KPC (Klebsiella pneumoniae carbapenemase, KPC)型碳青霉烯酶等;②ESBL和/或AmpC酶过度表达同时合并外膜孔蛋白的丢失;③外排泵高表达的膜屏障机制;④药物靶位改变。
在上述几种耐药机制中,产碳青霉烯酶是肠杆菌科细菌对碳青霉烯类耐药最主要的机制。
骆俊等人对2003年6月到2004年5月华山医院临床分离的耐亚胺培南的革兰阴性杆菌中的碳青霉烯酶进行了筛查,发现细菌产碳青霉烯酶是不动杆菌和弗劳地柠檬酸杆菌对亚胺培南和美罗培南等碳青霉烯类抗生素耐药的主要原因之一。
沈继录等人采用琼脂稀释法测定亚胺培南和美罗培南对199株革兰阴性杆菌的最低抑菌浓度(MIC),结果显示耐碳青霉烯类革兰阴性杆菌对12种抗生素的耐药率均高于碳青霉烯类敏感革兰阴性杆菌的耐药率,而且产生多种碳青霉烯酶,如KPC、IMP、VIM和OXA型碳青霉烯酶等,并在弗劳地柠檬酸杆菌、鲍曼不动杆菌和肺炎克雷伯菌中有产酶克隆株的流行。
在巴西,肠杆菌科细菌中对碳青霉烯耐药已成为主要问题,特别是产KPC酶的耐药株已在多个地区报道。
碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌中KPC基因分布杨朵;胡智颖;辛续丽【摘要】目的检测碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌中KPC基因分布情况,为此类菌感染的预防与控制提供理论依据.方法改良Hodge试验检测医院临床分离肺炎克雷伯菌中碳青霉烯酶表型;PCR法检测KPC基因的携带率.结果 642株碳青霉烯类抗生素耐药的肺炎克雷伯菌中,Hodge试验阳性率为96.6%.KPC基因的携带率为50.9%,均为KPC-2型.结论该医院临床分离的碳青霉烯类抗生素耐药肺炎克雷伯菌中KPC基因主要为KPC-2基因.【期刊名称】《中国感染与化疗杂志》【年(卷),期】2016(016)004【总页数】3页(P465-467)【关键词】肺炎克雷伯菌;碳青霉烯酶;KPC基因;Hodge试验【作者】杨朵;胡智颖;辛续丽【作者单位】首都医科大学附属北京世纪坛医院中心实验室,北京100038;首都医科大学附属北京世纪坛医院检验科,北京100038;首都医科大学附属北京世纪坛医院检验科,北京100038【正文语种】中文【中图分类】R378肺炎克雷伯菌是常见的医院感染病原菌,碳青霉烯类抗生素是治疗包括产ESBL在内肺炎克雷伯菌感染的重要抗菌药物。
但近年来碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌的出现,给临床感染控制提出了严重挑战。
目前研究认为,对碳青霉烯类抗生素产生耐药机制主要包括细菌外膜蛋白通透性下降、产碳青霉烯酶等[1],其中产碳青霉烯酶,特别是KPC型酶(Klebsiella pneumoniae carbapenemase,KPC)是肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗生素产生耐药的重要机制。
我院从2009年首次检出碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌,近年来此类菌已成为本院感染的重要致病菌,了解其对碳青霉烯类抗生素的耐药机制,了解KPC基因的分布情况,将有助于此类菌医院感染的有效控制。
1.1 材料1.1.1 菌株来源 642株碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌分离自本院2011年1月-2013年12月临床标本(剔除同一患者的同一部位重复菌株)。
耐碳青霉烯类肺炎克雷伯杆菌的感染现状及治疗进展摘要:本文首先对耐碳青霉烯类肺炎克雷伯杆菌(CRKP)的感染现状进行了分析,其次对其抗感染治疗的最新研究进展分别按照药物种类从β-内酰胺酶抑制剂、β-内酰胺类抗生素、氨基糖苷类抗生素、甘氨酰环素类抗生素、多肽类抗生素及中西医结合治疗的角度进行了分析,现综述如下:关键词:耐碳青霉烯类;肺炎克雷伯菌;抗感染;耐药;机制由于临床抗生素的长期大量应用,耐碳青霉烯类肺炎克雷伯杆菌(Carbapenem-Resistant Klebsiella Pneumoniae,CRKP)感染发病率逐年增加,耐药性的增加,使得治疗该病可供选择的药物类型不断减少,临床治疗难度提升。
对比,本文针对CRKP的感染现状及治疗的最新进展开展综述,以期能为循证医学提供临床指导。
2.1感染现状其中CRKP占CRE菌种感染的73.9%;从国内的耐药区域分布分析,河南省最高;从感染部位上分析,下呼吸道感染占比最高。
近年来CRKP的检出率正不断上升,2014年数据为6.4%,而2019年数据则攀升至10.9%,可见细菌耐药已成为危害全球卫生健康的重大卫生问题之一[1]。
2.2治疗进展2.1 β-内酰胺酶抑制剂其中以药物阿维巴坦为代表,该药物抑酶作用较为长效。
临床为强化该药的抗菌活性,常采用复合给药的方式,与头孢他啶相联合。
临床给药时,针对老年人,给药依据参照患者肾功能水平;而针对≥18岁以上人群,建议根据血药浓度水平及年龄调整剂量。
最新研究显示,头孢他啶-阿维巴坦杀灭肺炎克雷伯菌的效果较为显著。
数据结果显示,90%的抑菌浓度为8mg/L、50%的抑菌浓度为4mg/L[2]。
2.2 β-内酰胺类抗生素其中以美罗培南为代表,该药物的抗菌效果较为强力。
最新临床研究结果显示,针对菌群最低抑菌浓度≤8mg/L的KPC型肺炎克雷伯菌感染患者,应用美罗培南治疗,患者存活率提升较为显著。
研究者又进行了另一项实验,将菌群的最低抑菌浓度调整至≥16mg/L,结果显示美罗培南同样具备保护患者的效果。
DOI:10.12138力.I s sii.1671-9638.20216172•论著•全国细菌耐药监测网2014—2019年耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌流行病学变迁全国细菌耐药监测网[摘要]目的了解中国耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药变迁。
方法分析2014—2019年全国细菌耐药监测报告中CRKP相关数据,比较不同地区、不同等级医院、不同标本来源、不同年龄组及不同科室CRKP的耐药变迁。
结果全国CRKP检出率从2014年的6.4%上升至2019年10.9%.2019年河南省及上海市CRKP检出率最高,分别为32.8%和2&7%,西藏检出率最低(为0.6%)2019年全国儿童医院、三级医院及二级医院CRKP检出率分别为14.0%,11.6%及5.5%;2019年全国重症医学科患者CRKP检出率最高(23.0%),高于住院、急诊及门诊患者。
结论中国CRKP检出率呈现上升趋势,不同地区及不同科室间存在差异。
[关键词]肺炎克雷伯菌;碳青霉烯类耐药;抗生素;耐药性;全国细菌耐药监测网[中图分类号]R181.3+2Epidemiological change in carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae: surveillance report from China Antimicrobial Resistance Surveillance in 2014-2019China AnUmicrobial Resistance Surveiilance System[Abstract]Objective To investigate the change in antimicrobial resistance of carbapenem-resistant Klebsiella pneumoniae(CRKP)in China.Methods Data of CRKP in report of China Antimicrobial Resistance Surveillance System(CARSS)from2014to2019were analyzed,change in antimicrobial resistance of CRKP in different areas, different levels of hospitals,different specimen sources,different age groups,and different departments were compared.Results Isolation rate of CRKP in China rose from6.4%in2014to10.9%in2019.In2019,the highest isolationratesofCRKP werein HenanProvinceandShanghaiCity,which were328%and28%respectively,and the lowest rate was0.6%in Xizang;in2019,isolation rates of CRKP in children's hospitals,tertiary hospitals and secondary hospitals were14.0%,11.6%and5.5%respectively;isolation rate of CRKP from patients in intensive care unit was the highest(23.0%),which was higher than those of other hospitalized patients,patients in outpatient department and emergency department.Conclusion Isolation rate of CRKP in China is on the rise,there are di f erencesamongdi f erentareaanddepartments[Keywords]K l ebsie l l a pneumoniae;carbapenem resistance;antibiotic;antimicrobial resistance;China Antimi-crobialResistanceSurvei l anceSystem肺炎克雷伯菌(K l ebsiella pneumoniae,KP)是引起临床感染性疾病的常见病原菌,可引起呼吸道、血液、腹腔及泌尿系统等部位感染。
碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌β-内酰胺酶检测和基因分型王靖;李杰;李春英;张悦娴;贾红兵;鄢盛恺;衣美英【摘要】目的探讨碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯菌产β-内酰胺酶情况和β-内酰胺酶基因分型研究.方法用Vitek-Ⅱ全自动微生物分析仪对本院临床标本中分离的对碳青霉烯类耐药的肺炎克雷伯菌进行菌种鉴定和药物敏感试验;用冻融法提取β-内酰胺酶,三维试验检测β-内酰胺酶[ AmpC酶、超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)、金属酶];改良Hodge试验检测KPC酶;用PCR扩增TEM、SHV、CTX-M、PER、VEB、DHA、MIR/ACT、KPC、IMP、VIM、SPM、GIM和NDM-1基因,并对阳性基因进行测序分析确定其基因型;REP-PCR检测分析其同源性.结果 4株对碳青霉烯类抗生素耐药肺炎克雷伯菌均表现为多重耐药,其中2株菌对所有测试的抗菌药物均耐药;1株菌产金属酶,由IMP-4型金属酶基因编码;4株菌均产生DHA型AmpC酶,2株菌产CTX-M14型ESBLs;1株菌产TEM-71型ESBLs,均经测序证实;未检测出SHV、PER、VEB、M1R/ACT、KPC、VIM、SPM、GIM和NDM-1基因型.REP-PCR显示4株菌属于3个不同的克隆型.结论本院出现碳青霉烯类耐药的肺炎克雷伯菌,属于不同克隆型,产多种β-内酰胺酶(AmpC酶、ESBLs、金属酶),基因型为DHA、IMP-4、CTX-M-14、TEM-71.【期刊名称】《临床检验杂志》【年(卷),期】2012(030)003【总页数】4页(P201-203,206)【关键词】肺炎克雷伯菌;碳青霉烯类;β-内酰胺酶;耐药性;基因分型【作者】王靖;李杰;李春英;张悦娴;贾红兵;鄢盛恺;衣美英【作者单位】中日友好医院检验科,北京1000029;中日友好医院检验科,北京1000029;中日友好医院检验科,北京1000029;中日友好医院检验科,北京1000029;中日友好医院检验科,北京1000029;中日友好医院检验科,北京1000029;中日友好医院检验科,北京1000029【正文语种】中文【中图分类】R446.5亚胺培南和美罗培南是治疗革兰阴性杆菌感染的主要碳青霉烯类药物,特别是能有效治疗产超广谱β内酰胺酶(ESBLs)和持续高产头孢菌素酶 (AmpC酶)的革兰阴性杆菌感染,已成为重症监护室防治革兰阴性菌感染的主要抗菌药物。
肺炎克雷伯菌耐碳青霉烯类抗菌药的研究进展唐小红;朱卫民【摘要】肺炎克雷伯菌是一种常见的机会性致病菌,为医院内感染的重要病原菌之一.近年来,肺炎克雷伯菌的感染率及耐药率呈上升趋势,碳青霉烯类抗菌药是治疗该菌最有效的抗菌药物,但随着使用的增加,其耐药性也不断增加.本文就肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗生素耐药的主要机制:产生碳青霉烯酶、青霉素结合蛋白对碳青霉烯类亲和力的下降、高产AmpC酶或ESBLs合并外膜蛋白缺失、生物被膜、主动外排系统等方面的研究进展作一综述.【期刊名称】《国外医药(抗生素分册)》【年(卷),期】2014(035)003【总页数】5页(P115-118,122)【关键词】肺炎克雷伯菌;碳青霉烯酶;碳青霉烯类抗生素;细菌;耐药性【作者】唐小红;朱卫民【作者单位】重庆医科大学附属第一医院感染科, 重庆400016;重庆医科大学附属第一医院感染科, 重庆400016【正文语种】中文【中图分类】R378肺炎克雷伯菌(Kpn)属于克雷伯菌属的7个亚种之一—肺炎克雷伯菌肺炎亚种,革兰阴性菌,是重要的条件致病菌。
常导致肺炎、支气管炎、泌尿道和创伤感染等医院感染。
近十年来,因青霉素与头孢类抗菌药的大量及广泛使用,尤其是第3代头孢抗菌药的使用,肺炎克雷伯菌对β-内酰胺类抗生素为主的各种抗菌药的耐药性不断增强,该耐药菌的出现加剧了各种难治性感染,使治疗十分棘手 [1-3]。
碳青霉烯类抗生素因其广谱的抗菌活性,对超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)、头孢菌素酶(AmpC)稳定,持续的抗菌后效应[4]等特点,已成为临床治疗革兰阴性菌引起严重感染的一线药物[5],更成为治疗肠杆菌科细菌引起严重感染的首选药物。
但随着应用的增加,对其耐药的报道也逐渐增多。
探究其耐药机制有:产生碳青霉烯酶,青霉素结合蛋白对碳青霉烯类亲和力的下降,高产AmpC酶或ESBLs合并外膜蛋白缺失,生物被膜,主动外排系统。
本文就近年来肺炎克雷伯菌耐碳青霉烯类抗菌药的主要作用机制作一介绍,分述如下。
肺炎克雷伯菌耐药机制的研究进展肺炎克雷伯菌是临床分离和医院获得性感染最常见的致病菌之一,其主要耐药机制包括产生抗菌药物灭活酶、抗菌药物渗透障碍(生物被膜和外膜孔蛋白缺失)、药物作用靶位的改变、主动外排泵系统的亢进作用、整合子等。
肺炎克雷伯菌耐药机制的研究对于控制耐药菌的播散和合理使用抗生素都具有重要的意义。
本文就上述耐药机制的研究进展进行综述。
肺炎克雷伯菌(KPN)是重要的条件致病菌和医源性感染菌之一。
近年来,由于临床上抗菌药物的大量应用和滥用,致使KPN耐药率居高不下,直接影响到临床治疗效果。
Amazian等[1]研究显示,肺炎克雷伯菌占地中海地区医院内感染的9.2%;2011年全国医院感染监控网医院感染病原菌分布调查显示KPN占9.03%,成为国内医院感染的第二大病原菌[2]。
国外曾经报道一组由多重耐药KPN引起医院内感染的暴发流行,死亡率高达40%[3]。
KPN主要耐药机制包括产生抗菌药物灭活酶、药物作用靶位的改变、抗菌药物渗透障碍(生物被膜、外膜孔蛋白缺失)、主动外排泵系统的亢进作用等,同时抗菌药物耐药基因借助质粒、转座子、整合子的播散也是耐药菌株临床加剧的重要原因。
本文对上述耐药机制的研究进展作一简要综述。
1 产生抗菌药物灭活酶细菌可产生许多能引起抗菌药物灭活的酶,主要包括β-内酰胺酶、氨基糖苷类钝化酶(AME)。
KPN对β-内酰胺类药物耐药的主要机制之一是产生β-内酰胺酶。
它可通过水解β-内酰胺环,使β-内酰胺类药物水解从而失去抗菌活性,其水解率是细菌耐药性的主要决定因素。
KPN产生的β-内酰胺酶主要包括产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)、质粒介导的AmpC酶、耐酶抑制剂的β-内酰胺酶(IRBLs)及碳青霉烯酶(KPC酶)等。
1.1 产超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)ESBLs是KPN耐药产生的最主要的一类酶。
1983年由德国报告了世界上第一例ESBLs,1994年在中国医学科学院北京协和医院发现国内首例ESBLs感染,迄今已报告的ESBLs的代表菌株有肺炎克雷伯杆菌、大肠杆菌等。
基金项目:温州市科技计划项目(Y20140035)作者简介:王建友(1973-),男,主管技师,从事细菌耐药性方面研究,Email:wangjianyouyq@163.com通讯作者:王建友
·论著·碳青霉烯酶在碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯杆菌的分布及分子流行病学
王建友1,周阿旺2,陈丹11.检验科;2.呼吸内科,乐清市第二人民医院,浙江乐清325608
摘要:目的了解碳青霉烯酶在碳青霉烯类抗生素耐药肺炎克雷伯杆菌的分布及其分子流行病学。方法收集我院2010年1月至2012年12月分离的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯杆菌120株,采用改良Hodge试验及EDTA协同试验进行碳青霉烯酶表型的确认,用PCR方法扩增碳青霉烯酶基因(KPC、IMP、NDM、VIM、OXA-48),经电泳检测扩增产物后纯化测序。通过MLST及ERIC-PCR进行分子流行病学分析。结果
120株碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯杆菌中,95株CRKP菌株改良Hodge试验阳性,64株菌株EDTA协
同试验阳性。经PCR及测序确认,83株主要携带KPC-2型碳青霉烯酶,占69.2%;其次为IMP-4型金属酶,占28.3%(34/120),NDM-1型金属酶15株,占12.5%,未发现VIM和OXA-48碳青霉烯酶。ERIC-PCR及MLST分型显示出20个基因分型,其中ST395-A型和ST11-B型主要流行于产KPC-2型菌株中,占
43.88%;ST263-B型和ST15-C型主要流行于产NDM-1菌株中,占13.27%;而ST11-B型主要分布于产
IMP-4和KPC-2菌株中,占24.49%。结论我院碳青霉烯酶耐药肺炎克雷伯杆菌存在多种碳青霉烯酶,主要以KPC-2为主,产不同种类碳青霉烯酶菌株存在不同的流行基因型。关键词:碳青霉烯酶;流行病学;肺炎克雷伯杆菌中图分类号:R378.996文献标志码:A文章编号:1005-376X(2015)05-0517-04DOI编码:10.13381/j.cnki.cjm.201505006
Thedistributionandmolecularepidemiologyofcarbapenemaseincarbapenem-resistantKlebsiellapneumoniaeWANGJian-you1,ZHOUA-wang2,CHENDan11.DepartmentofLaboratoryMedicine;2.DepartmentofRespiratoryMedicine,theSecondPeople'sHospitalofYueqing,Yueqing325608,ChinaCorrespondingauthor:WANGJian-you,Email:wangjianyouyq@163.comAbstract:ObjectiveToinvestigatethedistributionandmolecularepidemiologyofcarbapenemaseincarbapenem-resistantKlebsiellapneumoniaeinourhospital.Methods120strainsofcarbapenem-resistantKlebsiellapneumoni-ae(CRKP)werecollectedfromourhospitalfromJan2010toDecember2012.ThemodifiedHodgetestandEDTAdouble-discsynergytestwereusedtodetectthecabapenemase.PCRwasusedtoamplifythecarbapenemasegenes(KPC,IMP,NDM,VIMandOXA-48),andallthePCRproductsweresequencedtobeconfirmed.Themolecu-larepidemiologyanalysiswasdonebyMLSTandERIC-PCR.ResultsAmongthe120strainsofCRKPs,95werepositivebythemodifiedHodgetestand64werepositivebyEDTA-synergismtest.PCRandsequencingconfirmedthat83strainscarriedKPC-2carbapenemase,accountingfor69.2%,followedbyIMP-4enzyme,accountingfor28.3%(34/120).Inaddition,therewere15strainsofNDM-1carbapenemaseproducers,accountingfor12.5%.TheVIMandOXA-48carbapenemaseswerenotfound.Therewere15genotypesofcarbapenemase-produ-cingKlebsiellapneumoniaeshowedbyERIC-PCRandMLSTtyping.Amongthem,theST395-AtypeandST11-BtypeareprevalentinKPC-2-producingstrains,accountingfor43.88%;ST263-BtypeandST15-Ctypewerepre-
715中国微生态学杂志2015年5月第27卷第5期
ChineseJournalofMicroecology,May.2015,Vol.27No.5dominantinNDM-1-producingstrains,accountingfor13.27%;ST11-Btypemainlydistributedinthestrainspro-ducingbothIMP-4andKPC-2,accountingfor24.49%.ConclusionThereareseveralcarbapenemasetypesprev-alentinthecarbapenem-resistantKlebsiellapneumoniaestrainsinourhospital.TheresistanceismainlymediatedbytheblaKPC-2gene.Thereareseveralprevalentgenotypesexistedinthestrainsproducingdifferenttypesofcar-bapenemase.Keywords:Carbapenemase;Epidemiology;Klebsiellapneumoniae
肺炎克雷伯杆菌是目前临床最常见的院内感染致病菌之一[1],由于人口流动的增多,临床多重耐药肺炎克雷伯杆菌甚至“超级细菌”正在以惊人的速度流行全球[2]。碳青霉烯类抗生素作为治疗产ESBL及多重耐药肺炎克雷伯杆菌感染的首选药物而受到临床治疗的广泛欢迎,同时也给临床耐药带来了严重的问题。近年来,碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯杆菌的比例逐年上升,而产碳青霉烯酶是导致其广泛播散的主要原因。碳青霉烯酶可广泛水解包括碳青霉烯类抗生素在内的所有β-内酰胺类抗生素,且可携带在质粒上而导致大范围的流行[3]。因此深入了解我院碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯杆菌中碳青霉烯酶的分布情况及其分子流行病学特征,有助于合理指导临床抗生素的使用,同时指导及时有效的控制其流行。1材料与方法1.1标本和菌株来源收集我院2010年1月至2012年12月分离的碳青霉烯类耐药肺炎克雷伯杆菌120株。菌株主要分离自痰液55株,其次为尿液33株,血液27株,引流液5株。经Vitek2compact全自动微生物鉴定药敏分析仪鉴定及药敏试验。试验操作及结果判读严格按照CLSI2013年版进行。质控菌株为大肠埃希菌ATCC25922和肺炎克雷伯杆菌ATCC700603(由本室保存)。1.2仪器Vitek2compact全自动微生物鉴定药敏
分析仪(法国生物梅里埃公司)、PCR仪(德国Eppen-dorf公司产品)、电泳仪(美国BIO.RAD公司);凝
胶成像系统(上海天能公司)。1.3试剂与引物PCR试剂和DNAMarkerI购于
TaKaRa大连宝生物公司,引物设计参照文献,PCR扩增产物纯化后送上海生工生物技术有限公司测序,见表1。
表1PCR引物序列引物序列长度(bp)文献KPCF5'-GTATCGCCGTCTAGTTCTGC-3'638[4]R5'-GGTCGTGTTTCCCTTTAGCC-3'IMPF5'-TGAGCAAGTTATCTGTATTC-3'740[4]R5'-TTAGTTGCTTGGTTTTGATG-3'VIMF5'-TTATGGAGCAGCAACCGATGT-3'920[4]R5'-CAAAAGTCCCGCTCCAACGA-3'NDM-1F5'-GGTTTGGCGATCTGGTTTTC-3'621[4]R5'-CGGAATGGCTCATCACGATC-3'OXA-48F5'-TTGGTGGCATCGATTATCGG-3'743[4]R5'-GAGCACTTCTTTTGTGATGGC-3'
1.4改良Hodge试验和EDTA协同试验参照参考
文献[4]进行。1.5PCR扩增碳青霉烯酶基因采用煮沸法提取
肺炎克雷伯杆菌基因组DNA,参照相关文献及PCR体系进行PCR操作[5],采用琼脂糖凝胶电泳对PCR产物进行电泳,纯化PCR产物送测序公司测序,并进行BLAST序列比对。1.6MLST分型参照网站http://www.pasteur.fr/recherche/genopole/PF8/mlst/Kpneumoniae.html,设计7对管家基因的引物(gapA-infB-mdh-pgi-phoE-rpoB-tonB),参照文献[6]进行PCR反应体系及设置参数,并将PCR阳性产物送至上海生工生物有限公司进行双向测序,序列结果在MLST网站上比对查询,每一个管家基因都得到一个亚型。7个管家基因得到7个亚型,然后经组合比对就得到一个序列型ST。1.7ERIC-PCR参照文献[7]使用ERIC-2引物3'-AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCG-5'对hvKP菌的同源
815中国微生态学杂志2015年5月第27卷第5期
ChineseJournalofMicroecology,May.2015,Vol.27No.5