中华鳖种群RAPD分析

中华鳖3个选育群体的生长对比肖凤芳;李伟;洪孝友;朱阿莉;朱新平;史燕;黄启成【期刊名称】《广东农业科学》【年(卷),期】2014(041)015【摘要】为评估中华鳖(Pelodiscus sinensis)黄河群体、洞庭群体及其杂交选育群体绿卡鳖(洞庭♀×黄河♂的杂交子代经过5代群体选育所得)的生长性能,对露天池塘养殖条件下3个选育群体进行了连续观测对比试验.试验时间为2012年8月1日到2014年4月15日.除越冬期外,每30 d左右记录3个群体的生长数据.结果显示:(1)在生长速度方面,表现为黄河鳖＞绿卡鳖＞洞庭鳖;(2)在整齐度方面,稚鳖期绿卡鳖的整齐度最好,幼鳖期表现为洞庭鳖＞绿卡鳖＞黄河鳖;(3)三者的裙边比无明显差异;(4)饲料利用率表现为洞庭鳖＞绿卡鳖＞黄河鳖,存活率表现为洞庭鳖＞绿卡鳖＞黄河鳖.综合可见绿卡鳖具有明显的优势,应予以推广.【总页数】4页(P107-110)【作者】肖凤芳;李伟;洪孝友;朱阿莉;朱新平;史燕;黄启成【作者单位】中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室,广东广州510380;南京农业大学无锡渔业学院,江苏无锡214081;中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室,广东广州510380;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室,广东广州510380;中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室,广东广州510380;南京农业大学无锡渔业学院,江苏无锡214081;中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室,广东广州510380;南京农业大学无锡渔业学院,江苏无锡214081;上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;中国水产科学研究院珠江水产研究所/农业部热带亚热带水产种质资源利用与养殖重点实验室,广东广州510380;广东绿卡实业有限公司,广东东莞523912【正文语种】中文【中图分类】S966.5【相关文献】1.中华鳖洞庭湖群体、黄河群体及其杂交种稚幼体生长对比试验 [J], 刘阳;龙建杰;刘佳瑶;周贵谭;朱新平2.中华鳖、黄沙鳖及黄沙鳖F1代生长性状比较分析 [J], 李登明;张益峰;陆专灵;潘志忠;卢天和;赵忠添3.中华鳖、黄沙鳖及黄沙鳖F_1代生长性状比较分析 [J], 李登明;张益峰;陆专灵;潘志忠;卢天和;赵忠添;4.完全或部分的食物剥夺对中华鳖(Pelodiscus sinensis)幼体补偿生长反应的影响:生长率的时间变化模式与体组成的变化 [J], 颉志刚;牛翠娟5.山瑞鳖与中华鳖的养殖生长和形态比较 [J], 郑文彪;梁淡茹;肖智;方昆阳;刘顺元;林蠡;孟帆因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

黄曲条跳甲种群分化的RAPD分析
傅建炜;陈小龙;尤民生
【期刊名称】《生态学杂志》
【年(卷),期】2008(27)12
【摘要】采用RAPD方法,对福建省19个不同菜区黄曲条跳甲地理种群的分化进行了研究。

结果表明:相同种群采用相同引物进行扩增的重复性较好,不同种群采用相同引物进行扩增的差异性较高;19个不同菜区的黄曲条跳甲主要分为4个类群:闽东南沿海地区类群、闽西北地区类群、泉州类群和东山岛类群,黄曲条跳甲不同地理种群的遗传距离与地理距离有关。

东山岛和泉州2个特异性类群的出现,说明地形、蔬菜种植以及农药使用等人为因子会影响其地理种群的分化。

【总页数】5页(P2141-2145)
【关键词】黄曲条跳甲;种群分化;RAPD
【作者】傅建炜;陈小龙;尤民生
【作者单位】福建农林大学应用生态研究所,福州350002;福建省农业科学院植物保护研究所,福州350013
【正文语种】中文
【中图分类】S436.3;Q346
【相关文献】
1.黄曲条跳甲实验种群生命表 [J], 刘芸;尤民生
2.黄曲条跳甲自然种群生命表的组建与分析 [J], 张茂新;梁广文;庞雄飞
3.黄曲条跳甲实验室种群的生命表研究 [J], 李甜;周小怡;朱茜;彭意文;王登科;董小林
4.黄曲条跳甲幼虫致病菌的鉴定及其对黄曲条跳甲的杀虫活性研究 [J], 杨建云;纪春艳;凌冰;张茂新
5.黄曲条跳甲幼虫致病菌的鉴定及其对黄曲条跳甲的杀虫活性研究 [J], 杨建云;纪春艳;凌冰;张茂新;
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中华鳖NR5a2基因的克隆与表达分析张超;马晓;刘倩;吴利敏;刘慧芬;李学军;王璐明【摘要】为了解NR5a2在中华鳖(Pelodiscus sinensis)性腺分化过程中的作用,通过RACE技术克隆获得中华鳖NR5a2 cDNA.发现该基因序列全长为2674 bp,开放阅读框为1608 bp,编码535个氨基酸,5′非编码区长度为40 bp,3′非编码区长度为026 bp.生物信息学分析表明该基因编码的蛋白质分子质量为60.5 kDa,等电点为8.57,具有保守的ZnF-C4结构域和HOLI结构域.氨基酸多重序列比对分析表明中华鳖NR5a2基因与西部锦龟(Chrysemys picta bellii)的相似性最高,其次是原鸡(Gallus gallus).系统进化分析表明中华鳖NR5a2与西部锦龟的亲缘关系最近.实时荧光定量PCR结果表明NR5a2在中华鳖不同组织中均有表达,且卵巢组织中的表达量显著高于精巢组织.31.5℃ 孵化条件下,不同发育时期的中华鳖胚胎组织中发现NR5a2基因在17期时表达量达到最高,随后显著下降.结果表明NR5a2可能参与中华鳖的性别分化.【期刊名称】《淡水渔业》【年(卷),期】2019(049)004【总页数】6页(P29-34)【关键词】中华鳖(Pelodiscus sinensis);NR5a2;性腺分化;基因克隆;组织表达【作者】张超;马晓;刘倩;吴利敏;刘慧芬;李学军;王璐明【作者单位】河南师范大学水产学院,河南新乡 453007;河南师范大学水产学院,河南新乡 453007;河南师范大学水产学院,河南新乡 453007;河南师范大学水产学院,河南新乡 453007;河南师范大学水产学院,河南新乡 453007;河南师范大学水产学院,河南新乡 453007;河南师范大学水产学院,河南新乡 453007【正文语种】中文【中图分类】S917.4NR5a2(nuclear receptor subfamily 5，group A，member 2)又称LRH-1(肝受体同系物)，是一种孤核受体，也是需要配体激活的转录因子。

中华鳖群体间编码MHCⅠ类分子α2结构域基因的克隆及序列分析刘至治;蔡完其;李思发【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2006(30)2【摘要】通过主要组织相容性复合体(MHC)基因的分析,探讨了中华鳖5个群体(黄河、淮河、洞庭湖、鄱阳湖、太湖)间的遗传变异与分化.中华鳖编码MHC I类分子α2结构域基因的多态性很丰富.主要表现在:(1)中华鳖编码MHC I类分子α2结构域的基因序列存在插入或缺失变异,共获得7种不同长度的基因序列,其中222 bp、231 bp分别在42、23个体出现,为两种主要长度的基因序列;(2)共获得41种不同的核苷酸序列,这些核苷酸序列的相似度在0.386～0.995之间,表明序列间的歧异度较大;(3)在所有核苷酸序列中,共有250个有效位点,其中174个为变异位点,多态位点百分率达69.6%,但群体间存在差异:①多态位点百分率大小顺序为鄱阳湖鳖(71.02% )> 太湖鳖(58.05%) >淮河鳖(57.69% )>黄河鳖(55.32% )> 洞庭湖鳖(48.09%);②核苷酸多样性指数(π)大小顺序为鄱阳湖鳖(0.4273)>太湖鳖(0.2872)>洞庭湖鳖(0.2840)>黄河鳖(0.2727)>淮河鳖(0.2463);(4)分子方差分析(AMOVA)表明,太湖鳖与黄河鳖、淮河鳖2群体间,淮河鳖与洞庭湖鳖间有极显著的遗传分化(P<0.001);(5)根据核苷酸序列的平均遗传距离,用UPGMA 和NJ法进行聚类分析,黄河鳖与淮河鳖、洞庭湖鳖与太湖鳖分别先聚在一起,最后再与鄱阳湖鳖聚类,显示鄱阳湖鳖与其它4群体中华鳖在MHC基因上有明显歧化.【总页数】7页(P197-203)【作者】刘至治;蔡完其;李思发【作者单位】上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海,200090;上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海,200090;上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室,上海,200090【正文语种】中文【中图分类】Q785;S917【相关文献】1.中华鳖MHC Iα2链基因克隆及序列分析 [J],2.黑线仓鼠MHCⅡ类DQA基因外显子2的克隆与序列分析 [J], 解学辉;董晓波;秦桢;孔繁华;徐来祥3.扬子鳄MHCⅡ类B基因第二外元的克隆及序列分析 [J], 史燕;吴孝兵;晏鹏;陈壁辉4.乌龟MHCⅡ类B基因第二外显子的克隆及序列分析 [J], 李恩;吴孝兵;晏鹏5.中华鳖MHCⅡα基因cDNA的克隆及组织表达分析 [J], 童正飞;葛玲瑞;胡亚洲;杨涛;涂开发;王佩;周先文;王晓清;熊钢因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

广西中华草龟遗传多样性的RAPD分析朱学峰【摘要】[目的]阐明广西中华草龟的遗传多样性,为今后保护其种质资源及基因库、防止规模化养殖后造成的基因流失提供理论指导,也为中华草龟合理开发利用及选择育种提供科学依据.[方法]运用RAPD技术从分子水平上对广西中华草龟遗传多样性进行分析.[结果]从7只广西中华草龟的基因组中共扩增出267条条带,平均每个个体约扩增出38条条带,平均每条随机引物获得15条以上的条带,扩增片段大小为100～2000 bp,多态性频率为66.29％;个体间的遗传距离指数为0.1360～0.3609,平均遗传距离指数为0.2092±0.0623.[结论]广西中华草龟的遗传多样性较丰富,但个体间的亲缘关系较近,遗传变异度较小.%The current experiment was conducted to analyze the genetic diversity amongst Chinemys reevesii accessions of Guangxi in order to protect and characterize the germplasm resources and promote its suitable development and selection breeding. [Method]Genetic diversity of Chinemys reevesii accessions of Guangxi was analyzed using RAPD markers. [ Result ]The results showed amplification of total of 267 bands from genomic DNA of 7 Chinemys reevesii accessions with an average of 38 bands per accession. Each random primer produced over 15 bands on an average. The size of fragments ranged from 100-2000 bp. Out of 267 bands, 177 were polymorphic with 66.29% polymorphism frequency. The genetic distance between individuals was 0.1360-0.3609,the average genetic distance was 0.2092±0.0623. [Conclusion] Abundant genetic diversity was observed amongst different accessions of Chinemys reevesii in Guangxi.【期刊名称】《南方农业学报》【年(卷),期】2011(042)009【总页数】3页(P1148-1150)【关键词】中华草龟;遗传多样性;RAPD分析;广西【作者】朱学峰【作者单位】广西大学,南宁530005【正文语种】中文【中图分类】Q173;Q959.6+3【研究意义】中华草龟（Chinemys reevesii）又称乌龟，分类上隶属龟鳖目、龟科、乌龟属，是常见的水生龟种，也是目前我国龟类中分布最广、养殖数量最大的品种之一。

日本稻蝗、中华稻蝗和赤胫伪稻蝗地理种群的RAPD遗传分化研究张建珍;郭亚平;段毅豪;马恩波【期刊名称】《生态学报》【年(卷),期】2004(24)7【摘要】运用10个RAPD引物对日本稻蝗 (Oxya japonica)、中华稻蝗 (Oxya chinensis)和赤胫伪稻蝗 (Pseudoxya diminuta) 的种群遗传分化进行分析.10个随机引物共产生135条带,扩增谱带具有明显的属、种间多态性.Shannon 信息指数表明中华稻蝗遗传多样性水平较高 (2.693), 日本稻蝗次之(2.319), 赤胫伪稻蝗最低 (1.042).中华稻蝗和日本稻蝗的不同地理居群出现遗传分化,由Shannon信息指数估算的种群间遗传分化系数分别为20.7%,42.4%.用UPGMA和NJ法对Nei's 遗传距离作聚类分析,构建分子系统树.系统树显示:同一种群的不同个体优先相聚,而后,同一种的不同种群依次相聚;日本稻蝗广西南宁种群和广东广州种群首先聚为一支,陕西西安种群和浙江杭州种群聚为另一支,两支相聚后与中华稻蝗聚在一起,最后与赤胫伪稻蝗相聚.聚类结果表明:不同地域日本稻蝗亲缘关系的远近与地理距离呈现一定的相关趋势,日本稻蝗与中华稻蝗亲缘关系较近,Nei's遗传距离平均为0.142,而赤胫伪稻蝗与它们关系较远, Nei's遗传距离平均为0.451.聚类图所显示的物种间亲缘关系的远近程度与形态分类学和细胞分类学结果相一致.【总页数】7页(P1399-1405)【作者】张建珍;郭亚平;段毅豪;马恩波【作者单位】山西大学生命科学与技术学院,太原,030006;山西大学生命科学与技术学院,太原,030006;山西大学环境与资源学院,太原,030006;山西大学生命科学与技术学院,太原,030006【正文语种】中文【中图分类】Q961【相关文献】1.亚洲小车蝗和黄胫小车蝗不同地理种群的RAPD遗传分化研究 [J], 高书晶;韩靖玲;刘爱萍;闫志坚;常秀清2.徐州、平山两地中华稻蝗和日本稻蝗的群体遗传关系分析 [J], 张建珍;张敏;郭亚平;马恩波3.中华稻蝗两地理种群酯酶特性的比较研究 [J], 杨美玲;吴海花;郭亚平;马恩波4.中华稻蝗不同地理种群遗传多样性的AFLP分析 [J], 马晋;李涛;龙文敏;安玮玮;郭亚平;马恩波5.中华稻蝗两地理种群乙酰胆碱酯酶生化特性研究 [J], 杨美玲;吴海花;郭亚平;马恩波因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

中华鳖MyD88部分序列克隆及其在组织中的表达差异分析朱炳林;李俊;方维焕;李肖梁【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2010(34)7【摘要】MyD88(Myeloid differentiation factor 88,MyD88)是多数TLRs(Toll like receptor,TLRs)信号转导过程中的关键接头分子.研究根据MyD88(Myeloid differentiation factor 88,MyD88)TIR结构域(Toll-like/IL-1 receptor domain)保守区设计筒并引物,通过PCR扩增,成功地从中华鳖脾脏cDNA中扩增出351 bp 的目标序列.测序后经结构域和序列比较分析,扩增片段为中华鳖的MyD88 TIR结构域.该序列与大黄鱼、鸡等脊椎动物的MyD88的TIR结构域序列同源性和相似性分别为72.9%~86%和77.6%～83.6%.以热灭活嗜水气单胞菌刺激中华鳖后,经荧光定量PCR检测,在4B h内,肝、脾和肾组织中MyD88 mRNA相对表达量均出现不同程度的增加,尤以脾脏中的增幅最为明显,为对照组的6.89倍;中华鳖心脏成纤维样细胞经20 ng LPS刺激后1-8 h,MyD88表达量有所提高,24 h的表达量最高.该研究结果将为开展中华鳖天然免疫奠定良好基础.【总页数】7页(P1018-1024)【作者】朱炳林;李俊;方维焕;李肖梁【作者单位】浙江大学动物科学学院,浙江省动物预防医学重点实验室,浙江,杭州,310029;西南大学动物科技学院,重庆,400716;浙江大学动物科学学院,浙江省动物预防医学重点实验室,浙江,杭州,310029;浙江大学动物科学学院,浙江省动物预防医学重点实验室,浙江,杭州,310029【正文语种】中文【中图分类】Q785;S917【相关文献】1.清远麻鸡NALP3基因部分cDNA序列克隆及组织表达差异分析 [J], 陶志云;施祖灏;朱春红;宋迟;徐文娟;宋卫涛;李慧芳2.中华鳖fut2基因的克隆及其组织表达模式分析 [J], 邢潇;宋如昕3.鸭髓样分化因子MyD88部分cDNA克隆及组织表达图谱分析 [J], 郭智莉;周作勇;聂奎4.中华鳖MHCⅡα基因cDNA的克隆及组织表达分析 [J], 童正飞;葛玲瑞;胡亚洲;杨涛;涂开发;王佩;周先文;王晓清;熊钢5.鸭IGF-IR基因部分序列克隆、鉴定及在胚胎期胸肌组织中的差异表达分析 [J], 束婧婷;单艳菊;胡艳;宋迟;宋卫涛;朱文奇;徐文娟;陈文峰;李慧芳因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

RAPD技术及在甲壳动物遗传多样性中的应用周宝洪;范樟荣;周海东【摘要】介绍了RAPD技术的特点、原理及在甲壳动物遗传多样性研究中的优点,并综述了近几年RAPD技术在甲壳动物遗传多样性研究中的进展.【期刊名称】《河北渔业》【年(卷),期】2010(000)007【总页数】3页(P37-38,61)【关键词】甲壳动物;RAPD技术;遗传多样性【作者】周宝洪;范樟荣;周海东【作者单位】遂昌县水利局,浙江,丽水,323000;遂昌县水利局,浙江,丽水,323000;遂昌县水利局,浙江,丽水,323000【正文语种】中文根据现代遗传学的观点，物种的遗传性状是由基因决定的，外部形态的变异及体内蛋白质分子的变化其本质是基因中DNA碱基序列发生了改变，因此，从DNA着手，物种的遗传和变异及与此相关的一系列问题均能得到有效解决。

近年来，在DNA聚合酶链反应技术(Polymerase Chain Reaction，PCR)基础上发展起来的随机扩增多态性DNA技术(Random Amplified Polymorphic DNA，RAPD)具有操作简便，实验周期短，对DNA纯度要求不高，检测过程中不需要同位素，也不需要进行克隆和测序, 并能克服同工酶电泳位点偏少等特点，已成功地应用于动物、植物遗传多样性的检测、基因定位、品系鉴定、遗传图谱的构建和系统学研究等诸多领域[1]，本文就RAPD的特点及其在甲壳动物遗传多样性中的研究应用作一介绍。

1 RAPD技术的基本原理RAPD技术建立在PCR技术基础上，利用一系列随机排列的碱基序列作引物，对基因组DNA进行PCR扩增，扩增产物通过聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶电泳分离，经溴化乙锭(EB)染色或通过放射自显影检测扩增产物DNA片段的多态性。

虽然RAPD所用的引物DNA序列各不相同，但对于特定引物，与基因组DNA有特定的结合位点，如果这些结合位点在基因区域分布符合PCR扩增反应条件，就可扩增出DNA片段，因此，若基因组在这些区域发生DNA片段插入、缺少或碱基突变就可能导致这些特定结合位点分布发生相应变化，而使PCR产物增加、缺少或分子量改变，通过PCR产物的检测即可测出基因组DNA在这些区域的多态性。