植物生理生化（生化部分）
绪论
（一）目的要求：掌握植物生化的定义、内容和任务，了解植物生化的发展和现状，了解植物生化与其它学科的关系。
（二）重点植物生化的定义、内容和任务（三）难点植物生化与其它学科的关系（四）学时 1
一、生物化学的定义
生物：是指自然界里存在的植物、动物和微生物。这些生物千差万别，种类极其丰富，如以微米计的病毒、细菌，大到百米高的参天大树，把这些客观存在统称为生物的条件就是：他们的组成成分与新陈代谢的同一性，即所有生物在物质组成及物质转化过程中具有相同或相近的规律性。
生物化学：研究物质组成的化学本质与物质转化的化学性质的学科，就是生物化学。简单说就是研究生命现象本质的科学。
生物化学研究的内容：
1.静态生化：
是研究生物体内物质的化学组成、结构、性质和功能。这些物质有：蛋白质、核酸、碳水化合物、脂类化合物等----四大生物分子，这些物质的静态生化前四章我们要讲。
2.动态生化：
研究生物体内物质代谢、能量转化及其调节--------新陈代谢
研究生物体生命现象的信息传递与表达（第九章以后的内容）
俗话说种瓜得瓜，种豆得豆生化就是探讨子代具有亲代相同或相似得这种化学特性，主要内容有：DNA复制、转录、翻译过程。
二、生物化学的历史简介
三、生物化学的重要性
工业上：工业生物化学研究生化在各领域如轻纺、酿造及食品加工中的应用。
农业上：生化为栽培、育种、遗传、施肥及植保各方面提供了理论基础和实践技术，如生物农药。
医药业：无论是医疗还是医药都受生化知识的影响，了解一个病理的机理和治疗都依靠生化知识。另外，国防上，生化战争（武器）都是从生化学角度出发的-----病毒、细菌。如美伊战争美国总认为伊拉克有生化核武器。
四、要求
1、弄懂基本的理论知识，这门课理论性较强，必须理解记忆。
2、必须认真听课，做好笔记。
3、及时复习和预习。
五、主要参考书：
聂剑初等主编《生物化学简明教程》、阎龙飞等主编《基础生物化学》
沈同等主编《生物化学》
阎龙飞等主编《分子生物化学》
第一章蛋白质
（一）目的要求：掌握蛋白质的基本组成单位——氨基酸的结构特点、性质以及蛋白质的结构、性质和功能，理解蛋白质的结构与功能的关系。
（二）重点氨基酸的结构特点和性质；蛋白质的结构和性质
（三）难点氨基酸的酸碱性和等电点蛋白质的结构蛋白质结构与功能的关系（四）学时 4
一. 蛋白质的生物学意义
1.是一切生物体的细胞和组织的主要组成成分；
2.催化新陈代谢的各种反应的酶多数是蛋白质；
3.在遗传信息的控制、细胞膜的透性、高等动物的记忆和识别等方面起重要作用；
4. 生物体的防御体系——抗体就是一类高度专一性的蛋白质如免疫球蛋白；
5. 以干扰素的形式存在于细胞内，以消灭在抗体作用下漏网的病毒；
6. 生命活动所需的许多小分子物质和离子都是靠蛋白质来运输的；
7. 生物的运动离不开蛋白质。如肌肉收缩是由肌球蛋白和肌动蛋白作相对滑动来实现的。
第一节氨基酸------蛋白质的
基本组成单位
氨基酸是指含氨基的羧酸，也就是说氨基酸是由氨基和羧基构成的。参与蛋白质组成的有20种氨基酸，他们也称标准氨基酸。除脯氨酸为亚氨基酸外，其它均为α—氨基酸，即羧酸的α—C原子上的一个H被氨基取代；构型均为L型的。除甘氨酸R为H，α—C不是手性碳外，其他的α—C原子都是不对称碳原子，因此具有旋光性（L—型、D型）。
α—氨基酸的结构通式为：R—CH—COO-
+
3NH R为侧链基团，方框内的基团为各种氨基酸所共有的。R不同，就成为各种不同的氨基酸。不同的蛋白质所含氨基酸种类和数目不同。
脯氨酸（图）
甘氨酸（图）
一、氨基酸的分类及化学结构
（一）常见的蛋白质氨基酸
由于组成蛋白质的20种常见的氨基酸的差异主要表现在侧链R基团上，因此根据组成蛋白质的20种氨基酸R基团的极性不同，将氨基酸分成四大类：
1、具有非极性或疏水的R基团的氨基酸
这类氨基酸共8种，R基团包括脂肪烃、芳香环、仲胺，不易溶于水。它们是Ala、Val、Leu、Ile、Pro、Phe、Try(Trp)、Met。这里面有两个特殊的氨基酸是脯氨酸（α-亚氨酸），另一个是蛋氨酸（含硫氨基酸）结构如下：
2、不带电荷的R基团的极性氨基酸
这些氨基酸的R基团虽然带有极性基团，如—OH、—SH、酰氨基等。但它们并不解离或解离极弱，所以不带电荷。比疏水氨基酸较易溶于水。共7种：Gly、Ser、Thr、Cys、Tyr、Asn、Gln。其中极性最小的是甘氨酸，最大的是酪氨酸（Tyr）和半胱氨酸（Cys）结构如下：
甘氨酸
3、带负电荷的R基团氨基酸（又称酸性氨基酸）
这类氨基酸都含有一个完全解离的第二羧基，所以在PH7时带负电荷。共2种：Asp、Glu。结构如下：图
4、带正点荷的R基团氨基酸
这类氨基酸在pH7时带正电荷，共3种：Lys、Arg、His。结构如下：图
在20种氨基酸中，Val、Leu、Ile、Met、Phe、Lys、Thr、Try、在人和动物体内不能合成，必须从食物中得到，称为必需氨基酸。（二）稀有的蛋白质氨基酸
除了这20种氨基酸外，还有一些稀有氨基酸，它们都是这些氨基酸的衍生物，只存在于个别蛋白质中。
如：4—羟脯氨酸（图）
5—羟赖氨酸（图）
它们没有相应的遗传密码，在多肽链合成中由其前体（Pro）（Lys）修饰而成。（三）非蛋白质氨基酸
除了蛋白质中的20种氨基酸和少数稀有氨基酸外，还有一些决不参与蛋白质组成的氨基酸呈游离或结合态存在于细胞或组织中，称为非蛋白氨基酸。如：β—丙氨酸
鸟氨酸（Orn）
瓜氨酸（Cit）
二、氨基酸的重要理化性质
（一）氨基酸的酸碱性与等氨电点由于氨基酸中同时存在NH2和COOH，所以在水溶液中或在晶体状态下都以离子形式存在。与无机盐不同的是它以两性离子形式存在。这些两性离子既可作酸提供质子，又可以作为碱接受H+：
作为酸：（图）
作为碱：（图）
所以这类化合物叫两性电解质，当其完全质子化时可以作为一个二元酸：
（1）两性离子：同时带有正负两种电荷的离子。两性离子的概念不同与两性电解质。前者为离子，后者为分子。
