明胶酶谱法详解
- 格式:pdf
- 大小:81.29 KB
- 文档页数:3
Zymography
Provided by Hsu suo-wen
一。
用品
1.细胞培养或者提取组织
2.试剂的配制
(1)配制10%SDS聚丙烯酰胺凝胶(含1.0mg/ml 明胶)
A.分离胶的配制(注:根据你所用的电泳仪胶的大下确定配制胶的量)
10% SDS聚丙烯酰胺凝胶 5ml(包括)
ddH2o 1.5ml
30%储备胶 (0.8%BIS+29.2%丙烯酰胺) 1.65ml
1.5mol/l Tris(PH 8.8) 1.25ml
10% SDS 50ul
10%过硫酸铵(AP) 50ul
TEMED 4ul
1%明胶 0.5ml(or 100ul)
(注意:天气如果较冷除TEMED,其他成分按顺序加完后要置于37度温育,最后加TEMED)
B.浓缩胶的配制-同Western Blot
浓缩胶 3ml
ddH2o 2.1ml
30%储备胶 0.5ml
1mol/l Tris-HCL( PH 6.8) 0.38ml
10% SDS 30ul
10%过硫酸铵 30ul
TEMED 3ul
(3)5×Tris –甘氨酸电极缓冲液
0.125mol/l Tris-HCL,1.25mol/l 甘氨酸,0.5%SDS(PH 8.3)
(4)4 ×上样缓冲液20ml(不同于Western)
0.32% Tris-HCL 6.4ml 50mM Tris 0.606g
4%SDS(PH7.2) 8ml 2% SDS 0.2g
16%甘油 3.2 ml 10%甘油 10ml
溴酚蓝 0.024g 0.1%溴酚蓝 0.01g
ddH2o 2.4ml(20ml) (10mlsystem)
(5) 洗脱液(1L):2.5% Triton X-100(25ml),50mmol/L Tris –HCl(6.06g),5mmol/L CaCl2(or 10mMol 1.11g),1μmol/L ZnCl2,pH7. 6
漂洗液(相比洗脱液,少了Triton): 50mmol/L Tris -HCl ,5mmol/L CaCl2,1μmol/L ZnCl2,pH7. 6
注意:洗脱液不能重复使用,必须现配,尽可能多加洗脱液,温育摇动时注意Triton有毒。
(7)孵育液(相比洗脱液,少了Triton,增加了Brij):50mmol/L Tris - HCl , 5mmol/ CaCl2 , 1μmol/L ZnCl2(不影响PH), 0. 02% Brij-35(or0.02%NaN3,W/V,剧毒) ,pH7.6
(8)染色液:0.05% Coomassic 亮蓝 R-250,30%or40%甲醇,10%乙酸
(9)脱色液A、B、C:甲醇浓度分别为30%、20%、10 % ,乙酸浓度分别为10 %、10 %、5%
二:步骤
1.取对数期的癌细胞在的无血清培养基DMEM中培养24h。
2.次日收集上清液,将上清液移入离心管中 2000rpm 离心10min,-70℃储存备用。
1h
3.根据细胞计数调整各组细胞培养上清液中的蛋白浓(或者测定蛋白浓度调整使所上蛋白总量一致)。
与4×上样缓冲液(4%SDS,0.25 mmol/L Tris-HCl,40%甘油,0.1% 溴酚蓝)按照1∶3混合。
4.配制分离胶和浓缩胶,15ul/孔上样,注意所有操作必须在冰上操作,不能煮沸。
(根据表达强忍和蛋白浓度确定上样量),4℃进行SDS-PAGE 电泳100v恒压跑至分离胶和浓缩胶交界处改为90毫安恒流,直至溴酚蓝跑出胶外。
(1小时左右)。
5.电泳结束后,将凝胶置于洗脱液(2.5% Triton X-100,50mmol/L Tris -HCl ,5mmol/L CaCl2, 1μmol/L ZnCl2,pH7. 6) 中振荡洗脱2次,每次45分钟,然后用漂洗液(除不含Triton X - 100 外其余同洗脱液) 漂洗2次,每次20分钟,接着,将凝胶置于孵育液( 50mmol/L Tris - HCl , 5mmol/ CaCl2 , 1μmol/L ZnCl2, 0. 02% Brij-35 ,pH7.6) 中37℃ 孵育42h。
6.孵育结束后经染色液(0.05% Coomassic 亮蓝、30%甲醇、10%乙酸) 染色3h,及脱色液A、B、C(甲醇浓度分别为30%、20%、10 % ,乙酸浓度分别为10 %、10 %、5%) 分别脱色0.5、1、2h后,显示出MMP-2(72KD) 和MMP -9(92 KD) 为位于蓝色背景上的透亮带,用凝胶图像分析系统分析读取条带面积,宽度和灰度值,做统计分析。
注意事项:
1. 制备聚丙烯酰胺时应注意排除气泡 。
2. 明胶酶谱的活性受钙离子,锌离子,和PH值等因素的影响,因此缓冲液 配制应严格准确,尽量用超纯水,孵育温度也掌握好。
3.刮蛋白时,用裂解液加PMSF, 其他不要,一定不加EDTA,其他同WB,蛋白
尽量在-80度保存,上样量不能太多,否则smear, 20-30ug足以。