当前位置：文档之家 › MAGE-A家族抗原共同B细胞表位预测分析

MAGE-A家族抗原共同B细胞表位预测分析

  • 格式：pdf
  • 大小：935.38 KB
  • 文档页数：5

Ｇ ａ ｓ ｔ ｒ ｏ ｅ ｎ ｔ ｅ ｒ ｏ ｌ ｏ ｇ ｉ ｃ ａ ｌ Ｓ ｕ ｒ ｇ ｅ ｒ ｙ ， ｔ ｈ ｅ Ｆ ｉ ｒ ｓ ｔ Ａ ｆ ｆ ｉ ｌ ｉ ａ ｔ ｅ ｄ Ｈｏ ｓ ｐ ｉ ｔ ａ ｌ ｏ ｆ Ｗｅ ｎ ｚ ｈ ｏ ｕ Ｍｅ ｄ ｉ ｃ ａ ｌ Ｕ ｎ ｉ ｖ ｅ ｒ ｓ ｉ ｔ ｙ ， Ｗ ｅ ｎ ｚ ｈ ｏ ｕ ， ３ ２ ５ ０ ０ ０ ２ ． Ｉ ｎ ｓ ｔ ｉ ｔ ｕ ｔ ｅ ｏ ｆ Ｍｏ ｌ ｅ ｃ ｕ ｌ ａ ｒ Ｖ ｉ ｒ ｏ ｌ ｏ ｇ ｙ ａ ｎ ｄ Ｉ ｍｍ ｕ ｎ ｏ ｌ ｏ ｇ ｙ ， Ｗ ｅ ｎ ｚ ｈ ｏ ｕ Ｍｅ ｄ ｉ ｃ ａ ｌ Ｕ ｎ ｉ ｖ ｅ ｒ ｓ ｉ ｔ ｙ ， Ｗ ｅ ｎ ｚ ｈ ｏ ｕ ， ３ ２ ５ ０ ３ ５
Ａ） ｓ ｕ ｂ ｆ ａ ｍｉ ｌ ｙ ． Ｍｅ ｔ ｈ ｏ ｄ ｓ ： Ｂａ ｓ ｅ ｏ ｎ ｔ ｈ ｅ ｆ ｕ ｌ ｌ — ｌ ｅ ｎ ｇ ｔ ｈ ａ ｍｉ ｎ ｏ ａ ｃ ｉ ｄ ｓ ｅ ｑ ｕ ｅ ｎ ｃ ｅ ｏ ｆ ｔ ｈ ｅ Ｍ ＡＧＥ — Ａ１ ． ｔ ｈ ｅ Ｂ— ｃ ｅ ｌ ｌ ｅ ｐ ｉ ｔ ｏ ｐ ｅ ｓ ｏ ｆ ｔ ｈ ｅ
域对Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ １ 的优 势 Ｂ表位 区段 进 行 综 合 分 析 ，进 一 步运 用抗 原 指 数 分 析预 测 Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ １ 的Ｂ 细 胞 表 位 ，并将
其 与Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ家族 中其他成 员 （ Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ ２至Ａ Ｉ ２ ）进行 比对 ，以预测 Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ家族抗原 的共 同Ｂ细胞表位。结
第４ ３卷第 １ １期
２ ０ １ ３年 １ １月
温
州医学院 Nhomakorabea学
报
ＶＯｌ ＿ ４３ Ｎｏ． １ １ Ｎｏ＇ ｑ ． ２ ０１ ３
Ｊ ｏ ｕ ｒ ｎ ａ ｌ ｏ ｆ Ｗｅ ｎ ｚ ｈ ｏ ｕ Ｍ ｅ ｄｉ ｃ ａ ｌ Ｃｏ ｌ ｌ ｅ ｇｅ
期
Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ家族抗原共 同 Ｂ 细胞表位预测分析
ＤＩ ＮＧ Ｙ ｕ ｊ ｉ ｅ ，Ｗ ＡＮ Ｇ Ｂ ｉ ｎ ｇ ｂ ｉ ｎ ｇ 。 ，ＨＯＵ Ｂ ｏ ｌ ｏ ｎ ｇ 。 ， Ｚ Ｈ Ａ ＮＧ Ｌ ｉ ｆ ａ ｎ ｇ 。 ， Ｚ ＨＵ Ｇｕ ａ ｎ ｂ ａ ｏ ．
． Ｄｅ ｐ ａ ｒ ｔ ｍｅ ｎ ｔ ｏ ｆ
［ 关键词］ 黑 色素瘤抗原 Ａ家族 ；黑 色素瘤抗原 Ａ ｌ ；Ｂ 细胞表位；共 同表位
［ 中图分类号］ Ｒ ７ ３ ０ ． ２ ［ 文献标志码］ Ａ ［ 文章编号］ １ ０ ０ ０ — ２ １ ３ ８（ ２ ０ １ ３ ）¨一 ０ ７ ０ ６ — ０ ５
Ｃｏ ｍｐ ｒ ｅ ｈ ｅ ｎ ｓ ｉ ｖ ｅ ｍａ ｐ ｐ ｉ ｎ ｇ ｏ ｆ ｃ ｏ ｍｍ ｏ ｎ ｉ ｍ ｍｕ ｎ ｏ ｄ ｏ ｍｉ ｎ ａ ｎ ｔ Ｂ－ ｃ ｅ ｌ ｌ ｅ ｐ ｉ ｔ ｏ ｐ ｅ ｓ ｏ ｆ Ｍ ＡＧＥ－ Ａ ｓ ｕ ｂ ｆ ａ ｍｉ ｌ ｙ Ｊ ｌ Ｎ Ｊ ｉ ｌ ．
［ 摘
要］ 目的 ：预测和 筛选黑 色素瘤抗原 Ａ（ Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ ）家 族抗原 的共 同Ｂ 细胞表位 。方法：以 Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ １ 的
全 长 氨基 酸 序 列 为基 础 ，利 用生 物 信 息 学软 件 ， 采 用 Ｈ ｏ ｐ ｐ ＆ Ｗ ｏ ｏ ｄ ｓ的 亲 水 性 方 案 、Ｚ ｉ ｍ ｍ ｅ ｒ ｍ ａ ｎ极 性 参 数和 Ｊ ａ ｍ ｅ ｓ ｏ ｎ — Ｗ ｏ ｌ ｆ 抗 原 指 数方 案 和 Ｅ ｍ ｉ ｎ ｉ 表 面可 及性 方 案 等 ，结 合 Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ １ 的 二 级 结 构 与 其 柔性 区域 及跨 膜 区
果 ：Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ １ 的全长为 ３ ０ ９个 氨 基 酸 ， 相对 分子 质 量 为 ４ ６ ｋ Ｄ ａ ， 为可 溶性 蛋 白 。经 综 合 分 析 ，其 Ｂ细胞 优 势 表 位 可 能 存 在 于 氨 基 酸序 列 Ｎ 端 的 ９～１ ４ ，８ ４～８ ８ ，１ １ ８—１ ２ ４ ，１ ６ ０～１ ６ ５ ，２ ０ ８ ～２ １ ４ ，２ ３ ３～２ ４ ０区段 ； 经 与Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ家族 中其他 成 员的 氨 基酸 序 列 比 对 ，Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ １ 的 ９～１ ４ ，８ ４— ８ ８ ，１ １ ８～１ ２ ４及 ２ ３ ３ ～２ ４ ０区段 ，
墨圆圈
Ｏ ｂ ｊ ｅ ｅ ｔ ｉ ｖ ｅ ： Ｔ ｏ ｐ ｒ ｅ ｄ ｉ ｃ ｔ ａ ｎ ｄ ｓ ｃ ｒ ｅ ｅ ｎ ｔ ｈ ｅ ｃ ｏ ｌ ｎ ｌ ｉ ｌ Ｏ ｎ Ｂ — ｃ ｅ ｌ ｌ ｅ ｐ ｉ ｔ ｏ ｐ ｅ ｓ ｏ ｆ ｈ ｔ ｅ ｍ ｅ ｌ ａ ｎ ｏ ｍ ａ ａ ｎ ｔ ｉ ｇ ｅ ｎ Ａ （ Ｍ Ａ Ｇ Ｅ —
金 劲 激 ， 丁 玉 杰 ，王 冰 冰 。 ， 侯 柏 龙 ，张 丽 芳 。 朱 冠 保
，
（ １ ． 温州 医科 大学附属 第一 医院 胃肠外科 ，浙江
研 究 所 ，浙 江 温州 ３ ２ ５ ０ ３ ５ ）
温州 ３ ２ ５ ０ ０ ０ ；２ ． 温 州 医 科 大 学 分 子 病 毒 与免 疫
即Ｈ Ｃ Ｋ Ｐ Ｅ Ｅ ，Ｅ Ｅ Ｅ Ｇ Ｐ ， Ｒ Ａ Ｒ Ｅ Ｐ Ｖ Ｔ Ｋ ，Ｇ Ｅ Ｐ Ｒ Ｋ Ｌ Ｌ Ｔ肽段 可能为Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ家族抗原共 同Ｂ细胞优 势表位 。结论：利用生
物 信 息 学预 测 发现 Ｍ Ａ Ｇ Ｅ — Ａ １ 的优 势 Ｂ细胞 表 位 中，９～１ ４ ，８ ４ ～８ ８ ，１ １ ８ ～１ ２ ４及 ２ ３ ３ ～２ ４ ０区段 可 能 为 Ｍ Ａ Ｇ Ｅ Ａ 家族 抗 原 的共 同 Ｂ细 胞 表 位 ， 可 为 表位 疫 苗的研 制 等提 供 理 论 依据 。

合集下载

B细胞抗原表位预测方法的研究进展

B细胞抗原表位预测方法的研究进展

B细胞抗原表位预测方法的研究进展
马凡舒;张蕾;王洋;孙彦刚;闫喜军
【期刊名称】《中国畜牧兽医》
【年(卷),期】2016(043)001
【摘要】抗原表位是抗原分子的主要功能单位.B细胞抗原表位的准确定位对疫苗设计、诊断试剂的研发及高通量抗体的制备均具有重要意义.作者对目前常用的B 细胞线性表位预测方法和B细胞构象表位预测方法进行概述,并对不同预测方法进行比较,旨在为病原微生物抗原表位研究提供一定的理论参考.
【总页数】5页(P63-67)
【作者】马凡舒;张蕾;王洋;孙彦刚;闫喜军
【作者单位】中国农业科学院特产研究所,长春130112;中国农业科学院特产研究所,长春130112;中国农业科学院特产研究所,长春130112;中国农业科学院特产研究所,长春130112;中国农业科学院特产研究所,长春130112
【正文语种】中文
【中图分类】S852.4
【相关文献】
1.线性B细胞表位预测方法研究进展 [J], 程华;成彬;羊红光
2.结核分枝杆菌蛋白抗原T细胞表位的研究进展 [J], 彭美玉;李柏青
3.肿瘤抗原细胞毒性T淋巴细胞表位鉴定和多肽疫苗的研究进展 [J], 吴亚红;高艳锋;祁元明
4.B 细胞抗原表位的研究进展及其应用 [J], 郭春艳;赵向绒;胡军
5.抗原表位预测方法的研究进展 [J], 王艳华;张德林;殷宏;付宝权
因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

MAGE-12的新B细胞表位抗原肽的设计、合成及免疫原性研究

MAGE-12的新B细胞表位抗原肽的设计、合成及免疫原性研究


肽的特异性抗体 。【 结果】免疫 Ｃ５ Ｂ ／ 小 鼠后可产生 Ｍ Ｇ ２ ．７ Ｌ６ Ａ Ｅ１ 的抗原特 异性 的多克隆 抗体 。 【 结论 】证 明所
预测的表位 Ｌ Ｑ ｓ Ｈ Ｋ Ｅ （ —１ ） ＭＡ ．２的新 Ｂ细胞表位 。 Ｅ Ｒ Ｑ Ｃ Ｐ Ｅ ３ ４为 ＧＥ １ 关键词 ：Ｂ细胞表 位；ＭＡＧ －２ Ｅ １ ；免疫原 ；Ｅ ＩＡ ＬＳ
【 文章编号 】 １ ８ ０ １２０ ）３０１— 【 ０ ． ４ （０７ ０．２６ ０ ５ ４ ０ 中图分 类号】 Ｒ ９ ．１【 ３２ １ 文献标识码 】 Ａ
Ｓ ｍｔ ｅ ｉ ｎ ｉ ｅ ｉ ｃ ｔｏ ｆａ ｎ ｗ ｃ ｌ ｐ ｔ ｐ ｆ ｔ ｌ ｏ ｎ ｉ ｅ ＡＧＥ－ ２ ｙ ｈ ｓｓ ａ ｄ ｄ ｎｔｆ ａ ｉ ｎ ｏ ｅ Ｂ－ ｅ ｌｅ ｉｏ ｅ ｏ ｕｌ ｒ ａ ｔｇ ｎ Ｍ ｉ ｌ １
摘
要： 【 目的】设计合成肿瘤抗原 Ｍ Ｇ 一２ Ｂ Ａ Ｅ１ 的 细胞表位并研究其免 疫原性 。 【 方法 Ｊ在 预测 ＭＡ Ｅ１ 的 Ｇ 一２
Ｂ细胞表位序列为 Ｌ Ｑ ＱＨ Ｋ Ｅ （ Ｅ Ｒｓ ｃ Ｐ Ｅ ３～１ ） ４ 、ＭＡ Ｅ １ｓ （ ｓ Ｅ ｓ ＮＥ ＱＥ 的基础 上 ，采用 ４分枝 多重 抗 Ｇ ．２２ Ｑ Ｄ Ｇ ｓ Ｅ ） 一 原肽结构设计合成抗原肽 ，免疫 Ｃ５ Ｂ ／ 鼠，产生多克隆抗体 ，应用 Ｅ Ｉ Ａ实 验检测多克隆抗体是否为抗原 ．７ Ｌ６小 ＬＳ
论 著
ＭＡ Ｅ １ Ｇ ．２的新 Ｂ细 胞 表 位 抗 原肽 的 设 计 、合 成 及 免 疫 原 性 研 究
李艳秋 ，董雪梅 ，李建春 ，吴玉章
（． １ 武警 医学院附属 医院检验科 ，天津 ３０ ６ ；２ 辽 宁 中医药大学 ，辽 宁 沈 阳 １０ ３ ；３ 第 三军 医大学全 军 ０ １２ ． １０ ２ ． 免疫 学研 究所 ，重庆 ４ ０ ３ ） ０ ０ ８
B细胞表位预测

B细胞表位预测


免疫球蛋白分子结构
免疫球蛋白的基本结构是由二硫键连接的四条肽链组 成的对称结构。分子量较小的一对肽链称为轻链
（Light chain，L链），每条轻链约由214个氨基酸 残基组成，L链共有两型，Kappa(κ）与Lambda （λ）。同一个免疫球蛋白单体分子上的L链型别完全 相同。分子量较大的一对肽链称为重链（Heavy
• 2、stabilization clean function
• 3、monitoring function
Immunocyte
• 1、Innate immune response cell
• ( Such as cell surface expression of the receptor can identify a molecule,this molecule express on the surface of a variety of pathogens )
IgA分血清型和分泌型。血清型IgA主要由肠系膜淋巴组织 中的浆细胞产生，占血清抗体总量的10%～20%，以单体为 主，分子量170KD，有IgA1和IgA2两个亚类。分泌型IgA
是由呼吸道、消化道、泌尿生殖道等处粘膜固有层中的浆细胞 产生的，在浆细胞内由J链连接成双聚体后分泌出细胞，当双 聚体的IgA通过粘膜上皮细胞向外分泌时，与上皮细胞合成的 分泌片结合形成完整的SIgA，释放到分泌液中，分布于粘膜 表面。SIgA主要存在于唾液、泪液、初乳、胃肠液、尿液、
• 2、Adaptive immune response cell
• (Cloning is the distribution of such cells,each of the cloned cells to identify an antigen receptor,)
黑色素瘤相关抗原MAGE-D研究进展

黑色素瘤相关抗原MAGE-D研究进展


ｃＡＭＰ反 应 元 件 结 合 蛋 白 （ｃＡＭＰ— ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｅｌｅｍｅｎｔ
ｂｉｎｄｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ，ＣＲＥＢ）相 互作 用，可调 节小鼠的学习和 记忆 。有研 究发现远端 少 同源盒 转 录因子 （ｄｉｓｔａｌ—
ｌｅｓｓ ｈｏｍｅｏｂｏｘ，ＤＬＸ）基 因家族 具有调控软 骨细胞 、破 骨 细胞 增 殖 和 分 化 的作 用 ．而 ＭＡＧＥ—Ｄ１可 通 过 ＩＲＤ 与
▲在 读 硕 士研 究 生 △通信作 者。教 授 ，博士 研究生 导师 ；Ｅ—ｍａｉｌ：１６９５２６１１８１＠ｑｑ．
（ｏｐｅｎ ｒｅａｄｉｎｇ ｆｒａｍｅ，ＯＲＦ）位 于第 １～ｌ３个 外显 子 之 间 ；ＭＡＧＥ—Ｄ４的 ＯＲＦ位 于第 ２～１２个外 显子之 间。 其 他 ＭＡＧＥ—Ｄ基 因 ＯＲＦ尚 未 见报 道 。
【摘要】 黑色素瘤相关抗原 一Ｄ（ＭＡＧＥ—Ｄ）基 因位 于 ｘ染 色体 ，具有 ＭＡＧＥ家族共有的同源结构域 （ＭＨＤ）；ＭＡＧＥ—Ｄ 由 ４个成 员组成 ，各 成 员的表 达及功 能各 异 ；目前 已发 现一 些成 员表 达 于 多种 肿 瘤组 织 ， 限制性表 达 于正 常组织 ；其 抗原肽 可被 特异 性 细胞 毒 性 Ｔ淋 巴细胞 识 别 ，在 体 外诱 导 出抗 肿 瘤 免 疫效 应 ，在 一 些肿 瘤 患者体 内产 生相应 的抗体 。ＭＡＧＥ—Ｄ家族 的一 些成 员有 望成 为胶 质瘤免 疫 治疗 的候 选靶 点 。
国家 自然科 学 基金 资助 项 目（编号 ：８１４６０３８２，８１５６０４０８），广 西 自然 科 学基金 资助项 目（编号 ：２０１４ＧＸＮＳＦＡＡ１１８０８９，２０１４ＧＸＮＳＦＡＡ１１８２３１），广 西 医 科 大 学 青 年 科 学 基 金 项 目 （编 号 ：ＧｘＭｕＹｓＦ２０１４Ｏ１１， ＧＸＭＵＹＳＦ２０１４０９）