未折叠蛋白反应
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线粒体未折叠蛋白质反应的激活剂线粒体未折叠蛋白质是指在线粒体内部由于各种原因无法正确折叠的蛋白质。
这些未折叠的蛋白质会积累在线粒体中,导致线粒体功能受损,从而引发一系列疾病。
为了解决线粒体未折叠蛋白质的问题,科学家们进行了大量的研究,并发现了一些可以促进线粒体未折叠蛋白质反应的激活剂。
一、胞内热休克蛋白(Hsp70)胞内热休克蛋白(Hsp70)是一类在细胞内广泛存在的重要分子伴侣。
它可以通过与线粒体未折叠蛋白质结合,并提供正确的环境来促进其正确折叠。
Hsp70通过其ATPase活性,可以将线粒体未折叠蛋白质从固定的构象中解开,使其能够进行正确的折叠。
二、蛋白质去磷酸酶1(PP1)蛋白质去磷酸酶1(PP1)是一种重要的酶类分子,它在细胞中起到去除磷酸基团的作用。
研究发现,PP1可以与线粒体未折叠蛋白质结合,并通过去除其上的磷酸基团,促进其正确折叠。
PP1可以与其他蛋白质一起形成复合物,从而在线粒体内提供一个适合的环境,使未折叠蛋白质得以正确折叠。
三、蛋白质氧化还原酶线粒体未折叠蛋白质的正确折叠还受到蛋白质氧化还原酶的调控。
蛋白质氧化还原酶可以通过在线粒体内提供还原剂或氧化剂的作用,调节线粒体内的氧化还原平衡,从而促进未折叠蛋白质的正确折叠。
此外,蛋白质氧化还原酶还可以与其他分子伴侣一起协同作用,为线粒体未折叠蛋白质的折叠提供帮助。
四、分子伴侣蛋白分子伴侣蛋白是一类能够与未折叠蛋白质结合,并提供正确折叠环境的蛋白质。
研究发现,线粒体内存在多种分子伴侣蛋白,如Hsp60和Hsp90等。
这些分子伴侣蛋白可以与线粒体未折叠蛋白质结合,通过调节其折叠状态来促进其正确折叠。
五、蛋白质分子伴侣的调控因子除了分子伴侣蛋白外,还有一些蛋白质分子伴侣的调控因子也可以作为线粒体未折叠蛋白质反应的激活剂。
这些调控因子可以通过与分子伴侣蛋白结合,调节其活性,从而促进线粒体未折叠蛋白质的正确折叠。
总结起来,线粒体未折叠蛋白质反应的激活剂包括胞内热休克蛋白、蛋白质去磷酸酶1、蛋白质氧化还原酶、分子伴侣蛋白及其调控因子等。
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非折叠蛋白反应
非折叠蛋白反应是指在蛋白质分子中,由于某些原因,蛋白质无法正确地折叠成其所需的三维结构,从而导致蛋白质失去其正常的功能。
这种现象在生物体内非常常见,因为蛋白质的折叠是一个非常复杂的过程,需要多种因素的协同作用。
非折叠蛋白反应的原因有很多,其中最常见的是蛋白质的突变。
当蛋白质的基因发生突变时,它的氨基酸序列会发生改变,从而导致蛋白质的折叠方式发生变化。
这种变化可能会导致蛋白质无法正确地折叠,从而失去其正常的功能。
除了基因突变外,其他因素也可能导致非折叠蛋白反应。
例如,蛋白质的环境条件(如温度、pH值等)发生变化时,也可能会影响蛋白质的折叠。
此外,一些化学物质(如重金属离子、有机溶剂等)也可能会干扰蛋白质的折叠过程。
非折叠蛋白反应对生物体的影响非常大。
许多疾病都与蛋白质的折叠异常有关。
例如,阿尔茨海默病、帕金森病、肌萎缩侧索硬化症等神经系统疾病都与蛋白质的异常折叠有关。
此外,一些癌症也与蛋白质的折叠异常有关。
为了解决非折叠蛋白反应带来的问题,科学家们正在研究各种方法来促进蛋白质的正确折叠。
例如,他们正在研究如何设计新的蛋白质,以便它们能够更容易地折叠成正确的结构。
此外,他们还在研
究如何使用药物来干预蛋白质的折叠过程,以防止蛋白质的异常折叠。
非折叠蛋白反应是一个非常重要的生物学现象,它对生物体的健康和疾病都有着重要的影响。
通过深入研究蛋白质的折叠过程,我们可以更好地理解生命的本质,并为治疗各种疾病提供新的思路和方法。
非折叠蛋白反应
非折叠蛋白反应是一种新型的生物化学反应,与传统的蛋白质折叠有所不同。
折叠是蛋白质在合适的条件下,通过内部的氢键、静电相互作用等力,使其在三维空间中形成稳定的结构。
而非折叠蛋白则是指某些蛋白质不具有明显的二级与三级结构,处于无序的状态。
最近的研究表明,这些非折叠蛋白质在细胞内有着极其重要的功能。
它们可以调控基因表达、维护细胞稳态、参与代谢和信号传递等多种生物学过程。
此外,也有研究发现,非折叠蛋白质具有几种传统蛋白质所不具备的物理性质,如高度可伸缩性、呈现多种不同的构象等。
然而,非折叠蛋白的研究也面临着很多挑战。
由于其无序性质,其结构的解析与预测较为困难。
同时,非折叠蛋白质的破坏也可能导致一些疾病的发生,如阿尔兹海默病、帕金森病等。
总之,非折叠蛋白在生物学领域中具有重要的地位,未来的研究仍需加强对其结构与功能的探究。
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线粒体未折叠蛋白反应
线粒体未折叠蛋白反应(Unfolded Protein Response,UPR)是
一种由线粒体未折叠蛋白质所驱动的信号通路,主要发生在细胞受到
线粒体内未折叠蛋白质超载压力时,该反应会提升细胞质量控制系统
的机能。
线粒体未折叠蛋白反应包括实体状线粒体内未折叠蛋白质聚集后,细胞就会介导三种不同的分子信号通路,以及其它弹性性信号通路来
应对此类蛋白质超载压力的情况发生。
这些通路大体上分为核内和核
外两个部分,前者包括转录因子ATF6和Gadd15,而后者则包括细胞膜
上的磷脂酶所催化的IRAK1蛋白信号通路,以及称为IRE1的内含子信
号通路。
ATF6是个膜融合蛋白,当它感知到线粒体内未折叠蛋白堆积压力时,它会从信号传导蛋白质中被释放出来,并与核内转录因子结合,
从而促进相关基因转录水平的提升,如ER钙泵基因等,以及线粒体钙
池容量的提升,从而缓解未折叠蛋白堆积压力。
Gadd15是一种核因子,它也被认为对非正常蛋白质堆积压力有重
要作用,主要负责触发细胞增殖,以缓解未折叠蛋白质堆积压力。
线粒体外膜上的磷脂酶IRE1作为一种内含子信号通路分子,能够
响应线粒体内未折叠蛋白质堆积压力并调控线粒体内蛋白质合成和未
折叠蛋白质重新折叠的过程,促进线粒体蛋白质翻译质量的提高,从
而延缓或终止未折叠蛋白质的堆积。
总的来说,线粒体内未折叠蛋白质反应能够帮助细胞应对线粒体
内未折叠蛋白质堆积压力的情况,这种反应既改善细胞质量控制系统,又能诱导抗逆性机制,以便有效地调节线粒体蛋白质的合成与折叠。
其目的就是维持蛋白质结构、线粒体功能与细胞行为的正常。
蛋白质未折叠反应
蛋白质未折叠反应是一种生物大分子的结构形成过程,也被称为蛋白质折叠。
蛋白质通常在合成后呈现出一种未折叠的状态,即链状的多肽结构。
然而,蛋白质需要经过折叠过程才能形成其功能性的三维结构。
蛋白质未折叠反应发生在细胞内,由分子伴侣、分子伴侣机构和其他辅助因子协助完成。
这些分子和机构对蛋白质进行保护,防止其在未折叠状态下发生聚集和非特异性相互作用。
未折叠的蛋白质链具有相对较高的能量,而折叠状态下的蛋白质具有更低的能量。
蛋白质折叠是通过非线性的空间构象搜索过程实现的,最小化蛋白质的自由能。
各种相互作用力,例如水合作用和亲疏水相互作用,被考虑在内,以帮助蛋白质实现最稳定的三维结构。
未折叠的蛋白质在折叠过程中可能会出现中间状态或折叠间体。
这些中间状态可以是部分折叠的结构,也可以是折叠一些域但还未正确整合的结构。
这些中间状态对于蛋白质的正确折叠至关重要,并在最终形成功能性蛋白质时起到重要作用。
蛋白质未折叠反应是一个复杂的过程,受到多种因素的影响,如温度、pH值和离子浓度等。
异常的蛋白质未折叠反应可能
导致蛋白质的错误折叠和聚集,从而引发多种疾病,包括变态反应、神经退行性疾病和癌症等。
因此,对蛋白质未折叠反应的研究有助于理解这些疾病的发生机制,并为疾病的治疗提供新的思路和策略。
upr未折叠蛋白反应
UPR (Unfolded Protein Response) 未折叠蛋白反应是一种细胞
应激反应,当内质网中的蛋白质发生未正确折叠或积累时触发。
这种反应旨在通过调控蛋白质合成、折叠和降解,以维持细胞内的蛋白质稳态。
当内质网中未正确折叠的蛋白质积累时,分析认为这可能会破坏细胞的生物平衡,并对细胞的生存状况造成影响。
为了应对这种情况,细胞启动UPR反应来减少新的蛋白质合成,增加
分子伴手动机的表达,以帮助蛋白质正确折叠,并增加内质网和细胞质中蛋白质降解的能力。
此外,UPR还能减少糖原的
合成和细胞凋亡的发生。
总之,UPR是一种细胞适应不良环境的生物反应,通过调节
蛋白质合成和降解,维持细胞内的蛋白质稳态,以确保细胞生存和功能的正常运作。
未折叠蛋白反应:从应激通路到稳定调节Peter Walter and David Ron细胞分泌或展示在起表面的大多蛋白质进入它们折叠组装的场所内质网,只有合适的组装蛋白质才能从内质网进入细胞表面。
细胞会根据需要来调节内质网内部蛋白质组装能力,从而确保蛋白质折叠的精确性。
分泌蛋白或膜蛋白在它们被分派到内膜系统其他细胞器、分泌到细胞表面、或释放到胞外之前都在内质网腔内折叠、成熟。
内质网通过激活包内信号转导来反应腔内未折叠蛋白的压力,这统称为未折叠蛋白反应(UPR)。
而且,至少三种明显不同的UPR通路来调节各种不同基因的表达使内质网保持稳态或当内质网应激得不到消除时诱导细胞凋亡。
最近研究进展给UPR的复杂机制及其在各种疾病中扮演的角色带来了一线光明。
分泌蛋白或膜蛋白在它们被分派到内膜系统其他细胞器、分泌到细胞表面、或释放到胞外之前都在内质网腔内折叠、成熟。
UPR,一种保守系统发生信号路径,是内质网的检测器,检测折叠能力的不足并,感知错误折叠的胁迫,从而根据内质网状态来交流信息来调控振和基因表达。
UPR的激活是通过对内质网膜表达的调节,用新合成的蛋白质折叠基质填充来满足需要。
这种长期大范围转录调控伴随着进入内质网的蛋白质流量瞬间减少。
这样UPR建立并维持的稳态的无数其他循环的一个范例。
复杂的细胞器安排发生元件的分子水平上得到阐明时,细胞生物学进展才能完美体现。
UPR就是其中一个例子,他详细表述的分子机制说明了一个真核细胞调控器内质网的能力。
令人感到意外的是,由于这些机制的激增,关于UPR是如何与细胞生理杂乱的各方面协调并维持稳态的,这方面的发现的大门被打开了。
事实上,真核细胞所有用来与环境惊醒信息交流的蛋白都在内质网组装。
它们传出传入的信息决定了器官的健康,比如传递细胞分裂、成熟、分化或死亡的信号。
一个阈值来保证各部分组装的精确性,离开了这些质量控制集体就会陷入混乱局面。
ER的基本功能就是运用对蛋白质的质量控制,使得只有经过正确折叠的蛋白质才能装入内质网囊泡被运网细胞表面。
未折叠反应
未折叠反应是指未折叠的蛋白质在内质网中的积累,引发内质网应激的一种反应。
这种反应是为了缓解内质网应激,细胞启动的一种未折叠蛋白反应(UPR)。
当细胞发生应激,如缺氧、营养缺乏、钙离子稳态失衡等时,内质网功能发生紊乱,未折叠或错误折叠的蛋白在内质网腔中积聚,进而导致内质网功能障碍的病理状态,称为内质网应激(ERS)。
为了缓解内质网应激,细胞会启动未折叠蛋白反应(UPR),并通过激活分子伴侣表达、调控脂质合成、促进内质网相关降解(ERAD)等方式减少未折叠或错误折叠的蛋白,恢复内质网稳态,提高细胞在不利条件下的生存能力。
以上信息仅供参考,建议查阅专业文献或者咨询专业人士获取更多信息。
线粒体非折叠蛋白反应嘿,你知道线粒体里的非折叠蛋白反应吗?这就像是线粒体这个小工厂里突然乱了套,蛋白们都没好好折叠,就像一群调皮的孩子在车间里打闹,把原本整齐的生产线弄得乱七八糟。
线粒体就像是细胞的能量发电站,而蛋白呢,那是发电站里精密的小零件。
正常情况下,蛋白们规规矩矩地折叠成该有的形状,就像小零件都精准地安装在机器上。
可一旦有蛋白非折叠了,那可不得了,就好比发电站里的齿轮突然变形了。
这时候,线粒体非折叠蛋白反应(UPRmt)就闪亮登场啦,反应方程式大概是这样:未折叠蛋白↑→UPRmt激活。
这就像是触发了一个紧急警报系统。
这个反应一启动,就像是派出了一群超级英雄。
线粒体开始努力调整自己的状态,就像一个手忙脚乱的厨师在厨房重新整理被弄乱的食材。
它会增加一些分子伴侣的产量,分子伴侣就像是蛋白的小保姆,负责把那些调皮的未折叠蛋白照顾好,帮它们正确折叠。
而且啊,UPRmt还会像个严厉的监工一样,减少新蛋白的合成。
这就好比工厂发现产品质量不行了,先停止生产新的,把现有的问题解决掉。
就像你做蛋糕的时候发现面糊不对劲,就先不做新的蛋糕了,先把这盆面糊弄好再说。
如果UPRmt搞不定这些未折叠蛋白,那可就惨咯。
就像救火队扑不灭大火一样,整个线粒体可能就会陷入危机,就像一个摇摇欲坠的城堡。
这时候细胞可能也会跟着遭殃,就像一艘船的发动机出问题了,整艘船都会有危险。
不过呢,当UPRmt成功的时候,那场面就像是把混乱的派对重新变得有序。
蛋白们都乖乖地折叠好了,线粒体又能欢快地生产能量了,就像一个重新充满活力的小工厂。
有时候我觉得UPRmt就像一个神奇的魔法棒,只要一挥,就能把线粒体里的混乱局面给扭转过来。
但它也不是万能的啦,要是未折叠蛋白太多太疯狂,就像一群汹涌的洪水,那这个魔法棒也可能会力不从心。
这个反应还很聪明呢,它能根据未折叠蛋白的情况做出不同的调整,就像一个经验丰富的老裁缝,根据不同的身材修改衣服。
总之,线粒体非折叠蛋白反应虽然听起来很复杂,但其实就像是细胞里一场有趣又刺激的拯救行动,时刻守护着线粒体这个重要的小世界呢。
未折叠蛋白反应:从应激通路到稳定调节Peter Walter and David Ron细胞分泌或展示在起表面的大多蛋白质进入它们折叠组装的场所内质网,只有合适的组装蛋白质才能从内质网进入细胞表面。
细胞会根据需要来调节内质网内部蛋白质组装能力,从而确保蛋白质折叠的精确性。
分泌蛋白或膜蛋白在它们被分派到内膜系统其他细胞器、分泌到细胞表面、或释放到胞外之前都在内质网腔内折叠、成熟。
内质网通过激活包内信号转导来反应腔内未折叠蛋白的压力,这统称为未折叠蛋白反应(UPR)。
而且,至少三种明显不同的UPR通路来调节各种不同基因的表达使内质网保持稳态或当内质网应激得不到消除时诱导细胞凋亡。
最近研究进展给UPR的复杂机制及其在各种疾病中扮演的角色带来了一线光明。
分泌蛋白或膜蛋白在它们被分派到内膜系统其他细胞器、分泌到细胞表面、或释放到胞外之前都在内质网腔内折叠、成熟。
UPR,一种保守系统发生信号路径,是内质网的检测器,检测折叠能力的不足并,感知错误折叠的胁迫,从而根据内质网状态来交流信息来调控振和基因表达。
UPR的激活是通过对内质网膜表达的调节,用新合成的蛋白质折叠基质填充来满足需要。
这种长期大范围转录调控伴随着进入内质网的蛋白质流量瞬间减少。
这样UPR建立并维持的稳态的无数其他循环的一个范例。
复杂的细胞器安排发生元件的分子水平上得到阐明时,细胞生物学进展才能完美体现。
UPR就是其中一个例子,他详细表述的分子机制说明了一个真核细胞调控器内质网的能力。
令人感到意外的是,由于这些机制的激增,关于UPR是如何与细胞生理杂乱的各方面协调并维持稳态的,这方面的发现的大门被打开了。
事实上,真核细胞所有用来与环境惊醒信息交流的蛋白都在内质网组装。
它们传出传入的信息决定了器官的健康,比如传递细胞分裂、成熟、分化或死亡的信号。
一个阈值来保证各部分组装的精确性,离开了这些质量控制集体就会陷入混乱局面。
ER的基本功能就是运用对蛋白质的质量控制,使得只有经过正确折叠的蛋白质才能装入内质网囊泡被运网细胞表面。
错误折叠蛋白滞留在ER内部,被排到细胞液后被蛋白酶体降解,这个过程成为内质网相关蛋白降解(ERAD)。
ERAD 在不能引起UPR的细胞中是必须的,这也体现了多台不能回到他原来的状态的重要性。
UPR的延长意味着ER应激没有得到缓和,稳态没有得到恢复,这关联细胞的生死。
同时也说明,保证凋亡可能涉及防止机体退化,劣种细胞缺乏保证精确的信号组分。
生死抉择基于内质网应激能否得到及时缓和,这也很好的解释了UPR 在各种人类疾病中重要角色。
如果细胞稳态失衡,杀死细胞对整体有利,UPR会是促使细胞凋亡的执行者,或是防治坏死细胞伤害机体的卫兵。
蛋白质错误折叠造成的疾病种类有:视网膜炎,(一种视网膜发育过程中突变的视紫红质折叠导致的视网膜恶化的遗传病,另外一个例子是二型糖尿病,胰岛B细胞因为胰岛素产量过度要求而妥协。
第二大类型涉及病毒感染,利用UPR来增加内质网组装能力来满足病毒的复制。
相似的,有一种类型的癌症,尤其是分泌细胞的癌变,如多发性骨髓瘤利用UPR的细胞保护功能来满足自身增殖的需要。
基于UPR活性结果分歧是否存在一个操作来治疗性的干预UPR还不清楚。
所以发展UPR的信号传导分子机制的精确理解,并且研制有选择的调节通路步骤显得尤为重要。
三种UPR信号传导器UPR主要的三种通路已被证明。
所有通路格子新号传到通路平行进行。
各通路根据一组内质网膜跨膜信号转道蛋白来命名:IRE1(抑制物阻抗性酯酶)、PERK(双键RNA依赖的蛋白激酶样内质网激酶)、ATF6(活性转录因子6)内质网膜上三种起信号转传导作用的跨膜蛋白。
IRE1通路存在低等生物中最为保守的通路。
伴随进化多细胞生物中才有了PERK和ATF6通路。
不同的细胞类型中UPR有不同的体现。
而且多重多样的基因编码ATF6家族蛋白,不如动物细胞中两类IRE1同源,暗示细胞类型的分化仍旧不得解。
无论那种通路的激活都会导致b-ZIP 转录因子的产生,单独作用或相互合作来激活靶基因。
ATF6是最初被合成的内质网膜跨膜蛋白,是能够大量内质网域的转录因子。
未折叠蛋白一旦累积,ATF6就被装入运输囊泡,被运往高尔基体。
在高尔基体ATF6被两个蛋白酶S1P和S2P水解,自由的N末端进入细胞核并激活UPR靶基因。
ATF6靶基因重要内质网腔内蛋白和内质网折叠有关。
例如,Bip(热休克蛋白家族的一员)。
蛋白质二硫键异构酶和葡萄糖调节蛋白94(GRP94;Hso90家族的一员)。
固醇调节元件结合蛋白是哺乳动物控制固醇生物合成的转录因子ATF6用和SREP 相同的酶。
然而,SREP在内质网内部调控机制很好理解,ATF6如何应答ER应激的机制就鲜为人知了。
它的ER腔内没有显示与其他蛋白的同源性。
ATF6和BIP 有关联,BIP在ER应激中的作用有助于UPR的激活。
ATF6在内质网腔内包含分子二硫键的连接,ER内环境氧化还原感受器的作用。
UPR的第二个信号通路是由内质网跨膜蛋白PERK介导的。
内质网应激时,PERK 形成同源二聚体并且自身磷酸化,普通翻译起始因子的a亚基eIF2a,间接抑制eIF2a,并抑制mRNA的翻译。
从而,eIF2被限制,一些包含开放5‘端的开放阅读框mRNA却被翻译。
其中就有编码ATF4的。
两个重要靶基因 ATF4驱动的是CHOP 和是一个控制编码诱导凋亡基因的转录因子。
UPR的PERK通路试试强有力的保护性信号通路又能诱导细胞凋亡。
此二元物极可能在eIF2 a磷酸化水平时表达,对其进行磷酸化处理的结果就是例证。
GADD34编码一个PERK诱导元件磷酸化蛋白PPIC抵抗PERK通过去磷酸化选择性的抑制GADD34-PP1C复杂化,通过小分子对GADD34的删除来保护细胞应对ERS通过延长低水平磷酸化。
如果GADD34受到危害基本被删除,这一致命结果有磷酸化造成,可见稳定的重要性。
UPR 的第三条通路因存在于酵母中而得名,是研究的最为清楚的一个通路。
IRE1是生物功能跨膜蛋白,具有核酸酶活性,它用独特机制拼接mRNA,传递UPR 信号。
随着之后内质网膜上的寡聚化造成构想的改变,IRE1在两个特殊位点切除一段基因来编码相应的UPR转录因子,称为XBP1(X-BOX结合蛋白1)。
剩余的外显子被连接在一起(存在于酵母中的RNA连接酶,一种或多种未见于哺乳动物细胞中的酶)转为一个拼接好的mRNA,可用于有活性的转录因子(XBP1s有标记物提示它是拼接后的RNA产物)酵母中,IRE1协助UPR基因的表达,然而在动物细胞中,诱导UPR转录因子间有冗余。
尽管如此,XBP1S在知道脂类生物合成酶方面的扮演着重要角色。
对IRE1激活的分子机制的深入研究结构和生物物理实验提供了IRE1激活的地详细视图。
RNA核酸酶激活过程:从无活性单体组装成紧密连接的二聚体进一步折叠成高度有序的低聚体。
在激活过程中IRE1自身磷酸化,IRE1单体间头对头相互作用,这样中符合有助于激活反相磷酸化,但是二聚体RNA核酸酶位点不组装状态。
IRE1单体反响磷酸化为寡聚体可能仍在继续。
IRE1激活新欢的磷酸化作用及其他蛋白激酶,增进核酸酶与其激酶位点的结合。
然而,IRE1的磷酸化状态可能会以其他方式改变活性。
IRE1低聚物结构部分磷酸盐形式稳定盐桥连接单体,表明磷酸化在IRE1激活中很重要。
PERK及其他激酶通常传递信号不通过磷酸化反应,IRE1的激酶活性可能被完全绕过去。
酵母中,没有IRE1蛋白激酶活性的突变体,在未折叠蛋白反应累积时,保持寡聚体状态仍能够拼接RNA并介导mRNA拼接,虽然程度有些减弱。
令人惊讶的是,这些突变体在关闭的延迟剪接反应后应对ER应激。
未能正确地灭活IRE1不当延长UPR信号,降低细胞UPR引起的条件下生存。
因此,自身磷酸化是一个关键的特性UPR自我平衡的反馈循环。
早些添加磷酸盐有助于稳定IRE1寡聚物形式和为进一步激活配体开放结合位点。
磷酸盐晚些加入的可能使低聚物受到破坏,也许只是简单在低聚物之间建立电荷斥力或是因为其他因素提供结合位点帮助低聚物的解体。
这种机制可能促进,向磷酸化的IRE1之间的嵌入到激活的低聚物和过度磷酸化而解体,这两者的之间的一个动态平衡。
有越来越多的证据表明使IRE1激活的阈值综合可以通过各种方式调解。
例如,结合到IRE1的激酶位点上的小分子可以被不同的催化剂抑制或激活。
这些化合物的绑定被认为保守的蛋白激酶:在两个构想状态之间的转换“aC-helix”和“aC-helix。
“在第一个构象,IRE1倾向于二聚体化并被激活第二种构想中倾向于抑制激活的。
因此IRE1的激酶域作为一个包含有配体的构象模块,可以调节激活阈值。
这为IRE1提供了一种由核苷酸调节的方法(或者其他涉及核苷酸结合域的代谢分子)。
通过寡聚化和激活反应的调节在酵母IRE1在低聚物界面上有第二配体结合位点,到目前为止,只见于体外。
IRE1与底物的相互作用目前的研究把注意力放在由IRE1靶向XBP1Mrna的作用机制。
在芽殖酵母中,HAC1mRNA(酵母中的XBP1同源物)在其必须的且能足够集中激活的IRE1的3′非翻译区包含一个目标信号。
相反,在哺乳动物细胞中,XBP1u相比之下,哺乳动物的XBP1u,是由未经剪切的 XBP1mRNA翻译过来的蛋白质,在c端包含有疏水多肽段,可以作为将XBP1u-转化多核糖体带到膜表面的信号序列。
植物细胞中的bZIP60是 XBP1的同源物,也是尤为间接的mRNA翻译而来,且靶向内质网膜成为其内嵌蛋白膜。
这两种情况下,拼接改变的是开放阅读框疏水的目标序列没有被翻译,致使产生可溶性的转录因子。
因此,bZIP60和ATF6之间存在有趣的相似之处都是mRNA拼接或蛋白质水解使得内质网驻留蛋白感应到并引发UPR反应产生的转录因子。
酵母IRE1的细胞质激酶/核糖核酸酶域表现出很大活性,动力学角度说明两个或更多IRE1分子只有组装才能表现完全的酶活性。
荧光标记IRE1融合蛋白的寡聚化在光学显微镜下是可见的,当UPR被激活动态的内质网膜上的离散点集聚直到允许荧光团之间荧光能量传递的接近程度。
一个基于活性的寡聚体的IRE1蛋白质作用面的晶体结构模型,当IRE1二聚体堆叠在一个低聚物时形成,并稳固核糖核酸酶活性部位,提供一个直观的说明了聚合反应和酶的激活可能是耦合的。
因为它的互作特性,IRE1核糖核酸酶激活性会突然达到临界阈值浓度, IRE1的胞质模块,有一种类似开关属性。
在细胞内,许多IRE1模块产生的信号,这样的二进制输出会累积成能体现输出信号的强度的反应这对稳态的维持是非常有用的。
只要将内质网多个位置上的信号进行集成,这种综合信号就会发生,可以随时有效的清点激活的IRE1集群的个数。