喉鳞状细胞癌中TIMP3基因启动子区甲基化状态的研究
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抑癌基因RUNX3启动子甲基化与喉癌的关系的开题报告
1. 研究背景
喉癌是一种常见的恶性肿瘤,其发病率逐年增加。
虽然喉癌的致病因素复杂,但研究表明,一些基因的异常甲基化可能与喉癌的发生发展有关。
RUNX3是一种抑癌基因,其启动子区域的甲基化状态与其表达水平相关,但RUNX3启动子甲基化与喉癌的关系尚未明确。
2. 研究目的
本研究旨在探究RUNX3启动子甲基化与喉癌的关系,为喉癌的早期诊断和治疗提供新的思路和方法。
3. 研究内容
(1)收集喉癌组织和正常喉组织标本,检测RUNX3的甲基化状态及表达水平;
(2)分析RUNX3启动子甲基化与喉癌的患病率和临床病理特征的相关性;
(3)探究RUNX3启动子甲基化对喉癌细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响。
4. 研究方法
(1)采用甲基化特异性PCR(MSP)检测RUNX3启动子的甲基化状态;
(2)采用RT-qPCR检测RUNX3的表达水平;
(3)进行免疫组织化学染色分析RUNX3的蛋白表达水平;
(4)利用小鼠模型验证RUNX3启动子甲基化对喉癌发生发展的影响。
5. 预期结果
通过本研究,预计可以得到以下结果:
(1)验证喉癌和正常喉组织中RUNX3启动子甲基化的差异;
(2)探究RUNX3启动子甲基化与喉癌患病率和临床病理特征的相关性;
(3)明确RUNX3启动子甲基化对喉癌细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响;
(4)提供新的思路和方法为喉癌的早期诊断和治疗做出贡献。
6. 研究意义
本研究将有助于深入探究甲基化与癌症的关系,为喉癌的早期诊断和治疗提供新的思路和方法。
同时,也将为RUNX3的研究提供新的思路和基础。
喉癌及癌前病变中细胞周期调控基因甲基化的研究郭伟;黄志刚;陈晓红;范尔钟;许洪波【期刊名称】《中国耳鼻咽喉头颈外科》【年(卷),期】2009()3【摘要】目的探讨细胞周期调控基因p14,p15及p16在喉癌发生发展中的作用。
方法选取20例喉癌癌前病变(包括喉角化8例、白斑4例和成人复发性喉乳头状瘤8例)、30例喉鳞状细胞癌(声门型)及10例癌旁组织。
采用甲基特异性聚合酶链反应(methylation-specific PCR,MSP)检测p14,p15及p16基因启动子区过甲基化。
结果p14,p15及p16基因启动子过甲基化发生率在癌前病变中分别为10%(2/20)、15%(3/20)、20%(4/20);在喉癌中分别为30.0%(9/30)、40.0%(12/30)、36.7%(11/30);在癌旁组织中未检测到过甲基化事件。
结论细胞周期调控基因p14,p15及p16启动子区过甲基化发生于喉癌早期病变中,可作为喉癌前病变及早期喉癌筛查的指标之一。
【总页数】4页(P111-114)【关键词】DNA甲基化;细胞周期蛋白质类;喉肿瘤;癌,鳞状细胞;癌前状态;基因,肿瘤抑制【作者】郭伟;黄志刚;陈晓红;范尔钟;许洪波【作者单位】首都医科大学附属北京同仁医院;首都医科大学附属北京同仁医院耳鼻咽喉头颈外科,耳鼻咽喉头颈科学教育部重点实验室(首都医科大学);北京市耳鼻咽喉科研究所【正文语种】中文【中图分类】R733.402;R739.65【相关文献】1.艾灸对HCC癌前病变大鼠细胞周期调控基因cyclinD1、cdk4影响的实验研究[J], 敖有光;刘东霞;杨运宽;翟伟;张迎军2.喉癌组织RKIP基因甲基化表达调控研究 [J], 赫莉;李芳芳;曹山虎;陈艳红;彭丽娜;武川军3.葛花解酲方对乙醇性 HBV 转基因小鼠肝癌癌前病变细胞周期调控因子表达的影响 [J], 郭斌;唐东昕;龙奉玺;罗莉;黄慧;王定雪;李军;王镜辉;杨柱4.细胞周期G1/S转换调控因子在喉癌发生过程中作用的研究 [J], 王金泉;王建波5.Tob与细胞周期蛋白D1在喉癌细胞增殖过程中调控关系的研究 [J], 尚超;李巍;富伟能;孙开来;郭艳因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
喉癌组织中DNA修复基因O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶启动子区过甲基化研究张松;孔维佳;刘争【期刊名称】《中华耳鼻咽喉头颈外科杂志》【年(卷),期】2004(039)003【摘要】目的 O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(O6-methylguanine DNA methyltransferase,MGMT)在烷化剂所致DNA损伤的修复中起重要作用,启动子区过甲基化而导致MGMT基因的转录失活.本文探索了喉癌中MGMT基因启动子区过甲基化状态及其mRNA表达情况.方法采用甲基化特异性聚合酶链反应及半定量逆转录聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)法分析喉癌、癌旁和正常喉部组织中MGMT基因启动子区过甲基化状态及其mRNA表达情况.结果 46例喉癌组织中有16例(34.8%)MGMT基因启动子过甲基化,相应的癌旁及正常组织中均无甲基化.MGMT基因甲基化在不同的病理分级(χ2=3.130,P=0.077)和临床TNM分期(χ2=3.957,P=0.138)中差异无显著性.所有甲基化的癌组织中均无MGMT mRNA表达,而所有非甲基化的癌组织、相应癌旁组织和5例正常组织中均有MGMT mRNA表达.且非甲基化的癌组织中MGMT mRNA表达较癌旁组织(t=30.540,P<0.01)和正常组织(t=31.882,P<0.01)强,而癌旁和正常组织之间差异无显著性(t=0.419,P=0.677).结论喉癌中MGMT基因启动子区过甲基化与其转录失活有关.【总页数】5页(P152-156)【作者】张松;孔维佳;刘争【作者单位】430022,武汉,华中科技大学同济医学院附属协和医院耳鼻咽喉科;430022,武汉,华中科技大学同济医学院附属协和医院耳鼻咽喉科;华中科技大学同济医学院附属同济医院耳鼻咽喉科【正文语种】中文【中图分类】R73【相关文献】1.O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶甲基化状态和同期放化治疗与中国香港胶质母细胞瘤患者生存的相关性研究 [J], 陈达明;伍兆龙;朱献伦;陈功;吴浩强;谭海斌;潘伟生;甘冠明;马碧如;吴志萍;彭颂先;刘嘉怡;萧容媛2.胶质瘤组织中DNA修复基因MGMT启动子区过甲基化研究 [J], 王之敏;高薇;朱凤清;许期年;左剑玲;王秀云;周岱3.散发性大肠癌O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶基因启动子过甲基化状况及K-ras表达与临床病理特征相关性分析 [J], 牛钊锋4.脑胶质瘤患者异柠檬酸脱氢酶(IDH)1/2基因突变与O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)基因启动子区甲基化的相关性研究 [J], 林华亮;郑泽洲;郑伟杰5.宫颈癌组织中DNA修复基因06-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶启动子区过甲基化研究 [J], 高艳萍;王泽华;李敏;张颖颖;王翰;贺小红因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
食管癌细胞系中TIMP3、E-cadherin基因甲基化的
研究的开题报告
引言:
食管癌是一种恶性肿瘤,其发病率在我国居高不下。
该疾病的治疗效果十分不理想,晚期患者的五年生存率不高,因此防治食管癌具有重要意义。
研究表明,食管癌的发生与基因表达异常、基因突变等有密切关系,而DNA甲基化是其中重要的基因表达调控机制之一。
本研究旨在研究食管癌细胞系中TIMP3、E-cadherin基因甲基化状态及其与食管癌发生的关系。
方法:
通过实验室培养的人食管癌EC109细胞系,采用甲基化特异性聚合酶链式反应(MSP)和双脱氧核糖核酸(DNA)测序技术,检测EC109细胞中TIMP3、E-cadherin基因的甲基化状态。
另外,通过实时荧光定量PCR 技术检测EC109细胞中TIMP3、E-cadherin mRNA的表达水平。
预期结果:
预计将发现在EC109细胞中,TIMP3、E-cadherin基因都存在甲基化现象,并且甲基化程度可能与该基因的表达水平呈负相关。
此外,我们希望研究不同甲基化状态的EC109细胞在肿瘤增殖、侵袭、转移等方面的差异,以阐明甲基化现象与食管癌发生的关系。
结论:
本研究将揭示食管癌细胞系中TIMP3、E-cadherin基因甲基化状态及其在食管癌发生中的作用,有助于拓展食管癌发病机制的认识,为寻找新型食管癌预防、治疗方法提供理论依据。
浙江医学2018年第40卷第5期喉癌是呼吸系统常见恶性肿瘤之一,其发病率居呼吸系统恶性肿瘤的第2位,仅次于肺癌[1];国人发病率有明显上升趋势,且发病年龄趋于年轻化,尤其在北方地区[2]。
喉鳞状细胞癌(LSCC )是喉癌最常见的病理类型。
喉癌的发生包括遗传学和表观遗传学两大机制,以及吸烟、饮酒过度、病毒感染等因素的参与[3]。
目前认为,以抑癌基因启动子异常甲基化(会导致基因沉默或失活)为代表的表观遗传学改变是肿瘤发生的重要机制之一,检测肿瘤相关基因启动子异常甲基化已逐步成为早期筛查肿瘤的常用方法[4-5]。
人类CLDN11基因定位于3q26.2,其编码的Claudin-11蛋白是完整的膜蛋白,为组成细胞紧密连接的主要成分,而紧密连接蛋白的异常表达被认为是肿瘤进展的重要一步[6]。
CLDN11基因表达下调会增强肿瘤细胞迁移、侵袭能力,进而促进肿瘤发生、发曹炳沈志森林乐希郝文娟周重昌doi :10.12056/j.issn.1006-2785.2018.40.5.2017-2263基金项目:浙江省自然科学基金(LY14H160003);浙江省医药卫生省部培育计划(2014PYA017);浙江省医药卫生科技计划项目(2012ZDA042);宁波市科技创新团队(2012B82019、2015B11050);宁波市重大择优委托项目(2012C5015);宁波市自然科学基金(2012A610208、2017A610236)作者单位:315000宁波大学医学院(曹炳、林乐希、郝文娟);宁波大学附属李惠利医院耳鼻咽喉头颈外科(沈志森、周重昌)通信作者:沈志森,E-mail:szs7216@喉鳞状细胞癌组织CLDN11基因启动子甲基化及临床意义研究【摘要】目的探讨喉鳞状细胞癌(LSCC )组织中CLDN11基因启动子的甲基化水平及其临床意义。
方法采用实时荧光定量甲基化特异性聚合酶链反应(qMSP )分别检测91例LSCC 患者的LSCC 组织及其配对的癌旁正常组织CLDN11基因启动子甲基化水平,分析其与临床病理特征及预后的关系,绘制ROC 曲线评估其诊断价值。
ctDNA启动子区甲基化在食管鳞癌诊断中的应用价值杨志珍;谈艳芳【期刊名称】《医学信息》【年(卷),期】2024(37)6【摘要】目的探讨ctDNA启动子区(Promoter)甲基化在食管鳞状细胞癌患者血浆中的表达情况,筛选可作为诊断食管鳞状细胞癌潜在的生物标志物。
方法收集2022年8月-2023年1月于德阳市人民医院初诊为食管鳞状细胞癌患者与健康体检者血浆标本分别作为食管鳞癌组与健康对照组。
采用全基因酶促甲基化测序(EM-Seq)检测两组间的ctDNA甲基化差异表达水平,结合GO、KEGG、Reactome富集筛选出食管鳞癌组甲基化水平高于健康对照组的前4位基因作为食管鳞状细胞癌相关的诊断生物标志物。
结果EM-Seq测序得到两组差异甲基化区基因共9354个,其中食管鳞癌组高于健康对照组的有553个基因位于Promoter上。
相关通路富集显示,食管鳞癌组甲基化水平高于健康对照组的前4位基因为AXIN1、EPS15、CACTIN、E2F1,分别位于16号染色体、1号染色体、19号染色体和20号染色体上,涉及DNA损伤修复、Wnt信号通路、EGFR信号通路及NF-kB信号通路等肿瘤中常见信号通路。
结论AXIN1、EPS15、CACTIN 和E2F1基因或可作为诊断食管鳞状细胞癌的潜在生物标志物。
【总页数】6页(P91-95)【作者】杨志珍;谈艳芳【作者单位】成都中医药大学医学技术学院;德阳市人民医院检验科【正文语种】中文【中图分类】R735.1【相关文献】1.RASSF1A基因启动子区甲基化状态在食管鳞癌诊断中的研究2.抑癌基因启动子区甲基化在食管鳞状细胞癌诊断、治疗和预后中的应用价值3.RASSF1A、MINT31启动子区高甲基化与食管上皮内瘤变和食管鳞癌的关系4.人食管鳞癌中CCNYL1启动子区甲基化研究因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
喉癌中Runx3基因启动子甲基化及其蛋白表达的研究的开题报告题目:喉癌中Runx3基因启动子甲基化及其蛋白表达的研究一、选题背景和意义喉癌是指在喉部发生的恶性肿瘤,其发生率逐年升高,并呈现年轻化趋势。
目前,喉癌病例的治疗方式有手术、放疗和化疗等,但治疗效果并不理想。
因此,进一步研究喉癌的病理机制和分子生物学机制,探索新的治疗方法是十分必要的。
Runx3是一种转录因子,参与了细胞增殖、分化、凋亡等重要生物学过程。
前期研究发现,Runx3在多种肿瘤中表达降低或缺失,与肿瘤的发生、发展密切相关。
而喉癌中Runx3启动子区域的甲基化及其对蛋白表达的影响尚未被深入研究。
因此,本课题旨在探讨喉癌中Runx3基因启动子甲基化及其蛋白表达的研究,探索其在喉癌发生发展中的作用和机制。
二、研究方案和内容1.采集喉癌组织和对照组织,提取DNA和RNA。
2.利用甲基化链反应荧光检测法检测喉癌组织和对照组织中的Runx3启动子甲基化水平。
3.利用RT-qPCR方法检测喉癌组织和对照组织中的Runx3 mRNA表达水平。
4.利用免疫组织化学技术进行Runx3蛋白的定位和表达水平检测。
5.对实验结果进行统计学分析,并分析Runx3启动子甲基化对其蛋白表达的影响。
三、计划进度和预期成果本研究采用横向比较,拟采集50例喉癌患者的喉癌组织和50例正常组织样本,预计在6个月内完成实验和数据分析,并得出以下预期成果:1.喉癌患者中Runx3启动子甲基化水平高于正常组织。
2.喉癌组织中Runx3 mRNA表达水平较低。
3.喉癌组织中Runx3蛋白表达水平较低。
4.分析Runx3启动子甲基化对其蛋白表达的影响。
5.为喉癌发生发展的分子生物学机制研究提供新的理论基础和实验依据。
以上计划进度和预期成果仅供参考,实际情况还需要进一步调整和完善。
基因启动子甲基化作为口腔鳞状细胞癌潜在诊断指标的研究进
展
王翰杰;沈佳程;梁俏美;刘伟
【期刊名称】《转化医学电子杂志》
【年(卷),期】2017(004)005
【摘要】DNA甲基化作为表观遗传学的表现形式之一,在维持细胞功能中起重要作用,是一种用来抑制不必要的基因表达的自然调控机制.基因启动子异常甲基化会导致基因表达下调,一定程度上参与了多种癌症的进程.近年来,大量研究发现,基因启动子甲基化可作为口腔鳞状细胞癌(OSCC)潜在和敏感的生物学标志物,实现其早期诊断和追踪癌症的预后情况.
【总页数】3页(P44-46)
【作者】王翰杰;沈佳程;梁俏美;刘伟
【作者单位】河北医科大学基础医学院,河北石家庄050017;河北医科大学基础医学院,河北石家庄050017;河北医科大学基础医学院,河北石家庄050017;河北医科大学基础医学院免疫学教研室,河北省重大疾病的免疫机制及干预重点实验室,河北石家庄050017
【正文语种】中文
【中图分类】R783.1
【相关文献】
1.口腔鳞状细胞癌中TSLC1基因启动子甲基化状态检测的临床意义 [J], 刘玉红;高菊荣;王琰
2.抑癌基因启动子区甲基化在食管鳞状细胞癌诊断、治疗和预后中的应用价值 [J], 吴亮;李闻;郭明洲
3.基因启动子甲基化与口腔鳞癌的研究进展 [J], 贾玉良
4.基因启动子甲基化作为卵巢癌诊断指标研究进展 [J], 姚然然(综述);张凯华(综述);吴闻音(综述);刘上聘(综述);王翰杰(综述);王应含(综述);刘伟(审校)
5.shRNA诱导Maspin基因启动子甲基化调控口腔鳞状细胞癌迁移与侵袭能力的实验研究 [J], 罗军;应于康;吴伟力;朱海钱
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