细菌毒力基因分布
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高毒力肺炎克雷伯菌血清型、毒力基因分布及分子标志物探索徐水宝; 杨思宇; 翁珊珊; 陈晨; 陈澍; 张文宏; 金嘉琳【期刊名称】《《微生物与感染》》【年(卷),期】2019(014)006【总页数】7页(P338-344)【关键词】高毒力肺炎克雷伯菌; 血清型; 毒力基因; 分子标志物【作者】徐水宝; 杨思宇; 翁珊珊; 陈晨; 陈澍; 张文宏; 金嘉琳【作者单位】复旦大学附属华山医院感染科上海200040【正文语种】中文肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae,KP)是一种革兰染色阴性、有荚膜的肠杆菌科细菌,广泛存在于环境中,亦寄生于人类的皮肤、鼻咽部、肠道等,为条件致病菌,主要感染免疫功能低下者[1]。
1986年7例由KP引起的肝脓肿并发眼内炎首次被报道,并被定义为高毒力肺炎克雷伯菌(hypervirulent Klebsiella pneumoniae,HVKP)[2]。
HVKP也可引起健康人群肝脓肿伴远处播散,如眼内炎、坏死性筋膜炎、中枢神经系统感染等,称为侵袭综合征[2-3]。
此后,HVKP 的报道在全球范围逐渐增多,早诊断、早治疗可改善其感染的预后,然而目前仍然缺乏确切的分子诊断标准和特异性分子标志物(不同文献之间所述标准不一),对人类健康造成严重威胁。
本研究对分离自本院的25株HVKP与28株普通肺炎克雷伯菌(classic Klebsiella pneumoniae,cKP)血清型和毒力基因分布特点进行比较分析,探索HVKP的分子标志物,期望对该病的分子诊断提供数据。
1 研究对象与方法1.1 对象从复旦大学附属华山医院(2009―2018年)住院患者中,根据临床病史和病原学检查结果,筛选出侵袭综合征KP阳性患者(表1),从本院保存的菌库中获得相应的非重复KP菌株共25株,将其视为HVKP组;从菌库中随机抽取血流感染的KP菌株,并根据病史剔除有合并其他侵袭性感染的菌株,最终得到28株,将其视为cKP组。
大肠杆菌毒力基因转录组概述及解释说明引言部分内容如下:大肠杆菌(Escherichia coli)是一种常见的革兰氏阴性菌,广泛存在于自然界中。
虽然大肠杆菌通常被认为是人和动物的共生菌,但某些毒力菌株却可能引发严重的疾病。
这些毒力菌株携带着一系列的毒力基因,这些基因在细菌所致疾病的发展过程中发挥着重要作用。
本文旨在综述并解释大肠杆菌毒力基因及其转录组相关知识。
首先,我们将对大肠杆菌毒力基因进行定义、分类和作用机制等方面进行概述。
随后,我们将介绍大肠杆菌转录组研究的概念、原理以及相关方法与技术发展。
最后,我们将详细阐述转录组在大肠杆菌毒力基因研究中的作用和意义。
通过研究大肠杆菌转录组数据,我们可以揭示与毒力基因表达调控有关的网络和通路。
这有助于深入了解大肠杆菌所引发疾病的发病机制。
此外,转录组研究还能够预测和鉴定新的毒力基因候选者,为进一步的实验研究提供有价值的指导。
尤其值得一提的是,转录组研究对于开发相关的疫苗和治疗策略具有重要意义。
通过深入了解毒力基因及其调控机制,我们可以寻找到干扰这些机制的方法,为新型药物和防治策略的发展提供理论依据。
然而,虽然大肠杆菌转录组研究在毒力基因领域中具有巨大潜力,但目前仍面临着挑战与限制。
例如,在数据分析过程中可能存在一些技术问题和误差。
此外,对于大肠杆菌复杂生态系统中转录组网络整体功能的理解仍需进一步深入。
总之,通过综合分析与讨论大肠杆菌毒力基因与转录组相关内容,并探讨其作用和意义,旨在为更好地理解大肠杆菌致病机制以及开发相应治疗策略提供参考。
本文将总结当前的研究进展,并对大肠杆菌毒力基因转录组研究的未来发展方向进行展望,同时也探讨了该领域目前存在的挑战和限制。
2. 大肠杆菌毒力基因:2.1 毒力基因的定义与分类:大肠杆菌是一种广泛存在于自然界中的细菌,其中一部分菌株具有致病性。
致病性大肠杆菌通常通过其特定的毒力因子对宿主产生危害。
这些毒力因子被称为大肠杆菌毒力基因。
毒力基因分类
毒力基因是指编码细菌病原体产生毒力因子的基因。
根据功能和特性,毒力基因可以分为以下几类:
1. 侵袭力基因:这类基因编码细菌产生侵袭力,使细菌能够穿过宿主细胞的防御屏障并感染宿主。
例如,金黄色葡萄球菌的侵袭力基因包括溶血素(HL)、葡萄球菌溶血素(SL)等。
2. 毒素基因:这类基因编码细菌产生各种毒素,对宿主造成损害。
例如,肉毒杆菌的毒素基因编码产生肉毒毒素,白喉杆菌的毒素基因编码产生白喉毒素等。
3. 抗药性基因:这类基因使细菌对抗生素产生抗性,抵抗抗生素的杀菌作用。
例如,金黄色葡萄球菌中的mecA基因使其对甲氧西林产生抗性,导致耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)的出现。
4. 生物被膜形成基因:这类基因编码细菌产生生物被膜,有助于细菌在宿主体内定植和抵抗宿主免疫攻击。
5. 铁摄取基因:这类基因编码细菌铁摄取系统,使细菌能够获取宿主体内的铁元素,从而促进细菌的生长和繁殖。
6. 群体感应基因:这类基因参与细菌群体感应系统,调控细菌的生物合成、毒力因子产生和抗生素抗性等。
7. 耐酸碱性基因:这类基因使细菌能够在酸性或碱性环境下生存,增强其对环境的适应能力。
8. 抗生素产生基因:这类基因编码细菌产生抗生素,用于抵抗其他细菌的竞争。
不同细菌的毒力基因种类和分布有所不同,对其进行研究和分析有助于了解细菌的致病机制、传播途径以及开发针对性的防治策略。
细菌耐药性与毒力的遗传机制研究随着抗生素的广泛使用,细菌耐药性成为了全球公共卫生问题,细菌对常规抗生素的耐药性不断增加,威胁了人类健康。
同时,细菌的毒力也对人类健康构成了严重威胁。
为了防止并控制细菌耐药性和毒力的迅速发展,研究细菌耐药性和毒力的遗传机制已经成为重要的课题。
耐药性基因的分子遗传学机制细菌的耐药性是通过多种表观和基因表达层面的机制实现的。
其中,细菌的主要耐药性机制是利用质粒或转座子通过间接水平基因转移(HGT)进行的。
通过HGT机制,耐药性基因可以广泛地传播,而无需通过传统的竖向遗传途径进行遗传。
将质粒或转座子含有耐药性基因的细菌放入稀释的培养基中,这些基因会在细菌群体中大量传播,并形成耐药菌群。
此外,有证据表明,HGT机制也可导致同种细菌的新的亚种,并增加了细菌对不同环境的适应性和抵抗能力。
毒力基因的分子遗传学机制细菌的毒力是通过特定毒性因子或荧光蛋白等生物素提供的。
这些素在细胞内部或外部环境中运作,导致组织损坏和细胞死亡。
毒性因子可以被垂直遗传给后代,也可以通过水平基因转移进行遗传。
有些毒性因子是由嵌合体或质粒编码的,可以通过水平基因转移来传递细胞。
这些因子具有相对份额的关系,即某些因子可以增加其传递率和相对毒性,而其他因子则可以减少其传递率和相对毒性。
还有一些毒性因子被编码在双链DNA的质粒中,在不同的环境中具有不同的传递率、稳定性和毒性。
应对细菌的耐药性与毒力挑战为降低细菌的耐药性和毒力,有许多策略可供选择。
首先,纯净水源和食品卫生控制是防止细菌生长和传播的基本措施,尤其是在医疗环境和集体单位中。
同时,合理地使用抗菌剂,包括超广谱抗生素或联合用药,可以减少细菌暴露于抗菌药物的机会。
此外,研究人员正在研发全新的抗菌药物,例如靶向淋巴系统的抗体和细菌菌体疗法,以试图控制细菌的传播和治疗细菌感染。
除此之外,对于广泛分布的细菌种类,在细菌遗传素材的基础上,引入一些相对清洁和无害的遗传素材,从而可生成新的洁净细菌。
肝脓肿肺炎克雷伯菌血清分型及毒力基因研究李花;王倩【摘要】目的探讨肝脓肿相关肺炎克雷伯菌耐药性、血清型和毒力基因分布.方法收集75株肝脓肿患者临床分离肺炎克雷伯菌,采用Vitek2系统检测耐药性;PCR法检测血清型及毒力基因分布情况.结果 75株肝脓肿肺炎克雷伯菌对哌拉西林耐药率为16%,对复方磺胺甲噁唑的耐药率为4%,对头孢菌素类、氨基糖苷类等多种抗菌药物敏感.血清型分布以K1型(62.7%)为主,其次为K2型(21.3%),其他型别K5、K20、K54及K57均占2.7%,4株(5.3%)未分型.毒力基因以rmpA和aer-obactin检出率最高,分别达98.7%和97.3%,其次为kfu(68%)、wcaG(66.7%)和allS(57.3%).K1血清型菌株中以rmpA、wcaG、aerobactin、kfu和allS 5种毒力基因同时携带为主,占83%;K2、K20和K57型菌株的主要携带模式为rmpA+aerobactin;K5型为rmpA+aerobactin+kfu;K54型为rmpA+aerobactin+wcaG.结论肝脓肿相关肺炎克雷伯菌对多种抗菌药物敏感,K1、K2型是主要血清型,毒力基因rmpA和aerobactin检出率最高,K1血清型毒力基因检出种类最多.【期刊名称】《临床检验杂志》【年(卷),期】2018(036)007【总页数】3页(P493-495)【关键词】肺炎克雷伯菌;肝脓肿;血清型;毒力基因【作者】李花;王倩【作者单位】中国医科大学附属第一医院检验科,沈阳 110001;中国医科大学附属第一医院检验科,沈阳 110001【正文语种】中文【中图分类】R446.5近年来,关于肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumonia)所致的原发性肝脓肿的报道显著增多[1]。
我国研究显示,肺炎克雷伯菌相关肝脓肿占化脓性肝脓肿的60%~70%[2]。
引起肝脓肿的肺炎克雷伯菌多为高黏液表型的高毒力菌株,其毒力与荚膜血清分型及与黏液表型、铁摄入系统等相关的毒力基因关系密切。
102猪源肺炎克雷伯氏菌耐药性及毒力基因分析欧冠标1,周雨晴1,彭 昊2,陆泽宁3,廖玉英2,马东鑫1,袁敬知1,葛 强1,李 珣1,王晓晔1(1.广西大学动物科学技术学院,广西南宁 530004;2. 广西壮族自治区兽医研究所,广西南宁 530000;3.南宁市武鸣区双桥镇水产畜牧兽医站,广西南宁 530104)摘 要:为了解猪群中猪源肺炎克雷伯氏菌耐药情况和毒力基因携带状况,2019年采集存栏生猪肛拭子样品125份、宰后生猪肉类样品50份,通过细菌分离培养、药敏试验以及PCR 扩增16S rRNA 、khe 基因、耐药基因和毒力基因等方法对肺炎克雷伯氏菌特性进行分析。
结果显示,从125份肛棉拭子样品、50份宰后生猪肉类样品中各分离得到32、4株肺炎克雷伯氏菌;药敏试验结果显示,分离的肺炎克雷伯氏菌对四环素耐药性最高(83.3%),其次是氯霉素(63.9%)。
对36株分离菌进行耐药基因和毒力基因检测,发现携带耐药基因tet(A)的达30株、携带floR 、mcr-1的分别为23、10株,且有23株菌同时携带tet(A)和floR 基因,少部份菌株携带aadA1、bla TEM 、bla CTX-M-1、bla OXA 、qnrB 、aac(6')-Ib -cr ;携带毒力基因wabG 的达26株、携带uge 和fimH 的25株、携带kfu 的23株、携带aereobactin 的7株,且有20株菌同时携带wabG 、uge 、fimH 和kfu 基因。
结果表明,我国猪群中肺炎克雷伯氏菌检出率可能较高,菌株携带耐药基因及毒力基因较为集中,对部分抗生素耐药性较强。
本研究为肺炎克雷伯氏菌的检测、诊断以及合理使用抗生素治疗提供了试验依据,同时也为猪源肺炎克雷伯氏菌防控提供了数据支撑。
关键词:猪源肺炎克雷伯氏菌;PCR 鉴定;药敏试验;耐药基因;毒力基因中图分类号:S852.61 文献标识码:A 文章编号:1005-944X (2021)06-0102-10DOI :10.3969/j.issn.1005-944X.2021.06.021 开放科学(资源服务)标识码(OSID ):Analysis on Drug Resistance and Virulence Genes of Porcine Klebsiella pneumoniaeOu Guanbiao 1,Zhou Yuqing 1,Peng Hao 2,Lu Zening 3,Liao Yuying 2,Ma Dongxin 1,Yuan Jingzhi 1,Ge Qiang 1,Li Xun 1,Wang Xiaoye 1(1. College of Animal Science and Technology ,Guangxi University ,Nanning ,Guangxi 530004,China ;2. Veterinary Research Institute of Guangxi Zhuang Autonomous Region ,Nanjing ,Guangxi 530000,China ;3. Fisheries ,Animal Husbandry and V eterinary Station of Shuangqiao Township ,Nanning ,Guangxi 530104,China )Abstract :In 2019,in order to investigate the status of drug resistance and carrying virulence genes of porcine Klebsiella pneumoniae (K. pneumoniae ),125 anal swabs and 50 fresh pork samples were collected respectively from live and slaughtered pigs to analyze the characteristics of K. pneumoniae through isolation and culture of bacteria ,drug sensitivity test and amplification of 16S rRNA and the Khe ,drug resistance and virulence genes by PCR. The results showed that ,32 and 4 strains of K. pneumoniae were isolated respectively from anal swabs and fresh pork samples. 收稿日期:2021-02-07 修回日期:2021-04-16基金项目:国家现代农业产业体系广西肉鸡产业创新团队建设专项(nycytxgxcxtd );南宁市科学研究与技术 开发计划项目(20202106);崇左市科技计划项目(崇科FA 2019006);南宁市武鸣区科学研究与 技术开发项目(20190101)同等贡献作者:欧冠标,周雨晴通信作者:王晓晔。
马链球菌兽疫亚种可能的毒力基因的发现及分布的
开题报告
马链球菌(Streptococcus equi),又称骏马链球菌,是一种致人和马等草食动物呼吸道和皮肤感染的细菌。
兽疫亚种(Streptococcus equi subsp. equi)是其中的一种高毒力毒株,引起的疾病为马疽疮(strangles),常常导致马咽喉处的败血性淋巴结炎。
马链球菌兽疫亚
种具有很高的传染性和致死率,对于养殖马匹的健康和养殖业发展造成
了严重影响。
本研究旨在寻找马链球菌兽疫亚种可能的毒力基因,进而探究其分
布和作用机制。
通过对兽疫亚种进行基因组学分析、比较基因组学、转
录组学和代谢组学等方面的研究,筛选出与其毒力相关的基因。
首先,
对兽疫亚种和其它马链球菌亚种的基因组序列进行比较,寻找特异性基因。
其次,利用RNA测序技术(RNA-seq)对兽疫亚种和野生型菌株进
行转录组学分析,找出差异表达的基因。
最后,通过代谢物组学技术(metabolomics)对兽疫亚种和野生型菌株的代谢产物进行分析,鉴定
与兽疫毒力相关的代谢产物。
本研究的成果将有助于深入了解马链球菌兽疫亚种的毒力分子机制
和传播途径,为防控马链球菌兽疫亚种的流行提供科学依据和治疗方案。
大肠杆菌的毒力基因包括黏附素基因(K88、K99、987P、F41、F18)、毒素基因(Stx1、Stx2、Sta、Stb、LT)、溶血素(HylA)、HPI毒力岛(FyuA、irp2)和Lee毒力岛(eaeA)等。
其中,黏附素基因是介导细菌与靶细胞相结合的蛋白质,能够使细菌快速突破一道道屏障并直接感染机体。
毒素基因则分为不耐热肠毒素和耐热肠毒素,它们由位于质粒上的三种毒力基因编码。
另外,大肠杆菌在人的尿道、体液和血液中可使iroN的表达增强,UPEC536株的iroBCDEN基因簇定位于III毒力岛上,有研究者认为iroN可增强大肠杆菌苯磷二酚铁结合性复合物-肠菌素的铁摄取能力。
除此之外,还有气杆菌素、耶尔森菌强毒力岛等毒力因子。
以上内容仅供参考,如需更多信息,建议查阅相关文献或咨询专业人士。
金黄色葡萄球菌sasX、psm-mec、pvl三种毒力基因的检测与分析刘根焰;黄一宁;赵旺胜;糜祖煌;翁幸鐾【摘要】目的分析54株金黄色葡萄球菌的mecA基因与sasX、psm-mec、pvl 三种毒力基因分布及临床相关性.方法收集2013年1~5月南京医科大学第一附属医院临床分离的54株金黄色葡萄球菌,用PCR及测序的方法分析mecA、sasX、psm-mec、pvl 基因的携带情况,并结合患者的临床资料,探讨其临床相关性.结果54株金黄色葡萄球菌中有23株mecA基因检测阳性,31株mecA基因阴性.mecA基因阳性菌株较mecA基因阴性株体外药敏试验呈多重耐药表型.sasX基因阳性1株,阳性率为1.9%;psm-mec基因阳性10株,阳性率为18.5%;pvl基因阳性38株,阳性率为70.4%.mecA基因阳性菌株psm-mec基因阳性率显著高于mecA基因阴性菌株(P<0.01),pvl基因阳性率显著低于mecA基因阴性菌株(P <0.05).mecA基因和psm-mec基因与临床感染严重程度显著相关(P均<0.01).结论联合检测mecA、psm-mec和pvl基因有利于金黄色葡萄球菌感染的诊断、治疗和预后综合评估.【期刊名称】《临床检验杂志》【年(卷),期】2013(031)010【总页数】4页(P744-746,750)【关键词】金黄色葡萄球菌;mecA;sasX;psm-mec;pvl【作者】刘根焰;黄一宁;赵旺胜;糜祖煌;翁幸鐾【作者单位】南京医科大学第一附属医院检验学部,南京210029;南京医科大学第一附属医院检验学部,南京210029;南京医科大学第一附属医院检验学部,南京210029;无锡市克隆遗传技术研究所,江苏无锡214026;宁波市第一医院检验科,浙江宁波315010【正文语种】中文【中图分类】R446.5金黄色葡萄球菌(Staphylcoccus aureus, SA)的定植、感染和预后与其携带的毒力因子有关[1]。
毒力基因分类1. 介绍毒力基因是指一类能够导致生物产生毒性的基因。
这些基因通过编码特定的蛋白质或表达非编码RNA来产生毒性效应。
毒力基因在各种生物中广泛存在,包括细菌、真菌、植物和动物。
研究毒力基因的分类和功能可以帮助我们更好地理解生物体内的毒性机制,并为药物研发和农业防治提供重要参考。
2. 毒力基因分类方法2.1 按作用方式分类根据毒力基因的作用方式,可以将其分为以下几类:2.1.1 毒素基因毒素基因编码能够产生具有直接毒性效应的蛋白质,如细菌中的肉毒杆菌产生的肉毒杆菌神经毒素。
这类基因通常通过水平转移等方式在不同微生物之间传播。
2.1.2 抗性基因抗性基因编码能够使生物对特定化合物或环境条件具有耐受性的蛋白质。
例如,细菌中常见的抗生素抗性基因可以使细菌对抗生素产生耐药性。
2.1.3 凋亡基因凋亡基因编码能够调控细胞凋亡过程的蛋白质。
凋亡是一种程序性死亡方式,通过调节凋亡基因的表达可以控制细胞的生长和死亡。
2.2 按来源分类根据毒力基因的来源,可以将其分为以下几类:2.2.1 自身源毒力基因自身源毒力基因是指生物本身具有的毒力基因。
这类基因通常在生物体内发挥重要的生理功能,如植物中产生的毒素能够保护植物免受害虫和病原菌的侵袭。
2.2.2 外源源毒力基因外源源毒力基因是指从其他生物体中获取的毒力基因。
这类基因通常通过水平转移等方式在不同生物之间传播,对于接收者来说可能具有致命的影响。
3. 毒力基因研究应用3.1 药物研发研究毒力基因可以帮助我们理解药物的毒性机制,从而指导药物研发和使用。
通过研究毒力基因,可以预测药物在体内的代谢途径和副作用,从而提前筛选出具有潜在毒性的候选化合物。
3.2 农业防治农业中常见的害虫和病原菌往往通过释放毒力分子来攻击作物。
研究这些害虫和病原菌产生毒力的基因,可以帮助我们开发新的农药和抗病品种,提高农作物的抵抗力。
3.3 毒性评估对于一些潜在危险物质,如化学品和食品添加剂等,在上市前需要进行严格的毒性评估。
细菌毒力基因是指细菌体内编码产生毒力因子的基因。
这些基因可以使细菌对宿主产生伤害,导致感染和疾病的发生。
细菌毒力基因的分布是指这些基因在不同细菌中的存在情况。
细菌毒力基因的分布是非常广泛的,不同种类的细菌都可能具有不同的毒力基因。
一些细菌具有多个毒力基因,而另一些细菌可能只有少数或甚至没有毒力基因。
细菌毒力基因的分布受到多种因素的影响,包括细菌的种类、环境条件、宿主免疫系统的反应等。
一些细菌毒力基因是通过水平基因转移的方式在不同细菌之间传播的,这也是细菌毒力基因分布广泛的原因之一。
了解细菌毒力基因的分布对于研究细菌感染机制、开发抗菌药物和疫苗等具有重要意义。
科学家们通过对细菌毒力基因的研究,可以更好地理解细菌的致病机制,从而寻找治疗和预防感染的方法。