用Image J软件给图片加标尺
Set Scale 【设置像素数长度与实际长度的对应关系】设置比例尺
Scale Bar 【沿用Set Scale的比例关系和长度单位】加入标尺
P=aRM
a- 希望标注的实际尺寸大小（如100um）
P- 照片分辨率（尺寸的单位要和a一致）
M- 放大倍数
照片分辨率有的软件提取不正确，需要注意。
怎样确定像素与单位长度的比例关系
在照片上没有刻度的情况下，确定标尺长度与像素的关系你必须至少知道以下信息：
1. 拍摄照片时的实际放大倍率M。
2. 照片的分辨率R (像素/英寸）。
假设在R (像素/英寸）分辨率条件下照片上的标尺长度b(宏观的，毫米或厘米）代表实际大小a（微观的，微米或纳米），那么：M=b/a，
另外，标尺长度b是有P个像素组成的，那么R=P/b, =>P=aRM.根据以上的关系你可以给照片确定一个合适的标尺长度。
注意：计算的过程中量纲要一致。
老司机带你解锁ImageJ实用技巧（下）今天我们继续来聊一聊ImageJ的高阶使用技巧。
问题三、为什么总是全部圈起来的灰度值，有没有大神指导呢求助！本问题涉及免疫印迹（Western Blot）分析，提问者不能分别得到每个条带的值。
灰度值0为纯黑，255为纯白，灰度值与光密度值（OD值）的关系如下图所示：以灰度来统计WB条带的话，无条带的纯白255左右，条带越黑着色越深灰度值反而越小，这与我们的认知不符。
步骤：1. File -> Open -> 打开需要分析的WB条带。
2. Image –> Type -> 8-bit, 将图像转换为8-bit的灰度图片；Image-> Invert，黑白反转，得到如下图片：3. Analyze -> Calibrate, 校正光密度值Function中选择Uncalibrated OD，左下方Global calibration，勾选表示有多张图片打开时对所有图片进行此操作。
否则只对当前图片进行此操作。
4. 在工具栏中选择矩形工具——Rectangular, 最左边的为矩形工具，选择条带：键盘上按数字1，弹出如下提示框：点Yes，键盘上按数字3，得到如下：5. 工具栏中选择直线工具——Straight，下图最右边的为直线工具，按住Shift键使用直线工具画竖线将步骤4的峰进行分割：6. 选择魔棒工具——Wand tool，分别点击分割好的峰，即可得到结果，保存结果（File -> Save as…）即可：7. WB统计分析一般将对照组标准化为100%或1，上述结果6个条带前3个为对照组。
在Excel中，先计算对照组3个的平均值（AVERAGE(B2:B4)）：然后所有B列的数值除以对照组平均值，此时对照组的均值为1：8. 将所得数据放入Graphpad prism绘图即可：拓展：弯曲的WB条带应如何使用ImageJ拉直？1. 使用Segmented line沿着倾斜条带画间断线段：2. 双击Segmented line，设置线段的宽度至包含所有条带：3. 点击菜单栏Edit -> Selection-> Straighten，倾斜的WB条带即可拉直：问题四、如何统计SEM图片小球数量？步骤：1. 打开ImageJ软件，File -> Open打开SEM图片。
ImageJ在荧光照⽚分析中的应⽤Image J在显微成像中的应⽤介绍1、关于Image JImageJ是⼀个基于java的公共的图像处理软件，它是由National Institutes of Health 开发的。
可运⾏于Microsoft Windows，Mac OS，Mac OS X，Linux，和Sharp Zaurus PDA等多种平台。
其基于java 的特点，使得它编写的程序能以applet等⽅式分发。
ImageJ能够显⽰，编辑，分析，处理，保存，打印8 位，16 位，32 位的图⽚，⽀持TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多种格式。
ImageJ ⽀持图像栈（stack）功能，即在⼀个窗⼝⾥以多线程的形式层叠多个图像，并⾏处理。
只要内存允许，ImageJ 能打开任意多的图像进⾏处理。
除了基本的图像操作，⽐如缩放，旋转，扭曲，平滑处理外，ImageJ还能进⾏图⽚的区域和像素统计，间距，⾓度计算，能创建柱状图和剖⾯图，进⾏傅⾥叶变换。
下载地址：/doc/faf455ab83d049649a665816.html /ij/download.html2、Image 界⾯界⾯分为：菜单栏，⼯具栏和状态栏。
菜单栏菜单栏从左⾄右分别是：⽂件，编辑，图形，处理，分析，插件，窗⼝，帮助。
⽂件和office word 等软件类似，主要有⽂件打开，关闭，保存等功能，⽐较特殊的⼀个功能是恢复功能（revert），可以直接回到上次保存过的状态。
由于编辑菜单⾥的取消功能（undo）只能回退⼀步，所以revert 有时会很有帮助。
编辑Undo, Cut, Copy, Copy to system, Paste, Paste Control.., Clear, Clear Outside, Fill, Draw, Invert, Selection, Options.图像Type（可改变图⽚格式，如彩⾊变灰度）, Adjust, Show info, Properties, Color, Stacks, Hyperstacks, Crop, Duplicate.., Rename, Scale, Transform, Zoom, Overlay, Lookup Tables.处理Smooth, Sharpen, Find Edges, Find Maxima, Enhance Contrast, Noise, Shadows, Binary, Math, FFT, Filters, Batch, Image calculator, Subtract Backgroud, Repeat Command.分析Measure, Analyze Particles, Summarize, Distibution, Label, Clear Results, Set measurements, Set Scale, Calibrate, Histogram, Plot Profile, Surface Plot, Gels, Tools.窗⼝和帮助⼯具栏⼯具栏从左⾄右分别是4种区域选择⼯具，直线选择⼯具，⾓度⼯具，点⼯具，魔棒，⽂字，放⼤镜，拖⼿，颜⾊吸管，动作宏，菜单宏，绘图⼯具等（颜⾊吸管以后的内容可以变化，通过点击最右边的>> 按钮选择需要的栏⽬。
用Image J软件给图片加标尺
Image J是着名的免费图像分析软件。
首先打开图片（点击图1中Open按钮）
图1
然后点击图2中set scale设置相关参数。
图2
原图片实际像素及大小用Photoshop中看出（图3所示）。
像素为1360×1024，大小为23.99×18.06 cm。
由于对拍摄实物进行了640倍放大，计算出1360像素对应拍摄实物的长度为（23.99×10000/640μm）。
然后计算一个像素对应长度。
如图4所示设置参数，设置参数为3.60像素对应1.00微米,然后点上Global，有效数字与图4中相同，点OK。
具体数据仔细计算后得到，这里只是简单说明。
图3
图4
然后点击图5所示，设置标尺格式。
图5
图6表示设定参数后最终所得效果，可以随心设定标尺长度，颜色，字体大小，位置等，点OK确定。
然后按图7另存为想要的格式（一般Jpeg或Tiff即可）就可。
图6
图7。
