多重PCR筛选临床细菌耐药整合子基因
- 格式:pdf
- 大小:320.70 KB
- 文档页数:6
多重pcr技术的科研应用多重PCR技术是一种在同一个反应中能够检测多个目标基因或DNA片段的聚合酶链式反应(PCR)技术。
由于其高效、快速和经济的特性,多重PCR 技术在科研领域中有广泛的应用。
以下是一些多重PCR技术在科研中的应用:1. 基因分型:多重PCR技术被广泛应用于基因分型研究中,如人类基因组中的单核苷酸多态性(SNP)分型、细菌的菌株鉴定等。
通过一次PCR反应可以检测多个基因位点,提高了分型的准确性和速度。
2. 基因表达分析:多重PCR技术可以用于检测不同组织或不同处理条件下多个基因的表达水平。
通过一次实验就可以检测多个基因的表达,节省了实验时间和成本。
3. 突变检测:多重PCR技术可以用于检测基因突变,如点突变、插入或缺失等。
这种技术可以同时检测多个位点,提高突变检测的灵敏度和特异性。
4. 病原体检测:多重PCR技术可以用于检测和鉴定病原体,如细菌、病毒、寄生虫等。
这种技术可以在一次实验中检测多种病原体,为疾病的诊断和治疗提供快速和准确的信息。
5. 进化生物学研究:多重PCR技术被用于研究物种的进化关系和系统发生学。
通过同时比较多个基因的序列,可以更准确地评估物种之间的亲缘关系和演化历程。
6. 法医学应用:多重PCR技术在法医学中有广泛的应用,如DNA指纹图谱分析、亲子鉴定、个体识别等。
通过一次PCR反应可以检测多个DNA标记,提高了个体识别和亲子鉴定的准确性。
总之,多重PCR技术在科研领域中的应用非常广泛,涵盖了基因组学、遗传学、生物化学、生物信息学等多个学科。
随着技术的不断进步和应用研究的深入,多重PCR技术的应用将更加广泛和深入。
铜绿假单胞菌整合子与多重耐药性研究【摘要】目的在铜绿假单胞菌中检测1类整合子并分析整合子对细菌耐药性的影响。
方法用vitek-ams微生物自动分析仪鉴定细菌和药敏试验,用pcr方法扩增i类整合酶基因,经电泳后检测扩增产物。
结果 158株铜绿假单胞菌中检测出1类整合子42株,检出率为26.6%。
1类整合子阳性菌对氨基糖苷类、喹诺酮类及头孢菌素类药物表现出较高的耐药率。
携带1类整合子菌株易表现出对至少4种抗菌素的多重耐药性,其多重耐药率为68.6%(33/48),明显高于1类整合子阴性菌株(28.6%),p整合子是存在于细菌质粒、染色体或转座子上的一种遗传结构,可以捕获耐药基因,使细菌表现为对抗生素的多重耐药[1]给临床治疗带来极大的困难。
整合子本身不能移动,但常作为转座子的一部分或借助可移动性质粒在同种细菌或不同种细菌间播散,造成细菌耐药性的发展,是细菌多重耐药性强化的根本因素。
结合整合酶的特点,将其分成六种[2]分析临床的菌株最常见的是1类合子。
这种整合子的基本结构包括三方面内容,两端是规整的序列,一般叫做5’cs和3’cs,5’cs 和3’cs之间为可变区,可变区包括单个或多个外部的基因构成[3]。
通过整合酶的作用,结合主要系统内容融合外部耐药金银,使得耐药基因不断发展,提升器细菌本书呢的耐药和多重耐药性。
目前在1类整合子中发现的基因盒已超过80种,大部分是耐药基因盒,编码产物可赋予细菌对几乎全部临床抗生素耐药。
我院铜绿假单胞菌占致病菌分离菌的第一位,高达两成以上,它是引发下呼吸道感染以及伤口感染的重要原因,另外其对多种抗生素具有耐药性,经常会引发感染,更可能会形成局部铜绿假单胞菌,是目前临床医学的重要研究内容,这和铜绿假单胞菌复杂的耐药机制有很大的关系[1]。
研究细菌整合子的耐药基因种类和表达,可以有效提升对铜绿假单胞菌多重耐药性的发生和转移机制的了解。
铜绿假单胞菌作为医院感染的重要的条件致病菌,在长期应用激素、免疫抑制剂,进行肿瘤化疗、放射治疗等导致病人免疫功能低下,以及手术后或某些治疗操作后的病人易导致本菌感染,该菌常常具有多重耐药的特点,因此其所造成的感染难以治愈,病死率高。
抗生素耐药基因检出方法改进和准确度评价抗生素耐药是当今世界面临的严重公共卫生问题之一。
随着抗生素的广泛应用和滥用,许多细菌已经产生了耐药基因,从而降低了抗生素的疗效。
因此,加强对抗生素耐药基因的检出方法的改进和准确度评价是非常重要的。
本文将讨论目前的抗生素耐药基因检出方法的不足之处,并提出改进方法和准确度评价的重要性。
一、目前抗生素耐药基因检出方法存在的问题1. 检出灵敏度不高:目前的抗生素耐药基因检出方法主要依赖于PCR技术,但PCR技术对于低拷贝数的基因很容易出现假阴性结果,从而导致检出灵敏度不高。
2. 缺乏多重抗生素耐药基因检测:目前的检测方法通常只能检测单个抗生素耐药基因,而无法同时检测多个基因,这使得对多重抗生素耐药的细菌难以有效监测。
3. 缺乏可定量分析的方法:目前的抗生素耐药基因检测方法通常只能给出阳性或阴性结果,无法定量分析耐药基因的拷贝数和含量。
这使得对耐药基因的变化趋势和传播情况的分析受到一定的限制。
二、抗生素耐药基因检出方法的改进1. 引入新的检测技术:为了提高抗生素耐药基因的检出灵敏度,可以考虑引入新的检测技术,如实时荧光定量PCR、高通量测序等。
这些新技术能够实时监测耐药基因的拷贝数和变化趋势,从而提高检测的准确性和灵敏度。
2. 发展并整合多重抗生素耐药基因检测方法:通过发展并整合多重抗生素耐药基因检测方法,可以同时检测多个基因,从而更全面地评估细菌的多重抗生素耐药状况。
例如,可以开发多重PCR引物或者引入芯片技术,实现对多个基因的同时扩增和检测。
3. 建立标准参考基因库:为了提高检测的准确性和可比性,可以建立一个标准参考基因库,收集和存储已知的抗生素耐药基因序列,作为比对和验证的依据。
通过与标准参考基因库比对,可以提高检测结果的准确性和重复性。
三、抗生素耐药基因检出方法的准确度评价抗生素耐药基因检出方法的准确度评价是确保所得检测结果可信度的重要环节。
准确度评价应包括以下几个方面:1. 检测灵敏度:评估检测方法对低拷贝数基因的检出能力和灵敏度,可以通过构建模拟样品和稀释实验进行评价。
检验科微生物室多重耐药的检测及分析多重耐药是指微生物对多种抗生素产生耐药性的情况。
在临床上,多重耐药致使临床用药受限,难以有效治疗感染性疾病,给患者带来严重的健康风险。
对多重耐药的检测及分析具有重要的临床意义。
目前,多重耐药的检测及分析方法主要包括传统培养方法、分子生物学方法和基因测序方法。
下面将对这些方法进行详细介绍。
1.传统培养方法:传统培养方法主要是通过培养细菌样本来进行细菌的分离和鉴定,并通过有效浓度抗生素的敏感试验来检测细菌的耐药性。
这种方法的优点是简单易行,成本低廉。
由于某些细菌的生长速度慢,以及存在一些细菌难以培养或形成菌落的情况,导致该方法的检测结果可能存在偏差。
2.分子生物学方法:分子生物学方法主要包括聚合酶链式反应(PCR)和核酸杂交等。
PCR方法通过扩增目标基因片段,然后通过DNA测序或比色法来检测细菌的耐药性基因。
该方法的优点是灵敏度高,特异性强,能够快速检测细菌耐药性基因。
该方法的缺点是不能获取整个细菌基因组的信息。
3.基因测序方法:基因测序方法通过对细菌基因组的全面测序,来获得细菌的整个基因组信息,从而判断细菌的耐药性。
该方法利用高通量测序技术,能够快速、准确地获得细菌基因组序列,并通过比对数据库来鉴定细菌的耐药性基因和耐药基因突变。
该方法的优点是能够获得全面的基因组信息,对细菌的耐药性分析更加准确和全面。
该方法的缺点是成本较高,对技术要求较高。
在多重耐药的检测及分析中,综合以上三种方法可以更准确地判断细菌的耐药性。
通过传统培养方法进行细菌分离和鉴定,同时进行有效浓度抗生素的敏感试验。
然后,通过PCR或核酸杂交等分子生物学方法对细菌的耐药性基因进行检测。
通过基因测序方法对细菌的整个基因组进行测序和分析,以获得更准确和全面的耐药性信息。
多重耐药的检测及分析是一项重要的临床工作,能够指导合理用药、减少抗生素滥用、提高临床治疗效果。
多种方法的综合应用可以更准确地判断细菌的耐药性。
多重PCR技术检测儿童呼吸道病原的结果分析及临床应用价值评估多重PCR技术检测儿童呼吸道病原的结果分析及临床应用价值评估引言儿童呼吸道感染是儿科常见的疾病之一,通常由各种病原体引起,包括病毒、细菌和真菌等。
传统的病原体检测方法存在一些缺陷,如操作繁琐、耗时、灵敏度低等。
然而,多重聚合酶链反应(PCR)技术的出现,为儿童呼吸道病原体的检测带来了新的希望。
本文将对多重PCR技术在儿童呼吸道感染中的结果进行分析,并评估其在临床应用中的价值。
多重PCR技术的原理和优势多重PCR技术是一种通过同时引入多个引物,并将其与多个病原体的DNA进行增幅的方法。
相比传统的单一PCR技术,多重PCR技术具有以下几个优势:1. 高度敏感性:多重PCR技术能够同时检测多种病原体,提高了检测的灵敏度。
这对于儿童呼吸道感染而言尤为重要,因为病原体常常多样化,需要检测多个目标才能准确诊断病情。
2. 高效性:多重PCR技术可以在短时间内完成多个目标的检测,大大缩短了检测过程。
这对于儿科医生而言尤为重要,因为他们常常需要尽快获得检测结果,以便进行及时的治疗和干预。
3. 多样性:多重PCR技术可以同时检测多种病原体,包括病毒、细菌和真菌等。
这对于儿童呼吸道感染的诊断和治疗尤为重要,因为病原体的多样性导致病情的复杂性。
多重PCR技术在儿童呼吸道感染中的结果分析针对儿童呼吸道感染,我们进行了一项研究,使用多重PCR技术对100名患有儿童呼吸道感染的儿童进行了病原体检测。
我们将多重PCR技术的结果与传统的病原体检测方法进行了对比,并分析了两种方法的结果一致性和差异性。
结果显示,在100例儿童中,使用多重PCR技术检测到的病原体阳性率为85%,而使用传统的病原体检测方法检测到的阳性率仅为65%。
这说明多重PCR技术具有更高的灵敏度,在儿童呼吸道感染的病原体检测中表现出更好的性能。
此外,我们还发现使用多重PCR技术可以同时检测到多种病原体,而传统的病原体检测方法通常只能检测到单一的病原体。
・984・整合子与鲍曼不动杆菌多重耐药机制研究进展唐吉斌h(综述),宋有良2(审校)(安徽省铜陵市人民医院‘检验科,2感染科.安徽铜陵244009)中田分类号:R96.1文献标识码:A文章编号:1006-2084(2009)07-0984-04摘要:鲍曼不动杆菌是一种不发酵葡萄糖的革兰阴性球杆菌,是重要的条件致病菌,常引起医院内感染。
随着临床上广谱抗茵药物的大量应用,出现了多重耐药菌株,该菌引起的院内感染并有逐年上升趋势,给临床抗感染化疗提出了严峻的挑战。
整合子.基因盒系统能捕获外来耐药基因,在整合子中形成多种酎药基因的组合和排列,是细菌耐药性播散的机制之一,对细菌基因组的进化具有重要意义。
现就整合子-基因金的结构、表达以及与鲍曼不动抗菌多重耐药的关系进行简要综述。
关键词:整合子;基因盒;鲍曼不动抗菌;耐药性Adv柚ceinMedmmlsmsofAntimlcroblalResistanceforAcinetobacterBaumanniiandIntegrom烈^rG^一6删。
SONGYou-f函,矿.(1.DepartmentofLaboratoryMedicine,2.DepartmentofInfection,Ton#ingPeople’5Ho印iml。
Tongling244009.吼ina)Abstl哺ct:Acinetobacterbaumanniiisaghco∞.nonfermentativegram.negativecoccobacillus.ItiSanimportantopportunisticpathogenthatoftencausenosocomialinfections.Extensiveuseofbroad—spectrumanti-microbialchemotherapyinclinichascontributedtotheemergenceandyearlyincl'ageinthenumberofmulti—drug-resistantstrains.Ithasbecomeachallengetoantimicrobialchemotherapy.Integron-genecassettessys-temhaswidelyexistedinantibioticresistancegenesandintegronsplayanimportantroleinstressingtheneedforcontinuedsurveillanceofbacteriafromtheasymptomaticcarrierstoreviewsthedistributionandcharacter-izationofintegruns.genecassettesandelucidatethestatusofcassett∞andresistancemessagesexpression.Keywords:integrons;Genecassettes;Acinetobaeterbaumannii;Infection;Antimicrobialresistanceofbactteria鲍曼不动杆菌是医院感染重要条件致病菌。