WesternBlot(个人版)

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WesternBlot(个人版)

Western Blot 实验方法

一蛋白提取

1、切取组织,置于已经用记号笔标记好的EP管底,称重(mg)插入冰盒中,注意不同样品间所用剪刀、刀片、镊子等要擦拭干净。

2、配置裂解液:980ulRiPA+10ul10%PMSF+10ul蛋白酶抑制剂混匀机混匀。

3、每EP管中加裂解液(10ul/1mg),超声(time --pulse--AMPL- -start--O)5s停5s循环1min ,振幅25%(AMPL参数),再裂解30min 。

4、于40C冷冻离心机中预冷15min,1200r/min.将裂解后的组织液离心15min,取上清即为所提蛋白,至于一个试管内,用酶标仪测浓度,再高温变性,再上样,多余的试剂置-80℃保存。

5、用玻璃小烧杯配制定量用的试剂:(2mlH2O+500ul考马斯亮蓝)+36ulH2O+4ul 样品,另加一个标准品BSA(10ul/ml)对照组,一个空白对照组。

6、(4倍)上样缓冲液稀释成(1倍),即:30ul上清液+10ul(4倍)上样缓冲液(红色的,购买的),震荡混合+离心,高温振荡机中变性,950C,5min,注意使离心液全部流于底部,准备跑电泳。

7、测595nm吸光度,打开盖预热30min,每次都将空白校正0,读取标准品对照组,样品组的吸光度,尽快。比色皿水洗+酒精洗。

8、建Excel:

(一)Cx=Ax/A标。C标(C标=10ug/ml ,由30ul稀释至40ul,

A标已经知道的)

(二)一般上样量为:30ug, 故: 30ug上样量/(0.75Cx)=V上样(ml)由(一)(二),得:V上样=A标/Ax .4

二配胶

1、提前配板:洗板,吹干,对齐,夹紧(向下压),配分离胶(两块板10ml),灌胶,压水,观察是否漏液,出现分界面,配浓缩胶(两块板4ml),若温度太低不易凝,可将分离胶中10%APS,TEMED同时加倍促凝.将配胶用烧杯洗净干燥,配胶:

10%分离胶5%浓缩胶

10ml(两快板) 15ml(三快板) 4ml (l两块板) 6ml(三块板) H2O

4.0ml 5.9ml 2.7ml 4.1 ml 30%丙稀酰胺 3.3ml 5ml 670ul 1.0

Tris-HCL 2.5ml(1.5M,Ph8.8)3.8ml 0.50ml(1.0M,Ph6.8)0.75ml 10%SDS 100μl 150ul 40μl60ul

10%APS(聚合剂,现配,灌胶前加入)100μl 150ul 40μl60ul

TEMED(加速剂,灌胶前加入)4μl 6ul 4μl6ul

2、根据板子数计算所需胶的体积数,根据比例配制胶液,为铺胶平整下层胶铺好后立即UP水封,待胶干后倒去上层UP水并用滤纸吸干,按比例配制浓缩胶(积压胶),最后上梳子(注意孔数、厚度与玻璃板搭配);补液。

3、制好胶的玻璃板,仔细观察可以看到一条水平的折线,如若不用,浸泡在电泳液里。

三上样及电泳

1、电泳液的配制:up水(1000ml),tris(3.03g),甘氨酸(18.8g),SDS (1.0g).

2、将两块配好胶的玻璃板薄面相对,夹好(注意对齐,防止漏液),中间倒入电泳液(注意拿错电泳架,分为:有电机的和无电极的),一般两块板的电泳液加到下面的线下面,四块板就加到上面线的刻度下。

3、若电泳液不渗漏,即可拔去梳子(注意两边同时用力,平整拔出)。

4、按上样量点样,每块板子第一孔为Mark(上样量为8-10ul),后面为样品,不用样品间换枪头。

5、将点好样的胶板放入电泳槽,槽内加适量电泳液,注意正负极连接.

6、打开开关,调整电压(80V)、电流(250mA)时间(30min),开始电泳,结束后,调节电压(110V)、时间(60min)。 四转膜

1、转膜液的配制:up水(800ml),tris(3.03g),甘氨酸(14.4g)于40C置于冰箱,用时加甲醇200ml(20%)搅拌混匀。(记得用的时候要加啊)

2、按海绵大小剪滤纸(上下共8张)、NC膜,放在电泳槽内,使之与转膜液充分浸泡.

3、将转膜夹打开,透明面(正极)朝下,上面依次放置:海绵、滤纸(4张)、NC膜、胶带、滤纸(4张)、海绵(胶带与膜之间不要有气泡),然后将黑色面压下,夹好,注意NC膜一直要保持湿润。

4、电泳完毕后,将玻璃板拆卸下来,薄板和厚板分离(小心避免撬碎玻璃板);将带有胶的板子下方衬白色滤纸,读出Mark标记,用绿色小平板撬开玻璃板,将浓缩胶去除,将分离胶切去左上角以标记正反面,将胶放入平皿,平衡30min;根据标记切胶(切割时注意水平),选取含有目的蛋白的胶条(ASIC蛋白分子量72,为兔抗。Actin作内参考43,为鼠抗),切好的蛋白胶条放在转膜液里浸泡一下以减小表面张力,铺胶带时,注意条带的左右顺序,用圆珠笔标记。

5、放入4℃冰箱,连接电极,黑对黑,红对红,打开电源,调整电压(300V)、时间(1.5h),开始转膜。(总蛋白:100-130,40-55)

六封闭

1、配制TBST缓冲液:UP水(996ml),NacL(8.5g),Tris(6.057g),用盐酸调Ph 值至7.5-7.6(4管0.9mlHcl),最后加Tween20(500ml),注意 Tween20粘稠,将枪头去尖嘴后吸取。

2、配制封闭液:一般配制的是BSA(5%):40mlTBST+2.0gBSA,

置于塑料器皿或半个牛奶盒中,于摇床摇匀1.0小时。

3、一抗孵育:

(1)1%的BSA配制:称取0.04gBSA加到装有4mlTBST溶液的4ml小管中。(2)配制一抗缓冲液配制1%的脱脂奶粉与TBST液中(W/V),按1:200稀释ASICI 抗体。(本实验室:1%的BSA:一抗=4ml:1ul,一般每条带2ml).(具体见抗体说明书) (2)用压塑机做塑料袋(先封住相邻两边,每边封两道防漏,尽量撑展),将膜取出移入塑料袋中,标记,正面向上。然后再封住一边,加入一抗缓冲液5ml,排气泡,封最后一边;放在4℃冰箱的摇床上摇动(正面朝上,尽量用最快速度),过夜(一般大于18小时)。

(3)剪开塑料袋,将膜取出放入皿中用一定量的TBST洗膜,10min×3次,一抗回收,放入冰箱。

4、二抗孵育:

(1)1%的BSA配制:称取0.04gBSA加到装有4mlBTST溶液的4ml小管中。(4)二抗缓冲液的配制:配制1%的脱脂奶粉与TBST液中(W/V),稀释HRP标记的二抗(GLU用兔抗:1:3000,β-actin用鼠抗:1:3000)(本实验室:1%的BSA:二抗=4ml:1ul,一般每条带2ml).(具体见抗体说明书)

(2)用压塑机做塑料袋(先封住相邻两边,每边封两道防漏,尽量撑展),将膜取出移入塑料袋中,标记,正面向上。然后再封住一边,加入二抗缓冲液5ml,排气泡,封最后一边;放在摇床上摇动1.0小时(正面朝上,尽量用最快速度)。(3)剪开塑料袋,将膜取出放入皿中用一定量的TBST洗膜,10min×3次。

七化学发光检测

1、取出化学发光试剂盒(4℃避光保存),在开启之前平衡至室温。黑白瓶各取2ml,共4ml(要求的体积是膜面积×0.125ml),吹打混匀。垫保鲜膜,将膜正面朝上置于保鲜膜上,加2ml混合的检测试剂于膜上,饭盒盖盖住,室温孵育5min;吸掉发光液,放入化学发光仪(Omega 16ic)内检测:化学发光曝光10-15min。

2、将Western Blot产物进行条带灰度分析,用Gel-Pro

Analyzer专业分析软件读取IOD值。以目的蛋白的IOD值/内参的IOD值半定量蛋白的水平。结果进行方差分析,以P<0.05为具有统计学意义。

Western Blot实验

成功完成Western Blot检测,必须满足4个条件:(1)凝胶洗脱:转移期间蛋白质必须从凝胶中洗脱出来,如果蛋白质还截留在凝胶中,将无法在膜上进行分析(2)吸附到膜上:在转移过程中蛋白质必须吸附到膜上,如果蛋白不吸附,将无法在膜上进行分析(3)处理期间仍截留在膜上:在转移后的处理过程中蛋白质必须保持吸附在印迹膜上(4)处理过程中可接近:被吸附的蛋白质必须能够与检测试剂接触,如果蛋白质被掩盖则无法检测成功进行WB检测,则设置合适正确的对照是必不可少的,只要正确设置了这些对照,即可快速和准确的找到WB的问题所在,并保证实验结果的准确性和特异性!一般需要设置的对照如下:

阳性对照:明确表达检测蛋白的组织或细胞,用于检测抗体的工作效率

阴性对照:明确不表达检测蛋白组织或细胞,用于检测抗体的特异性

二抗对照:不加一抗,用于检测二抗的特异性

内参对照:检测标本的质量和二抗系统

空白对照:不加一抗和二抗;用于检测膜的性质和封闭的效果

WB检测基本过程

1、获取细胞或组织裂解物

1)根据检测蛋白的位置选择合适的裂解buffer:

蛋白位置推荐buffer

全细胞NP-40 or RIPA

胞浆(可溶性蛋白)Tris-HCl

胞浆(骨架结合蛋白)Tris-Triton

膜蛋白NP-40 or RIPA

核蛋白RIPA or 核蛋白提取试剂盒

线粒体蛋白RIPA or 线粒体分离试剂盒

亦可购买商业化的蛋白提取试剂盒来保证标本制备的质量

2)选择合适的蛋白酶抑制剂,避免蛋白降解,从而保证检测的准确性!

2、蛋白定量

常用的蛋白定量方法:Bradford assay, Lowry assay 或BCA assay。定量后,可根据情况将标本保存在-20°C /-80°C备用,进行免疫沉淀(IP)或者直接进行电泳分离蛋白

3、电泳分离蛋白质

根据待测蛋白状态确定电泳条件:

待测蛋白状态凝胶条件上样buffer 电泳buffer Reduced -

Denatured 还原,变性含β-巯基乙醇或DTT,含SDS 含SDS

Reduced - Native 还原,不变性含β-巯基乙醇或DTT,不含SDS 不含SDS Oxidized - Denatured 不还原,变性不含β-巯基乙醇或DTT,含SDS 含SDS Oxidized - Native 不还原,不变性不含β-巯基乙醇或DTT,不含

不含SDS

SDS

根据待测蛋白分子量大小确定凝胶浓度

蛋白分子量(kDa)凝胶浓度(%)

4-40 20

12-45 15

10-70 12.5

15-100 10

25-200 8

4、转膜

根据不同的检测目的和待测蛋白的特性,选择合适的膜类型。常用的转移膜类型有:PVDF膜、硝酸纤维素膜(NC膜)和尼龙膜,其中PVDF和NC膜的使用频率最高。各种膜的技术参数及比较如下:

PVDF膜NC膜尼龙膜

灵敏度和分辨率高高高

背景低低较高

蛋白结合能力100-200ug/cm2(适用于SDS存在

时与蛋白结合)

80-100ug/cm2 >400ug/cm2

机械强度强干的膜易脆软而结实