第八章 真核生物基因表达调控
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第七章基因的表达与调控(下)——真核基因表达调控的一般规律重点:1. 真核生物的基因结构与转录活性2. 真核基因的转录3. 真核基因转录调控的主要模式难点:1. 真核生物的基因结构与转录活性2. 真核基因的转录3. 反式作用因子4. 真核基因转录调控的主要模式课时分配:8学时真核生物和原核生物在基因表达调控的巨大差别是有两者基本生活方式不同所决定的。
原核生物一般为自由生活的单细胞,只要条件合适,养料供应充分,它们就能无限生长、分裂。
因此,它们的调控系统就是要在一个特定的环境中为细胞创造高速生长的基础,或使细胞在受到损伤时,尽快得到修复。
它们主要通过转录调控,以开启或关闭某些基因的表达来适应环境条件。
环境因子往往是调控的诱导物,群体中每个细胞对环境的反应都是直接和基本一致的。
真核生物主要由多细胞组成,每个真核细胞所携带的基因数量及总基因组中蕴藏的遗传信息量都大大高于原核生物。
真核生物基因组DNA中有许多重复序列,基因内部还常插入不翻译成蛋白质的序列,都影响了真核基因的表达。
真核生物的DNA还常与蛋白质(包括组蛋白和非组蛋白)结合,形成十分复杂的染色质结构。
染色质构象的变化,染色质中蛋白质的变化及染色质对DNA酶敏感程度的变化等都会对基因表达产生重要影响。
此外,真核生物染色质被包裹在细胞核内,基因的转录和翻译被核膜所隔开,核内RNA的合成与转运,细胞质中RNA的剪接和加工等无不扩大了真核生物基因调控的范围,使真核生物基因调控达到了原核生物所不可能拥有的深度和广度。
对大多数真核生物来说,基因表达调控最明显特征是能在特定的时间和特定的细胞中激活特定的基因,从而实现“预定”的、有序的、不可逆转的分化、发育过程,并使生物的组织和器官保持正常功能。
1. 真核生物基因表达调控与原核不同点在于:(1)转录激活与染色体转录区特定结构相适应(2)正性调节占主导(3)转录与翻译在空间上的分离(4)更多、更复杂的调控蛋白真核生物基因表达调控可分为两大类,第一类是瞬时调控或称为可逆性调控,它相当于原核细胞对环境条件的变化所作出的反应,包括某种底物或激素水平升降时,或细胞周期不同阶段中酶活性的调节;第二类是发育调控或称为不可逆性调控,是真核基因调控的精髓部分他决定了真核细胞生长、分化、发育的全部进程。
第十章作业1. 简述真核生物基因表达调控的7个层次。
①染色体和染色质水平上的结构变化与基因活化②转录水平上的调控,包括基因的开与关,转录效率的高与低③RNA加工水平的调控,包括对出事转录产物的特异性剪接、修饰、编辑等。
④转录后加工产物在从细胞核向细胞质转运过程中所受到的调控⑤在翻译水平上的控制,即对哪一种mRNA结合核糖体进行翻译的选择以及蛋白质成量的控制⑥对蛋白质合成后选择性地被激活的控制,蛋白质和酶分子水平上的剪接等的控制⑦对mRNA选择性降解的调控2. 真核基因表达调控与原核生物相比有何异同?相同点:①与原核基因的调控一样,真核基因表达调控也有转录水平调控和转录后水平的调控,并且也以转录水平调控为最重要;②在真核结构基因的上游和下游(甚至内部)也存在着许多特异的调控成分,并依靠特异蛋白因子与这些调控成分的结合与否调控基因的转录。
不同点:①原核细胞的染色质是裸露的DNA,而真核细胞染色质则是由DNA与组蛋白紧密结合形成的核小体。
②在原核基因转录的调控中,既有激活物参与的正调控,也有阻遏物参与的负调控,二者同等重要。
③原核基因的转录和翻译通常是相互偶联的,即在转录尚未完成之前翻译便已开始。
④真核生物大都为多细胞生物,在个体发育过程中发生细胞分化后,不同细胞的功能不同,基因表达的情况也就不一样,某些基因仅特异地在某种细胞中表达,称为细胞特异性或组织特异性表达,因而具有调控这种特异性表达的机制。
3. DNA 甲基化对基因表达的调控机制。
甲基化抑制基因转录的机制:DNA甲基化会导致某些区域DNA构象改变,包括甲基化后染色质对于核酸酶或限制性内切酶的敏感度下降,更容易与组蛋白H1相结合,DNaseⅠ超敏感位点丢失,使染色质高度螺旋化, 凝缩成团, 直接影响了转录因子与启动区DNA的结合效率的结合活性,不能启始基因转录。
DNA的甲基化不利于模板与RNA聚合酶的结合,降低了转录活性。
4. 转录因子结合DNA的结构基序(结构域)有哪几类?①螺旋-转折-螺旋②锌指结构③碱性-亮氨酸拉链④碱性-螺旋-环-螺旋5. 真核基因转调控中有几种方式能够置换核小体?①占先模式:可以解释转录时染色质结构的变化。
真核⽣物基因表达的调控课次:19教案⽬的:使学⽣了解真核基因表达调控的特点、转录前的调控,掌握增强⼦的作⽤特点和反式作⽤因⼦的DNA结合域的结构花式。
重点:增强⼦和反式作⽤因⼦的DNA结合域的结构花式。
难点:反式作⽤因⼦的DNA结合域的结构花式。
复习旧课:提问2⼈,了解教案效果。
导⼊新课:第⼋章真核⽣物基因表达的调控第⼀节概述真核⽣物细胞中由核膜将核和细胞质分隔开,转录和翻译并不偶联;基困组是由多条染⾊体组成。
真核基因的调节分为:真核基因表达调控的特点:第⼆节转录前的调控⼀. DNA的甲基化与去甲基化真核DNA中的胞嘧啶约有5%被甲基化为5-甲基胞嘧啶(5-methylcytidine,m5C>,⽽活跃转录的DNA段落中胞嘧啶甲基化程度常较低。
b5E2RGbCAP甲基化可使基因失活,去甲基化⼜可使基因恢复活性。
⼆染⾊质结构对真核基因转录的调控1.染⾊质结构影响基因转录常染⾊质中的基因可以转录,异染⾊质(heterochromatin>,⽆基因转录表达。
2. 组蛋⽩的作⽤组蛋⽩扮演了⾮特异性阻遏蛋⽩的作⽤,⾮组蛋⽩成分起到特异性的去阻遏促转录作⽤。
核⼩体结构影响基因转录。
三基因重排和基因扩增对基因表达的影响基因重排(gene rearrangement>,即原胚性基因组中某些基因会再组合变化形成第⼆级基因。
p1EanqFDPw基因扩增(gene amplification>,即基因组中的特定段落在某些情况下会复制产⽣许多拷贝。
DXDiTa9E3d基因丢失:在细胞分化过程中,丢掉某些基因⽽去除其活性。
例如某些原⽣动物,线⾍、昆⾍、甲壳类动物,体细胞常丢掉部分或整条染⾊体,只保留将来分化产⽣⽣殖细胞的那套染⾊体。
例如在蛔⾍胚胎发育过程中,有27%DNA丢失。
在⾼等动植物中,尚未发现类似现象。
RTCrpUDGiT第三节真核基因转录⽔平的调控1 顺式作⽤元件(cis-acting elements>顺式作⽤元件:对基因表达有调节活性的DNA序列,其活性只影响与其⾃⾝同处在⼀个DNA分⼦上的基因;通常不编码蛋⽩质,多位于基因旁侧或内含⼦中。
简述真核生物基因表达调控过程真核生物基因表达调控过程是指在真核生物细胞中,如何通过一系列的调控机制,将基因中的遗传信息转化为蛋白质,以实现细胞功能的正常发挥。
基因表达调控过程可以分为转录调控和转录后调控两个阶段。
在转录调控阶段,首先是在细胞核中进行转录。
细胞核中的DNA被RNA聚合酶酶识别并解链,形成单链mRNA。
但并不是所有基因都会被转录,细胞会根据需要选择性地进行转录。
这是通过转录因子的作用来实现的。
转录因子是一类能够与DNA特定序列结合的蛋白质,它们能够促进或抑制转录的进行。
转录因子的结合位点位于启动子区域,当转录因子结合到启动子区域时,会引发一系列的反应,包括启动RNA聚合酶的活性和引导其结合到合适位置上,从而促使转录的进行。
转录因子的表达受到多种因素的调控,如细胞内的信号分子、细胞周期等。
转录后调控是指在mRNA合成后,通过一系列的调控机制来决定其在细胞中的命运。
mRNA在合成后需要经过剪接、修饰和运输等过程。
剪接是指将mRNA中的内含子去除,将外显子进行连接的过程。
通过剪接的不同方式,可以生成不同的mRNA亚型,从而在翻译过程中产生不同的蛋白质。
修饰是指在mRNA上加上帽子和尾巴等化学修饰,这些修饰可以保护mRNA不被降解,并帮助mRNA与翻译机器结合。
运输是指mRNA离开细胞核,进入到细胞质中,进一步参与翻译过程。
这个过程受到RNA结合蛋白的调控。
在翻译过程中,mRNA被核糖体识别并翻译成蛋白质。
这个过程也受到多种调控机制的影响。
一方面,mRNA上的启动子序列会影响翻译的起始位置,从而决定蛋白质的翻译起始位点。
另一方面,mRNA的稳定性也会影响翻译的效率和蛋白质的表达水平。
mRNA 的稳定性受到RNA结合蛋白和非编码RNA的调控。
总的来说,真核生物基因表达调控过程是一个复杂而精细的调控网络。
通过转录调控和转录后调控的相互作用,细胞可以根据内外环境的需要,在不同的时空位置上产生不同类型的蛋白质,以实现细胞功能的正常发挥。
第八章真核生物基因表达调控
RNA水平转录水平调控RNA的转录后加工mRNA向胞浆转运mRNA稳定性
DNA水平基因丢失
基因扩增
基因重排
甲基化修饰
染色质的结构状态
蛋白质水平翻译过程
翻译后加工
蛋白质的稳定性
真核生物基因表达调控的环节多
一、DNA水平的调控
1.基因丢失:
丢失一段DNA或整条染色体的现象。
在细胞分化过程中,可以通过丢失掉某些基因而去除这些基
因的活性。
某些原生动物、线虫、昆虫和甲壳类动物在个体
发育中,许多体细胞常常丢失掉整条或部分的染色体,只有
将来分化产生生殖细胞的那些细胞一直保留着整套的染色体。
目前,在高等真核生物(包括动物、植物)中尚未发现类似
的基因丢失现象。
马蛔虫受精卵的早期分裂
马蛔虫2n =2,但染色体上有多个着丝粒。
第一次卵裂是横裂,产生上下2个子细胞。
第二次卵裂时,一个子细胞仍进行横裂,保持完整的基因组,而另一个子细胞却进行纵向分裂,丢失部分染色体。
生殖细胞
体细胞
四膜虫:
大核:营养核可转录
小核:生殖核无转录活性
大核由小核发育而来,发育过程中有多处染色质断裂,并删除约10%的基因组DNA。
被删除序列的存在可能抑制了基因的正常表达。
2.基因扩增:
通过改变基因数量来调节基因表达产物的水平
非洲爪蟾卵母细胞:
为储备大量核糖体以供卵细胞受精后发育的需要,通
常都要专一性地增加编码核糖体rRNA的基因(rDNA) rDNA的滚环复制:
拷贝数由1500→2×106,总量可达细胞DNA的75%,
当胚胎期开始后,所合成的rDNA失去需要而逐渐降解
消失。
3.基因重排---免疫的多样性
在胚胎细胞中,V、J、(D)和C基因是分散排列的,在B细胞发育成熟过程中,基因组中组成免疫球蛋白分子的各个基因开始发生重排,转录产生mRNA。
随机重排的结果可以产生108—10l0种免疫球蛋白分子。
二、转录水平的调控
活跃转录的基因全部位于常染色质中,处于异染色质的基因则不表达。
主要发生在转录起始时的调控(包括启动子的活化和转录复合体与mRNA的结合)。
1.启动子的活化
DNA的甲基化:主要发生在胞嘧啶(C),抑制基因表达。
高等生物中的甲基化主要是多核苷酸链的CpG岛上胞嘧
啶的5位碳原子,生成m5CpG。
DNA的不同甲基化状态
(过甲基化与去甲基化)与基因的活性和功能有关。
DNA甲基化主要形成5-甲基胞嘧啶(5-mC)和少量的
N6-甲基嘌呤(N6-mA)及7-甲基鸟嘌呤(7-mG)。
甲基化抑制基因转录的机制
DNA 甲 基 化 导 致 某 些 区 域 DNA 构象变化,从而影响蛋 白质与 DNA 的相互作用,抑 制基因转录。
DNA甲基化与Cancer
组蛋白的乙酰化:主要发生在Lys,Arg,His,激活基因。
组蛋白乙酰转移酶(histone acetyltransferase,HAT)
组蛋白去乙酰化酶(histone acetylase,HDAC)
组蛋白乙酰化激活基因转录的机制 组蛋白乙酰化使组蛋白携带正电荷量减少,降低其与 带负电荷的DNA链的亲和性,导致局部DNA与组蛋白 八聚体解开缠绕,从而促使参与转录调控的各种蛋白 因子与DNA特异序列结合,进而发挥转录调控作用; 组蛋白的N末端尾巴可与参与维持染色质高级结构的多 种蛋白质相互作用,更加稳定了核小体的结构。
而组 蛋白乙酰化却减弱了上述作用,阻碍了核小体装配成 规则的高级结构。
DNA甲基化、组蛋白乙酰化都是表观遗传学的重要内 容之一。
在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰,这种 改变不仅可以影响个体的发育,而且还可以遗传下去。
因此,这类变异被称为“表观遗传修饰”。
2. 基因调控的顺式作用元件 是指基因周围能与特异转录因子结合而影响转录的DNA序 列。
其中主要是起正性调控作用的顺式作用元件,包括启动 子(promoter)、增强子(enhancer);近年又发现起负性调控 作用的元件---沉默子(silencer)。
哺乳类RNA聚合酶Ⅱ启动子中常见的元件
增强子增强子::一种能够提高转录效率的顺式调控元件,可使旁侧的基
因转录提高100倍。
可以单拷贝或多拷贝串连形式存在。
增强子
增强子成分增强子成分
小于100bp 增强子元
增强子元小于5bp +特异激活蛋白+特异激活蛋白促进转录的复合体促进转录的复合体增强子元增强子元小于5bp +特异激活蛋白+特异激活蛋白促进转录的复合体促进转录的复合体
增强子增强转录主要是按一种成环模式实现其远距离、双方向的增强功能。
增强子的作用有以下特点:
增强子提高同一条DNA链上基因转录效率,可以远距离作用。
增强子作用与其序列的正反方向无关,将增强子方向倒置依然能起作用。
增强子要有启动子才能发挥作用,对动子没有严格的专一性,同一增强子可以影响不同类型启动子的转录。
增强子的作用机理虽然还不明确,但与其他顺式调控元件一样,必须与特定的蛋白质因结合后才能发挥增强转录的作用。
绝缘子
是一段具有特化染色质结构的区域,它能阻断增强子或沉默子对靶基因/启动子的增强或失活作用效应。
而且能保护两个绝缘子之间的基因免受任何外界因子的作用与影响。
2.基因调控的反式作用元件
通用转录因子:基本转录复合体组装所需的转录因子。
RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子
激活剂:结合于上游启动子元件和增强子上的转录因子,
能增强基本转录复合物与核心启动子的结合。
具有DNA结合域和激活域。
辅激活剂:不与DNA结合,连接激活剂和基本转录复合体。
与DNA结合的转录因子大多以二聚体形式起作用,与DNA结合的功 能域常见有以下几种:
锌指(zinc finger)
与专一性识别有关的功能域是非锌指的Phe(F)、Leu(L)、 Tyr(Y)等核心疏水氨基酸
C C
Zn
H H
C C
Zn
C C
---- 表示DNA结合部位
螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix,HTH) 其构象包括2个α-螺旋,借助螺旋间的相互作用形成固定的角 度,螺旋之间连接一个短的伸展的肽链,其羧基端的一个α-螺 旋直接与DNA大沟的碱基专一性结合,也称为“识别螺旋”。
另 一个α-螺旋则穿越大沟,与DNA发生非特异结合。
两个HLH蛋白通过HLH基序形 成二聚体发挥作用。
碱性域(basic domain)或亮氨酸拉链(leucine zipper) 这类蛋白质含有4个或5个亮氨酸残基, 彼此之间精确的相距7个 氨基酸残基。
这样, 在α螺旋的每一个侧面就出现一个Leu, 这 些Leu排成一排, 两个蛋白质分子的α螺旋之间靠Leu残基之间 的疏水作用形成一条拉链。
L L L L L L L L
---- 表示DNA结合部位
碱性域一般只促进二聚体的形成,不直接与DNA作用,两个 α螺旋在二聚化界面前面一点的位置分开,形成Y型结构,这 样二聚体就夹住了DNA双链,其侧链可以与DNA大沟结合。
三、转录后水平的调控 1. 真核生物转录后mRNA的加工 前体mRNA加工为成熟的mRNA的过程:加帽、加尾、 剪接、修饰和编辑等过程。
前体mRNA的加工和成熟是真核生物所特有,并具有提 高mRNA的稳定性、保证遗传信息的稳定性和多样性、 提高翻译效率等重要的生物学意义。
2. RNA干涉和反义RNA 反义基因在耐储藏番茄育种中的应用
增加了番茄的耐贮藏性
。