流感病毒实验室检测
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3种流感病毒检测方法检测流感样病例病原结果及分析【摘要】目的:分析应用3种流感病毒检测方法检测流感样病例病原结果。
方法:选取永州市疾控中心2015年1月~2016年1月采集到的100份流感样病例(influenza—like illness,ILI)样品作为研究对象,分别采用胶体金法、逆转录-聚合酶链式反应法(reverse transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)、细胞培养法对样品进行检测,比较三种方法阳性检出率,并用RT-PCR法分析流感病毒分型。
结果:在对100份ILI样品分别进行胶体金法、RT-PCR法、细胞培养法检测后,阳性检出率分别为85%、61%、33%,组间差异具有统计学意义(P<0.05);RT-PCR法分析病毒分型结果分别为B型(27%)、H3N2型(31%)、H1型(3%),年龄分布以20岁~29岁为主21株(21%)。
结论:综上所述,胶体金法检测流感病毒敏感性最高,其次为RT-PCR法、细胞培养法。
但胶体金法检测流感病毒容易出现假阳性[5], RT-PCR法用于检测流感病毒特异性最高,流感病毒的分型须用RT-PCR法进行。
【关键词】流感样病例;胶体金法;逆转录-聚合酶链式反应法;细胞培养法流行性感冒病毒(influenza virus)简称为流感病毒,为正粘病毒科(Orthomyxoviridae)的代表,根据目前临床研究证实,流感病毒共包含甲型流感病毒(Influenza A virus)、乙型流感病毒(Influenza B virus)、丙型流感病毒(Influenza C virus)三个类型[1]。
随着不良生活习惯、失衡的饮食结构等因素影响,机体免疫力处于下降趋势,在应对流感病毒的侵袭时无法做出有效抵抗,使得流感患者发病率呈现出显著上升态势,已经成为世界范围内的公共健康问题之一。
由于流感病毒亚型数量日益多元化,使得流感病毒带来的危害性与日俱增,给疾控工作带来较大压力。
2024呼吸道7项检测的临床意义肺炎衣原体IgM抗体肺炎衣原体(Cpneumoniae,CP)是呼吸道感染主要病原之一,与小儿肺炎、哮喘及慢性咳嗽等呼吸道疾病密切相关。
CP感染所致的肺炎占5%-20%,症状和体征无特异性,多数起病缓慢,潜伏期一般为30天左右,临床开始时出现流感样的上呼吸道症状,如咽炎、头痛、发热,一般低于38℃,数天至数周后出现持续性干咳,如不积极治疗可持续数月,痰分泌很少或无痰,肺部可闻及干湿啰音。
胸片表现类似非典型性肺炎,常为单侧节段性肺炎,严重者病变较广泛,甚至波及双肺,也可伴胸膜炎或胸腔积液。
肺炎衣原体的实验室检测可辅助诊断急性肺炎衣原体感染,常用的检测方法有分离培养、血清学检测、核酸扩增技术等,目前临床主要使用血清学检测方法。
IgM抗体在感染后1~2周出现,3~4周达高峰。
因此,CP-IgM阳性可作为急性期感染的辅助诊断指标。
肺炎支原体IgM抗体肺炎支原体(M.pneumoniae,MP)是引起无症状性、轻度或少数严重上呼吸道和下呼吸道感染的常见人类病原体,已经发现肺炎支原体感染占所有肺炎病例的15-20%,肺炎支原体主要通过呼吸道飞沫传播,平时多为散发病例,全年均可发病,但发病季节以秋冬初春为高峰,约每隔3~7年发生一次地区性流行。
学龄儿童患病较多,学龄前儿童包括婴幼儿也可发生肺炎支原体感染。
肺炎支原体的实验室检测可辅助诊断急性肺炎支原体感染,常用的检测方法有分离培养、血清学检测、核酸扩增技术等,目前临床主要使用血清学检测方法。
IgM 抗体在感染后1-2周出现,3~4周达高峰,由于MP的潜伏期为2~3周,当患者出现症状就诊时MP-IgM水平已经很高,因此,MP-IgM阳性可作为急性期感染的诊断指标。
甲型、乙型流感病毒IgM抗体甲、乙型流感病毒属于正黏病毒科,为单股、负链RNA病毒,是引起流行性感冒(简称流感)的主要病原体之一;流感是一种传播性强、传播速度快的呼吸道感染疾病,其典型症状是发热且有咳嗽、上呼吸道症状(如咽痛、流鼻涕)和全身症状(如头痛、肌痛、萎靡不振)。
山羊副流感病毒3型检测技术1 范围本标准规定了山羊副流感病毒3型(Caprine paraifluenza virus 3, CPIV3)的病原学检测(病毒核酸的RT-PCR和荧光定量RT-PCR检测)、血清学检测(血凝抑制(HI)试验)的技术要求。
本标准适用于山羊副流感病毒3型及其感染情况的实验室检测。
2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。
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GB/T 6682 分析实验室用水规格和试验方法GB 19489 实验室生物安全通用要求NY/T 541 兽医诊断样品采集、保存与运输技术规范3 病原学检测3.1 材料微量移液器及吸头、DEPC水处理的离心管、吸头、PCR扩增管、TRIzol试剂、三氯甲烷、异丙醇、DEPC处理水(用水符合GB/T 6682规定)、反转录酶/Taq DNA聚合酶混合液、2×一步法RT-PCR反应缓冲液、一步法荧光定量RT-PCR试剂盒、TAE缓冲液、琼脂糖、核酸染料、引物MF/MR、引物qMF/qMR 与探针(附录A)。
3.2 仪器设备PCR仪、荧光定量PCR仪、台式冷冻离心机、电泳仪和水平电泳槽、凝胶成相仪(或紫外透射仪)。
3.3 反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)3.3.1 样品处理与RNA的提取采集羊的鼻拭子、气管拭子或肺脏(样品的采集、保存和运输应符合NY/T 541相关规定)。
取200 μL待检样品液至无菌无RNA酶的EP管中,使用TRIzol试剂、RNA提取试剂盒或自动化核酸提取仪等方法提取RNA。
3.3.2 RT-PCR反应RT-PCR反应使用20 μL体系:10 μL 2×一步法RT-PCR反应缓冲液、引物MF/MR各0.5 μL(10 μmol/L)、0.4 μL反转录酶/Taq DNA聚合酶混合液、4 μL RNA模板,4.6 μL DEPC处理水。
甲型/乙型流感病毒实验室活动风险评估报告一、生物学特征(一)种类和分型流行性感冒病毒(influenza virus),是正粘病毒科(Orthomyxoviridae)的代表种,简称流感病毒,包括人流感病毒和动物流感病毒,人流感病毒分为甲(A)、乙(B)、丙(C)三型,是流行性感冒(流感)的病原体。
其中甲型流感病毒抗原性易发生变异,多次引起世界性大流行。
例如1918~1919年的大流行中,全世界至少有2000万~4000万人死于流感;乙型流感病毒对人类致病性也比较强,但是人们还没有发现乙型流感病毒引起过世界性大流行;丙型流感病毒只引起人类不明显的或轻微的上呼吸道感染,很少造成流行。
甲型流感病毒于1933年分离成功,乙型流感病毒于1940年获得,丙型流感病毒直到1949年才成功分离。
流感分类根据流感病毒感染的对象,可以将病毒分为人类流感病毒、猪流感病毒、马流感病毒以及禽流感病毒等类群,其中人类流感病毒根据其核蛋白的抗原性可以分为三类:甲型流感病毒(Influenza A virus),又称A型流感病毒乙型流感病毒(Influenza B virus),又称B型流感病毒丙型流感病毒(Influenza C virus),又称C型流感病毒感染鸟类、猪等其他动物的流感病毒,其核蛋白的抗原性与人甲型流感病毒相同,但是由于甲型、乙型和丙型流感病毒的分类只是针对人流感病毒的,因此通常不将禽流感病毒等非人类宿主的流感病毒称作甲型流感病毒。
在核蛋白抗原性的基础上,流感病毒还根据血凝素HA和神经氨酸酶NA的抗原性分为不同的亚型。
(二)形态结构流感病毒呈球形,新分离的毒株则多呈丝状,其直径在80至120纳米之间,丝状流感病毒的长度可达4000纳米。
流感病毒结构自外而内可分为包膜、基质蛋白以及核心三部分。
病毒的核心包含了存贮病毒信息的遗传物质以及复制这些信息必须的酶。
流感病毒的遗传物质是单股负链RNA,简写为ss-RNA,ss-RNA与核蛋白 (NP)相结合,缠绕成核糖核蛋白体 (RNP),以密度极高的形式存在。