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ImageJ软件在大型医疗设备质量检测中的应用徐桓;段新安【摘要】Objective：To clarify the methods, advantages and value of ImageJ for large medical equipment quality test. Methods：The testing of MRI thickness, DSA subtract function was taken for an example to make an argument, and it was compared with the traditional methods. Results：Compared with traditional methods, the measurement results using ImageJ were consistent. The use of ImageJ can improve test efficiency. Conclusion：ImageJ is powerful in image analysis and processing. The use of ImageJ in the large medical equipment quality test has advantages of accurate and effect test data and simple and feasible methods. Therefore, it can meet the needs of analysis and processing test image.%目的：将计算机技术引入大型医疗设备质量检测工作之中是今后质量检测技术的发展方向,阐述ImageJ软件用于大型医疗设备质量检测中的方法、优势及意义。
方法：以使用ImageJ软件测量MRI层厚、DSA减影功能为例,进行具体论证,并与传统的测量方法进行比较。
如何利用ImageJ测量显微图像的长度？
ImageJ是一款小巧开放的图像分析软件，可以从其官方网站上免费下载。
下面就对如何利用ImageJ进行图像测量作一简单介绍：
1、从文件菜单打开你要测量的图像。
2、从工具菜单选择，如果测量的是直接则选择直线工具（line tool），要不然则选择分段线
工具（segemented line）或手写工具(freehand)。
3、 选择线形工具时，移动鼠标至需要测量长度的位置1，按下左键不放，拖动至测量位置
2松开鼠标。
Line
Segemented line
freehand
位置1
位置2
4、如果选择的是分段线工具时，在位置1按下鼠标没轨迹移动至要改变方向的位置2，点
击鼠标，再移至位置3，点击鼠标，……，至终点位置X，双击鼠标。
位置3
位置2
位置1
位置x
5、如果选择的是手写工具则，在位置1点鼠标不松开，然后按希望的轨迹移动，到目标位
置2松开即可。
位置1
位置2
6、在分析（analyze）菜单下，选择测量命令（measure）或按ctrl+M完成测量，长度单位
是像素。
7、测量结果以文本形式显示一个名为results的窗口中，可以选择保存为文本文件备用，图
中结果为1348像素，利用原有的比例尺信息可计算出实际距离，关于比例尺的设置将另外撰文介绍。
imagej使用手册
ImageJ是一款功能强大的图像处理和分析软件，使用手册如下：
1. 安装与运行：ImageJ可以在线或下载后运行，只要安装了Java 或更高
版本虚拟机的计算机即可。
支持Windows、Mac OS X以及Linux系统。
2. 显示、编辑、分析、处理、保存和打印图像：ImageJ可以显示、编辑、
分析、处理、保存和打印8位、16位和32位图像。
可读取的图片格式包括TIFF、GIF、JPEG、BMP、DICOM、FITS以及“原始图件”。
支持“堆栈”（以及多维的堆栈），一系列的图片共用一个窗口。
3. 图像处理和测量计算：可以计算用户自定义选择的面积和像素值统计，可以测量距离和角度，可以创建密度直方图和线图。
所有功能在任意倍数下均可使用。
此外，ImageJ是多线程的程序，因此，像图片读取这种较耗时的操作可与
其他操作同时进行。
希望以上信息对您有帮助。
imagej用法ImageJ是一款强大的图像处理软件，广泛应用于生命科学、医学和材料科学等领域。
它具有开源、跨平台、丰富的插件支持等特点，使其成为科研人员和工程师们常用的图像分析工具。
本文将介绍ImageJ的基本用法，帮助用户更好地利用这一工具进行图像处理和分析。
1. ImageJ简介1.1 ImageJ的特点•开源：ImageJ是一款免费、开源的软件，用户可以自由获取、使用和修改源代码。
•跨平台：ImageJ支持多种操作系统，包括Windows、macOS和Linux，保证用户在不同平台上都能方便地使用。
•插件支持：ImageJ具有强大的插件体系，用户可以通过安装插件扩展功能，满足不同领域的需求。
1.2 安装与启动1.下载：在ImageJ官方网站上下载适用于您操作系统的版本。
2.安装：解压下载的压缩包，将文件夹移动到合适的位置即可。
3.启动：进入ImageJ文件夹，找到并运行可执行文件（如ImageJ.exe），即可启动ImageJ。
2. 基本操作2.1 打开图像在ImageJ中，可以通过以下方式打开图像：•文件-> 打开：选择要打开的图像文件。
•拖放：将图像文件直接拖放到ImageJ窗口中。
2.2 图像显示与导航•放大与缩小：利用工具栏上的放大和缩小工具，或者使用鼠标滚轮进行图像的放大和缩小。
•导航：在ImageJ窗口中，可以使用滚动条或者拖动图像来导航图像。
2.3 测量与标注•测量工具：通过工具栏上的测量工具，可以测量图像中的长度、面积等。
•标注：利用文本工具在图像上添加文字标注，方便说明和标记。
3. 图像处理3.1 图像滤波与增强•滤波器：ImageJ提供了多种滤波器，包括平滑、锐化、边缘检测等，可通过“处理-> 滤波器”进行选择。
•对比度与亮度：可以通过“图像-> 对比度/亮度”调整图像的对比度和亮度。
3.2 阈值处理与分割•阈值处理：可以通过“图像-> 调整-> 阈值”设置阈值，将图像转换为二值图像。
一种基于ImageJ软件的植物叶片表型参数测量方法近些年来，随着计算机技术和图像处理算法的不息进步，基于图像信息的植物表型测量方法越来越受到探究者们的关注。
植物叶片表型参数的测量对于植物形态学、生理学和遗传学等领域的探究具有重要意义。
传统的测量方法往往耗时耗力且易引起人为误差，因此，探究人员亟需一种准确、高效的测量方法来分析和比较不同植物叶片的形态特征。
ImageJ是一种图像处理软件，其提供了丰富的图像处理和分析功能，广泛应用于医学、生物学、工程和材料科学等领域。
基于ImageJ软件的植物叶片表型参数测量方法可以极大地简化测量过程，并提高测量结果的准确性和可重复性。
起首，我们需要得到植物叶片的数字图像。
可以利用数码相机或显微镜等设备，将植物叶片摄影或拍摄下来，并将图像导入到ImageJ软件中。
接下来，我们可以利用ImageJ软件的图像预处理功能对图像进行必要的调整，包括裁剪、旋转和调整亮度、对比度等。
通过这些预处理，可以使叶片图像更加明晰、准确，为后续的参数测量做好筹办。
第二步，我们需要选择合适的测量方法和工具。
基于ImageJ软件，我们可以利用其丰富的测量工具和测量算法，来测量植物叶片的形态特征。
比如，我们可以利用ImageJ软件的线性选择工具，测量叶片的长度和宽度。
同时，通过描绘叶片外轮廓的自动阈值处理和粒子分析工具，我们可以测量叶片的面积、周长和外形系数等参数。
此外，ImageJ软件还提供了多种滤波和分割方法，可以援助我们处理含有复杂纹理或背景的叶片图像，从而准确地测量叶片的表型参数。
最后，我们需要对测量结果进行统计分析和比较。
ImageJ软件提供了丰富的数据分析和可视化工具，可以便利地对测量结果进行统计、分布和相关性分析。
同时，我们还可以利用ImageJ软件的扩展插件，比如MorphoJ，来进行更复杂的外形和尺寸分析。
通过这些分析工具，探究人员可以对不同植物的叶片形态进行比较，找出具有显著差异的表型参数，并进一步探究与植物遗传、环境和生长发育的相关性。
4hne imagej 测定方法
摘要：
1.引言
2.4hne 和imagej 简介
3.4hne 的测定方法
4.imagej 在4hne 测定中的应用
5.结果与讨论
6.总结
正文：
【引言】
4hne（4-羟基壬烯）是一种环境污染物，对人体健康具有潜在危害。
了解4hne 的分布和浓度对于环境保护和人类健康至关重要。
本文介绍了使用imagej 软件测定4hne 的方法。
【4hne 和imagej 简介】
4hne 是一种环境污染物，主要来源于燃烧过程和工业排放。
imagej 是一款强大的图像分析软件，广泛应用于生物医学和环境科学领域。
【4hne 的测定方法】
4hne 的测定方法主要有液相色谱法和气质联用法。
液相色谱法包括液相色谱- 紫外检测法和液相色谱- 串联质谱法；气质联用法采用气相色谱- 质谱法。
【imagej 在4hne 测定中的应用】
imagej 软件可以用于处理和分析4hne 检测图像。
首先，对图像进行预处理，包括去背景、阈值分割和形态学处理等。
然后，通过测量和计算图像中4hne 区域的面积和像素数量，得到4hne 的浓度。
【结果与讨论】
通过imagej 软件处理4hne 检测图像，可以得到准确、快速的结果。
与其他测定方法相比，imagej 具有操作简便、成本低廉的优点。
同时，通过软件对图像的分析，可以获得关于4hne 分布的更多信息。
【总结】
本文介绍了使用imagej 软件测定4hne 的方法。
作图软件：Image J介绍：该软件可以计算选定区域内分析对象的一系列几何特征，分析指标包括：长度，角度，周长，面积，长轴，短轴，圆度等。
参考：解螺旋-套路课01-第三章-第3节两种应用：免疫组化定量分析，计数免疫组化定量分析3种方法：手动、自动1、自动2【1】手动定量1.打开图片File –open –找到图片2.选择完所有阳性结果后，再同一进行计算Analyze –tools –ROI manger（感兴趣区域）然后标签栏选择第3个标签（以任意形状选取感兴趣区域）【2】自动定量11. 打开图片File –open –找到图片2. 彩图转换为8bit灰度图Image –type –8-bit3. 设定阈值Image –adjust –threshold系统会自动设定一个阈值，并将阈值之上的面积进行统计，此时打开免疫组化原始图片，手动调节阈值大小，当我们设定的阈值能够比价好的反应免疫组化的生物学意义时，就使用此时的阈值统计4. 统计Analyze –measure得到4个参数：area(阳性区域总面积)，mean(平均光密度)，min(最小光密度)，max(最大光密度)，后续作图用。
【3】自动定量21. 打开图片File –open –找到图片2. 彩图转换为RGBImage –type –RGB stack在得到的图片中，通过拖动下方的进度条，选取对比度最显著的那张3. 设定阈值Image –adjust –threshold系统会自动设定一个阈值，并将阈值之上的面积进行统计，此时打开免疫组化原始图片，手动调节阈值大小，当我们设定的阈值能够比价好的反应免疫组化的生物学意义时，就使用此时的阈值统计4. 统计Analyze –measure得到4个参数：area(阳性区域总面积)，mean(平均光密度)，min(最小光密度)，max(最大光密度)，后续作图用。
计数例如：克隆形成实验定量分析两种方法：手动计数、自动计数【1】手动计数1. 打开图片File –open –找到图片2. 点击工具栏第7个按钮“多点计数工具”在每个克隆上进行点击，每点一下，图上就会多一个软件加上的点3. 所有的点都选上之后，点击analyze –measure软件会生成一个结果图拉到最下面，就可以看到一共有多少点【2】自动计数1. 打开图片File –open –找到图片2. 彩图转换为8bit灰度图Image –type –8-bit3. 设定本张图中最大克隆和最小克隆设置最大克隆：点击工具栏第3个按钮，然后圈出本图中最大的克隆，再analyze –measure，看这个克隆的面积，例如area = 276设置最小克隆：点击工具栏第3个按钮，然后圈出本图中最小的克隆，再analyze –measure，看这个克隆的面积，例如area = 544. 设定阈值Image –adjust –threshold系统会自动设定一个阈值，并将阈值之上的面积全部用红色标记如果不合适，可手动调节因为阴影的存在，软件把这些阴影也识别为阳性结果，我们需要通过对克隆大小的限定，从而将阴影排除在阳性结果之外5. 通过对克隆大小的限定，从而将阴影排除Analyze –analyze particles在size（pixel^2）处填入克隆的大小范围，结合第3步的结果设置：30---300，点击“OK”这样，阴影就被排除了6. 拉到最低，便可以看到克隆的数量。
老司机带你解锁ImageJ实用技巧（下）今天我们继续来聊一聊ImageJ的高阶使用技巧。
问题三、为什么总是全部圈起来的灰度值，有没有大神指导呢求助！本问题涉及免疫印迹（Western Blot）分析，提问者不能分别得到每个条带的值。
灰度值0为纯黑，255为纯白，灰度值与光密度值（OD值）的关系如下图所示：以灰度来统计WB条带的话，无条带的纯白255左右，条带越黑着色越深灰度值反而越小，这与我们的认知不符。
步骤：1. File -> Open -> 打开需要分析的WB条带。
2. Image –> Type -> 8-bit, 将图像转换为8-bit的灰度图片；Image-> Invert，黑白反转，得到如下图片：3. Analyze -> Calibrate, 校正光密度值Function中选择Uncalibrated OD，左下方Global calibration，勾选表示有多张图片打开时对所有图片进行此操作。
否则只对当前图片进行此操作。
4. 在工具栏中选择矩形工具——Rectangular, 最左边的为矩形工具，选择条带：键盘上按数字1，弹出如下提示框：点Yes，键盘上按数字3，得到如下：5. 工具栏中选择直线工具——Straight，下图最右边的为直线工具，按住Shift键使用直线工具画竖线将步骤4的峰进行分割：6. 选择魔棒工具——Wand tool，分别点击分割好的峰，即可得到结果，保存结果（File -> Save as…）即可：7. WB统计分析一般将对照组标准化为100%或1，上述结果6个条带前3个为对照组。
在Excel中，先计算对照组3个的平均值（AVERAGE(B2:B4)）：然后所有B列的数值除以对照组平均值，此时对照组的均值为1：8. 将所得数据放入Graphpad prism绘图即可：拓展：弯曲的WB条带应如何使用ImageJ拉直？1. 使用Segmented line沿着倾斜条带画间断线段：2. 双击Segmented line，设置线段的宽度至包含所有条带：3. 点击菜单栏Edit -> Selection-> Straighten，倾斜的WB条带即可拉直：问题四、如何统计SEM图片小球数量？步骤：1. 打开ImageJ软件，File -> Open打开SEM图片。
Image J 测脊髓损伤的体积组织：脊髓长度：10mm切片厚度：100um准备工作：1 损伤后30min，断头处死，共处死6只大鼠用于实验。
然后取出损伤区域的脊柱，10mm，置于4%多聚甲醛中过夜。
2 待固定完全后，取出脊髓，放入30%蔗糖缓冲液中进行脱水。
3 待脱水完全后，用滤纸吸干组织表面液体，置于冰冻切片机内，速冻，备用。
4 用冰冻切片机行连续切片，由损伤前端开始切，切片厚度为100um，依次黏贴在载玻片上，每张载玻片贴4片，顺序为从左到右依次排列。
并做好起始标记。
同时载玻片亦按顺序放置在玻片盒中，备用。
5 待所有切片切完后，用olympus显微镜拍照，选取40×的照片，并依次编号，备用。
6 镜台测微尺图像拍摄：将镜台测微尺置于载物台上，然后用olympus显微镜，在同一焦距下，分别用4倍，10倍，40倍物镜拍摄，并分别进行编号，备用。
ImageJ软件测量损伤体积（LV）的操作方法：1 安装ImageJ软件（已经安装该软件的直接进入第二步）ImageJ软件下载，（版本1.42）直接双击下载后的程序即可安装，软件运行最少需要64M内存，可以在Windows、Linux、Mac OS等操作系统上运行。
2 损伤体积（LV）测量的具体流程2.1获取图片将olympus显微镜中拍摄的组织照片和测微尺的照片拷贝到个人电脑，建立文件夹并命名“脊髓损伤体积测定”，然后对其进行LV测量。
在测LV之前，我们需要对标尺进行校正。
2.2标尺设定运行ImageJ软件，导入标尺图片，点击工具栏选择 straight lines（直线工具），用鼠标左键在标尺上画一段直线（这样就能确定我们所画的直线的长度），点击菜单栏中的Analyze→set scale（分析→设置标尺），自动弹出“set scale （设置标尺）”窗口，设定“known distance”选项为“”（刚才所画的已知长度），设定“unite of lenth”选项为“um”（已知长度的单位值），在global选项中打钩。
imagej用户使用手册第三部分【原创版】目录1.概述2.图像处理基本操作3.图像处理高级操作4.常见问题与解决方案5.总结正文【概述】本部分将详细介绍 ImageJ 图像处理软件的使用方法。
ImageJ 是一款功能强大的开源图像处理软件，广泛应用于生物医学、化学、物理等多个领域。
在本文中，我们将从基本操作到高级操作，一步一步地为您展示如何使用 ImageJ 进行图像处理。
【图像处理基本操作】1.打开和保存图像- 通过“文件”菜单打开或保存图像- 可以支持的图像格式包括：JPEG、PNG、BMP、TIFF 等2.图像的缩放与裁剪- 通过“图像”菜单下的“缩放”或“裁剪”子菜单进行操作 - 可以自由地调整图像大小和裁剪区域3.图像的旋转与翻转- 通过“图像”菜单下的“旋转”或“翻转”子菜单进行操作- 可以对图像进行任意角度的旋转或翻转【图像处理高级操作】1.区域选择与分割- 通过“选择”菜单下的“区域”子菜单进行操作- 可以使用矩形、椭圆、自由手绘等方法选择图像区域2.图像的亮度和对比度调整- 通过“图像”菜单下的“调整”子菜单进行操作- 可以对图像的亮度、对比度、色调等进行精确调整3.图像的滤波处理- 通过“图像”菜单下的“滤波”子菜单进行操作- 可以使用多种滤波器对图像进行处理，如：模糊、锐化、边缘检测等【常见问题与解决方案】1.问题：打开图像时出现“无法载入图像”的提示解决方案：检查图像文件的路径是否正确，或尝试重新安装ImageJ 软件2.问题：图像处理后保存时出现“保存失败”的提示解决方案：检查保存路径是否正确，或尝试重新安装 ImageJ 软件【总结】本篇文章详细介绍了如何使用 ImageJ 进行图像处理的基本操作和高级操作，以及常见的问题与解决方案。
基于Image J软件的裸鼠肝脏原位肿瘤图像定量分析方法姜棋予;冯帆;侯俊;陈艳;李瑞生;孙慧伟;李晓娟;柴燕涛;王志杰;杨锐创;张莹石【期刊名称】《生物技术通讯》【年(卷),期】2018(029)004【摘要】目的:采用门静脉注射肝细胞癌细胞的方法,能够在裸鼠肝脏形成多发与弥散的肿瘤病灶,进而模拟进展期肝细胞癌的转移与侵袭性生长.本研究旨在建立基于图像分析软件Image J的裸鼠肝脏原位肿瘤图像定量分析方法.方法:培养高侵袭性的人肝细胞癌细胞系MHCC97-H,通过肝门静脉注射的方法,将MHCC97-H细胞接种于裸鼠肝脏,经2～4周生长,MHCC97-H细胞能够在裸鼠肝脏形成多发与弥散的肿瘤病灶;收集动物获得肝脏脏器进行拍照,对所得图片进行分析;用Image J软件对图像进行定量分析,分别确定整体肝脏脏器的面积与肿瘤病灶的面积,二者之比即可反映出肝细胞癌在裸鼠肝脏形成肿瘤病灶占肝脏脏器的面积比例;在此基础上,对接种有肝细胞癌细胞的裸鼠,行灌胃给药,给予2 mg/kg剂量的分子靶向药物索拉非尼进行治疗,分别确定对照组与治疗组肝脏形成的肿瘤病灶并进行定量分析,可依据此计算索拉非尼治疗对肿瘤病灶的抑制率.结果:MHCC97-H细胞接种能够在裸鼠肝脏形成多发与弥散的肿瘤病灶,用Image J软件可准确圈出肝脏脏器上的肿瘤病灶,确定病灶占肝脏脏器的面积比例.利用本研究的方法能够定量分析索拉非尼对MHCC97-H细胞形成多发、弥散病灶的抑制作用.结论:建立了基于图像分析软件Image J的裸鼠肝脏原位肿瘤图像定量分析方法,对抗肿瘤药物活性评价相关研究具有重要意义.【总页数】6页(P541-546)【作者】姜棋予;冯帆;侯俊;陈艳;李瑞生;孙慧伟;李晓娟;柴燕涛;王志杰;杨锐创;张莹石【作者单位】解放军第三O二医院临床研究管理中心,北京100039;解放军第三O 二医院临床研究管理中心,北京100039;解放军第三O二医院临床研究管理中心,北京100039;解放军第三O二医院临床研究管理中心,北京100039;解放军第三O 二医院临床研究管理中心,北京100039;解放军第三O二医院临床研究管理中心,北京100039;解放军第三O二医院临床研究管理中心,北京100039;解放军第三O 二医院临床研究管理中心,北京100039;解放军第三O二医院临床研究管理中心,北京100039;解放军第三O二医院临床研究管理中心,北京100039;解放军第三O 二医院临床研究管理中心,北京100039【正文语种】中文【中图分类】R445【相关文献】1.MKN-45人胃癌实体瘤的荷瘤裸鼠原位移植肿瘤组织和癌旁远近端组织肿瘤相关因子基因蛋白表达的实验研究 [J], 孙大志;张璇;徐晶钰;陆烨;巨大维;叶敏;矫健鹏;魏品康;何金2.抗人CD147单克隆抗体对人肝癌细胞MHCC97-H裸鼠肝脏原位移植瘤生长抑制的实验研究 [J], 王乐天;毛沙;吕裕霞;岳阳;吴凤东;张庆PIO在乳腺癌细胞MCF-7裸鼠原位肿瘤模型中的应用及MRI成像评估效果研究 [J], 马宜传4.地高辛对人肺癌裸鼠皮下移植瘤与原位移植瘤抗肿瘤作用的比较 [J], 王佳南;汪紫易;卢洪胜;陈浩轩;陶玲珑;王峥涛;陈晨;汪旭明;胡琼莹5.基于Image J软件对BALB/c突变卷毛鼠肝肿瘤的定量分析 [J], 李晓娟;李兴杰;孙慧伟;姜棋予;柴燕涛;高蓉;李润;李瑞生;汤紫荣因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
imagej细胞计数方法ImageJ是一款开源的图像处理软件，广泛应用于生物学、医学等领域。
在细胞学研究中，细胞计数是一项重要的工作，可以通过ImageJ来实现。
本文将介绍使用ImageJ进行细胞计数的方法。
打开ImageJ软件并导入需要进行细胞计数的图像。
在菜单栏中选择“File”，然后点击“Open”选项，选择要分析的图像文件。
可以在弹出的对话框中选择图像格式并打开相应的图像文件。
接下来，我们需要对图像进行预处理，以便更好地进行细胞计数。
常用的预处理方法包括图像平滑、图像增强、图像阈值化等。
这些方法可以帮助我们去除图像中的噪声，使细胞边界更清晰，方便计数。
图像平滑可以通过在菜单栏中选择“Process”-“Smooth”来实现。
可以根据需要选择不同的平滑算法和参数进行图像平滑处理。
图像增强可以通过在菜单栏中选择“Process”-“Enhance Contrast”来实现。
可以根据需要调整对比度和亮度参数，以增强图像的细节。
图像阈值化可以通过在菜单栏中选择“Image”-“Adjust”-“Threshold”来实现。
可以手动调整阈值参数，也可以使用自动阈值算法进行阈值化操作。
阈值化操作将图像转换为黑白二值图像，方便我们进行细胞计数。
在进行细胞计数之前，我们需要对图像进行分割，将细胞与背景分离开来。
ImageJ提供了多种分割方法，如基于区域生长、边缘检测等。
我们可以根据图像的特点选择适合的分割方法进行操作。
分割完成后，我们可以利用ImageJ的“Analyze Particles”功能进行细胞计数。
在菜单栏中选择“Analyse”-“Analyze Particle s”，在弹出的对话框中选择合适的参数，然后点击“OK”按钮即可进行计数。
可以选择计数的对象大小范围、计数方式等参数，以满足实际需求。
细胞计数完成后，可以在ImageJ的结果窗口中查看计数结果。
除了计数结果，还可以获取每个细胞的面积、周长等相关信息。
利用ImageJ软件测量眼眶脂肪体积
蒋丽琼; 何小寒; 刘桂琴; 衣晓明
【期刊名称】《《中国CT和MRI杂志》》
【年(卷),期】2016(014)003
【摘要】目的建立一种精确测量眼眶脂肪体积的方法。
方法应用Image J软件计算眼眶CT图像中的眼眶容积及眼眶脂肪体积,在提取眼眶边界时分别采用手工描计法及半自动方法。
结果半自动方法与手工描计法计算结果大致相同,但更为精确与省时。
结论 Image J软件可精确测量眼眶容积及眼眶脂肪体积。
【总页数】4页(P11-13,17)
【作者】蒋丽琼; 何小寒; 刘桂琴; 衣晓明
【作者单位】暨南大学附属深圳眼科医院(深圳市眼科医院、深圳眼科学重点实验室)眼眶病眼整形科广东深圳518040; 深圳华侨城医院眼科广东深圳518040; 深圳华侨城医院放射科广东深圳518040
【正文语种】中文
【中图分类】R77
【相关文献】
1.基于ImageJ软件的香樟千粒重的测量及其应用 [J], 钟永达;周燕玲;李彦强;刘立盘;刘淑娟;杨爱红;刘腾云;余发新
2.ImageJ软件测量肝脏体积的方法 [J], 吴涛;张会如;王梅;董睿;刘洪美
3.ImageJ测量颅内血肿体积与多田公式的比较评价 [J], 符鹏程;陈继华;夏明万;雷生锁
4.MRI测量眼眶不同部位脂肪体积在TAO诊断中的价值 [J], 焦华杰;于芝;王琰娟;朱蓉蓉;何维恒;饶慧敏
5.一种利用ImageJ软件对棉花叶面积进行测量的方法 [J], 张选; 彭小峰; 刘素华; 彭延
因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。
软件论文关于软件论文：
ImageJ软件测量肝脏体积的方法
[摘要]ImageJ软件是一种可免费下载的JAVA图像分析与处理软件。基于其对医学影像图像
可直接进行分析和处理，提出了一种在个人电脑上利用ImageJ软件测量肝脏体积的方法。
并展示了外科医生可利用个人电脑独立进行肝脏CT容积的分析。
[关键词]ImageJ软件；肝脏体积；图像处理
肝脏体积(liver volume，LV)是间接反映肝脏储备功能的一项重要指标[1]，根据CT或MRI的
扫描图像准确计算手术前、后的肝脏体积，对于肝脏切除、肝移植等手术的病人非常有必要，
有助于减少因术后残肝体积过小而造成的各种并发症。术后测量残余肝脏体积，有助于外科
医生了解肝脏的再生情况。遗憾的是这种处理医学影像的软件通常是安装在医院影像设备上，
非放射人员无法经常接触，而且这种软件需要影像设备的支持，不能安装在个人电脑中，市
面上独立的CT体积测量软件又非常昂贵，这给肝脏外科医生进行临床和科学研究带来诸多
不便。ImageJ是一个可免费下载的图像分析软件包，由美国国立卫生研究院（National
Institutes of Health，NIH）研究开发，用于帮助分析临床和科研中的医学影像。目前国内尚
未见有关ImageJ软件测量肝脏体积的报道，基于以上原因，本文提出了一种在个人电脑上
利用ImageJ软件测量肝脏体积的方法。
1安装ImageJ软件
ImageJ软件下载，（版本1.42）直接双击下载后的程序即可安装，软件运行最少需要64M内
存，可以在Windows、Linux、Mac OS等操作系统上运行。
2 LV测量的过程
2.1获取图片
由我院附属医院PACS图像处理工作站，选取行腹部多层螺旋CT平扫获得的肝脏CT图像，
扫描层厚5 mm，螺距1.0，管电压120 kV，管电流65 mAs。将CICOM格式的图像文件夹拷
至个人电脑，对其进行LV测量。
2.2半自动法测量LV
2.2.1制作图像栈
每例病人的DICOM格式CT图像文件夹中，每层CT图片都有一个唯一的编号，运行ImageJ
软件，选择菜单File→open，找到待处理的文件夹，按文件夹中CT图像的编号顺序,依次打
开含有肝脏的DICOM格式的CT图像，共N层；点击菜单栏Image→stacks→Images to stack，
软件自动将N幅图像转换成图像栈，即在一个窗口里以多线程的形式层叠N幅图像，并行
处理。只要内存允许，ImageJ软件能够打开任意多的图像进行处理。
2.2.2图像预处理
DICOM格式的图像栈每像素16位存储，为得到最佳的图像分割效果，需要先对栈进行预处
理。通过点击菜单栏Image→Adjust→Window/Level，调节图像栈的窗宽、窗位，本文中窗
宽、窗位为300 HU、40 HU；点击Image→Type→8-bit将168位图像，灰度值范围为0-255，
并将此时的图像栈保存命名为“原始栈图像”以备用；点击菜单栏Process→Enhance Contrast，
对栈作图像增强处理；Process→Smooth对栈进行平滑处理。
2.2.3阈值分割和二值化
阈值分割是利用灰度直方图分分布，选择合适的阈值Threshold，并把灰度图像分成目标与
背景。ImageJ软件提供了阈值化的用户窗口，单击菜单栏Image→Adjust→Threshold，弹出
Threshold窗口，拖动滑块调整阈值，对图像栈进行阈值分割。本文使用两个阈值同时调整
的方法，阈值的大小选取根据实时的调整确定，一般最小值为100，最大值为230，单击Apply
后得到二值化图像；单击菜单栏Process→Binary→Outline，获得图像的边缘轮廓，得到“边
缘图像”。
2.2.4创建感兴趣区域
打开已保存的“原始栈图像”，单击Process→Image Calculator，弹出Image Calculator窗口，
在Image1栏选择“原始栈图像”，Image 2栏选择“边缘图像”，Operation栏选择Subtract，
对两算（原始栈图像减去边边缘轮廓的图像栈，本文称之为“减图像”；如果“减图像”中
肝脏的边缘轮廓是闭合的，可利用软件的魔术棒工具直接点击肝脏边缘的任意一点，自动获
得感兴趣区域，黄线即为肝脏感兴趣区域（Region of interesting,ROI），工具栏灰暗区是魔术
棒工具；但是如果“减图像”中肝脏的边缘轮廓存在不连续的地方，需要利用软件画笔工具
连接断开的边缘，这样获得闭合的肝脏边缘后，再利用魔术棒工具得到感兴趣区域。
2.2.5计算肝脏体积
获取栈的第一幅CT图像的ROI后，点击菜单栏Analyze→Tools→ROI Manager„，在弹出的
ROIManager窗口中点击Add，软件自动添加第一幅图像的ROI数据；然后利用魔术棒工具
创建第二幅图像的ROI，并在ROI Manager窗口中点击Add，添加第二I数据，之后依次对
栈图像做以上处理，直到添加完N幅图像的ROI数据，点击ROI Manager窗口中的Measure
按钮，软件自动弹出Result窗口显示所有感兴趣区域的面积计算结果，单击File→Save As
可自动存为Excel格式文件，利用Exc算各层面ROI面积和层厚的乘积，再累加各项乘积，
得到肝脏总体积。本文计算肝脏体积为1264.056cm3。
3小结
ImageJ软件是一种支持Java语言的图像分析与处理软件，该软件开放源代码，占用内存空
间小，图像处理速度快，可以在Windows、Mac OS、Mac OSX、Linux等操作系统上运行，
支持DICOM，JPEG，BMP，TIFF，GIF,FITS等多种图片格式，可对医学影像图像直接分析和
处理；ImageJ软件还可用来做肝脏CT容量分析，它的好处是可以免费下载，在不需要放射
科医生的支持下，外科医生可在个人电脑上独立进行肝脏CT容积的分析。此外ImageJ支持
宏语言和插件扩展功能，使用ImageJ内置的文本编辑器和Java编译器开发Java语言的各种
插件，可完成对ImageJ的扩展，这种机制使专业人员能够通过Java编程完善该软件，并实
现相应专业领域的特殊用途扩展，自定义的插件可以解决几乎所有图像处理和分析方面的问
题。该软件目前已被广泛用于医学生物图像的处理，如显微镜图像细胞计数、细胞分割，医
学检验图谱分析[2]等，在国外被较多地应用于通讯、信息技术、航海航空等工程技术领域[3]。
参考文献
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王银改.I m a g e J软件在检验医学图像分析处理中的应用[J].中华检验医学杂[1][2][4][3]收稿
日期：2010-04-20[5]志,2005(7):747-748.
Keagan Moodley,Hugh Murrell.A colour-map plugin for the open source,Javabased,image
processing package,ImageJ[J].Computers Geosci，2004,30:609-618.
张国华.旋转DSA在肝动脉造影中的应用[J].中国医学装备，2007,4(6):42.
