碱性单细胞凝胶电泳铺胶技术的改进
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DS电泳太慢和带弥散的改进措施建议改进措施:1.可以适当进一步地拉开浓缩胶和分离胶之间的pH值,比如浓缩胶为pH=6.6,分离胶为pH=8.9。
2.可以考虑加高电泳时,浓缩胶的电压为90-100 V,分离胶的电压到120V-200V,;浓缩胶和分离胶有时候可能都设成150 V也能电泳成功。
3.使用全新配置的缓冲溶液。
4.适当该种胶浓度下使用分离效果明显的Marker。
5.保持各种蛋白质样品和Marker在上样前能够充分溶解,上样前最好离心一下,实在溶解不掉的颗粒就去掉。
6.适当调整聚丙烯酰胺的凝胶浓度。
7. 聚丙烯酰胺的充分聚合,可提高凝胶的分辨率。
建议做法:待凝胶在室温凝固后,可在室温下放置一段时间使用。
忌即配即用或4度冰箱放置,前者易导致凝固不充分,后者可导致SDS结晶。
一般凝胶可在室温下保存4天,SDS可水解聚丙烯酰胺。
8.样品缓冲溶液用:Tris-HCl缓冲溶液,电泳缓冲溶液用:Tris–Gly缓冲溶液。
9.分离胶的浓度应高于浓缩胶,但是胶浓度高会引起电泳时间变长,电泳时间会引起电泳带弥散。
具体的参考的凝胶浓度参见附录。
控制好电泳时间,别把样品跑出了胶外。
附录:1.样品处理(充分溶解样品):根据样品分离目的不同,在上样前对样品进行的溶解处理主要有三种处理方法:还原SDS处理、非还原SDS处理、带有烷基化作用的还原SDS处理。
(1)还原SDS处理:在上样buffer中加入SDS和DTT(或Beta巯基乙醇)后,蛋白质构象被解离,电荷被中和,形成SDS与蛋白相结合的分子,在电泳中,只根据分子量来分离。
一般电泳均按这种方式处理,样品稀释适当浓度,加入上样Buffer,离心,沸水煮5min,再离心加样。
(2)带有烷基化作用的还原SDS处理:碘乙酸胺的烷基化作用可以很好的并经久牢固的保护SH基团,得到较窄的谱带;另碘乙酸胺可捕集过量的DTT,而防止银染时的纹理现象。
100μl 样品缓冲液中10μl 20%的碘乙酸胺,并在室温保温30min。
大学物理化学实验“胶体电泳”的改进研究作者:韩锡光,李秋艳来源:《大学教育》 2017年第11期[摘要]Fe(OH)3胶体电泳是物理化学电学部分的一个重要实验,本文针对该实验耗时长、电泳实验现象不明显等问题,给出了适当的修改建议,即重新调整实验步骤和时间分配;稍提高渗析温度、延长单次渗析时间、减少渗析次数对胶体进行纯化;改用最后的渗析液作辅助液;选用较粗的电泳U型管和较粗的石墨电极,根据电极距离确定合适的外加电压值,经以上措施,较成功地完成了电泳实验。
[关键词]物理化学实验;胶体电泳;实验改进[中图分类号]G642.0 [文献标识码] A [文章编号]2095-3437(2017)11-0084-03物理化学是从物质的物理现象和化学现象的联系入手,来探求化学变化基本规律的一门科学。
物理化学实验则借用物理和数学的方法来完成化学测试表征任务,是一门多学科交叉的实验科学。
[1]物理化学实验作为一门独立的基础实验课,是学生学习和研究物理化学的重要手段和途径,是物理化学教学的重要组成部分,在物理化学教学中起着举足轻重的作用。
[2]胶体电泳实验是物理化学实验电学部分的一个重要实验,该实验的目的是使学生掌握Fe (OH)3溶胶的制备和纯化方法,掌握电泳法测定胶粒的电泳速度和ζ电位的方法,它对于学生理解胶体的电学性质、电泳情况以及电动电势概念具有重要的意义。
[3]但是现实中,学生在做此实验时成功率不高,主要存在以下问题:(1)实验操作步骤繁琐,胶体制备纯化耗时长,时间分配不合理,学生缺少耐心,经常在实验等待期无所事事。
(2)电泳实验现象不明显,界面不迁移或界面模糊迁,移速度慢。
第二个问题的出现将直接导致实验的失败。
针对以上两个主要问题,各种文献报道中亦有很多改进措施。
高明国等针对Fe(OH)3胶体纯化时间长的问题,利用电渗析法代替传统渗析法来纯化胶体,缩短了纯化时间,节省了蒸馏水。
[4]董家新等将传统火棉胶渗析袋换为硫酸纸半透膜材料,采用热渗析和大接触面积,提高了胶体的渗析效率。
将混有待测细胞的琼脂糖铺于载玻片上,凝固后浸入冷溶解液中使细胞裂解,在电泳液中解链后水平电泳,洗涤后用DNA 结合荧光染料染色,在荧光显微镜下观察玻片上细胞的荧光图像,评价DNA 的损伤程度。
3.1 形状指标这是一类比较粗略的指标。
根据细胞荧光图像是否象慧星一样头尾分明将其分为慧星一样细胞和非慧星样细胞,计数一定量细胞中慧星样细胞所占的比例,即慧星样细胞发生率,估计DNA 的损伤程度。
这种指标可通过镜下观察直接得到,方便实用。
3.2 距离指标直接在显微镜下或在照片上测出慧星的一些长度数值,如尾长,即沿电泳方向“慧星”尾部最远端与头部中心间接的距离;总慧星长度,即“慧星”电泳方向上的最大长度;尾长与头部直径比值等,以评价DNA损伤程度。
这些指标描述电泳中DNA泳动的距离,易于测量,无需复杂的仪器设备及图像处理软件,而且在损伤因素剂量较大时,这些数值的大小与作用剂量之间有较为良好的线性关系。
3.3 强度指标Ostling等人最初用SCGE 技术检测射线对DNA损伤时用“慧星”头部中心处荧光强度与电泳方向上一定距离处荧光强度的比值来描述DNA 的损伤。
PoI1er 等人用“慧星”尾部总荧光强度同“慧星”头部总荧光强度的比值来表示DNA 的损伤程度。
新近有报道根据“ 星”尾部荧光强度将细胞分为五类,由弱到强分别计为0、1、2、3、4,将100 个细胞的分值加在一起表示DNA 的损伤程度,并证明该数值与总慧星长度有较好的相关性。
这些指标都不同程度地反映了电泳中泳动DNA 的量。
3.4 “矩”类指标为反映DNA 损伤,上述距离类指标和强度类指标均不全面,有实验证明损伤因素作用剂量增大时,DNA 损伤程度明显增加而尾长基本不变。
为将二者结合起来,更全面反映DNA 损伤程度,Olive 等人于1990 年首次描述了“尾矩”(tail moment ,TM )的概念,定义为尾部DNA 占总DNA 的百分比与头、尾部中心间距的乘积。
单细胞凝胶电泳试剂盒(彗星实验)使用说明书一 单细胞凝胶电泳实验介绍单细胞凝胶电泳( Single Cell Gel Electrophoresis, SCGE) 又名彗星试验(comet assay), 1984 年起用于检测的真核细胞的DNA 断裂和修复,具有方法灵敏、快速优点,同时既可以定性又可以定量,目前DNA 损伤检测的其他方法(Giemsa 染色法,TUNUL 法、DNA 电泳梯度法、流式细胞检测法)是无法比拟的。
彗星实验是检测DNA 微损伤和修复的新方法,得到国际遗传毒性检测程序工作会议认可。
彗星实验是简单、快捷检测DNA 微损伤的方法,被广泛应用于遗传毒理、放射生物学、生物监测、癌症化疗和细胞凋亡、衰老等领域。
是一个十分成熟的技术,逐渐成为快速检测DNA损伤的一种方法,尤其应用于新药开发、保健品开发、化妆品开发、环境监测和毒理学研究等领域。
彗星实验具有以下优点:1 适用范围广,不仅适用于静止状态的细胞,且对T 和B 淋巴细胞敏感;2 所需实验器材较少,一台荧光显微镜和一套电泳装置即可完成彗星实验;3 实验流程短,一天可完成一个实验流程,且图像获取和数据分析可隔日完成;4 安全性好,避免了同位素的使用;5 在单细胞水平上对DNA 损伤进行可视性检测;6 准确性好、灵敏度高;7 属于新技术,客观实际,国际遗传毒性学术委员会认可。
二、试剂盒组成(见试剂盒内)三、试剂使用说明(见试剂盒内)四、操作步骤1.各种细胞用冰冷的PBS 洗一次,离心收集,用PBS 重悬,密度为1×104-5个/ml。
2.铺胶:下述各浓度琼脂糖凝胶均用PBS 配制。
3.第1 层凝胶的制备:将加热熔解的正常熔点琼脂糖(NMA),冷至45-60℃,取适量铺于载玻片CometSlide上,再置4℃下10min 使NMA 凝固。
也可以先铺胶,晾干后无尘存放,1周内使用(据经验,此法较优)。
4.第2 层凝胶的制备:低熔点琼脂糖LMA在60-70℃水浴加热至少20min 使之完全溶化,冷至37℃(可以放置于细胞培养箱中或水浴箱冷却至37℃,低熔点琼脂糖LMA在37℃可维持3小时)。
凝胶电泳实验中的关键步骤与优化策略凝胶电泳是一种常用的生物分析技术,广泛应用于DNA、RNA和蛋白质等生物大分子的分离和检测。
在凝胶电泳实验中,关键步骤的正确操作和优化策略的选择对实验结果的准确性和可重复性起着至关重要的作用。
首先,凝胶制备是凝胶电泳实验中的第一步,也是至关重要的一步。
凝胶的选择和制备条件直接影响到分离效果和分辨率。
常用的凝胶有琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶。
琼脂糖凝胶适用于较大分子量的核酸和蛋白质分离,而聚丙烯酰胺凝胶适用于较小分子量的核酸和蛋白质分离。
在制备凝胶时,需要控制好凝胶浓度、聚合物交联程度和凝胶孔径大小,以达到最佳的分离效果。
其次,样品处理是凝胶电泳实验中的另一个关键步骤。
样品的处理包括DNA 或蛋白质的提取、纯化和浓缩等过程。
对于DNA样品,可以通过酚/氯仿提取或商用提取试剂盒进行提取。
对于蛋白质样品,可以通过离心、超滤或电泳浓缩等方法进行浓缩。
样品处理的关键是要避免污染和损失,确保样品的完整性和稳定性。
然后,样品加载是凝胶电泳实验中的重要步骤之一。
样品加载的目的是将样品均匀地加载到凝胶孔中,以便进行分离和检测。
在加载样品时,应该控制好样品的体积和浓度,避免过多或过少的样品导致分离效果不佳。
此外,还可以使用DNA 或蛋白质标记物来确定加载位置和分子量。
最后,电泳条件的选择和优化是凝胶电泳实验中的关键策略。
电泳条件包括电泳缓冲液的选择、电场强度的控制和电泳时间的设定等。
电泳缓冲液的选择应根据实验需要来确定,常用的缓冲液有TAE缓冲液和TBE缓冲液。
电场强度的控制要根据样品的大小和分离要求来确定,一般情况下,较大分子量的样品需要较低的电场强度,而较小分子量的样品需要较高的电场强度。
电泳时间的设定要根据实验目的和样品的分离情况来确定,一般情况下,电泳时间越长,分离效果越好。
综上所述,凝胶电泳实验中的关键步骤包括凝胶制备、样品处理、样品加载和电泳条件的选择和优化。
正确操作这些步骤并选择合适的优化策略,可以提高实验结果的准确性和可重复性,从而为生物学研究和临床诊断提供可靠的数据支持。
凝胶电泳与蛋白质印迹技术实验方法的改进和探索
廖志银;霍朝霞;翁登坡;赵鲁杭;于晓虹
【期刊名称】《现代盐化工》
【年(卷),期】2022(49)6
【摘要】凝胶电泳与蛋白质印迹技术是生命医学研究领域的常用技术,但因此项技术步骤较多、操作复杂,学生在实验过程中出现的问题较多,结果不稳定,重复性差。
为使学生能熟练且稳定地掌握该技术,对十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)及蛋白质印迹技术进行了长期的实践和探索,通过改进凝胶各成分配比方案,不断完善和优化实验条件,有效增强了凝胶配制的时效性,大大提高了凝胶电泳后续实验的稳定性和成功率。
通过优化蛋白印迹过程中抗体的使用浓度,印记杂交结果目标蛋白质条带更加清晰可见,易分析,重复性好。
【总页数】4页(P22-25)
【作者】廖志银;霍朝霞;翁登坡;赵鲁杭;于晓虹
【作者单位】浙江大学医学院基础医学实验教学中心
【正文语种】中文
【中图分类】G63
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第19卷第4期 安康学院学报 Vol119№4 2007年8月 Journal of Ankang University Aug12007蛋白质凝胶电泳及染色方法的几点改进陈 芳,陈久存(安康学院化学与生命科学系,陕西安康725000)摘 要:S DS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(S DS-P AGE)及染色技术,是常用测定蛋白质亚基分子量的方法之一,具有设备简单、操作方便和分辨率高等优点1但在操作中,尤其样品较多时,此方法仍然有一些不足之处1通过大量实践,做以下改进:建立根据不同相对分子量的蛋白质快速选择凝胶浓度的方法,并确立解决蛋白质凝胶电泳和染色过程中的常见问题及改进策略1关键词:S DS-聚丙烯酰胺凝胶电泳;考马斯亮蓝染色;蛋白质银染中图分类号:Q51 文献标识码:A 文章编号:1674-0092(2007)04-0078-03Severa l I m provem en ts of the Prote i n Gel Electrophoresis and St a i n i n g M ethodCHE N Fang,CHE N J iucun(The D epart m ent of Che m istry and L ife-Science,A nkang U niversity,A nkang725000,Shaanxi,China) Abstract:The techn ique of the SD S-PAG E and dye ing is one of com m on ly used m e thods of the D e te r m in ing of p ro2 te in m o lecu la r w e igh t1Th is m e thod has m e rit of the s i m p le equ ipm en t,the ease of O p e ra tion and the h ighe r reso lving ra tio and so on1B u t in the p rocess of op e ra tion,th is m e thod s till has som e defic ienc ies,esp ec ia lly fo r m any sam2 p les1Th rough the m ass ive p rac tices,has m ade fo llow ing i m p rovem en t to th is m e thod:es tab lishes the sp lit-second se lec tion ge la tin dens ity m e thod w ith d iffe ren t p ro te in re la tive m o lecu la r w e igh t,and es tab lishes the so lu tion p ro te in ge l e lec trop ho res is and the dye ing p rocess frequen tly ques tions s tra tegy1Key words:SD S-Po lyac rylam ide ge l E lec trop ho res is;coom ass ie b rillian t b lue s ta in ing;s ilve r s ta in ingS DS-P AGE及染色技术在蛋白质的分析中,具有设备简单,操作方便,所需样品量少(1~100μg),分辨率较高等优点,在分析或研究中应用范围广泛1可用于蛋白质、酶、核酸等生物分子的分离、定性、定量及少量的制备,还可用于测定分子量、等电点等〔1-2〕1该方法主要依据S DS-聚丙烯酰胺凝胶体系中,使蛋白质样品与S DS结合形成带负电荷的复合物,由于复合物的分子量不同,在电泳中反映出不同的迁移率,根据标准蛋白质样品在该系统电泳中所作出的标准曲线,就可以推算出被测蛋白质样品的相对分子量1在聚丙烯酰胺凝胶系统中,蛋白质分子的电泳迁移率主要取决于它的分子量大小,而其他因素对电泳迁移率的影响可以忽略不计〔3-5〕1因此,快速有效地利用S DS-P AGE及染色技术进行相关领域研究是十分有必要的11 材料与方法111试剂和主要仪器S DS、Tris-base、标准分子量蛋白质均购自北京鼎国生物有限公司,丙烯酰胺、甲叉丙烯酰胺购自华美生物工程公司,5804R高速冷冻离心机购自Eppendorf公司产品,紫外分光光度计购自日本岛津,24D垂直电泳槽为北京六一公司产品1112方法11211凝胶电泳溶液的配制凝胶溶液、样品处理液、电泳缓冲液及考马斯亮蓝染色液均按文献〔6〕方法配制及存储;银染液的配制、保存均按文献〔7〕方法1①收稿日期:2007-03-10作者简介:陈芳(1979-),女,陕西旬阳人,安康学院化学与生命科学系教师,硕士,主要从事蛋白质分离纯化及活性研究1 8711212不同浓度凝胶分离标准分子量蛋白质采用垂直、不连续S DS -P AGE 对标准蛋白质样品和牛血清白蛋白组分五进行分析1凝胶浓度分别为:浓缩胶浓度为315%,分离胶浓度分别为8%、10%、12%和15%1将标准蛋白质样品、牛血清白蛋白组分五分别与样品缓冲液等体积混合后沸水浴3-5m in,上样1置于电泳仪,恒流40mA 电泳分离各种蛋白质样品1电泳完毕后固定凝胶,并用银染或考马斯亮兰染色和显色1标准蛋白质样品含有分子量分别为615、1615、2510、3215、4715、6210、8310、17510k D 的成分,作为小、中、大分子量的标准蛋白质,用牛血清白蛋白组分五(BS A 分子量:6612k D )与标准蛋白质分别在8%、10%、12%和15%的凝胶中进行电泳,以进行凝胶浓度选择实验111213蛋白质凝胶电泳的染色分离胶用去离子水冲洗干净,置于含有凝胶体积10倍左右固定液的培养皿中,室温放置于脱色摇床,固定4-12h 1分别采用考马斯亮蓝染和银染,进行蛋白质凝胶电泳结果分析12 结果和讨论211凝胶浓度的选择图1 不同凝胶浓度蛋白质的S DS -P AGE 结果图(M:标准分子量蛋白质(单位:k D ),BS A 为牛血清白蛋白组分五,分子量为6612k D,从左向右凝胶的浓度依次为8%、10%、12%和15%,蛋白样品上样量均为20μL 1)利用S DS -P AGE 测定蛋白质分子量时,往往根据待测蛋白质样品的分子量大小,选择不同浓度的分离胶1由于各种蛋白质的分子量差异很大,不同大小蛋白质分子量的测定,需要用不同浓度凝胶进行凝胶电泳分析1图1表示:标准分子量蛋白质和牛血清白蛋白组分五(BS A ),在不同浓度凝胶中的电泳区带1表1表示:不同浓度分离胶电泳可分离的最佳蛋白质分子量范围1表1 不同浓度凝胶测定蛋白质分子量的比较分离胶浓度8%10%12%15%浓缩胶浓度315%315%315%315%凝胶性质较软适中适中较脆分离蛋白质的M r 120-50k D 60k D 左右45-15k D 20k D 以下 由图1和表1可知:8%浓度的凝胶(比8%浓度再小的凝胶,柔软性较大,无法进行蛋白质染色分析)对较大分子量蛋白质有一定的分离作用,而对分子量在20kD 以下的小分子蛋白质分离效果较差;10%、12%浓度的凝胶对中间分子量(15-80k D )分离效果较好;15%的凝胶对20kD 以下的小蛋白质和氨基酸肽段有较好的分离效果1212蛋白质凝胶电泳和染色过程中常见问题及改进策略21211凝胶电泳的溴酚蓝前沿不齐正常情况下,采用S DS -P AGE 分析蛋白质样品时,溴酚蓝区带总是跑在电泳泳道的最前沿且呈现直线1这样才能通过标准分子量蛋白质准确判断和分析待测样品的分子量1但有时在进行S DS -97陈 芳,陈久存:蛋白质凝胶电泳及染色方法的几点改进P AGE 发现,溴酚蓝前沿不齐,呈现波浪形和斜线形1上述溴酚蓝前沿不正常的现象,主要由以下几方面造成:(1)电泳的溴酚蓝前沿呈现波浪形,是由于电泳浓缩胶缓冲液或分离胶缓冲液的pH 不准确造成的;只需将浓缩胶和分离胶pH 重新调准即可解决1(2)电泳的溴酚蓝前沿呈斜线形,主要有两种可能的原因1其一,进行垂直电泳时,凝胶底部存在有大量气泡,而电泳前又没有及时赶掉气泡1解决办法是:放凝胶时,应将凝胶板缓慢斜放进电泳槽里,或者稍稍左右倾斜电泳槽几次以排掉凝胶板底部的气泡1其二,进行垂直电泳时,用了多次回收的电泳缓冲液(回收的电泳缓冲液pH 和离子浓度有所改变)或长久放置的电泳缓冲液(可能有细菌污染),电泳缓冲液可回收利用1-3次121212蛋白质凝胶在固定中应注意的问题电泳完毕后,应及时将分离胶用去离子水冲洗干净,置于含有一定体积固定液的培养皿中进行固定1盛电泳凝胶的表面皿应放在脱色摇床,缓慢摇动固定4-12h 1固定时间要严格控制,固定的时间过短,在染色过程中含量微小的蛋白质条带将会丢失;固定时间过长将会出现胶片变形或染色出来胶面背景过高且蛋白区带不清晰1图2表示:不同的固定时间与蛋白质染色效果对比1由图2可知:凝胶的最佳固定时间应为4-12h 1图2 固定时间与蛋白质染色效果比较图a:为固定时间过短;b:为固定时间4-12h;c:为固定时间过长21213蛋白质凝胶染色过程中应注意的问题蛋白质凝胶染色过程中注意的问题主要有:(1)考马斯亮蓝染色:染色液配好后应过滤除去杂质和固体颗粒,染色液不能多次重复利用,否则显出的条带不清晰1(2)银染:此法染色可以检测到110-011ng 的蛋白质1在S DS -P AGE 进行银染时,应注意几点:首先,在染色过程中必须使用干净的玻璃器皿和去离子水,因水中离子会大大降低银染的灵敏度1其次,在加硝酸银染液前,必须用乙醇溶液将固定液除去,否则蛋白质条带不清1最后,硝酸银染液、银染显色液应在临用前现配,加银染液后摇床应缓慢摇动(注意不要太剧烈)以防银粒从蛋白质区带上脱落1参考文献:〔1〕郭尧君1蛋白质电泳实验技术〔M 〕1北京:科学出版社,19991〔2〕陆建1蛋白质纯化技术及应用〔M 〕1北京:化学工业出版社,20051〔3〕Harris E LV 1Pr otein purificati on methods a p ractical app r oach 〔M 〕1I RL Press,Oxf ord University Press 119891〔4〕Davis,BJ 1D isc electr ophoresis II 1Method and app licati on t o hu man seru m p r oteins 〔J 〕1Ann 1N 1Y 1Acad 1Sci 11964,121:4041〔5〕O rnstein,L 1D isc electr ophoresis I 1Backgr ound and Theory 〔J 〕1Ann 1N 1Y 1Acad 1Sci 11964,121:3211〔6〕汪家政,范明1蛋白质技术手册〔M 〕1北京:科学出版社,20001〔7〕金冬雁,黎梦枫等译1分子克隆实验指南〔M 〕1北京:科学出版社,1999108第19卷 安康学院学报 2007年。
凝胶电泳在蛋白质分析中的应用凝胶电泳(Gel Electrophoresis)是一种常见的分离技术,在蛋白质分析中有着广泛的应用。
凝胶电泳通过将不同大小、电性的蛋白质分子沿电场分离移动,从而达到单独检测和研究不同蛋白质的目的。
本文将对凝胶电泳在蛋白质分析中的应用进行介绍。
一、凝胶电泳原理凝胶电泳是通过电场作用,将蛋白质分子分离开来。
当蛋白质分子在凝胶中向电极移动时,会受到电场力和凝胶中的孔隙阻力的相互作用。
电场力越大,蛋白质分子移动速率越快。
孔隙阻力则取决于凝胶中孔隙的大小和形状,孔隙越小,阻力越大,移动速率越慢。
因此,不同大小、电性的蛋白质分子沿着凝胶中的孔隙逐渐分离。
通常在凝胶电泳中使用的凝胶有两种:聚丙烯酰胺凝胶和琼脂糖凝胶。
前者通常用于高分辨率的分离,而后者则适用于分子量较大的蛋白质。
这两种凝胶中均含有交联剂,可以在蛋白质分子之间形成交联,使凝胶具备一定的稳定性。
同时,为了进一步提高凝胶电泳的分辨率和灵敏度,可以利用一些染料和蛋白印迹等技术进行检测。
二、凝胶电泳在蛋白质分析中应用广泛,主要用于分离、定量、检测和研究不同蛋白质。
下面将针对常见的几种应用进行介绍。
1. 蛋白质分子量的测定蛋白质的分子量通常是其生化性质的一项关键参数。
凝胶电泳对于蛋白质分子量的测定具备很高的准确性和灵敏度。
通过将蛋白质进行凝胶电泳分离,再根据不同蛋白质的相对迁移距离和标准品的相对分子质量进行比较,可以精确地测定蛋白质的分子量。
2. 蛋白质的分离和检测凝胶电泳可以将混合蛋白质分子分离开来,从而使不同的蛋白质单独检测。
同时可以通过向凝胶中加入一些特定的染料进行染色,以便于观察和分析。
如常见的Coomassie蓝染色、银染色等,可以将分离的蛋白质显色后直接检测。
3. 蛋白质的定量在凝胶电泳分离过程中,蛋白质分子在凝胶中的迁移距离与其浓度成正比。
因此,可以通过比较标准品和待定测样的迁移距离,计算出待定测样的蛋白质浓度,从而实现蛋白质的定量分析。
3复旦大学985项目基金资助碱性单细胞凝胶电泳铺胶技术的改进3高建军 丰盛梅 金慰芳(复旦大学放射医学研究所骨代谢研究室上海 200032)
【摘要】 目的 聚苯乙烯孔槽单层铺胶技术在碱性单细胞凝胶电泳中的可行性研究。方法 自制聚苯乙烯孔槽的载胶片,将1%低熔点凝胶与淋巴细胞混合后单层铺胶,经6Gyγ射线照射后进行碱性单细胞凝胶电泳,观察胶面和淋巴细胞的DNA损伤情况。结果 载胶片孔槽单层灌胶后胶面平整,操作过程无脱落;淋巴细胞DNA电泳图像清晰,6Gy照射产生的“彗星”形态特征明显。结论 采用聚苯乙烯孔槽进行单层铺胶的技术,可以克服碱性单细胞凝胶电泳中的胶板脱落等问题。【关键词】 碱性单细胞凝胶电泳; 聚苯乙烯孔槽; 琼脂糖; γ射线照射【中国图书馆分类法分类号】 R811.5
ImprovementofGelPreparationonAlkaliSingleCellGelElectrophoresisGAOJian2jun,FENGSheng2mei,JINWei2fang(BoneMetabolismDepartment,InstituteofRadiationMedicine,FudanUniversity,Shanghai200032,China)
【Abstract】 Purpose Todeterminethepossibilityofthemono2layergelonploystyrenepondsusedinalkali
singlecellgelelectrophoresis(ASCGE). Methods Thecarriedslicewaspreparedwiththecoveroftis2sue2cultureplate.Themono2layergelplatesweremadebyfillingthepolystyrenepondswith1%LMAem2beddedlymphocytesandexposedto6Gyγraysirradiation,thenanalysiswereperformedbycometassayinalkalinesolution. Results Thegelsurfacewassmoothandglossyandtherewasnogeldepartureordriftintheoperateprocess.TheDNAimageswereclearandthecometmorphologicalcharacterwasshowedobvi2ouslyinthecellsexposedto6Gyγraysirradiation. Conclusions Themono2layergelonpolystyrenepondscanavoidthegeldepartureanddriftinASCGE.【Keywords】 alkalisinglecellgelelectrophoresis; polystyrenepond; agarose; γraysirradiation
碱性单细胞凝胶电泳(alkalinesinglecellgelelectrophoresis,ASCGE)技术,是单细胞凝胶电泳,又称彗星分析技术(cometassay)中的一种技术,可于单细胞水平快速灵敏检测DNA单链断裂而得到广泛应用。但其制胶步骤多、时间长,胶板易损坏和胶落的问题没有很好解决,给该技术的规范和推广带来一定困难。因此,我们尝试采用聚苯乙烯孔槽进行铺胶,简化操作步骤。材料和方法载胶片准备 取96孔细胞培养板(NUNC)盖,用美工刀裁成25mm×68mm大小载胶片(共16孔)若干,蒸馏水冲洗,置清洁处晾干。铺胶 取淋巴细胞悬液(肝素抗凝,淋巴细胞分离液分离,锥虫蓝排斥试验存活率大于95%),PBS稀释为4×10
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/mL后与1%低熔点凝胶(LMA,
SIGMA)按体积1∶3混合,平铺在预温的载胶片孔槽内(18μL/孔),即转移至4℃暗盒。照射 将铺胶的载胶片置4℃湿盒内于137Cs放
射源(剂量率为0.9Gy/min,GammaCell40)接受单次6Gy照射。对照组带入准备室,不受照。裂解、解旋和电泳 将受照后的载胶片小心浸入裂解液(2.5mol/LNaCl,100mmol/LNa
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TA,100mmol/LTirs,pH10;临用前加入1%Tri2tonX-100和10%DMSO)于4℃暗盒进行细胞裂解1h20min。经0.4mol/LTris缓冲液漂洗后浸入电泳液(30mmol/LNaOH,1mmol/LNa
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2ED2
TA,pH13)于4℃暗盒进行DNA双链解旋20min,电泳(18V,70mA)30min。阅片 经0.4mol/LTris缓冲液中和后,在胶
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复旦学报(医学版)
FudanUnivJMedSci2004May,31(3)上滴加溴化乙锭(EB,15μg/mL),每孔约5μL,于4℃暗盒染色10min。用滤纸吸去载胶片上过多液体后,置荧光显微镜下观察和图像采集(NikonDXM1200)。结 果载胶片上单层灌胶后产生的凝胶胶面平整,操作结束无胶落(图1)。DNA分子经EB染色后,在紫外线照射下呈红色。对照组DNA分子聚集在细胞核,电泳图像清晰,而6Gy照射后产生的DNA碎片经电泳扩散形成“彗星尾”状影像,形态特征明显(图2)。图1 聚苯乙烯孔槽上的凝胶胶面Fig1 Photographsofpolystyrenepondswithgel图2 碱性单细胞凝胶电泳Fig2 TypicalimagesofalkalisinglecellgelelectrophoresisA:Untreatedhumanbloodlymphocytes;B:Humanbloodlymphocytesexposedto6Gyofγrays 讨 论ASCGE技术自Singh等[1]建立以来,被广泛应用于电离辐射、紫外线和氧化以及化学药物引起的DNA损伤检测,其操作规范已引起广泛重视[2]。近年来尽管已在制胶等各方面进行不断改进[3,4],如由传统的磨毛载玻片上铺3层凝胶的“夹心法”改进为2层或单层灌胶法,但胶板易损坏和胶落的问题仍没有得到很好解决,并且操作步骤多、时间长,给该技术的规范和推广带来一定困难。实验失败的原因主要包括盖玻片揭取或推移时对凝胶板造成的撕裂或移动,强碱对玻璃表面的侵蚀作用和电泳过程产生的温度升高等,使胶与玻璃表面贴附不稳定,使之在随后的浸入或取出操作时脱落或漂浮。碱与玻璃的反应产物可能也是胶中颗粒性杂质的主要来源。因此选择在碱性溶液中稳定的材料,避免盖玻片推移和减低电泳时温度等是必要的。为此,我们根据聚苯乙烯材料性质稳定的特点,
用96孔培养板盖来裁制载胶片,利用孔凸边形成的圆形凹槽进行单层铺胶,基本克服以上缺点。胶片大小可根据需要来定,一般接近载玻片大小易于观察操作,如25mm×68mm或35mm×68mm大小,可有2或3列共16或24孔供分组选用,其中两端各1行不灌胶,更于夹取和标记。铺胶时将37℃保温的1%LMA凝胶按3∶1比例加入细胞悬液,轻轻打匀后平铺入孔内,每孔灌胶15~20μL,可形成直径9mm厚约0.2~0.3mm的0.75%胶板,一般灌胶18
μ
L形成的胶面较平整,载胶片预温有利于
胶板牢固贴附。我们采用该聚苯乙烯孔槽单层铺胶的制胶方法缩短了铺胶过程,制成的胶面平整,在随后的裂解、电泳和中和等操作过程中无脱落。观察时减少了杂质干扰,DNA电泳图像清晰。6Gy照射产生的“彗星”形态特征清楚典型,与传统方法一致[5,6]。同时铺制的胶板大小一致,裂解、电泳和中和等操作的条件相同,单片上分组选择多,从而提高了各组数据的可比性,尤其适合普查等多样品分析使用。
参 考 文 献1 SinghNP,MccoyMT,TiceRR,etal.Asimpletechniqueforquan2titationoflowlevelsofDNAdamageinindividualcells.ExpCell
Res,1988,175:1842 HartmannA,AgurellE,BeeversC,etal.Recommendationsforcon2ductingtheinvivoalkalineCometassay.4thInternationalCometAssayWorkshop.Mutagenesis,2003,18(1):453 张遵真,衡正昌,李蕊,等.单细胞凝胶电泳试验的最适条件研究.卫生毒理学杂志,1998,12(4):249
4 张建平,田源,陈道达.单细胞凝胶电泳制胶方法的改进.癌变畸变突变,1998,10(3):189
5 OlivePL,FrazerG,BanathJP.Radiation2inducedapoptosismeasuredinTK6humanBlymphoblastcellsusingthecometassay.Radiat
Res,1993,136:1306 张军宁,洪承皎,朱寿彭.单细胞凝胶电泳检测外照射诱导DNA单链断裂和双链断裂.辐射研究与辐射工艺学报,2002,20(3):
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(收稿日期:2003-09-16)(编辑:张秀峰)
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