基因芯片技术在分枝杆菌菌种鉴定和结核耐药性检测中的应用及评价

生物芯片在结核分支杆菌抗体检测中的应用目的探讨利用生物芯片技术对结核分支杆菌抗体进行快速检测。

方法利用物芯片标本对2 000例确诊为结核的患者血液进行LAM、16- kDa、38- kDa 信号的检测及结果分析。

结果在2 000例结核患者中，结核LAM、16- kDa、38- kDa指标的检出率分别为47.2%（944/2000）、18.2%（364/2000）、23.2%（464/2000）。

结论生物芯片可用作结核病有效的临床诊断手段。

标签：生物芯片；结核；抗体；检测随着基因技术的快速发展，生物芯片在遗传病及蛋白检测中得到了广泛的应用。

20世纪90年代人们采用分子生物学的原理对结核等进行了相关的研究，并将其做为结核病在细菌学上临床诊断的手段之一，相关的研究也不断的深入。

当前，人们研究中使用的结核抗原主要有三种，包括：①结核致病细菌的细胞壁蛋白，常用的有38- kDa和16- kDa等蛋白；②结核细菌细胞壁的脂多糖抗原，产用的有LAM和TBGL等蛋白；③结核细菌的菌体。

我国现阶段的耐多药性结核病的临床发病率呈逐年增加的事态，结核病的早期诊断就显得尤为重要。

为探讨利用生物芯片技术对结核分支杆菌抗体进行快速检测，该研究以病原体蛋白分子为模型对结合LAM、38- kDa及16- kDa进行检测和分析。

在检测过程中把抗原点在芯片的膜表面，并将其与患者血清样本进行杂交，以CCD 原理对患者样本进行检测。

该研究就2009年1月—2012年12月间收治的2 000例结核患者的血清样本进行了测试，现将结果报道如下。

1 实验部分1.1 患者样品来源实验收集了确诊的结核病患者2000例的血清样本，并用50例医院健康体检的血清样本作为对照。

对受试着进行空腹取血，将抽取的血液以1500 转的速度进行离心后取上清液，并进行相关的样本的检测。

1.2 测试方法将蛋白与样本杂交后对样品进行编号处理，在蛋白芯片的盒窗口中加入 4 滴试剂A将芯片膜湿润。

基因芯片技术及其在结核分枝杆菌检测中的应用摘要：基因芯片技术，是指将已知核酸序列的DNA或RNA片段作为探针，在芯片上做成点阵，再与待测标本中的DNA或RN;片段，按照碱基互补配对原则进行杂交，经特定软件的分析处理，获取大量相关基因信息的技术。

本文对该技术及其在结核分枝杆菌检测中的应用进行综述。

关键词：基因芯片技术；结核分枝杆菌结核病是由结核分枝杆菌引起的一种慢性传染病，主要侵犯肺脏。

在某些经济欠发达地区，许多结核病患者因为得不到全程，合理的救治而产生结核耐药，这使得控制结核病的发生发展成为世界性难题。

目前，临床实验室采用的检测结核分枝杆菌的方法主要有抗酸染色法和细菌培养法等 .2001 年康润田[1]等应用抗酸染色、细菌培养、荧光染色、PCRPCR反向探针膜杂交法，检测59例标本(其中，结合组 43例，对照组 16例)中的结核分支杆菌，比较分析后，阳性率( %) 结果如下图：依上图，可以得出的结论为：抗酸染色法简便、实用、快捷 , 但非结核性分枝杆菌亦可出现阳性结果；细菌培养作为结核病诊断的金标准，虽优于抗酸染色法，但时间比较长，影响早期用药；荧光染色和PC是可供选择的检测方法，却可能出现假阳性和假阴性；而依赖于基因芯片的PC杂交梳法敏感性和特异性均高，是比较准确的检测方法[1]。

1.基因芯片基因芯片 (gene chip) 技术是随着“人类基因组计划” (human genome project,HGP) 的进展而发展起来的 , 它是 21 世纪以来影响最深远的重大科技进展之一 , 是分子生物学、微电子学及物理学综合交叉形成的高新技术。

1.1基因芯片的概念基因是指具有遗传效应的 DNA片段，位于细胞的染色体上。

我们将大量的基因片段按一定的顺序固定在特定的载体上，即为基因芯片，它是专门应用于核酸检测的一种生物芯片。

在一块约1cm2大小的芯片上，可固定数千甚至上万的基因片段，由此形成一个密集的基因方阵，方便对多个基因进行同步检测[2]。

the alb umin cobalt -binding tes t after a marath on race[J ].Clin Ch em,2002,48(7):1097-1100.[19]Can M ,Demirtas S,Polat O,et al.E valuation of effects of ischae -m ia on th e albu min cobalt binding (ACB )assay in patients ex -posed to trauma[J].Emerg M ed J,2006,23(7):537-539.(收稿日期:2010-07-01)综 述基因芯片在细菌及其耐药检测中的应用季 芳综述,伍 勇审校(中南大学湘雅三医院外科教研室,湖南长沙410013)关键词:寡核苷酸序列分析; 细菌; 抗药性,细菌DOI:10.3969/j.issn.1673-4130.2011.02.048文献标识码:A文章编号:1673-4130(2011)02-0240-03广谱抗生素的广泛使用易导致菌株变异和产生耐药性,迫切需要新的技术来解决如何快速、准确诊断病原,正确选择药物和合理用药等问题。

基因芯片不仅可以大量快捷地检测出耐药性菌株,进行细菌诊断、鉴别诊断、耐药性监测,而且可以检测引起细菌耐药的基因突变。

本文就基因芯片技术在细菌鉴定及其耐药检测、耐药机制研究方面的应用进展作一综述。

1 基因芯片技术基因芯片又称DN A 芯片、cDN A 微阵列或寡核苷酸微芯片,可一次性分析多种生物样品。

基因芯片技术采用了集成的方式,改变了弥补过去只能孤立研究单个基因在某个特定位置、特定时间表达状况的不足,具有检测范围广、检测速度快、样品用量少等特点。

基因芯片技术因其可快速、准确、高效地显示病原体的遗传信息,已广泛应用于基因序列分析、病原微生物的快速诊断、变异及耐药机制研究、基因分型、分子流行病学调查和抗感染药物研制等。

基因芯片技术对结核分枝杆菌耐药性检测的临床应用陈瑶;吴英松【期刊名称】《分子诊断与治疗杂志》【年(卷),期】2017(009)002【摘要】目的评价基因芯片技术对结核分枝杆菌耐药性检测的效果. 方法选取我院结核科2014年3月至2016年3月收治的涂片阳性的肺结核住院患者238例,取其痰标本,分别用基因芯片、传统的罗氏培养和药敏试验3种方法进行结核分枝杆菌的异烟肼耐药性检测和利福平耐药性检测;把罗氏培养和药敏试验的结果作为金标准,评价基因芯片技术的临床应用价值. 结果基因芯片技术检测涂片阳性患者痰标本异烟肼耐药的情况与金标准无显著差异(P＞0.05);利福平耐药的情况与金标准相比也无明显差异(p>0.05). 结论基因芯片能够快速、准确地检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼的耐药情况,是一种值得推广的临床实验室检测方法.【总页数】4页(P108-111)【作者】陈瑶;吴英松【作者单位】南方医科大学检验与生物技术学院,广东,广州510515;南方医科大学检验与生物技术学院,广东,广州510515【正文语种】中文【相关文献】1.基因芯片技术检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药性临床应用评价 [J], 许榕青;李丹;林银霞;黄明翔;陈新朝2.基因芯片技术在检测痰涂阳肺结核患者结核分枝杆菌耐药性的应用效果 [J], 陈林;沈静;朱大冕;王晓英3.基因芯片技术检测结核分枝杆菌对异烟肼耐药性的结果分析及临床价值 [J], 芮冬妹;朱珍;樊燕;王永忠4.基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐药性的临床价值 [J], 罗一钧5.基因芯片技术对结核分枝杆菌利福平及异烟肼的耐药性检测研究 [J], 孙桂英; 赵刚; 沈燕; 徐密琴; 高胜利; 俞净; 钮志林因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐药性的临床价值杨璟1 王丽玲2 胡荣2 肖杰2 阮小洁2 宋家武2发布时间：2023-05-14T03:07:24.287Z 来源：《中国科技人才》2023年5期作者：杨璟1 王丽玲2 胡荣2 肖杰2 阮小洁2 宋家武2 [导读] 目的：对结核分枝杆菌耐药性检测过程当中应用基因芯片技术的效果以及价值进行分析研究。

方法：从2019年1月至2022年11月在医院接受治疗的疑似患有结核病的患者当中随机无目的性地挑选200名参与到这一次实验研究当中。

结果：200名疑似患者当中阳性患者40名，占比20%，基因芯片检测结果显示结核病38例，非结核病2例，阳性几率为19%，耐药基因检测21例，利福平以及异烟肼基因突变3例，总突变几率为14.3%，其中，有2例为利福平以及异烟肼均耐药，双重基因突变几率为9.5%，另外1例只耐受利福平，利福平总突变几率为14.3%，异烟肼总突变几率为9.5%，耐多药几率为9.5%。

结论：结核分枝杆菌耐药性检测过程当中应用基因芯片技术具有明显的效果，能够有效减少诊断时间，提高工作效率，所以可以进行大范围推广应用。

1.珠海市人民医院呼吸科2.广东省基因芯片工程技术研究中心，珠海赛乐奇生物技术股份有限公司广东珠海 519001摘要：目的：对结核分枝杆菌耐药性检测过程当中应用基因芯片技术的效果以及价值进行分析研究。

方法：从2019年1月至2022年11月在医院接受治疗的疑似患有结核病的患者当中随机无目的性地挑选200名参与到这一次实验研究当中。

结果：200名疑似患者当中阳性患者40名，占比20%，基因芯片检测结果显示结核病38例，非结核病2例，阳性几率为19%，耐药基因检测21例，利福平以及异烟肼基因突变3例，总突变几率为14.3%，其中，有2例为利福平以及异烟肼均耐药，双重基因突变几率为9.5%，另外1例只耐受利福平，利福平总突变几率为14.3%，异烟肼总突变几率为9.5%，耐多药几率为9.5%。

基因芯片检测临床标本结核分枝杆菌目的：评价基因芯片檢测技术在结核病诊断中的效果。

方法：收集我院2012年4月至2013年6月符合标准的432例进行基因芯片耐药基因技术检测，同时进行传统比例法药物敏感试验，后者作为金标准，对两组检测结果进行比较评价。

结果：基因芯片技术检测结核菌异烟肼耐药性的灵敏度和特异度分别为78.13%和89.88%，与金标准差异有统计学意义（P＜0.01）；基因芯片技术检测结核菌利福平耐药性的灵敏度和特异度分别为86.57%和91.95%，与金标准差异有统计学意义（P＜0.01）；基因芯片技术检测结核菌同时耐异烟肼和利福平（耐多药）的灵敏度和特异度分别为70.11%和90.14%，与金标准差异有统计学意义（P＜0.01）。

结论：基因芯片检测技术是一种快捷、简便、灵敏度高的方法，对于结核菌耐药性的检测具有很好的效果，但直接用于临床标本检测结核菌的耐药性不够理想。

标签：基因芯片；结核分枝杆菌；耐药性结核病是一种严重危害人类健康的慢性传染病，曾一度得到控制，但20世纪80年代以来，全球呈现“复燃”的趋势，随着人类免疫缺陷病毒的出现，耐多药菌株的产生，耐药结核病控制工作面临着严峻的挑战。

为了进一步推进耐药结核病防治工作，医务工作者开展了大量基因芯片检测技术的研究，试图以基因芯片快速检测技术替代耗时的传统检测方法。

本研究以传统的比例法药物敏感试验为金标准，评估基因芯片技术检测临床各种标本中结核分枝杆菌对异烟肼、利福平耐药性的灵敏度和特异度，了解基因芯片技术在临床的应用价值，从而为耐多药结核病患者提供有效的抗结核治疗方案。

1资料与方法1.1一般资料选取我院2012年4月至2013年6月住院和门诊患者，收集患者留取的各种标本共计1350份，每份标本直接行基因芯片技术检测和罗氏培养，剔除了非结核分枝杆菌（NTM），对基因芯片技术检测阳性同时罗氏培养阳性的标本共计432份纳入进一步研究。

432份阳性标本直接行基因芯片技术耐药基因检测和比例法药物敏感试验，了解结核分枝杆菌对异烟肼和利福平的耐药情况。

基因芯片技术在结核分枝杆菌耐药检测及菌种鉴定中的应用石国民;喻容;彭雪峰;石燕;聂英;齐志强;陈拥军;向延根;刘忠泉【期刊名称】《中国防痨杂志》【年(卷),期】2015(037)001【摘要】目的应用基因芯片技术快速检测结核分枝杆菌的耐药基因型以及分枝杆菌菌种基因型,探讨基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐药性和基因型的临床价值.方法应用菌种分型基因芯片技术和间隔区寡核苷酸分型(spacer oligonucleotide typing,Spoligotyping)技术对长沙市中心医院2011年1月至2012年12月的临床标本分离菌株137株进行菌种鉴定.对鉴定为结核分枝杆菌的菌株应用绝对浓度法进行利福平和异烟肼药物敏感性检测.并进一步对结核分枝杆菌临床分离株(利福平耐药、异烟肼耐药、敏感株)应用耐药基因芯片技术对rpoB、katG、inhA基因的野生型位点及各突变位点进行检测.即rpoB基因中1个或多个位点的碱基突变为利福平耐药,katG、inhA基因任何基因中的1个或多个位点的碱基突变为异烟肼耐药.Spoligotyping法和基因芯片法菌种鉴定比较应用Kappa检验,绝对浓度法和基因芯片法药物敏感性比较采用x2检验和Kappa检验,均以P＜0.05为差异有统计学意义.结果 (1)与绝对浓度法比较,对利福平敏感和异烟肼敏感的菌株45株,耐药基因芯片法检测鉴定为敏感株、即野生型的rpoB基因42株,符合率为93.3％(42/45)(不符合的1株为511T-C突变,1株为531C-T突变,1株为516A-T突变);katG基因45株,符合率为100.0％ (45/45);inhA基因43株,符合率为95.6％(43/45)(不符合的2株为inhA-15C-T突变).(2)与绝对浓度法比较,对利福平轻度耐药的耐药菌株18株,耐药基因芯片检测鉴定为rpoB基因突变型的16株,符合率为88.9％(16/18),且与531、516、526、511位点突变相关.对利福平高度耐药的耐药菌株19株,耐药基因芯片检测全部鉴定为rpoB基因突变型,符合率为100.0％(19/19),且与531、516、526、511位点突变相关.(3)与绝对浓度法比较,对异烟肼轻度耐药的耐药菌株13株,耐药基因芯片检测鉴定为katG基因突变型的12株,符合率为92.3％(12/13),与315G-C和315G-A位点突变相关.inhA基因突变型0株.对异烟肼高度耐药的耐药菌株9株,耐药基因芯片检测鉴定为katG基因全部为突变型,符合率为100.0％(9/9),与315G-C和315G-A位点突变相关.inhA基因突变型0株.(4)与Spoligotyping法比较,137株临床分离株中104株分离株基因芯片法检测鉴定为结核分枝杆菌复合群,33株基因芯片法检测出7株鸟分枝杆菌、15株胞内分枝杆菌、1株偶然分枝杆菌、10株龟或脓肿分枝杆菌,与Spoligotyping 法比较,结核分枝杆菌复合群一致性为100.0％(104/104),鸟分枝杆菌一致性为77.8％(7/9),胞内分枝杆菌一致性为93.8％(15/16),偶然分枝杆菌一致性为0.0％(0/0),龟或脓肿分枝杆菌一致性为100.0％(8/8).经Kappa检验,Kappa=0.95,U=30.6,P＜0.05.结论耐药基因芯片检测法与绝对浓度法有高度的一致性,且利福平耐药与rpoB基因的531、516、526、511位点突变相关.异烟肼耐药与katG基因的315位点突变相关,没有发现inhA相关的耐药位点突变.基因芯片方法可快速、准确地检测临床分离株的菌种基因型和耐药性.【总页数】8页(P66-73)【作者】石国民;喻容;彭雪峰;石燕;聂英;齐志强;陈拥军;向延根;刘忠泉【作者单位】410004 长沙市中心医院检验科;410004 长沙市中心医院检验科;410004 长沙市中心医院检验科;410004 长沙市中心医院检验科;410004 长沙市中心医院检验科;410004 长沙市中心医院检验科;410004 长沙市中心医院检验科;410004 长沙市中心医院检验科;北京市结核病胸部肿瘤研究所耐药结核病北京市重点实验室【正文语种】中文【相关文献】1.基因芯片技术对结核分枝杆菌耐药性检测的临床应用 [J], 陈瑶;吴英松2.基因芯片技术在分枝杆菌菌种鉴定和结核耐药性检测中的应用及评价 [J], 李晓非;梁桂亮;普冬;杨冬梅;赵旻3.基因芯片技术检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药性临床应用评价 [J], 许榕青;李丹;林银霞;黄明翔;陈新朝4.基因芯片技术及其在结核分枝杆菌菌种鉴定及耐药性检测方面的研究进展 [J], 张俊仙;吴雪琼5.基因芯片技术在分枝杆菌菌种鉴定和耐药性分析中的应用 [J], 李丹;杜德兵;吴文燕;王德成因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

基因芯片技术在检测痰涂阳肺结核患者结核分枝杆菌耐药性的应用效果陈林;沈静;朱大冕;王晓英【期刊名称】《检验医学与临床》【年(卷),期】2017(014)009【摘要】Objective To analyze the performance of genechip in rapid detecting multidrug-resistant tuberculosis (MDR-TB).Methods The sputum samples collected from 1 030 smear positive TB patients detected in five districts of Chongqing were analyzed by genechip for detecting INH-and RFP-resistance.Simultaneously,the sputum samples were cultured with Lwenstein-Jensen culture medium followed by conventional drug susceptibility testing (DST) for detecting INH-and RFP-resistance.The conventional DST results by proportion method were served as the gold standard to evaluate the detection capability of genechip.Results Finally 958 patients with the results of genechip and DST were analyzed.The coincidence rate,sensitivity,specificity,positive predictive value and negative predictive value of genechip for INH drug resistance were94.1%,80.2%,95.9%,71.8% and 97.4%,pared with conventional DST,the difference had no statistical significance(P>0.05).And Kappa value was 0.724.The coincidencerate,sensitivity,specificity,positive predictive value and negative predictive value of genechip for INH drug resistance were 96.3%,86.4%,97.5%,80.9%and 98.3%,pared with conventional DST,the difference had no statistical significance(P>0.05).And Kappa value was0.815.Additionally,coincidence rate,sensitivity,specificity,positive predictive value and negative predictive value of NH-and RFP-resistance were96.9%,78.3%,98.3%,78.3% and 98.3%,and Kappa value waspared with conventional DST,the difference had no statistical significance(P>0.05).Conclusion Genechip can be used for early and rapid screening and diagnosis for MDR-TB,which could cover the shortage of conventional DST,but genechip is strict with testing environment and needs strict training for the operators.%目的探讨基因芯片技术在结核病耐多药快速检测中的应用效果.方法收集重庆市五个区县1 030例涂阳肺结核患者的痰标本,同时进行罗氏培养和基因芯片检测异烟肼、利福平耐药性,培养后的菌株用比例法药敏试验检测异烟肼、利福平的耐药性.以比例法药敏试验为判断标准,对基因芯片的检测效果进行分析.结果对同时有两种耐药性检测结果的958例患者进行了统计学分析,基因芯片对异烟肼检测结果和比例法药敏试验比较差异无统计学意义(P>0.05),符合率94.1%,灵敏度80.2%,特异度95.9%,阳性预测值71.8%,阴性预测值97.4%,Kappa值为0.724.基因芯片对利福平检测结果和比例法药敏试验比较差异无统计学意义(P>0.05),符合率96.3%,灵敏度86.4%,特异度97.5%,阳性预测值80.9%,阴性预测值98.3%,Kappa值为0.815.此外,基因芯片对异烟肼和利福平耐药结核病检测结果和比例法药敏试验比较差异无统计学意义(P>0.05),符合率96.9%,灵敏度78.3%,特异度98.3%,阳性预测值78.3%,阴性预测值98.3%,Kappa 值为0.766.结论基因芯片技术可用于耐多药结核病早期快速筛查和诊断,以弥补传统药敏试验的不足,但该方法对检测环境要求较高,需对操作人员严格培训.【总页数】4页(P1220-1223)【作者】陈林;沈静;朱大冕;王晓英【作者单位】重庆市结核病防治所参比实验室 400050;重庆市结核病防治所参比实验室 400050;重庆市结核病防治所参比实验室 400050;重庆市结核病防治所参比实验室 400050【正文语种】中文【中图分类】A【相关文献】1.基因芯片技术对结核分枝杆菌耐药性检测的临床应用 [J], 陈瑶;吴英松2.PCR探针熔解曲线法在对肺结核患者进行结核分枝杆菌耐药基因检测中的应用效果 [J], 常凤霞3.基因芯片与线性探针技术检测涂阳肺结核患者痰标本MTB耐药性的价值 [J], 刘元;周俊;崔晓利;雷佳媛;党丽云4.基因芯片技术对结核分枝杆菌利福平及异烟肼的耐药性检测研究 [J], 孙桂英; 赵刚; 沈燕; 徐密琴; 高胜利; 俞净; 钮志林5.DNA微阵列芯片技术检测培阳肺结核患者痰样本中结核分枝杆菌耐药性的价值[J], 王悦;孙颖;孙炳奇因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

基因芯片技术在结核耐药基因检测中的应用陈兆云;蒋静;王家路;杨立【期刊名称】《新疆医学》【年(卷),期】2012(042)011【摘要】目的:应用DNA芯片杂交技术快速检测临床分离株中结核分枝杆菌对利福平(Rifampicin RFP)和异烟肼(isoniazide INH)的3个耐药相关基因rpoB、katG、inhA基因,并评价其临床应用价值.方法:采用基因芯片技术对我院2010年10月～2011年4月门诊或住院患者的体液标本经培养、分离和鉴定得到的34株结核分枝杆菌样本进行耐药相关基因检测,并将结果与绝对浓度法药敏试验结果进行比较.结果:34株样本中,利福平rpoB基因有7株突变,总突变率为20.6％,其中6株为531(C-T)位点突变,1株526(C-T)位点突变.与药敏试验的符合率为88.2％.异烟肼基因突变有10株,总突变率为29.4％,其中7株为KatG 315(G-C)位点突变,1株为katG 315(G-A)位点突变,2株为inhA-15(C-T)位点突变.与药敏试验的符合率为85.3％.利福平的7株耐药株中,基因芯片检测5株为突变型,突变率为71.4％,在利福平的27株敏感株中,基因芯片检测2株为突变型,突变率为7.4％.在异烟肼的9株耐药株中,基因芯片检测7株为突变型,突变率为77.8％,在异烟肼的25株敏感株中,基因芯片检测3株为突变型,突变率为12％.耐药基因检测灵敏度和特异度分别为利福平71.4％和92.6％,异烟肼77.8％和88％.结论:用基因芯片技术检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼的耐药性具有较高的特异性和敏感性,快速准确,可以应用于结核分枝杆菌耐药性的检测.【总页数】5页(P55-59)【作者】陈兆云;蒋静;王家路;杨立【作者单位】830054 新疆乌鲁木齐新疆医科大学第一附属医院医学检验中心;830054 新疆乌鲁木齐新疆医科大学第一附属医院医学检验中心;830054 新疆乌鲁木齐新疆医科大学第一附属医院医学检验中心;830054 新疆乌鲁木齐新疆医科大学第一附属医院医学检验中心【正文语种】中文【相关文献】1.基因芯片技术在结核分支杆菌耐药突变基因检测中的应用 [J], 单万水;吴驰;陈心春;刘厚明;詹能勇;杨燕;韩红星;余卫业;周伯平2.基因芯片技术在慢性HBV感染者病毒基因分型和耐药基因检测中的应用及临床意义 [J], 周冬青;王骥;赵娴;陈辉3.基因芯片技术在慢性乙型肝炎患者中耐药基因检测的应用情况 [J],4.PCR-反向点杂交法耐药基因检测和BD960结核菌药敏在耐药结核病检测中的应用价值 [J], 李晓琴;周敏;王霖;曾海燕;骆鹏举;林丽佳5.PCR-反向点杂交法耐药基因检测和BD960结核菌药敏在耐药结核病检测中的应用价值 [J], 李晓琴;周敏;王霖;曾海燕;骆鹏举;林丽佳因版权原因，仅展示原文概要，查看原文内容请购买。

基因芯片在分枝杆菌菌种鉴定及结核耐药基因检测的诊断价值【摘要】目的：研究基因芯片检测应用在分枝杆菌菌种的鉴定以及结核耐药基因检测中的临床应用价值。

方法：选取2018年6月~2019年6月我院采集的158例痰涂片检测为阳性的肺结核患者作为研究资料，将采集的患者痰液标本进行基因芯片检测鉴定以及使用全自动分枝杆菌检测系统（BD BACTEC MGIT 960，以下简称“MGIT-960”）培养，并实施耐药性检测分析。

对比不同方法的一致性。

结果：RFP检测中，124例患者样本内通过基因芯片法与培养法结果相同均为115例：以MGIT-960培养为参考，基因芯片法准确定为92.7%、灵敏度为79.3%、特异性为96.8%、Kappa为0.790；INH的检测中，124例患者样本内通过基因芯片法与培养法结果相同均为98例，基因芯片法准确定为88.3%、灵敏度为78.1%、特异性为92.4%、Kappa为0.712。

组间比较差异有显著性（P> 0.05）。

结论：利用基因芯片检测能够精准地鉴定出菌种类型以及耐药基因检测，且与MGIT-960培养具有较好的一致性，具有重要的临床推广价值。

【关键词】基因芯片；分枝杆菌；菌种鉴定；耐药基因；肺结核1 资料和方法1.1 一般资料选取2018年6月~2019年6月我院采集的158例痰涂片检测为阳性的肺结核患者作为研究资料，其中男性患者99例、女性患者59例，患者年龄为16~70岁，平均年龄（46.58±11.24）岁。

研究中患者均符合《肺结核诊断》(WS288-2017)中肺结核临床诊断标准，并排除其他重大疾病；经过病理检测后确诊为肺结核。

1.2 仪器及试剂基因芯片检测平台及分枝杆菌配套试剂生产厂家为北京博奥生物有限公司，其中包含DNA提取液、聚合酶链式反应扩增试剂、RNA杂交缓冲液等；MGIT-960培养设备以及试剂生产厂家为美国碧迪公司1.3 方法使用基因芯片检测16种分枝杆菌，结核耐药基因检测为利福平（RFP）耐药性基因rpo上的6个点位（见表1）以及异烟肼（INH）耐药性基因KatG与inhA 启动子的各1个位点（见表2）。

基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐药性的临床价值目的探讨基因芯片技术检测结核分枝杆菌耐药性的临床价值。

方法回顾性分析685例结核病临床疑似病例的临床资料，采用晶芯结核分枝杆菌生物芯片技术进行检测。

结果本组685例临床疑似病例中，阳性135例，阳性率为19.7%，基因芯片检测结果显示结核131例，非结核4例，阳性率为19.1%。

耐药基因检测68例，利福平和异烟肼基因突变12例，总突变率为17.6%，其中11例为利福平和异烟肼均耐药，双重基因突变率为16.2%，另1例只耐利福平。

利福平总突变率为17.6%，异烟肼总突变率为16.2%，耐多药率为16.2%。

结论晶芯结核分枝杆菌生物芯片技术用于临床诊断结核病及其耐药性，能够缩短诊断时间，提高临床时效性，值得推广应用。

标签：结核分枝杆菌；基因芯片；结核病诊断国内每年有将近13万人因结核病死亡[1]，且有将近12万新发耐多药结核病患者，未来数年内可能出现耐药菌为主的流行态势[2]。

目前，结核病诊断的标准方法主要包括分枝杆菌分离培养、抗酸菌痰涂片镜检、菌种鉴定和药敏试验等，但是其普遍存在特异性差、灵敏度低或需时长的缺点[3]，本院引进国内最新的结核诊断技术——晶芯结核分枝杆菌生物芯片诊断系统，是近年发展起来的进行大规模遗传多态性检测的新方法[4]，其应用于临床诊断结核病，提高了时效性，现报道如下。

1 资料与方法1.1 一般资料本院2013年3月1日～2013年9月30日接受诊治的结核病临床疑似病例共685例，其中男性363例，女性322例；年龄9～76岁，平均（34.51±2.28）岁；其中临床诊断结核病病例681例，包括185例痰结核菌培养阴性肺结核，157例痰结核菌培养阳性肺结核，193例结核性脑膜炎，95例结核性胸膜炎，51例骨结核。

非结核分枝杆菌病4例。

1.2 试剂与仪器Extractor 36核酸提取仪、BioMixerⅡ芯片杂交仪、Slider Washer芯片洗干仪、LuxScan 10 K-B芯片扫描仪、晶芯分枝杆菌菌种鉴定试剂盒、晶芯结核分枝杆菌耐药基因检测试剂盒，均购自博奥生物有限公司。

基因芯片技术检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药性临床应用评价许榕青;李丹;林银霞;黄明翔;陈新朝【摘要】We evaluated clinical application effect of gene chip for detection of rifampin (RFP) and isoniazid (INH) resistance in Mycobacterium tuberculosis (MTB).Rifampin and isoniazid drug-resistance gene loci were detected by gene chip with sputum specimens from smear-positive tuberculosis patients and clinical strains,comparing the results of detection.BACTEC MGIT 960 drug susceptibility test results were used as control to evaluate the detection performance of gene chip.The sequences of the polymerase chain reaction products of the rpoB,katG and inhA genes from 999 strains identified as Mycobacterium tuberculosis were determined to confirm the mutations by DNA sequencing.Results showed that 100 cases were identified as nontuberculous mycobacteria by gene chip in the 1 108 cases of smear-positive samples.Among the rest 1 008 samples,there were only 9 cases of microarray results different from BACTEC MGIT960 culture-positive strains,achieving the coincidences of 99.1％.Compared with BACTEC MGIT 960 drug susceptibility testresults,the gene chip method displayed a concordance of 98.1 ％ and 94.5 ％for RFP and INH respectively in the 999 pared with the DNA sequencing method,the accuracy of gene chip method was 99.6％ for rifampin resistance and 99.8％ for isoniazid resistance.It's concluded that the gene chip technology can quickly and accurately detect rifampin andisoniazid resistance in MTB and can be used directly for the detection of sputum samples.%目的评价基因芯片技术检测结核分枝杆菌利福平和异烟肼耐药性的临床应用效果.方法利用基因芯片技术对涂阳肺结核患者的痰标本和临床分离株进行利福平和异烟肼耐药基因位点检测,比较痰标本与菌株检测结果的差异;并以BACTEC MGIT 960药敏试验结果为对照评价基因芯片的检测性能.另外,通过对999株鉴定为结核分枝杆菌的临床分离菌株进行rpoB、katG和inhA基因耐药相关区域扩增产物测序,以验证基因芯片对核酸序列检测的准确性.结果在涂阳的1 108例标本中有100例经基因芯片菌种鉴定为非结核分枝杆菌.其余的1 008例痰标本基因芯片结果与BACTEC MGIT960培养阳性的菌株基因芯片结果比较仅有9例结果不一致,符合率为99.1％.以BACTEC MGIT960培养法药敏结果为对照,999株菌株基因芯片法检测利福平耐药性的符合率为98.1％,异烟肼的耐药性的符合率为94.5％.与DNA测序法相比,基因芯片法检测利福平和异烟肼耐药性的准确率分别为99.6％和99.8％.结论基因芯片技术能够快速、准确地进行结核分枝杆菌利福平和异烟肼的耐药性检测,并能直接用于痰标本检测.【期刊名称】《中国人兽共患病学报》【年(卷),期】2017(033)001【总页数】6页(P43-48)【关键词】结核分枝杆菌;利福平;异烟肼;耐药性;基因芯片【作者】许榕青;李丹;林银霞;黄明翔;陈新朝【作者单位】福建省福州肺科医院检验科,福建医科大学临床教学医院,福州350008;福建省福州肺科医院检验科,福建医科大学临床教学医院,福州 350008;福建省福州肺科医院检验科,福建医科大学临床教学医院,福州 350008;福建省福州肺科医院检验科,福建医科大学临床教学医院,福州 350008;福建省福州肺科医院检验科,福建医科大学临床教学医院,福州 350008【正文语种】中文【中图分类】R378.91Supported by the Young Research Program of Department of Public Health of Fujian Province (No. 2013-2-77) Corresponding author: Huang Ming-xiang,Email:**************结核病是全世界范围内严重威胁公共健康的传染病。

利用基因芯片检测结核分支杆菌及其利福平耐药性的分析目的：讨论基因芯片检测技术应用在结核分支杆菌中的临床效果以及利福平耐药性。

方法：选取我院2011年7月-2013年6月收治治疗的500例结核病患者，通过基因芯片检测技术对结核病患者的结核杆菌以及利福平耐药性实施检测。

结果：对于结核患者来说，通过基因芯片技术对其结核分支杆菌进行检测的阳性率为80.0%，而细胞培养组与痰涂片组的阳性率分别为36.0%与40.0%，其基因芯片组的阳性率明显的高于细胞培养组与痰涂片组。

结论：应用基因芯片检测技术对结核病患者的结核杆菌以及利福平耐药性实施检测具备着显著的临床效果，在临床中值得被广泛的推广使用。

标签：基因芯片；检测；结核分支杆菌；利福平；耐药性结核病是通过呼吸道进行传播的一种慢性传染病，其具有着病例发现率低、高感染率、高耐药率、高患病率、低递减率以及高死亡率等特征，对人民群众的生命安全与身体健康等产生了非常严重的影响，已经逐渐的变成重要的社会问题与公共卫生问题[1]。

因为人口流动的变化、艾滋病病毒和结核菌的双重感染以及耐药结核病的持续蔓延等，导致结核病的病情出现恶化，从而导致结核病的防治面临着巨大的挑战与难题[2]。

因为基因芯片具备着高度自动化、快速高效、大规模、高通量、高灵敏度以及高度并行性等优势，因此在临床中得到了广泛的应用。

本研究主要讨论分析了基因芯片检测技术应用在结核分支杆菌中的临床效果以及利福平耐药性，其具备着显著的临床效果，现总结如下：1.资料与方法1.1一般资料选取我院2011年7月-2013年6月收治治疗的500例结核病患者，其中男性患者为280例，其年龄为22～72岁，平均为（45.2±4.5）岁；女性患者为220例，其年龄为21～75岁，平均为（44.9±3.6）岁；全部患者在年龄以及疾病症状等方面进行对比都不存在明显的差异（P>0.05），具备可比性。

对全部患者的晨痰标本进行采集，根据全国结核病检验标准实施药敏试验、分支杆菌培养、痰涂片以及菌种鉴定等操作。