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FcαR1基因 5'端调控及UTR区SNPs及其单倍型与华南地区汉族IgA肾病患者预后关系(一)

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FcαR1基因 5＇端调控及UTR区SNPs及其单倍型与华南地区汉族IgA
肾病患者预后关系(一)
作者：陈伟强，古宏标，李幼姬,黄玮俊
【摘要】目的研究我国南方汉族IgA肾病患者FcαR1基因5＇端调控及
UTR区SNPs及其单倍型与我国南方IgA肾病患者预后的关系。方法采
集266例肾活检证实的IgA肾病患者血样，提取基因组DNA。用PCR
产物直接测序法鉴定基因型，每3～6个月查尿蛋白、血肌酐及其他指
标随访，以血肌酐浓度比基础值升高1倍以上或死亡作为随访终点。
采用单因素相关分析及Logistic多元回归分析各位点多态性及其单倍型
与肾功能恶化及预后的关系。结果（1）该区域单倍型对及-27、56位
点多态性与肾功能进展显著相关;（2）-27位点基因型TC与TT比较差
异显著（P=0.003）；56位点基因型CC与TT比较，P=0.011；单倍型对
TCC/CTC与TTT/TTT比较，P=0.000。结论FcαR1基因第一外显子C56T
多态位点基因型与我国南方IgAN患者预后相关。
【关键词】IgA肾病;FcαR1基因；多态性;预后；相关分析
Abstract:ObjectiveToinvestigatetherelationshipbetweentheprognosesandt
hepolymorphismsofFcαR1geneinChineseHanIgAnephropathy(IgAN)patient

eenprovenIgAnephropathywerecollected，
thegenotypesweredeterminedbyPCRproductsequencing.Allpatientswerefo
llowedupevery3to6monthsbyexaminingurinaryprotein,Scr,andotherindicat
lastedformorethansix
months.Therelationshipbetweentherenalfunctionandthepolymorphismsof
FcαR1genewereevaluatedbysinglefactoranalysisandmultipleregressionanal
ysiswithSPSS10.0.Results(1)Haplotypesand-27,56lociweresignificantlycorre
latedwiththeaggravationofrenalfunction.(2)GenotypeTCvs.TTin-27locus,CC
vs.TTin56locus,haplotypicalTCC/CTCvs.TTT/TTTweredifferentsignificantlyon
theaggravationofrenalfunctioninChineseHanIgANpatientsintheSouthChina.
ConclusionSNPsandit＇shaplotypesofFcαR1genein5＇
regulatoryregionandUTRregionwereassociatedwiththeprognosesofChinese
HanIgANpatientsintheSouthChina.
Keywords:IgAN;FcαR1gene;polymorphism;prognosis;correlationanalysis
资料显示,约15%～40%IgA肾病
患者在确诊后的20年内逐渐进展到终末期肾衰
(endstagerenalfailure,ESRF)。最近的一项研究表明，影响IgAN预后的主
要指标依次为：伴有高血压的男性患者；每天大于1g的蛋白尿；肾功
能损伤（肾小球滤过率小于60mL/min）；严重的肾小球病理损伤（如
严重系膜增殖、肾小球硬化、新月体形成和血管硬化等）〔1〕。近年来
越来越多的研究表明,遗传因素不但影响对该病的易感性,且影响疾病
的进程。已有研究发现包括ACE基因、及其受体基因多态位点与
IgAN的进展相关〔2-4〕。
FcaR1系体内许多细胞表面特异性识别IgA的跨膜受体，与IgA结合后
可触发吞噬及ADCC反应，产生过氧化物，释放炎症介质等，从而引发
各种肾脏病理改变。有研究表明IgAN患者肾小球、中性粒细胞、单核
细胞FcɑR1表达水平升高。也有研究发现当伴有血IgA水平升高时表达
水平则降低。目前认为一种可溶解于血浆的FcɑR1与IgA形成的复合物
可选择性地沉积在肾小球系膜区可能是FcɑR1致病的主要机理〔5〕。
日本学者通过测序发现位于该基因5＇调控区及第一外显子非转录区有
3个SNPs，分别是、及T+56C，关于该多态性与IgAN
发病的相关性研究日本学者的研究结果相互矛盾〔6〕。但体外研究证
实这些多态性可影响该基因转录活性，而有关这些SNPs及其单倍型与
IgAN预后的关系，国内外均未见报道。1对象与方法
1.1研究对象
266例患者系中大第一附属医院、香港大学玛丽医院1980～2004年肾
活检确诊的IgA肾病患者，均符合WHO制定的IgA肾病诊断标准，并
排除紫癜性肾炎、肝炎等继发病因。年龄2～61岁，平均年龄(29.9±9.9)
岁，其中男121例，女145例。所有研究对象均获知情并自愿参加,且
该项目得到中山大学医学伦理委员会批准。
1.2方法
1.2.1全血基因组DNA提取
按照QIAampDNABloodMaxiKit试剂盒说明书操作。采用紫外分光光度
法测定提取DNA的浓度与纯度。
1.2.2PCR扩增目的区域
根据FcαR1基因的核苷酸序(GenBank序列号:X59875),设计扩增引物：
上游引物5＇＇；下游引物5＇
＇。反应体系为：10×PCR缓冲液(无镁)2.5μL、
50mmol/LMgCl21.5μL、2mmol/LdNTP混合物2.5μL、10μmol/L上、下游
引物各1μL、TaqDNA多聚酶(1U/μL)1.1μL、DNA模板1μL、灭菌去离子
水加至25μL；反应条件：94℃预变性3min，94℃变性30s，55℃退火
30s，72℃延伸45s，共30个循环，最后72℃延伸5min。
1.2.3FcαR15＇端调控及UTR区SNPs多态性的鉴定、分型
PCR扩增含有FcαR15＇端调控及UTR区单核苷酸多态性区域，反应体
系为：10×PCR缓冲液(无镁)2.5μL、50mmol/LMgCl21.5μL、2mmol/LdNTP
混合物2.5μL、10μmol/L上、下游引物各1μL、TaqDNA多聚酶(1U/μL)1.1μL、
DNA模板1μL、灭菌去离子水加至25μL；反应条件：94℃预变性3min，
94℃变性30s，55℃退火30s，72℃延伸45s，共30个循环，最后72℃
延伸5min。取PCR产物测序。
具体方法：纯化的DNA模板20ng，
ABIPrismBigDyeTerminatorCycleSequencingReadyReactionKitmix2μL，测序
引物(同PCR扩增引物)10pmol组成8μL反应体系进行测序PCR。反应条
件：98℃1min，96℃30s，50℃30s，60℃4min，25个循环。3mol/L乙
酸钠(pH5.2)和无水乙醇沉淀扩增的DNA，再用75%(φ)乙醇洗涤1次，
然后加入18μL模板变性剂TSR(templatesuppressionreagent)。测序模板
在95℃水浴5min，立即置于冰水中5min将其淬灭成单链，转移至测
序管，在ABI3100全自动序列分析仪上进行毛细管电泳测序。
1.2.4杂合子样本行双向测序确认

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CDAN1基因突变导致的胎儿期非免疫性水肿的家系遗传学分析

CDAN1基因突变导致的胎儿期非免疫性水肿的家系遗传学分析

非免疫性水肿（NIHF ）是目前引起胎儿水肿的最常见原因，研究表明遗传因素（如单基因遗传病、染色体结构或数目异常）、血液病、感染和心血管疾病均可导致非免疫性胎儿水肿［1-3］。

先天性红细胞生成障碍性贫血（CDA ）是一种罕见的孟德尔遗传病，该病以大红细胞贫血、无效红细胞生成和发育不良为主要特征［4］。

OMIM数据库根据临床症状和突变基因的不同，可将CDA 分为5种类型［5］：即CDA Ⅰ型（CDAN1基因和C15ORF41基因）、CDA Ⅱ型（SEC23B 基因）、CDA Ⅲ型（KIF23基因）、CDA Ⅳ型（KLF1基因）和XLTDA （GATA1基因）。

约75%CDA Ⅰ型是由于15号常染色体上CDAN1基因复合杂合突变所致［6］，其特点是在儿童、青少年或以后的生活中出现中度至重度的大细胞性贫血［7］。

目前，国内暂无CDA Ⅰ型基因检测相关中文研究报道，国际上有关该疾病的研究对象大多为青少年和儿童，且主要侧重研究患者血液学参数与红细胞形态变化以及分析该病的Whole exome sequencing analysis of compound heterozygous variants of CDAN1gene in a Chinese family with non-immune hydrops fetalisWANG Yanchao 1,2,3,LI Qing 1,2,3,SUN Xiaofang 1,2,3,LI Shaoying 1,2,3,HE Jianchun 1,3,ZHANG Mincong 1,HUANG Lingling 1,HE Wenzhi 1,2,31Experimental Department of Institute of Obstetrics and Gynecology,Third Affiliated Hospital of Guangzhou Medical University,Guangzhou 510150,China;2Key Laboratory for Major Obstetrics Diseases of Guangdong Province,Guangzhou 510150,China;3Key Laboratory of Reproduction and Genetics of Guangdong Higher Education Institutes,Guangzhou 510150,China摘要：目的对一例因不明原因胎儿期水肿的流产组织进行临床和遗传学分析，为该家系产前诊断以及遗传咨询提供可靠的理论依据。

MLL-AF6融合基因阳性急性髓系白血病的临床特征及预后

MLL-AF6融合基因阳性急性髓系白血病的临床特征及预后

北 京大学学报! 医学版# SKT%N*LKQMIUVNWTNVXI%OVPY! ZI*LPZO6VIN6IO# !X7B(/)!N7(/!KF?(.#."
$%I 融合基因阳性急性髓系白血病的
临床特征及预后
张梅香" 史文芝. 刘建新" 王春键" 李!燕" 王!蔚" 江!滨"!
$%资料与方法
$($!研究对象 .#"/ 年 & 月至 .#"$ 年 $ 月北京大学国际医院
共收治 /" 例 ""e.) 1JLL重 排 急 性 白 血 病" 其 中 ?JJ8K.I 融 合 基 因 阳 性 *JL患 者 "" 例" 均 经 JV6J分型确诊, $(&!免疫表型分析
!"(北京大学国际医院血液科"北京!"#..#&$ .(山西长治医学院附属和平医院血液科"山西长治!#0&####
摘!要 目的探讨 ?JJ8K.I 融合基因阳性的急性髓系白血病! =F>?9AC9B73; B9>G9A3=" *JL# 患者的临床特征和 预后, 方法回顾分析 "" 例初治 ?JJ8K.I 阳性 *JL患者的临床和实验室资料"复习文献"总结该类疾病的临床特 征及预后, 结果"" 例患者中男 & 例"女 / 例"中位年龄 )& 岁"急性白血病的分型诊断标准 Q*R分型 ! Q895F@, *A983F=5,R83?34@ FB=443D3F=?375 4C4?9A4# J/ & 例"J0 / 例, 起病症状为牙龈肿痛 & 例"发热 / 例"初诊时中位白细胞计 数 //(/ p"#$ 1L"免疫分型可见髓系细胞-单核细胞系统及干细胞系列抗原表达, ?JJ8K.I 融合基因水平! 实时定 量 M6%法# 为 "0(.f g."0(/f"& 1"" 例!/0(/f# 合并 0L>@ 基因高表达, 0 例患者二代测序检测出合并 M-K/E0EA-K/DJ@-E+NB-OP?EBK及 .JEB8>EO基因突变, 染色体 W显带检查". 例为 ?!&$""# ! e.+"e.)# 伴复杂核型异 常"0 1$ 例!00(0f# 伴有 d' 异常". 例为正常核型, 给予患者常规诱导化疗"达到完全缓解者 ' 1"" 例!+.(+f# " ) 例患者原发耐药, ' 例完全缓解的患者中". 例达到微小残留病! A353A=B8943;>=B;349=49" J%[# 阴性"中位完全 缓解的持续时间为 0(/ 个月, . 例 J%[阳性及 ) 例难治复发患者接受了异基因造血干细胞移植! =BB7<9593F@9A=, ?7:739?3F4?9AF9BB?8=54:B=5?=?375" =BB7,ZO6P# " 后均死于白血病进展, 随访至 .#"$ 年 ". 月 " 日" . 例存活"$ 例死 亡"中位生存时间 $ 个月, 结论?JJ8K.I 融合基因阳性 *JL多为年轻患者"Q*R分型以 J0-J/ 居多"常以发热 起病"白细胞增高"可伴器官浸润"合并 0L>@ 基因高表达多见, 本病常规化疗的缓解率不低"但达到分子学缓解困 难"极易出现早期复发"持续分子学阴性状态下尽早行 =BB7,ZO6P可能获得长期完全缓解, 关键词 白血病"髓系$基因融合$基因重排$?JJ8K.I$疾病特征$预后 中图分类号 %+))(+"!! 文献标志码 *!! 文章编号 "&+","&+-!.#."##/,#$"/,#& !"#%"#("$+.) 12(3445("&+","&+-(.#."(#/(#"+
新疆地区汉族人群ORAI 1基因rs12313273多态性与尿路含钙结石关系的研究

新疆地区汉族人群ORAI 1基因rs12313273多态性与尿路含钙结石关系的研究

ｌ４
Ｗｏｒｌｄ Ｌａｔｅｓｔ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ Ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ（Ｅｌｅｃｔｒｏｎｉｃ Ｖｅｒｓｉｏｎ）２０ １ ８ Ｖｏ １．１ ８ Ｎｏ．２４
论 著
新 疆 地 区汉 族 人群 ＯＲＡＩ １基 因 ｒｓ１２３１３２７３多 态性 与 尿 路
含钙结石关 系的研 究
艾 日班 ．焚合人 ，杜恒 ，邵齐 ，张云宇 ，玛沛莉 ，术 拉拢 · 合小提
ｗ ａｓ ａｎａｌｙｚｅｄ ｂｙ ｔｈｅ ｍｅｔｈｏｄｓ ｏｆ ＳｎａＰｓｈｏｔ ａｎｄ ｔｈｅ ｇｅｎｏｔｙｐｅ ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｗａｓ ｃｏｍ ｐａｒｅｄ ｂｅｔｗｅｅｎ ｃａｓｅｓ ａｎｄ ｃｏｎｔｒｏｌｓ．Ｔｈｅ ｓｅｒｕｍ ｃａｌｃｉｕｍ ａｎｄ ２４ｈ ｕｒｉｎａｒｙ ｃａｌｃｉｕｍ ｅｘｃｒｅｔｉｏｎ １ｅｖｅｌｓ ｗｅｒｅ ｃｏｍ ｐａｒｅｄ ａｍｏｎｇ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔ ｇｅｎｏｔｙｐｅｓ ｉｎ ｂｏｔｈ ｃａｓｅ ａｎｄ ｅｃｔ ｏｆ ＯＲＡ ｌ １ Ｇｅｎｅ Ｐｏｌｙｍ ｏｒｐｈｉｓｍ ｏｎ ｔｈｅ Ｆｏｒｍ ａｔｉｏｎ ｏｆ Ｃａｌｃｉｕｍ Ｕｒｏｌｉｔｈｉａｓｉｓ ｂｙ Ｓｅｒｕｍ Ｃａｌｃｉｕｍ ａｎｄ ２４ Ｈ ｏｕｒ
Ｕｒｉｎａｒｙ Ｃａｌｃｉｕｍ ｏｆ Ｈａｎ Ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ ｉｎ Ｘｉｎｊｉａｎｇ Ｒｅｇｉｏｎ
关 键 词 ：含钙结石 ；钙释放激活钙通道调节分子 （ＯＲ Ａ ｌ １）；多态性；汉族 中图 分 类 号 ：Ｒ９８３￣．２ 文 献 标 识 码 ：Ａ ＤＯＩ：１０．１９６１ ３／ｊ．ｃｎｋｉ．１６７１—３１４１，２０１８．２４．００５ 本 文 引 用 格 式 ： 艾 日班 ｔ莫合太 ，杜 恒 ，邵齐 ，等 ．新疆地 区汉族人群 ＯＲＡＩ １基 因 ｒｓ１２３１３２７３多态性与尿 路含钙结石关系的研 究 口１． 世 界 最 新 医学 信 息 文 摘 ，２０１８，１８（２４）：１４—１６．
分子生物学检验完整版

分子生物学检验完整版

1病原生物基因组在医学上有何应用？详见书P3a菌种鉴定b确定病毒感染和病毒载量c病毒分析d细菌耐药监测和分子流行病学调查2什么是原癌基因，原癌基因有什么特性，原癌基因可以分为哪些种类以及原癌基因常见的激活机制有哪些？原癌基因是指人类或其他动物细胞(以及致癌病毒)固有的一类基因，能诱导细胞正常转化并使之获得新生物特征的基因总称。

特性：进化上高度保守，负责调控正常细胞生命活动，可以转化为癌基因。

功能分类：生长因子，生长因子受体，信号转导蛋白，核调节蛋白，细胞周期调节蛋白，抑制凋亡蛋白激活机制：插入激活，基因重排，基因点突变，基因扩增，基因转录改变3试述Down综合征（21三体综合征）的主要临床特征及核型。

临床特征：生长发育障碍，智力低。

呆滞面容，又称伸舌样痴呆。

40%患者有先天性心脏畸形。

肌张力低，50%患者有贯通手，男患者无生育能力，女患者少数有生育能力，遗传风险高。

核型：92.5%患者游离型：核型为47，XX(XY),+212.5%患者为嵌合型：46，XX(XY)/47，XX(XY),+215%患者为易位型：46，XX(XY),-14，+t(14q21q)4简述淋球菌感染的主要传统实验室诊断方法及其主要特点，对比分析分子生物学方法的优势1直接涂片染镜检：敏感度和特异性差，不能用于确诊。

2分离培养法：诊断NG感染的金标准，但是其对标本和培养及营养要求高，培养周期长，出报告慢，难以满足临床要求。

3免疫学法：分泌物标本中的非特异性反应严重以及抗体法间的稳定性和条件限制，推广受限。

分子生物学的优点：敏感，特异，可直接从了临床标本中检出含量很低的病原菌，适应于快速检测5、在单基因遗传病的分子生物学检验中，点突变检测常用方法有哪些？1异源双链分析法（HA）2突变体富集PCR法3变性梯度凝胶电泳法4化学切割错配法5等位基因特异性寡核苷酸分析法6DNA芯片技术7连接酶链反应8等位基因特异性扩增法9RNA酶A切割法10染色体原位杂交11荧光原位杂交技术6、简述白假丝酵母菌的分子生物学检验方法白假丝酵母菌分子生物学检验主要包括白假丝酵母菌特异性核酸（DNA RNA）的检测、基因分型和耐药基因分析等。