家畜育种学第6章育种值估计2011-课件

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[家畜繁殖学课件]第六章_家畜的繁殖力概要

情期受胎率=妊娠母畜数/配种情期×100%
(4)不返情率
不返情率=配种后一定时间不再发情母种情期数
2.衡量畜群增殖情况的指标
(1) 繁殖率
本年度出生仔畜数/上年度可繁母畜数×100%
(2) 繁殖成活率
本年度成活仔畜数/上年度可繁母畜数×100%
(6) 产羔率
指所产羔羊占配种母羊数的百分比
(7) 双羔率
指产双羔母羊占配种母羊数的百分比
三.家畜的繁殖率
1.牛的繁殖率见表6-2
2.猪的繁殖率见表6-3
3.羊的繁殖率见表6-4
第二节繁殖障碍一.雌性的不育
（一）遗传性不育
1.生殖器官畸形 2.雌雄间性 3.异性孪生母犊不育 4.种间杂种
第六章家畜的繁殖力
第一节繁殖力第二节繁殖障碍
第三节提高繁殖力的措施
第一节繁殖力
一.概念
繁殖力
二.衡量指标
1.衡量发情与配种质量的指标
（1）受胎率
受胎率=妊娠母畜数/配种母畜数×100%
（2）第一情期受胎率
第一情期受胎率=第一情期妊娠母畜数/第一情期配种母畜数×100%
(3)情期受胎率
（一）遗传性不育
1.隐睾 2.睾丸发育不全 3.染色体畸形
（二）机能性不育
1.性欲缺乏 2.精液品质差
（三）疾病性及营养不育
1.睾丸炎 2.生殖道感染 3.营养不良
第三节提高繁殖力的措施
一.影响繁殖力的主要因素
1.年龄的影响
2.环境的影响
1 温度 2 光照
3.营养的影响
4.管理的影响
1 配种时间 2 饲养设施 3 管理制度
（二）机能性不育
1.卵巢机能障碍 1 卵巢萎缩、硬化 2 持久黄体 3 卵巢囊肿

家畜育种第六章3

0.5 0.5 rA( PE 2 I ) 1
w1 25 w w2 1.3
综合选择指数的估计
偏回归系数为：
ˆ V 1 DAw b
2 25 0 318 .8 0.5 12 .5 63 .75 63 .75 512 25 2 80 1300 .8 0.5 1.3 sym 80 2 1 63 .75 512 3.115 0.244 0.712 2 1
I、AT：综合选择指数 Wi：第 i 个性状的经济加权值
Ai：第 i 个性状的育种值
综合选择指数的估计
I 的计算公式:
n i
多元回归方法
I AT Wi Ai bi ( pi pi )
矩阵形式：
I b' (p p)
b’: 含遗传基础和经济意义的偏回归系数向量 p : 为不同来源的信息性状表型值 p ：与p对应的均数
‫ބ‬不仅考虑性状的遗传基础和经济重要性，而且还考虑性状间的遗传相关 ‫ބ‬选择效率较高，在BLUP之前被广泛应用
多性状选择概述
综合选择指数的估计
选择指数应用的注意事项
综合选择指数的估计
综合选择指数的基本公式：
I AT Wi Ai
i n
根据各性状在育种和经济上的重要性，给予相应的经济加权值
育种值估计方法
育种值估计的初级阶段目前广为应用的育种值估计方法
选择指数法
数量遗传学
BLUP法
分子遗传学
未来的育种值估计方法
MBLUP法
分子数量遗传学
个体遗传评定
遗传评定概述单性状育种值估计多性状综合遗传评定

家畜育种学06种畜的遗传评估(二)：多性状育种值估计—选择指数39页PPT

谢谢！
5、教导儿童服从真理、服从集体，养成儿童自觉的纪律性，这是儿童道德教育最重要的部分。—— 陈鹤琴

61、奢侈是舒适的，否则就不是奢侈。——CocoCha nel 62、少而好学，如日出之阳；壮而好学，如日中之光；志而好学，如炳烛之光。 ——刘向 63、三军可夺帅也，匹夫不可夺志也。 ——孔丘 64、人生就是学校。在那里，与其说好的教师是幸福，不如说好的教师是不幸。 ——海贝尔 65、接受挑战，就可以享受胜利的喜悦。——杰纳勒尔·乔治·S·巴顿
家畜育种学06种畜的遗传评估(二)：多性状育种值估计—选择指数
1、纪律是管理关系的形式。——阿法纳西耶夫 2、改革如果不讲纪律，就难以成功。
3、道德行为训练，不是通过语言影响，而是让儿童练习良好道德行为，克服懒惰、轻率、不守纪律、颓废等不良行为。 4、学校没有纪律便如磨房里没有水。 ——夸美纽斯

家畜育种学第6章育种值估计2019

bAP是育种值对表型值的回归系数
个体育种值估计的基本公式
若A和P均以离均差形式表示，则：

A b AP ( P P ) P

A b AP P
σ b AP rAP A σP
σ σ rAP Cov(A, P) AP
个体育种值估计的基本公式
σ bAPrAP A , rAPCovP(A ) ,
当h2≥0.6时，A1、A2 、A3、 A4分别为根据亲代、同胞、后裔、本身资料估计的育种值(高h2)。
多种资料育种值的估计
A=0.1A1+0.2A2+0.3A3+0.4A4
可见: 亲代的可靠性总是最低，同胞可靠性总是低于后裔本身资料的可靠性随h2增大而逐渐增大
复合育种值能充分利用所获得的资料，根据它进行选种的效果比根据单项资料的育种值好。

AHO PbA(PPP)1.4 00.47 1(17.3 21)41.3 6226
H2=0.5,为中等遗传力性状 A=0.1*AP+0.2*AHS+0.3*A+0.4*AHO =0.1*14.0+0.2*13.52+0.3*13.5+0.4*13.62=13.602
（参见P.86 13.6672）
相对育种值（RBV）
以畜群平均值为标准，将个体育种值化为没有单位的相对值的形式。
RBV=A/P * 100%
即 A=0.1A1+0.2A2+0.3A3+0.4A4
多种资料育种值的估计
A=0.1A1+0.2A2+0.3A3+0.4A4
当h2<0.2时，A1、A2 、A3、 A4分别为根据亲代、本身、同胞、后裔资料估计的育种值(低h2)。

育种值的估计PPT课件

第20页/共43页
二、选择指数的制定
• 在制定综合选择指数时，应考虑以下几个方面。 • 第三、生长和胴体性状是构成指数的目标性状，在不进行个体饲喂时，以体重达 100 kg的日增重和活体背膘厚为主选性状，有条件测量个体饲料转化率和眼肌面积时，也可以纳入到指数中去。在十分重视肉质性状而又没有活体测量设备时，可借用同胞测定的屠宰信息。 • 第四、应尽量避免季节误差，即一个综合指数中包括的性状应在尽可能短的时间内测定完毕。即节省时间，又缩小了环境误差。 • 第五、将全群平均指数调整为100，便于选择时应用。
• 所能固定的只有基因加性效应造成的部分，即基因的加性值，也就是育种值。
PGE P ADI E P AR
第6页/共43页
（二）育种值
• 个体育种值 • 理论定义——个体所携带的影响某性状的所有基因平均效应的总和。 • 实际定义——该个体与群体中的其他个体随机交配产生的子代群，其均值是整个群体均值离差的2倍。
⑵综合选择指数
• 英国制定的约克夏猪的生长性能指数
Male: I 100 0.39(DG DG) 121.4(FC FC) 1.1(BF BF) Female: I 100 0.04(DG DG) 75.0(FC FC) 1.0(BF BF)
• DG——日增重（克）； • FC——饲料转化率； • BF——超声波背膘厚（mm）；
• ②根据这一型构造线性方程组，其中的方程个数的那古语模型中所有因子的所有水平之和。
• ③对方程组求解，计算出估计育种值（EBV）和环境效应值。
第34页/共43页
⑶BLUP法的计算问题
• 计算问题是BLUP的难点，方程组的个数可达几万至几十万个。 • 商品软件：
• PEST • GENESIS • PIGBLUP • GBS • NETPIG

家畜育种学-07

Xi 的偏回归系数
通过通径分析计算偏回归系数将用于估计个体育种值的信息归纳为下列3种类型：1.一个个体单次度量表型值，统计为Pi；2.多次度量表型均值，统计为Pi；3.多个个体多次度量均值，统计为Pi。这3种类型信息资料是依次决定于前者的，可以用通径关系图表示。

在这一关系链上， hi为个体育种值到个体单次度量表型值的通径系数，即遗传力平方根 zi为个体单次度量表型均值或多个个体单次度量表型均值的通径系数 qi为个体多次度量表型均值到多个个体多次度量表型均值的通径系数
... r( ij ) ... 1 d i2 ...
... b iX b ... b jX ...
第三节利用多种亲属信息估计个体育种值一．估计原理二．利用多种亲属信息估计个体育种值示例
本身单次记录(PI)+父亲单次记录(PS) d1=h d2=h r(12)=0.5 r(1X)=1 r(2X)=0.5

依据通径分析原理，当偏回归系数为1时，通径系数等于原因变量标准差与结果变量标准差之比，因此得到：
i
A A hi h P P
i
P k zi P 1 (k 1)rP
i i i
rP为多个表型值间的相关如果是一个个体多次度量，rP=re 如果多个个体单次度量，rP=rAh2 rA为多个个体间的亲缘相关系数
2 2 2ຫໍສະໝຸດ h (4 h ) 2h (1 h ) ˆ AX b1 ( PI ) b2 ( PS ) PI PS 4 4 4h 4h
2
育种值估计的准确度：
rAI b' r
b1
2
r1 X b2 r 2X

家畜育种学-PPT精选文档

主要参考书
张沅主编，《家畜育种学》（动物生产类专业用），中国农业出版社，2019 内蒙古农牧学院主编，《家畜育种学》第二版，全国高等农业院校教材，畜牧专业用北京：农业出版社，1990 焦骅主编，《家畜育种学》，全国高等农林专科统编教材（畜牧专业用），北京：中国农业出版社，2019 精品课程网页：/（学校）， jingpinke/xpe/portal/20a4bb00-1188-1000-8b6cac9dee625938（国家精品课程服务平台）。
/jcyzx/index.htm
主要内容
第8章个体选配（教材第10、11章）第9章种群选配（教材第12章）第10章家畜品系与品种的培育（教材第15、16章）第11章杂种优势利用（教材第13、14章）第12章家畜育种组织与规划（教材第22章）第13章家畜遗传资源多样性保护（教材第20、21章）第14章家畜育种新技术（教材第17～19章）专题讲座
围。最终提高种畜品质，增加生产群体的良种数量，生产
出符合市场需求的高质量畜产品。
/jcyzx/index.htm
对育种概念的两点理解 1. 育种是一个过程：
A B .选种：选好种用家畜家畜种用价值的遗传评估 .选配：配种方案制订配合力测定杂种优势利用
• 群体遗传学 • 数量遗传学
Mendel Hardy Lush
细胞遗传学分子遗传学
Morgan
Crick & Watson
/jcyzx/index.htm
二、家畜育种的意义
提供良种。良种是一个生产场赢利的保证育种对发展畜牧业的作用：畜牧生产效率的提高中，遗传育种的贡献率达40％。体现在： • 提供良种

家畜育种学06种畜的遗传评估(二)：多性状育种值估计—选择指数

0.0367 - 5.5501 - 0.1100 A - 5.5501 1490.1 - 5.6814 - 0.1100 - 5.6814 2.1661
其中：
2 A11 A hx2 x2 0.30 0.12 0.0367
1 1 1
择指数、最宜选择指数、以及通用选择指数等，因而成为
多性状选择的一种重要的方法。
/jcyzx/index.htm
第一节
选择指数概述
选择指数的类别
经典选择指数（selection index）
• 由Hazel（1943）提出。它将需要选择的几个性状，依据各自的遗传力、表型方差、经济加权值，以及相应的遗传相关和表型相关，制定的一个综合指标。然后计算出各个体的指数值，依据指数值的高低进行选留和淘汰。
选择指数制定步骤计算性状的表型方差、协方差矩阵和育种值方差、协方差矩阵；
i2 Pij rij i j hi2 i2 Aij r( ij ) hi i h j j
i j i j i j i j
计算各性状偏回归系数选择效果估计计算个体指数值
表7-1 猪三个性状的表型遗传参数和边际效益（表中右边4项的右上角为表型相关；右边4项左下角为遗传相关）
性状饲料利用率平均日增重胴体瘦肉率单位
2 p
x
2.8 650.0 60
w
-78.80 0.11 10.40
h
2
x1
— -0.75 -0.39
x2
-0.65 — -0.10
x3
-0.23 -0.25 —
选择指数效果的度量综合育种值估计准确度 Cov ( H , I ) I rHI

家畜育种学第六章(10级)

群体近交系数的计算
（1）规则近交：将群体中近交程度相同的个体数量乘以该近交系数后求和。（2）小群体：先求出每个近交个体的近交系数后，进行平均。（3）大群体：可随机抽取一定数量的家畜，并逐个求出它们的近交系数后进行平均。
4、闭锁群：
1 1 1 F 2 N e 8N S 8N D
（三）近交使群体均值下降
近交能使群体中的基因纯合，从而降低群体中的杂合子频率，那么随着群体中杂合子频率的降低，群体中的平均杂合效应值（I、D）也要减少。因此，群体的平均值就要下降。即群体的近交衰退。
设：F是一个近交系数，表示近交程度；H0表示原始群体中的杂合子频率。杂合子频率的减少与近交程度有关，近交程度越高，杂合子频率减少越多，因此，经过近交，杂合子频率就减少了 H0F。
第三节种群选配
所谓种群是指品种、品系或品种内的类群。种群选配主要是考虑交配双方所处的种群是同一种群还是不同种群。
一、杂交繁育
（一）杂交繁育的概念与作用 1、概念指不同品种以至不同种属个体间进行交配繁殖，同时进行选育提高的方法。 2、作用（1）杂交利用（2）杂交改良（3）杂交育种
近交使基因纯合的效应是普遍的，能使优良基因纯合，也能使不良基因纯合，优良基因纯合，可使优良性状固定下来，遗传下去；不良基因纯合，利于人们清除和淘汰。因此，在育种工作中适当采用近交，可加快育种速度。
（二）近交使群体产生分化
近交可提高纯合子频率，经过近交，一对基因可分化出两个纯系：如Aa×Aa→AA、Aa、aa 两对基因可分化出四个纯系：如AABB、AAbb，aaBB，aabb 如果有N对基因就可分化出2N个纯系，因而一个原本一致的群体最后被分化成2N个不同的纯合系，不同的纯合类型在品质、特点均不相同。

《家畜育种学课件》课件

家畜生殖器官重要性
繁殖管理
直接影响繁殖效果
疾病防控
疾病易发部位
遗传传递
决定后代品质
家畜繁殖管理技术
家畜繁殖管理技术是现代畜牧业中必不可少的一部分，通过人工授精、胚胎移植、优生学等技术手段，可以提高品种的遗传质量，加快育种进程，对于家畜的繁殖效率和质量起到关键作用。
家畜繁殖管理技术应用
种畜优选
家畜育种学的历史
驯养家畜的时期
最早期的人类开始与家畜动物相互驯
化
发展迅速
现代家畜育种学已经成为一个独立的
学科
科学技术的进步
家畜育种学不断受到科技进步影响
家畜遗传育种的意义
提高生产力
通过优选遗传优良的家畜，提高生产效率
经济效益
改良育种可以提高产品质量，带来更好的经济收益
满足需求
优良的家畜品种可以满足人类对肉、奶、毛等产品的需求
遗传算法
应用遗传算法优化家畜选配，提高育种效率
基因组测序
通过基因组测序技术，解读家畜基因组的结构和功能特征
其他新兴技术在家畜育种中的探索
除了基因编辑技术、转基因技术和生物信息学，还有诸如克隆技术、基因组选择等新兴技术在家畜育种领域的应用和探索。这些技术的不断发展和创新，为家畜育种带来了更多的机遇和挑战，推动了家畜品种改良的进程。
不同品种
不同用途
生长阶段
家畜饲养健康管理
疫病预防
定期消毒饲养场所接种疫苗
免疫注射
根据时间表进行疫苗接种
定期体检
检查家畜身体状况及时发现并处理疾病
01 多种因素影响经济效益 02 成本与收益分析 03 科学经营策略
结语

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则： Co(vA,P)Co(vA,A)rA2A
rAPrAPA
rA是提供信息的亲属个体与被估个体的亲缘系数。这意味着与被估个体亲缘关系越近的资料，估计的个体育种值准确性越高。
个体育种值估计的基本公式
EB A V bA(PP*P)
关键是计算出bAP
bAP
rAnh2估个体的亲缘系数 r：重复率或提供信息的多个同类个体的表型相关系数
遗亲传缘力系乘数以不同信息估计个体育种值的bAP
信息资料类型
一个体单次度量值
一个体k次度量均值
n个同类个体单次度量均值
本身亲本全同胞兄妹半同胞兄妹全同胞后裔半同胞后裔
h2 0.5h2 0.5h2 0.25h2 0.5h2 0.5h2
kh 2 1 (k 1)re
0.5kh 2 1 (k 1)re
多种资料育种值的估计
A=0.1A1+0.2A2+0.3A3+0.4A4
可见: 亲代的可靠性总是最低，同胞可靠性总是低于后裔本身资料的可靠性随h2增大而逐渐增大
复合育种值能充分利用所获得的资料，根据它进行选种的效果比根据单项资料的育种值好。
多种资料育种值的估计
例：计算表6-2中1250号个体多项资料的估计育种值（P.82）
多种资料育种值的估计
简化的复合育种值是将单项资料估计的育种值根据其可靠程度不同，给以不同的权数复合而成的。
为了计算方便，可将四种资料对应的权数定为0.1，0.2，0.3，0.4
即 A=0.1A1+0.2A2+0.3A3+0.4A4
多种资料育种值的估计
A=0.1A1+0.2A2+0.3A3+0.4A4
0.5kh 2 1 (k 1)re
0.25 kh 2 1 (k 1)re
0.5kh 2 1 (k 1)re
0.5kh 2 1 (k 1)re
h2
0.5nh2 1 0.5(n 1)h2
0.25nh2 10.25(n1)h2
0.5nh2 1 0.5(n 1)h2
0.5nh2 10.25(n1)h2
精品
家畜育种学第6章育种值估计2011
个体育种值的概念
数量性状表型值由个体基因型值和环境效应值共同决定。 P=G+E
P=A+D+I+E
P=A+R（剩余值）
个体育种值的概念
估计育种值
个体育种值无法直接测量，能够测定的是包含育种值在内的各种遗传效应和环境效应共同作用得到的表型值。
只能利用统计学方法，通过表型值和个体间的亲缘关系对育种值进行估计，由此得到的估计值称为估计育种值（EBV）
H2=0.5,为中等遗传力性状 A=0.1*AP+0.2*AHS+0.3*A+0.4*AHO =0.1*14.0+0.2*13.52+0.3*13.5+0.4*13.62=13.602
（参见P.86 13.6672）
Thanks！
个体本身，个体父亲，个体半同胞计算的育种值分别为13.5， 14.0，13.52 （P.81）
半同胞后裔：
bAP 10 0..5 2(n51 2n )h2h10 0..5 2 (555 0 010 ). 50.50.4717
AHO PbA(PPP)1.4 00.47 1(17.3 21)41.3 6226
个体育种值的概念
估计传递力
对数量性状而言，个体育种值的一半能够传递给下一代，将其定义为估计传递力
ETA EBV 2
个体育种值估计的基本公式
通过直线回归方程，由自变量P（表型值）求依变量A（育种值）的估计值
A b AP ( P P ) A
A b AP ( P P ) P
bAP是育种值对表型值的回归系数
个体育种值估计的基本公式
若A和P均以离均差形式表示，则：
A b AP ( P P ) P
A b AP P
σ b AP rAP A σP
Cov(A, P)
σ σ rAP
AP
个体育种值估计的基本公式
σ bAPrAP A , rAPCovP(A ) ,
σ σσ P
AP
一般假设Cov（A，R）=0
当h2<0.2时，A1、A2 、A3、 A4分别为根据亲代、本身、同胞、后裔资料估计的育种值(低h2)。
当0.2≤h2<0.6时，A1、A2 、A3、 A4分别为根据亲代、同胞、本身、后裔资料估计的育种值(中等h2)。
当h2≥0.6时，A1、A2 、A3、 A4分别为根据亲代、同胞、后裔、本身资料估计的育种值(高h2)。