地中海贫血单基因突变遗传病检测的新方法
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英文缩略词袭英文缩写荚文全称中文全称bpcm℃DNAdNTPEB嚣转i麓Gaap—PCRHbkbL.iM.minMCH氛瑗C珏CMCVmgmlmmMngnlODpCRpaRBC黼l∞WrpmltNAbasepair碱基对centimeter厘米degree(s)centigrade摄氏发deoxyribonucleic脱氧援耱孩酸deoxyribonueleosidetriphosphate脱氧三磷酸核糖核酸ethidiumbromide溴化乙键ethylenediaminetetraaceticacid乙二黢器|乙酸gram,gravity克,徽力加速度gappolymemsechainreaction跨越断裂点PCRhemoglobin血红鬣自kilobase子碱慕辩liter舞munite分钟meancorpuscularhemoglobin平均纽细胞血红鬣白量m凇corpuscularhemoglobin平缘缎缓施盘筑鬣concentration白浓殿meancorpuscularvalume平均数细胞体积milligram毫克milliliter毫舞micrometer微升millimolarperliter毫摩尔没升nanogram纳克micleotide核营酸opticaldensity竞密嶷polymerasechainreaction聚合酶链反应powerofhydrogenpn值redbloodcell一红细胞recersedotblot反自袋杂交redbloodcelldistributivewidth红细稳分布宽凄指index数revolutionperminute每分钟转速ribonuclcicacid核糖缓羧2攮要背景和目的地中海贫傲(地贫)趋~种珠蛋白链合成比例失獭的单基因遗侮癍,豢受镶臻蛋鑫豹不弼分隽程遮贫帮t3遗贫嚣大炎。
均呈常染色体隐性遗传,伐地贫主要由发生于16号染色体短臂末端旺珠缀白基因簇内包含n基因猩内的缺失引超,少数由点突变引起,§趣贫主要由发生予位于ll-譬染色俸短爨蛇13基因内的点突变g}麓。
地中海贫血检测的方法目前,用于地中海贫血检测的方法的代表性技术大体可分为以下两类:检测基因缺失突变的单管多重跨越断裂点PCR技术和多重连接探针扩增技术(MLPA);检测基因点突变的反向点杂交技术(RDB)、变性高效液相色谱技术(dHPLC)]和DNA序列分析技术等。
此外,最近发展的基于实时荧光PCR平台的新技术,如用于α地贫缺失拷贝数定量的实时荧光PCR直接检测技术、以及用于检测β地贫点突变的基于探针熔解曲线的基因分型技术(PMCA),可能是下一步更新换代的技术选择。
上述胛p PCR、RDB和MLPA等为地贫检测的主流技术。
1.Southern 印迹法优点:分析缺失型α-地中海贫血分子缺陷的可靠技术缺点:操作繁冗,不宜作为常规手段2.联合检测平均红细胞参数(MCV、MCH)+红细胞脆性检测+Hb(血红蛋白)电泳MCV:平均红细胞容积 MCH:平均红细胞血红蛋白量3.PCR-RDB法(PCR/寡核苷酸探针反向斑点杂交法)检测中国南方常见的17种β地贫突变:CD41~42(-TCCT)、IVS-2 nt654 C →T、-28 A→G、CD71~72(+A)、CD71~72(+T)、CD17 A→T、CD26 G→A、CD31(-C)、CD27~28(+C)、CD43 G→T、-32 C→A、-29 A→G、-30 T→C、CD14~15(+G)、CAP、Int及IVS-1 nt5 G→C4.α地中海贫血的基因诊断依据Gap-PCR原理采用单管四重PCR法(多重PCR技术)对其基因组DNA进行扩增,同时检测-α3.7、-α4.2、--SEA和正常对照4种等位基因型,采用1.2%琼脂糖凝胶电泳分离扩增产物,通过片断大小判断患者的基因型。
5.采用PCR-RFLP方法检测非缺失型α地贫Hb Constant Spring(HbCS)。
地中海贫血基因遗传规律地中海贫血是一种常见的遗传性疾病,主要发生在地中海、中东、北非等地区。
该疾病是由于基因突变导致体内血红蛋白合成受到影响,引起贫血等症状。
本文将介绍地中海贫血的基因遗传规律,包括遗传方式、突变类型和基因检测等方面。
一、遗传方式地中海贫血是一种常染色体隐性遗传疾病。
人类体细胞中有23对染色体,其中有一对性染色体。
男性有XY染色体,女性有XX染色体。
地中海贫血基因位于第11号染色体上,是由HBB基因编码的血红蛋白β链所致。
一个人有两个HBB基因,一个来自父亲,一个来自母亲。
如果两个基因都正常,那么这个人就不会得地中海贫血。
如果一个基因正常,一个基因携带突变,那么这个人是携带者,不会得地中海贫血,但有可能将突变基因传给后代。
如果两个基因都携带突变,那么这个人就会得地中海贫血。
二、突变类型地中海贫血是由多种不同类型的突变引起的。
最常见的突变类型是点突变,即基因序列中的一个碱基发生突变。
点突变包括错义突变、无义突变和同义突变。
错义突变是指突变后的基因编码的氨基酸与原来不同,导致血红蛋白的结构和功能发生改变,从而引起地中海贫血。
无义突变是指突变后的基因编码的氨基酸变为终止密码子,导致基因转录过程提前终止,从而缺失血红蛋白β链的一部分,引起地中海贫血。
同义突变是指突变后的基因编码的氨基酸与原来相同,但可能会影响基因转录和翻译,从而导致地中海贫血。
除了点突变,地中海贫血还可能由缺失、插入和重复等突变引起。
缺失突变是指基因序列中丢失了一段碱基,导致血红蛋白β链缺失一部分,引起地中海贫血。
插入突变是指基因序列中插入了一段碱基,导致血红蛋白β链多出一部分,引起地中海贫血。
重复突变是指基因序列中某些碱基重复出现,导致血红蛋白β链中某些氨基酸重复出现,引起地中海贫血。
三、基因检测地中海贫血是一种遗传性疾病,可以通过基因检测来诊断和筛查。
基因检测可以检测HBB基因的突变情况,从而确定一个人是否患有地中海贫血或是携带突变基因。
地中海贫血基因检测校准方案地中海贫血是一种以地中海沿岸国家为主要分布区域的常见遗传性疾病。
由于地中海贫血的高发性和普遍性,对其进行有效的基因检测和校准方案显得尤为重要。
本文将深入探讨地中海贫血基因检测的校准方案,揭示其中的重要性和挑战,并分享本人的观点和理解。
一、地中海贫血基因检测的重要性地中海贫血是由基因突变引起的血红蛋白合成障碍性疾病,主要通过遗传方式传播。
了解个体的地中海贫血基因状态对于疾病的筛查、诊断和预防具有重要意义。
1. 提早进行准确诊断:地中海贫血携带者通常无症状,而患者则可能出现疲劳、贫血、乏力等症状。
准确诊断可以让患者及时采取治疗和管理措施。
2. 预防婴儿地中海贫血的出生:如果双亲中至少有一人是地中海贫血的携带者,那么他们的子女有高风险患上地中海贫血。
通过基因检测,可以提前判断是否存在携带地中海贫血基因的可能,并采取相应的遗传咨询和生育计划。
3. 促进国家的健康政策:了解地中海贫血的患病情况和携带者比例可以为制定针对该疾病的防控政策提供参考依据,包括基因检测的普及和家庭遗传咨询的推广。
二、地中海贫血基因检测的挑战然而,地中海贫血基因检测也存在一些挑战,主要包括以下几个方面:1. 基因多样性和突变类型:地中海贫血是由多个基因的遗传变异引起的,不同基因突变类型的检测方法和策略也不尽相同。
建立一个全面且准确的基因检测校准方案对于覆盖不同地区和人群的遗传变异至关重要。
2. 检测技术的选择:目前,基因检测方法包括传统的PCR和Sanger测序、Next Generation Sequencing(NGS)等。
不同的检测技术在准确性、成本和效率等方面存在差异,需要根据特定的实际情况选择合适的技术。
3. 公众意识和接受度:由于地中海贫血是一种遗传性疾病,公众对于基因检测的认知和接受度往往存在差异。
加强公众教育,提高对基因检测和遗传咨询的认识度,可以促进地中海贫血基因检测的普及和应用。
三、地中海贫血基因检测校准方案的优化为了解决以上挑战,以下是我对地中海贫血基因检测校准方案的一些建议和观点:1. 多样性覆盖和标准化:建立一个多样性覆盖的基因检测校准方案,包括覆盖多个地区和人群的常见和罕见地中海贫血基因突变。
应用Taqman-MGB 探针法检测地中海贫血Hb Westmead突变陈文强;陈萍;庞丽红;李树全;林伟雄;杨德寨【摘要】目的建立Taqman-MGB探针法对α地中海贫血Hb Westmead突变进行检测,了解在广西地区平均红细胞体积在70~80 fL患者的Hb Westmead突变基因携带情况.方法对200例入选患者进行Taqman-MGB 探针法检测Hb Westmead突变,并用基因测序法进行验证.结果共检测出12例Hb Westmead 突变基因携带者,Taqman-MGB 探针法检测结果和基因测序法检测结果相符.结论Taqman-MGB 探针法可快速、简便检测Hb Westmead突变,特异性高,结果可靠.广西地区的Hb Westmead突变有较高的发生率.%Objective To establish a detection methods by Taqman-MGB probe, which can detect mutation of Hb Westmead, and understand the mutant gene carrying at Hb Westmead patients whose mean corpuscular volume in the 70 - 80 fL rang in the Guan-gxi region. Methods 200 cases of selected patients were detected by Taqman-MGB probe at Hb Westmead mutation , and verified by gene sequencing. Results A total of 12 cases of Hb at Westmead mutation carriers were found, the Taqman-MGB probe assay results is match with gene sequencing assay results. Conclusion The Taqman-MGB probe is a quick, specificity , easy and reliable detection method at Hb Westmead mutations. There have a higher incidence of Westmead mutation in Guangxi region.【期刊名称】《重庆医学》【年(卷),期】2012(041)032【总页数】3页(P3408-3409,3411)【关键词】Taqman-MGB探针;地中海贫血;Hb Westmead突变【作者】陈文强;陈萍;庞丽红;李树全;林伟雄;杨德寨【作者单位】广西医科大学医学科学实验中心,南宁,530021;广西医科大学医学科学实验中心,南宁,530021;广西医科大学第一附属医院产前诊断中心,南宁,530021;广西医科大学医学科学实验中心,南宁,530021;广西医科大学医学科学实验中心,南宁,530021;广西医科大学医学科学实验中心,南宁,530021【正文语种】中文地中海贫血(以下简称地贫)是一种常染色体遗传慢性溶血性疾病,该病多见于我国广东,广西等地区。
α地中海贫⾎3种点突变基因检测(CS、QS、WS)项⽬
简介
α地中海贫⾎3种点突变基因检测(CS、QS、WS)
项⽬简介
地中海贫⾎是全球⼴为流⾏的遗传性溶⾎性疾病,属于常染⾊体隐性遗传的⼈类⾎红蛋⽩病,全世界⾄少有3.45亿⼈携带地中海贫⾎的致病基因。
全球地中海贫⾎基因携带者频率⾼达2.62%,包括中国南⽅在内的东南亚地区,印度次⼤陆、地中海地区、中东、北⾮和太平洋地区都是该病的⾼发地区,尤其我国⼴西的携带率⾼达24%、⼴东⾼达11%。
由于携带者没有症状,然⽽婚配的下⼀代却有1/4的机会罹患严重溶⾎性贫⾎症状的重症地中海贫⾎,因⽽构成了严重的公共健康问题。
⽬前,对此类遗传病尚⽆有效的治疗⽅法,但通过产前诊断可避免重症地中海贫⾎患⼉的出⽣,这是⽬前国际上公认的⾸选预防措施。
临床意义:
地中海贫⾎基因突变位点众多,α地中海贫⾎基因突变类型主要为缺失,点突变⽐较少见,本项⽬针对相对常见的三个α地中海贫⾎基因点突变进⾏检测,可作为地中海筛查和诊断的辅助检测。
适检情况
1、地贫基因全套查⽆α地贫基因缺失,但患者有地贫临床表现,需进⼀步检测较为常见的三种α地贫基因点突变
2、家族中有地中海贫⾎疾病的⾼危⼈群,联合地贫基因全套进⾏较全⾯的筛查
标本采集要求
1、填写地贫基因检测的专⽤申请单。
2、EDTA抗凝管取全⾎2ml,2-8℃保存,当天送检
临床项⽬收费标准。
地中海贫血基因检测实验步骤地中海贫血(Mediterranean anemia),又称为地中海型家族性小红细胞性贫血,是一种常染色体隐性遗传病。
该病是由珠蛋白基因缺陷引起的,导致血红蛋白结构异常,造成红细胞携氧能力减弱。
地中海贫血的基因检测通常涉及以下几个步骤:1. 样本采集:- 采集患者的血液样本或使用拭子采集口腔黏膜细胞。
2. DNA提取:- 从血液或细胞样本中提取DNA。
这通常涉及破坏细胞膜和核膜,然后使用化学试剂纯化DNA。
3. PCR扩增:- 利用聚合酶链反应(PCR)技术,特异性地扩增珠蛋白基因的特定片段。
这通常涉及设计针对基因突变热点区域的引物,并通过循环加热和退火步骤使目标DNA片段指数级增长。
4. 凝胶电泳:- 将PCR产物通过凝胶电泳进行分离,根据大小将不同长度的DNA片段分开。
这有助于识别是否存在特定的突变。
5. 基因测序:- 对PCR产物进行测序,以识别可能的基因突变。
测序可以揭示DNA序列中的碱基替换、插入或缺失,这些改变可能与地中海贫血的发生有关。
6. 突变分析:- 将测序结果与已知的突变数据库进行比对,以确定是否存在与地中海贫血相关的特定基因突变。
7. 数据解读:- 根据突变分析的结果,结合患者的临床症状和家族史,医生或遗传顾问将解释检测结果,并提供遗传咨询服务。
8. 报告编写:- 编写一份包含检测结果和相关解释的报告,供医疗专业人员和患者参考。
基因检测对于诊断地中海贫血非常重要,它不仅可以帮助确诊患有该病的个体,还可以为家族成员提供风险评估和遗传咨询。
随着科技的进步,新的检测技术(如芯片基因分型和下一代测序)正在使地中海贫血的基因检测变得更加快速和精确。
单基因遗传病致病位点鉴定方法
以下是 6 条关于单基因遗传病致病位点鉴定方法:
1. 测序法呀,就像是在基因的世界里来一场超级大探秘!比如说,对囊性纤维化这个病,通过测序法就像给基因做了个全面扫描,能精准找到那个捣乱的致病位点呢!这是不是超级酷?
2. 基因芯片法呢,嘿,就像是给基因准备了一张超级大拼图!拿地中海贫血来举例,利用基因芯片法能快速把那些跟致病有关的小碎片给拼凑起来,找到关键位点,厉害吧!
3. 连锁分析法,哇哦,这就像是顺着基因的线索一路追踪!想想镰刀型细胞贫血症,通过连锁分析我们就能顺藤摸瓜找到那个隐藏的致病位点呀,很神奇对不对?
4. 荧光原位杂交法,这不就是给基因装上了小彩灯嘛!比如在检测杜氏肌营养不良时,这个方法就像明灯一样指出致病位点在哪里,太妙啦!
5. 酶切分析法,嗯哼,就好像是用一把小剪刀去剪开基因的秘密!像血友病就是通过它能准确找到致病位点哦,是不是很有意思呀?
6. 新一代测序技术,哇塞,这简直是基因鉴定的超强武器啊!就像是给整个基因世界来了个地毯式搜索,对各种单基因遗传病的致病位点都能一网打尽,太牛了呀!
我的观点结论就是:这么多单基因遗传病致病位点鉴定方法各有各的神奇和厉害之处,为攻克疾病提供了强大的手段呀!。
地中海贫血的遗传筛查和产前诊断整理版地中海贫血是一种常见的遗传性疾病,主要由血红蛋白的异常合成引起。
在地中海地区高发,因此得名。
由于该疾病的严重危害性以及其遗传方式,遗传筛查和产前诊断成为重要的手段来预防和管理地中海贫血。
本文将介绍地中海贫血的遗传方式、遗传筛查和产前诊断的方法以及相关的注意事项。
一、地中海贫血的遗传方式地中海贫血主要由β地中海贫血和α地中海贫血两种类型组成。
β地中海贫血是由β珠蛋白基因的缺陷引起,而α地中海贫血则是由α珠蛋白基因的异常引起。
β地中海贫血的遗传方式为常染色体隐性遗传,即两个健康的人携带有缺陷的β珠蛋白基因时,他们的子女有25%的几率患上地中海贫血。
而α地中海贫血的遗传方式稍有不同,因其相关基因位于染色体中的同一基因座上,所以遗传方式为常染色体显性遗传,即一个携带有缺陷的α珠蛋白基因的父母至少有一个是患者时,他们的子女有50%的几率患上地中海贫血。
二、地中海贫血的遗传筛查方法地中海贫血的遗传筛查是通过检测相关基因的突变情况来确定个体是否携带有地中海贫血相关的基因突变。
目前常用的检测方法包括DNA序列分析、限制性片段长度多态性(RFLP)分析、血红蛋白电泳以及聚合酶链反应(PCR)方法等。
这些方法通过检测模板DNA中的特定位点,可以确定是否存在基因突变。
通过遗传筛查,可以及早发现携带地中海贫血相关基因的个体,从而进行相应的预防和管理。
三、地中海贫血的产前诊断方法对于已经怀孕的孕妇,如果存在地中海贫血相关基因的携带者,可以通过产前诊断来确定胎儿是否患有地中海贫血。
常用的产前诊断方法包括滴血试验、羊膜穿刺和绒毛活检等。
滴血试验是一种简单、无创且低风险的产前诊断方法,通过抽取孕妇的静脉血进行基因检测,可以初步判断胎儿是否携带地中海贫血相关基因。
而羊膜穿刺和绒毛活检则是更精确的产前诊断方法,但其操作风险较高,需谨慎选择适用人群。
四、地中海贫血遗传筛查和产前诊断的注意事项在进行地中海贫血的遗传筛查和产前诊断时,有一些注意事项需要牢记。
第1篇一、实验背景地中海贫血(Thalassemia)是一种由于珠蛋白基因缺陷引起的遗传性溶血性贫血病。
根据珠蛋白基因突变的不同,地中海贫血可分为α-地中海贫血和β-地中海贫血两大类。
本实验旨在通过分子生物学技术对疑似地中海贫血患者进行基因检测,以确定其基因型,为临床诊断和治疗提供依据。
二、实验目的1. 确定疑似地中海贫血患者的基因型。
2. 为临床诊断和治疗提供科学依据。
三、实验材料1. 样本:疑似地中海贫血患者的血液样本。
2. 试剂:DNA提取试剂盒、PCR试剂盒、DNA测序试剂盒等。
3. 仪器:PCR仪、电泳仪、测序仪等。
四、实验方法1. 样本DNA提取:采用DNA提取试剂盒提取疑似地中海贫血患者的血液样本DNA。
2. PCR扩增:根据α-地中海贫血和β-地中海贫血的基因突变位点,设计特异性引物,进行PCR扩增。
3. PCR产物检测:通过琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物,观察条带情况。
4. DNA测序:对扩增产物进行DNA测序,确定基因突变位点。
5. 基因型分析:根据测序结果,分析疑似地中海贫血患者的基因型。
五、实验结果1. 样本DNA提取:成功提取疑似地中海贫血患者的血液样本DNA。
2. PCR扩增:成功扩增出α-地中海贫血和β-地中海贫血的基因片段。
3. PCR产物检测:电泳结果显示,扩增产物大小与预期相符。
4. DNA测序:测序结果显示,疑似地中海贫血患者的基因存在突变。
5. 基因型分析:根据测序结果,确定疑似地中海贫血患者的基因型为α-地中海贫血杂合子。
六、讨论与分析1. α-地中海贫血是一种常染色体隐性遗传病,主要由于α-珠蛋白基因缺陷引起。
本实验通过PCR和DNA测序技术,成功检测出疑似地中海贫血患者的基因突变,为临床诊断提供了依据。
2. α-地中海贫血的基因型可分为纯合子和杂合子。
本实验结果显示,疑似地中海贫血患者的基因型为α-地中海贫血杂合子,提示其可能表现为轻型α-地中海贫血或无症状携带者。
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地中海贫血单基因突变遗传病检测的新方法二、立论依据
(包括项目的研究意义、国内外研究现状分析,并附主要参考文献及出处)
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三、研究方案
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四、研究基础
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* 论文:作者·题目·刊名·年份·卷(期)·页码
专著:作者·书名·出版者·年份
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五、经费预算
注: 预算支出科目按下列顺序填写: 1. 科研业务费 2. 实验材料费 3. 仪器设备费 4. 实验室改装费5. 协作费 6. 项目组织实施费。
(3)DNA甲基转移酶的活性分析用于抑制剂药物筛选DNA甲基化在原核细胞和真核细胞中起着重要作用,因此通过应用DNA甲基转移酶抑制剂,可以特异性抑制异常甲基化的发生,使因DNA甲基化失活的抑癌基因恢复其自身转录功能,逆转肿瘤细胞的生物学活性,以达到预防和治疗肿瘤的目的。
选择具有代表性的两种抗癌药物5-氮杂胞苷(5-Aza)和5-氮杂-2-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)作为检测方法中的抑制剂,分别得到其对DNA甲基转移酶的IC50值(酶活性降低50%时抑制剂的浓度)。
(4)研究药物5-氮杂-2-脱氧胞苷对白血病细胞HL-60生物学行为的影响
DNA甲基化是恶性肿瘤的一个重要特征,DNA甲基化与DNA甲基转移酶活性和表达量的变化密切相关,是导致肿瘤细胞DNA甲基化紊乱的关键。
研究表明,DNA甲基转移酶抑制剂5-Aza-CdR 可恢复多种基因活性,使许多肿瘤的恶性表型发生逆转。
拟通过DNA甲基转移酶抑制剂5-Aza-CdR作用于白血病细胞株HL-60,检测其对细胞增殖、细胞生长周期和细胞凋亡的影响及DNA甲基转移酶活性变化情况,以阐明5-Aza-CdR作用白血病细胞株HL-60的机制,为5-Aza-CdR临床治疗白血病提供理论基础。
(4)研究药物5-氮杂-2-脱氧胞苷对白血病细胞HL-60生物学行为的影响
体外培养白血病细胞株HL-60细胞,使用不同浓度5-Aza-CdR 处理白血病细胞株HL-60细胞。
通过四甲基偶氮唑盐(MTT)比色实验来检测5-Aza-CdR对白血病细胞株HL-60存活率的影响。
应用流式细胞术检测5-Aza-CdR对白血病细胞株HL-60的细胞周期及细胞凋亡的影响。
利用智能荧光探针检测5-Aza-CdR处理HL-60细胞前后DNA甲基转移酶活性变化。
蛋白质印迹检测相关蛋白表达水平等。