SmaⅠ:5 ’ -CCC↓GGG-3’ →5'…CCC GGG..3’ 3 ’ -GGG↓CCC-5’ →3'…GGG CCC..5’
• Ⅱ类限制性内切酶可分四类:
1.异源同工酶:是不同来源分离得来的不同酶,它们 有相同的识别序列,切割方式可以相同,也可不同。 如HpaⅡ与MspI,它们识别和切割序列相同,但MspI 还可识别切割已甲基化的序列,如GG mCC。SmaI 和XmaI识别序列相同,但切割位点和方式不同,前 者产生平末端,后者产生5‘粘性末端。
2.限制性内切酶及其缓冲液购自TAKARA公司, 在配套的缓冲液中该限制性内切酶均可获得 100%酶切活性。
3.灭菌的离心管和移液器Tip头
三、试剂
1.5×TBE电泳缓冲液:称取 Tris 54 g,硼酸27.5 g, 并加入 0.5M EDTA (pH8.0) 20ml,定溶至1000 ml。 0.5×TAE为配制琼脂糖凝胶及其电泳的应用缓冲液。
成0.5×TBE稀释缓冲液。 2、胶板的制备:将冷却至60℃左右的琼脂糖凝胶液,缓慢倒入内
槽,直至所需厚度,注意不要形成气泡,特别是梳子下,如有 气泡可用牙签挑破。待胶凝固后,小心取出梳子,将带凝胶的 内槽放入电泳槽中,凝胶点样端靠近负极。 3、加入1×TAE缓冲液至电泳槽中,使缓冲液淹过凝胶表面0.5 CM。 4、加样:剪取适当大小的蜡膜(Parafilm膜),取6×上样缓冲液1 μl点于膜上数点。取5 μl酶切DNA样品、0.5-1 μg未酶切质 粒DNA、DNA分子量标准分别与上样缓冲液混匀,将其分别加入 凝胶点样孔,记录点样顺序及点样量。 5、电泳: 接通电源槽与电泳仪的电源(点样端接负极,另一端接 正极),调好电压(5 V/cm凝胶长度),开始电泳。当溴酚蓝6、观察结果:取出内槽,将凝胶小心推入紫外扫描分析仪的玻璃 平板上,关上仪器防护屏,在计算机上观察并扫描记录质粒DNA 与酶切DNA电泳结果,比较分析经酶切与未经酶切的DNA图谱的 区别。