次级键及超分子结构化学
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专题4.范德华力Van der Waals' force一、次级键secondary bond1.concept次级键,除了典型的强化学键(共价键、离子键和金属键)等,依靠氢键以及弱的共价键和范德华 作用力相结合的各种分子内和分子间作用力的总称;2.次级键可根据原子间的距离、核磁共振谱和光谱等实验数据来确定;化学反应过程中形成的过渡态正是以次级键为特征的中间体或活化络合体; 次级键在物质的结构和性质的研究以及生物体系和超分子化学中起重大作用;3.反映在分子结构上,当原子间距离小于或接近相应的离子半径、共价半径或金属半径之和时, 可以认为原子间形成了化学键;当不同分子中的原子间距离范德华半径之和时,可以认为分子间存在着范德华力; 当原子间距离介于化学键与范德华力范围之间时,可以认为原子间生成次级键;4.次级键普遍客观存在,且化学键、次级键和范德华力三者之间的界限是很难明确划分;5.次级键中有相当一部分是有氢原子参与的;氢键(hydrogen bond )是次级键的一个典型,也是最早发现和研究的次级键;二、范德华半径V an der Waals radius1.concept:非金属元素有一种半径,叫范德华半径;原子的范德华半径是指当分子中两个相邻但不成键的原子靠近至一定距离时,可设想原子本身 的排斥力范围为一刚性球体,这一球体的半径称为范德华半径;2.如图表示出2个Cl 2,在同一个Cl 2里,2个Cl 核间距的一半是共价半径共r ; 在不同的2个Cl 2间,2个Cl 的核间距的一半是范氏半径范r ,显而易见共r <范r ;3.区别与联系①一般来说,对于金属元素,只有共价半径和金属半径; ②非金属元素(稀有气体除外)有共价半径和范德华半径; ③稀有气体元素只有范德华半径;④高中教材上原子半径全部用的是共价半径,所以稀有气体元素与同周期其它元素没有可比性;三、偶极dipole1.concept :偶极---表示分子的极性;2.偶极可以分为三类:①固有偶极:极性分子中由于组成元素不同,其吸引电子的能力各有差异(元素周期律),这就使 得分子中有电子偏移的现象,这样就产生了极性,并且偶极持续存在,称为固有偶极;-+δδCl H —②诱导偶极:是指非极性分子在电场中或者有其他极性分子在较近距离的情况下,由于电子带 负电,核带正电,它们会发生偏移,这种现象称为诱导偶极;③瞬时偶极:一切分子中,不管是极性分子还是非极性分子,原子核时刻在震动,电子时刻在 运动、跃迁,在它们运动的时候,偶尔离开平衡位置而产生极性,只不过这个过程持续时间 很短,故称瞬时偶极;四、偶极矩dipole moment1.concept正、负电荷中心间的距离和电荷中心所带电量的乘积,它是一个矢量,方向规定为从正电中心 指向负电中心,用符号μ表示,单位为库伦·米(C·m ); ①当一个电量(C e 19106022.1-⨯=)的正、负电荷相距m 1010-,则其偶极矩为: m C ⋅⨯=-29106022.1μ;②在静电制中,上述偶极矩为deb esu cm 8.4108.418=⋅⨯=-μ;③德拜是偶极矩的另一种单位,两者之间的换算为:m C deb ⋅⨯=-3010336.31; 2.偶极矩的数学表达式为μ=qd ;3.应用:①衡量键的极性强弱⎪⎩⎪⎨⎧≠=越大,键的极性越强,极性共价键,非极性共价键μμμ00【键的偶极矩简称键矩】A -B 键矩/deb A -B 键矩/debA -B 键矩/deb H -C 0.4 C -C 0 N -F 0.17 H -N 1.31 C -N 0.22 C =C 0 H -O 1.51 C -O 0.74 C =N 0.9 H -S 0.68 C -S 0.9 C =O 2.3 H -Cl 1.08 C -F 1.41 C =S 2.6 H -Br 0.78 C -Cl 1.46 N =O 2.0 H -I 0.38 C -Br 1.38 P =O 2.7 H -P 0.36 N -O 0.3 S =O 3.0②判断多原子分子极性强弱⎪⎩⎪⎨⎧≠=越大,分子的极性越强,分子是极性分子,分子是非极性分子μμμ00分子 μ/(m C ⋅-3010))10/(10m r - )10/(30m C er ⋅- er /μ CO 0.39 1.1283 18.08 0.02 HF 6.37 0.9168 14.69 0.43 HCl 3.50 1.2744 20.42 0.18 HBr 2.64 1.4145 22.66 0.12 HI1.271.6090 25.780.05五、范德华力V an der Waals' force1.concept范德华力(又称分子作用力)产生于分子或原子之间的静电相互作用;范德华力偶极子电荷位移近邻原子相互作用电偶极矩的感应作用−−−−−→−→→)(dipoles 2.范德华力又可以分为三种作用力:诱导力、色散力和取向力;①色散力dispersion force 【非极性分子间形成】※色散力(也称“伦敦力”,London force )是指非极性分子相互靠拢时,它们的瞬时偶极矩之间 产生的很弱的吸引力,所有分子或原子间都存在;※是分子的瞬时偶极间的作用力,即由于电子的运动,瞬间电子的位置对原子核是不对称的, 也就是说正电荷重心和负电荷重心发生瞬时的不重合,从而产生瞬时偶极;※色散力和相互作用分子的变形性有关,变形性越大(分子量愈大,变形性愈大)色散力越大; ※色散力和相互作用分子的电离势(即为电离能)有关,分子的电离势越低(分子内所含的电子数 愈多),色散力越大;※色散力的相互作用随着61r 而变化;其公式为:I 1和I 2 分别是两个相互作用分子的电离能,α1和α2 是它们的极化率;206212121d )4(123E πεααr I I I I +-= ※色散力是菲列兹·伦敦(Fritz London )于1930年根据近代量子力学方法证明的,由于从量子 力学导出的理论公式与光色散公式相似,因此把这种作用称为色散力,又叫做伦敦力; ②诱导力induction force 【极性与非极性分子间或极性分子间形成】※诱导力在极性分子和非极性分子之间或极性分子和极性分子之间都存在诱导力; ※由于极性分子偶极所产生的电场对非极性分子发生影响,使非极性分子电子云变形(即电子云 被吸向极性分子偶极的正电的一极),结果使非极性分子的电子云与原子核发生相对位移,本 来非极性分子中的正、负电荷重心是重合的,相对位移后就不再重合,使非极性分子产生了 偶极;※这种电荷重心的相对位移叫做“变形”,因变形而产生的偶极,叫做诱导偶极,以区别于极 性分子中原有的固有偶极;※诱导偶极和固有偶极就相互吸引,这种由于诱导偶极而产生的作用力,叫做诱导力;※在极性分子和极性分子之间,除了取向力外,由于极性分子的相互影响,每个分子也会发生 变形,产生诱导偶极;其结果使分子的偶极距增大,既具有取向力又具有诱导力; ※在阳离子和阴离子之间也会出现诱导力; ※诱导力与极性分子偶极矩的平方成正比;※诱导力与被诱导分子的变形性成正比,通常分子中各原子核的外层电子壳越大(含重原子越多)它在外来静电力作用下越容易变形;相互作用随着61r而变化,诱导力与温度无关;其公式:α为极化率;620212)4(rE πεμα-=诱 ③取向力dipole-dipole force 【极性分子间形成】 ※取向力发生在极性分子与极性分子之间;※由于极性分子的电性分布不均匀,一端带正电,一端带负电,形成偶极;因此,当两个极性 分子相互接近时,由于它们偶极的同极相斥,异极相吸,两个分子必将发生相对转动;这种 偶极子的互相转动,就使偶极子的相反的极相对,叫做“取向”;这时由于相反的极相距较 近,同极相距较远,结果引力大于斥力,两个分子靠近,当接近到一定距离之后,斥力与引 力达到相对平衡;这种由于极性分子的取向而产生的分子间的作用力,叫做取向力; ※取向力与分子的偶极矩平方(μ)成正比,即分子的极性越大,取向力越大; ※温度越高,极性分子运动越活跃,越不容易取向,取向力越弱;其公式为:0622214132E πεμμkTr -=取 μ1,μ2为两个分子的偶极矩;r 为分子质心间的距离,k 为Boltzmann 常数,T 为热力学温度, 负值表示能量降低; ④三种力的关系※极性分子与极性分子之间,取向力、诱导力、色散力都存在; ※极性分子与非极性分子之间,则存在诱导力和色散力; ※非极性分子与非极性分子之间,则只存在色散力;※这三种类型的力的比例大小,决定于相互作用分子的极性和变形性; ※极性越大,取向力的作用越重要;变形性越大,色散力就越重要;※诱导力则与这两种因素都有关;但对大多数分子来说,色散力是主要的; ※只有偶极矩很大的分子(如水),取向力才是主要的;而诱导力通常是很小的; ※极化率α反映分子中的电子云是否容易变形;※虽然范德华力只有0.4~4.0kJ/mol ,但是在大量大分子间的相互作用则会变得十分稳固;。
第十章次级键和超分子结构次级键是除共价键、离子键和金属键以外,其他各种化学键的总称。
次级键涉及分子间和分子内基团间的相互作用、涉及超分子、各种分子组合体和聚集体的结构和性质、涉及生命物质内部的作用等等,内涵极为丰富。
10.1 键价和键的强度早期的键级和键长的关系:'log 711'n d d n −=n’为键级;d n 为键长。
键价理论认为:键长是化学键强弱的一种量度,原子组成分子化学键,键长值小、键强度高、键价数值大;反之,键长值大、键强度低、键价数值小;1)两原子间的键长r ij 与键价S ij 的关系:]/exp[0B r R S ij ij −=Nij ij R r S −=)/(0或 式中R 0和R(或R 0和N)是和原子种类及价态有关的经验常数2)键价和规则:每个原子所连诸键的键价之和等于该原子的原子价。
10.2 氢键X—H…Y用来表示氢键,其中X—Hσ键的电子云偏向高电负性的X原子,导致出现屏蔽小的带正电性的氢原子核,它强烈地被另一个高电负性的Y原子所吸引。
氢键的一些特点:1)大多数氢键X—H…Y是不对称的,H—X距离较近,H—Y距离较远;2) X—H…Y可以为直线形θ=180°,能量上有利;也可为弯曲形,即θ<180°;3)X和Y间的距离作为氢键的键长,键长越短,氢键越强,H原子处于中心点时,是最强的氢键;4)氢键的实测键长要比氢键中共价键键长加范德华半径之和要短;5)氢键X—H…Y和Y—R键间形成的角度α,通常为100°~140°之间;6)一般情况,氢键中H原子是二配位,有时有三、四配位;7)多数氢键,只有一个H原子是直接指向Y上的孤对电子,但有例外。
非常规氢键1) X—H…π(质子受体是π键和大π键)2) X—H…M(质子受体是富电子的过渡金属)3) X—H…H—Y (二氢键)冰和水中的氢键:水分子四面体的四个顶点都可形成氢键,有11种晶型,常见的是I型h氢键和物质的性能:1)物质溶解性能;2)物质的熔沸点和气化焓; 3)粘度和表面张力;4)氢键在生命物质中的作用;10.3 非氢键型的次级键:除氢键和范德华力以外的次级键,主要包括:非金属原子间的次级键;金属原子与非金属原子间的次级键;金属原子间的次级键。
蛋白质的次级键
蛋白质的次级键是指维持蛋白质高级结构的主要化学键,包括氢键、离子键、疏水键、二硫键以及范德华引力。
氢键:是由一个极性较强的X-H基上的氢原子,与另一个电负性强的原子Y(如O、N等)相互作用形成的一种吸引力。
在蛋白质多肽链间或链内均能形成氢键,对于维持蛋白质的稳定性起着重要作用。
离子键:在蛋白质分子中,一些氨基酸侧链可以形成离子键。
这些离子键在维持蛋白质的结构和功能方面起着重要作用。
疏水键:是由蛋白质中的一些疏水性较强的侧链基团,为避开水分子而互相粘聚在一起形成的。
疏水键对于维持蛋白质的三维结构具有重要作用。
二硫键:是由两个硫原子之间形成的化学键。
在蛋白质分子中,二硫键可以稳定蛋白质的高级结构,特别是在一些需要保持稳定的蛋白质中,如酶、膜蛋白等。
范德华引力:是分子间的一种相互作用力,包括范德华力、诱导力和色散力等。
在蛋白质分子中,范德华引力对于维持蛋白质的稳定性具有一定作用。
10次级键及超分子结构化学【10.1】在硫酸盐和硼酸盐中,SO2-和BO>的构型分别 为正四面体和平面正三角形,S —O 键和B -O 键而键长平均值分别为 山 和,试计算S — O 和B —O 键的键价以及 原子和B原子的键价和.解:将查得的R 0值和B 值数据代入计算价键的公式.S 二 exp 侬/四一148Pm =1.4837 pmS 原子的键价和为4M1.48 =5.92.此值和S 原子的氧化态 相近.B 原子的键价和为3".01=3.03.止匕值和B 原子的原子价 相近.【10.2】沁一〔弯曲形〕、ClO【〔三角锥形〕和C 10『〔四面体形〕离子中,Cl-0键的平均键长值分别为157 pm 5 148P m和142.5pm ,试分别计算其键价及键价和.171Pm - 157 Pm S = exp1.46ClO2■中Cl 原子键价和为2M1.46 = 2.92和氧化态为3相近.ClO3"中Cl 原子的键价和为3M1.67 = 5.01和氧化态为5相近.ClO4"中Cl 原子的键价和为4M1.75 = 7.0和氧化态为7相近.【10.3]试计算以下化合物已标明键长值的 Xe-F 键键 价.说明稀有气体Xe 原子在不同条件下和其他原子形1 / 132SO :BO 3S 二exp ;37.1pm —136.6pm I 37 pm-1.01解:ClO2■:37 pmClO 3-.167 pm-148 pmS 二 exp ---- - ----------37 pm = 1.67ClO 4-.SFy 2班".75为 Xe( 2 )200 pm Xe( 4 )193 pmXe- F 202 pm解:S=exp 200P m -200P m =1.00(a)Xe|||F :-37P m」 S=exp 200Pm -190Pm =1.31(b)XeLF :-37P m」S 二 exp 200Pm -214Pm = 0.68Xe|||F :- 37pm 」 S= exp 189Pm -255Pm PR(C)Xe|||F:_37P m」 Sep 200Pm一279Pm =0.12(d)XelllF :-37P m」S 二,乂「193P m一202P m =0.78(e)Xe-F :- 37pm 」Xe 和F 的范德华半径和为 216pm^ 147pm=363pm 上述化学键中成键两原子间的键距均短于范德华半径2 / 13成化学键的情况.I 按〔 7.1.3 )式计算*6»键时%值Xe (6)189pm, B值为 37 Pm 】.〔a 〕 XeF 2 〔直线形〕: Xe-F200pm(b)I Xe2 F3 I- lSbF6「・.F. 210pmF 「e151.Xe、、190Pm(c) I.NO 2 .r lXe 2F 13 厂.F. .(d)[(2,6 —F 2c 6H 3 )Xe 『lBF 4(e) lMe 4N I' lXeF5「・平面五角形的XeF5-离子中XeF 6 _■ *F 255pm和.Xe原子既可以和F, O, C等原子成共价键,也可结构化学根底习题答案-周公度-第4版形成次级键【10.4]CaO具有NaCl型的晶体结构,试根据表7,1.1 的数据估算Ca — O键的键长及Ca2十的半径[按.2-的离子半径为140pm , Ca"和.2-的离子半径和即为Ca-O的键长计算].解:CaO中Ca2+是+2价离子,Ca2+周围有6个距离相等的.2一,按键价和规那么,每个键的键价〔S〕为〔2/6〕=0.333.查表得Ca-O键的RHgTpmiBnSWm,代入得:S=0.333 ; exp196,7pm - dpm37 pmln[0,3331J96,7pm - dpm=-1.1037 pmd =237.4 pmCa2+的离子半径为237.4pm— 140pm=97.4pm【10.5]NiO具有NaCl型结构,试根据表7,1.1数据估算Ni2・离子半径.福:查袤得Ni2+和O2-结合时,R值为167.0p m.B值为牛. 代入〔1〕式得:167 pm - dpmS = 0.333 = exp I ----- ----- —J 37 pm _, 1167 Pm - dpmln 1.0,333 1.1037 pmNi -O 问键距 d = 207.7p mNi2+的离子半径为207.7 pm -140.0 pm = 67.7 pm【10.6]试说明氢键的本领及其形成的条件.解:在氢键XIIIHMIY中,当H原子以共价键和X结合时,由于X的电负性高,尖电子偏向X, H原子带局部正电荷,当和有孤对电子而电负性强的Y原子接触,彼此间的静电吸引作用使之结合而成氢键.对于假设干强氢键如O-H-O、F-H-F那么以形成三中央四电子的共价键为主.氢键的形成条件是X, Y都是强电负性原子,3 / 13结构化学根底习题答案-周公度-第4版/X - H|||Y一般不小于 120.【10.7]怎样知道液态水中仍保存一定的氢键?怎样 解释水在40C 时密度最大?解:从能量看,冰的升华热高达 51.0k 川mol 」.融化热为 6.0kJ由ol 」.冰中H 20分子间的结合力大局部是氢键力, 冰融化为水后,氢键结合力依然存在.从 Raman ^谱 等数据也证实水中仍保持一定的氢键.冰的结构中,每个H 2O 分子均和周围4个H 2O分子 按四面体方式形成氢键,因此它具有空旷的低密度的 结构,冰的密度比水低,冰变为水密度增加,氢键破 坏的多,谜底增加得多,另一方面温度升高热膨胀又 使密度降低,两种相反因素与致水有密度最大的温 度,至于出现在4c 那么由水的性质决定.【10.8]下表给出150C 时几种物质的粘度〔单位: 10%m~s 」〕,试说明为什么会有这样的大小次序.物质 丙酮 苯 HAcC 2 H 50HH 2sO 4粘度0^3409T1.311.33 32.8解:物质粘度的大小决定于分子间的作用力: H 2SO4中每个分子可形成4个氢键;C 2H 50H 和CH 3COOH那么平土匀可 形成2个氢键:强、黏度最大;C 2H 50H 和HAc 次之,这两者相差不多 苯因有离域冗键,色散力大,粘度大于丙酮.【10.9】水和乙触的外表能分别为72.8和17.1 〔10"J cm说明存在如此大差异的原因.结构化学根底习题答案-周公度-第4版...0°-心. 「S、0-H…O O H ...苯和丙酮不能生成氢键 c 」., C 2H 5 H所以 O ...CH 3-C 、3 \0——H ...H分子间作用力最解:水中小.分子间存在氢键,分子间作用力大.乙触(H5c2 —0 —C2H5 )分子间不能形成氢键,作用力仅是较微弱的范德华力,故表现在外表能上有较大差异.【10.10】举例说迷什么是配位水、骨架水、结构水和结晶水.为什么硫化物和磷化物一般不存在结晶解:以CuS.415H2.晶体为例,该晶体中每个Cu2+离子周围有4个H2.提供孤对电子和Cu2+白^dsp2杂化轨道形成4个EO T C U配键.晶体中的这种水称为配位水. CuS.415H2.晶体中有1个H2.分子不和金属离子配位,只通过.-HI".氢键和其他基团结合,这种山.分子称结构水.骨架水是指水作为构建晶体的主要组分组成骨架.例如气体水合物8cH4146H2.中,水分子通过氢键组成具有多面体孔穴的骨架,将客体小分子CH4包含在其结晶水是指晶态水合物中存在的水, 或是指除冰以外在晶体中和其他组分一起存在的水.结晶水除上述配位水、结构水和骨架水等组成确定的结晶水以外, 还包括层间水、沸石水和蛋白质晶体中连续分布的水等组成不确定的结晶水.硫化物和磷化物中由于S和P原子的电负性较低, 分别为2.6和2.2,和H相似(2.3),不能形成S-H|||S>P-HIHP..-H |||S和.-H|||P等型式氢锤,一般不存在结晶水.【10.11]根据SbF3晶体结构测定数据,Sb-F间除3个较短的强键呈三角形分布外,还有3个弱键和3个非常弱的键.它们的键长(以pm为单位)如下:195, 195, 206; 250, 250, 256; 375, 378, 378.解:按(2)式查得计算键价的R和N值,Sb(3) •一 F (― 1)的R0值为177.2Pm,N=3.7,计算所得各键键价及键价和如下:键195 195 206 250 256 256 375 378 3785 / 13长/pm键0.7 0.7 0.5 0.2 0.2 0.2 0.0 0.0 0.0价008866666键价和:2.96键价和为2.96接近于SbF3中Sb的原子价.【10.12]什么是绝对构型?画出R型甘油酸H250H卜CH(0H 卜co0H的立体结构式.解:绝对构型是指手性分子中各个基团在空间排列的真实结构.绝对构型是和相对构型相比拟而提出的概念,当还未能确定所指的手性分子是R型或S型之前,这种构型称为相对构型,确定后的真实构型称为绝对构型.R 型甘油酸的立体结构如图7.12.HOHCCOOHH2COH图7.2【10.13】乙酸、丙酸、丁酸、戊酸的密度分别为1.409 ,0.993 ,0.959 和0.939 g cm\ 试根据表7.5.1 所列原子基团的体积增量数据,计算分子的堆积系数.讨论它们的变化规律,解释其原因.解:查表得原子基团体积增量为:CH3 23.5父10.而,CH2 3四产加,COOH24 323.1 10 cm乙酸化学式CH3c00H 摩尔质量-1/ g mol 丙酸丁酸CH3cH2COOH CH3 CH2 2COOH戊酸CH 3 CH 2 3 COOH60 74 88 102密度/ gLcm^1.049 0.993^体积57.2 74.5/ cm 3mol-1基团体积增 量和28.1 38.4 /cm 3mol -1堆积系数 0.49 0.52 0.530.54由上述计算可见,随着碳氢链的增长,堆积系数加大, 这和COOH 间能形成氢键,缩短分子间距离有关.即在 分子中COOH 占的比例较大时,堆积系数较小.【10.14】邻位和对位硝基苯酚 20 c 时在水中的溶解 度之比为0.39,在苯中为1.93,请由氢键说明其差 异的原因.解:溶质在溶剂中的溶解性,可用“相似相溶〞 原理表达.这一经验原理指出:结构相似的物质易于 互溶,结构相差较大的物质不能互溶. “结构〞二字 的含义有:一是指物质结合在一起所依靠的化学键或 分子间结合力的形式,二是指分子、离子和原子的相 对大小及离子的电价.溶解过程总是嫡增加的.因此溶质在溶剂中的溶解 性在很大程度上决定于溶解过程的始变 A H o 假设A H 较 小,自由始减少,那么溶质易溶解于溶剂;假设 A H 增大, 超过了 TL&S,使A G >0,那么溶解不能进行.邻硝基苯酚可形成分子内氢键,极性减弱,与水〔极 性溶剂〕分子间的作用力小.而且,停止不能与水分 子形成氢键.相反,它分散到水中会破坏水本身的氢 键,使,H 增大,能量上不利.因此,邻硝基苯酚在水 中的溶解度很小,而在非极性的苯中溶解度较大.对硝基苯酚不能形成分子内氢键,极性较大,并能 与水形成氢键,使溶解过程的 阳较小,自由始减少, 因而在水中的溶解度较大,而在苯中的溶解度较小.【10.15】乙触分子量比丙酮大,但沸点〔34.6 C 〕7 / 13结构化学根底习题答案-周公度-第4版0.959 91.848.6 0.939 108.6比丙酮沸点〔56.5 C〕低;乙醇分子量更小,但沸点〔78.5 C〕更高.试分别解释其原因.解:物质沸点的上下是其汽化过程中焙变和嫡变的综合结果,其中始变起决定作用.而始变又决定于分子间作用能的大小,归根结底决定于分子的结构.分子量只是影响分子间作用能大小的因素之一.丙酮与乙触相比,虽然分子量小,但由于分子内有易于变形的冗键,极化率大,分子间作用能大,因而沸点高.而乙醇由于形成分子间氢键,作用能更大, 因而沸点更高〔乙触,丙酮和乙醇的摩尔汽化热分别为26.0 , 30.2 和39.4 k川moi」〕【10.16]请根据分子中原子的共价半径和范德华半径估算分子的形状和大小."共价双键半径假设不考虑尿素分子的共转效应,按正常的单、算键长,那么得各共价键的键长如下:双键计、C- N / C=N- H8 / 13结构化学根底习题答案-周公度-第4版第一套键长152 127/pm第二套键长147 119/pm实测键长133 126 /pm其中第一套数据是用同核键键键长的计算方法〔键长 等于两原子共价半径之和〕得到的.第二套数据是按 异核键键长的计算方法〔键长等于两原子共价半径之 和减去两元素电负性之差的9倍〕得到的.可见,两 套计算数据中有的与实测数据较吻合,有的那么差异较 大.根据实测键参数和范氏半径画出尿素分子的形状 如图7.16.【10.17】环氧乙烷中含少量水,试画出它们的分子模型,估计最小分子直径,并判断能否用 3A 型分子 筛〔孔径3.3A 〕作为环氧乙烷的枯燥剂? 4A 和5A 型 〔孔径分别为4A 和5A 〕又如何?9 / 13107 9910解:用上列数据,按同〔异〕核键键长的计算方法得有关键长数据如下:M H C— O C— C C— H键长/pm 93.8 102 154 105.9这些计算值与实验测定值有的接近有的那么差异较大.图7.17所示的分子形状是按实测键参数和范氏半径画出来的.图7.17水分子和环H乙烷分子的大小〔图中数字篇位为pm〕由图可见,水分子和环氧乙烷分子的最小直径分别约为320pm^口440Pm因此,水分子能够进入3A分子筛的孔道而环氧乙烷分子不能. 所以,3A分子筛对环氧乙烷有枯燥作用.但由于水分子的最小直径与3A 分子筛的孔径相差很小,因而脱水效果不会太好.10 / 13用4A分子筛枯燥环氧乙烷效果很好,由于4A分子筛的孔道只允许水分子进入,而将环氧乙烷分子拒之门外.5A分子筛的孔径和环氧乙烷分子的最小直径非常接近,有可能也吸附环氧乙烷,因此不宜用作环氧乙烷的枯燥剂.环氧乙烷是最重要的一个环氧化合物,是以乙烯为原料的第三大产品,仅次于聚乙烯和苯乙烯.它是重要的石油化工原料及有机和精细化工的中间体.主要用来生产乙二醇、非离子外表活性剂等产品.工业上环氧乙烷是用乙烯和空气催化氧化〔以银/多孔载体为催化剂〕制得的.实验室中那么常用有机过酸〔如CHCGH等〕氧化乙烯来制备.水是平衡混合产物的组分之一,需要除去,简便而又经济的除水方法是使用4A分子筛脱水.所以,此题所涉及的是一个实际问题, 从沟通结构一一性能一一应用这一渠道来说也是很有意义的.【10.18]试根据苯分子的构型和液态水中和冰中分子的堆积系数.解:苯环中央到C原子距离为140PmC— H100Pm H原子范德华半径120Pm分子直径=2 140 100 120 pm = 2 360pm-720pmC原子范德华半径170Pm苯环厚度340pm【10.19】计算水分子的体积以及液态水中和冰中分11 / 13子的堆积系数.解:根据7.17所列数据.O 原子所占体积%和2个H 原子所占体积5432V O =- -: 140Pm ,-2二 60Pm i 140 Pm3.- J 11.49-2.71 106 pm 3 =8.87 1024cm 34 3 2VH=2 -二 120pm -二 100pm 120pm-一 3= 2 7.24—2.73I106 pm 3 = 9.02 10^4cm 324317.8 10 cm 冰中的堆积系数为32.5 10 24 cm 3= 0.55【10.20】举例说明什么是分子识别.解:分子识别是指一种接受体分子的特殊部位具有某 些基团或空间结构,正适合另一种底物分子的基团或 空间结构相结合,表达出锁和钥匙的原理.当这两种 分子相遇时,好似彼此相识,互相选择对方,形成次 级键结合在一起,使体系趋于稳定.例如三环纪杂冠 触分子形成孔穴的大小和四面体配位点的分布,正适 合于和N H 4'形成4个N^H ・・,N 氢键以及供N H 4十居留.【10.21】疏水效应为什么能降低体系能量、增高嫡 解:疏水效应是指水溶液中的疏水组分或基团倾向于60 pm 3100pm24一个H 2O 分子的体积为〔8.78+9.02产10 cm液态水中一个 七0分子占据的体积为:_243= 17.80 10 cm30.0 10 ^cm 3〔由摩尔体积/N A 得到〕冰中一个小0分子占据的体积为:体积/N A 得到〕32.5X10^4 cm 3 〔由摩尔所以液态水中的堆积系数为17.8 10 cm 354 3 :0.5930.0 10 cm结构化学根底习题答案-周公度-第4版和水疏远,疏水组分相互结合,或是被水充满而内壁带有疏水基团的空腔.当遇上疏水组分或基团时,疏水组分要进入空腔,排挤出水分子而和空腔内壁的疏水基团结合.疏水效应一方面要减少水和疏水基团问相互接触的时机,而增加水和水之间互相通过氢键结合,降低体系的能量;另一方面,滞留在空腔内相对有序的水被排挤出来,增加了自由活动的水,嫡增加.13 / 13。
维持蛋白质三级结构的主要化学键
维持蛋白质三级结构的主要键是次级键。
1.该体系的三层结构是由疏水性、氢键、范德华力以及静电荷作用来维持的。
(基于第二层结构,通过不同的次要键,将其折叠成一个特殊的球形分子结构)该蛋白的三级结构是由两种不同的结构组成的球形蛋白的多肽链组成。
次级结构如α螺旋、β折叠、β角、不规则卷曲等,由于侧链的作用,进一步卷曲、折叠。
2.在二级结构、超二级结构和区域结构的基础上,通过二级结构、超二级结构和区域结构,构成了一个更高层次的三维结构。
肽键保持着一个层次的结构,而第三个层次的结构,则是由氢键组成,二硫键次之。
PS:蛋白的三层结构,是一条由第二层、第二层、第三层、第三层、第三层的结构组成的蛋白质。
蛋白质分为四个层次,每一个层次都是由一阶向二阶至三阶的层次逐步扩展。
第一个结构:在多肽链中,按氨基酸的顺序排列,叫做第一个结构,而以肽键为主。
4.第二类结构:在蛋白质分子中,有一条特定的肽链段,其主链与其上的原子位置不相关,没有氨基酸残基,也没有侧链的构象,而第二个结构为氢键。
第三层:指的是整个多肽链中,所有的氨基酸残基,都是由离子键、氢键组成的。
结构化学基础知识点结构化学课程是高等学校化学专业的主干课程之一,也是应用化学、材料化学等专业的基础理论课。
接下来店铺为你整理了结构化学基础知识点,一起来看看吧。
结构化学基础知识点:量子力学经典物理学是由Newton(牛顿)的力学,Maxwell(麦克斯韦)的电磁场理论,Gibbs(吉布斯)的热力学和Boltzmann(玻耳兹曼)的统计物理学等组成,而经典物理学却无法解释黑体辐射,光电效应,电子波性等微观的现象。
黑体:是一种可以全部吸收照射到它上面的各种波长辐射的物体,带一个微孔的空心金属球,非常接近黑体,进入金属球小孔的辐射,经多次吸收,反射使射入的辐射实际全被吸收,当空腔受热,空腔壁会发出辐射,极少数从小孔逸出,它是理想的吸收体也是理想的放射体,若把几种金属物体加热到同一温度,黑体放热最多,用棱镜把黑体发出的辐射分开就可测出指定狭窄的频率范围的黑体的能量。
规律:频率相同下黑体的能量随温度的升高而增大,温度相同下黑体的能量呈峰型,峰植大致出现在频率范围是0.6-1.0/10-14S-1。
且随着温度的升高,能量最大值向高频移动.加热金属块时,开始发红光,后依次为橙,白,蓝白。
黑体辐射频率为v的能量是hv的整数倍.光电效应和光子学说:Planck能量量子化提出标志量子理论的诞生。
光电效应是光照在金属表面上使金属放出电子的现象,实验证实:1.只有当照射光的频率超过金属最小频率(临阈频率)时,金属才能发出电子,不同金属的最小频率不同,大多金属的最小频率位于紫外区。
2.增强光照而不改变照射光频率,则只能使发射的光电子数增多,不影响动能。
3.照射光的频率增强,逸出电子动能增强。
光是一束光子流,每一种频率的光的能量都有一个最小单位光子,其能量和光子的频率成正比,即 E=hv光子还有质量,但是光子的静止质量是0,按相对论质能定律光子的质量是m=hv/c2光子的动量:p=mc=hv/c=h/波长光的强度取决于单位体积内光子的数目,即光子密度。