不可忽视的转膜和封闭 WesternBlot专题_经验篇
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根据自己的实验体会,总结做好WB的一些心得,与大家分享,不当之处欢迎批评指正。
叙述的思路就是围绕着实验的每个步骤展开,这样可能更具体些。
1.配胶: 该部分较为重要的是配制凝胶时要充分混匀,此外应保证试剂的新鲜。
常出现的问题有:A.凝胶出现花纹:此时应检查原料中过硫酸铵(AP)粉末是否受潮B.凝胶聚合时间较长:聚合时间由AP以及TEMED决定,通常在30min左右,AP不新鲜会导致聚合变慢:此外还需注意环境的温度也很重要,气温较低时胶是会凝得慢一些,必要时可适当增加AP以及TEMED的量,但通常不会超过1h,若超过1h甚至更长仍未聚合,应检查配制的操作有无错误。
2.处理蛋白样品:该部分蛋白样品本身很关键,若蛋白提取过程存在问题或蛋白发生降解则很难进行好之后的实验,也就很难做出好的结果了;除此之外loading buffer的作用也不容忽视,切莫使用不新鲜的上样缓冲液,同时在处理时将样品与loading buffer混合均匀也应注意。
3.电泳:首先在跑积层胶时应尽可能使样品压齐,若上样量较大(如细胞蛋白通常上样在20-30甚至40ul),可适当减小电压跑20-30min,待压齐后方可开始分离。
4.转膜:该环节电流的大小,转膜的时间决定是否能成功将蛋白转上,而具体的参数应取决于所要蛋白的分子量大小,应反复摸索,本人在实验中得出的经验为:10KDa:200mA 1h; 60KDa 70V,2h;90KDa 70V,4h;200KDa 70V,6h. 此外还有如下几个细节问题需要注意:A.膜的选择:PVDF还是NC,0.22μm还是0.45μmB.转膜液中甲醇的量:通常在10%-20%,蛋白分子量较大时可适当减少,蛋白分子量小时应适当增加,建议先从15%开始。
5.封闭:该步骤一般不易出现问题,常见的有室温2-3h,或者4度封闭过夜,但仍需强调一点的是有些抗体的使用需配套使用特殊的封闭液。
6.一抗孵育:通常购买到一种新抗体后,还是建议先按说明书推荐的浓度比例在室温孵育2-3h, 若该抗体效价较好,应该显带很漂亮,尤其是在抗体刚买时间不长,然而事情往往不能尽如人意,我们在遇到一个不好的抗体时该怎么办?可通过延长孵育时间(如:4度过夜孵育甚至室温过夜孵育),增大抗体浓度,如果你想尽了一切可能结果仍然很不理想,建议还是换抗体吧,不要再浪费时间与精力了。
Western Blot 原理和操作方法(全)工作原理蛋白质的电泳分离是重要的生物化学分离纯化技术之一,电泳是指带电粒子在电场作用下,向着与其电荷相反的电极移动的现象.根据所采用的支持物不同,有琼脂糖凝胶电泳,淀粉凝胶电泳,聚丙烯酰胺凝胶电泳等.其中,聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)由于无电渗作用,样品用量少(1-100μg),分辨率高,可检出10-9-10-12mol的样品,凝胶机械强度大,重复性好以及可以通过调节单体浓度或单体与交联剂的比例而得到孔径不同的凝胶等优点而受到广泛的应用.SDS-PAGE是最常用的定性分析蛋白质的电泳方式,特别是用于蛋白质纯度检测和测定蛋白质分子量.PAGE能有效的分离蛋白质,主要依据其分子量和电荷的差异,而SDS-PAGE(SDS变性不连续聚丙烯酰胺凝胶电泳)的分离原理则仅根据蛋白质的分子量的差异,因为SDS-PAGE的样品处理液是在要跑电泳的样品中假如含有SDS和巯基乙醇(2-ME)或二巯基赤藓醇(DTT),其可以断开半胱氨酸残基之间的二硫键,破坏蛋白质的四级结构,SDS是一种阴离子表面活性剂即去污剂,它可以断开分子内和分子间的氢键,破坏蛋白质分子的二级及三级结构,并与蛋白质的疏水部分相结合,破坏其折叠结构,电泳样品假如样品缓冲液后,要在沸水中煮3-5分钟使SDS 与蛋白质充分结合形成SDS-蛋白质复合物,SDS-蛋白质复合物在强还原剂巯基乙醇存在时,蛋白质分子内的二硫键被打开而不被氧化,蛋白质也完全变性和解聚,并形成榛状结构,稳定的存在于均一的溶液中,SDS与蛋白质结合后使SDS-蛋白质复合物上带有大量的负电荷,平均每两个氨基酸残基结合一个SDS分子,这时各种蛋白质分子本身的电荷完全被SDS掩盖,远远超过其原来所带的电荷,从而使蛋白质原来所带的电荷可以忽略不计,消除了不同分子之间原有的电荷差别,其电泳迁移率主要取决于亚基分子质量的大小,这样分离出的谱带也为蛋白质的亚基.样品处理液中通常加入溴酚蓝染料, 溴酚蓝指示剂是一个较小的分子,可以自由通过凝胶孔径,所以它显示着电泳的前沿位置,当指示剂到达凝胶底部时,即可停止电泳.另外样品处理液中也可加入适量的甘油或蔗糖以增大溶液密度,使加样时样品溶液可以沉入样品加样槽底部.重要参数①聚丙烯酰胺凝胶(PAG)制备原则:由于孔径的大小取决于单体和双体丙烯酰胺在凝胶中的总浓度(T)以及双体占总浓度的百分含量即交联度(C)决定的,因而制胶之前必须首先知道这两个参数.一般可以由下述公式计算:T%=(a+b)/m*100%; 和C%=a/(a+b)*100%其中: a=双体(bis)的重量;b=单体(arc)的重量;m=溶液的体积(ml)②当分析一个未知样品时,常常先用7.5%的标准凝胶制成4-10的梯度凝胶进行试验,以便选择理想的胶浓度.如果蛋白质的分子量已知,可参考下表选择所需凝胶浓度:蛋白质分子量范围(Da) 适宜的凝胶浓度(%)<10420-301×104-4×10415-204×104-1×10510-151×105-5×1055-10>5×1052-5蛋白分子量 (kDa)凝胶浓度 (%)4-40 20 12-45 15 10-70 12.5 15-100 10 25-2008③分离胶(5ml 体积):5%的积层胶的配置:蛋白质的样品制备:蛋白质的样品制备是Western Blotting 的第一步,样品制备是关键步骤,要求尽可能的获得所有蛋白质,应注意以下问题:1:在合适的盐浓度下,应保持蛋白质的最大溶解性和可重复性。
Western Blot原理、显色分类及操作步骤(2008-08-14 23:07:59)标签:western blot显色教育一、原理与Southern或Northern杂交方法类似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。
经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素薄膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。
以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。
该技术也广泛应用于检测蛋白水平的表达。
既可以定性,又可以半定量的Western是初步鉴定蛋白质最方便也是最通用的方法。
western显色的方法主要有以下几种:i. 放射自显影ii. 底物化学发光ECLiii. 底物荧光ECFiv. 底物DAB呈色现常用的有底物化学发光ECL和底物DAB呈色,体同水平和实验条件的是用第一种方法,目前发表文章通常是用底物化学发光ECL。
只要买现成的试剂盒就行,操作也比较简单,原理如下(二抗用HRP标记):反应底物为过氧化物+鲁米诺,如遇到HRP,即发光,可使胶片曝光,就可洗出条带。
二、操作步骤:(一) 配胶1、注意一定要将玻璃板洗净,最后用ddH2O冲洗,将与胶接触的一面向下倾斜置于干净的纸巾晾干。
分离胶及浓缩胶均可事先配好(除AP及TEMED外),过滤后作为储存液避光存放于4℃,可至少存放1个月,临用前取出室温平衡(否则凝胶过程产生的热量会使低温时溶解于储存液中的气体析出而导致气泡,有条件者可真空抽吸3分钟),加入10%AP(0.7~0.8:100, 分离胶浓度越高AP浓度越低,15%的分离胶可用到0.5:100)及TEMED(分离胶用0.4:1000, 15%的可用到0.3:1000,浓缩胶用0.8:1000)即可,如室温较低可升高10%AP及TEMED浓度到《分子克隆》建议浓度。
转膜(Trarsmembran)1 转膜的定义将电泳后分离的蛋白质从凝胶中转移到固相载体(例如NC膜)上,通常有两种方法:毛细管印迹法和电泳印迹法.常用的电泳转移方法有湿转和半干转。
两者的原理完全相同,只是用于固定胶/膜叠层和施加电场的机械装置不同.前者操作容易,转移效率高;而后者适用于大胶的蛋白转移,所用缓冲液少.2 转移膜的选择杂交膜的选择是决定Western blot成败的重要环节。
应根据杂交方案、被转移蛋白的特性以及分子大小等因素,选择合适材质、孔径和规格的杂交膜。
用于Western blot的膜主要有两种:硝酸纤维素膜(NC) 和PVDF膜。
NC膜是蛋白印迹实验的标准固相支持物,在低离子转移缓冲液的环境下,大多数带负电荷的蛋白质会与膜发生疏水作用而高亲和力的结合在一起,但在非离子型的去污剂作用下,结合的蛋白还可以被洗脱下来。
根据被转移的蛋白分子量大小,选择不同孔径的NC膜。
因为随着膜孔径的不断减小,膜对低分子量蛋白的结合就越牢固。
通常用0.45 μm和0。
2 μm两种规格的NC膜。
大于20 kD的蛋白可用0.45 μm的膜,小于20 kD的蛋白就要用0。
2 μm的膜了,如用0.45 μm的膜就会发生“Blowthrough”的现象。
PVDF膜灵敏度、分辨率和蛋白亲和力比常规的膜要高,非常适合于低分子量蛋白的检测。
但PVDF膜在使用之前必需用纯甲醇浸泡饱和1-5秒钟。
最常用于Western Blot的转移膜主要是硝酸纤维素(Nitrocellulose, NC)膜和聚偏二氟乙烯(Polyvinylidene Fluoride, PVDF)膜,此外也有用尼龙膜、DEAE纤维素膜做蛋白印迹。
尼龙膜和NC膜的特点相似,主要用于核酸杂交。
硝酸纤维素(nitrocellulose, NC)膜:NC与蛋白质靠疏水作用结合,无需预先活化,对蛋白质的活性影响小;非特异性本底显色浅;价格低廉,使用方便.但结合在NC上的小分子蛋白质在洗涤时易丢失; NC韧性较差,易损坏。
WesternBlot实验经验分享,你都知道吗?Western blot真的是让人头疼的实验,辛苦付出和完美结果不成正比的实验,是整个研究生阶段最磨练我个人忍耐力的实验,要掌握整体操作并不难,但是需要注意的细节却很多,而且,三分靠努力,七分靠运气,当你把能做的都做了的时候,能修改的条件都修改了,结果仍然是空白条带,what can I do for you?今天,小编给大家简单整理一下,自己在跑小分子蛋白和大分子蛋白时,摸索出来的经验和条件,欢迎大家积极讨论分享。
一、小分子蛋白小编当时在跑S100A4,分子量12kDa。
首先,要注意的一点就是,小分子蛋白很容易在提取的过程中降解,所以整个操作过程一定要保证在冰上低温快速充分的研磨提取,具体的裂解组织的步骤我就不说了,不过说到组织,小编想提一句,组织提蛋白有一点需要注意,就是这个蛋白在组织中的表达丰度、以及蛋白定位。
胞浆或者核内的蛋白提取方式会有不同,细胞核内的蛋白可能需要特殊的裂解液,一是通过阅读文献,清楚相同的蛋白和组织,别人的跑出来的情况如何;二是可以通过在The Human Protein Atlas网站(不懂看这个(工具篇)S5E50:航母级神器——蛋白组学结果大收录!)上查询。
1、电泳条件:a) 小分子的蛋白电泳建议选择15%分离胶,5%浓缩胶。
正常配胶时,一个迷你垂直电泳仪的配制,5ml分离胶,2ml浓缩胶,跑正常分子量的蛋白是没有问题的。
但是跑小分子蛋白,浓缩胶的长度要再长一些,最起码要保证三分之一浓缩胶,三分之二的分离胶,浓缩胶多,可以保证不同分子量的蛋白充分压缩到同一起跑线。
b) 电泳时间:浓缩胶80V,300mA 50min,分离胶120V,300mA1h10min,分离胶时间不建议太长,只要把marker跑开,能够区分开内参和小分子蛋白就好了。
我的习惯是电泳的全程也会把机器放到冰水混合物中,防止温度过高,蛋白弥散。
c) 蛋白上样量:正常分子量蛋白30ug足够,可以建议小分子量蛋白先用二倍的量60ug试一下看看。
维真生物-WesternBlot实验方法及注意事项WesternBlot实验方法及注意事项实验原理:WesternBlot印迹方法,又称为免疫印记,是将获得的蛋白质样品通过SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,对不同分子量的蛋白质进行分离,并通过转移电泳将凝胶上分离到的蛋白质转印至固相支持物(NC膜或PVDF膜)上,用抗靶蛋白的非标记抗体(一抗)与转印后膜上的靶蛋白进行特异性结合,再与经辣根过氧化物酶标记(偶联)的二抗结合,最后用ECL超敏发光液试剂检测。
如果转印膜上含有靶蛋白,经X光片曝光、显影后,则会在X-光片上出现特异性蛋白条带。
实验材料:分离胶及积层胶溶液、水饱和异丁醇、1×Tris?Cl/SDS,pH8.8 、蛋白质分子量标准混合物、1×SDS电泳缓冲液、电泳装置及夹子、玻璃板、灌胶支架、缓冲液槽等附件、0.75mm封边垫片、0.75mm样品梳子、50μl微量加样器、恒流电源常用试剂:1)30%丙烯酰胺/0.8% N,N’-亚甲丙烯酰胺将30克丙烯酰胺和0.8克N,N’-亚甲丙烯酰胺溶于总体积为60ml 水中,加热至37℃溶解之,补加水至终体积为100ml。
0.45μm 微孔滤膜过滤除菌,查证该溶液pH应不大于7.0,置棕色瓶中保存。
小心:丙烯酰胺具有很强的神经毒性并可通过皮肤吸收,其作用具有累积性。
称量丙烯酰胺和N,N’-亚甲丙烯酰胺时应戴手套和面具。
可认为聚丙烯酰胺无毒,但也应谨慎操作,因为它还可能含有少量未聚合材料。
2)4×Tris?Cl/SDS,pH8.8,在300mlH2O中溶解91g Tris碱(1.5mol/L),用1mol/L调节pH 至8.8,补加H2O至体积500ml。
用0.45μm滤膜过滤溶液,再加入2g SDS[0.4%(w/v)],于4℃可保存1月。
3)4×Tris?Cl/SDS,pH6.8,在40mlH2O中溶解6.05g Tris碱(0.5mol/L),用1mol/L调节pH 至6.8,补加H2O至体积100ml。
不可忽视的转膜和封闭:WesternBlot专题(经验篇)生物通技术专题:既可以定性,又可以半定量的Western是初步鉴定蛋白质最方便也是最通用的方法。
Western印迹要想做的好,当然每个步骤都不能马虎,看看这张图,从电泳,转膜,封闭,一抗,二抗到最后的检测,就像“发现号”升空的120万个步骤那样一个也不能少。
如果忽视了其中的一步,结果做不出来,也是令人非常头痛的。
“工欲善其事,必先利其器”,要想有好的实验结果,好仪器是相当重要的,因此让我们先来看看什么样的仪器能让我们无后顾之忧,顺利痛快的一步到位。
Western 印迹的仪器主要就是电泳系统和电转移系统了,最好的品牌当然是Bio-Rad和Amersham(GE Healthcare)的Hoefer系列了,现在国内出品的物美价廉的电泳系列产品,也是不错的选择,几乎每个实验室都需要至少一套Mini Cell吧?如果还没有你该怎么挑选呢。
一、Bio-Rad经典Mini系列Bio-Rad Laboratories由David Schwartz 先生和妻子化学家Alice Schwartz于1957 年创建,总部位于加州Hercules,下设三大部门——生命科学部,临床诊断部和工业材料部,其中生命科学部成功跻身世界排名前五名。
在2004年,Bio-Rad还低价收购了因侵犯知识产权限于困境的MJ Research,使得伯乐在PCR领域的市场份额骤然扩大。
Bio-Rad生命科学部产品包括蛋白组研究产品、层析仪与填料、蛋白质和核酸电泳产品等,不过最为普通实验室熟悉的莫过于蛋白电泳Mini系列和层析仪。
只要是提到SDS-PAGE,Bio-Rad绝对是每个实验室首先考虑的品牌,经典就是经典呀。
Mini-PROTEAN3电泳系统与MiniTrans-Blot转移系统这一套Mini系列可谓是Bio-Rad最多人熟悉和称道的产品了。
自上个世纪50年代Raymond利用聚丙烯酰胺凝胶的分子筛性质来延缓蛋白质的迁移率从而达到分离蛋白的目的以来,经过这么多年来的发展,SDS-PAGE电泳技术已经基本成熟了。
westernblot转膜常见现象及处理方法western blot转膜常见现象及处理方法1,转膜不充分/过转对于非小分子量尤其是大分子量(>100kd)蛋白而言,一般不会出现过转情况,转膜不充分是主要原因,增加转膜力度无非是加大电压/电流,延长时间。
但对于小分子蛋白(<30kd就要注意了,<15kd 尤其要当心)很可能出现过转,丽春红染膜或观察marker有没有穿膜可以确认,没有丽春红也可以考染转膜后的胶,如果是一片空白,则要小心了,可适当降低转膜力度。
对于低分子量一般转膜液不要加SDS以防过转,《抗体技术实验指南》提供的针对中低分子量的湿转缓与高分子量的相比也是不含SDS的。
2,封闭时间不足这一点似乎多数人都不重视,所以有时候会有些意外。
我一般室温2~4h,但4度过夜确实是最好的。
另外在平皿中摇似乎比封口膜更容易掌握并获得较好的效果,对新手似乎更好。
3,抗体与封闭液有交叉。
实际上牛奶对于多数抗体来说还是很好的,但所有二抗也都写着:与牛奶可能有交叉反应。
BSA蛋白单一,可降低因牛奶其他成分引起的背景。
单用TBST也可以,此法虽然减少了交叉,但单就封闭能力而言却也因此而降低。
4,抗原-抗体浓度过高一般10min*3次就足够了,如果不放心可按自己意志加强时间、次数、洗脱液用量。
5,暴光时间过长降低曝光时间,以牺牲敏感度为代价其最低标准是使目的条带能够正常显影,对一切原因有效,但效果局限。
6,抗原-抗体浓度过高降低抗体浓度或蛋白上样量,以牺牲敏感度为代价其最低标准是使目的条带能够正常显影,仅对膜上蛋白和一抗引起的有效。
7,转膜不良(如有气泡在胶-膜之间) 主要是气泡在胶-膜之间引起的绝缘区使蛋白无法通过而不能到达膜上,这一步在操作时尤其要小心,我自己犯过,也看到其他人犯过。
我的办法是把胶铺到膜上,先使其一边接触膜的一边,这样就会在胶和膜交界的地方形成一个水相前缘,然后慢慢落下凝胶,这样这个水相前缘就会逐渐推进直至胶膜重合,如是则不会有气泡产生。