WB免疫印迹实验常见问题全汇总
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WB免疫印迹中常见问题和解决方法1.电泳中常出现的一些现象:●︶条带呈笑脸状原因:凝胶不均匀冷却,中间冷却不好; 电泳系统温度偏高。
●︵条带呈皱眉状原因:可能是由于装置不合适,特别可能是凝胶和玻璃挡板底部有气泡,或者两边聚合不完全。
●拖尾原因:样品溶解不好。
●纹理(纵向条纹)原因:样品中含有不溶性颗粒。
●条带偏斜原因:电极不平衡或者加样位置偏斜。
●条带两边扩散原因:加样量过多。
2.Western blot 结果中背景较高可能的原因及建议:●膜封闭不够延长封闭的时间;选择更加适合的封闭液。
●一抗稀释度不适宜对抗体进行滴度测试,选择最适宜的抗体稀释度。
●一抗孵育的温度偏高建议4℃结合过夜。
●选择的膜容易产生高背景一般硝酸纤维素膜的背景会比PVDF 膜低。
●膜在实验过程中干过实验过程中要注意保持膜的湿润。
●检测时曝光时间过长减少曝光时间。
3.Western blot 结果中杂带较多可能的原因及建议:●目的蛋白有多个修饰位点(磷酸化位点、糖基化位点、乙酰化位点等),本身可以呈现多条带。
查阅文献或进行生物信息学分析,获得蛋白序列的修饰位点信息,通过去修饰确定蛋白实际大小。
●目的蛋白有其它剪切本查阅文献或生物信息学分析可能性。
●样本处理过程中目的蛋白发生降解加入蛋白酶抑制剂;样本处理时在冰上操作。
●上样量过高,太敏感适当减少上样量。
●一抗特异性不高重新选择或制备高特异性的抗体。
●一抗不纯纯化抗体●一抗或者二抗浓度偏高降低抗体浓度。
4 . Western blot 结果中无信号或显示信号弱可能的原因及建议:●检测样本不表达目的蛋白选择表达量高的细胞作为阳性对照,用于确定检测样本是否为阴性。
●检测样本低表达目的蛋白提高上样量,裂解液中注意加入蛋白酶抑制剂。
●转移不完全或过转移可以用丽春红染膜并结合染胶(考马斯亮蓝)后确定条带是否转至膜上或转移过头;适当调整转膜的时间和电流。
●抗体不能识别测试种属的相关蛋白购买抗体前应当认真阅读抗体说明书,确定其是否能够交叉识别测试种属的对应蛋白。
wb实验过程中的各种问题和解决方法在进行WB实验过程中,可能会遇到一些问题,下面是一些常见问题和相应的解决方法。
1.染料溶液没有颜色或颜色很浅。
解决方法:-检查染料溶液是否过期,如果过期需要更换新的溶液。
-检查染料溶液的浓度是否正确,可能需要重新制备一份更浓的溶液。
-检查染料溶液的保存条件是否正确,染料溶液应避光保存,并且在低温下保存。
2.染料在染色过程中不均匀。
解决方法:-在染色前先将细胞均匀地分布在载玻片上,可以通过离心或其他方法来实现。
-在染料溶液中加入混匀剂,如液体洗涤剂,以帮助染料均匀地渗透到细胞内。
-改变染色时间和温度,染色时间过长或温度过高都可能导致染料渗透不均匀。
3.染色结果不明显。
解决方法:-检查抗体的质量,可能需要更换新的抗体。
-检查染色的时间和温度,染色时间过短或温度过低可能导致染色结果不明显。
-检查染色液的浓度,可能需要调整染色液的浓度以获得更明显的染色结果。
-提高显微镜的放大倍数,以便更清楚地观察染色结果。
4.细胞在染色过程中丧失形态。
解决方法:-确保在染色前细胞的状态良好,新鲜的细胞应该被使用。
-降低染色液的渗透压,使用低渗透压的缓冲液来进行染色。
-控制染色液的温度,避免用过高或过低的温度来处理细胞。
5.染色结果有杂质。
解决方法:-使用高纯度的试剂和试验设备,避免使用过期的试剂。
-对比试验,使用负对照来排除非特异性染色引起的杂质。
-进行洗涤步骤时,确保从载玻片上完全洗去所有未结合的染料。
6.染色结果无法观察到。
解决方法:-检查显微镜的镜头和光源是否正常,可能需要清洁镜头或更换光源。
-调整显微镜的对焦和光源的亮度,以找到最佳的观察条件。
-检查染色实验的结果是否正常,可能需要重新实验。
在进行WB实验时,还应注意以下问题:1.实验操作要准确无误,遵循实验方案的步骤和要求。
2.注意个人防护,佩戴实验室服和防护手套等个人防护用品。
3.注意实验器材的清洁与消毒,避免交叉污染。
4.正确保存和处理实验样品和废弃物,按照实验室安全规范进行处理。
我做的WB中检测两个目的基因,一个是90kd,一个是42kd,内参是36kd,请问一下我这个怎么做才有可比性,后面一个目的蛋白和内参大小差不了多少,如果是一块胶的话,剪膜也不能剪。
谢谢大家!这个很容易做,跑两个膜,每张膜上分别Blot两个目的基因,只要保证两个膜使用的都是同样来源的样品就好。
然后在分别strip掉blot内参基因。
如果你非要在一张膜上做的话,取决于你的前两个目的基因使用多抗还是单抗,使用抗兔的二抗的话,你可以先加一个基因的一抗,再加另一个基因的一抗,然后用抗兔的二抗一次将两个基因同时Blot出来。
一般内参基因都是单抗,所以将blot过的膜很轻微的strip一下,去除掉抗兔的二抗即可进一步blot内参,这样两个的结果都没有互相的干扰。
但是你一定要记得,不管你怎么做,内参一定要最后才能blot,如果你先blot了内参,由于内参蛋白在膜上的量实在太大,导致化学发光很强,你在后来无论如何strip还是blot 你的目的基因,都没办法拿到很好的结果。
1.为什么一定需要内参?内参的重要性。
2。
常用的几种内参。
3。
不同的情况如何选择不同的内参。
1:用内参照是为了评价你的各个上样孔内蛋白的总量是否基本一致,通常使用一些看家蛋白,比如β-actin、GAPDH等等。
这些蛋白在所有细胞中的表达量基本一致,所以用他们来作为你加样量的对照。
这样western结果中你的目的蛋白经过处理后发生变化,而内参的条带基本均匀一致。
这样才有说服力,表明的确是处理因素造成目的蛋白的变化而不是加样误差或是人为造成目的条带浓度的变化。
严格意义上说,内参事必须做的。
2:常用的内参有:b-actin,GAPDH,近2-3 年,更详细的研究发现,β-Tubulin (球管蛋白),被广泛应用于Western Blotting,β-Tubolin分子量为55KD左右。
3:一般我们选择内参与要检测的目的蛋白的分子量最好相差5KD以上。
刚开始接触WB实验有没有大佬可以分享常见WB常见问题的解决方法对于WB实验,我真的很有发言权,实验室苦干几年加上毕业后在试剂公司做技术支持好几年,我碰到的正常与非正常的WB实验问题肯定比一般人更多!这里给大家分享我们合作的课题组以及我们自己课题组在做WB实验的时候常见的一些问题以及解决方法!在讲WB之前,大家有兴趣的可以保存下这套课程,这是我自己买过的一套解螺旋实验技术学习的课程,2000分钟的实验讲堂,40个实验技能认证培训,有需要的可以自取,能学到非常多的实验实操知识。
好了,继续我们的主题内容。
Western Blot,通常我们在日常交流中说的就是简称“WB”,中文名称是“蛋白印迹”或“免疫印迹”,其核心本质是抗原抗体的特异性反应。
Western Blot的基本原理是蛋白质通过凝胶电泳后,按分子量大小顺序在分离胶中分离开来,通过转膜可将胶上蛋白质转移到固相载体(通常是PVDF膜、NC膜和尼龙膜)表面,然后加入一抗去特异性结合膜上蛋白质,再加入酶或者荧光素标记的二抗,二抗与一抗结合反应后,通过底物显色、化学发光等方法检测目的蛋白。
Western Blot实验一般用来判断特定蛋白在样本中是否表达及粗略分析特定蛋白表达量的高低。
01样本问题Q:蛋白样本如何准备?A:对于细胞样本,蛋白的提取方法比较简单,只需要将细胞培养基弃掉,然后利用PBS清洗2-3次,随后添加RIPA裂解液进行冰上直接裂解,离心上清即为蛋白;但是对于植物和动物组织而言,需要将组织分解成较小的组织块,液氮研磨,后续利用RIPA裂解液进行冰上裂解,相对于细胞蛋白的提取,多了一步组织样块的处理步骤。
02电泳问题Q1:大小分子蛋白各自的电泳胶浓度如何选择?小提示:1、由于SDS能够阻止蛋白与膜的结合,因此小分子蛋白转膜可不加SDS,同时甲醇浓度提高到20%;2、大蛋白易在凝胶里形成沉淀,转膜缓冲液中加入0.1%SDS,可增加蛋白的溶解性;3、由于甲醇易使SDS从蛋白上脱离,可降低甲醇的浓度(低至10%或者更低)来防止蛋白沉淀;4、推荐浓度梯度预制胶,4-20%高分辨率梯度预制胶,分离分子量范围3.5-200kD,大分子量小分子量兼顾,非常好用幺。
Western免疫印迹常见问题解答赛信通(上海)生物试做Western免疫印迹时,将膜孵育在稀释的抗体中轻轻摇动并4°C过夜。
抗体稀释在含5% 的w/v BSA或者1X TBS, 0.1% Tween-20的脱脂奶粉当中。
注意:参考一抗的产品说明书选用合适的抗体稀释液与稀释比例。
A.所需溶液与试剂注意:所有溶液用Milli-Q或者相当级别的水配制。
1. 20X 磷酸盐缓冲生理盐水(PBS):2. 1X SDS 上样缓冲液:3. 转膜缓冲液:25 mM Tris 碱, 0.2 M 甘氨酸, 20% 甲醇(pH 8.5)。
4. 10X Tris缓冲盐水(TBS):配制1L时,称取24.2g Tris碱,80g NaCl加入1L水中;调整pH为7.6(稀释至1X使用)。
5. 脱脂牛奶:6. 封闭液:含5% w/v脱脂奶粉,0.1% Tween-20的1X TBS。
配150ml时,在135ml水中兑入15ml 10X TBS,混匀;加入7.5g脱脂奶粉,使之溶解;边搅拌边加入0.15 ml Tween-20 (100%),混匀。
7. 洗液:1X TBS, 0.1% Tween-20 (TBS/T)。
9. 一抗稀释液:含5% w/v脱脂奶粉或者BSA,0.1% Tween-20的1X TBS。
配20ml时,在18ml水中兑入2ml 10X TBS,混匀;加入1gBSA或者脱脂奶粉,使之溶解;边搅拌边加入20 μl Tween-20 (100%),混匀。
10. Phototope®-辣根过氧化物酶Western印迹检测体系:12. 印迹膜:本套方法在硝酸纤维素膜上优化过,CST推荐使用硝酸纤维素膜。
PVDF也能够用本方法。
B.蛋白印迹样品制备的通用方法如下所述:1. 刺激细胞:加入含调节因子的新鲜培养基处理一定的时间。
2. 吸去培养基。
用PBS清洗一次,吸去洗液。
3. 加入1X SDS样品缓冲液裂解细胞(6孔板中每孔加100 μl,10cm盘中每盘加500μl)4. 超声处理10–15秒打断DNA同时降低样品的粘度。
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做了很久的WB(western blot ),走了很多弯路,但是WE想要做好并不难,总结WB实验中可能会遇到的问题,分析可能的原因及对应的解决方案,这就是实验成功的基石。
以下,我们先解决很多技术菌的疑惑,然后再着手汇总实验中常见问题和可能原因分析以及给出建议解决方案。
WB常见问题分析
1. 为什么我的细胞提取液中没有检测到目的蛋白?
原因有很多:
a)细胞中不表达这种蛋白质,换一种细胞;
b)细胞中的蛋白质被降解掉了,可加入蛋白酶抑制剂,抑制蛋白酶活性;
c)抗体不能识别目标蛋白,多看看说明,是否有问题;
d)酶降解可能是没有保持低温操作,样品保存不当,样品放置时间过长。
2. 我做的蛋白质分子量很小(10KDa ),请问怎么做 WB ?
a)可以选择PSQ膜,同时缩短转移时间。
也可以将两张膜叠在一起,再转移。
其他按步骤即可;
b)也可选择孔径0.22um的PVDF膜或者NC膜,转膜时间缩短,另外可采用
Tricin e-SDS-PAGE 体系。
3. 我的目的带很弱,如何加强?
a)可以加大抗原上样量,这是最主要的;
b)也可以将一抗稀释比例降低;
c)还可以延长曝光时间。
4. DAB好还是ECL好?
DAB有毒,但是比较灵敏,是 HRP最敏感的底物;
ECL结果容易控制,但被催化时灵敏度差一点,但如果达到阀值,就特别灵敏,可以
检测pg级抗原。
5. 胶片是一片空白,是怎么回事?
如果能够排除下面的几个问题那么问题多半出现在一抗和抗原制备上。
a)二抗的HRP活性太强,将底物消耗光;
b)ECM 底物中H2O2,不稳定,失活;
c)ECL底物没覆盖到相应位置;
d)一抗选择不当二抗失活;
e)二抗失活。
6. 磷酸化抗体的检测样本制备时是否一定要加NaF等?
NaF是一种广谱磷酸化酶的抑制剂,一般最好加。
但是不加也可以,大部分时候是不用加的。
7. 细胞水平要做 WB,多少细胞提的蛋白够做 WB ?
一般5X106就足够。
8. 如果上样量超载,要用什么方法来增加上样量?
可以浓缩样品,也可以根据目标分子量透析掉一部分小分子蛋白。
一般地,超载30 % 是不会有问题的。
如果已经超了不少了,而且小分子量的也要,可以考虑加大胶的厚度,可以试试1.5mm的。
9. 大分子量蛋白200KDa,在做 WB要注意什么?
a)做200kd蛋白的WB时要注意,分离胶最好选择 >7%的;剥胶时要小心;
b)转移时间需要相应延长;要做分子量参照(否则出现杂带不知道如何分析)。
c)转膜液中甲醇含量可适当降低,推荐使用湿装转膜效率更高哦!
10. 免疫组化和 WB可以用同一种抗体吗?
免疫组化时抗体识别的是未经变性处理的抗原决定簇(又称表位),有些表位是线性的,而有的属于构象型;线性表位不受蛋白变性的影响,天然蛋白和煮后的蛋白都含有;构象型表位由于受蛋白空间结构限制,煮后变性会消失。
如果所用的抗体识别的是蛋白上连续的几个氨基酸,也就是线性表位,那么这种抗体可同时用于免疫组化和WB ,而如果抗体识别构象形表位,则只能用于免疫组化。
11. WB中抗体的可以重复应用吗?
抗体工作溶液一般不主张储存反复使用,但是如抗体比较珍贵,可反复使用2-3次。
稀释后应在2- 3天内使用,4度保存,避免反复冻融。
12. 上下槽缓冲液有何要求,怎样才能达到最佳效果?
无特殊要求。
但一般是上槽放新鲜的缓冲液,下槽可以是重复使用过一两次的缓冲液。
WB实验中常会出现各种问题,也跟技术菌们一起分享下WB实验中各种问题及
应用对策,希望给您的实验带来实实在在的帮助~
WB可题汇总及解决建议
问题原因解决方案
胶凝的不均匀,聚合不好灌胶前将溶液充分混匀
某些样品盐浓度较高除盐或将样品盐浓度调成一致
条带形状不1
缓冲液陈旧,成分改变重配
好看
凝胶下面有气泡电泳前先将气泡赶走
电泳时温度过高降低电流或电压
样品中含有不溶性颗粒样品充分搅拌混匀
电极不平衡或者加样位置偏斜调整电极和加样
样品上样量不足或目的蛋白浓
度过低
加大上样量或浓缩样品
转移不完全或过转移可以用丽春红染膜并结合染胶(考马斯亮蓝)后确定条带是否转至膜上或转移过头;适当调整转膜的时间和电流
蛋白条带信
抗体浓度低增加抗体浓度或延长孵育时间
号弱
封闭过度
减少封闭剂的量或缩短时间,换用不冋封
闭剂类型
显色剂失效
更换显色剂(吸取A、B液的枪头不可混
用)
显色或曝光时间不足延长显色或曝光时间
HRP抑制剂所用溶液和容器内避免含有叠氮化钠
转膜缓冲液pH值与目的蛋白等
电点相近
提高转膜缓冲液pH值
凝胶与膜之间存在气泡转膜前要排尽气泡
转印膜种类选择不当
使用质量可靠的 PVDF膜或硝酸纤
维素膜
转膜效率
低电压或电流过小
湿转时20mA恒流,半干转时25V 左右恒
压
转印时间过长或过短
根据蛋白大小及转印装置选择合适
的转印时间
湿转过程中环境温度过高使用预冷的转膜缓冲液或将装置至于4度
显色或曝光后无条带选用的一抗、二抗及显色方法不
合适
选择合适的一抗、二抗和显色方法
目的蛋白含量低于检测下限加大上样量或浓缩样品
抗体效价过低增加抗体浓度
抗体孵育时间不足
延长孵育时间,37。
C孵育1小时以
上
抗体过度洗涤
减少洗涤时间及次数,加入的去垢剂不宜
过强或过多
加入HRP底物反应与曝光检测
之间间隔时间过长
反应3到5分钟及时检测
膜没有完全均匀湿透使用100% methanol浸透膜
洗膜不充分增加洗液体积和洗涤次数
封闭物用量不足
提高封闭物浓度,孵育时保证封闭液完全
浸没转印膜
封闭物使用不当
检测生物素标记的蛋白时不可用脱
脂奶粉圭寸闭
背景高]封闭时间不够
室温37度封闭1小时以上,4度封闭过
夜
抗体非特异性结合降低抗体浓度,减少孵育时间
一抗稀释度不适宜
对抗体进行滴度测试,选择最适宜的抗体
稀释度
一抗孵育的温度偏咼建议4C结合过夜
抗体浓度过高或洗涤不够降低抗体浓度,增加洗涤次数和时间
化学显色底物过多按说明书加入适量的显色底物
蛋白条带位相对电荷氨基酸电荷的组成置
(大小)胶浓度不同浓度的胶跑出的蛋白条带的位置可
能有所偏差,调整浓度
不对抗体孵育不充分增加抗体浓度,延长孵育时间
酶失活直接将酶和底物进行混合,如果不显色则说明酶失活了。
选择在有效期内、有活性的酶联物
目的蛋白存在翻译后修饰或剪切体查询相关文献确定
标本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太
低
设置阳性对照比对结果,增加标本上样量
目的蛋白有多个修饰位点,本身可以呈现多条带查阅文献或进行生物信息学分析,获得蛋白序列的修饰位点信息,通过去修饰确定蛋白实际大小
样本处理过程中目的蛋白发生降解
加入蛋白酶抑制剂;样本处理时在冰上操
作
杂蛋白多处理目的蛋白
杂带多
抗体特异性不强使用特异性强的抗体
抗体孵育时间过久减少抗体孵育时间
一抗与抗原有交叉反应选择合适的圭寸闭物
—聚体或多聚体存在增加蛋白质变性过程及强度
底物显色与曝光时间过长缩短显色及曝光的时间
膜孔径太小更换孔径较大的膜
转膜电压电流低提高电压/电流
大分子量
WB
转膜时间短延长转膜时间
胶浓度太大使用低浓度的胶
转膜缓冲液配方不合适调整转膜缓冲液中甲醇及 SDS浓度
背景有黑色抗体与封闭试剂反应使用前过滤封闭试剂
斑点HRP偶联二抗中有聚集体过滤二抗试剂,去除聚集体
120K&—
►
120KD-+ 12COT 9CKD~>
9OKD —►
9OKD-* 50KD T
5OKD —►
5OKD->
35KD —
35KD-* 35K&->
25KD —►
25KDT 沥KD —
2DKDf
20KD —►
2OKD->
lXkDa 一
130KDL 95kDL T2kD —
S5kDa — bOhDa —
36kDa^
35kDa — 25kDa —
17kDa — 30kDa^
17kE>ti —
10kt>i —
暗背景上白
色带
HRP 含量过高
降低酶联二抗的浓度
背景有不均 匀的白色斑 占 八、、
抗体分布不均匀
孵育抗体时使用摇床
顺便给大家来几张在实验中的
10kDa —
Uns 1 Lms 2
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