血液病细胞-分子遗传学检测中国专家共识(2013年版)
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血液病的分子诊断方法引言:血液病是一类严重威胁人类健康和生命的疾病。
传统上,对血液病的诊断主要依赖于骨髓穿刺、染色体核型分析等传统检测手段,但这些方法存在着一定的局限性。
近年来,随着分子生物学和遗传学技术的不断发展,新型的分子诊断方法逐渐成为血液病诊断领域的重要工具。
本文将介绍血液病的分子诊断方法,并探讨其在临床应用中的意义和前景。
一、常见血液病的分子诊断方法1.1 遗传突变检测遗传突变是导致很多血液病发生发展的关键因素。
通过对患者DNA或RNA进行序列分析,可以检测到与血液病相关基因中可能存在的突变。
例如,在急性淋巴细胞白血病(ALL)中,常见基因TLX1和TLX3异常导致白细胞克隆扩增并抑制细胞凋亡,可通过PCR技术对其进行检测。
1.2 基因重排检测在某些血液病中,基因间的重排现象是发生肿瘤发展的关键步骤。
这种重排不仅可以导致特定基因的过度表达,还可能造成其他癌基因的激活。
通过利用荧光原位杂交(FISH)、倒转录聚合酶链反应(RT-PCR)等技术,可以对此类基因重排进行检测。
如APML(急性早幼粒细胞白血病)常见的PML/RARA染色体融合基因就可以通过FISH技术诊断。
1.3 突变谱分析突变谱分析是一种对疾病相关基因中多个位点进行突变频率统计和相关性分析的方法。
通过该方法,可以发现血液病相关基因的主要突变类型和频率分布规律。
例如,在慢性髓系白血病(CML)中常见的BCR/ABL融合基因存在多个突变点,通过突变谱分析可以更全面地了解临床样本中该突变谱。
二、分子诊断方法在血液病中的应用意义2.1 提高诊断准确性传统的血液病诊断方法往往依赖于骨髓穿刺等操作,而分子诊断方法可以通过血液或组织样本,避免了对患者身体的创伤。
同时,与传统诊断方法相比,分子诊断方法具有更高的敏感性和特异性,可以更准确地检测到血液病相关基因突变、基因重排和改变。
2.2 提供个体化治疗指导血液病是一类异质性疾病,不同患者对治疗的反应存在差异。
嗜酸粒细胞增多症诊断与治疗中国专家共识(完整版)为了进一步规范我国血液科医师对嗜酸粒细胞增多症患者的临床诊治,由中华医学会血液学分会白血病淋巴瘤学组牵头,在广泛征求国内专家意见基础上,最终达成了嗜酸粒细胞增多症的诊断程序、实验室检查、诊断标准和治疗原则等方面的共识。
一、定义和分类[1,2,3,4,5,6]1.嗜酸粒细胞增多症(Eosinophilia):外周血嗜酸粒细胞绝对计数>0.5×109/L。
2.高嗜酸粒细胞增多症(Hypereosinophilia, HE):外周血2次检查(间隔时间>1个月)嗜酸粒细胞绝对计数>1.5×109/L 和(或)骨髓有核细胞计数嗜酸粒细胞比例≥20%和(或)病理证实组织嗜酸粒细胞广泛浸润和(或)发现嗜酸粒细胞颗粒蛋白显著沉积(在有或没有较明显的组织嗜酸粒细胞浸润情况下)。
3.HE的分类:分为遗传性(家族性)HE(HEFA)、继发性(反应性)HE(HER)、原发性(克隆性)HE(HEN)和意义未定(特发性)HE(HEUS)的四大类。
(1)HEFA:发病机制不明,呈家族聚集,无遗传性免疫缺陷症状或体征,无HER 和HEN证据。
(2)HER:主要可能原因有:①过敏性疾病:如哮喘、异位性皮炎、花粉症等;②皮肤病(非过敏性):Wells综合征等;③药物:包括抗生素和抗痉挛剂;④感染性疾病:寄生虫感染和真菌感染等;⑤胃肠道疾病:嗜酸细胞性胃肠炎、肠道炎症性疾病、慢性胰腺炎、乳糜泄等;⑥脉管炎:Churg-Strauss综合征、结节性多动脉炎等;⑦风湿病:系统性红斑狼疮、Shulman病、类风湿性关节炎等;⑧呼吸道疾病:Lǒeffler综合征、过敏性支气管肺曲霉菌病等;⑨肿瘤:实体瘤、淋巴瘤和急性淋巴细胞白血病(嗜酸粒细胞为非克隆性)、系统性肥大细胞增多症(嗜酸粒细胞为非克隆性)等;⑩其他:慢性移植物抗宿主病、Gleich病等。
(3)HEN:是指嗜酸粒细胞起源于血液肿瘤克隆。
全基因组测序在遗传病检测中的临床应用专家共识(完整版)遗传病是指由于基因或基因组的结构或功能改变所导致的疾病。
下一代测序(next-generation sequencing,NGS)是遗传病检测领域的一项革新性技术。
近年来靶向测序和全外显子组测序(whole exome sequencing,WES)得到广泛认可,逐渐成为辅助医生进行遗传病诊断的重要工具[1]。
这些检测手段尽管有效,仍然存在一些技术限制,特别是在检测结构变异(structural variations,SV)等方面。
全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)有望进一步提升临床遗传检测的效能[2]。
WGS对受检者基因组中的全部DNA序列进行检测,较WES所覆盖的区域更广,不仅覆盖了几乎全部基因的外显子序列,也覆盖了内含子序列和基因间序列。
现在认为WGS可有效避免在对相关基因组区域进行靶向富集时产生的技术偏差,不仅可以检出单核苷酸变异(single nucleotide variations,SNV),还可以对SV进行分析,并常规性地对线粒体基因组(mitochondrial genome DNA,mtDNA)变异进行分析[2,3]。
同时其操作步骤相对简化,能更加快速地获得更完整的基因组信息。
因此,WGS 应用于临床遗传诊断有望提高诊断率,缩短诊断流程,节省时间及降低诊疗费用[4]。
由于WGS产生的数据涉及受检者的几乎全部遗传信息,其应用于临床遗传病检测需遵循医学伦理中的自愿、患者受益、不伤害和公平原则。
为了实现其应有的临床意义,并妥善处理检测可能带来的复杂遗传咨询问题,本共识列出了WGS作为遗传病诊断检测手段的关键特征,并在检测申请、检测及分析流程、报告及遗传咨询等方面给出建议,但其实施流程及效能验证的具体步骤不在本共识的涵盖范围。
本共识适用于以NGS技术为主的高覆盖度WGS(通常>40X)在遗传病临床诊断性检测中的应用,主要针对符合孟德尔遗传规律的基因或基因组疾病。
四色流式细胞术用于急性白血病免疫分型的中国专家共识(完整版)白血病免疫分型是利用不同单克隆抗体检测白血病细胞胞膜和胞质抗原,通过流式细胞术(FCM)分析其表型,实现对白血病细胞系列来源及其分化程度的诊断。
白血病免疫分型已成为诊断白血病的必要依据,同时也可为微小残留病(MRD)的检测以及白血病的治疗和预后提供重要信息。
白血病免疫分型是细胞形态学分型的重要补充和进一步深化,以荧光标记技术联合FCM检测并判定白血病免疫表型,具有准确、快速、客观、重复性好、特异性强等特点,提高了白血病诊断的准确性[1, 2]。
采用不同数量及组合的荧光标记免疫抗体处理白血病细胞并进行荧光检测及分型是免疫分型的关键环节。
准确诊断需要选择一定数量的抗体,白血病免疫分型涉及多个造血系列的抗原,但目前国内甚至国际上均无规范化的方案可以借鉴;国内不同的医疗单位所用的抗体数量和种类均有较大的异质性,有些单位由于应用的抗体数量较少或抗体选择不当,影响对疾病的诊断、分期和预后的判断。
鉴于国内的实际情况,中国免疫学会血液免疫分会临床流式细胞术学组经过多次讨论,提出以CD45/侧向散射光(SSC)为基础的中国FCM急性白血病免疫分型四色方案,本方案以2组表面抗原作为筛查抗原,试图利用相对少的抗体,达到对各个类型白血病进行较全面的检测,具有快速、客观、准确的特点。
已在国内的多家医疗单位试用,证明此方案能够满足临床的需要[3, 4]。
目前,虽然国际上有八色甚至十色方案[5, 6, 7],但对仪器及操作人员的技术要求较高。
鉴于国内的实际情况,我们首先提出中国FCM急性白血病免疫分型四色方案,供从事急性白血病免疫分型的实验室参考,以期促进我国急性白血病免疫分型诊断的规范化及整体水平的提高。
一、四色方案的基本要求理想的急性白血病免疫分型方案应满足以下几点要求:①识别白血病细胞,能将其与正常细胞或反应性细胞相区别;②鉴别白血病细胞的系列来源;③根据细胞的分化程度对疾病进行亚型分型;④鉴别用于检测MRD 的白血病相关免疫表型(LAIP) ;⑤帮助判断某些特异分子改变,即基因型检测;⑥提供预后相关及治疗靶点的免疫标志检测结果。
临床分子病理实验室二代基因测序检测专家共识近年二代基因测序(next—generation sequencing,NGS)技术快速发展,其应用已进展至临床检测,如遗传疾病、实体肿瘤、血液肿瘤、感染性疾病、人类白细胞抗原分析及非侵袭性产前筛查等。
国内外有关学会已出台相关共识与指南以推动其在临床中的应用。
中华医学会病理学分会和中国抗癌协会肿瘤病理专委会前期组织病理、临床、生物信息等专家进行了充分讨论,拟在NGS的操作流程、数据处理、结果解读等方面作规范和建议,以规范NGS在分子病理领域的应用。
临床分子病理实验室NGS样本可采用甲醛固定石蜡包埋组织(formalin-fixedparaffin—embedded,FFPE)、新鲜组织、各种体液上清液、体液离心细胞块、石蜡包埋标本和血浆/血液标本等。
本共识特色是基于病理评估的组织样本(FFPE、新鲜)的规范。
测序分析范围基于目前临床需求,本共识着重在于目标区域测序(panel)分析的实践。
随着技术的更新和应用的成熟,本共识将持续更新以满足临床需求。
一、实验室总体要求NGS检测实验室的总体设计与要求应参考《分子病理诊断实验室建设指南(试行)》、《医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则》、《个体化医学检测质量保证指南》、《肿瘤个体化治疗检测技术指南》、《个体化医学检测实验室管理办法》、《测序技术的个体化医学检测应用技术指南(试行)》进行。
1。
NGS检测人员的资质要求:NGS检测技术人员应具备临床病理学、分子生物学的相关专业大专以上学历,并经过NGS 技术的理论与技能培训合格。
数据分析人员应具有临床医学或分子生物学或遗传学知识背景并经生物信息学培训。
最终报告应由中级或硕士以上具有病理学背景、经培训合格的本单位执业医师或者授权签字人(医学博士学位或高级职称)审核。
2.NGS检测实验室的区域设置要求:原则上NGS实验室应当有以下分区:样本前处理区、试剂储存和准备区、样本制备区、文库制备区、杂交捕获区/多重PCR区域(第一扩增区)、文库扩增区(第二扩增区)、文库检测与质控区、测序区、数据存贮区.各工作区空气及人员流向需要严格按照《医疗机构临床基因扩增检验实验室工作导则》.分区可根据实际情况合并,但是在前处理和建库时,血液样本应与组织样本分开. 3。
获得性纯红细胞再生障碍诊断与治疗中国专家共识(完整版)为进一步提高我国纯红细胞再生障碍(Pure red cell aplasia, PRCA)的诊治水平,中华医学会血液学分会红细胞疾病(贫血)学组在广泛征求国内多位专家意见的基础上,达成以下我国获得性PRCA诊断与治疗专家共识。
一、PRCA定义及发病机制PRCA是一种以正细胞正色素贫血、网织红细胞减低和骨髓幼红细胞显著减少或缺如为特征的综合征,包括先天性PRCA (Diamond- Blackfan贫血,DBA)和获得性PRCA。
DBA是由核糖体蛋白结构基因突变导致核糖体生物合成异常,为红细胞内源性生成缺陷所致,多在出生后1年内发病,约1/3合并先天畸形。
获得性PRCA又可分为原发性和继发性,原发性PRCA可能与自身免疫有关,也可见于白血病前期,大多数为特发性,无确切诱因。
继发性PRCA 常继发于不同疾病,机制复杂,尚不十分明确(表1)。
表1获得性纯红细胞再生障碍病因和分类二、获得性PRCA的诊断建议(一)病史采集1.既往基础疾病:感染、结缔组织病、肾功能衰竭、肿瘤、慢性溶血性贫血、胸腺瘤、血液系统肿瘤等。
2.用药史:氯霉素、氯磺丙脲、硫唑嘌呤、红细胞生成素(EPO)等。
3.化学品接触史。
4.有无妊娠。
5.有无营养不良。
(二)实验室检查1.血常规:红细胞计数、血红蛋白含量、网织红细胞百分比;白细胞计数及分类、血小板计数;血细胞涂片等。
2.肝肾功能、电解质。
3.血清EPO水平、EPO抗体检测:EPO相关PRCA患者血清EPO 水平与贫血程度呈负相关。
原发性PRCA多与异常免疫有关,自身抗体作用于定向干细胞或EPO受体上,或原发产生EPO的自身抗体。
部分患者血清IgG水平升高。
4.结缔组织病相关抗体检测:至少包括ANA、ENA、dsDNA、RF、ASO等筛查。
5.甲状腺功能检查。
6.病毒学检测:包括细小病毒B19、肝炎病毒、EBV、HIV、成人T 细胞白血病-淋巴瘤病毒、CMV等。
∙标准与讨论∙血液病细胞-分子遗传学检测中国专家共识(2013年版)中华医学会血液学分会实验诊断血液学学组DOI:10.3760/cma.j.issn.0253-2727.2013.08.022通信作者:王健民,Email:jmwang@Consensus of Chinese experts on cytogenetics and molecu-lar genetic analysis for the diagnosis of hematologic disor-ders(2013)Hematology Society of Chinese Medical Associa⁃tion,Laboratory Diagnosis GroupCorrsponding author:WANG Jian-min.Department of Hema-tology,Changhai Hospital,Second Military Medical Univer-sity Shanghai200433,China.Email:jmwang@.cn血液系统恶性克隆性疾病,常伴有获得性细胞遗传学异常。
细胞遗传学检测对于血液病患者的诊断、分型、危险度分层、预后判断和随访具有重要意义。
细胞遗传学检测方法包括常规染色体显带及荧光原位杂交(FISH)技术,已成为血液病诊断的核心技术之一,但包括标本准备、处理、分析和报告等在内的诸多环节均可能影响检测结果的准确性。
为了规范和完善血液病细胞遗传学诊断技术的各个环节,进一步提高我国血液病细胞分子遗传学诊断技术的水平,中华医学会血液学分会实验诊断血液学学组组织有关专家在系统复习文献的基础上结合我国实际情况,经过反复讨论,形成了本共识,供从事血液病细胞分子遗传学诊断的实验室参考,为今后在全国范围内推广细胞遗传学诊断技术的标准化奠定基础。
一、标本取材和运输1.取材时机:细胞毒性药物(包括激素)可以影响血液病患者中期分裂象的数量或质量,甚至导致核型分析失败。
因此初诊患者通常应在使用细胞毒性药物前留取标本。
慢性髓性白血病(CML)患者使用羟基脲也可能会影响分裂象的数量和质量,如病情允许,可在临床医师指导下,停止羟基脲治疗1周后留取标本。
2.取材部位:(1)染色体核型分析:血液病患者染色体核型分析的标本来源通常以骨髓为宜,取骨髓的量视外周血白细胞计数的高低而定,多数病例取2~5ml可满足检测需求,对于骨髓增生活跃程度高的患者,少量标本也可能满足需求。
当外周血白细胞计数>10×109/L,且原始+幼稚细胞比例>0.10时,也可采用外周血作为检测标本。
拟诊断为慢性淋巴细胞白血病(CLL)的患者,可采用外周血作为标本来源。
拟诊淋巴瘤的患者,可将淋巴结活检样本处理成单细胞悬液后作为标本来源。
进行体细胞染色体异常检测或范可尼贫血诊断时,可采用外周血作为标本来源。
脑脊液及离心浓缩后的胸腔积液、腹腔积液也可作为样本来源。
(2)荧光原位杂交(FISH)分析:FISH检测通常以染色体悬液为标本来源,新鲜的骨髓涂片或外周血涂片也可作为FISH的标本来源,石蜡包埋病理切片、染色后的骨髓涂片在回顾性分析时也可作为标本来源。
3.标本保存:抗凝剂通常选择肝素钠。
肝素锂尤其是EDTA可对细胞的活性产生不利影响。
标本的快速肝素化对于防止凝结非常重要。
取骨髓(或外周血)的针管事先应用2g/L的无菌肝素钠抗凝剂0.2ml湿润内壁(注意不能超量,较多肝素反而会导致白细胞聚集)。
将取出的骨髓迅速转移至含RPMI1640完全培养液[培养液含20%胎牛血清或新生牛血清、少量肝素钠和青霉素、链霉素]的无菌培养瓶内送检。
4.标本标记和申请单:装标本的容器应标记患者姓名、床号及其他必要信息。
染色体显带核型分析及FISH检查申请单至少应包含以下信息:患者基本信息及联系方式;住院号或门诊号、送检日期;送检医生、送检单位及联系方式;患者主诉、病史、体检、治疗相关重要信息;重要的实验室检测结果以及检测要求(如FISH检测靶点或探针名称、丝裂霉素断裂试验等);提供患者的初步诊断,以便实验室技术人员在进一步的标本处理中根据患者可能的诊断给予合适的培养条件。
5.标本运输:取出的新鲜标本应于室温条件下尽快(24h内)送至实验室进行处理,夏季和冬季应采取措施防止运输过程中标本温度过低或过高,标本不能与冰块或冰袋直接接触。
如果无条件将标本放在含RPMI1640完全培养液容器中送检,而是置于肝素抗凝管或注射器内送检,建议最迟5~6h内送达检测实验室。
标本运输耗时越长,则对细胞活性影响越大。
送检延迟的标本中,正常造血细胞往往较血液肿瘤细胞更有增殖优势,由此可增加检测结果假阴性的几率。
此外,送检延迟对于外周血高白细胞计数及急性淋巴细胞白血病的标本影响尤其显著,因此对这类标本更应尽快送检。
二、染色体标本的制备1.骨髓细胞直接培养法:血细胞染色体核型分析通常采用骨髓细胞短期培养法,即骨髓标本经计数,调整细胞密度为(1~2)×106/ml,接种于RPMI1640完全培养基中,在37℃恒温培养箱内孵育24或48h。
2.外周血和(或)骨髓细胞特殊处理培养法:进行体细胞染色体异常检测一般采用外周血标本,培养时需额外加入新鲜配制的植物血凝素(PHA),在37℃刺激培养72h;范可尼贫血患者外周血标本在加入PHA的同时需要加入丝裂霉素共同孵育;CLL患者外周血标本在培养时加入未甲基化胞嘧啶鸟嘌呤二核苷酸寡脱氧核苷酸(CpG-ODN)和美洲商陆素(PWM)等刺激培养72h可提高异常核型检出率;淋巴结活检标本应于无菌条件下剪碎研磨、过滤成单个细胞后进行培养;多发性骨髓瘤患者的骨髓标本可用CD138磁珠分选联合间期FISH(I-FISH)或胞质轻链免疫荧光结合FISH(cIg-FISH)技术提高染色体异常检出率;浆膜腔积液需离心、弃上清,调整细胞密度为(1~2)×106/ml进行培养。
3.收获染色体标本:细胞培养结束前,加入秋水仙胺处理1h,以增加中期分裂象(CLL患者及检测体细胞染色体异常的患者,秋水仙胺处理时间可延长至3.5h)。
随即以0.075mol/L KCl进行低渗处理(骨髓细胞37℃处理35min,外周血细胞处理25min)。
最后加入新鲜配制的固定液(甲醇∶冰醋酸=3∶1)进行预固定及固定,收获的染色体标本悬液于2~8℃保存备用。
4.染色体标本显带:将染色体标本悬液用新鲜配制的固定液重新固定、吹打混匀,采用气干法或火焰烧灼法滴片。
将制备的玻片置于pH6.5~6.8的Earle’s溶液恒温水浴加热(87.5℃,60~120min),进行热变性R显带;或者将制备的玻片置于70℃烤箱中处理2h后浸入胰蛋白酶溶液(pH7.0),37℃水浴1~2min进行G显带(根据老化时间及各实验室条件的差异,合适的胰蛋白酶变性时间可有较大差异)。
变性后以新鲜配制的10%吉姆萨染液染色10min。
5.核型分析及报告:(1)核型分析:分析时先用低倍镜从左至右、自上而下逐个视野寻找合适的分裂象,再换用油镜进行观察。
凡长度适中、分散良好、基本无重叠、带型可识别者均列为分析的对象。
分析时要遵循“随机”的原则,避免只挑选“漂亮”的分裂象进行分析,否则可致人为的假阴性结论。
因为“漂亮”的分裂象常来自正常细胞,而“丑陋”的分裂象常来自白血病细胞。
核型分析时如发现中期分裂象质量不佳,以致难以分辨是否为正常或异常细胞,可以增加分析分裂象的数量或重新显带,在部分患者中重新显带可能会改善中期分裂象的显带质量。
同一标本可能存在多个相关或不相关异常克隆,故应仔细分析,以免漏检。
当核型分析发现一些不常见异常,且比例为100%时,应注意进行外周血PHA刺激法制备染色体标本进行核型分析,以排除体细胞染色体异常。
通常要求分析20个以上的中期分裂象,分析细胞不足此数而又未能发现异常者不能下正常核型的结论;相反,已发现异常克隆者则不一定强求此数。
(2)核型描述:核型分析结果必须遵循人类细胞遗传学国际命名体制(ISCN)进行描述。
核型描述可分简式和繁式。
常用简式,例如:46,XY表示1个染色体数目为46的正常男性核型;47,XY,+8表示1个染色体数目为47的超二倍体男性核型,其中增加了1条8号染色体(即8三体);46,XY,t(9;22)(q34;q11)表示染色体数目为46的假二倍体男性核型,其中有一个涉及9和22号染色体的相互易位,断裂点分别位于9号染色体长臂的3区4带和22号染色体长臂的1区1带。
常用缩写符号为p(短臂)、q(长臂)、t(易位)、del(缺失)、inv(倒位)、ins(插入)、der(衍生染色体)、dup(重复)、mar(标记染色体)、r(环状染色体)、i(等臂染色体)等。
异性造血干细胞移植后,受者和供者嵌合型核型的描述与其他核型描述不同。
在报告核型时应先列出受者核型及分析的细胞数目,再列出供者核型及分析的细胞数目,两者之间用“//”隔开。
例如:46,XX[2]//46,XY[18]表示供者为男性,受者为女性,移植后受者的嵌合核型中仍有2个细胞为受者自身的女性核型,18个细胞为来自受者的男性核型;46,XX,t(9;22)[1]//46,XY[19]表示1个伴有9和22号染色体易位的细胞为来自患者自身的女性核型,19个细胞为来自供者的男性核型;//46,XY[20]表示所分析细胞均为来自供者的男性核型;46,XX[20]//表示所分析细胞均为来自患者自身的女性核型。
(3)克隆性定义及标准:克隆指来自单个祖细胞的一个细胞群体,通常用来描述有着相同或相近染色体异常的一群细胞。
其标准:如为结构异常或染色体数目增加异常,则至少要有2个或2个以上的中期分裂象具有相同的异常方可称为1个克隆;如为染色体数目减少异常,则至少要有3个或3个以上的细胞具有相同的异常才可称为1个克隆。
(4)染色体核型报告:染色体分析报告至少要包含以下内容:①诊断实验室名称。
②患者信息:包括姓名、性别、年龄、门诊号或住院号、联系方式、标本编号和临床诊断等。
③标本信息:包括标本来源、标本类型、采集或接收日期、标本质量、培养方法、显带方法等。
④核型描述:按照ISCN要求详细描述核型分析结果,并显示所分析细胞数目(正常核型≥20个,伴克隆性异常核型≥10个)。
⑤核型结论:根据核型分析的结果做出染色体分析的诊断结论,如果发现需要与临床医师确认、或需要采用FISH、PCR或其他技术进一步核实的问题,应在备注及建议栏中加以注明。
注明报告日期、分析者和审核者姓名。
三、FISH检测及报告1.镜下观察:根据标记荧光素的激发光与发射光波长,选择合适的荧光显微镜滤片(必备滤片:DAPI;常用滤片:Spectrum Orange/Texas Red、Spectrum Green/FITC)。