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3.实验方法(以16SrRNA为例):
⑴用T1核糖核酸酶水解(32P标记的)16SrRNA 得 一系 列长度不一的寡核苷酸片段。
⑵水解产物双向电泳。 ⑶利用放射自显影技术获得16SrRNA寡核苷酸的指纹。 ⑷对6个核苷酸以上的寡核苷酸进行序列分析,并按长度将
分析结果编成分类目录。 ⑸最后按照目录比较对偶(两个被测M)间的相似性,即
种来定种。
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• 一、种以上的分类单元 • 二、种以下的分类单元
㈠亚种(Subspecies,subsp,ssp.) ㈡变种(Variety,var.) ㈢型(form) ㈣菌株(strain),又称品系 ㈤培养物(culture) ㈥居群(population)(群体、种群、群丛)
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• Bacillus subtilis BF7658 α-淀粉酶高产的枯草杆菌 • Corynebacterium pekinense AS1.299
谷氨酸高产的北京棒杆菌
• Bifidobacterium bifidum ATCC 29521
双歧双歧杆菌的一个模式菌株 • ATCC-(Amercian Type Culture Collection) • AS-中国科学院(Academia Sinica) • BF-北京纺织工业局科学研究所
配对的专一性,将待测的不同来源的DNA在 体外加热,使其解链,并在合适条件下使互 补的碱基重新配对,然后测定杂交百分率。 • (以同源%or碱基相似性%表示)。%↑——两 者间碱基顺序的同源性↑(亲缘关系接近)
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说明:一般 70%以上――种 20%以上――属
(DNA-DNA杂交一般用于测定有密切关系(种或种内)微生物间的相似性;DNArRNA分子杂交用于检查关系较远的微生物间的相似性。)