CTAB法提取植物DNA
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关于CTAB法提取基因组DNA,原理CTAB法原理CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特性。
在高离子强度的溶液中(>0.7mol/L NaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸。
通过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。
CTAB提取缓冲液的经典配方Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,在于液相中;CTAB 溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖。
用酚抽提细胞DNA时,有什么作用?使蛋白质变性,同时抑制了DNase的降解作用。
用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA 联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。
蛋白分子溶于酚相,而DNA 溶于水相。
使用酚的优点:1.有效变性蛋白质;2抑制了DNase的降解作用。
缺点:1.能溶解10-15%的水,从而溶解一部分poly(A)RNA。
2.不能完全抑制RNase的活性。
氯仿的作用?氯仿:克服酚的缺点;加速有机相与液相分层。
最后用氯仿抽提:去除核酸溶液中的迹量酚。
(酚易溶于氯仿中)用酚-氯仿抽提细胞基因组DNA时,通常要在酚-氯仿中加少许异戊醇,为什么?异戊醇:减少蛋白质变性操作过程中产生的气泡。
异戊醇可以降低表面张力,从而减少气泡产生。
另外,异戊醇有助于分相,使离心后的上层含DNA的水相、中间的变性蛋白相及下层有机溶剂相维持稳定。
ctab法提取dna实验报告CTAB 法提取 DNA 实验报告一、实验目的掌握 CTAB 法提取 DNA 的原理和操作方法,提取高质量的植物或微生物 DNA,为后续的分子生物学实验(如 PCR、基因测序等)提供纯净的 DNA 样本。
二、实验原理CTAB(十六烷基三甲基溴化铵)是一种阳离子去污剂,在高离子强度的溶液中能与核酸形成复合物,并通过离心将其与蛋白质、多糖等杂质分离。
随后,用乙醇或异丙醇沉淀 DNA,使其从溶液中析出。
三、实验材料与试剂1、实验材料选取新鲜的植物叶片(或微生物培养物)。
2、实验试剂CTAB 提取缓冲液:2% CTAB,14 M NaCl,20 mM EDTA,100 mM TrisHCl(pH 80),02% β巯基乙醇(使用前加入)。
氯仿异戊醇(24 : 1)异丙醇70% 乙醇TE 缓冲液(10 mM TrisHCl,1 mM EDTA,pH 80)四、实验仪器与设备1、高速冷冻离心机2、恒温水浴锅3、移液器4、涡旋振荡器5、微量紫外分光光度计五、实验步骤1、材料处理植物材料:取新鲜植物叶片约 2 g,用液氮速冻后研磨成粉末。
微生物材料:收集一定量的微生物培养物,离心收集菌体,用无菌水洗涤后重悬。
2、加入提取缓冲液将研磨好的植物粉末(或重悬的微生物)迅速转移至离心管中,加入预热至 65℃的 CTAB 提取缓冲液,充分混匀,65℃水浴保温 30 60 分钟,期间不时轻轻颠倒混匀。
3、抽提加入等体积的氯仿异戊醇(24 : 1),涡旋振荡 10 15 分钟,使其充分混匀,然后 12000 rpm 离心 10 15 分钟。
4、转移上清用移液器小心吸取上清液至新的离心管中,避免吸取中间的蛋白质层。
5、 DNA 沉淀向上清液中加入 06 07 倍体积的异丙醇,轻轻颠倒混匀,室温放置10 20 分钟,使 DNA 沉淀。
6、离心收集12000 rpm 离心 10 15 分钟,弃上清。
7、洗涤用 70% 乙醇洗涤沉淀 2 3 次,每次离心 5 10 分钟,弃上清。
CTAB法提取植物基因组DNACTAB法原理CTAB(Cetyl trimethyl ammonium bromide),十六烷基三甲基溴化铵,是一种阳离子去污剂,可溶解细胞膜,能与核酸形成复合物,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸的特性。
当降低溶液盐浓度到一定程度(0.3 mol/L NaCl)时,CTAB-核酸的复合物从溶液中沉淀,通过离心就可将其与蛋白,多糖类物质分开,在经过有机溶剂抽提,去除蛋白,多糖,酚类等杂质。
最后通过乙醇或异丙醇沉淀DNA,而CTAB溶于乙醇或异丙醇而除去在高离子强度的溶液中(>0.7mol/L NaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,不能沉淀核酸。
CTAB溶液在低于15℃时会形成沉淀析出,因此,在将其加入冰冷的植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于15℃。
另外,它还能保护DNA不受内源核酸酶的降解。
主要试剂与溶液的配制:PVP(聚乙烯吡咯烷酮K30)巯基乙醇氯仿︰异戊醇(24︰1)异丙醇70%乙醇Tris-苯酚RNaseA无水乙醇CTAB 溶液:CTAB——20g/LNaCl(58.44)——1.4 mol/L(81.816g)EDTA(292.25)——10 mmol/L(2.9225g)Tris(121.14)——100 mmol/L(12.114g)pH 8.01×TE 缓冲液:EDTA(292.25)——1 mmol/L(0.29225g)Tris(121.14)——10 mmol/L(1.2114g)pH 8.0NaAC溶液:NaAC(82.03)——3mol/L(246.09g)pH 4.0植物总DNA的提取1、取适量甘薯新鲜叶片,用液氮迅速研磨,中间加PVP(聚乙烯吡咯烷酮K30)少许,成粉末后转入10mL的离心管中,放入液氮或-80℃冰箱储存(在研磨样品时,研的细和研的粗,提出的DNA量可以相差几倍,所以,在液氮保护的很好的情况下尽量多研磨几次)。
提取植物DNA方法提取植物DNA的方法有许多种,下面将介绍其中几种常用的方法。
1. CTAB法CTAB法(Cetyltrimethylammonium Bromide法)是一种经典的植物DNA 提取方法,适用于多种植物样本。
其基本步骤如下:(1)取植物样本,如叶片、茎等,将其研磨成细碎的粉末。
(2)将粉末加入含有CTAB(一种能溶解细胞膜的表面活性剂)的提取缓冲液中,加入蛋白酶K(能降解蛋白质)和β-巯基乙醇(能还原核酸)。
(3)在65下进行细胞破裂和DNA溶解。
(4)通过氯仿/异戊醇提取和乙醇沉淀的方法,将DNA从混合物中分离出来。
(5)最后用纯净水洗涤DNA,使其得以纯化。
2. 高盐法高盐法属于常规的DNA提取方法,适用于大部分的植物样本。
基本步骤如下:(1)取捣碎的植物材料加入含有高盐浓度的提取缓冲液中,并加入蛋白酶K和β-巯基乙醇。
(2)在室温下进行混合,并在高温下(如65)进行DNA的溶解。
(3)通过氯仿/异戊醇提取和乙醇沉淀的方法,将DNA分离和纯化出来。
(4)最后用纯净水洗涤DNA,使其得以纯化。
3. 磁珠法磁珠法是一种相对快速、高效的DNA提取方法,基于磁珠与DNA之间的亲和力。
该方法需要使用一些商业化的提取试剂盒,操作过程相对简单,适用于大规模样本的提取。
基本步骤如下:(1)将植物样本加入含有提取缓冲液和蛋白酶K的试管中,同时加入磁珠试剂。
(2)在高温下进行DNA的溶解和蛋白质的降解。
(3)将混合物与磁珠结合,并使用磁力架将DNA磁珠复合物分离出来。
(4)对磁珠复合物进行洗涤和溶解,获得纯化的DNA。
4. 二硫苏糖盐法二硫苏糖盐法是一种用于植物材料中DNA提取的改良方法,适用于纤维素含量较高的植物样本。
基本步骤如下:(1)将植物材料加入二硫苏糖盐提取缓冲液中,加入蛋白酶和β-巯基乙醇。
(2)对细胞质进行破裂和溶解,使DNA释放到溶液中。
(3)通过异丙醇的加入,将DNA从混合物中分离和沉淀。
CTAB法原理(植物DNA提取经典方法)原理:CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特性。
在高离子强度的溶液中(>0.7mol/L NaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸.通过有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。
注:CTAB溶液在低于15℃时会形成沉淀析出,因此,在将其加入冰冷的植物材料之前必须预热,且离心时温度不要低于15℃。
一、CTAB提取缓冲液的经典配方:Tris-HCl (pH8.0)提供一个缓冲环境,防止核酸被破坏;EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase活性;NaCl 提供一个高盐环境,使DNP充分溶解,存在于液相中;CTAB溶解细胞膜,并结合核酸,使核酸便于分离;β-巯基乙醇是抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚容易去除。
二、CTAB提取缓冲液的改进配方:(1) PVP(聚乙烯吡咯烷酮)是酚的络合物,能与多酚形成一种不溶的络合物质,有效去除多酚,减少DNA 中酚的污染;同时它也能和多糖结合,有效去除多糖;(2) 蛋白质的去除:酚/氯仿抽提使用变性剂变性(SDS、异硫氰酸胍等)高盐洗涤蛋白酶处理核酸分离,纯化;(3)多糖的去除:高盐法:用乙醇沉淀时,在待沉淀溶液中加入1/2体积的5M NaCl,高盐可溶解多糖。
用多糖水解酶将多糖降解。
在提取缓冲液中加一定量的氯苯(1/2体积),氯苯可以与多糖的羟基作用,从而去除多糖。
用PEG8000代替乙醇沉淀DNA:在500 μL DNA液中加入200μl 20% PEG8000 (含1.2 M NaCl),冰浴20min.核酸分离,纯化;(4) 多酚的去除:在抽提液中加入防止酚类氧化的试剂:β-巯基乙醇、抗坏血酸、半胱氨酸、二硫苏糖醇等加入易与酚类结合的试剂:如PVP(聚乙烯吡咯酮),PEG(聚乙二醇),它们与酚类有较强的亲和力,可防止酚类与DNA的结合;(5) 盐离子的去除:70%的乙醇洗涤核酸吸附,沉淀和溶解使用合适的吸附材料吸附核酸,其它的杂质均被洗掉,达到纯化DNA的目的另一种方式加入1/10体积的NaAc(pH5.2,3M),用预冷的乙醇或异丙醇沉淀RNA吸附或沉淀后应用70%的乙醇洗涤,以除去盐离子等若长期储存建议使用TE缓冲液溶解TE 中的EDTA能螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNasepH值为8.0,可防止DNA发生酸解。
CTAB法提取植物总DNA
实验原理
CTAB(hexadecyltrimethylammonium bromide,十六烷基三甲基溴化铵),是一种阳离子去污剂,具有从低离子强度溶液中沉淀核酸与酸性多聚糖的特性。
在高离子强度的溶液中(>0.7mol/LNaCl),CTAB与蛋白质和多聚糖形成复合物,只是不能沉淀核酸.通过有机溶剂抽提,去除蛋白、多糖、酚类等杂质后加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。
采用机械破碎植物细胞,然后加入CTAB分离缓冲液将DNA溶解出来,再经氯仿-异戊醇抽提除去蛋白质,最后得到DNA。
实验步骤
1. 取1-50g新鲜植物材料,于液氮中研成粉。
2. 将冻粉转入预冷的离心管中,立即加入等体积(w/v) 2×CTAB提取缓冲液,65℃保温10-20分钟,其间不时摇动。
3. 加入等体积的氯仿/异戊醇,轻缓颠倒离心管混匀,室温下,12000r/min 离心10-20分钟。
4. 将上清液转入另一离心管中,加入等体积的氯仿/异戊醇,颠倒离心管混匀,室温、12000r/min 离心10分钟。
5. 将上层水相转入新的经硅烷化处理的离心管中,加入0.6-1倍体积的异丙醇,混匀,室温下放置30分钟。
6. 3500-4000r/min 离心5-10分钟,去上清液, 70%乙醇漂洗,沉淀吹干。
7. 风干后加入40ul的TE缓冲液溶解DNA,-20℃保存备用。
8. 取2ul溶液电泳检测。
注意事项
所有操作均须温和,避免剧烈震荡。
1)取0.1~0.2 g幼叶片放入液氮预冷的研钵液氮种研磨成粉。
加入含有65℃预热的1 000 μl CTAB裂解液和20 μlβ-巯基乙醇的2 ml离心管中,65℃水浴裂解40~60 min,每隔10min颠倒混匀一次。
然后常温12 000 r/min离心10 min。
2)取上清,加入2 ml离心管中,加入等体积氯仿:异戊醇(24:1), 旋涡混匀,4℃, 12 000 r/min, 离心10 min。
重复这一步骤至界面清晰。
3)取上清,加入到1. 5 ml离心管, 加入两倍体积-20℃预冷的无水乙醇和1/10体积3M的NaAc(pH=5.2), 小心颠倒均匀,-20℃沉淀10~30 min。
4)4℃, 12 000 r/min, 离心10 min。
弃上清,用70%的乙醇洗2~3次。
室温干燥30 min。
5)加入1μl 10 mg/ml RNase,37℃温浴30-60 min去除RNA。
6)溶于40μl灭菌的ddH2O,琼脂糖凝胶检测。
注:无水乙醇、NaAc、70%的乙醇预冷7)取0.1~0.2 g植物材料放入液氮预冷的研钵液氮种研磨成粉。
加入含有65℃预热的1 000 μl CTAB裂解液和20 μlβ-巯基乙醇的2 ml 离心管中,65℃水浴裂解40~60 min,每隔10min颠倒混匀一次。
8)加入等体积氯仿:异戊醇(24:1), 旋涡混匀静置3 min,4℃, 12 000r/min, 离心10 min。
9)取上清800 μl于2 ml离心管中,加入等体积氯仿:异戊醇(24:1), 旋涡混匀冰上静置3 min,4℃, 12 000 r/min, 离心10 min。
10)取上清600μl,加入1/30体积的NaAc(3M,pH=5.2)和1/10体积的无水乙醇(均预冷),混匀,在冰上静置10 min,再加入等体积氯仿:异戊醇(24:1),4℃,12 000 r/min, 离心10 min。
CTAB提取植物DNA步骤一、将冷冻干燥的样品用液氮研磨成粉末,转移到离心管,加入65℃预热的2ml CTAB抽提液,65℃保温30 min 以上,间或轻摇混匀;12 000 r/min室温离心10 min,取上清液;二、加入等体积的苯酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),轻轻混匀15 min 以上,12 000 r/min室温离心10 min,用剪去端部约0.8 cm的1 mL 吸头小心将上层液相转移至一干净的Eppendorf管中;加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),颠倒混匀,12000 r/min 离心5 min 。
三、加入2/3体积( )的-20℃预冷的异丙醇,轻轻摇动5 min,颠倒混匀至有白色絮状沉淀出现,在4℃下12000 r/min离心l0 min,沉淀出DNA,去上清;四、沉淀用75%乙醇/和0.2mol/L KAC洗涤2次,每次12000 r /min室温离心10 min;五、加入预冷的无水乙醇,轻轻上下颠倒,l2 000 r/min室温离心20 min,弃乙醇,自然晾干;加入200μL 去离子水,轻轻敲打使沉淀溶解;六、加入l μL 10 mg/mL Rnase37℃水浴,保温l h,去除RNA;DNA 提取物于-20℃冰箱贮藏备用.一、母液配制方法1、1M Tris-HCl 1L配制量配制方法称量121.1g Tris 置于1L烧杯中。
加入约800ml的去离子水,充分搅拌溶解。
按下表量加入浓盐酸调节所需要的pH值。
pH值浓盐酸7.4 70ml7.6 60ml8.0 42ml将溶液定容到1L。
高温高压灭菌后,室温保存。
注意:应使溶液冷却后加调定pH值,因为Tris溶液的pH值随温度的变化差异很大,温度每升高1℃,溶液的pH值大约降低0.03个单位。
2、5M NaCl 配制量 1L配制方法称取292.2gNaCl置于1L 烧杯中,加入约800 ml的去离子水后搅拌溶解加去离子水将溶液定容到1L 后,适量分成小份,高温高压灭菌后,4℃保存。
CTAB配方及植物DNA提取方法主要试剂的配制参考(美)萨姆布鲁克(sambrook,j.)等.分子克隆实验指南(下册)配置如下[94]:(1)0.5mo1/ledta(ph8.0):称取edta-na218.61g,提80ml双蒸水,磁力搅拌器上频繁烘烤。
重新加入7ml10mo1/lnaoh调到ph8.0再用双蒸水定容至100ml,在1.03×105pa之下高压杀菌20min。
(2)5mol/lnacl溶液:称取nacl29.22g,溶解于90ml的双蒸水,加热到80℃溶解,冷却,再用双蒸水定容100ml,在高压灭菌20min。
(3)10mol/lnaoh溶液:称取40.00gnaoh溶80ml的双蒸水,烘烤,定容至100ml。
(4)1mol/ltris-hc1溶液(ph8.0):称取12.114gtris碱,溶80ml的双蒸水,重新加入浓hc14.2ml,调整phsuperficial8.0,搅拌定容至100ml,高压杀菌20min。
(5)10%ctab(m/v):称取ctab10.00g,熔化于80ml的双蒸水,冷却推动熔化,提双蒸水定容至100ml,室温留存。
(6)5mo1/lkac溶液(ph4.8和6.5):分别称取kac晶体49.07g,溶于80ml的双蒸水,再用冰乙酸调至ph4.8和6.5,加双蒸水定容到100ml,在1.03×105pa之下杀菌20min。
4℃留存。
(7)3mo1/lnaac3h2o溶液(ph5.2):称取naac晶体20.412g熔化于约30ml的双蒸水,用冰乙酸调到ph5.2,提双蒸水定容至50ml,高压杀菌20min。
4℃留存。
(8)提取缓冲液(0.4mol/l葡萄糖,3%pvp,2%β-巯基乙醇)250ml:称取葡萄糖19.817g、pvp7.50g,加水溶解并定容到250ml,在1.03×105pa下灭菌20min,β-巯基乙醇现用现加。
CTAB法提取植物总DNACTAB法(Cetyltrimethylammonium bromide法)是一种常用的植物总DNA提取方法,其优点是简单、高效、成本低、适用性广,能够快速提取高质量的DNA。
CTAB法利用季铵盐CTAB(Cetyltrimethylammonium bromide)和NaCl共同提取植物样品中的DNA。
下面就CTAB法的步骤进行详细介绍。
材料:- 植物样品- CTAB提取缓冲液(含0.6 M CTAB和NaCl)- 65℃和37℃的水浴- 70%、95%和100%的乙醇- TE 缓冲液(含10 mM Tris-HCl和1 mM EDTA,pH 8.0)步骤:1. 准备植物样品将新鲜植物样品(约0.1g)用液氮粉碎成粉末,加入2 mL CTAB提取缓冲液中,研磨均匀。
可以使用带球磨器或者手持器具进行研磨。
2. 加入蛋白酶K加入加入50μL蛋白酶K (20mg/L) 溶液后,65℃恒温振荡2~3 h。
蛋白酶K的作用是降解蛋白质,提高DNA的纯度。
3. 加入腰芽菜素和EB加入5μL腰芽菜素(10mg/mL)和5μL EB(1mg/mL)后,65℃水浴12~15min,使溶液呈现棕黄色,使样品中的腰芽菜素结合到DNA上。
4. 加入氯仿和异丙醇加入等体积氯仿和异丙醇后,轻轻摇匀,离心10min。
离心之后,样品分为四层:上层是异丙醇、第二层是氯仿,中间是粘稠的蛋白质、细胞碎片和杂质,最下面是DNA层。
5. 取出DNA层用200μL的容器沿着DNA层边缘吸取DNA,转移到新管中,并加入300μL75%乙醇洗涤,旋转离心5min,弃上清液,重复一次,最后用吹风机将残留的乙醇风干。
6. 测定DNA浓度用TE缓冲液稀释后测定DNA的浓度和纯度,可以用紫外线光度计进行测定。
测定的结果应该控制在1.8-2.0左右。
总之,CTAB法是一种有效、简单的DNA提取方法,与其他方法相比具有简便易行、节省时间和成本的优势。
实验1 转基因植物PCR 检测一、植物DNA 的提取技术(CTAB 法)一、实验目的1.掌握用CTAB 法提取植物总DNA 的方法和基本原理。
2.学习根据不同的植物和实验要求设计和改良植物总DNA 抽提方法。
二、原理CTAB 法[十六烷基三甲基溴化铵(hexadyltrimethyl ammomum bromide ,简称为CTAB)]是一种快速简便的提取植物总DNA 的方法。
通常采用机械研磨的方法破碎植物的组织和细胞,然后加入CTAB ,CTAB 是离子型表面活性剂,能溶解细胞膜和核膜蛋白,使核蛋白解聚,从而使核酸(DNA 、RNA)得以游离出来。
再加入苯酚和氯仿等有机溶剂,能使蛋白质变性,并使抽提液分相,因核酸(DNA 、RNA)水溶性很强,经离心后即可从抽提液中除去细胞碎片和大部分蛋白质。
上清液中加入无水乙醇使DNA 沉淀,沉淀DNA 溶于TE 溶液中,即得植物总DNA 溶液。
三、实验材料大豆幼苗[材料的采集与保存对提取DNA 的产量和质量有很大影响。
通常应尽可能采集新鲜、幼嫩的组织材料,采集过程中应尽可能保持组织材料所含的水分。
通常的做法是取样时立即用浸湿的纱布包裹采集到的组织材料,放置在带有冷藏功能的采集箱中,这样通常使组织材料在3-5d 内仍然保持新鲜。
野外远距离采集样本时,在可能的条件下应冷冻保存(如放置于液氮中);当不具备冷冻条件时,最好用盛有无水CaSO4的瓶子分别保存,使其迅速干燥,这种方法可将材料保存数月,返回后应尽快进行DNA 的提取工作。
那些具有大量次生代谢产物(如单宁、酚类、醌类等)的植物材料,应尽可能采集幼嫩组织。
]四、试剂4.1 CTAB 提取缓冲液:100 mmol/L Tris-HCl (pH8.0),20 mmol/L EDTA-Na 2,1.4mol/L NaCl (如表1),2% CTAB ,使用前加入0.1%(V/V )的β-巯基乙醇。
表1 CTAB 提取缓冲液配制4.2 TE 缓冲液:10mmol/L Tris-HCl, 1mM EDTA ( pH8.0)。
CTAB法抽提植物组织DNA
1、准备工作:
(1)将玻璃瓶,药匙,镊子,研钵,滤纸,枪头,水浴锅准备好;
(2)准备CTAB溶液:
2×CTAB buffer(50mL)
CTAB Powder(2%) 1.0g
1M Tris-HCl(pH8.0,100mM) 5.0mL
0.5M EDTA(20mM) 2.0mL
5M NaCl(1.4M)14.0mL
(3)将水浴锅调到65℃;
(4)事先准备好要用的氯仿,Tris饱和酚(1:1),异丙醇。
无水乙醇放在-20℃冰箱。
2、提取方法
(1)称取0.5 g 新鲜植物叶片,置于研钵中,加入液氮迅速研磨成粉末,用小药匙迅速转移至1.5 mL Eppendorf 管中;
(2)加入700 μL 2×CTAB/巯基乙醇缓冲液,颠倒混匀;
(3)将离心管置于65℃水浴中保温1h,中间不时颠倒混匀;
(4)加入700 μL氯仿:Tris饱和酚(1:1),温和颠倒5min;
(5)室温,12000×g,离心10min;
(6)取上清(约700μL)于一新的Eppendorf管中(切勿扰动界面),加入氯仿:异戊醇(24:1)700μL,轻轻颠倒混匀;
(7)室温,12000×g,离心10min;
(8)取上清500 μL,加入500 μL-20℃预冷的无水乙醇,混匀。
-20℃放置30min;
(9)室温,12000×g,离心10min;
(10)弃上清,用70%乙醇将沉淀小心清洗两遍;
(11)铺一块吸水纸于超净台中,将离心管开口向下置于滤纸上,室温下吹干10min左右;
(12)溶于适量水或TE溶液中(约50 μL)。
ctab法提取dna流程CTAB法是一种常用的DNA提取方法,它能够从植物、真菌、昆虫等样品中高效地提取DNA。
本文将介绍CTAB法提取DNA的主要步骤及注意事项。
1. 样品制备首先,需要准备好待提取的样品。
对于植物样品,应在新鲜或经过冷冻保存的样品中选取新生叶片或芽。
对于昆虫样品,应选取腹部组织或头部组织,并将其切碎。
2. 组织破碎将样品放入研钵中,并加入适量的液氮使其快速冷冻。
然后使用研钵和研杵将样品彻底破碎,直到完全成为粉末状。
3. 细胞裂解将粉末转移到离心管中,并加入适量的CTAB缓冲液和蛋白酶K,混合均匀后放入65℃水浴中静置30分钟左右。
此过程中CTAB缓冲液能够裂解细胞壁并溶解蛋白质,而蛋白酶K则能够降解核酸外侧的核蛋白质。
4. 分离DNA将上述混合液加入等体积的氯仿中,轻轻摇晃后放置静置。
此时,DNA会在上层形成白色的沉淀,而RNA和蛋白质则会在下层。
使用移液管将上层沉淀转移到新的离心管中,并加入70%的乙醇进行洗涤。
最后将DNA沉淀干燥即可。
5. 检测DNA使用紫外分光光度计或琼脂糖凝胶电泳检测提取得到的DNA。
如果需要保存DNA,则应将其溶于TE缓冲液中,并放置于-20℃冰箱中保存。
注意事项:1. 样品制备时应避免污染,使用无菌操作器材。
2. 细胞裂解时应注意温度和时间的控制,避免过度裂解或过短时间裂解。
3. 在分离DNA时应注意不要将底部物质搅拌到上层沉淀中。
4. 检测DNA时应注意样品的稀释和纯化程度,避免误判结果。
总之,CTAB法是一种简单、高效、适用范围广的DNA提取方法。
在实际操作中,应严格控制每个步骤的条件和操作方法,以确保提取得到高质量的DNA。
利用CTAB法提取植物基因组DNA植物基因组DNA提取是分子生物学领域中常用的技术之一。
目的是为了获取高质量的DNA样品,以便进行PCR、测序、基因克隆以及染色体制备等实验。
目前,CTAB法是植物基因组DNA提取中广泛采用的方法之一。
本文将介绍利用CTAB法提取植物基因组DNA的步骤及注意事项。
1. 准备植物组织样品首先需要准备好待提取的植物组织样品,这些样品可以是叶子、花、芽、根等。
样品应该分别收集、标记,冷藏保存并尽快进行提取。
2. 样品研磨取一小段样品,用液氮将其冷冻,然后用研钵和研杵将其研磨成细碎的粉末状。
如果样品过多,则可以用离心管研磨器等仪器进行批量高效研磨。
3. 细胞壁裂解将磨细的植物组织加入CTAB裂解缓冲液中,加热至65℃,开启混合器磁子,同时混合2-3分钟左右,以破坏细胞壁,释放出DNA。
4. 除去蛋白质加入一定量的氯仿,并短暂的混合均匀,待混合物静置后,可以观察到混合液结成两层。
上层为水相,在此基础上加入同体积的异丙醇,沉淀出DNA进行洗涤和离心。
离心后,上清液含有蛋白质,可以废弃,而下沉淀可以进行枸橼酸溶解。
5. 获取DNA加入枸橼酸缓冲液后,可以分别进行洗涤和沉淀。
最后,通过乙醇提取,可以得到纯度较高的基因组DNA样品。
注意事项:1. 必须严格控制植物组织样品的数量,避免混入过多的杂质干扰提取效果。
2. 在DNA分离过程中,所有试剂、试管和磨具等物品都必须干燥无水,以免水分对提取质量产生干扰。
3. CTAB裂解缓冲液中的NaCl浓度和pH值的调节必须准确,其浓度和pH值直接关系到DNA的结晶和浓度。
4. 在进行DNA纯化过程中,必须注意所有材料的稳定性和纯度,同时要充分保护目标DNA,避免DNA被降解。
总之,CTAB法提取植物基因组DNA是一种安全、高效、可靠的方法。
在实际操作中,应充分掌握其原理、步骤和注意事项,以获取高质量的DNA样品,为后续的实验打下良好的基础。
2×CTAB法植物总DNA提取1. 液氮研磨1g左右的植物组织,转移到离心管中。
改用研磨枪在冰上研磨,不加β-巯基乙醇研磨时可加入适量的PVP、β-巯基乙醇。
若CTAB准备2-3天内用完,则可将PVP、β-巯基乙醇直接加入其中。
2. 加入500µl的2*CTAB (60℃或65℃预热) ,颠倒混合均匀后在60℃或65℃水浴30m-1h 小时,其间要上下颠倒混匀数次。
3.取出离心管,加入等体积的24:1(三氯甲烷:异戊醇),上下颠倒充分混合。
若量多,则可以直接侧立于摇床上晃动10分钟。
4.12000转速离心5-10min。
将离心管动作轻缓的取出转子,放置于离心管架上。
a.离心后溶液分三层:上层为水相;中层为碎片和蛋白相;底层为氯仿b.迅速进入下一步,以免各相混合5.用移液枪吸取管中上层水相,动作一定要轻缓,不可搅动其它两层。
a.此步骤要宁舍不贪多,尽量避免吸取到下层液体。
b.若上步骤中中间层较厚,则继续加入等体积24:1,再次抽提一次,直至中间层较薄。
6.在抽提出的水相中加入1/3体积的5M的KAc及等体积的异丙醇(4℃预冷),轻轻晃动混合均匀后在-20℃沉淀。
沉淀至少15分钟至过夜。
6-1 在抽提出的水相中加入1/10体积醋酸钠(pH5.2, 3M),混匀后,加入2倍体积预冷的无水乙醇,-20℃沉淀15min至过夜。
6-3. 在抽提出的水相中加入加入2倍体积预冷的无水乙醇,-20℃沉淀15分钟至过夜。
a.时间越长,DNA的产量越多,污染也越多7. 12000转速离心5-10min,去上清,倒置于吸水纸上数分钟,加入700µl 70%的酒精,上下颠倒数次,洗涤沉淀。
12000转离心5-10m,去上清,倒置于吸水纸上数分钟。
重复一遍。
8. 12000转速离心5-10min,去上清,倒置于吸水纸上数分钟,最后置于超净工作台中吹干。
9. 在离心管中加入30-50µl的灭菌去离子水或者TE溶液,4℃放置数小时,使其充分溶解。