半定量检测与表述
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百泰派克生物科技
蛋白半定量,定量,绝对定量
在蛋白质分析中主要对定性分析和定量分析进行研究,定量分析就是对蛋白样品的含量进行鉴定,可以分为定量、半定量、相对定量和绝对定量。
蛋白定量很容易理解,那什么又是半定量、相对定量和绝对定量呢?今天小编就和大家聊聊这个问题。
蛋白定量就是对某蛋白样品进行精确的定量鉴定,其测定结果较接近真实值,可信度高。
通常利用标记(iTRAQ、TMT、SILAC等)或非标记(Label Free)策略进行
蛋白定量研究。
蛋白半定量不是指对一半的蛋白质进行定量研究,而是指在某些特殊情况下,如难以直接对蛋白质含量进行测定或蛋白含量易发生周期性波动时,只能对蛋白质的含量进行粗略的、大致的鉴定,所得到的结果是近似的测量值,精确度远不如定量分析。
蛋白相对定量,又称为比较定量,是将两种蛋白质在不同状态下的表达量或含量进行相对比较分析,常用于检测不同生理或病理状态下蛋白含量的变化。
蛋白绝对定量是对各类蛋白进行浓度或含量的绝对分析,可以对组织、体液或细胞蛋白质组中的每一种蛋白质进行绝对含量和浓度分析,是一种靶向定量蛋白组学技术,常用于蛋白质或其修饰状态的定量分析。
目前主要利用内标法或基于质谱的非标记方法进行蛋白绝对定量研究。
百泰派克生物科技基于高分辨率质谱仪结合丰富的生物信息学分析经验,提供高效精准的蛋白质定量服务技术包裹,能够实现蛋白质定量、半定量、相对定量、绝对定量、标记定量以及非标记定量等分析,欢迎免费咨询。
半定量又叫半定量PCR半定量是RT-PCR做基因表达分析的一种方法,其操作的方法是在野生型和突变体中用一个看家基因(通常是actin)做参照标准来观察目标基因在各自的表达情况(上调还是下调),所谓半定量的“半”是通俗的说法,即在看电泳图估计参照亮度一致(可看作是表达的细胞数一致)情况下,确定目标基因的表达;这是与更加精确的Q-PCR的相对定量和绝对的量区分。
半定量解释(semi-quantitative interpretation)是介于定性和定量之间的解释。
尽管使用了数学方法对地质目标的空间位置或物性进行了数值计算,也获得了量值,但由于这些方法的使用是有非常严格的前提条件的,而在实际情况下这些条件是不满足的,所以这些定量计算的结果只能从趋势上为解释人员提供参考。
半定量分析定性分析是能区分出是个什么东西。
举个例子来说,你能辨认出这是苹果,但你不能确定是几个苹果。
定量分析是在定性的基础上给出清晰的数量关系。
比如,你确定了这是5个苹果。
而半定量分析是通常实现定量分析非常困难时采取的一种则中办法。
还是举例说明。
这里有一堆苹果,你不知道具体的数量。
但是你能知道的是这一堆苹果能装5麻袋。
这5麻袋的数量估计就是半定量分析。
定量PCR是PCR的一种。
PCR仪目的为了基因扩增。
在基因扩增中最重要的就是升降温过程,最早的PCR就是三个水浴锅,一个机械臂,定时抓出反应槽转换水浴锅。
PCR的结果需要借助其他手段来检测。
后来随着定量技术的发展,将PCR和检测做成一体,就形成了定量PCR仪。
还可以与荧光技术结合,同时在每个扩增过程都能实施监控。
定量PCR(PolymeraseChainReaction)技术有广义概念和狭义概念。
广义概念的定量PCR技术是指以外参或内参为标准,通过对PCR终产物的分析或PCR过程的监测,进行PCR 起始模板量的定量。
广义概念下的定量PCR技术可以分为五种类型:(1)外参法+终产物分析。
所谓“外参法”是指样本与阳性参照在两个反应容器内反应。
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关于mRNA和蛋白的一致性,mRNA是不能代替蛋白水平的分析的,因为还有翻译效率和RNA降解速度的影响,当然还有蛋白的剪切和分解速度等等,但是表达水平一般来说可以大致估计一种基因的翻译产物的,有时。
但二者不能混委一谈。
基因组问题:如上所述,可以不用处理基因组的。
但是如果是单外显子呢?曾经有以为朋友问我,她的样品中总是有基因组的污染,用RNA去p总能P出来。
她先用trizol过两遍,再用qiagen过两遍,还能P出来。
这是很多人碰到的问题,问题的关键是TAQ(除了具有DNA指导的)还有RNA指导的DNA聚合酶功能,所以是可以直接从RNA中P出来的!那就冒险让RNA 高温一下吧,只是DNAase处理时一定小心,买大公司的,保险一些,至少也应该是takara 的,买液体做好的,不要自己配,比起标本来,这时候银子已经退居其次了。
长度:我们认为500之内比较好,不受中间可能出现的各种序列和二级结构的影响。
至于eeflying说的跑的在前会弥散则可以用2%的胶就行了。
我一般是250左右。
目的基因和内参照之间的大小比例可以根据爱好和胶的浓度、分辨率调整的。
如果是250,则相差100bp很好,如果4、500则差个200bp也可以。
内参照:每一次一定要做内参。
不作内参的结果是不可信的,实际上我想大部分半定量RT-PCR 本身就是不可信的,不过我做的是可信的,因为我反复摸,重复做,每次作内参照,跟自己对照,用不同的酶,不同的体系,作出同样的结果(基因表达结果,不是条带什么的)。
不管多少样品,内参不作,等于说比较珠穆朗玛峰和泰山的高度一样,没有海拔,泰山从地面的高度和珠穆朗玛峰从青藏高原的高度没什么差别。
PCR一定要同时作,但是电泳可以不一起跑,没有关系,记住,计算的是相对表达程度,再说一遍我的观点:1、半定量和定量RT-PCR做的都是基因相对表达量,不是绝对表达量,除非你能准确知道来自多少细胞,但是细胞还有死的呢。
半定量又叫半定量PCR半定量是RT-PCR做基因表达分析的一种方法,其操作的方法是在野生型和突变体中用一个看家基因(通常是actin)做参照标准来观察目标基因在各自的表达情况(上调还是下调),所谓半定量的“半”是通俗的说法,即在看电泳图估计参照亮度一致(可看作是表达的细胞数一致)情况下,确定目标基因的表达;这是与更加精确的Q-PCR的相对定量和绝对的量区分。
半定量解释(semi-quantitative interpretation)是介于定性和定量之间的解释。
尽管使用了数学方法对地质目标的空间位置或物性进行了数值计算,也获得了量值,但由于这些方法的使用是有非常严格的前提条件的,而在实际情况下这些条件是不满足的,所以这些定量计算的结果只能从趋势上为解释人员提供参考。
半定量分析定性分析是能区分出是个什么东西。
举个例子来说,你能辨认出这是苹果,但你不能确定是几个苹果。
定量分析是在定性的基础上给出清晰的数量关系。
比如,你确定了这是5个苹果。
而半定量分析是通常实现定量分析非常困难时采取的一种则中办法。
还是举例说明。
这里有一堆苹果,你不知道具体的数量。
但是你能知道的是这一堆苹果能装5麻袋。
这5麻袋的数量估计就是半定量分析。
定量PCR是PCR的一种。
PCR仪目的为了基因扩增。
在基因扩增中最重要的就是升降温过程,最早的PCR就是三个水浴锅,一个机械臂,定时抓出反应槽转换水浴锅。
PCR的结果需要借助其他手段来检测。
后来随着定量技术的发展,将PCR和检测做成一体,就形成了定量PCR仪。
还可以与荧光技术结合,同时在每个扩增过程都能实施监控。
定量PCR(PolymeraseChainReaction)技术有广义概念和狭义概念。
广义概念的定量PCR技术是指以外参或内参为标准,通过对PCR终产物的分析或PCR过程的监测,进行PCR 起始模板量的定量。
广义概念下的定量PCR技术可以分为五种类型:(1)外参法+终产物分析。
所谓“外参法”是指样本与阳性参照在两个反应容器内反应。
半定量PCR的原理及其应用1. 引言半定量PCR(Semi-quantitative PCR)是一种应用广泛的分子生物学技术,用于分析特定基因在样本中的相对表达水平。
本文将介绍半定量PCR的原理和其在生命科学研究中的应用。
2. 原理半定量PCR基于定量PCR技术,但相对于定量PCR,半定量PCR并不精确地确定特定基因的绝对表达水平,而是通过对样本中目标基因和内部参照基因的PCR扩增进行比较,从而得出目标基因的相对表达水平。
半定量PCR的原理过程如下:1.样本提取:从待测样本(如细胞、组织等)中提取总RNA或DNA,并经过反转录反应获得cDNA。
2.反应设计:选择目标基因的引物和内部参照基因的引物。
内部参照基因在不同样本中的表达水平稳定,因此可作为对照。
3.PCR反应:将待测样本的cDNA和引物以及适当的PCR缓冲液、酶等加入PCR反应管中,进行PCR扩增。
4.延伸周期:利用PCR仪按照特定的温度和时间条件进行一系列的扩增周期,使目标基因和内部参照基因进行扩增。
5.凝胶电泳:将PCR产物进行凝胶电泳,确定扩增产物的大小,并通过测定相对带状强度来比较目标基因和内部参照基因的表达水平。
6.数据分析:通过半定量PCR的标准曲线或内标法等方法,计算出目标基因的相对表达水平。
3. 应用半定量PCR的应用广泛,特别在以下方面具有重要作用:3.1 基因表达研究半定量PCR可用于研究不同基因在不同组织或细胞中的相对表达水平,从而了解基因的功能及其调控机制。
通过对目标基因和内部参照基因的半定量PCR分析,可以比较不同样本中目标基因的表达差异。
3.2 药物研发半定量PCR可用于药物研发过程中的药效评估。
通过比较药物处理组和对照组样本中目标基因的表达水平,可以评估药物对基因表达的影响。
3.3 疾病诊断半定量PCR在疾病诊断中具有重要的应用价值。
通过检测目标基因在患者样本中的表达水平,可以辅助诊断某些疾病,如癌症、遗传病等。
基因表达的半定量PCR检测实验目的:以cDNA为模板,利用PCR技术制备目的基因甘油醛-3-磷酸脱氢酶(Glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)的大量拷贝,以便进行目的基因的克隆;此实验还包括PCR引物设计,PCR产物的琼脂糖电泳检测等内容。
实验原理:真核细胞含有三类基本RNA:核糖体RNA(rRNA)、信使RNA(mRNA)、转移RNA(tRNA)。
其中mRNA传递合成蛋白质的全部遗传信息,是蛋白质生物合成的中间环节,具有特殊意义。
Trizol试剂可从细胞中快速提取细胞总RNA,将其中的mRNA逆转录成cDNA,以一对特异性引物对目的cDNA进行聚合酶链式反应扩增。
由于每个循环中合成的引物延伸产物可作为下一循环中的模板,因而每次循环中靶DNA的拷贝数呈几何级数增长,因此,30次PCR循环将产生约1亿倍(230)的扩增片段。
PCR技术又称聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction)技术,是一种在体外(试管)扩增核酸的技术。
该技术模拟体内天然DNA的复制过程。
其基本原理是在模板、引物、4种dNTP和耐热DNA聚合酶(Taq DNA polymerase)存在的条件下,特异扩增位于两段已知序列之间的DNA区段的酶促合成反应。
每一循环包括高温变性、低温退火、中温延伸三步反应。
每一循环的产物作为下一个循环的模板,如此循环30次,介于两个引物之间的新生DNA片段理论上达到230拷贝(约为109个分子)。
PCR技术的特异性取决于引物与模板结合的特异性(图3-1)。
PCR反应的基本步骤包括高温变性(denaturation);低温退火(annealing);中温延伸(extension)三步反应(图3-2)。
①变性(denaturation)(95℃);②退火(annealing);③延伸(elogation)(72℃)图3-1 PCR扩增DNA原理示意图图3-2PCR实验中各种组分的剂量:(1)dNTP常用浓度为20~200μM,不能低于10~15μM。
化学计量实验教案:半定量分析的方法和应用半定量分析的方法和应用化学计量实验是化学教育中的重要实验之一,是化学学科中非常重要的一个分支。
化学计量实验是以化学计量基本原理为基础,通过实验技术和方法来进行定量或半定量分析的一种实验方法。
化学计量实验的应用非常广泛,可以用于环境监测、食品检验、药品制造等领域。
本文将重点介绍化学计量实验中的半定量分析方法和应用。
一、半定量分析的方法半定量分析是一种只能得到样品中化学物质约定量的方法。
下面列举几种半定量分析常用的方法:1、滴定法滴定法是一种利用滴定液与被测液体反应生成定量产物的方法。
该方法可以用于计算定量的物质,但是无法得到准确的结果。
因此,它通常是被用于半定量分析。
滴定法的基本原理是利用滴定液中的一种化学物质来与被测液体中的目标化学物质反应,生成定量产物,如常用的KMnO4滴定法、HClO4滴定法等。
2、分光光度法分光光度法是一种可以利用吸收特定波长的光来测定化学物质浓度的方法。
它基于分子吸收光的本质,可用于半定量或使用校准曲线来进行定量分析。
该方法又称分光光度测定法,常用于分析痕量元素。
3、比色法比色法是利用化学物质与某种显色剂反应,使溶液颜色发生变化进行半定量分析的一种方法。
该方法与分光光度法的原理类似,但是常常受到样品矩阵干扰的影响。
二、半定量分析的应用1、环境监测半定量分析在环境监测中应用广泛,可以用于测定水、大气、土壤等中的污染物含量。
如利用滴定法测定水中硬度离子的含量、利用光度法测定大气中氧化物浓度的方法等。
2、食品检验食品安全问题一直是人们所关注的话题,半定量分析方法在食品检测中有着非常重要的应用。
如利用比色法检测食品中的添加剂、利用滴定法测定食品中盐分含量、利用分光光度法测定食品中的微量元素等。
3、药品制造半定量分析方法在药品制造中也应用广泛。
如利用分光光度法检测药品中的杂质、利用滴定法测定药品中有效成分的含量、利用比色法测定药品中添加剂的含量等。