细菌种属

细菌种属分类细菌是一类单细胞微生物，它们广泛存在于自然界中，包括土壤、水体、空气、动植物体内等各种环境中。

细菌种属分类是对细菌进行分类的一种方法，它是根据细菌的形态、生理特征、生态习性等方面的差异来进行分类的。

本文将介绍几种常见的细菌种属分类。

1. 革兰氏阳性菌革兰氏阳性菌是一类细菌，它们的细胞壁含有大量的肽聚糖和穿过细胞壁的脂肪酸，这使得它们在革兰染色中呈现出紫色。

革兰氏阳性菌包括许多病原菌，如金黄色葡萄球菌、链球菌、炭疽杆菌等。

此外，革兰氏阳性菌还包括一些产生抗生素的菌株，如放线菌属、链霉菌属等。

2. 革兰氏阴性菌革兰氏阴性菌是一类细菌，它们的细胞壁相对较薄，不含有大量的肽聚糖和脂肪酸，这使得它们在革兰染色中呈现出红色。

革兰氏阴性菌包括许多病原菌，如大肠杆菌、沙门氏菌、克雷伯菌等。

此外，革兰氏阴性菌还包括一些产生抗生素的菌株，如铜绿假单胞菌属、鲍曼不动杆菌属等。

3. 厌氧菌厌氧菌是一类不能在氧气存在下生长的细菌，它们需要在缺氧或微氧的环境中生长。

厌氧菌包括许多产生有机酸、酒精、气体等化合物的菌株，如乳酸菌属、酵母菌属、甲烷菌属等。

此外，厌氧菌还包括一些产生毒素的菌株，如肉毒杆菌属、产气荚膜梭菌属等。

4. 嗜热菌嗜热菌是一类能够在高温环境下生长的细菌，它们的生长温度通常在50℃以上。

嗜热菌包括许多生活在地热泉、海底热液等高温环境中的菌株，如嗜热菌属、嗜热蓝菌属等。

此外，嗜热菌还包括一些产生酶类的菌株，如热稳定性蛋白酶的产生菌株。

5. 光合细菌光合细菌是一类能够进行光合作用的细菌，它们能够利用光能将二氧化碳转化为有机物质。

光合细菌包括许多生活在水体中的菌株，如蓝藻属、紫细菌属等。

此外，光合细菌还包括一些生活在土壤中的菌株，如光合细菌属等。

细菌种属分类是对细菌进行分类的一种方法，它能够帮助我们更好地了解细菌的形态、生理特征、生态习性等方面的差异。

通过对细菌种属分类的研究，我们能够更好地认识细菌的生态、生物学特性，为细菌的应用和控制提供科学依据。

2009—2012年发现的人口腔细菌新种属简介细菌是人口腔微生物的优势种群，不断有新的种属被发现和命名。

本文介绍2009—2012年从人口腔分离的5个新菌属和16个新菌种的主要生物学特性。

标签：新菌属；新菌种；人口腔细菌是人口腔内微生物的优势种群，与口腔健康和疾病密切相关。

随着医学理论和技术的发展和完善，人口腔内不断有新的细菌种属被发现和命名，其在微生物系统内的分类位置也会发生变动。

了解这些新的种属有助于全面了解口腔微生物的分类现状，对口腔基础和临床研究也具有重要意义。

新的细菌种属被发现后，在《国际微生物分类进化学杂志》（International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology）上发表后才能被业界认可，本文即介绍2009—2012年发表在该期刊上，从人口腔分离的5个新菌属和16个新菌种的主要生物学特性。

1 新菌属1.1 锥形杆菌属（Pyramidobacter）（Downes，et al.2009）[1]命名：因在培养基上形成锥形样菌落而得名。

特性：革兰阴性杆菌，专性厌氧、无芽胞、无动力；蛋白胨-酵母提取物-葡萄糖（peptone yeast ex-tract glucose，PYG）肉汤培养物的主要终末代谢产物是乙酸、少量的异戊酸和痕迹量到少量的丙酸、异丁酸、琥珀酸、苯乙酸。

模式种：鱼腥味锥形杆菌（Pyramidobacter pisco-lens），DNA的G+C摩尔分数为59%，分离自人的口腔。

1.2 拟普雷沃菌属（Alloprevotella）（Downes，et al.2012）[2]命名：因与普雷沃菌有相似性而被命名为拟普雷沃菌属。

特性：革兰阴性杆菌，专性厌氧、无芽胞、无动力；发酵碳水化合物的终末代谢产物是乙酸和琥珀酸。

模式种：坦纳拟普雷沃菌（Alloprevotella tanne-rae），DNA的G+C摩尔分数为45%～47%，分离自人的口腔。

简述细菌种属的分类鉴定流程下载温馨提示:该文档是我店铺精心编制而成，希望大家下载以后，能够帮助大家解决实际的问题。

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进行细菌种属分类鉴定首先要进行样本采集。

16SrDNA鉴定菌株的标准操作规程1.适用范围本标准规定了通过特定引物对细菌的16SrDNA片段进行PCR扩增，然后对扩增片段进行序列分析比对，快速获得细菌种属信息的操作规程.本标准适用于未知细菌的快速种属分析,以及为细菌的生化鉴定提供指导信息。

2.方法和原理16SrDNA鉴定是指用利用细菌16SrDNA序列测序的方法对细菌进行种属鉴定。

包括细菌基因组DNA提取、16SrDNA特异引物PCR扩增、扩增产物纯化、DNA测序、序列比对等步骤。

是一种快速获得细菌种属信息的方法。

细菌rRNA（核糖体RNA)按沉降系数分为3种，分别为5S、16S和23S rRNA。

16S rDNA是细菌染色体上编码16S rRNA相对应的DNA序列。

16S rDNA由于大小适中，约1.5Kb左右,既能体现不同菌属之间的差异，又能利用测序技术较容易地得到其序列，故被细菌学家和分类学家接受。

在16S rRNA分子中,可变区序列因细菌不同而异,恒定区序列基本保守，所以可利用恒定区序列设计引物，将16S rDNA片段扩增出来，利用可变区序列的差异来对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定。

16SrDNA序列的前500bp序列变化较大，包含有丰富的细菌种属的特异性信息,所以对于绝大多数菌株来说，只需要第一对引物测前500bp序列即可鉴别出细菌的菌属。

针对科学论文发表或是前500bp无法鉴别的情况，需要进行16SrDNA的全序列扩增和测序,得到较为全面的16SrDNA的序列信息。

由于测序仪一次反应最多只能测出700bp的有效序列，为了结果的可靠性,通常将16SrDNA全长序列分成3部分进行测序。

3.设备和材料1.1器材移液器(1000μL、200μL 、100μL、10μL）；涡旋振荡器；Eppendorf MixMate；离心机；水浴锅；电泳仪；制冰机；低温冰箱；PCR仪：Veriti 96 Well Thermal Cycler；凝胶成像仪：VersaDoc MP 4000;基因分析仪:AB3500、AB31301.2试剂DNA快速提取试剂：PrepMan Ultra；琼脂糖；PCR试剂：Taq酶,10×Taq Buffer （Mg2+），dNTPs，ddH2O等；ExoSAP-IT；测序试剂：BigDye Terminator,5×Sequencing Buffer；BigDye XTerminator Purification Kit；1.3耗材移液器吸头：1000μL、200μL、10μL；离心管:1.5mL、200μL;Micro Amp TM Optical 96—Well Reaction Plate;Micro Amp TM Optical Adhesive Film；1.4引物16SrDNA 名称序列扩增长度第1部分正向引物27F 5’—AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG—3'500 bp左右反向引物519R 5’- GWA TTA CCG CGG CKG CTG —3’第2部分正向引物357F 5'—CTC CTA CGG GAG GCA GCA G—3’750bp左右反向引物1115R 5'-AGG GTT GCG CTC GTT GC—3’第3部分正向引物926F5'- AAA CTY AAA KGA ATT GAC GG —3’560 bp 左右反向引物1492R5'—TAC GGC TAC CTT GTT ACG ACT T —3’其中M=C:A ， Y=C ：T 。

生活中有哪些常见的致病菌一、人体中的常见的致病菌：1、葡萄球菌：属革兰氏阳性球菌。

是人体皮肤上寄居最多的致病菌，也见于鼻咽等处。

金黄色葡萄球菌致病力最强，主要产生溶血素、杀白细胞素和血浆凝固酶等，造成许多种感染，如疖、痈、脓肿和伤口感染等。

金黄色葡萄球菌感染的特点是局限性组织坏死，脓液稠厚、黄色、不臭。

也能引起全身性感染。

2、链球菌：属革兰氏染色阳性球菌。

存在于口、鼻、咽和肠腔内。

链球菌的种类很多，溶血性链球菌、绿色链球菌和粪链球菌是常见的致病菌。

溶血性链球菌能产生溶血素和透明质酸酶、链激酶等，溶解破坏细胞间质中的透明质酸、纤维蛋白和其他蛋白质，使炎症易扩散而缺乏局限化的倾向。

脓液特点是比较稀薄，淡红色，量较多。

典型的感染是急性蜂窝织炎、淋巴管炎等。

绿色链球菌是一些胆道感染和亚急性心内膜炎的致病菌。

粪链球菌属厌氧菌，常和大肠杆菌一同引起混合感染。

3、大肠杆菌：革兰氏染色阴性。

寄居于肠道内。

对维生素K的合成有重要作用。

它的单独致病力不大，若和其他致病菌在一起时，可造成严重的混合感染，如大面积烧伤感染、阑尾脓肿、急性胆囊炎等，产生的脓液稠厚，有粪臭。

4、绿脓杆菌：革兰氏染色阴性。

常寄居于肠道和皮肤上，它对大多数抗菌药物不敏感，故成为继发感染中的重要致病菌，特别是大面积烧伤感染时，可引起难以控制的绿脓杆菌败血症。

绿脓杆菌感染的伤口常不易愈合，其脓液呈淡绿色，有腥臭味。

5、变形杆菌：革兰氏染色阴性。

存在于肠道和前尿道，为尿路感染、急性腹膜炎和大面积烧伤感染的致病菌之一。

变形杆菌对大多数抗菌药物有耐药性。

脓液具有特殊的恶臭。

6、无芽胞厌氧菌：革兰氏染色阴性的专性厌氧菌。

在一般外科感染中，此类细菌为重要的病原体之一。

具有临床意义的有脆弱类杆菌、核梭形菌、消化球菌和消化链球菌等多种。

这些无芽胞厌氧菌寄生在人体内的腔道，特别是胃肠道（结肠内的数量最多）、口腔、阴道等处。

它们与需氧菌共同构成机体的正常菌群。

正常情况下保持菌群相对平衡，对人体无害。

细菌种属分类细菌（Bacteria）是生物的主要类群之一，属于细菌域。

细菌是所有生物中数量最多的一类依据分类标准不同，细菌的分类有所差异。

1、根据形状分为三类，即：球菌（包括单球菌、双球菌、链球菌、葡萄球菌等）、杆菌（比如肠杆菌）和螺旋菌（包括弧菌、螺菌、螺杆菌）。

2、按细菌的生活方式来分类，分为两大类：自养菌和异养菌，其中异养菌包括腐生菌和寄生菌。

3、按细菌对氧气的需求来分类，可分为需氧（完全需氧和微需氧）和厌氧（不完全厌氧、有氧耐受和完全厌氧）细菌。

4、按细菌生存温度分类，可分为喜冷、常温和喜高温三类。

5、根据细菌阴阳分类：革兰氏阳性菌和革兰氏阴性菌。

例如：化脓性球菌都属于革兰氏氏阳性菌，它们能产生外毒素使人致病，而肠道菌多属于革兰氏阴性菌，它们产生内毒素，靠内毒素使人致病。

常见的革兰氏阳性菌有：葡萄球菌、链球菌、肺炎双球菌、炭疽杆菌、白喉杆菌、破伤风杆菌等。

补注：①国际上最具权威性的细菌分类系统专著有“伯杰氏系统细菌学手册”和“伯杰鉴定细菌学手册”。

②细菌的分类层次与其他生物一样，也是界、门、纲、目、科、属、种，但细菌常用的是“属和种”，种是细菌分类的基本单位。

③细菌的结构分为基本结构和特殊结构。

基本结构是各种细菌都具有的结构，包括细菌的细胞壁、细胞膜、细胞质、核质。

某些细菌特有的结构称为特殊结构，包括细菌的荚膜、鞭毛、菌毛、芽胞。

④细菌主要以无性二分裂方式繁殖(裂殖)，即细菌生长到一定时期，在细胞中间逐渐形成横隔，由一个母细胞分裂为两个大小相等的子细胞。

⑤微生物划分为以下8大类——细菌、病毒、真菌、放线菌、立克次氏体、支原体、衣原体、螺旋体。

中国农业植物病原菌物常见种属名录本文旨在介绍中国农业植物病原菌物中的一些常见种属，包括其名称、研究意义和分布情况。

这些病原菌物对农业植物的生长发育产生重要影响，对农业生产构成潜在威胁。

通过了解这些常见病原菌物的特征和分布情况，有助于采取有效的防治措施，提高农业生产的稳定性。

名称：稻瘟病菌属，包括多种水稻瘟病菌种，如稻瘟病菌（Piricularia oryzae）等。

研究意义：稻瘟病是水稻生产中的重要病害之一，对水稻产量和质量造成严重影响。

研究稻瘟病菌属及其相关病害的防治措施，对保障水稻安全生产具有重要意义。

分布情况：稻瘟病菌属在中国分布广泛，尤其在长江流域和华南地区发生较为严重。

名称：轮纹病菌属，包括多种植物病原菌种，如梨轮纹病菌（Macrophomina phaseolina）等。

研究意义：轮纹病是果树生产中的一种重要病害，可导致果实品质下降和产量损失。

研究轮纹病菌属及其病害的防治措施，对保障果树安全生产具有重要意义。

分布情况：轮纹病菌属在中国果树产区有广泛分布，其中部分地区发生较为严重。

名称：枯萎病菌属，包括多种植物病原菌种，如香蕉枯萎病菌4号小种（Fusarium oxysporum f.sp. cubense）等。

研究意义：枯萎病是农作物生产中的一种毁灭性病害，可导致植物生长衰弱甚至死亡。

研究枯萎病菌属及其病害的防治措施，对保障农作物安全生产具有重要意义。

分布情况：枯萎病菌属在中国农作物产区有广泛分布，其中部分地区发生较为严重。

名称：疫病菌属，包括多种植物病原菌种，如大豆疫病菌（Phytophthora sojae）等。

研究意义：疫病是农作物生产中的一种常见病害，可导致植物叶片黄化、植株死亡等。

研究疫病菌属及其病害的防治措施，对保障农作物安全生产具有重要意义。

分布情况：疫病菌属在中国农作物产区有广泛分布，其中部分地区发生较为严重。

炭疽病菌属（Colletotrichum）名称：炭疽病菌属，包括多种植物病原菌种，如香蕉炭疽病菌（Colletotrichum musae）等。

用16S rDNA方法鉴定细菌种属一、目的1. 掌握16S rDNA对细菌进行分类的原理及方法；2. 掌握DNA提取、PCR原理及方法、DNA片段回收等实验操作。

二、原理随着分子生物学的迅速发展，细菌的分类鉴定从传统的表型、生理生化分类进入到各种基因型分类水平，如(G+C)mol%、DNA杂交、rDNA指纹图、质粒图谱和16S rDNA序列分析等。

细菌中包括有三种核糖体RNA，分别为5S rRNA、16S rRNA、23S rRNA，rRNA基因由保守区和可变区组成。

16S rRNA对应于基因组DNA上的一段基因序列称为16S rDNA。

5S rRNA虽易分析，但核苷酸太少，没有足够的遗传信息用于分类研究；23S rRNA含有的核苷酸数几乎是16S rRNA的两倍，分析较困难。

而16S rRNA相对分子量适中，又具有保守性和存在的普遍性等特点，序列变化与进化距离相适应，序列分析的重现性极高，因此，现在一般普遍采用16S rRNA作为序列分析对象对微生物进行测序分析。

利用16S rDNA鉴定细菌的技术路线：三、操作步骤（一）细菌基因组DNA提取1. 挑单菌落接种到10 mL LB培养基中37℃振荡过夜培养。

2. 取2 mL培养液到2 mLEppendorf管中，8000 rpm离心2分钟后倒掉上清液。

3. 加140 μL TE打散细菌，再加入60 μL 10 mg/ml的溶菌酶。

37℃放置10分钟。

4. 加入400 μL Digestion Buffer，混匀。

再加入3 μL Protein K，混匀，55℃温育5分钟。

5. 加入260 μL乙醇，混匀，全部转入UNIQ-10柱中。

10000 rpm离心1分钟，倒去收集管内的液体。

6. 加入500 μL 70％乙醇（Wash Solution），10000 rpm离心0.5分钟。

7. 重复第六步。

8. 再10000 rpm离心2分钟彻底甩干乙醇。

吸附柱转移到一个新的1.5 mL的离心管。