犬细小病毒VP2基因的比较及分型研究
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犬细小病毒的分离鉴定及其VP2基因序列分析林鹏;赵航;王建科;程悦宁;任静强;易立;仝明薇;程世鹏【期刊名称】《中国畜牧兽医》【年(卷),期】2015(042)010【摘要】本试验从北京某动物医院疑似犬细小病毒(CPV)感染犬粪便中分离出一株病毒.通过电子显微镜观察、血凝试验、动物回归试验和分子生物学鉴定,本试验成功分离出一株CPV,命名为BJ-24.对BJ-24株的VP2基因序列分析发现该分离株为CPV-2a亚型,其VP2基因与GenBank中19株CPV VP2基因核苷酸序列有较高的同源性,均在98.7%以上,甚至与CPV-JS2株达到100.0%.系统进化分析结果表明所分离的BJ-24株属于中国分支,与CPV-JS2株遗传距离最近.本试验对进一步开展北京地区CPV的流行病学调查提供基础依据,并对防制病毒传播和疫苗研制奠定了坚实的基础.【总页数】7页(P2587-2593)【作者】林鹏;赵航;王建科;程悦宁;任静强;易立;仝明薇;程世鹏【作者单位】中国农业科学院特产研究所,吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室,长春130112;中国农业科学院特产研究所,吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室,长春130112;中国农业科学院特产研究所,吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室,长春130112;中国农业科学院特产研究所,吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室,长春130112;中国农业科学院特产研究所,吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室,长春130112;中国农业科学院特产研究所,吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室,长春130112;中国农业科学院特产研究所,吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室,长春130112;中国农业科学院特产研究所,吉林省特种经济动物分子生物学重点实验室,长春130112【正文语种】中文【中图分类】Q78【相关文献】1.犬细小病毒YBYJ株的分离鉴定及VP2基因的序列分析 [J], 张立媛;高旭;陈海迪;于清洋;方爽2.犬细小病毒JN株的分离鉴定及VP2基因序列分析 [J], 姜燕霞;张淑玲;王金良;申识川3.犬细小病毒昆明流行株的分离鉴定与VP2基因序列分析 [J], 赵屹钦;曾梦颖;郭娟;张迪;高洪;严玉霖4.犬细小病毒VP2基因序列分析及BJ-1株的分离鉴定 [J], 周宏专;苏霞;林路路;齐颀;张进;徐福洲;杨兵5.三株犬细小病毒的分离鉴定及VP2基因序列分析 [J], 陈延宗;钱晶;王晶宇;赵航;毕振威;夏兴霞;诸玉梅;芮荣;王永山因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
昆明犬细小病毒的PCR检测及VP2基因的进化分析苑述友;邱薇;张富强;郑颖;李刚山;刘华;尹革芬;李作生;范泉水【期刊名称】《西南国防医药》【年(卷),期】2010(020)006【摘要】目的自昆明某犬场病死犬心脏扩增犬细小病毒VP2基因并进行测序比对分析,了解其变异和进化情况.方法从病死犬心脏提取病毒DNA进行PCR扩增,PCR阳性产物克隆至pMD18-T载体测序,并与已知参考毒株序列进行比对及系统发育分析.结果 p1p2引物测序与国内外毒株核苷酸同源性在98.0%~100.0%之间,其中与KU739_09最高为100.0%;p3p4引物测序与国内外毒株核苷酸同源性在98.3%~99.6%之间,其中核苷酸同源性与KU739_09、02B9、08 - 5-WH和bj-3最高均为99.6%.系统发育分析表明本次犬细小病毒分离株在CPV-2a亚型的进化分支上.结论从昆明病死幼犬心脏中检测出犬细小病毒,此细小病毒为CPV-2a 亚型,并且和KU739_09、02B9、08-5-WH和bj-3遗传关系比较密切.【总页数】4页(P599-602)【作者】苑述友;邱薇;张富强;郑颖;李刚山;刘华;尹革芬;李作生;范泉水【作者单位】650223,昆明,云南农业大学动物科学技术学院成都军区疾病预防控制中心军事医学研究所;成都军区疾病预防控制中心军事医学研究所;成都军区疾病预防控制中心军事医学研究所;成都军区疾病预防控制中心军事医学研究所;成都军区疾病预防控制中心军事医学研究所;650223,昆明,云南农业大学动物科学技术学院;650223,昆明,云南农业大学动物科学技术学院;成都军区疾病预防控制中心军事医学研究所;成都军区疾病预防控制中心军事医学研究所【正文语种】中文【中图分类】R446.9【相关文献】1.大理地区犬细小病毒VP2基因变异研究及进化分析 [J], 李志敏;丁福先;何秉宁;袁鸿胜;施瑞华2.犬细小病毒CPV-BJ03/17株分离鉴定及VP2基因遗传进化分析 [J], 王洋;胡博;鲁荣光;吕爽;赵辉;廉士珍;闫喜军3.贵阳地区犬细小病毒VP2基因的克隆及遗传进化分析 [J], 陈强;嵇辛勤;段志强;阮涌;雷云;龙丹丹;胡焱;万彪4.南宁地区犬细小病毒VP2基因的克隆及遗传进化分析 [J], 徐闰;黄华旭;徐小明;李政泰;马麟;劳小香;吴显实5.犬细小病毒临床分离株VP2基因进化分析 [J], 温峰琴;项海涛;郝宝成;邢小勇;包世俊;胡永浩因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
分类号:单位代码:10019 密级:学号:S0*******硕士学位论文北京地区犬细小病毒VP2基因序列分析和流行病学调查Sequence analysis of VP2 gene and epidemiological survey ofcanine parvovirus in Beijing研究生:宋永奇指导教师:吕艳丽副教授合作指导教师:申请学位门类级别:农学硕士专业名称:预防兽医学研究方向:兽医微生物学与免疫学所在学院:动物医学院2008年 5 月独 创 性 声 明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。
尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得中国农业大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。
与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。
研究生签名:时间:年月日关于论文使用授权的说明本人完全了解中国农业大学有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权保留送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。
同意中国农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。
(保密的学位论文在解密后应遵守此协议)研究生签名:时间:年月日导师签名:时间:年月摘 要犬细小病毒(Canine parvovirus,CPV)感染是目前危害养犬业的最严重传染病之一。
为了了解CPV的变异情况,本研究在2006-2007年间不同时间采集CPV感染患犬粪便样本20份,经PCR方法从中扩增出了CPV VP2基因,并对该基因进行了序列测定与分析;为了了解本病的流行状况,本研究对临床上常用的CPV检测方法的可靠性进行了评估,并在此基础上对2005-2007年到中国农业大学动物医院诊治的所有有呕吐、腹泻和呕吐或腹泻症状的犬粪便样本的CPV检测结果进行了统计分析,获得如下结果:VP2基因全长1755bp,编码585个氨基酸。
犬细小病毒CPV-2c型亚洲株分离鉴定及VP2基因序列分析李昀真;李双双;丛培强;曹海旭;鲁荣光;廉士珍;张海玲;李虹晔;胡博;白雪
【期刊名称】《特产研究》
【年(卷),期】2024(46)2
【摘要】为探明北京某犬场犬的死亡原因,从患有肠道出血的犬肛拭子中分离出1株犬细小病毒,试验通过PCR、血凝和间接免疫荧光试验方法对毒株进行鉴定,并对VP2基因进行克隆测序和序列分析,确定其遗传分支。
结果表明,该分离株属于犬细小病毒CPV-2c型,命名为CPV-BJ21株。
应用犬细小病毒单克隆抗体进行间接免疫荧光检测,结果为阳性;基因序列分析表明,分离株与犬细小病毒为同一进化分支,VP2基因核苷酸序列与中国四川的CPV-2c(MH476581.1)同源性达99%,与亚洲分离的犬细小病毒之间亲缘关系较近。
VP2氨基酸序列在第A5G、S297A、D426E位出现了氨基酸突变;在F81细胞上传3代后,病毒液的血凝效价稳定于210。
本研究可为犬细小病毒的流行情况及新疫苗的研究提供参考依据。
【总页数】6页(P1-6)
【作者】李昀真;李双双;丛培强;曹海旭;鲁荣光;廉士珍;张海玲;李虹晔;胡博;白雪【作者单位】中国农业科学院特产研究所;山东省威海市文登区畜牧兽医技术服务中心
【正文语种】中文
【中图分类】S852.4
【相关文献】
1.犬细小病毒昆明流行株的分离鉴定与VP2基因序列分析
2.犬细小病毒VP2基因序列分析及BJ-1株的分离鉴定
3.三株犬细小病毒的分离鉴定及VP2基因序列分析
4.犬细小病毒荆州株的分离鉴定及VP2基因序列分析
5.犬细小病毒新乡株的分离鉴定及其VP2基因的序列分析
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犬科和猫科动物细小病毒分离株VP2基因的遗传进化分析研究的开题报告一、研究背景与意义犬科和猫科动物是人类近距离生活的宠物动物,对人类健康具有危害,比如犬瘟热、狂犬病等等。
而细小病毒是引起宠物疾病的重要病原体,犬和猫感染细小病毒后会引起消化道和呼吸道病症,严重时可导致犬、猫死亡。
因此,了解犬科和猫科动物细小病毒的遗传进化,对于防治犬、猫感染疾病具有重要意义。
二、研究目的本研究的目的是通过犬科和猫科动物细小病毒分离株VP2基因的遗传进化分析,探讨其基因型特征以及可能的起源及传播途径。
三、研究方法通过文献调研和实验室测序,收集、比对和分析犬科和猫科动物细小病毒分离株VP2基因序列数据,并使用生物信息学工具进行DNA序列的物系和进化树分析,得出遗传演化规律和基因型特征。
四、研究内容1. 犬科和猫科动物细小病毒分离株VP2基因的收集和比对;2. DNA序列的物系和进化树分析;3. 遗传演化规律分析;4. 基因型特征分析。
五、研究预期结果1. 收集到多个犬科和猫科动物细小病毒分离株VP2基因序列数据;2. 通过比对和分析数据,得到细小病毒的物系演化树;3. 发现和分析犬科和猫科动物细小病毒的遗传演化规律和基因型特征。
六、研究难点与解决方案1. 分离株VP2基因序列数据的获取和数据比对的准确性问题;解决方案:对数据源的准确性进行评估,对异常数据进行清理,使用比对软件进行多次比对提高数据的准确性。
2. 如何选择合适的生物信息学工具进行数据分析和处理;解决方案:参考已有研究文献,选择相应工具进行分析和处理,并结合实际情况锤炼。
3. 对犬科和猫科动物细小病毒的遗传进化机制理解不够深入;解决方案:广泛查阅相关研究文献和专家意见,研究原理机制,并创新性地提出自己的见解。
七、研究时间表1. 数据收集和比对(2个月);2. 生物信息学分析和处理(3个月);3. 遗传演化规律分析(1个月);4. 基因型特征分析(1个月);5. 论文撰写和提交(2个月)。