qPCR实验步骤

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Q-PCR实验流程
一、总RNA抽提
1)细胞培养皿中细胞样品用1X PBS洗两次后,用1ml枪将PBS吸干净,加入1ml Trizol (invitrogen)溶液,吹打混匀,并吸至1.5ml RNase free EP管中使细胞充分裂解,室温静置5min;
组织样品用液氮充分研磨,加入1ml Trizol (Invitro gen)溶液,混匀,室温放置5min使其充分裂解;(管盖与管壁都需标记样品名称)
2)加入200μl氯仿(5X),剧烈振荡混匀1min,使水相和有机相充分接触,室温静置3-5min;(离心时离心管按顺序排放,离心完毕,离心管的顺序也按顺序排好,与第一步的顺序一致)
3)4℃下,14000g离心5min,可见分为三层,RNA在上层水相,移至另一个新的RNase free EP管;(用20-200ul的枪吸取上清,吸上清时,枪头应沿着液面上层吸取上清,枪头不可碰到、吸到中间层)
4)沉淀RNA:加入等体积(1:1)异丙醇,轻柔地充分混匀(颠倒6-8次)(不应用振荡器混匀),室温静置10min;
5)4℃下,14000g离心15min,收集RNA沉淀(如离心后仍不见EP管底部有沉淀,应将EP管放置在-80度冰箱过夜,继续在4℃下,14000g离心10min,收集RNA 沉淀),去上清;
6)用75%乙醇洗涤两次,12000g离心5min(加入乙醇后只需轻轻颠倒EP管即可,不用振荡器震荡或枪头吸打沉淀),弃去上清液,空甩一次,以完全去除乙醇,开盖晾3~5min,反复2次,挥干,使样品变透明。

7)视沉淀量加入适量DEPC水(至少15ul)溶解沉淀。

,打散,备用。

二、反转录
1) 在RNase free的PCR管中配置下列溶液.
2) 将上述溶液吹打均匀,置70℃保温5min,使RNA变性。

随后4℃,保持5min,以防止RNA复性;
3) 在该PCR管中加入下列试剂
4) 将上述20μl反应溶液混匀,空甩,开始反转录:
25℃保温10min;
42℃保温60min;
70℃保温15min;
4℃,∞。

三、调cDNA浓度
反转结束后,每个样品加入80 ul的超纯水,混匀,用微量分光光度计检测浓度,先用超纯水校准。

20 ul(cDNA)+ 80 ul超纯水→100 ul(cDNA)
然后将各样品的cDNA浓度调至150 ng/ul.
初始浓度 X 100 = 150 X (水 + 100)
加水量 = 初始浓度 X 100/150 – 100.
四、PCR:
离心甩匀后,放入PCR扩增器中,设置反应体系。

五.电泳
配胶:1.5%
80 ml 1 X TBE + 1.2 g 琼脂
微波3 min,使之澄清,加入8 ul Gelred摇匀(与TBE 1:10000),加入板上,排除气泡,放入梳子,静置。

垂直拔出梳子,倒入TBE使之没过所有孔,上样,注意每行预留Marker位置,加样完成后,120 V 跑胶。