链霉菌及其主要抗生素共22页
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[链霉菌的应用]琼州学院生物科学与技术学院本科生学年论文设计论文题目《链霉菌的应用》作者刘琦指导教师徐小雄专业生物科学班级 07生物科学(2)班完成日期: 2019 年 6 月 10 日琼州学院生物科学与技术学院本科生学年论文开题报告琼州学院生物科学与技术学院本科生学年论文设计综述题目《链霉菌的应用》摘要: 链霉菌属革兰氏阳性放线菌,具有复杂的生活周期和次生代谢途径,并产生大量具有重要价值的天然代谢物。
本文首先概述了链霉菌的基本应用,其次论述了现阶段链霉菌的应用前景。
从基因方面论述了如何利用基因文库信息改造和调控链霉菌次生代谢途径。
为提高具有重要价值的天然代谢物的产量和获得新代谢物创造更有利的条件。
最后对组合生物合成在链霉菌中的应用做一综述。
关键词: 链霉菌,基因文库,组成生物合成,次级代谢产物链霉菌的应用刘琦(琼州学院,生物科学与技术学院07生物科学2班,海南省五指山市,572200)链霉菌是有复杂生活周期的革兰阳性放线菌,该属的许多成员都能产生在医疗农业、食品等领域具有重要意义的天然次级代谢物[1]。
由于链霉菌属因在代谢过程,次代谢物为抗生素,所以链霉菌属常用于生产抗生素。
相较于其他菌种,链霉菌属繁殖较缓慢,但由于代谢过程的抗生素能抑制其他菌种的生长,所以时间一长,链霉菌属就会成为环境中的优势菌种。
目前所知的链霉菌属,有500余种;链霉菌属菌种与同属菌种,大都具有交换RNA 的特性,所以新的链霉菌属菌种持继不断被发现。
微生物制药方面的工作都会或多或少的和链霉菌打点交道。
抗生素药物的一多半是放线菌产生的,产生抗生素的放线菌中有95%以上的是链霉菌。
后基因组时代的功能基因组研究使人类深入了解链霉菌家族,对链霉菌进行更合理高效的遗传操作,为提高具有重要价值的天然代谢物产量和获得新代谢物创造更为有利的条件。
本文就近年来链霉菌在各方面的应用,以及如何通过设计与构建基因文库,并结合基因工程等组合生物合成的手段,操纵天然产物的基因,最终达到优化链霉菌代谢合成途径, 提高天然代谢物产量和获得新代谢物的成果。
β-内酰胺类抗生素β-内酰胺类抗生素〔Beta-lactam antibiotic〕是一种种类很广的抗生素,其中包括青霉素及其衍生物、头孢菌素、单酰胺环类、碳青霉烯和青霉烯类酶抑制剂等。
基本上所有在其分子结构中包括β-内酰胺核的抗生素均属于β内酰胺类抗生素。
它是现有的抗生素中使用最广泛的一类。
临床应用β-内酰胺类抗生素被用来进行预防和治疗受此类抗生素打击的细菌的感染力。
过去β-内酰胺类抗生素只被用来对付革兰氏阳性菌,但是通过发展可以对付各种革兰氏阴性菌的广谱β-内酰胺类抗生素提高了其作用范围。
作用原理β-内酰胺类抗生素是一种杀菌剂,它抑制细菌细胞壁中肽聚糖的形成。
肽聚糖对于细胞壁、尤其革兰氏阳性菌的细胞壁的结构强度。
肽聚糖合成的最后一步是被称为青霉素结合蛋白的转肽酶形成的。
β-内酰胺类抗生素与D-丙氨酰-D-丙氨酸类似,其终结的氨基酸吸附在正在形成的肽聚糖的前兆NAM-NAG肽单元上。
β内酰胺类抗生素与D-丙氨酰-D-丙氨酸结构上的相似使得它们与青霉素结合蛋白结合。
β-内酰胺核不可逆地与青霉素结合蛋白的Ser403单元结合。
这个不可逆的结合使得青霉素结合蛋白无法链接正在形成的肽聚糖层。
此外这个结合可能还激活细胞壁中的自溶酶。
耐药性原理β-内酰胺类抗生素有一个β-内酰胺环之结构。
这些抗生素的效应取决于它们是否能够完整地到达青霉素结合蛋白以及是否能与青霉素结合蛋白结合。
因此细菌有两种抵抗β-内酰胺类抗生素的方法。
第一个抵抗方法是使用酶水解β-内酰胺环。
通过生产β-内酰胺酶等酶,细菌可以解开抗生素中的β-内酰胺环,使得抗生素失效。
这些酶的基因可能本身就在细菌的染色体上,也可能通过质粒交换而获得,例如新德里金属β-内酰胺酶〔NDM-1〕。
其基因表现可能是在接触抗生素后开始的。
细菌生产β-内酰胺酶并不表示使用任何β-内酰胺类抗生素均无效。
有时β-内酰胺类抗生素可以与β内酰胺酶抑制剂同时使用。
不过在对付任何疑心生产β-内酰胺酶的细菌时,在使用β-内酰胺类抗生素前要仔细评估,尤其因为使用β-内酰胺类抗生素可能导致细菌生产β-内酰胺酶。
链霉素(Streptomycin )链霉素是从放线菌属的灰链霉菌 (Streρtomyces griseus)的培养滤液中提取而得。
常用其硫酸盐。
【理化性质】白色或类白色的粉末;无臭或几乎无臭,味微苦;有引湿性。
在水中易溶,在乙醇或氯仿中不溶。
【药动学】内服难以吸收,大部分以原形由粪便排出。
肌肉注射后吸收良好,约0.5~2h 达血药峰浓度;其血药浓度随剂量的加大而增加。
在常规剂量下,一般在血中维持有效浓度 6~12h。
主要分布于细胞外液,存在于体内各个脏器,以肾中浓度最高,肺及肌肉内含量较少,脑组织中几乎不可测出,易渗入胸腔、腹腔中,有炎症渗入更多。
能透过胎盘屏障,胎血浓度约为母畜血浓度的一半,因此孕畜慎用链霉素,应警惕对胎儿的毒性。
本品不易进入脑脊液。
蛋白结合率约 20%~30%。
本品在体内不代谢灭活, 绝大部分以原型经肾小球过滤排出 , 尿中浓度很高 (24h 内排出肌内注射量的50%-60%),可用于治疗泌尿系统感染。
在胆汁、乳汁中也排出少量。
在碱性环境中抗菌作用增强,如在pH8的抗菌作用比在pH5.8时强20-80倍,故可加服碳酸氢钠碱化尿液,增强治疗效果。
在杂食动物及肉食动物用药时尤其重要。
【药理作用】抗菌谱较广,对结核杆菌的作用在氨基糖苷类中最强,对大多数革兰氏阴性杆菌和革兰氏阳性球菌有效。
如:大肠杆菌、沙门氏菌、布氏杆菌、变形杆菌、痢疾杆菌、鼠疫杆菌、产气荚膜杆菌、鼻疽杆菌和巴氏杆菌等有较强的抗菌作用。
对金色葡萄球菌等多数革兰氏阳性球菌效果差,对钩端螺旋体、放线菌、败血支原体也有效。
对梭菌、真菌、立克次氏体、病毒无效。
链球菌、绿脓杆菌和厌氧菌对链霉素固有耐药。
【应用】用于治疗各种敏感菌的急性感染 , 如大肠杆菌所引起的各种腹泻、乳腺炎、子宫炎、败血症、膀胱炎等;巴氏杆菌所引起的牛出血性败血症、犊牛肺炎、猪肺疫、禽霍乱等;鸡传染性鼻炎;马致贺菌引起的脓毒败血症,马棒状杆菌引起的幼驹肺炎等。
链霉菌室实验操作手册(2003年)第一章培养基抗生素生长因子 (3)常用抗生素及其使用浓度 (3)LB(Luria-Bertani)培养基 (3)LA (3)基本培养基(MM) (3)R5(1L)链霉菌原生质体转化时用 (4)YEME(酵母膏-麦芽膏培养基) 1L(液体培养链霉菌) (4)TSBY (1L)(液体培养链霉菌) (4)MS培养基 (5)2CMY培养基(用于井岗的接合转移) (5)YMS培养基(阿维,井岗产孢) (5)YD培养基 (5)生长因子补充物的使用浓度 (6)第二章DNA基本操作 (7)大肠杆菌质粒的抽提 (7)酶连反应 (7)DNA片段凝胶回收 (8)DNA纯化 (9)E.coil总DNA的提取 (9)链霉菌质粒DNA的小量提取(还需改进) (10)去磷酸化处理(详见分子克隆实验指南以及Takara的CIAP使用说明) (10)AT克隆(详见说明书) (10)Southern Blot (11)第三章PCR及相关技术 (13)PCR (13)PCR重组(详见《PCR技术实验指南》p429 重叠延伸技术) (14)PCR定点诱变(DpnI法) (14)第四章基因片段转移技术 (15)大肠杆菌CaCl2法制备感受态细胞及DNA转化 (15)DNA转化 (15)大肠杆菌质粒的快速检测 (15)接合转移(详见英文《手册》249页) (16)链霉菌原生质体的制备 (16)链霉菌原生质体的转化 (17)PCR-Targeting技术中E.coli电转化感受态的制备及电转化 (17)第五章RNA操作技术 (19)链霉菌总RNA的抽提 (19)链霉菌的RT-PCR(promega RT kit) (19)第六章蛋白质基本操作技术 (21)SDS-PAGE,考马斯亮蓝染色 (21)大肠杆菌可溶性蛋白表达及抽提(用于由IPTG诱导的表达体系): (21)链霉菌总蛋白抽提: (22)大肠杆菌目标蛋白的诱导及总蛋白检测(含T7表达系统如BL21菌株中的pET系列表达体系): (22)Western Blot (23)第七章遗传作图相关技术 (25)链霉菌孢子悬液的制备 (25)链霉菌中NF的证明 (25)孢子杂交 (25)在遗传图谱上两个标记基因之间定位新的基因 (25)第八章其他技术 (27)链霉菌菌种保藏 (27)检测链霉菌淀粉酶的活性 (27)第一章培养基抗生素生长因子常用抗生素及其使用浓度抗生素英文名称及缩写抗性基因贮藏液浓度(mg/ml)使用终浓度(μg/ml)链霉菌大肠杆菌M M2CM Y E M E L A或L B氨苄青霉素氯霉素潮霉素卡那霉素壮观霉素链霉素硫链丝菌素红霉素阿泊拉霉素Ampicillin, AmpChloramphenicol, CmlHygromycin, HygKanamycin, KmSpectinomycin, SpcStreptomycin, StrThiostrepton, ThioErythomycin, EryApramycin, Amblacathygaac或aphaadAstrtsrerm Eaac(3)IV10025(无水乙醇配)5025505025(DMSO配)10050R10102?5010510010R-2550502510-50R---50-2.5-5050-1002550505025不敏感2030-50*–表示无记录或不能使用,贮存液除特别说明外均用无菌水配制*此表仅供参考!!!*R表示不敏感*Km 和Am有交叉抗性,所以同时具有这两种抗性基因时应适当提高抗生素的量,并作好对照。