经典染色体微阵列分析技术(CMA)在产前诊断中的应用.pptx
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染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用协作组目前,G 显带染色体核型分析技术仍然是细胞遗传学产前诊断的“金标准”,但该技术具有细胞培养耗时长、分辨率低以及耗费人力的局限性。
包括荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization,FISH) 技术在内的快速产前诊断技术的引入虽然具有快速及特异性高的优点,但还不能做到对染色体组的全局分析。
染色体微阵列分析(chromosomal mlcroarray analysis,CMA) 技术又被称为“分子核型分析”,能够在全基因组水平进行扫描,可检测染色体不平衡的拷贝数变异(copy number variant,CNV),尤其是对于检测染色体组微小缺失、重复等不平衡性重排具有突出优势。
根据芯片设计与检测原理的不同,CMA 技术可分为两大类:基于微阵列的比较基因组杂交(array- based comparative genomic hybridization ,aCGH) 技术和单核苷酸多态性微阵列(single nucleotide polymorphism array,SNP array) 技术。
前者需要将待测样本DNA 与正常对照样本DNA 分别标记、进行竞争性杂交后获得定量的拷贝数检测结果,而后者则只需将待测样本DNA 与一整套正常基因组对照资料进行对比即可获得诊断结果。
通过aCGH 技术能够很好地检出CNV,而SNP array 除了能够检出CNV 外,还能够检测出大多数的单亲二倍体(uniparental disomy,UPD) 和三倍体,并且可以检测到一定水平的嵌合体。
而设计涵盖CNV+SNP 检测探针的芯片,可同时具有CNV 和SNP 芯片的特点。
2010 年,国际细胞基因组芯片标准协作组(lntemational Standards for Cytogenomic Arrays Consortium,ISCA Consortium) 在研究了21698 例具有异常临床表征,包括智力低下、发育迟缓、多种体征畸形以及自闭症的先证者的基础上,发现aCGH 技术对致病性CNV 的检出率为 12.2%,比传统G 显带核型分析技术的检出率提高了10%。
染色体微阵列分析技术在产前诊断中的应用专家共识(主整版)目前,G显带染色体核型分析技术仍然是细胞遗传学产前诊断的 "全标准",但该技术具有细胞培养耗时长、分辨率低以及耗费人力的局限性。
包括荧光原位杂交(fluorescence in situ hybridization , FISH)技术在内的快速产前诊断技术的引入虽然具有快速及特异性高的优点,但还不能做到对染色体组的全局分析。
染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis , CMA)技术又被称为"分子核型分析",能够在全基因组水平进行扫描,可检测染色体不平衡的拷贝数变异(copy number variant , CNV),尤其是对于检测染色体组微小缺失、重复等不平衡性重排具有突出优势。
根据芯片设计与检测原理的不同,CMA技术可分为两大类:基于微阵列的比较基因组杂交(array . based comparative genomic hybridization , aCGH)技术和单核苜酸多态性微阵列⑸ngle nucleotide polymorphism array . SNP array)技术。
前者需要将待测样本DNA 与正常对照样本DNA分别标记、进行竞争性杂交后获得定量的拷贝数检测结果,而后者则只需将待测样本DNA与一整套正常基因组对照资料进行对比即可获得诊断结果。
通过aCGH技术能够很好地检出CNV ,而SNP array除了能够检出CNV外,还能够检测出大多数的单亲二倍体(uniparental disomv , UPD)和三倍体,并且可以检测到一定水平的嵌合体。
而设计涵盖CNV+SNP检测探针的芯片,可同时具有CNV和SNP芯片的特点"。
2010年,国际细胞基因组芯片标准协作组(International Standards for Cytogenomic Arrays Consortium , ISCA Consortium) 在硏究了2 1 698例具有异常临床表征,包括智力低下、发育迟缓、多种体征畸形以及自闭症的先证者的基础上,发现aCGH技术对致病性CNV的检出率为12.2%,比传统G显带核型分析技术的检出率提高了10%。
·综述·《中国产前诊断杂志(电子版)》 2016年第8卷第3期染色体微阵列分析技术在胎儿遗传病诊断中的应用顾莹1 黄欢2 孙丽洲2(1.连云港市妇幼保健院生殖遗传科,江苏连云港 222006;2.江苏省妇幼保健院产科,江苏南京 210036)【摘要】 染色体微阵列分析(chromosomalmicroarrayanalysis,CMA)技术是一种通过对染色体进行全基因组扫描,发现染色体组的数目和结构异常的检测技术。
CMA以其高分辨率、高效率、高自动化操作等优点,不仅能有效检测传统核型分析技术所能检测的染色体数目异常及非平衡性结构异常,还能检测染色体组亚显微结构水平上不平衡重排引起的拷贝数变异(copynumbervariation,CNV),成为现代临床遗传学常规诊断工具,并被引入到产前胎儿遗传疾病检测中。
本文将就产前胎儿遗传病、胎儿遗传病检测的技术回顾、CMA技术的发展及在胎儿遗传病检测中的应用、优势和面临的挑战等做一个详细的综述。
【关键词】 染色体微阵列分析;产前诊断;遗传病;遗传咨询【中图分类号】 R714.53 【文献标识码】 A犱狅犻:10.13470/j.cnki.cjpd.2016.03.011 遗传病指人体遗传物质(包括细胞核DNA和核外线粒体DNA)发生变异或可遗传性修饰而导致的疾病,可由亲代遗传给子代,故称遗传病。
在产前胎儿检测的遗传性疾病中主要包括染色体病、基因病、线粒体病等。
目前已发现的人类染色体异常超过10000种[1],主要包括数目异常,如唐氏综合征21号染色体比正常多一条,女性先天卵巢发育不全缺少一条X染色体;部分染色体大片段结构变异,罗氏易位等;染色体亚显微结构的微缺失或重复,如17q21.31微缺失综合征和22q1l.2微重复综合征。
染色体病对胎儿的危害尤其巨大,除极少数三体和性染色体异常可以存活下来,大多数的染色体数目异常均以流产、死胎而告终,而染色体结构异常则是引起新生儿出生缺陷非常重要的原因,包括智力低下、发育迟缓、多器官畸形等[2],而目前尚无有效的治疗措施,因此需要及早准确检测和积极干预。
染色体微阵列分析在单纯不良孕产史孕妇产前诊断中的应用(全文)我国母婴保健法规定,对曾经分娩过先天性严重缺陷婴儿的孕妇应进行产前诊断[1]。
先天缺陷儿发生的病因复杂,遗传学异常是造成先天缺陷的重要原因。
目前产前遗传学诊断的主要方法是染色体微阵列分析(chromosomal microarray analysis, CMA),其检测范围包括了部分染色体病和基因组病,一些临床指南认为该技术可用于所有需要产前诊断的孕妇[2-3]。
由此产生了一种认知,认为不良孕产史的孕妇均需要进行产前CMA检测。
然而,不良孕产史的遗传学病因复杂多样,包括染色体病、基因组病、单基因病等,而CMA并不能覆盖所有遗传异常。
对于不同病因造成的不良孕产史,再次妊娠时,如胎儿未出现明确的CMA检测指征(如超声结构异常)时,CMA检测是否可成为普适性的检测值得思索。
本研究总结单中心6年间单纯因“不良孕产史”行CMA检测的病例,分析不同先证者遗传学病因时CMA产前诊断的异常检出情况,探讨CMA 在单纯不良孕产史孕妇中应用的注意事项。
一、资料与方法1.研究对象:2014年6月至2020年7月间,共5 563例孕妇在南京大学医学院附属鼓楼医院应用CMA进行产前诊断,本研究回顾性纳入其中单纯因“不良孕产史”[既往生育/妊娠异常患儿/胎儿(遗传学诊断明确或不明确)]进行产前诊断的病例。
纳入标准:既往生育或妊娠出生缺陷患儿,本次妊娠已进行超声检查确定宫内妊娠,且暂未发现胎儿有明确异常。
排除标准:(1)此次妊娠产前筛查实验提示“高风险”;(2)不良孕产史仅是反复早孕期自然流产。
最终纳入孕妇169例(胎儿172例),包括2例双胎妊娠孕妇和1例孕妇2次单胎妊娠。
所采集样本27例为绒毛,145例为羊水。
孕妇年龄为(32.3±4.68)岁(23~53岁)。
2. CMA检测方法:基因组DNA提取、CMA实验及分析、验证流程按本中心常规操作流程[4]进行。