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第二章 基因定位和遗传作图

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基因定位与连锁遗传图

基因定位与连锁遗传图

三点测验法
P 凹陷、非糯性、有色 × 饱满、糯性、无色
shsh++++ ↓ ++wxwxcc
Ｆ1 饱满、非糯性、有色 × 凹陷、糯性、无色
+sh+wx+c ↓ shshwxwxcc
+wxc 2708
｝亲 型
sh++
2538
++ c
626
｝单交换
shwx+ 601
sh+ c
113
｝单交换
+ wx+ 116
b
c 5%C 5%B Nhomakorabea 5%a
C 20%
b
c 20%
三对基因不完全连锁
❖ 确定基因顺序 按照“一变或一不变” 的法则确定之。
首先从Ft中选出亲本基因型，如：上例
变）
+ wx c ++ +
亲型 双交换型 （一不
+ wx c sh wx c
亲型 双交换型 （一变）
该基因sh 就位于中间 ,其基因顺序为：
│
│
│
│←─── 16.4 ────→│← 3.6→ │
│←─────── 20 ─────→ │
用两点测验法进行基因定位步骤 多，比较麻烦；
用两点测验法当基因相距较远时，
其间可能发生两次以上的部分染色体 片断交换，使重组配子出现频率小于 实际交换频率。使测定的交换值不准 确，因此实际工作中常常采用三点测 验法。
3.50%
连锁遗传图
c
Sh
Wx
━┿━━━━┿━━━━━━━━━━━┿━
3.50

遗传作图及基因定位

遗传作图及基因定位

连锁分析的原理
遗传标记与疾病基因连锁
通过分析遗传标记在疾病家系中的传递 情况，判断遗传标记与疾病基因是否连 锁。
VS
遗传距离与重组率
利用遗传标记与疾病基因的相对位置关系 ，计算遗传距离和重组率，进一步定位疾 病基因。
连锁分析的应用
定位到特定的染色体 区域。
生物信息学方法
利用计算机技术对大量基因组数据进 行整合分析，确定基因位置。
03
遗传标记与连锁分析
遗传标记的种类
形态学标记
利用个体的形态差异进行标记，如身高、肤色等。
细胞学标记
利用细胞分裂和染色体变异进行标记，如染色体数目和结构异常。
分子遗传标记
利用DNA序列变异进行标记，如单核苷酸多态性（SNP）。
遗传信息传递
生物体的遗传信息通过DNA分 子传递给后代，基因型的不同
会导致表型的不同。
连锁分析
利用基因型和表型之间的连锁 关系，通过统计分析确定基因 在染色体上的位置。
分子标记技术
利用DNA分子的多态性，通过比较 不同个体间的基因型差异，构建基 因型和表型之间的对应关系。
全基因组测序
通过对全基因组进行测序和分析，确 定基因在染色体上的位置和功能，进
疾病风险预测
基因定位可以帮助预测个体患某种疾病的风险，为预防措施提供指 导。
生物进化研究
01
物种起源与演化
基因定位有助于揭示物种的起源 和演化过程，了解生物多样性的 形成机制。
02
适应性进化研究
03
系统发生学研究
通过基因定位技术，可以研究生 物对环境变化的适应性进化过程。
基因定位有助于构建物种之间的 系统发生关系，为生物分类提供 依据。

基因定位常用的方法ppt课件

基因定位常用的方法ppt课件

4）原位杂交的步骤
制备中期染色体 DNA原位变性 变性 放射性或非放射性标记探针 杂交（在载玻片上） 洗膜 放射性标记：放射自显影 检测 非放射性标记：荧光染料与抗体或蛋白结合 记录杂交信号 结合染色体形态进行基因定位
DMD女性患者的核型
X染色体与常染色体易位时X染色体失活的结果
两个研究小组分别采用两种不同的方法克隆了DMD基因： 一组是通过X常染色体易位，克隆了该基因的一部分。 另一研究组使用有Xp21.1微小缺失的男孩的DNA，利用消减技术，获得了在正常X染色体存在而在这个男孩DNA中缺乏的DNA克隆片段。
遗传做图：是以研究家族的减数分裂，以了解两个基因分离趋势为基础来绘制基因座位间的距离，它表明基因之间连锁关系和相对距离，并以重组率来计算和表示，以厘摩（cM）为单位。 染色体定位：只把基因定位到某条染色体上。 细胞水平上的基因图又称细胞遗传图 区域定位：从细胞遗传学水平，用染色体显带等技术在光学显微镜下观察，将基因定位到染色体的具体区带。
5）荧光原位杂交 （florescence in situ hybridization，FISH）
用特殊荧光素（dig或Biotin）标记探针DNA（Nick translation 标记法），变性成单链后与变性后的染色体或细胞核靶DNA杂交。在荧光显微镜下观察并记录结果。 FISH 优点：可用来作基因或特定DNA片段的染色体区 域定位。 缺点：必须在已知探针的情况下方可进行。
HAT选择系统：
人的突变细胞株：缺乏HGPRT酶 小鼠细胞株：缺乏TK酶 两者融合培养于HAT培养基中 HAT培养基： H为次黄嘌呤，是HGPRT的底物，为DNA合成提供原料（核苷酸旁路合成原料） A可阻断正常的DNA合成（嘌呤及TMP合成受抑制） T在胸苷激酶（TK）的作用下生成胸腺嘧啶核苷酸，为DNA合成提供原料

遗传制作和基因定位上

遗传制作和基因定位上
如果上述3次测验确认3对基因间都是连锁 根据交 换值的大小 确定这三对基因在染色体上的位置。
第4页/共97页
例如:已知玉米子粒有色(C)对无色(c)为显性，饱满(Sh)对 凹陷(sh)为显性，非糯性(Wx)对糯性(wx)为显性。
为了明确这三对基因是否连锁遗传，分别进行了以下三个试验:
第一组试验：
F1
F1 饱满、非糯、有色× 凹陷、粒性、无色 +sh +wx +c ↓ shsh wxwx cc Ft
F1配子及Ft表型见下表：
第13页/共97页
第14页/共97页
先不考虑wx，只考虑C-Sh间的情况，这样就可以计算 出C-Sh间的重组值
F1
CCShSh × ccshsh ↓
CcShsh × ccshsh
三点测交的一般方法
表型
实得数 比例(%) 重组发生位点
a-b a-c c-b
a + + 580 80.9
+ b c 592
a b c 45 5.9
√√
+ + + 40
a b + 89 12.6
√√
+ + c 94
a+ c
3 0.6
√√
+b+
5
合计 1448 100
18.5 6.5 13.2
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基因在染色体上各有其一定的位置 确定基因的位置 主要是确定基因之间的距离和顺序 基因之间的距离是用 交换值来表示的，叫图距，图距单位是厘摩（centimorgan， cM)。
准确地估算出交换值 确定基因在染色体上的相对 位置 把基因标志在染色体上。

2.3遗传作图的方法

2.3遗传作图的方法

2.3遗传作图的方法2.3 遗传作图的方法染色体作图：确定相互连锁的基因在染色体上的相对位置以及它们之间的遗传距离的过程，又称为基因定位(gene mapping)。

连锁图：根据基因在染色体上直线排列的定律，构建的基因位置以及相互交换值的图谱称为连锁图(linkage map)或遗传学图(genetic map)2.3.1 构建遗传图谱的基本原理假设交换是随机发生的，一对并列的染色单体上任何两点发生交换的机会是均等的；两个彼此靠近的基因之间因交换而分离的的几率要比互相远离的2个基因之间发生分离的几率要小。

随机的染色体上两个任意基因座越远，它们越容易被染色体断裂所分离。

因此重组率可以成为测量两个基因之间相对距离的尺度。

计算出不同基因间的重组率，就可以构建出显示基因在染色体上相对位置的图。

真核生物遗传过程中会发生减数分裂，此过程中染色体要进行重组和交换，这种重组和交换的概率会随着染色体上任意两点间相对距离的远近而发生相应的变化。

根据概率大小，就可以推断出同一条染色体上两点间的相对距离和位置关系。

正因为如此，得到的这张图谱也就只能显示标记之间的相对距离。

我们称这一距离(概率)为遗传距离(cM)，由此构建的图谱也称为遗传图谱。

重组率：是指重组型配子占总配子数的百分比，用Rf表示。

Rf ＝(重组型配子数/总配子数) ×100%交换值：重组率通常又称为交换值。

但严格地讲，交换值不能等同于重组率。

因为非等位基因之间可能发生多重交换，但不一定形成重组型配子，导致用重组率代表交换值会造成偏低估计。

基因间距离与交换值、遗传距离、连锁强度遗传图的偏离与造成遗传图偏离的原因重组热点（r e c o m b i n a t i o n h o t s p o t):染色体上某些比其他位点有更高交换频率的位点。

近端粒区和远着丝粒区有较高重组率。

性别之间也表现重组率的差异。

双交换的出现，产生距离减少的假象。

遗传学图的绘制1）测定基因所属连锁群2）确定基因在染色体上的顺序连锁群(linkage map)：位于同一染色体上的所有基因构成一个连锁群。

第二章遗传图绘制

第二章遗传图绘制
细菌（供体）转移到另一个细菌（受体）中。转移长度可达1Mb。
• 转导（transduction)：以噬菌体为媒介，将小片段DNA(长度可
达50kb)从供体菌转移到受体菌。
• 转化(transformation)：供体细胞释放的一段DNA（通常小于
50kb)，经受体细胞摄取后整合到基因组中，可借助抗性培养基筛选
contig:构成一段连续的DNA序列的一组相互重叠的DNA克隆
➢ 全基因组鸟枪法(whole genome shotgun approach)
在获得一定的遗传及物理图谱信息的基础上，绕过BAC克隆逐个排序的过程， 全基因组被打断进行随机测序，根据序列之间的重叠组装成一系列连续的序 列，再根据连续的序列上带有的标记将其锚定在染色体上。 down to up
§2.1 遗传图与物理图 §2.1.1 遗传图
➢ 遗传图是应用遗传学分析方法（杂交实验或者家系分析）将基因或其他 DNA分子标记标定在染色体上构建的连锁图。
➢ 遗传图距单位为厘摩(cM), 每单位厘摩定义为1%交换率。
• 2.1.2 物理图
➢ 物理图是应用分子生物学技术来直接将DNA分子标记、基因或克隆标定在基因 组实际位置。
是统计的性状是DNA标记
SSR分子标记连锁图绘制
SSR分子标记连锁图绘制
➢ 系谱分析作图
• 系谱分析法即对某家庭性状相关成员进行 统 计，分析性状之间的连锁关系，通过重组率 进行相关基因定位。
人 类 系 谱 分 析
➢ 细菌的遗传作图
• 接合（conjuPCR分型，因为它的重复单位较长，可以形成
20kb长的聚集区，而微卫星区较短，通常小于150bp，用
PCR扩增时反应快又精确。
人类基因组约有6.5×105个微卫星标记

真核生物基因定位基本方法和遗传图制作

真核生物基因定位的基本方法和遗传图的制作图距(map distance)即指两个基因在染色体图上距离的数量单位，它是以重组值1%去掉%号表示基因在染色体上的一个距离单位，即某基因间的距离为一个图距单位（map unit, mu）。

后人为了纪念现代遗传学的奠基人摩尔根，将图距单位称为"厘摩"（centimorgan, cM）。

假设两基因a-b间的重组率为17%，即这两个基因相距17个图距单位(17cM) 。

基因定位（gene mapping）是指将基因定位于某一特定的染色体上，以及测定基因在染色体上线性排列的顺序与距离。

基因定位的目的是通过将基因定位到染色体的基因座上后，以帮助我们理解和开发生物性状的遗传性质，特别是通过遗传连锁将一种性状的遗传与另一种性状或标记相联系，或者通过将表型差异与染色体结构的改变联系起来。

这在商业上可用于改良动植物的性状、定位和克隆人类的疾病基因等。

1．两点测交（two-point testcross）：两点测交是指每次只测定两个基因间的遗传距离，这是基因定位的最基本方法。

(我仅重点介绍三点测交)2．三点测交(three-point testcross)：三点测交就是通过一次杂交和一次测交，同时确定三对等位基因（即三个基因位点）的排列顺序和它们之间的遗传距离，是基因定位的常用方法。

用三点测交能测出双交换，因此更能准确地反映出连锁基因间的相对距离。

同样，在做三点测交时需要用这三个基因的杂合子(abc/+++，或ab+/++c，或a++/+bc等)同这三个基因的隐性纯合子(abc/abc)测交。

下面还是以玉米的上述三个基因为例来说明，假如用于三点测交的两个亲本为：+ + + / + + +和c sh wx / c sh wx，则F1代的基因型为：+ + + / c sh wx，然后F1与三隐性纯合体c sh wx / c sh wx测交，获得如下的结果。

从上表可以看出，8种表型的实得籽粒数各不相等，且相差悬殊，说明它们是连锁的。

05 生物竞赛之基因定位与染色体作图


计算ec—cv之间的重组值
ec +
F1
+ sc + cv
计算出ec-cv间的重组值为9.7%。
计算sc—cv之间的重组值
ec +
F1
+ sc + cv
算出sc-cv间的重组值为17.3%。
ec
7.6
sc
ec
9.7
cv
sc-cv间的重组值为17.3%。
这样，就可画出这三个基因在连锁图上的相对位置：
表型
实得数 810
828 62 88 89 103 1980 测交后代 的表型比例反 映F1雌果蝇的
测 交 后 代
ec + +
+ sc cv
ec sc +
+ + cv + sc + ec + cv 合计
配子的比例。
首先计算ec-sc间的重组值：
ec +
F1
+ sc + cv
亲组合为：810 + 828 + 89 + 103 =1830 重组合为：62 + 88 = 150 ec-sc间的重组值为150 /（1830+150）= 7.6%
实得数 2125 2207 273 265 217 223 5 3 5318
比例 81.5% 10.1% 8.3% 0.1%
ec + ec + ec + + ec
表型 ct + + ct + ct + ct
比例 + cv cv + + cv + cv 81.5% 10.1% Nhomakorabea8.3%

第二章 基因定位和遗传作图


四、SSR标记
SSR，简单重复序列 （ Simple sequence repeat）又叫微卫星标记。 应用：多态性分析和新基因的发现、定位与作图。 特点：(1) 数量丰富，覆盖整个基因组；(2) 呈现多基因特点，信息含量高， 表现为共显性遗传；(3) 可采用PCR技术进行检测，且重复性好；(4) 对 DNA数量及纯度要求不高，即使是部分降解的样品也可；(5) 标记带型简单， 条带一致、客观、明确。
6
发生地点
第二节 遗传作图和染色体定位
一、有性杂交重组定位 (三点测交法) 例题
二、细菌基因定位 例题 1. 中断杂交作图 2. 基因重组作图 3. 转化基因定位 4. 转导基因定位 5. 性导基因定位 三、体细胞杂交定位 物种间体细胞杂交→杂种细胞→各种clone →同线法基因定位 四、 缺失定位 1. 单体定位法 2. 染色体缺失定位法图
7
第三节 染色体区域定位
一、染色体步行(chromosome walk) 法 1. 概念 2. 类型：反向PCR、锅柄PCR、不对称PCR、SON PCR 二、荧光原位杂交法 （florescence in situ hybridization，FISH） 1. 概念 优点：可用来作基因或特定DNA片段的染色体区域定位。 缺点：必须在已知探针的情况下方可进行
突变体１ 8 0 7 + 6 0 5 0 4 0 3 0 2 0 1 0 ２ 0 + 0 0 0 0 0 ３ 0 + 0 0 0 0 ４ 0 + 0 0 0 ５ 0 + 0 0 ６ 0 + 0 7 + 0 8 0
18
顺反子的测定
假如上题的8个突变体测试产生了下列结果，结论是什么？

遗传作图


4. 对数量性状作图
QTL定位理论： •早在1923 年, Sax就对菜豆种子的大小(数量性状) 与种 皮色素(离散的单基因性状) 之间的遗传关联进行了研究； •Thoday首次提出利用两个单基因标记对控制数量性状的多 基因进行系统定位的构想, 认为当标记位于要定位的基因 两侧时, 标记和要定位基因之间的共分离基因型易于鉴别, 定位也更准确,因而主张应首先筛选这样的标记； •数量性状基因座(quantitative trait loci ,简称QTL) 定位的理论,即分析标记基因型和数量性状值之间的连锁； QTL定位的群体: 单交组合产生后代F2、F3、F4；回交群体BC；重组自交系 群体（Recombinant inbred lines，RILs）；加倍单倍体 （Double haploid lines，DH） QTL 定位方法：
♪ 性别之间也会表现重组率的差异
♪ 同一染色体发生多起交换的现象
3. 不同模式生物的连锁分析 连锁分析的三大范畴: ♪ 有性杂交实验 ♪ 系谱分析 ♪ DNA转移
3.1 杂交实验的连锁分析
杂交实验的连锁分析的程序: 选择已知基因型的亲本 → 设计杂 交方案 → 获得交配的子代 → 分析其表 型及基因型
本章主要内容： 第一节 遗传作图基本概念 第二节 遗传作图的分子标记 第三节 遗传作图的方法
第一节 遗传作图基本概念
1. 遗传作图定义 采用遗传学分析方法将基因或其他 DNA顺序标定在染色体上构建连锁图。
2. 遗传作图的基本原理 随机的染色体上两个任意基因座越远， 它们越容易被染色体断裂所分离。
3.遗传图距的单位 厘摩（cM）:每单位厘摩为1％交换率。 交换率或交换值或重组频率= 减数分裂的重组产物\减数分裂的总产物
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分子标记的优点
（1）直接以DNA的形式表现，在生物体的各个组织、各发育时期均可检测。 （2）数量极高，遍及整个基因组。 （3）多态性高，等位基因变异随处可见。 （4）表现为“中性”，即不影响目标性状的表达。
分子标记的意义
第四节 分子标记
一、RFLP
限制性片段长度多态性（Restriction Fragment Length Polymorphism）： 1. 优点：RFLP是发展最早（Bosterin等1980）的分子标记技术。 ①无表型 效应；②一般表现为共显性；③具有种族特异性，它对分析一个分离群体中 来源不同的染色体片段具有重要价值；④标记范围遍及全基因组；⑤在不同 的物种之间具有通用性。 2. 缺点：操作复杂、成本高、费时等。
第二章
基因定位和遗传作图
1
概述
细胞做图：利用三点测验法计算交换率或重组率，并以此作为基
因间连锁关系和相对距离绘制连锁图，常以mu为单位
染色体定位：利用同线法、缺失法、单体法、三体法把基因定位
到特定的染色体上。细胞水平上的基因图又称细胞遗传图
区域定位：利用染色体步行、FISH和基因克隆等方法从细胞遗

10
第四节 分子标记
三、AFLP
扩增片段长度多态性（Amplified fragment length plymorphism） 优点：（ Zabeau和Vos，1992），(1) 可标记的数目是无限的； (2) 多数具 有共显性；(3) DNA用量少，而且对模板浓度的变化不敏感；(4)扩增片段较 短，分辨率高；(5)利用特定引物扩增，退火温度高，可靠性高。 缺陷：操作技术复杂，需要酶切、连接等步骤。

四、SSR标记
SSR，简单重复序列 （ Simple sequence repeat）又叫微卫星标记。 应用：多态性分析和新基因的发现、定位与作图。 特点：(1) 数量丰富，覆盖整个基因组；(2) 呈现多基因特点，信息含量高， 表现为共显性遗传；(3) 可采用PCR技术进行检测，且重复性好；(4) 对 DNA数量及纯度要求不高，即使是部分降解的样品也可；(5) 标记带型简单， 条带一致、客观、明确。
第五节 DNA芯片技术
二、DNA芯片技术的基本步骤
1. 芯片制备 （1）支持物的预处理：支持物(硅芯片、玻片或瓷片) 预处理，使其表面衍生出羟基、氨基活性基团。 （2）DNA芯片阵列的制备：将制备的基因探针（已克隆的基因片段PCR或 人工合成的DNA片段）、打印（喷墨打印或针式打印）
2. 准备样品:
突变体１ 8 0 7 + 6 0 5 0 4 0 3 0 2 0 1 0 ２ 0 + 0 0 0 0 0 ３ 0 + 0 0 0 0 ４ 0 + 0 0 0 ５ 0 + 0 0 ６ 0 + 0 7 + 0 8 0
18
顺反子的测定
假如上题的8个突变体测试产生了下列结果，结论是什么？



2. 噬菌体突变型间的杂交 图 3. 连锁图
r47 r104 r101 r106 | r51 r102 —|—————|————|—————|—|———————|—————|——— 1.3 1.0 1.6 | 1.9 1.6 A区 | B区
3
第一节 顺反子学说
二、互补试验和顺反子学说 1.顺反位置效应和互补试验

二、RAPD
随机扩增多态性DNA技术 （Random amplified polymorphic DNA) 优点：（Willians1990） ① 能反映整个基因组的变化； ②不需DNA探针， 无需合成特定序列引物； ③ 高效灵活，可在短期内获得大量的多态性DNA 片段，亲缘关系非常近的个体也能识别； ④操作简单易行，不需要接触放 射性物质，简便、快速、费用低、分子识别率高、对环境污染小等。 缺陷：重复性和稳定性较差



17
顺反子的测定
E.coli 的8个用T4突变株都不能在没有组氨酸的培养基上生长(his-), 两两进行重组测验，发现所有的顺式杂合体都能在基本培养基上 生长。而反式杂合体中，有的能在基本培养基上生长(+)，有的 则不能(0)，如下表所示，确定这8个突变位点分属于几个不同的 顺反子？
分离纯化cDNA , mRNA→扩增→标记(荧光、生物素、放射性标记）
3.分子杂交
样品与DNA芯片上的探针阵列进行杂交(30min)
4. 检测分析
软件进行进行图象分析和数据处理
15
第五节 DNA芯片技术
三、DNA芯片技术的应用

1. 2. 3. 4.
DNA测序 基因表达分析 基因组研究：作图、测序、基因鉴定、基因功能分析 基因诊断：寻找和检测与疾病相关的基因

（1）同一顺反子中的突变位点（等位） 基因型 —|———|———|— 顺式 —|———|———|— + + —|———|———|— 反式 —|———|———|— + m2
m1 + m1 m2



表型 野生型
是否互补 —

突变型
无


（2）不同顺反子中的突变位点（非等位）
基因型 表型

2.原位杂交的步骤 图
三、基因克隆 1. 功能克隆(functional cloning) 2. 定位克隆(positional cloning)：也叫图位克隆(Map-based cloning)
8
第四节 分子标记
分子标记的类型： （1） 基于杂交的分子标记：RFLP标记，小卫星DNA标记（SSR） （2）基于PCR的分子标记：①单引物PCR标记，如RAPD、ISSR标记；②双 引物PCR标记，如AFLP标记；③双引物特异PCR标记，如SSR标记 （3） 其他一些新型分子标记：如SNP标记、STS标记、EST标记
第一节 顺反子学说
三、基因内互补intragenic complementation
1 .概念和机理
机制：可能是由于两个突变基因所产生的失活产物结合，成为具有活性的蛋 白质。 如果将两个有关纯合体的抽提物混合时看到互补现象，叫离体互补或体外互 补。

5
第一节 顺反子学说
2 基因内互补与基因间互补的区别

九、基因与氨基酸同源序列比对图
（蛋白质分子标记）
13
第五节 DNA芯片技术
一、概述 1. 基本概念
DNA芯片（DNA Chip Technology） 、DNA微阵列（DNAmicroarray）、寡核苷 酸阵列（oligonucleotide array）。 生物芯片包括：DNA芯片、蛋白质芯片
基因间互补 发生机率 缺失突变 酶活性 互补结果 普遍存在 能发生互补 同野生型
基因内互补 只少数能发生 不能发生 明显低于野生型（仅25%）
可完全恢复野 最多只能使表型恢复到野生型的 生型表型 25％，而且突变位点相距愈近则 互补程度愈弱 在任何两个非 同一基因内的若干不同的突变型 等位基因之间 之间

2. DNA芯片的主要类型 （1） 根据探针的来源分 ①原位合成芯片：采用显微光蚀刻等技术在特定部位原位合成寡核苷酸 而制备的芯片。探针较短 ②DNA微集阵列：将预先制备的DNA片段以显微打印的方式有序地固化 于支持物表面而制成的芯片。探针的来源较灵活 （2）根据探针的大小分 ① Oligo-Chip 8 n or 20 n → expression ②cDNA-Chip < 2,000 n → expression 14 ③Genomic Chip> 50,000 n → genomic analysis
六、STS
序列标签位点 （Sequence-tagged site，M.Olson，1989) 1. 类型：（1）特异DNA序列；（2）无序的DNA片段：未知片段序列标签 2. 特点：产生的信息十分可靠。对基因的研究、新基因的克隆以及基因图谱 向物理图谱的转化研究具有重要意义。

12
第四节 分子标记
反式杂合体在基本培养基上的生长情况 突变体 1 ２ ３ ４ ５ ６ 7 8 8 + + + + + + 0 0 7 + + + + + + 0 6 + + + + 0 0 5 + + + + 0 4 + + 0 0 3 + 0 2 0 0 1 0
19
例题
普通生物的基因定位 ABC42
abc42 ABc92 abC92 细菌基因定位
Abc8 aBC8 AbC358 aBc358 1000
某杂交：Hfr ABC strs × F－ abc strr → 经检测后代的基因
型和菌落数分别是： ABC ABc AbC Abc 800 30 80 40

11
第四节 分子标记
五、 SNP

SNP（single nucleotide polymorphism单核苷酸多态性） 优点：(1) SNP分布广泛，多态性丰富；(2) 易于实现自动化分析；(3) 具有 稳定的遗传特性。 (4) SNP基因座的片段更短，更适合PCR扩增；(5) 易于对 复杂性状进行关联分析。 SNP标记可与DNA芯片技术结合：将不同的寡核苷酸固定在芯片上，标记 待测DNA，一次就可检测很多SNP标记。
传学水平，将基因定位到染色体的具体区带。
分子定位：利用分子标记、DNA芯片技术，将基因确切定位在
DNA上的具体位置上。
2