蛋白质连接技术
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sortase连接的原理Sortase连接是一种重要的化学生物学技术,用于连接蛋白质或肽段的方法。
它通过将底物蛋白质的C端与底物序列的N端连接起来,从而实现蛋白质的定向连接。
这种连接方式在生物医学研究和药物开发中具有广泛的应用前景。
Sortase连接的原理基于一种酶——sortase。
Sortase是一种革兰氏阳性菌的膜蛋白酶,其主要作用是将底物蛋白质的C端与底物序列中的Gly-Gly结构的N端连接起来。
Sortase酶能够识别和切割底物蛋白质的C端,同时将其连接到底物序列的N端。
这种连接方式不需要使用化学试剂,具有高效、可控和可重复的特点。
Sortase连接的过程可以分为两个关键步骤:底物蛋白质的C端切割和连接。
在第一步中,Sortase酶通过识别底物蛋白质的特定氨基酸序列,将其C端切割,形成一个C末端的酰基中间体。
在第二步中,Sortase酶识别底物序列中的Gly-Gly结构,并与其发生核酸疣的反应,将底物蛋白质的C末端连接到底物序列的N末端。
Sortase连接的优势在于其高度可控性和灵活性。
由于Sortase酶对底物蛋白质的识别和切割是高度特异性的,因此可以实现对特定氨基酸序列的选择性连接。
此外,Sortase连接还可以在生物体内和体外进行,适用于不同的实验条件。
此外,Sortase连接还可以应用于动态的蛋白质修饰,如荧光标记、生物素标记等。
Sortase连接在生物医学研究和药物开发中具有广泛的应用前景。
例如,通过Sortase连接可以实现对蛋白质的定向修饰,用于研究蛋白质的功能和相互作用。
此外,Sortase连接还可以用于设计和构建新的蛋白质纳米结构,用于构建智能药物传递系统和生物传感器。
此外,Sortase连接还可以用于合成具有特定结构和功能的肽类药物,用于治疗多种疾病。
Sortase连接是一种重要的化学生物学技术,通过Sortase酶将底物蛋白质的C端连接到底物序列的N端,实现蛋白质的定向连接。
蛋白质交联方法及其应用蛋白质交联系指将小分子物质(如药物、半抗原等)或大分子物质(如酶、蛋白毒素等)以共价键的方式连接于蛋白质分子,以制备人工抗原、酶标抗体、载体释放药物、抗体导向药物和免疫毒素等。
随着放射免疫分析法、酶标免疫技术、载体药物学和导向物学的发展,蛋白质交联技术的方法和手段也不断改进和完善,并且在生物学和医学领域得到愈来愈广泛的应用。
蛋白质交联方法首先发展于人工抗原的制备研究。
自70年前Landsteiner第一次合成人工抗原以来,人们将许多没有抗原性的小分子物质(半抗原)如化学药物、神经递质和激素等与蛋白质或多糖等载体大分子共价结台;使其具备抗原性,以诱发动物产生特异性抗体,用于放射免疫分析等。
为了使放射免疫分析达到灵敏度高、特异性强的要求,前人对半抗原和蛋白质连接的方法进行了大量的研究,建立了重氮化法、戊二醛法、混合酸酐法、二异氰酸酯法及卤代硝基苯法等交联技术。
近10多年来发展起来的酶标免疫检测技术,要求制备保持酶的生物活性和抗体的免疫结合活性的酶—抗体偶合物。
常用的交联方法如戊二醛法、碳二亚胺法和混合酸酐法不可避免地要产生酶或抗体的自身交联产物或多聚物,致使交联效率降低、结合物活性减弱。
为了克服这一不足,人们发展了异型双功能交联试剂,如N—羟基琥珀酰亚胺—3—(2吡啶基二硫)—丙酸酯,以实现控制交联,提高交联反应的选择性和交联产物的均一性。
将药物与大分子载体连接,制备药物一载体结合物,以改善和控制药物在体内的转运和代谢,实现缓释给药和定向给药,提高生物利用度和治疗指数。
这是现代药物研究领域一个崭新的分支。
载体药物必须能够在体内定量、定位释放原型药物,因此要求设计pH敏感或特定酶敏感的偶联键。
导向药物的发展对蛋白质交联方法提出了更高的要求。
早在1906年,Ehrlich就提出了靶向给药的设想。
随着生物医学的发展,这一设想不断得到具体的实现。
单克隆抗体作为导向载体的出现,更使导向药物的研究成为当代药物研究中最活跃和最引人注目的领域之一,而其中研究得最广泛的是肿瘤治疗的抗体导向研究。
蛋白质互作方法pla
蛋白质互作方法PLA(Proximity Ligation Assay)是一种用于检测和可视化蛋白质间相互作用的技术。
它结合了ELISA的特异性和PCR的灵敏度,通过使用一对DNA邻位探针,在蛋白质间相互作用时使两个探针之间的距离缩短,产生邻近效应。
此时加入一段分别与连接在抗体上的DNA互补的寡聚脱氧核苷酸作为连接子,使PLA probe上的DNA通过配对互补作用与该段DNA互补。
在连接酶的作用下,形成环状单链DNA 分子,并通过滚环复制产生多连体。
然后使用荧光探针进行PCR扩增,从而对这个新的DNA片段进行定量。
PLA技术具有较高的灵敏度和特异性,能够实现稳定、微弱及瞬时内源性蛋白质相互作用的可视化研究。
它可以在固定的细胞和组织中对内源性修饰过程进行可视化的研究,并检测单个蛋白质或蛋白质-蛋白质间相互作用的表达水平。
此外,如需在同一个样品中分析多个蛋白质事件,可选用多色multicolor PLA试剂盒,最多可在同一个样本中检测4个蛋白质事件。
PLA技术操作简单,用时短,仅需一天即可得到结果。
其结果真实可靠,检测灵敏方便,技术新颖又有说服力,是发表文章的利器。
AlphaFold蛋白互作技术是使用灵活的接头连接两个或多个蛋白质并将其用作输入,通过共折叠蛋白质来模拟蛋白质之间的相互作用。
这种技术可以预测蛋白质复合物的结构,为探索蛋白质-蛋白质相互作用开辟了新的可能性。
AlphaFold蛋白互作技术可以预测蛋白质的结构和复合物的结构,使用灵活的接头将两个或多个蛋白质连接起来,通过共折叠模拟蛋白质之间的相互作用。
这种技术可以用于研究蛋白质-蛋白质相互作用,以及开发新的药物和治疗方法。
在预测蛋白质的结构方面,AlphaFold采用了深度学习算法,对单体形式的序列进行训练和预测。
而在预测复合物的结构方面,AlphaFold通过将两个或多个蛋白质连接起来并作为输入,利用共折叠模拟蛋白质之间的相互作用。
这种方法可以用于研究蛋白质-蛋白质相互作用,以及开发新的药物和治疗方法。
AlphaFold蛋白互作技术已经取得了一些成功的应用,例如预测了多种蛋白质的结构,包括一些重要的药物靶点。
此外,该技术还可以用于研究蛋白质-蛋白质相互作用,以及开发新的药物和治疗方法。
未来,随着技术的不断发展和改进,AlphaFold蛋白互作技术有望在更多领域得到应用。
蛋白质融合表达的原理和优点
蛋白质融合表达是一种利用重组DNA技术将两个或多个不同的基因序列融合在一起,从而产生一个新的蛋白质的表达方式。
这种技术可以用于生产大量的特定蛋白质,具有广泛的应用前景。
该技术的原理是将两个或多个不同基因序列通过PCR扩增、限制性酶切和连接等步骤连接在一起,形成一个新的基因序列。
该基因序列可以在细胞内进行转录和翻译,产生一个新的融合蛋白质。
这种方法可以将两个或多个不同功能的蛋白质结合在一起,形成一个新的具有多种功能的复合物。
该技术具有许多优点。
首先,它可以有效地增加目标蛋白质表达量。
由于许多目标蛋白质无法通过常规表达方式进行高效表达,因此使用融合表达技术可以显着提高目标蛋白质的产量。
其次,该技术可以使目标蛋白质更加稳定和易于纯化。
由于许多目标蛋白质会出现折叠异常或聚集现象,使得其难以纯化和稳定保存。
使用融合表达技术可以将目标蛋白质与其他稳定的蛋白质结合在一起,从而使其更加稳定且易于纯化。
此外,该技术还可以用于产生新的功能蛋白质。
通过将两个或多个不
同的蛋白质结合在一起,可以产生新的具有多种功能的复合物。
这种
方法不仅可以用于基础研究,还可以用于产生具有特定功能的药物或
工业酶。
总之,蛋白质融合表达技术是一种有效、高效且灵活的表达方式。
它
可以用于产生大量目标蛋白质、提高目标蛋白质稳定性和易于纯化性,并产生新的具有多种功能的复合物。
随着该技术在各个领域中的广泛
应用,相信它将为科学研究和工业应用带来更多机会和挑战。
ggggs 蛋白linker 融合蛋白构建方法蛋白linker 融合蛋白构建方法蛋白linker 是指连接两个或多个蛋白质结构域的多肽链段,用于构建融合蛋白的重要工具。
在蛋白质工程中,蛋白linker 可以改变蛋白质的稳定性、溶解度、折叠速度和功能活性等特性。
构建融合蛋白的方法包括以下几个步骤:1. 确定蛋白质结构域:首先,需要确定要融合的两个或多个蛋白质结构域。
这些结构域可以是同源的,也可以是异源的。
2. 选择合适的linker:根据蛋白质结构域的特性和需求,选择合适的linker。
常用的linker 包括天然氨基酸序列,如Gly-Ser-Gly-Gly(GGSG),以及人工合成的linker,如Pro-Linker-Pro(PLP)。
3. 设计连接方式:根据蛋白质结构域的相对位置和功能需求,设计连接方式。
连接方式可以是直接连接,也可以是通过linker 进行间接连接。
4. 合成融合蛋白基因:将蛋白质结构域的基因序列与linker 的基因序列连接起来,构建融合蛋白基因。
在连接时,需要考虑到启动子、终止子和表达调控序列等元件的组合。
5. 表达和纯化融合蛋白:将融合蛋白基因转化到合适的宿主表达系统中,例如大肠杆菌、酵母或昆虫细胞等。
通过诱导表达,经过培养和收获细胞,使用适当的纯化方法纯化融合蛋白。
6. 验证融合蛋白构建成功:利用蛋白质分析技术,如SDS-PAGE、Western blotting、质谱等,验证融合蛋白的存在和纯度。
总之,蛋白linker 融合蛋白构建方法涉及确定蛋白质结构域、选择合适的linker、设计连接方式、合成基因、表达纯化和验证等步骤。
这些方法为构建具有特定功能的融合蛋白提供了有效的工具和策略。
交联法蛋白相互作用交联法是一种用于研究蛋白质相互作用的常用方法。
它可以帮助我们了解生物体内蛋白质的互动方式,提供设计新药物和疾病治疗策略的基础。
交联法的原理是通过共价化学交联两个或多个蛋白质,使它们在实验过程中处于固定的位置。
在本文中,我们将详细介绍交联法的原理、应用以及未来的发展方向。
交联法的核心原理是使用一个交联剂(cross-linking reagent)与蛋白质中的自由氨基酸残基(例如赖氨酸、苯丙氨酸等)发生反应,形成共价的连接。
交联剂可以是任何具有双功能的分子,例如含有两个活性酯或酰胺基团的化合物。
交联剂与蛋白质中的氨基酸反应后会形成可逆的、稳定的化学键,使蛋白质相互连接形成一个复合物。
在实验中,交联剂一般是以过量的量加入到反应体系中,以增加交联的效率。
交联法可以使用多种手段来实现,包括化学交联、光交联和酶促交联。
化学交联是最常用的方法,它通常使用含有活性酯或酰胺基团的交联剂。
光交联是利用紫外光照射交联剂,使其产生活性自由基,与蛋白质中的氨基酸发生反应。
酶促交联则是通过酶的作用,将交联剂与蛋白质连接在一起。
交联法的主要应用之一是确定蛋白质的互作结构。
通过交联法,研究人员可以确定蛋白质中靠近的残基,进而推断出蛋白质的空间构象和相互作用方式。
这对于了解蛋白质功能以及蛋白质与其他生物分子的相互作用具有重要意义。
交联法还可以帮助鉴定蛋白质复合物的组成成员,以及分析复合物的稳定性和动态变化。
除了确定蛋白质结构和相互作用,交联法还可以用于研究蛋白质的功能。
例如,交联法可以用于研究酶的催化机制、蛋白质复合物的功能以及信号转导通路的调控机制。
通过交联法,研究人员可以将关键的残基固定在特定的位置,从而改变蛋白质的功能或者破坏其功能。
尽管交联法已经在蛋白质研究中取得了巨大的成功,但仍然存在一些挑战和限制。
首先,交联剂的选择非常重要,需要考虑其反应性、稳定性以及对蛋白质结构的影响。
其次,交联法在分析复杂蛋白质体系时存在一定的困难,例如高分子量蛋白质复合物和跨膜蛋白质。
蛋白的融合表达名词解释蛋白是构成生物体的重要组成部分,也是生命活动的基础。
它们不仅在细胞内发挥着重要的功能,还在体内调节着各种生物过程。
蛋白的融合表达是指将两种或多种蛋白合并为一个蛋白分子,以实现特定的功能或产生新的特性。
这种融合表达方式可以通过基因工程技术来实现,具有广泛的应用前景。
蛋白的融合表达的原理是利用基因重组技术将不同基因的DNA序列组合在一起,使它们在同一蛋白分子中共享同一条多肽链。
融合表达蛋白通常由两个或多个蛋白质结构域组成,分别来自不同的源。
这种融合可以通过两种主要方式实现:一是将两个或多个目标蛋白质的编码序列直接连接在一起,形成一个多功能的蛋白质;二是将一个目标蛋白质的编码序列与另一个蛋白质的编码序列融合,形成一个新的蛋白质。
蛋白的融合表达可以为我们提供多种优势。
首先,它可以增加蛋白质的稳定性和溶解性,提高蛋白质的生产效率。
有些蛋白质在原生条件下很难表达或纯化,但通过融合表达可以提高它们的表达量和稳定性,从而更容易获取高纯度的产物。
其次,融合表达可以改变蛋白质的功能和特性。
通过融合表达不同的蛋白质结构域,可以赋予蛋白质新的功能或改变其特性,从而扩展蛋白质的应用范围。
例如,将抗体结构域与毒素结构域融合可以产生具有杀伤性的蛋白质,用于治疗某些疾病。
此外,融合表达还可以将两种蛋白质的互作性结构域融合在一起,用于研究蛋白质间的相互作用和信号传导机制。
蛋白的融合表达在医药、生物工程和农业等领域有着广泛的应用。
在医药领域,通过融合表达产生的融合蛋白质可以用于疫苗的研发、药物的开发和治疗特定疾病。
在生物工程领域,融合表达可以用于改善目标蛋白质的表达量和质量,提高生产效率和经济性。
在农业领域,融合表达可以用于改良农作物,提高其抗病性和适应性,增加产量和品质。
尽管蛋白的融合表达具有巨大的潜力,但也存在一些挑战和限制。
首先,不同蛋白质的结构和功能可能对融合表达产生不利影响。
某些蛋白质的融合可能导致其折叠不正常或失去原有的功能。
蛋白质与蛋白质相互作用的技术
蛋白质与蛋白质相互作用的技术主要包括酵母双杂交技术、免疫共沉淀技术、荧光能量转移技术、噬菌体展示技术等。
这些技术可用于研究蛋白质之间的相互作用,从而深入了解生命活动的机制。
1.酵母双杂交技术:这是一种有效的筛选蛋白质相互作用的方法,尤其适用
于大规模蛋白质之间相互作用的研究。
通过将目标蛋白与报告基因连接,在酵母细胞中检测报告基因的表达,可以确定目标蛋白与其他蛋白的相互作用。
2.免疫共沉淀技术:利用抗体与抗原之间的特异性结合,将目标蛋白与其他
相关蛋白一起沉淀下来,然后通过Western blot等技术对沉淀的蛋白质进行分析。
通过这种方法可以检测到目标蛋白与其他蛋白质的直接相互作用或者间接相互作用。
3.荧光能量转移技术:一种高灵敏度的检测蛋白质相互作用的方法。
该技术
利用荧光物质标记目标蛋白,通过检测荧光物质之间的能量转移,来间接检测蛋白质之间的相互作用。
4.噬菌体展示技术:将外源基因插入噬菌体外壳蛋白基因的技术,使外源基
因编码的蛋白质与噬菌体外壳蛋白融合,并在噬菌体表面展示出来。
通过该技术可以筛选与目标蛋白相互作用的蛋白质,并对相互作用进行定量分析。
蛋白交联质谱蛋白质交联是一种重要的生物化学现象,它在维持细胞结构和功能方面起着重要的作用。
蛋白质交联是指两个或更多蛋白质分子之间以共价键连接的过程。
这种连接可以通过天然交联剂、酶催化或化学反应来实现。
蛋白质交联可以产生具有不同结构和功能的大分子复合物,从而扩大蛋白质的功能范围。
质谱是一种常用的蛋白质分析方法,可以用来研究蛋白质的化学性质、结构和功能。
质谱分析中的一个重要应用是用于鉴定和定量分析蛋白质交联产物。
蛋白质交联产物的质谱分析可以提供关于交联位点、交联结构和交联数量的信息。
这对于理解蛋白质交联的机制和功能具有重要意义。
蛋白质交联产物的质谱分析通常是在两个方面进行的:交联位点的鉴定和交联产物的结构分析。
交联位点的鉴定是通过质谱分析中的肽酶消化和段选择性酶消化来确定。
肽酶消化可以将交联产物水解为小肽片段,然后通过质谱分析鉴定这些片段的氨基酸序列,从而确定交联位点。
交联产物的结构分析是通过质谱分析中的碎片离子诱导解离(CID)和中性损失(NL)扫描进行的。
在CID扫描中,通过碎片离子的相互作用,可以得到交联产物的碎片离子,从而确定其结构。
在NL扫描中,通过测量中性分子的丢失,可以分析交联产物的结构和组成。
质谱分析中常用的方法是质子转移反应器(PTRMS)。
PTRMS是一种基于质谱的分析方法,可以对气态和溶液中的物质进行分析。
PTRMS的原理是通过质子转移反应,将待测物质中的质子质量化,并进行质谱分析。
PTRMS可以用于分析蛋白质交联产物的结构和组成。
蛋白质交联质谱是一种复杂的分析方法,需要综合使用多种技术和仪器来完成。
这包括对样品的制备、质谱分析仪器的选择和参数的调整等。
蛋白质交联质谱的分析结果对于研究蛋白质交联的机制和功能、发现新的靶标和药物靶点等具有重要意义。
总的来说,蛋白质交联质谱是一种重要的蛋白质分析方法,可以提供关于交联位点、交联结构和交联数量的信息。
蛋白质交联质谱的分析结果对于解析蛋白质交联的机制和功能具有重要意义。
蛋白质pla技术步骤蛋白质PLA技术步骤近年来,蛋白质PLA技术在生物科学领域取得了重大突破,为研究者们提供了一种高效、精确的方法来研究和操作蛋白质。
下面将介绍蛋白质PLA技术的一般步骤。
1. 样本准备蛋白质PLA技术的第一步是准备样本。
这包括从细胞中提取蛋白质,并将其固定在载玻片上。
样本的选择和准备对后续实验的成功至关重要。
2. 抗体结合接下来,需要选择两种特异性的抗体,一种与感兴趣的蛋白质结合,另一种与引物结合。
将这两种抗体分别与蛋白质和引物标记结合。
3. 混合反应将标记后的抗体与样本中的蛋白质一起混合,在适当的条件下进行反应。
这一步的目的是使标记的抗体与目标蛋白质结合形成复合物。
4. Ligation在混合反应后,需要进行连接反应。
连接反应使用连接酶来连接复合物中的两个引物。
这个步骤非常重要,它确保复合物的稳定性和可靠性。
5. 聚合酶链式反应连接反应后,需要进行聚合酶链式反应(PCR)来扩增连接的DNA 分子。
PCR是一种常用的方法,可以在短时间内扩增目标DNA分子的数量。
6. 检测和分析在PCR扩增后,可以使用各种方法来检测和分析扩增的DNA分子。
常用的方法包括凝胶电泳、荧光显微镜观察等。
这些方法可以帮助研究者确定样本中是否存在感兴趣的蛋白质。
蛋白质PLA技术的步骤相对简单,但对实验者的技术要求较高。
只有准确地掌握每个步骤,才能得到可靠的实验结果。
蛋白质PLA技术的应用范围广泛,可以用于研究细胞信号传导、蛋白质相互作用等生物学过程,为科学研究提供了有力的工具。
nhs共价连接蛋白NHS共价连接蛋白NHS是一种常用的交联剂,被广泛应用于生物化学和分子生物学领域中。
共价连接蛋白是利用NHS的一种常见方法。
本文将重点介绍NHS共价连接蛋白的原理、应用和相关技术。
一、NHS共价连接蛋白的原理NHS(N-Hydroxysuccinimide)是一种活性酯化合物,具有高度的亲电性,可与氨基或羟基反应形成酰胺键或酯键。
在共价连接蛋白的实验中,NHS常与EDC(1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) carbodiimide)一起使用,EDC可激活NHS,使其更容易与蛋白反应。
NHS共价连接蛋白的步骤如下:1. 将NHS和EDC加入反应体系中,生成活化的NHS酯化合物。
2. 将待连接的蛋白加入反应体系,NHS酯与蛋白中的氨基或羟基发生反应,形成酰胺键或酯键。
3. 反应结束后,通过洗涤等步骤去除未反应的NHS和EDC。
二、NHS共价连接蛋白的应用1. 蛋白共价标记NHS共价连接蛋白可用于标记蛋白,使其具有特定的性质或功能。
例如,可以将荧光染料或酶标记与蛋白共价连接,用于蛋白质定位、分析和检测等实验。
2. 蛋白共价固定NHS共价连接蛋白还可用于将蛋白固定在固体载体上,如琼脂糖凝胶或磁珠。
这种固定可以增强蛋白的稳定性和寿命,有助于后续实验的进行。
3. 蛋白共价交联NHS共价连接蛋白还可用于将不同的蛋白共价交联在一起,形成复合物或聚集体。
这种方法可以用于研究蛋白相互作用、信号传导和细胞功能等领域。
三、NHS共价连接蛋白的相关技术1. SDS-PAGESDS-PAGE是一种常用的蛋白质分离和定量技术,可用于分析NHS共价连接蛋白的纯度和大小。
通过电泳分离,可以观察到连接后的蛋白带和未连接的蛋白带。
2. Western blotWestern blot是一种常用的蛋白质检测技术,可用于确认NHS共价连接蛋白的成功。
通过使用特异性的抗体,可以检测到连接后的蛋白,并确定其位置和相对丰度。
蛋白质杂交技术的原理和应用1. 蛋白质杂交技术简介蛋白质杂交技术是一种常用的生物学实验方法,用于研究蛋白质的相互作用及其功能。
通过将两个不同的蛋白质片段或融合蛋白合并在一起,可以检测它们之间是否存在相互作用,并进一步研究这种相互作用的功能和机制。
2. 蛋白质杂交技术的原理蛋白质杂交技术基于DNA分子的互补性原理进行设计。
通过将目标蛋白质的DNA序列与另一个蛋白质的DNA序列连接在一起,形成一个新的杂交DNA,然后将这个杂交DNA转化到宿主细胞中,使宿主细胞表达出杂交蛋白。
通过检测该杂交蛋白的功能或相互作用,可以研究目标蛋白质的功能和相互作用机制。
2.1 DNA互补性原理DNA序列是由四种碱基(腺嘌呤、鸟嘌呤、胸腺嘧啶和胞嘧啶)组成的,碱基之间存在对应关系,即腺嘌呤与胸腺嘧啶之间形成两个氢键,鸟嘌呤与胞嘧啶之间形成三个氢键。
根据这种互补原理,我们可以将两段DNA序列通过相互配对形成一个完整的DNA。
2.2 蛋白质片段连接将两个蛋白质的DNA片段连接在一起时,通常会使用DNA重组技术,通过PCR扩增目标DNA片段并使用限制性内切酶进行切割,之后通过连接酶将两个片段连接在一起,形成杂交DNA序列。
2.3 转染宿主细胞将合成的杂交DNA导入宿主细胞中,可通过多种方式实现,例如利用病毒载体将DNA导入细胞内,或通过电穿孔等物理方法使DNA直接进入细胞。
2.4 杂交蛋白表达和检测转染后,宿主细胞会开始表达杂交DNA中的融合蛋白。
通过特定的检测方法,如免疫印迹、荧光染色、酶活性测定等技术,可以确定杂交蛋白是否成功表达,并进一步研究其功能和相互作用。
3. 蛋白质杂交技术的应用蛋白质杂交技术被广泛应用于生物医学研究和药物开发领域,并取得了重要的成果。
3.1 蛋白质相互作用研究蛋白质杂交技术可用于研究蛋白质间的相互作用关系,从而揭示细胞内的信号传导途径、蛋白质结构和功能等方面的信息。
通过构建杂交蛋白库以及筛选和鉴定具有特定相互作用的蛋白质,可以进一步了解蛋白质的功能和作用机制。
蛋白质连接技术人工抗原的合成是化学免疫的重要问题,化学免疫研究的对象,除上面提及的药物、毒物、激素外,还有多糖类、神经递质、肽类、核酸及生物体内其它小分子活性物质,总起来说,它们大多都是无免疫原性的半抗原,在对其进行免疫学及其它相关研究时,一方面要通过化学合成的手段,即蛋白质连接技术,经与载体蛋白交联合成制备人工抗原,继而用其免疫动物制备相应的抗体或单克隆抗体,作为研究用的探针;另一方面还必须将此探针用各种标记物进行标记,如本文论及的酶标记,以便用作研究工具;在分子生物学研究中,包括核酸或基因探针的研究及应用,多种类型探针的标记也都将涉及蛋白质连接技术。
半抗原分子量一般较小,其结构及化学功能团的性质多种多样,数量各不相同,在与酶蛋白或载体蛋白进行交联时,必须考虑交联双方的性质、交联剂、交联方法和载体.2.混合酸酐法制备G6PDH(葡糖—6—磷酸脱氢酶)标记利多卡因(Lidocaine.Li)结合物[29](1)Li—混合酸酐的制备首先将Li经化学修饰(琥珀酸酐法,略),在其分子中引入羟基(一COOH),制成Li—COOH(Li一琥珀酸半酯);然后,将此Li—COOHl0mg(0.0285mm0l)溶于375ul的DMF中,用电磁搅拌混溶。
在一10℃条件下,边搅动边滴入21ul的三乙胺,再缓慢滴入14ul的卡必醇氯甲酸酯,于一10。
C 继续搅拌反应1.5小时,此全部过程应保持无水,即获得Li—混合酸酐(Li—MA)。
(2)酶——底物溶液的制备在冰浴中,将G6FDH(L.m)lmg用50mmol/LpH8.1Tris—HCl溶解,同时加入G6P—Na(葡糖—6一磷·酸钠盐)10mg及NADH 3mg(底物一辅酶系统,用于保护酶活性),使其溶解,随后缓慢加入300ul卡必醇,用2m0l/LNaOH调pH至9.0。
(3)G6PDH—Li的交联将酶—底物溶液置于冰浴中,在搅拌条件下,每隔10~15分钟向此酶液中缓慢加入一定量(25ul,50ul,100ul……)的Li—MA溶液,反应10~15分钟后,分别取出反应液5u1测定酶活性及Li半抗原的抗体对标记酶活性的抑制率.直至加入Li—MA的量所引起酶活性的下降程度最低,而抗体对酶活性的抑制率又最高时,此标记过程即完成(表2—8)表2—8 G6PDH—Lidocaine交联反应中酶活性变化及抗体抑制率3.碳化二亚胺法(EDC)制备人工抗原最近几年,在对无免疫原性小分子物质的化学免疫研究中,采用碳化二亚胺作为交联剂制备合成人工抗原的工作愈来愈多,因为用这种试剂进行交联最为方便,除交联的一方作为载体的蛋白质,具有多个氨基或羧基外,不少小分于化合物也具有此反应基团,或通过化学修饰引入羧基。
因此,EDC交联法已被广泛应用,并为大家所熟悉。
然而,在实践过程中,也遇到不少问题,给相关研究带来不少困难,以下就有关问题略加讨论。
使用EDC试剂进行化学交联虽然非常方便,但它除具有同型双功能交联剂的缺点外,在合成人工抗原时,还会出现异常情况。
如前所述,EDC是一类非常活泼的化学交联剂,据文献报道,它可以交联含有多种类型化学功能基团的化合物,包括羧酸、胺、磷酸、醇类、含巯基化合物等。
交联过程至少可分为两步:如图2—l中的反应①和反应②,假定含氨基的半抗原与载体蛋白的交联是通过酰胺键连接,如反应②;然而,EDC也可以通过分子重排与蛋白的羧基结合,成一种稳定的N—取代脲,这一反应过程如图2—l中的反应①和③,在此反应中,载体蛋白如是白蛋白,取代脲就结合到该蛋白的羧基上。
图2—1 碳二亚胺法制备人工抗原交联反应的可能机制有人认为,在用EDC合成人工抗原时,可能形成两种产物,一种是半抗原—蛋白复合物(即本合成的目的产物——人工抗原),另一种则是取代脲—蛋白复合物(图2—1)。
然而,这两种产物往往是被当作均一的人工抗原作为免疫原给动物免疫的,但是,实际上加到载体蛋白分子上的外源性抗原决定族就有两种,一种是半抗原的,一种是取代脲的,因而,也就可能产生两种抗体。
后一种抗体往往对半抗原的检测专一性和灵敏度有明显的干扰,使问题复杂。
用第一种碳二亚胺合成半抗原一蛋白结合物,即用于免疫动物的人工抗原(免疫原);而用第二种碳二亚胺合成的结合物作为抗体的检测抗原,当然,两者也可调换使用。
可以选用的两种水溶性碳二亚胺是EDC 和CMC(图2-2),其化学名称分别为1-ethyl—3一(3一dimethyl—aminopropyl)carbodiimide hydrochloride〔1一乙基一3一(3一二甲基氨丙基)碳二亚胺盐酸盐,EDC或Ethyl—CDl]和1—cyclohexyl—3—(2—morph0linyl—(4)—ethyl)carodiimidemetho—p—t01uenesulfonate〔1—环己基—3—(2—吗啉代乙基)—碳二亚胺对甲苯甲磺酸,CMC或Morpho—CDl]。
以下简要介绍EDC法制备人工抗原的操作步骤:说明:在交联过程中,可不加(8)H标半抗原,结合比可用其它方法计算。
5.酮基与氮基的交联O(羧甲基)羟胺法:含酮基化合物与O(羧甲基)羟胺反应,生成O—羧甲肟衍生物,此中间体的羧基与另一化合物的氨基结合,形成结合物。
(四)酶与蛋白质的交联酶的本质是蛋白质,因此,酶对蛋白抗原、抗体的标记,实质上就是两种不同蛋白质之间的交联。
酶与蛋白质之间的交联反应,主要受到蛋白质分子内所具有的适合于偶联的化学功能团类型和数量的限制,大部分交联反应是通过蛋白质分子中的a—和ε—氨基、亚氨基和琉基的亲核性质,常用的交联方法主要是利用a—氨基作为交联部位(表2—4)。
如前所述,由于交联双方具有多种不同的反应功能团,故可据此选用不同的交联方法和交联剂。
交联剂有多种,如单功能、双功能和多功能试剂。
双功能试剂又可分为同型和异型两类,其中多数都可用于酶与蛋白质的交联。
戊二醛法和高碘酸钠法是最通用的方法,而又以后者为最佳;二马来酰亚胺、氟二硝基苯砜、苯醌等方法也可采用。
当酶与抗体蛋白用同型双功能试剂进行交联时,常常形成不均一的混合物,—有酶与抗体蛋白的结合物,也有酶—酶、抗体蛋白—抗体蛋白自身结合而形成的聚合物同时存在。
为克服同型双功能交联剂的这种缺点,可采用一类新型的交联剂——异型双功能试剂,其中,目前应用较多的一种是N—琥珀酰亚胺基3—(2—吡啶基二硫)丙酸酯(简称SPDP),使用SPQ可将酶与抗体蛋通过两者的氨基进行交联,而不会形成酶或蛋白的自身聚和物。
新近,生物素—亲和素系统(Biotin—AYidin System,BAS)的引用是标记技术一重大进展,巳用于酶对抗原或抗体,以及多种物质的交联标记,它可明显地提高标记效率。
利用BAS制备的酶标结合物,除具有抗原—抗体专一结合的特点外,还具有生物素—亲和素系统的特异亲和性,因此,结合物亦具有高度的专一性,同时也就显、著地增加了ELISA和EMIT的测定灵敏度。
以下简要介绍酶标抗体的两种制备方法:1.高碘酸(钠)盐氧化法及其发展、改进的三个阶段酶标抗体结合物是酶免疫分析中的重要试剂,酶结合物的制备是EIA或ElISA技术中的重要环节。
在ELlSA的研究和应用发展过程中,辣根过氧化物酶(HRP)是最常用和最方便的标记酶,而高碘酸钠氧化制备酶标抗体结合物的方法也是最通用,最易实施的方法。
因此,本方法在近20年的应用实践中,也得到不断的提高、改进和完善。
本方法的三个主要发展阶段:(1)1972年的Nakane法[21]:其基本原理以下图示意本法需用FDNB(氟二硝基苯)封闭氨基,但是,在此反应过程中所产生的氟化氢(HF)对酶活性有抑制作用,而且,又不能完全避免自身交联,标记周期需4、5天。
(2)1978年的Wilson—Nakane改良法[22]由于方法(1)存在不少缺点,Wilson 和Nakane等人于1978年又提出高碘酸钠改良法,本方法的特点是在PH4~5条件下,用高碘酸钠直接氧化HRP,而不需用FDNB预先封闭酶的氨基,并在加入抗体(IgG)蛋白之前,反应体系一直保持在低pH值条件。
利用本方法进行标记的优点是,仅有5%的醛化酶(HRP—CHO)发生自身交联,而(1)法发生自身交联率则为35%,同时,也免除了FDNB对酶活性的破坏;其标记周期仅为两天。
(3)1984年的Tussen—Kurstak改良法[23]Tussen等在前两个方法的基础上,进一步改进和简化了用高碘酸钠氧化制备HRP—Ab的方法,并对这一标记方法中的关键环节进行了研究。
他们指出,高碘酸钠氧化法的中心问题是NaI04对酶分子中糖基(严格地说应该是指连二糖基)的氧化。
在此氧化过程中,若氧化强度不足,会影响交联标记的效率;但是,如果氧化作用过强,则会导致①氧化结果形成羧基而不是醛基;②酶失活;③形成聚合物,这是因为强氧化所产生的HRP—CHO易成为两个IgG分子之间的桥分子;④给用ConA—Sepharose亲和层析纯化标记结合物带来困难。
因此,特别强调要选择最佳氧化条件。
由表2—5可以看到,高碘酸钠氧化的最佳浓度为4~8mmol,其结合率可以达到95%;酶活性可保留80~90%。
由其实验结果表明,高碘酸钠的浓度对于有效的结合和酶活性的保护是非常关键的因素。
除此之外,他们还在以下几方面进行了探讨和改进:①在标记过程中,试剂系统要使用双蒸水配制,以避免pH及水中所合杂质对氧化作用和酶活性产生不良影响;②在酶与抗体交联时,要加入干燥的Sephadex G—25,这样可使其迅速吸收反应溶液中的液体,以增加HRP—CHO和IgG的反应浓度,而小分子交联剂(NaI04)则可被分子筛G—25吸进微孔中,以借此控制并降低反应系统中NaIO4的相对浓度。
此举有助于加速HRP—Ab结合物的形成;⑤在标记时,所采用的HRP/IgG摩尔比应略高于1的比例,以保证HRP与IgG充分相互结合;④对Schiff氏碱的稳定化作用,是采取类似于还原性甲基化反应的方法进行的,因为硼氢化钠在水溶液中几乎立即水解,所以要重复加入一次,同时孵温时间也缩短许多。
⑥在使用ConA—Sepharose亲和层析对结合物进行纯化时,只有在HRP的糖基部分没有被NaIO4过分氧化,即高碘酸钠的浓度低于15mm0l时,才能进行有效的纯化。
[附]Tussen—Kurstak 改良法简要步骤(时间:1天)[23](1)活化辣根过氧化物酶(HRP)的活化①在青霉素瓶中用新鲜配制的O.5ml~0.1m0l/L碳酸氢钠溶液溶解5mg 纯化的HRP(用双蒸水配制);[配制]0.1m0l/L NaHCO3:16.8mg NaHCO3溶于2m1双蒸水中;(注意:此时溶液颜色呈棕色)②在上述酶液中逐滴加入新鲜配制的0.5ml 8~16mm0l/L NaI04(根据HRP 使用量确定),加塞,避光,室温(20℃)条件下慢速电磁搅拌反应2小时;[配制]20mmol/L NaI04:21.4mg、NaI04溶于5ml双蒸水中;(注意:在滴加NaIO4的过程中,反应液的颜色应由棕色逐渐变为暗绿色,如无变化,可加少许固体NaIO4)(2)标记活化HRP—CHO与IgG交联①用0.1mol/LNaHCO3:pH9.2(1~2ml)溶解15mg纯化的IgG;②将HRP—CHO与IgG溶液混合,搅拌,把干燥的5ephadex G—25加入其中(G—25加入量相当于HRP和IgG总量的l/6)室温搅拌反应2~3小时,(3)稳定化①从上述交联反应液中离心分离出Sephadex G—25;②加入1/20体积的新鲜配制的5mg/mlNaBH4(在0.1mm0l/L NaOH中),30分钟后再加入3/2o体积的另外新配制的NaBH4溶液,放置一小时,使Schiff 氏碱还原成稳定的酶标抗体结合物;(4)纯化用等体积的饱和硫酸铵溶液将结合物和游离的IgG沉淀,收集沉淀物,用PBS 溶解并充分透析;②准备一支小的ConA—Sepharose柱,加入上述溶液,用PBS洗脱游离的IgG,吸附的结合物则用含有0.Olmol/L甲基—a—D—甘露(糖)吡喃糖普的PBS洗脱;(说明:如果HRP和IgG的纯度较高,上述纯化过程可以省略);③在加入等体积的甘油后,将结合物置于一20℃保存。