仿刺参的微卫星标记_战爱斌
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仿刺参微卫星DNA标记的筛选与应用及性别差异研究初探的开题报告开题报告题目:仿刺参微卫星DNA标记的筛选与应用及性别差异研究初探一、研究背景和意义仿刺参是我国对外出口的一种重要海产品,其种质资源十分丰富。
然而,现有的种质资源管理还停留在传统方法上,缺乏先进的分子生物学手段进行深入的研究和管理。
微卫星DNA标记是一种具有高度多态性、复杂性和重复性的DNA序列,被广泛应用于物种鉴定、种群遗传结构分析、遗传连锁图构建等领域。
本研究旨在筛选仿刺参微卫星DNA标记,建立其PCR扩增体系并进行基因分型,为仿刺参种质资源的分子鉴定和分类提供有力的支持。
本研究同时将对仿刺参种群中不同性别个体的遗传差异进行分析,探究其性别分类的分子标记,为性别选择和性别控制提供科学依据。
二、研究方法和内容1. 样本采集:根据不同产地,采集不同的仿刺参样本,将其经过漂洗和冷冻保存,用以后续的检测和分析。
2. DNA提取:采用常规离子交换法或柱式纯化法从仿刺参的体内或鳃部组织提取总DNA,质量检测后进行储存并备用。
3. 微卫星DNA标记筛选:运用微卫星富集法或高通量测序技术,从仿刺参基因组序列中筛选出一批微卫星DNA标记,并进行PCR扩增条件的优化。
4. 微卫星DNA标记应用:将筛选出的微卫星DNA标记应用于仿刺参种群的基因分型,对分型结果进行分析、比对和校正。
5. 性别控制分子标记筛选:以采集自仿刺参个体不同部位的DNA为基础,通过分子技术筛选适用于不同性别个体分型区分的分子标记。
6. 性别差异分析:利用筛选出的分子标记对仿刺参种群中不同性别个体进行基因分型,并进行遗传差异分析,探究其性别间基因差异的特点和规律。
三、研究预期结果1. 筛选出适用于仿刺参种群分型的微卫星DNA标记集,为其分子鉴定和分类提供有力支持。
2. 筛选出适用于不同性别个体分型区分的分子标记,并对遗传差异进行分析,为仿刺参性别控制提供依据。
3. 为激活仿刺参种质资源,推进作出来提供了科学可靠的手段和理论支持。
刺参杂交子代的微卫星和AFLP分析李莉;李琪;胡美艳【期刊名称】《中国海洋大学学报(自然科学版)》【年(卷),期】2010(040)007【摘要】用微卫星和AFLP标记分析了中国刺参(♀)和日本红刺参(♂)杂交子一代的遗传特性.2对微卫星标记对两亲本及其杂交子代的分析结果表明,杂交子代的等位基因均来自两亲本,为真正的杂交种.8对AFLP引物共扩增出375个位点,其中多态位点265个,多态位点比例69.8%;238个位点在子代中发生分离,符合孟德尔分离规律的位点175个,其中母本69个,父本66个;偏离孟德尔分离的位点43个;异常分离位点20个.子一代与母本间的遗传距离为0.0391,小于其与父本之间的遗传距离(0.0999),表明杂交子代在遗传上与母本较近.【总页数】6页(P53-58)【作者】李莉;李琪;胡美艳【作者单位】中国海洋大学水产学院,山东,青岛,266003;中国海洋大学水产学院,山东,青岛,266003;中国海洋大学水产学院,山东,青岛,266003【正文语种】中文【中图分类】S917【相关文献】1.紫扇贝、海湾扇贝及其正反杂交子代群体遗传结构的AFLP分析 [J], 孙妍;黄晓婷;胡丽萍;王师;王春德;包振民2.真鲷、黑鲷及其杂交子代的染色体构成与 AFLP 分析 [J], 林勉;苗亮;李明云;俞寅寅;徐万土3.仿刺参中国群体与韩国群体杂交子代微卫星标记分析 [J], 王鹤;王田田;胡丽萍;赵强;孙国华;孙灵毅4.银白杨×马氏杨杂交子代及亲本的AFLP分析 [J], 李晓宇;梁德军;纪纯阳;赵继梅;赵鑫闻5.银白杨×N001杨杂交子代及亲本的AFLP分析 [J], 李晓宇;梁德军;纪纯阳;赵继梅;彭儒胜因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。
刺参遗传多样性的微卫星及RAPD分析的开题报告
一、研究背景
刺参是我国农渔业最重要的经济海参之一,其品种众多、产地广泛,以其高蛋白、低
脂肪、高营养、滋补养生等特点而备受消费者青睐。
然而,由于过度捕捞、环境污染、海洋气候等因素的影响,刺参的资源量已经大幅减少,因此开展对刺参的遗传多样性
研究,有助于为其保护和育种提供科学依据。
二、研究目的
本研究旨在通过微卫星和RAPD技术对刺参的遗传多样性进行分析,探讨其种群结构
和遗传多样性状况,为刺参保护和育种提供科学依据。
三、研究方法
1.样本采集
本研究采用不同产地的刺参样本,共计100个。
2. DNA提取
采用组织DNA提取试剂盒对样本进行DNA提取。
3. 微卫星分析
选取10对已发表的适用于刺参的微卫星引物,采用PCR扩增。
将扩增产物进行聚丙
烯酰胺凝胶电泳分析,检测分离大小和数量和PCR产物的等位基因。
4. RAPD分析
采用10个随机引物进行RAPD扩增。
将扩增产物进行聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,检测分离大小和数量和PCR产物的等位基因。
5.数据分析
使用POPGENE软件分析微卫星分子多态性信息,包括等位基因数、平均杂合度、平均PIC等遗传学参数。
使用WingF1软件分析RAPD分子多态性信息,包括遗传距离、相似性系数等参数。
同时,对不同种群的遗传多样性进行比较和分析。
四、研究意义
通过对刺参遗传多样性的研究,可以为刺参保护和育种的工作提供可靠的遗传学依据。
同时,也为其他经济海参的遗传多样性研究提供参考。
仿刺参的微卫星标记战爱斌;包振民;陆维;汪小龙;胡景杰【期刊名称】《水产学报》【年(卷),期】2006(30)2【摘要】为了评价种质资源及基础生物学研究的需要,本文开发了仿刺参的微卫星标记.NCBI数据库中共有20个含有仿刺参微卫星的序列,从中选取8个设计引物,发现6个微卫星位点有多态性.不同的引物获得的等位基因数为3~9个不等,6个位点共获得了31个等位基因,每个位点平均获得5.2个等位基因.6个位点的平均观测杂合度(Ho)为0.3611,平均期望杂合度(He)为0.6402.位点AJMS004提供的多态性信息含量值较低,为0.4862;其他5个位点均在0.5以上.另外,还尝试了红海参(Parastichopus californicus)微卫星标记在仿刺参的通用性.实验结果表明,在较高的退火温度下,5对引物均能扩增仿刺参的基因组DNA并具多态性.5个位点共获得了22个等位基因,每个位点平均获得4.4个等位基因.5个位点的平均观测杂合度(Ho)为0.1733,平均期望杂合度(He)为0.4201.其中位点Psc 2的多态性信息含量值最高,为0.8500.【总页数】5页(P192-196)【作者】战爱斌;包振民;陆维;汪小龙;胡景杰【作者单位】中国海洋大学生命科学与技术学部海洋生物遗传与种质工程实验室,山东,青岛,266003;中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室,山东,青岛,266003;中国海洋大学生命科学与技术学部海洋生物遗传与种质工程实验室,山东,青岛,266003;中国海洋大学生命科学与技术学部海洋生物遗传与种质工程实验室,山东,青岛,266003;中国海洋大学生命科学与技术学部海洋生物遗传与种质工程实验室,山东,青岛,266003;中国海洋大学生命科学与技术学部海洋生物遗传与种质工程实验室,山东,青岛,266003【正文语种】中文【中图分类】S917【相关文献】1.仿刺参微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析 [J], 潘传燕;臧云鹏;廖梅杰;王印庚;荣小军;张正;李彬;陈贵平2.仿刺参自然群体和养殖群体间遗传变异的微卫星标记研究 [J], 谭杰;孙慧玲;刘萍;杨爱国;燕敬平;刘志鸿;周丽青3.仿刺参中国群体与韩国群体杂交子代微卫星标记分析 [J], 王鹤;王田田;胡丽萍;赵强;孙国华;孙灵毅4.基于微卫星标记的地理群体仿刺参遗传结构判别分析模型的建立 [J], 高银雪;常亚青;庞震国;白雪秋;姬南京5.富集文库-菌落原位杂交法筛选仿刺参微卫星标记 [J], 卢超;包振民;彭薇;鄢婧婧;吕雅萌;胡景杰因版权原因,仅展示原文概要,查看原文内容请购买。