mRNA差异显示技术ppt课件
- 格式:ppt
- 大小:406.50 KB
- 文档页数:20
mrna差异表达摘要:1.mRNA 差异表达的概述2.mRNA 差异表达的原因3.mRNA 差异表达的应用4.mRNA 差异表达的挑战与未来发展正文:1.mRNA 差异表达的概述mRNA 差异表达是指在不同的生物体、不同组织、不同发育阶段以及不同处理条件下,基因的表达水平出现差异,从而导致mRNA 的表达量也不同。
这种现象在生物学研究中具有重要的意义,因为mRNA 差异表达往往与生物体的生长、发育、免疫、疾病等许多生物学过程密切相关。
2.mRNA 差异表达的原因mRNA 差异表达的原因多种多样,主要包括以下几个方面:(1) 基因本身的特性:不同的基因具有不同的表达水平和表达模式,这是由基因本身的序列特性、结构和功能决定的。
(2) 表观遗传调控:表观遗传是指通过化学修饰等方式,在不改变DNA 序列的前提下,影响基因的表达。
这种调控机制可以导致mRNA 的表达水平发生变化。
(3) 转录后调控:转录后调控是指在mRNA 合成后,通过剪接、修饰、运输和降解等过程,调控基因表达。
这些过程可以导致不同条件下mRNA 表达水平的差异。
(4) 环境因素:外部环境因素,如温度、光照、营养等,可以影响生物体内基因的表达,从而导致mRNA 差异表达。
3.mRNA 差异表达的应用mRNA 差异表达在生物学研究中具有广泛的应用价值,包括:(1) 基因功能研究:通过研究不同条件下基因表达水平的变化,可以推测基因在生物体内的功能和作用机制。
(2) 疾病诊断:许多疾病都与基因表达异常有关,通过检测mRNA 差异表达,可以为疾病的早期诊断和疗效监测提供依据。
(3) 药物研发:mRNA 差异表达可以为药物靶点发现和药物筛选提供重要线索。
4.mRNA 差异表达的挑战与未来发展尽管mRNA 差异表达研究取得了显著进展,但仍面临许多挑战,如数据分析方法的完善、样本多样性、数据标准化等。
随着高通量测序技术的发展,越来越多的mRNA 差异表达数据得以积累,为数据挖掘和生物信息学分析提供了基础。
mrna差别显示技术分离产物
MRNA差别显示技术(Differential Display of mRNA,DD)是一种用于寻找不同表达的基因的方法,属于基因差异分析的一种。
该技术以聚合酶链式反应(PCR)为基础,利用反转录酶将mRNA逆转录成cDNA,利用DD引物引导PCR扩增特定区域的cDNA,通过PCR扩增产物的差异性,从而分离出不同表达的mRNA。
这个方法已被广泛应用于许多生物领域中。
DD技术的实验步骤如下:
(1)以反转录酶为媒介,将总RNA逆转录成cDNA,加上合适的引物,经特定PCR扩增后,在聚丙烯酰胺凝胶中进行分离。
由于PCR扩增引物的选择性,只有与引物对应的mRNA 会被扩增出来。
(2)将不同条件下(如不同组织、不同发育阶段、不同细胞状态等)提取的RNA样品按照第一步的方法进行反转录、扩增和分离,得到不同的PCR产物。
(3)将不同条件下得到的PCR产物大小和数量进行比较,筛选出只在其中一个样品中存在的PCR产物,这就是mRNA的差异表达产物。
(4)将差异表达产物纯化后,进行后续的克隆、测序和同源比对等分析,确定其详细信息,为研究差异表达的基因提供线索。
DD技术的优点在于不需要事先了解基因的序列信息,能够从许多的基因中快速筛选出有差异表达的基因并进行深入研究。
缺点是有可能会测量到某些零星的基因表达变化,需要进行进一步的验证。
总之,DD技术在生物医学领域中具有广泛的应用前景,尤其在寻找某些疾病的分子机制和治疗靶点等方面起到了重要作용。
mRNA差异显示技术mRNA differetial display1.概述mRNA差异显示技术(mRNA differetial display)是一种快速有效的克隆差异性表达基因的方法。
•方法建立:1992年Liang P和Pardee首次应用DD技术对比人类乳腺癌细胞与正常细胞所表达的mRNA,以此来克隆癌细胞所特有的基因•目前已应用于个各领域:–农业、植物–动物–医学•胚胎发育•遗传病•药物•肿瘤2.mRNA差异显示原理•是分离差异表达基因的一个重要方法。
人类大约含有三万个不同的基因。
在不同的单个细胞中只有10%的基因处于表达状态。
•生物体在不同的生理,病理状态下,基因的表达水平不同。
•生命过程中选择性表达的基因主要有:发育与分化、体内平衡、对攻击的应答、细胞周期调节、老化和程序性细胞死亡等。
•差异显示获得的只是某个基因的片段,而不是直接获得全长cDNA克隆。
3.基本程序–选择表型特性差异显著对象–展示mRNA的差异–基因差异–克隆与表型差异高度相关的新基因4.技术•基本技术–逆转录(RT )–聚合酶链反应(PCR)–凝胶电泳5.RT-PCR•锚定引物T12-MN,含有12个T可以结合于mRNA 3`端poly(A)尾,M为A、C、G 3种碱基之一,N为A、T、C、G 4种碱基之一。
•荧光锚定引物,引物5`端加入T7 RNA多聚酶启动子并带有荧光分子----------- AAAAAAAAAA –3` mRNA------------XAAAAAAAAAAA–3` 1/3 mRNAMTTTTTTTTTTTT(12T)Prime---------YXAAAAAAAAAAAAA –3` 1/12 mRNANMTTTTTTTTTTTT(12T)Anchor Prime•荧光锚定引物:NMTTTTTTTTTTTT-T7 RNA多聚酶启动子-荧光分子(Genomyx company)因此共有12种锚定引物•同位素标记锚定引物•随机引物(Arbitrary Prime)可以随机地与cDNA不同位置多个位点结合,扩增出不同长度的cDNA片段混合物。