RNA提取器材及试剂预处理
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RNA的提取准备试剂:氯仿,异丙醇,75℅乙醇,无RNase的水或0.5℅SDS(溶液均需用DEPC处理过的水配制)操作步骤:1. 匀浆处理:a.组织将组织在液氮中磨碎,每50-100mg组织加入1ml TRIzol,用匀浆仪进行匀浆处理。
样品体积不应超过TRIzol体积10℅。
b.单层培养细胞直接在培养板中加入TRIzol裂解细胞,每10cm2面积(即3.5cm直径的培养板)加1ml,用移液器吸打几次。
TRIzol的用量应根据培养板面积而定,不取决于细胞数。
TRIzol加量不足可能导致提取的RNA有DNA污染。
c.细胞悬液离心收集细胞,每5-10×106动物、植物、酵母细胞或1×107细菌细胞加入1ml TRIzol,反复吸打。
加TRIzol之前不要洗涤细胞以免mRNA降解。
一些酵母和细菌细胞需用匀浆仪处理。
2.将匀浆样品在室温(15-30℃)放置5分钟,使核酸蛋白复合物完全分离。
3.可选步骤:如样品中含有较多蛋白质,脂肪,多糖或胞外物质(肌肉,植物结节部分等)可于2-8℃10000×g离心10分钟,取上清。
离心得到的沉淀中包括细胞外膜,多糖,高分子量DNA,上清中含有RNA。
处理脂肪组织时,上层有大量油脂应去除。
取澄清的匀浆液进行下一步操作。
5. 每使用1ml TRIzol加入0.2ml氯仿,剧烈振荡15秒,室温放置3分钟。
6. 2-8℃10000×g离心15分钟。
样品分为三层:底层为黄色有机相,上层为无色水相和一个中间层。
RNA主要在水相中,水相体积约为所用TRIzol试剂的60℅。
7. 把水相转移到新管中,如要分离DNA和蛋白质可保留有机相,进一步操作见后。
用异丙醇沉淀水相中的RNA。
每使用1ml TRIzol加入0.5ml异丙醇,室温放置10分钟。
8. 2-8℃10000×g离心10分钟,离心前看不出RNA沉淀,离心后在管侧和管底出现胶状沉淀。
RNA提取实验材料实验耗材:1.5ml灭菌EP管、去RNA酶枪头、、高速低温离心机试剂:Trizol、氯仿(三氯甲烷)、异丙醇、DEPC水、无水乙醇实验步骤:1.对于培养细胞样品:贴壁细胞:1)去除培养液,加PBS清洗,按照6孔板每孔加入500μl Trizol细胞裂解液,移液枪反复吹打至细胞完全脱落后,将细胞裂解液转移至1.5ml 去RNA EP管中(可置-80℃保存);2)每管加入100μl氯仿(三氯甲烷),轻柔的上下颠倒混匀,冰上静置10分钟,置12000转4℃离心15分钟;小心取出EP管,可清楚看到管内3分层,从上到下依次为:上层无色透明液体(RNA层)、中层白色沉淀(脂质层)、下层粉红色油状液体(苯酚-氯仿层);3)尽可能多的取出上层无色透明液体(200~300μl)至一新的1.5ml EP管中,若取出沉淀,需重新离心再取;4)每管加入等体积异丙醇,振荡、混匀,4℃静置10分钟。
12000转4℃离心10分钟,取出EP管可见下层白色沉淀,弃上清液;5)加入500μl 75%无水乙醇(无水乙醇与DEPC水,现配现用),上下颠倒、摇晃EP管至白色沉淀漂浮,7500转4℃离心5分钟,弃上清,75%无水乙醇重复清洗一次。
弃上清,瞬时离心数秒,移液枪小心去除多余上清液,打开EP管盖置超净台风干;6)至管内白色沉淀消失完全,加20-50μl DEPC水,轻轻振荡溶解RNA。
置-80℃保存一段时间后,用NanoDrop2000测样品RNA浓度,加适量DEPC水稀释RNA至200或500ng/μl。
2.悬浮细胞:2000rpm离心3min收集细胞,去上清,加入PBS洗1次,离心去除PBS(尽量去除干净),加入相应量的Trizol试剂吹打混匀。
其他步骤同贴壁细胞RNA 提取操作。
3.组织样本:取50~100mg的组织加入1 ml Trizol试剂,用匀浆器打匀(Trizol 先放于冰上)。
其余步骤同贴壁细胞RNA提取操作。
一、实验准备1、实验器具与材料:(1)移液枪:1ml、200ul、10ul(2)吸头:1ml、200ul、20ul(3)吸头台:放置1ml吸头的一个,放置200ul和20ul的吸头一个(4)EP管1.5ml、100ul(5)玻璃研磨器(6)容量瓶:1000ml(7)盐水瓶:100ml(8)15ml塑料管一个(配75%乙醇用)2、实验器具的处理与准备(1)塑料制品:(包括吸头、EP管等)将塑料制品逐个浸泡于1‰DEPC水中(必要时小枪头需要用吸管打入DEPC水)37℃过夜,然后送至高压3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小时左右烘干),试验前将枪头放入吸头台。
(2)玻璃制品:(主要是玻璃研磨器)先泡酸过夜,冲洗干净后,在1‰DEPC水中泡8小时左右,37℃烘干,用蒙锡纸包裹送至干烤3次。
(3)金属制品:(镊子等)先洗干净,再送干烤3次。
(不需要泡DEPC水)3、试剂配制和准备:(1)DEPC水:泡实验器具的DEPC水的配制:1000ml双蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml 容量瓶中静置4小时后备用。
配75%乙醇的DEPC水的配制:100ml盐水瓶内装40ml双蒸水,加40ulDEPC,37℃过夜,送至高压。
(2)75%乙醇(要在抽提时现配):用无水乙醇和DEPC水配制(DEPC水:无水乙醇=1:3),然后放于-20℃备用。
(3)异丙醇:放入棕色瓶(4)氯仿:放入棕色瓶(5)Trizol:100ml/瓶存放于4℃图:TRIzol抽提总RNA步骤二、抽提时注意事项全程佩戴一次性手套和口罩,手套要勤换,避免戴上的一次性的手套接触可疑污染物。
三、抽提步骤1、匀浆化作用取约100mg鼠脑组织放于玻璃研磨器内,先加0.2ml的Trizol溶液,研磨组织后,倒入1.5mlEP 管中,再在研磨器内加入0.8ml的Trizol溶液洗,后全部再倒入EP管中。
颠倒混匀10下,室温静置5分钟。
2、分离阶段每1mlTrizol中加0。
RNA提取准备工作及注意事项RNA提取是分子生物学实验中常用的操作步骤之一,它是从细胞或组织中提取RNA分子的过程。
在进行RNA提取前,需要进行一系列的准备工作以及注意事项,以确保提取出的RNA质量好、纯度高。
下面是RNA提取的准备工作及注意事项的详细介绍。
一、实验前准备1.实验器材准备:常用的器材有离心管、离心机、恒温水浴器、pH计、显微镜等,根据实验的需要选择相应的器材,并确保所有器材都经过充分的洗涤和消毒。
2.试剂准备:RNA提取试剂盒通常包括缓冲液、酚-氯仿、异丙醇等,根据试剂盒的说明书准备相应的试剂溶液,并保证试剂的纯度和保存状态。
3.工作区准备:RNA提取实验应在清洁、干净的台面上进行。
实验室湿度应保持在50-60%之间,温度保持在20-25°C之间,以防止RNA降解和污染。
二、实验注意事项1. 避免污染:RNA易受到RNase的污染,因此,实验操作时应避免污染源。
严格控制实验室环境的清洁程度,使用无RNase酶的试剂和离心管,避免直接接触RNase。
2. 快速操作:RNA易被RNase降解,因此在提取过程中应尽量减少操作时间。
在每一个步骤中,应迅速进行,尽量避免长时间的搅拌和振荡。
4.酚-氯仿提取法:酚-氯仿法是一种经典的RNA提取方法,但需要注意的是,该方法中酚对人体有毒,因此在操作时应注意避免接触皮肤和吸入。
5.商业试剂的选择:市场上有许多RNA提取试剂盒可供选择,根据实验需求和预算,选择可靠的商业试剂。
确保试剂的批次一致,并严格按照说明书操作。
6.RNA样品的保存:提取得到的RNA样本应立即保存在低温条件下,如-80°C冰箱中,以避免RNA的降解和污染。
7.评估RNA质量:提取得到的RNA样品可以通过吸光光度计检测A260/A280比值来评估其纯度。
通常来说,纯度好的RNA样品A260/A280比值应在1.8-2.0之间。
总结:RNA提取是一项关键的实验步骤,准备工作和注意事项的严格执行对RNA提取的结果和后续实验的顺利进行非常重要。
RNA的提取及定量操作步骤主要仪器及试剂1.原则避免RNA酶污染。
2.主要仪器及试剂①紫外分光光度计(以下以Bio-Rad公司的SmartSpecTM3000分光光度计为例)。
②无菌乳胶手套(无滑石粉)、口罩、离心管(EP管)、移液器及枪头、匀浆器等。
③Trizol、氯仿(三氯甲烷)、异丙醇、乙醇、DEPC处理水等3.操作步骤(全程戴手套和口罩)①Trizol处理。
将细胞培养液细胞吸出后,用PBS洗两次,加入I ml Trizol,室温裂解1~2min,用移液器均匀吹下细胞并置于EP管中,上下轻柔颠倒10次,室温静置5min。
组织样品可以加入Trizol后匀浆,后续的步骤和细胞样品相同。
Trizol的用量一般1ml至少可以处理一个长满的25cm2细胞培养皿的细胞或200mg的组织。
②加1/5体积的氯仿(如1 ml Trizol加0.2ml氯仿),颠倒混匀10次,室温静置5min,4℃,12000/min,离心20min③转上层水相于新EP管中,加等体积异丙醇,颠倒混匀10次,室温静置10min,4℃,12000r/min,离心15min④用真空泵或移液器小心吸取上清液,加预冷的75%乙醇(乙=0.75)(用DEPC处理水配制),4℃,12000r/min,离心10min⑤弃上清液,EP管倒扣,空气干燥5-10min。
⑥溶于10-100μDEPC处理水中。
⑦定量时将溶于DEPC处理水的RNA进行适量稀释,如50倍或100倍稀释(98μ1去离子水加2μRNA或99山去离子水加1 uI RNA,总体积100u1),用紫外分光光度计的微量石英杯定量,开机后选择RNA 定量,先用100ul去离子水做空白读数去除背景,再检测样品。
读取OD260值及OD260/OD280比值。
提取RNA前的准备工作1、提取RNA操作全程及配制RNA提取试剂必须穿实验服,戴口罩和一次性手套,触摸皮肤(例如面部)、门把手及实验室其他未处理过RNase的普通物体表面后立即更换手套。
2、器具干烤:需要干烤的器具包括金属和玻璃制品,如研钵、钥匙、镊子、剪刀、试剂瓶(200mL、500mL、1L)、量筒(50mL、100mL)、烧杯,即所有在配制RNA提取试剂过程中需要用到的玻璃器皿均需要干烤处理。
所有干烤的器具均用锡箔纸包住,如研钵、钥匙、镊子、剪刀和匀浆器,容器用锡箔纸封口,如试剂瓶、量筒和烧杯。
180℃干烤6h后放入RNA专用柜中备用。
3、DEPC水的处理:用于处理枪头、试剂瓶盖和离心管等塑料制品的0.1%的DEPC水可以在烧杯中配制,磁力搅拌器上搅拌过夜,搅拌过程中用锡箔纸封口。
用于配制RNA提取试剂的DEPC水需要在干烤过的试剂瓶中配制,盖上瓶盖搅拌过夜后121℃灭菌20min。
4、枪头、离心管和试剂瓶盖用0.1%DEPC水过夜处理后用报纸包好高温灭菌,移液器必须是专用的,用之前用DEPC处理的水配制的75%酒精擦拭整个移液器,特别是枪杆。
超净台的处理:用DEPC处理的水配制的75%酒精擦拭干净后,用氯仿快速擦拭,再用75%酒精擦拭,将提取所需的物品放入超净台,并用75%酒精擦拭,另放置一个废物缸,表面喷酒精,上述完成后,超净工作台紫外灯照射15-20min。
试剂配制过程中所用的枪头也必须是DEPC水处理过并高温灭菌的。
5、提取过程中用新开封的氯仿和异丙醇,用DEPC水处理过的15mL离心管分装,每管分装10mL并于4℃保存,最后溶解RNA沉淀的DEPC处理过的水用处理过的1.5mL离心管分装并于-20℃保存。
6、用专用的电泳槽电泳RNA,用DEPC处理的水配制50×TAE缓冲液,每次电泳前用DEPC处理的水配制1×TAE缓冲液进行电泳,电泳前用去污剂将电泳槽、制胶板和梳子清洗干净,DEPC水配制的75%乙醇擦拭,最后用DEPC处理的水冲洗干净。
RNA 提取方法(TRIzol法)一、试剂准备1、TROzlo试剂、氯仿、75%乙醇(0.1% DEPC配制)。
2、塑料器皿需用0.1% DEPC 水浸泡。
3、0.1%DEPC水:100ml dd水中加入DEPC0.1ml,充分振荡,37℃孵育12h以上,121℃高压灭菌20min,于4℃保存。
二、操作步骤1、样品处理(1)组织:50-100mg组织中加入1ml TROzlo试剂。
(2)单层细胞:加入TROzlo 试剂1ml/cm2平板。
(3)悬浮细胞:处理前洗涤细胞,以防止RNA降解。
每5-10×105动物、植物或酵母细胞,或1×107细菌加入1 ml TROzlo试剂。
2、将上述样品于15-30℃静置5min,使核蛋白充分解离。
3、加入0.2ml(1 ml TROzlo试剂)氯仿,盖紧盖子,充分剧烈振荡15s并于15-30℃静置2-3min。
4、于2-8℃12000g离心15min。
离心后样品分层,上层水相中含RNA,下层有机相中含蛋白和DNA。
5、取上清,加入0.5ml异丙醇,轻轻混匀,于15-30℃静置10min后,在管底会出现胶状沉淀,即为RNA。
6、于2-8℃12000g离心10min后弃去上清。
7、向沉淀中加入1ml 75%乙醇,轻轻混匀。
8、于2-8℃7500g离心5min后弃上清9、将RNA样品凉干(不要彻底干燥),加入适量DEPC水溶解(可于55-60℃促溶10min)。
三、注意问题1、在加入氯仿之前(第1步),样品能于-60- -70℃保存至少一个月。
2、RNA沉淀(第6步)在75%乙醇中于2-8℃能保存至少一周,于-5- -20℃能保存至少一年。
四、RNA定量RNA(mg/mL)=40×OD260×稀释倍数(n)/1000 RNA纯品OD260/OD280=2.0 五、RNA电泳(1)用1×TAE电泳缓冲液制作琼脂糖凝胶,加1×TAE电泳缓冲液至液面覆盖凝胶。
RNA抽提全过程(TRIZOL)一,准备工作1,实验器具与材料:(1)移液枪:1ml、200ul、10ul(2)吸头:1ml、200ul、20ul(3)吸头台:放置1ml吸头的一个,放置200ul和20ul的吸头一个(4)EP管1.5ml、100ul(5)玻璃研磨器(6)容量瓶:1000ml(7)盐水瓶:100ml(8)15ml塑料管一个(配75%乙醇用)2,实验器具的处理与准备(1)塑料制品:(包括吸头、EP管等)将塑料制品逐个浸泡于1‰DEPC水中(必要时小枪头需要用吸管打入DEPC水)37℃过夜,然后送至高压3次,后在80℃烘烤箱中烘干(或置于37℃中8小时左右烘干),试验前将枪头放入吸头台。
或直接购买经DEPC处理的枪头和EP管,每盒大约30元,基本上试剂公司都可以购买。
(2)玻璃制品:(主要是玻璃研磨器)先泡酸过夜,冲洗干净后,在1‰DEPC水中泡8小时左右,37℃烘干,用蒙锡纸包裹送至干烤3次(或180度干烤)。
(3)金属制品:(镊子等)先洗干净,再送干烤3次。
(不需要泡DEPC水)3,试剂配制和准备:(1)DEPC水:泡实验器具的DEPC水的配制:1000ml双蒸水中加1mlDEPC,放在1000ml 容量瓶中静置4小时后备用。
配75%乙醇的DEPC水的配制:100ml盐水瓶内装40ml双蒸水,加40ulDEPC,37℃过夜,送至高压。
(2)75%乙醇(要在抽提时现配):用无水乙醇和DEPC水配制(DEPC水:无水乙醇=1:3),然后放于-20℃备用。
(3)异丙醇:放入棕色瓶(4)氯仿:放入棕色瓶(5)Trizol:100ml/瓶存放于4℃二,抽提时注意事项:全程佩戴一次性手套和口罩,手套要勤换,避免戴上的一次性的手套接触可疑污染物。
三,抽提步骤1.匀浆化作用取约100mg鼠脑组织放于玻璃研磨器内,先加0.2ml的Trizol溶液,研磨组织后,倒入1.5mlEP管中,再在研磨器内加入0.8ml的Trizol溶液洗,后全部再倒入EP管中。
RNA提取准备工作及注意事项一、准备工作:1.设计实验方案:根据研究对象的不同,设计合适的实验方案,例如提取样品的数量、提取方法的选择等。
2.购买试剂和设备:准备好所需的试剂和设备,如RNA提取试剂盒、离心机、冷冻离心管等。
3.设置实验环境:确保提取RNA的工作环境干净、无菌,避免外部污染对实验结果的影响。
4.消毒操作台、仪器和试剂:使用漂白水或酒精将操作台、仪器和试剂进行消毒,以保证实验的无菌性。
5. 准备辅助试剂:根据实验方案的需要,准备好辅助试剂,如裂解缓冲液、RNase抑制剂、维生素C等。
二、注意事项:1. 避免RNA的降解:RNA容易受到核酸酶的降解,因此在处理样品时需注意使用RNase抑制剂,并避免RNA接触空气、水等容易污染的环境。
2.样品的采集和储存:样品的采集和储存条件对RNA的质量有很大影响,应注意快速采集样品并冷冻保存,避免样品的长时间存放和频繁冻融。
3. 避免污染:在整个提取过程中,应注意避免污染,使用专门的无菌、无DNase的耗材,并严格遵守实验室操作规范。
4.快速操作:RNA提取过程中,所有步骤都要迅速进行,尽量减少RNA长时间暴露在空气中,避免RNA的降解和污染。
5.质控检测:在提取过程中,可通过紫外吸收检测RNA的浓度和完整性,也可用琼脂糖凝胶电泳检测RNA的降解情况。
三、RNA提取的流程:1.样品裂解:将样品经过细胞裂解液处理,使DNA和RNA被释放出来。
2.分离RNA:经过离心将细胞碎片、核糖体、DNA等物质和RNA分离开来。
3.去除DNA:通过DNA酶的作用将DNA分解掉,使提取的物质中只含有RNA。
4. RNA稳定化:加入RNase抑制剂,防止RNA被降解。
5.沉淀RNA:将RNA进行萃取,并用酒精沉淀将RNA从提取溶液中分离出来。
6. 清洗和溶解:通过洗涤剂和酒精去除杂质,并用RNase-free水将RNA溶解。
7.浓缩RNA:将溶解的RNA进行浓缩,以便后续实验使用。
RNA提取实验方案1.所需试剂和设备-细胞样品(细菌、真核细胞等)- RNA提取试剂盒(例如TRIzol)- RNase去除剂(例如RNase A)-乙醇或异丙醇-游离亚硫酸-蒸馏水-离心机-定量和质量测量设备(例如紫外-可见光分光光度计)-冰桶和冷冻离心管2.操作步骤A.细胞样品处理和收集1.根据实验需求选择适当的生长培养基和条件培养细胞。
2.在适当的培养条件下培养细胞样品直到其数量达到目标水平。
3.将细胞样品收集到冷冻离心管中,通过离心将细胞沉淀于离心管底部。
B.细胞裂解和RNA分离4. 在冷冻离心管中加入适量的RNA提取试剂盒(例如TRIzol),按照试剂盒说明书中的比例加入。
5.快速颠倒离心管,混合细胞样品和试剂,使样品充分裂解。
6.在室温下静置5-10分钟,促使RNA与试剂发生充分结合。
7. 加入适量的RNase去除剂,按照试剂盒说明书中的比例加入。
8.快速颠倒离心管,继续混合样品。
9. 在室温下静置10分钟,使RNase去除剂与RNA结合。
C.RNA沉淀10.加入等体积的冷异丙醇或乙醇,混合样品。
11.在室温下静置10分钟,使RNA沉淀。
13.小心倒掉上清液,避免损失沉淀的RNA。
15.重复洗涤步骤一次。
D.RNA溶解和保存16.用适量的蒸馏水溶解RNA沉淀,使其完全溶解。
17.使用紫外-可见光分光光度计定量和质量测量RNA的浓度和纯度。
18.根据实验需求将RNA保存在合适的条件下(例如冷冻保存)。
3.注意事项- 在整个过程中要注意RNA的RNase污染,使用经RNase去除的试剂和消毒实验器具以避免污染。
-在RNA提取过程中要注意细胞样品的处理和保存,避免样品质量下降。
-每个步骤中的试剂和设备要根据实验室的具体情况进行选择和调整。
-在浓度和纯度测量RNA时要严格按照设备和试剂的操作要求进行操作。
这份RNA提取实验方案提供了一个通用的操作步骤,以便科研人员从细胞样品中提取RNA。
根据实验需求,可以对方案进行修改和调整,以获得更好的提取效果。
一、处理前必读
1.Rnase是一种蛋白酶,能够降解RNA,活体生物比如我们的皮肤上含量较多,
且高效稳定,要么0.1%的depc水中浸泡8h以上(室温),要么180℃高温烘烤8小时以上,此酶才会失效(分子克隆第二版,343页)。
2.在RNA提取过程中,非常重要的是在抽提后吸取上清液时,不能让枪头接
触蛋白层(内含有RNase),否则失败机率将大增。
3.RNA提取必须创造无RNase的环境,所有仪器与试剂可按照以下方法进行处
理:研钵、研棒、药匙、玻璃器皿等需在180℃烘干8h以上;电泳槽、胶板、梳子、用0.1 %~0.2%DEPC水处理过夜或者用洗涤灵清洗干净后用0.5%的SDS (Sodium dodecyl sulfate,抑制RNase的活性)浸泡过夜,然后用ddH2O 冲洗干净,晾干备用;离心管,枪头等塑料器皿要用0.1%~0.2%DEPC水浸泡过夜,然后高压灭菌,灭活DEPC;溶液都需用经DEPC处理过的水配置,且用新开封的试剂,RNA提取的所有操作应尽可能在超净工作台上进行。
4.DEPC,做焦碳酸二乙酯,液态(4℃),有毒。
DEPC水,一般指两种状态,
a,配制好未消毒;b,配制好已消毒。
通过高压消毒或者煮沸15min以上,该物质会降解成CO2和酒精,从而无毒。
配制方法如下:无菌蒸馏水中加入
0.1%(v/v)焦碳酸二乙酯(DEPC),室温搅拌4小时以上至完全溶解。
注:DEPC
能与胺和巯基反应,因而含Tris和DTT的试剂不能用DEPC处理。
5.溶剂:75%的酒精(新开封的),尽量现用现配(用高压灭菌后的DEPC水),
不可高压灭菌;氯仿和异丙醇必须专用,用时倒出一些使用即可(最好用新开封的),不可高压灭菌。
6.为啥在28S之后还是有影影约约的片断?和模糊的smear?这都与非变性电
泳方式有关。
RNA 的电泳,严格讲是要使用变性电泳的,我们平时所知道的
RNA 电泳的知识,实际上都是由变性电泳获得的。
但因为非变性电泳实在是太方便了,同时,就一般检测而言,完全可以替代变性电泳,所以我们日常检测就都使用非变性电泳了。
7.电泳:电泳的上样量1ug,电泳buffer用DEPC处理的水配制且加入RNA酶
抑制剂,电泳时间不要太久,120V,10-15min足够了。
8.电泳建议:先用2%琼脂糖胶,若分离效果不好,可用甲醛变性胶。
28S:18S
的亮度应为2:1,同时还有一条5S的弱带。
还要注意观察,在加样孔或刚出加样孔附近,有没有带,若有,可能为基因组DNA污染。
OD值只有1.5,可能为基因组DNA污染。