【生物化学】课后习题详细解答
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单字母 符号
丙氨酸(alanine) 精氨酸(arginine) 天冬酰氨(asparagines)
Ala
A 亮氨酸(leucine)
Leu
L
Arg
R 赖氨酸(lysine)
Lys
K
Asn
N 甲硫氨酸(蛋氨酸)(methionine) Met
M
天冬氨酸(aspartic acid)
Asp
D 苯丙氨酸(phenylalanine)
14、指出在正丁醇:醋酸:水的系统中进行纸层析时,下列混合物中氨基酸的相对迁移率(假定水 相的 pH 为 4.5):(1)Ile, Lys; (2)Phe, Ser (3)Ala, Val, Leu; (4)Pro, Val (5)Glu, Asp; (6)Tyr, Ala, Ser, His. [Ile> lys;Phe,> Ser;Leu> Val > Ala,;Val >Pro;Glu>Asp;Tyr> Ala>Ser≌His] 解:根据 P151 图 3-25 可得结果。
氨基酸是两性电解质。当 pH 接近 1 时,氨基酸的可解离基团全部质子化,当 pH 在 13 左右时, 则全部去质子化。在这中间的某一 pH(因不同氨基酸而异),氨基酸以等电的兼性离子(H3N+CHRCOO-) 状态存在。某一氨基酸处于净电荷为零的兼性离子状态时的介质 pH 称为该氨基酸的等电点,用 pI 表示。
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解:根据逆流分溶原理,可得: 对于 Gly:Kd = CA/CB = 4 = q(动相)/p(静相) p+q = 1 = (1/5 + 4/5)
4 个分溶管分溶 3 次:(1/5 + 4/5)3=1/125+2/125+48/125+64/125 对于 Phe:Kd = CA/CB = 2 = q(动相)/p(静相) p+q = 1 = (1/3 + 2/3)
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生物化学(第三版)课后习题详细解答
第三章 氨基酸
提要
α-氨基酸是蛋白质的构件分子,当用酸、碱或蛋白酶水解蛋白质时可获得它们。蛋白质中的氨 基酸都是 L 型的。但碱水解得到的氨基酸是 D 型和 L 型的消旋混合物。
参与蛋白质组成的基本氨基酸只有 20 种。此外还有若干种氨基酸在某些蛋白质中存在,但它们 都是在蛋白质生物合成后由相应是基本氨基酸(残基)经化学修饰而成。除参与蛋白质组成的氨基 酸外,还有很多种其他氨基酸存在与各种组织和细胞中,有的是β-、γ-或δ-氨基酸,有些是 D 型 氨基酸。
5、根据表 3-3 中氨基酸的 pKa 值,计算下列氨基酸的 pI 值:丙氨酸、半胱氨酸、谷氨酸和精氨酸。
[pI:6.02;5.02;3.22;10.76] 解:pI = 1/2(pKa1+ pKa2)
pI(Ala) = 1/2(2.34+9.69)= 6.02 pI(Cys) = 1/2(1.71+10.78)= 5.02 pI(Glu) = 1/2(2.19+4.25)= 3.22 pI(Ala) = 1/2(9.04+12.48)= 10.76
测定蛋白质一级结构的策略是:(1)测定蛋白质分子中多肽链数目;(2)拆分蛋白质分子的多 肽链;(3)断开多肽链内的二硫桥;(4)分析每一多肽链的氨基酸组成;(5)鉴定多肽链的 N-末端 和 C-末端残基;(6)断裂多肽链成较小的肽段,并将它们分离开来;(7)测定各肽段的氨基酸序列; (8)利用重叠肽重建完整多肽链的一级结构;(9)确定半胱氨酸残基形成的 S-S 交联桥的位置。
为了表示蛋白质结构的不同组织层次,经常使用一级结构、二级结构、三级结构和四级结构这 样一些专门术语。一级结构就是共价主链的氨基酸序列,有时也称化学结构。二、三和四级结构又 称空间结构(即三维结构)或高级结构。
蛋白质的生物功能决定于它的高级结构,高级结构是由一级结构即氨基酸序列决定的,二氨基 酸序列是由遗传物质 DNA 的核苷酸序列规定的。
氨基酸分析分离方法主要是基于氨基酸的酸碱性质和极性大小。常用方法有离子交换柱层析、 高效液相层析(HPLC)等。
习题
1.写出下列氨基酸的单字母和三字母的缩写符号:精氨酸、天冬氨酸、谷氨酰氨、谷氨酸、苯丙氨
酸、色氨酸和酪氨酸。[见表 3-1]
表 3-1 氨基酸的简写符号
名称
三字母符 单字母
号
符号
名称
三字 母符 号
4 个分溶管分溶 3 次:(1/3 + 2/3)3=1/27+6/27+12/27+8/27 故利用 4 个分溶管组成的分溶系统中,甘氨酸和苯丙氨酸各在 4 管和第 3 管中含量最高,其中: 第 4 管:Gly:64/125×100=51.2 mg Phe:8/27×81=24 mg 第 3 管:Gly:48/125×100=38.4 mg Phe:12/27×81=36 mg
ቤተ መጻሕፍቲ ባይዱGls
Z
Gly
G 色氨酸(tryptophan)
Thr
T
Trp
W
组氨酸(histidine)
His
H 酪氨酸(tyrosine)
Tyr
Y
异亮氨酸(isoleucine)
Ile
I
缬氨酸(valine)
Val
V
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2、计算赖氨酸的εα-NH3+20%被解离时的溶液 PH。[9.9] 解:pH = pKa + lg20% pKa = 10.53 (见表 3-3,P133)
pH = 10.53 + lg20% = 9.83
3、计算谷氨酸的γ-COOH 三分之二被解离时的溶液 pH。[4.6] 解:pH = pKa + lg2/3% pKa = 4.25
pH = 4.25 + 0.176 = 4.426
4、计算下列物质 0.3mol/L 溶液的 pH:(a)亮氨酸盐酸盐;(b)亮氨酸钠盐;(c)等电亮氨酸。[(a)约 1.46,(b) 约 11.5, (c)约 6.05]
在不同生物体中行使相同或相似功能的蛋白质称同源蛋白质。同源蛋白质具有明显的序列相似 性(称序列同源),两个物种的同源蛋白质,其序列间的氨基酸差异数目与这些物种间的系统发生差异 是成比例的。并根据同源蛋白质的氨基酸序列资料建立起进化树。同源蛋白质具有共同的进化起源。
在生物体内有些蛋白质常以前体形试合成,只有按一定方式裂解除去部分肽链之后才出现生物 活性,这一现象称蛋白质的激活。血液凝固是涉及氨基酸序列断裂的一系列酶原被激活的结果,酶 促激活的级联放大,使血凝块迅速形成成为可能。凝血酶原和血清蛋白原是两个最重要的血凝因子。 血纤蛋白蛋白原在凝血酶的作用下转变为血清蛋白凝块(血块的主要成分)。
10、为什么氨基酸的茚三酮反映液能用测压法定量氨基酸? 解:茚三酮在弱酸性溶液中与α-氨基酸共热,引起氨基酸氧化脱氨脱羧反映,(其反应化学式见 P139),其中,定量释放的 CO2 可用测压法测量,从而计算出参加反应的氨基酸量。
11、L-亮氨酸溶液(3.0g/50ml 6mol/L HCl)在 20cm 旋光管中测得的旋光度为+1.81º。计算 L-亮氨 酸在 6mol/L HCl 中的比旋([a])。[[a]=+15.1º]
除甘氨酸外α-氨基酸的α-碳是一个手性碳原子,因此α-氨基酸具有光学活性。比旋是α-氨 基酸的物理常数之一,它是鉴别各种氨基酸的一种根据。
参与蛋白质组成的氨基酸中色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸在紫外区有光吸收,这是紫外吸收法定 量蛋白质的依据。核磁共振(NMR)波谱技术在氨基酸和蛋白质的化学表征方面起重要作用。
肽键(CO—NH)是连接多肽链主链中氨基酸残缺的共价键,二硫键是使多肽链之间交联或使多 肽链成环的共价键。
多肽链或蛋白质当发生部分水解时,可形成长短不一的肽段。除部分水解可以产生小肽之外, 生物界还存在许多游离的小肽,如谷胱甘肽等。小肽晶体的熔点都很高,这说明短肽的晶体是离子 晶格、在水溶液中也是以偶极离子存在的。
所有的α-氨基酸都能与茚三酮发生颜色反应。α-NH2 与 2,4-二硝基氟苯(DNFB)作用产生相应 的 DNP-氨基酸(Sanger 反应);α-NH2 与苯乙硫氰酸酯(PITC)作用形成相应氨基酸的苯胺基硫甲 酰衍生物( Edman 反应)。胱氨酸中的二硫键可用氧化剂(如过甲酸)或还原剂(如巯基乙醇)断 裂。半胱氨酸的 SH 基在空气中氧化则成二硫键。这几个反应在氨基酸荷蛋白质化学中占有重要地位。
12、标出异亮氨酸的 4 个光学异构体的(R,S)构型名称。[参考图 3-15]
13、甘氨酸在溶剂 A 中的溶解度为在溶剂 B 中的 4 倍,苯丙氨酸在溶剂 A 中的溶解度为溶剂 B 中 的两倍。利用在溶剂 A 和 B 之间的逆流分溶方法将甘氨酸和苯丙氨酸分开。在起始溶液中甘氨酸含 量为 100mg ,苯丙氨酸为 81mg ,试回答下列问题:(1)利用由 4 个分溶管组成的逆流分溶系统时, 甘氨酸和苯丙氨酸各在哪一号分溶管中含量最高?(2)在这样的管中每种氨基酸各为多少毫克? [(1)第 4 管和第 3 管;(2)51.2mg Gly+24mg Phe 和 38.4mgGly+36mg Phe]
Phe
F
Asn 和/或 Asp 半胱氨酸(cysteine) 谷氨酰氨(glutamine)
Asx
B
Cys
C 脯氨酸(praline)
Gln
Q 丝氨酸(serine)
Pro
P
Ser